3S0OA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-1-138
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
298
structure length
293
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 293
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3s0oA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3s0oA01
2BHHA 3M42A 4PDSA 3GB2A 3L8SA 5HO8A 1OMWA 2YCQA 4XH6A 2HENA 3R8ZA 3P7BA 2V55A 2J5FA 1PHKA 2XBJA 3TN8A 4AS0A 3O8UA 4D0WA 4YBJA 3UQFA 4YHFA 2XCKA 4IVBA 2FH9A 4RFYA 2W06A 3RAHA 4AT3A 2OI4X 2UZDA 2Y8OA 4L8MA 3VQHA 1IRKA 2E9VA 2QR8A 4IDVA 5AV2A 4YJRA 3GCSA 4IWPA 5AR5A 4EH6A 3HMIA 3LFFA 5CF5A 3VW6A 1PKDA 4RJ5A 3IO7A 3NNWA 4FTMA 5C4KA 3QZFA 5HI2A 4AZSA 5LMKC 3UOLA 4L45A 3CC6A 3A7GA 3ORKA 1NY3A 3HNGA 2ACXA 4LGDA 2B54A 4QP7A 4BI0A 4F1TA 3QTWA 3GNIB 2C1AA 1GZ8A 3AC4A 4XG6A 2UVYA 4YTIA 5KO1A 2C6EA 3FY0A 4AW0A 4WO5A 4BI2A 3ITZA 3P23A 2ZB0A 2KULA 3CP9A 2R3RA 4XG4A 3VVHA 5CZHA 3DBFA 5EHOA 4G6NA 3ODZX 4K6ZA 4KIQA 4YJOA 2CNVA 2VO7A 2C6KA 4J96A 1A48A 1CDKA 4GK4A 4XBRA 3TZMA 5HX8A 5AR8A 3NUAA 5EYDA 5HLWA 4IJPA 2W5BA 4JR7A 4PL3A 4OT6A 4C62A 4EH3A 3PTGA 4O7SA 2HCKA 3AGLA 5KMMA 3UQGA 3ANQA 1CKIA 1P4FA 2QO2A 2FSTX 4A9UA 3GCUA 2CJMA 4LGGA 3F2RA 1OITA 3IGGA 5LXMA 3QD4A 3QD3A 3BV2A 1FQ1B 2X9FA 4OT5A 2I40A 3OZ6A 4WUNA 5FTQA 4BCNA 5CAQA 5JQ5A 3TDVA 5DEYA 4MXCA 3T9TA 3RZFA 4IAZA 3EL8A 2ESMA 2XRWA 4FT7A 3KCKA 5A4TA 4I0SA 3OMVA 2J0LA 4FV6A 3IGOA 4RX5A 5L6PA 1YOLA 5AAGA 3JYAA 2FYSA 3Q4UA 3KKVA 3OC1A 1Q3DA 4PL5A 3O8TA 5BVNA 3DDQA 5E8UA 4GCJA 1S9IA 3U8WA 4HVIA 2FSMX 3AC8A 3BE9A 5E1EA 3BEAA 4X7QA 2J0JA 3FLZA 1YDRE 3QXOA 5EDPA 4BGHA 4BZOA 3P5KA 4I93A 1NXKA 3LFBA 4FSYA 3TCPA 5IKWA 3DKCA 4ZS0A 4FTNA 3ZSHA 3MS9A 5TR6A 2W1ZA 2WTCA 5HU3A 5C1QB 3PVUA 5HHWA 3FMEA 1SNUA 4EK3A 4I94A 3GU7A 1Z5MA 4XG2A 2ITNA 3WF8A 1P2AA 2G2FA 2IVVA 1O6YA 2O8YA 3PYYA 2JDVA 2XNBA 3R7GA 1DAWA 3ENMA 4DEAA 5A6NA 5HORA 3R9RA 4IIRA 2WOUA 2XKFA 1SZMA 2BDFA 2FSOX 2YLEA 3LFEA 