3RMFA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-33
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
278
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 278
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rmfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3rmfA01
3AQVA 1VEBA 4B6LA 1KV2A 4DGGA 4GJ3A 4EOKA 3CLYA 4MXOA 4ALUA 3VF8A 3QD3A 4F7LA 2OG8A 4G3EA 5K5XA 5TR6A 3CQEA 5AV0A 4IZYA 2W9ZB 3MFTA 4XEYA 4ACMA 4BCHA 3BHUA 4BIEA 3D4QA 4X3FA 4WBOA 3E3BX 2BHEA 3PLSA 4FKOA 1G8SA 2XNGA 4D2WA 1OZ1A 3C4XA 1XH9A 2HELA 3AC2A 3GI3A 1WMKA 2X2KA 3RAWA 4EZ3A 3MPTA 4DH1A 1DAWA 5BVWA 4R78A 2HZIA 5HTBA 1PXPA 5AUYA 4D5KA 3A7IA 1URWA 1TQPA 3LFFA 5GZAA 4BC6A 4LFIA 5CLPA 3LJ0A 4CTBA 4EUTA 2Z8CA 4LGGA 4UWCA 1RW8A 5HO8A 2R4BA 2CN5A 3JUHA 4EHZA 4E3CA 5L2SA 2I6LA 4LYNA 1BL6A 2XKCA 1FVVA 4ZS0A 2OWBA 5FBOA 3BGZA 4NL0A 4FI1A 4CQGA 5JQ8A 4DFUA 4RZVA 5HBEA 4I6QA 4KUJA 2G01A 2ITNA 5BVDA 4WUNA 4QYHA 3QCQA 4TYHB 2Z7RA 4EOLA 4MH7A 3ULZA 3EQDA 4ZY4A 3SA0A 4WNKA 4DH8A 2CNQA 5EYKA 4O7SA 3NEWA 5DEWA 3V01A 4YO6A 4RJ5A 1VYWA 4QMLA 2QKRA 4N6ZA 5AX3A 3VQHA 4LGDA 4OTRA 5LQFA 5C8KA 3HMNA 2Z2WA 3G9LX 3HEGA 4PTGA 4EC9A 5T3QA 3F2RA 2ZOQA 3C4EA 3OY1A 1H1WA 4ZSJA 4ZXTA 3TKHA 4QQ5A 4ID7A 4FE2A 4FG8A 3QAME 2XS0A 3LFSA 4NM3A 3SOCA 2GNGA 3EN6A 4YBJA 2QR8A 3OEZA 2PZ5A 3AT4A 3PZHA 4JX7A 3G90X 3VHKA 5EK7A 3CSVA 4PWNA 2PE0A 4M13A 3RK5A 4PNIA 4RLLA 4D1SA 3NIZA 4O7VA 3CIKA 3M11A 5JKGA 3MN3A 2H9VA 4WG3A 3U9NA 1FBNA 3QTQA 4PUZA 2ZB1A 1FPUA 2ZM1A 4NM7A 4W4XA 2R3JA 3ZTXA 5KMJA 2CLXA 3V51A 4YMJA 5IA0A 2GSFA 4F9CA 2OZAA 4QYFA 4IC8A 5HQ0A 1QPCA 1XH6A 2XRWA 4FNWA 3QC4A 4FL3A 2JFMA 4BDKA 2QOFA 2B9HA 2Y6OA 3QTUA 5IQGA 4MAOA 4S2ZA 3KQ7A 1Q8ZA 2BFXA 2BAJA 4FF8A 4IJ9A 4QMOA 2EU9A 4WBBB 1OECA 4ZEGA 5K4IA 2EXEA 1JSUA 1P2AA 2W4JA 3DCVA 4M69B 1SVGA 1BL7A 3H9RA 2AC5A 4G5PA 4QP3A 3MFSA 4QPAA 4FMQA 3UOLA 1M2PA 5BYZA 2W5HA 2ZM4A 4GEOA 4I94A 4AACA 3DJ7A 2X1NA 4EYMA 