3S4QA

P38 alpha kinase complexed with a pyrazolo-triazine based inhibitor
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
349
structure length
326
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAATRWYRAPEIMYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine C6-ketones as potent, orally active p38α MAP kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 326
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3s4qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3s4qA01
3P08A 3NAXA 3IW5A 4FSUA 4HYSA 4RBLA 4LUDA 3RAWA 3SW7A 3R8ZA 2EU9A 3R8VA 5IUHA 4KNBA 2XBAA 1YI4A 4QTDA 5K9IA 1H26A 1OPKA 4UWBA 2WKMA 3ZO3A 1I44A 4RZVA 3VNTA 4Z3VA 1UNHA 3PXKA 3PY1A 4FKVA 2Y6MA 1OUKA 3SHEA 3CR0A 5L6WL 4E26A 4MKCA 3DK3A 4C8BA 2RKUA 5HG8A 3TDWA 2PZ5A 4TYIA 3W2PA 1FVTA 4O27B 4OAVB 5GIPE 3KB7A 4UMUA 1SNXA 4QP6A 5AV0A 3LAUA 4L52A 4DF3A 4G6OA 3FI4A 5FQDC 5D1JA 5HLPA 4DH5A 4JDIA 4EK3A 1GZ8A 2F2UA 4U9AA 3EWHA 3CSVA 1PMEA 3SOCA 2VTNA 1SMHA 4GJ2A 1OL7A 4BDKA 3OXTA 4DEHA 3I5NA 1XBCA 4DFLA 4KD1A 3IONA 4IC8A 1H28A 2ITPA 2UZWE 4NEUA 4NW5A 4PQNA 5CX9A 1FBNA 4YC3A 3OWLA 4DINA 2IJMA 4CCUA 4XX9A 1ZMUA 4G31A 3EQFA 4FA2A 1YOJA 3IG7A 4B4LA 4ZZMA 3BBWA 4NWMA 2CKOA 4FV5A 5BQ0A 2WQOA 4EHZA 5CAUA 5IQFA 3VQHA 4IIRA 2OJJA 5BVKA 4DT9A 1IG1A 4IFGA 4BDAA 2YIXA 1W84A 3DAJA 3LFAA 4U80A 5L8KA 5CYIA 4TYEA 4YTFA 5CWZA 5M57A 3BPRA 3IDCA 1H27A 2NP8A 3Q32A 1BLXA 3MPAA 4JAJA 3DBCA 2QOIA 2R5TA 2B55A 4FIIA 4DFXE 5HCXA 4P5QA 3L9PA 4M15A 3NNVA 3QWJA 3O50A 3NWWA 3ZBFA 4BDHA 2PVLA 4WNKA 3B8QA 4DLJA 2OXDA 1E9HA 3QD2B 4BC6A 3C0HA 1UU9A 4EH2A 4J96A 3Q6WA 1O6YA 5IA4A 4YP8A 3DU8A 1DI8A 3HVCA 4YR8A 4PP9A 2YIQA 4UWYA 1OVEA 3OFMA 1GAGA 5DNRA 3UJGA 4HGEA 4KKGA 1ZYCA 1OL2A 3TNQB 3ZLSA 2UVXA 3HA6A 4C62A 4O7TA 3BEAA 4NKAA 3A4OX 3PUPA 3WZDA 2IZUA 5BVWA 3F7WA 4U42A 2JDVA 4LL0A 4YLLA 2QCSA 2UW8A 5AM6A 3NZ0A 4WIHA 3JY0A 5C8MA 3BHTA 4RWIA 4W4VA 4WOVA 5ANDA 4YNEA 5EYKA 3C4XA 3QA0A 3UVRA 2YFXA 4OBOA 4C3PA 3DZQA 5ANGA 2XK7A 4FZ6A 1DM2A 3C0GA 4G17A 3BLHA 4QYEA 5AX9A 4AZVA 4EZ5A 3RNYA 4U5JA 5E92A 3AXWA 3Q9WA 1HCLA 5DT3A 4JLCA 2WTVA 4MVFA 5FXSA 1REKA 3NCZA 3Q3BA 5ANOA 3SVVA 4ANQA 