1U54B 2W1IA 3AT3A 4MHAA 5AX3A 4B8MA 4C4FA 3KRWA 4R7BA 4L68A 4WD5A 5K4IA 4PL4A 4D4VA 4IWQA 3UNKA 3KEXA 1UV5A 3PXFA 4M66A 4J1RA 4RQVA 5I3RA 5CQWA 4E8AA 2VTAA 4GS6A 3HV5A 5CVGA 2J9MA 3UP7A 3EN7A 4OBPA 4BC6A 1JBPE 4M97A 4DFZE 2VRXA 2YCSA 4YO4A 2XS0A 4TXCA 3WZDA 1OL1A 2J6MA 4GH2A 4X3FA 4CFFA 5IMEA 4AGUA 1KV2A 4H58A 2JKMA 1M17A 3FMKA 4QQTA 2NPQA 2OU7A 4FC0A 5AUVA 3QUEA 3PE1A 4O0YA 4BVUA 4PRJA 4AAAA 3ZRLA 3C51A 3IONA 4F08A 5IQEA 4EWQA 4E5AX 2JIUA 3MH2A 5HKMA 4G17A 4DEIA 3R73A 5H3QA 3QTRA 3Q9ZA 2H96A 3QZIA 2PE2A 4LL5A 1FVVA 4F9BA 5DLSA 4ALVA 1FMOE 5AP7A 3IQ7A 3BYUA 3QYZA 2C0OA 3I0OA 4FKIA 2XA4A 3KVWA 3KMWA 3Q32A 4ZSGA 5HG9A 4LMNA 5EKNA 4GU6A 4I41A 4TWNA 2WMRA 2YWPA 4USDA 5AP1A 4U6RA 2OG8A 4AU8A 2E9UA 3JS2A 3POZA 4OTWA 5FBNC 3M1SA 4ZZOA 5IQIA 5LVOA 2YIRA 3FZTA 1Y6BA 3R9NA 4YUQA 2X0GA 4RJ6A 4APCA 4PP7A 5HTCA 4UXQA 5CEIA 4G9CA 3CPBA 5ACKA 3ATTA 3LLAA 4R6VA 3BU3A 5EI6A 3WBLA 3NYNA 4EZ7A 3C4CA 1WVWA 3LOKA 2WFYA 4DH1A 3EOCA 4DH5A 4YTCA 1M14A 2ITVA 1YXSA 2ETRA 4XJ0A 4FT0A 2W1CA 5AP6A 4HVDA 5LCJA 3LW0A 2XK4A 3BYMA 3DGKA 4C2VA 3MDYA 3F5GA 3ZBFA 5A54A 1H01A 3A99A 4NW6A 4QMTA 5LOHA 4D1XA 4BDGA 5B7VA 2VGPA 1DM2A 5JMSA 3G90X 2GU8A 4W9WA 5J1WA 3ZCLA 2WMXA 4H3PA 1P4OA 2B55A 2WOTA 5LMKA 1AQ1A 3IW6A 2EWAA 3C13A 4N4SA 3KN6A 1YWVA 3QGWA 4J53A 2PMLX 2C3KA 2W17A 3GENA 4DITA 4XOYA 4AZFA 3R7YA 4PDYA 4FSZA 4C59A 2R3HA 2YZAA 1Q62A 5IISA 3R01A 5CEOA 3POOA 4EYJA 4FT5A 3TKIA 3VBWA 5FRIA 3R7UA 1MQBA 5IQDA 4BGQA 5D12A 5FBOA 1H00A 3V8WA 3MN3A 3D14A 4FNZA 1PXOA 3DAKA 4XV9A 3EZVA 2QOHA 4J99A 1OBDA 2VWBA 3UVQA 3UYTA 2HIWA 3PXRA 2EVAA 2R9SA 3PG1A 1CMKE 4R8QA 4OTHA 5M55A 3SG8A 1R78A 3QWKA 1R3CA 1REKA 4F6WA 3BQCA 3OHTA 4DG0E 5EHLA 4Y46A 4G1WA 3OW3A 3TNIA 4PMSA 4Y8DA 3DDPA 4IFGA 2CGVA 5FTOA 4ACCA 3FC1X 5FP6A 3BE2A 4WIHA 5HO6A 2XVDA 1AGWA 4L42A 2YZLA 2YISA 1XBAA 5GNKA 4LYNA 3DBCA 5J9LA 4YZ9A 3VIDA 1UU9A 2V0DA 2UZBA 1V0BA 1Z9XA 2BFYA 1XQZA 4IX6A 3FAAA 4BCPA 2QONA 