5I3RA 2XKFA 3WBLA 4QP9A 1Y57A 5C1QB 4DFNA 5AUTA 2CNUA 3D15A 4C57A 3EFJA 4FG7A 1FGKA 5CF4A 5CU6A 5L2WA 2Z60A 4XG2A 3FZPA 3QGWA 4DE4A 3FC2A 3NUNA 3TNQB 1UV5A 3AD4A 4C3RA 4GKIA 1ZXEA 2R5TA 2B52A 1HCKA 2XM9A 4J96A 2R3GA 3PXZA 4F1MA 1A48A 2GHMA 4GFMA 1H1PA 3EN9A 5FP5A 5IA5A 3RALA 3LFQA 4IM2A 4U5JA 3E8NA 3R71A 2C68A 4JG6A 4L44A 5KKRB 1K3AA 4JG7A 4AU8A 5A54A 5IH6A 2YLFA 4N57A 3ZCLA 3KVXA 2X39A 1PXIA 5F20A 3FV8A 4K6ZA 4X6RA 2VAGA 3AT2A 3L1SA 4CG8A 3EN4A 2BKKA 2FO0A 4FV5A 4FZFB 4JQEA 3BZ3A 5HG8A 4ASEA 3AOXA 3QYWA 2O2UA 3DBEA 3IW7A 3QRIA 4FTAA 1U5RA 4OTWA 2CNVA 4PDSA 4X0MA 1PYEA 1YVJA 2ZYBA 4JG8A 4F99A 4ZTHA 3VULA 3LMIA 4LL5A 4O0RA 4D0WA 1Z5MA 2UVXA 3G51A 1GY3A 3NW5A 4K33A 4NU1A 2FVDA 4FSQA 1OKWA 3O71A 3SXSA 5FGKA 1DI9A 5GJDA 4I3ZA 5M4CA 4IX3A 2J4ZA 3HV4A 3VJOA 4V0GB 3NNWA 2P55A 4F7NA 1I44A 5I9WA 3NW7A 4CEGA 3I1AA 4D2SA 1RQQA 5H9BA 1Q4LA 1OB3A 2GS2A 4NIFA 4C8BA 5AUVA 4E4LA 3ATSA 3GU8A 4X2JA 5CI7A 3Q52A 3RNIA 3VBVA 2XJ1A 2WAJA 4D4SA 1YHVA 3KREA 1PXJA 5IDPA 1NA7A 2VO7A 4FKQA 4QMPA 3VBQA 4KABA 2FSMX 4R6VA 5AUXA 3E88A 1NVQA 3LHJA 3ZM9A 4HGSA 2X8DA 5M56A 4RIYB 4L42A 3E8EA 3UYSA 2WXVA 2PPQA 3THBA 3F3UA 3VC4A 5AAGA 5M51A 3QKLA 3ERKA 5TO8A 3V6SA 3VIDA 3QTIA 3W2OA 4DEIA 1Q3WA 4PF4A 3BGQA 4KS7A 3NMUF 1JKSA 4DTBA 1MRYA 2GS7A 5LWNA 3I5NA 2Y4PA 3P7BA 2PZPA 3NYXA 4FOBA 4FKIA 4J97A 3PXRA 4NEUA 3ZEPA 3VVHA 1PMEA 3D7ZA 3TJDA 4L6QA 1YHSA 3RM6A 4A4XA 3BX5A 3HRBA 5J8IA 5IQFA 2W1GA 5AR7A 2CGUA 4JDIA 4KIKA 3R1QA 4Q5EA 4R5YA 4L52A 4MQ2A 3S0OA 4XOYA 4WRSA 2OK1A 3KXNA 1WVWA 4LI5A 4DFZE 2WTKB 3PA3A 4NJ3A 4E6QA 5EYDA 5FD2A 4MNEA 3FMKA 2VGPA 3E63A 5J1WA 4I93A 4JOAA 5KO1A 2OFUA 3ZO4A 3F5XA 3II5A 4E4NA 5GIPE 3SHEA 1MQ4A 4FSZA 1YXVA 2GHLA 5CEQA 4YHJA 2H6DA 4K8AA 2XIXA 2ITUA 3TV6A 4C3FA 3H3CA 4E6AA 3CC6A 5E7RA 2GHGA 4ITJA 1YW2A 4L3JA 4RX7A 3FZ1A 3ZYAA 4X7QA 3FPQA 2BFYA 2J0JA 2G15A 3F9NA 2KULA 4WNMA 4UALA 5AR5A 1IG1A 2R3LA 4RWJA 5IA1A 1JPAA 1W84A 4R1YA 