3F5GA 2E9VA 4A9RA 4C4FA 2HYYA 3MBLA 3RINA 1B38A 3AC1A 5KMMA 4PDPA 3EIDA 2IWIA 4XP3A 4YO6A 4HYUA 4EQUA 4E6AA 4UYNA 4FKRA 3ACKA 1OM1A 1VEBA 3BGPA 4IVAA 4MX9A 3VUMA 4DGOA 2IW8A 3BQRA 3NX8A 3PG1A 1K3AA 1JWHA 4UYAA 1Q5KA 2XS0A 4L01A 3TZ9A 2CKPA 5AM7A 3QZFA 4L9IA 1TQMA 1W7HA 3V6RA 4CMOA 3KXZA 4Q2AA 3NR9A 5LCJA 4J95A 3UC4A 4TY1A 4X3JA 1W83A 5JFSA 3UZRA 4RRVA 4I20A 2HXQA 2HZ4A 4H1MA 2EUFB 3ULZA 2BALA 1KE7A 4EH7A 4KRDA 3HMPA 3NDMA 3R6XA 4U97A 4ZJVA 4G5PA 1OKZA 3OMVA 4GT4A 3ZUTA 5HKMA 3DLZA 2DUVA 3UYTA 2XEZA 3HNGA 3JUHA 3LM0A 3Q4CA 5A4LA 2IO6A 4X0MA 3C4ZA 3PPJA 3IS5A 4RZWA 3PA4A 4C35A 2HZNA 3W32A 2QVSE 5BVNA 3EKNA 5KZIA 4C4GA 3QRJA 3P78A 1ZZLA 4FGBA 4L3PA 3ORTA 4FG9A 3TV7A 4AE6A 4R5SA 3FI8A 5CEPA 3QQFA 5L8LA 3QD0A 3UO4A 3IGGA 1S9JA 3F3VA 2Z7RA 3CIKA 4L53A 1GIHA 3VUGA 4C4JA 1LEZA 1A9UA 2QLUA 3FMHA 3GQIA 2XVDA 3MTLA 1Z5MA 3BE9A 5JEBA 4IZYA 5KMJA 2X9FA 4QPMA 1CMKE 4AQCA 3MH3A 4RIWA 4XYFA 2R3GA 2CHLA 2J0IA 3BGQA 1ZRZA 3AGMA 3DDPA 4NT4A 3BV2A 5D10A 4QQCA 5FDXA 5JH6A 3K54A 4M0YA 2HZIA 2YABA 4ZTLA 3EQBA 3ZO1A 4G1WA 3PWYA 4XG4A 5ETFA 2YACA 1FGKA 2GNHA 1GJOA 4YJQA 4YHTA 5C01A 3CS9A 1URCA 4QMUA 2I0EA 3AD5A 3TNIA 2VO0A 2XYNA 4IZ7A 3SKCA 4TW9A 4P4CA 3E8DA 5CT7A 3W2OA 3FL5A 4IC7A 4KIQA 2GU8A 5CF6A 2JGZA 4USFA 4R3CA 4GKHA 4YUQA 1NY3A 2QO7A 3EFWA 3KY2A 3CJGA 3FXWA 1PXPA 3KVXA 4RIYA 4ZS4A 1LP4A 3BLQA 2WMVA 5ETAA 2XA4A 4F7LA 3JVSA 3TUDA 5DIAA 3I79A 3ZO4A 5I4NA 4EKKA 2E9UA 2PVYA 5AMNA 2OLCA 2CGUA 4C58A 1DAWA 4NJDA 3B2TA 4V05A 3RK5A 3R00A 2X2KA 4EONA 3SV0A 2OK1A 5K4IA 5C4KA 4LUEA 1BX6A 3U4WA 3RK9A 4CKJA 2V5QA 5CLPA 4ZEGA 3QTSA 5T3QA 2Y4IB 3GEQA 2PVFA 4A06A 4YSJA 4CFXA 5IEXA 5KMIA 4R8QA 3UQFA 3LFSA 4CKIA 3Q9ZA 1SVHA 3EJ1A 4YJOA 5CVFA 2PWLA 1LR4A 2XIRA 4I0TA 1Y91A 3WYXA 4FV2A 3VBWA 4CCBA 2UW7A 1QCFA 2GFCA 4GG5A 3KMUA 3QTXA 4EHVA 1OUYA 3TNHA 4O7WA 1YOLA 5GHVA 3EL8A 3PXYA 4BTFA 1ZWSA 2R3HA 2WMAA 2X2LA 4W4XA 4EQCA 5CANA 2J7TA 3NPCA 1OKYA 3K5VA 1PYXA 4GIHA 4WO5A 5JRSA 3LHJA 4O86A 5ANKA 2PVJA 2XIKA 1XBBA 3LIJA 5KBQA 5C8KA 4ZMFA 1UKIA 4IAYA 4EZ3A 3LFQA 1OMWA 3MI9A 2GSFA 4FF8A 4M8TA 3N9XA 4OTPA 2BTSA 4ZY6A 3HAVA 4FV9A 2QNJA 3OT8A 4ZTHA 3E87A 1ZLTA 1CM8A 