2OLCA 2VO6A 1T45A 2BAJA 3F7ZA 1OUKA 5HZNA 4GEOA 4PDPA 4XUFA 1ZOGA 1YW2A 3ORNA 4PNIA 3GVUA 3UBDA 5JT2A 3CSVA 3IW5A 1WBVA 1YDTE 3UP2A 2PUIA 2JKKA 3CKXA 4IVAA 3ULIA 4HCTA 4EK6A 3F3ZA 2ZYBA 5CY3A 1ZARA 3FJQE 3GOPA 4MK0A 4TTHB 1RDQE 3ODYX 1JAMA 3CLYA 5HE3A 3DA6A 5A14A 3WF6A 4EI4A 3ZBXA 5AUZA 5KBRA 2RIOA 4JS8A 2BZJA 1UWJA 4I24A 5E1SA 4C3PA 4OBOA 4WKQA 4H1MA 3VUDA 4DGMA 1JSVA 4QMOA 4P5ZA 3MTFA 3VULA 4DG2E 4DH7A 2PE1A 4CG8A 3OUKA 2W4JA 3COHA 4OTQA 3QWJA 1M7QA 2C6TA 4M84A 5HE2A 4JLCA 4W8DA 3AC2A 3ZLXA 3CQUA 5CI6A 3DXNA 4EBWA 3QQKA 5I4NA 2R0UA 4X0MA 3ZSIA 2B7AA 5K5NA 2RG6A 4ITHA 3VBQA 1BI8A 1BYGA 3P4KA 5K3YA 4RMZA 3BPRA 4O2ZA 4RWLA 1CM8A 5DG5A 3B8QA 5ACBC 3VUGA 4EOIA 5CSPA 5HU9A 3CQEA 1B39A 4AXAA 3ACJA 2Y0AA 1OKWA 2PUNA 4FF8A 3NVKI 4D5HA 3H0ZA 4DG3E 3NRMA 4NT4A 3AD6A 3F88A 3RM7A 5DFPA 3EN4A 4R5SA 2Y4IB 4M69A 3MVMA 4PMMA 4YSJA 4RWIA 4FOBA 3RNYA 3LCKA 1KOAA 4PMTA 4BBFA 3SW7A 4FT9A 4L43A 3R7IA 3E63A 1W0XC 5FG8A 4HCUA 1F0QA 1Y8GA 4GVAA 4U9AA 4AFEA 5LQFA 3A61A 3FY2A 3SHEA 3D9VA 1XJDA 4E20A 4X3FB 4GG5A 5HG5A 4DBXA 4DTAA 4JBOA 4QP9A 2ITXA 3CTHA 4WBOA 5F95A 5EYMA 2X4FA 4LOPA 1BMKA 3MIAA 5IU2A 3SDJA 4FSRA 5AUTA 2UW3A 4O38A 1JWHA 1LR4A 2GCDA 4TT7A 5LVPA 1YXXA 1U5QA 4RJ4A 5BPYA 5C26A 3FLWA 1OUYA 2EXCX 5CAVA 4JDHA 3BHYA 3N51A 4NWMA 4YSMA 2PYWA 1CTPE 5E8ZA 2VTNA 3ZEWA 3KCFA 4FSQA 4EOQA 3UC3A 4BBEA 4XEYA 4QMNA 3A4PA 3PA3A 3MY0A 2ZMDA 3KGAA 4XG8A 2VWIA 4Z55A 4ZTMA 4XV3A 3T9IA 3ZO4A 4D5KA 4HVSA 4FG7A 4UMPA 2GHMA 4UN0C 4U41A 5IH5A 5K9IA 3LLTA 3ZH8A 3TM0A 3EQIA 5H8GA 2WTKC 3WOWA 1ZYDA 3A7FA 3OF0A 4ZP5A 4PY1A 2JIIA 4ANMA 4QP3A 5JN2A 3P7AA 3UMXA 4L3JA 1XH8A 4O21A 4CEGA 4Y85A 2G1TA 3GCPA 5T6KA 5J95A 3SX9A 2WO6A 4GK2A 1Y91A 4G3CA 2ZV9A 3SD0A 3GC8A 2QNJA 3U6JA 3E88A 4C4HA 4I5MA 4TRLA 5M4UA 2XB7A 2WQNA 4BDDA 4LV5A 4C02A 1NVRA 2EB2A 2XJ0A 3MIYA 4FKJA 4IM2A 4JT3A 4U80A 1FVTA 3P78A 1BKXA 3TJDA 3EYHA 3D2KA 4RIYA 3PZEA 3EZRA 4BWXA 1WVXA 4UX9A 1NA7A 3U54A 