5KMNA 5JN2A 4IHPA 1ZOGA 4M14A 4TN6A 5HU3A 1PF8A 3I6WA 3KGAA 5AUUA 3RGFA 4TY1A 5T68A 2QI8A 2UW4A 3DTCA 2CN8A 3GT8A 4AE9A 2OXYA 2IZSA 4HGEA 3ZUUA 4I1ZA 4Y46A 5HZNA 3DK6A 5AA8A 2VTQA 3OG7A 4FBXA 4TYJA 5EHLA 3EQFA 4CMTA 4XYFA 4MQ1A 4FX3A 2WGJA 1OITA 3R8UA 4BKYA 2CHLA 2AC3A 4RJ6A 4QMSA 5CXHA 5HNGA 2W4OA 2JBOA 3ANRA 5EHOA 2HXLA 4EH3A 3QKMA 2BKZA 5CEIA 4AN9A 2JDVA 1KE9A 2C1BA 2FSLX 4YR8A 2FB8A 1P4FA 5AP3A 3BE9A 5HKMA 4O96A 4BTKA 4CGAA 4U0IA 3ODZX 3OD6X 3A99A 2WKMA 3QD2B 1SVHA 3JXWA 3OTVA 2CKQA 4PNKA 4M69A 4F08A 2WTIA 4R7BA 2HZNA 2Y4IB 2PSQA 4AOTA 4HOKA 4CV8A 2QG5A 4JIKA 2I0HA 3MBLA 2GDOA 3L8XA 3LIJA 4C33A 4HYIA 4RRVA 1V0BA 3DBQA 2VWBA 2EWAA 2UVZA 2VX1A 4I41A 4LG4A 2XK6A 2QURA 2QOKA 5GZ9A 5DA3A 5HBHA 5JZNA 3IDCA 1IAJA 3C7QA 4ANOA 2PUIA 5BVNA 1OUYA 1PJKA 4DG0E 3WARA 5K4JA 4YC8A 2WTDA 2YA9A 1ZMWA 4IQ6A 4UZHA 3IKAA 4ZSLA 3PY0A 3VBXA 1IAHA 1CKIA 2WTCA 4DYMA 3QTSA 5CTPA 2VO6A 4JXFA 4YZ9A 2GNIA 3QHWA 5DR6A 4HCVA 1OIUA 4JAJA 4N4SA 1F0QA 1YOLA 4M3QA 1XBAA 5LMKC 3AG9A 5G1XA 3SC1A 4BI2A 4CKRA 3PLAE 1OL5A 4XMOA 5AFVA 2BVAA 3HDMA 5DBXA 4ITHA 4OBQA 4O0SA 4G9CA 2OJIA 4RJ4A 4TW9A 4RFYA 5CAPA 4XV1A 2BMCA 3VUTA 4CFWA 3TZMA 4GKHA 3VUKA 5CAOA 4R7IA 3KXXA 4KSQA 5AP4A 3FZTA 2C6KA 3QQUA 5M44A 3AC3A 5FP6A 4F9BA 1OKZA 2XYNA 4DCAA 4UWYA 3FEGA 1PXKA 3ORNA 2R3IA 3NWWA 5EYCA 5AWMA 4HVDA 1JKLA 2JKOA 1E9HA 2VNYA 3COMA 3QA0A 2B9IA 4F7JA 5DR2A 5LVPA 4RJ7A 2UZUE 5HIBA 4E93A 4APPA 1R1WA 1XO2B 4PP9A 4ANQA 4U44A 4I23A 1OL2A 3K2LA 4OW8A 1ZY5A 4GFGA 4XG8A 2UW0A 5CT0A 4YJQA 5ANKA 5TE0A 3R7YA 3RZFA 4F0GA 5M09A 1SYKA 3A7GA 3M1SA 2YCFA 3FKNA 3Q60A 3S1HA 3G5DA 1Q5KA 2JDSA 4CKJA 3QD0A 4V0GA 1L8TA 1UWHA 2BRNA 2UZOA 4H1JA 4PX6A 5A14A 3GGFA 1OIRA 4FTJA 3U6JA 2I0EA 1Q8YA 4IAFA 3MIAA 1TQMA 4CV9A 3ACJA 3P23A 4NZWB 1IRKA 3DBFA 3H0ZA 4QOXA 1H07A 3A7FA 3QC9A 5EW3A 4EJ7A 3COKA 1ZLTA 4DFXE 3ELJA 3O0GA 5KCVA 3UMWA 4QPMA 3IPHA 5CYIA 4AGCA 4MTAA 4YSMA 2XNOA 3TTIA 1G3NA 2CGXA 3ZFMA 3TG1A 3IG7A 1QPEA 2JC6A 4QTCA 2VWYA 3K5UA 4F9YA 1Q8WA 1Q97A 4X2GA 2XIYA 1FGIA 1JBPE 2YWPA 4EK8A 3H9FA 2R9SA 3NDMA 5CAVA 2WEVA 2V5QA 2FSOX 1IA9A 4IVDA 4O1PA 5HCYA 2F2CB 4G1WA 3T3UA 3IW5A 1BI7A 1JNKA 5I9XA 5HU9A 3RK9A 3SGCA 3L9NA 2XP2A 2W05A 3I5ZA 4I5HA 1PYXA 1BKXA 3N4UA 3EQPA 2I0VA 2IWIA 4J99A 1U4DA 2F7ZE 1RJBA 3FYJX 2WTVA 3HV6A 3R1NA 5B2MA 3MVJA 4KS8A 5M4IA 1YDSE 2VD5A 5HIDA 4EKLA 1LR4A 3Q9WA 4R1VA 4HVIA 5BVFA 4BHNA 3H4JA 4GL9A 4XCUA 3F66A 5CVFA 1NVSA 3W2SA 4FT3A 2ZDUA 4FSMA 2XNPA 3PVGA 4A9YA 4CRSA 4PMPA 5A4LA 5HNIX 3Q32A 4IWQA 3ZEWA 4IB5A 4F6SA 5AV3A 4IM3A 4QTBA 1GAGA 2GTNA 5EOLA 3TDVA 4UWBA 5TKDA 5E91A 3G15A 4YZDA 4FV2A 3LE6A 3O51A 4TWPA 3TCPA 2WMTA 4F6UA 3OWJA 2YM4A 2WQMA 3PIYA 2ITOA 3FMMA 3H9OA 3Q6UA 5M55A 4O7NA 2YFXA 4KKGA 2F57A 2Y8OA 1KSWA 4JQ8A 3P79A 4FEUA 2PVKA 3W33A 4QP4A 1G8AA 4U6RA 3DU8A 3SVVA 1B39A 3OOGA 4HYHA 4LOOA 4YJPA 5DFPA 4W8DA 4E4MA 5ANIA 3MTFA 1QMZA 4R8QA 5HCXA 5KNJA 2R7IA 3OTUA 3HLLA 3CY3A 4BWKA 5KHWA 3BV3A 4FZ6A 4H3PA 2WU7A 4ZLYA 5C8NA 4YTFA 4Q9ZA 4U45A 4EYJA 4XUFA 4K77A 4J53A 3VUDA 4M12A 4F9WA 2BTSA 1KE5A 4EHGA 3N51A 4FV7A 1CKJA 3VW8A 4U3YA 5BVKA 4B9DA 4FSYA 3QQJA 5IF1A 3EL7A 1H24A 3PIZA 2OSCA 4DT9A 5IEXA 4EK4A 1J3HA 3IO7A 4X6QC 5T6KA 2BAQA 2C6EA 2C6DA 3BPRA 3KULB 4OGRA 3RBWA 3JS2A 3VS7A 5HVYA 5JEBA 5JH6A 4EH4A 3DXNA 4P5QA 2YZLA 4ANBA 3OBJA 2Y4IC 2WMUA 4IAKA 3MS9A 2OIBA 3UZPA 4YC6A 3MVLA 3OCGA 3H30A 3EN5A 3CTQA 2P0CA 2VO0A 4TNBA 4QP8A 3AD6A 4RWLA 4EOSA 5ANEA 4D0XA 5CSVA 4O82A 1XBBA 3RPVA 1BMKA 4BKZA 3CKWA 5AJQA 3FHIA 4AZTA 2X8EA 3HP2A 4FSNA 5AAEA 5CEMA 3PJ2A 3PIXA 4CFMA 4QP7A 3NX8A 4I22A 3O8PA 5IQCA 2G1TA 4BZOA 2C6TA 3MYGA 4APCA 3DB6A 4ZP5A 2ZDTA 2XNEA 3LFAA 3Q4UA 4PPAA 4RFZA 4AA5A 4Y5QA 3H0YA 3TT0A 5EOBA 3Q9XA 4FSUA 3NVKI 3LLTA 3BHVA 1WBTA 3CJGA 4D1ZA 5IQAA 4LRMA 2OF4A 4XS2A 4FIIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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