3MPMA 3O96A 4FUXA 3MA6A 3CPCA 3LCOA 4QMPA 5BUIA 4J52A 5CENA 4FV0A 4YJTA 4O0WA 3R8LA 2EU9A 3HV3A 3MY5A 2HELA 5C8KA 3CGOA 3MVJA 3Q4ZA 2CLXA 2P2HA 3LJ0A 1KWPA 3UO4A 5CAUA 2BRHA 4HOKA 4E93A 4HNFA 4CKRA 2J51A 5LVMA 1ERKA 1ZXEA 3C9WA 2HXLA 3DB8A 2F57A 4X6QC 4YP8A 4ZXTA 3TIZA 3WZUA 4FKQA 5IEYA 5M08A 2PVRA 4AG8A 3UIUA 4XP2A 5IA2A 3IG7A 1W8CA 5CSVA 1PRYA 5KHXA 2ZV2A 4I92A 4L52A 4P2KA 4LV8A 1H28A 2XNMA 3W8QA 2WB8A 1R39A 4QMZA 3L8VA 4I4FA 3FHRA 5D41A 1MP8A 2PMNX 4XG7A 4EUTA 3FYKX 3BWJA 3LXNA 1ZY5A 4QMVA 1SMHA 3PPZA 4IEBA 3LFSA 3HYHA 3NIZA 3R1NA 3NUPA 4B0GA 4NCTA 4O1PA 3TI1A 2IZSA 5AUXA 2YACA 4IWDA 4EOSA 3UODA 5BX0A 5AFVA 1J7LA 3NYVA 3BHVA 4HYHA 4ZZNA 1NT2A 3L1SA 4IC7A 1H1QA 4IAKA 5E8VA 5EQEA 4Y72A 4QYHA 4YLJA 3M2WA 4FKUA 3HV6A 4FKLA 3THBA 4BIEA 2GPHA 2YDKA 1UWHA 4QNYA 2X9EA 3EQFA 4ZEGA 4U8ZA 4EL9A 3FMLA 4L46A 1M2PA 3R6XA 3S0OA 2WEIA 4AUAA 3PUPA 2GDOA 3G5DA 1SYKA 1RQQA 2PZYA 4ARKA 2IZUA 3KFAA 4GK3A 3ORMA 3ZLSA 3N4TA 4EK5A 5L2WA 5AR2A 4LGHA 1UA2A 4P5QA 2O0UA 3NVMB 3HP5A 1H26A 4GJ3A 3H0YA 4TYIA 5K4JA 4BDCA 3ENHA 3GU4A 1NVSA 4BIBA 4IAFA 3CJFA 3MFTA 5HCYA 3MESA 4NM7A 2RG5A 3ORLA 1PXLA 3HAMA 3GGFA 4R1YA 4FMQA 4XG3A 4V01A 4PMPA 3FI4A 3B2WA 4UV0A 4C4JA 3HMMA 2JITA 3IDBA 5AM6A 3AMBA 4RA4A 5FLFA 4V04A 1VR2A 2ETMA 2VNYA 4MXAA 2VTHA 3O2MA 2HXQA 4QP8A 5AR7A 5J87A 5IDNA 2ONLC 1T46A 4FKWA 2WQBA 4EHVA 3Q9WA 3V5LA 4O86A 2WMQA 4L00A 4YNOA 4DEGA 4BDIA 2GHGA 3G51A 3Q2MA 2YM3A 2GQSA 4IZ7A 1WAKA 4X2KA 4C33A 4FK6A 3R02A 3MB7A 5F94A 4Q9SA 4PDOA 4EKKA 2R7BA 2Z7LA 2ZAZA 4N70A 4X2NA 2OFUA 2BHEA 1UNGA 4IE9A 2C0IA 1UNHA 5CVFA 4GJ2A 5HG8A 2RFSA 2H9VA 1PXPA 4LUEA 3VHKA 1GZNA 2IVTA 3MPTA 5CS6A 4EH5A 2ZVAA 1U46A 3W1FA 5KKRC 3KN5A 3Q52A 4M69B 3C1XA 3QZGA 4YO6A 1OI9A 4D1SA 2XEZA 4EH2A 4H3BA 3PLSA 4JJRA 4QPMA 5DR9A 4Y5HA 5ANGA 4B7TA 4JI9A 4RBLA 3ZFMA 1H1PA 4FKSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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