1V0PA 2E2BA 3FKOA 3LCKA 4AOTA 4EBWA 4ZLOA 3BGZA 1PXOA 5DLSA 4YTIA 3KULA 3OOMA 4RJ6A 3QQUA 3P5KA 1RJBA 3IW4A 2LGCA 4GT5A 4FV8A 4GYIA 3O71A 3HLLA 3QU0A 5EDPA 5KMOA 4OUCA 3FSKA 4UZHA 2X4ZA 4H3QA 1QL6A 2ZM4A 3PXFA 5IQIA 2QLQA 4HGSA 3OCBA 5I9WA 2O64A 4NM0A 4RQKA 2ITTA 4E8AA 1DAYA 3FQSA 3PTGA 2VWYA 4C4EA 3RCDA 5KMKA 3DA6A 3ZSIA 4GIIA 4W8DA 4F09A 4FEVA 4ZIMA 4UALA 4FTCA 4GUBA 3HRCA 1DS5A 3EOCA 3QYZA 2Q0BA 2EWAA 3AC2A 2XIZA 2J51A 4ASZA 2Z2WA 4XRLA 3BYMA 2VUWA 3SG9A 4LL5A 5LMKA 3DTCA 3KRJA 3Q9YA 4X6RA 4ZSLA 3A7IA 4FE2A 2YM3A 3GT8A 2WXVA 3ATSA 2CPKE 4IAIA 4BICA 3V5JA 1P2AA 5AR5A 3CD3A 4JDHA 5EHYA 3KRRA 4EOIA 1WFCA 2HIWA 3LVPA 4TWNA 4OAUC 2HWOA 4FSZA 4BCKA 4O7SA 4DG3E 5CEKA 4R7BA 3OF0A 2AC5A 3F69A 3GOPA 3NUXA 3VRZA 4YHJA 4FTIA 4NCTC 2W9ZB 3D4QA 2R3LA 4I5PA 5M4CA 3GU6A 3PSDA 4FKIA 4IDTA 5IU2A 3FKNA 4I0SA 3DBQA 4C2VA 1PMNA 3DXQA 4HOKA 5HIBA 3DV3A 2BPMA 4AE9A 5EKOA 4E1ZA 3GCVA 1JVPP 2VX3A 3CP9A 3DXPA 4R1VA 4FZFB 1U54A 4JG8A 4OTDA 3U6IA 4DYMA 4AZSA 1U54B 4X2NA 3ZC5A 3BBTB 5AP6A 4DEAA 1QPJA 4FVRA 5IUGA 2RG6A 1Q8UA 3OVVA 4HVDA 3MY1A 5LWNA 3ALOA 3C13A 4FSMA 5I9VA 1GY3A 2KULA 3QUDA 2WNTA 2YLFA 3UOLA 4TT7A 5E8TA 3MY0A 1YHVA 5CSHA 3VW8A 4FC0A 2WEVA 3CCNA 4BDBA 4UMTA 5IA2A 5L6PA 2C4GA 2WMUA 5EQEA 4FZDB 4S2ZA 1MQBA 4EKLA 3QTZA 4AN3A 2BAKA 4G34A 3CGFA 5KE0A 3TACA 4DTKA 3S0OA 2WQBA 2UV2A 2FO0A 5DRBA 4AP7A 3UVQA 3NEWA 4EH3A 5IMXA 4R5YA 4JJRA 5ACKA 5FTOA 4MEDA 4AGDA 4ZTRA 4FODA 3P9JA 4BBFA 4IZ5A 4I24A 1VR2A 2WPAA 3IW8A 3C1XA 4G6NA 3FMJA 4XNEA 3V5TA 4CG8A 1STCE 4FK6A 4J52A 4YTHA 1ZOEA 1OZ1A 3F66A 3NNWA 3RPVA 3CGOA 3QRKA 1FGIA 4FIJA 4OTGA 4R1YA 4ACMA 1JBPE 2X81A 4DBXA 3QGYA 4D2PA 4EOJA 4RIXA 2XJ0A 3MFSA 4I5CA 2EXCX 4HPUE 4RIXB 1KUTA 3CJFA 4BDEA 3RAIA 2C3JA 2C6DA 2QI8A 2JIIA 1OL5A 3FAAA 5CEIA 3ZHPC 5J9LA 2Z8CA 3EYGA 4PMMA 4X2KA 3Q2JA 3HV7A 3OWJA 1RE8A 3TTIA 3BHHA 2XK8A 1OPLA 3E3PA 3LW0A 5DT4A 2EVAA 3PA5A 3UPXA 4D2RA 4E3CA 2RGPA 2EXMA 4OTRA 4AW2A 4II5A 4QPAA 3F5PA 4B7TA 4FL1A 5CSXA 5EDRA 1OECA 1MQ4A 2O65A 3MH2A 2BRNA 4XMOA 2BDWA 2X9EA 5IA1A 3P79A 1Y8YA 2YEXA 4D58A 4C36A 4ZSGA 3T8OA 3VS3A 5CSPA 2E9PA 2GNIA 3BIZA 4M84A 4J71A 3ZZWA 3C50A 2H34A 4JXFA 4RA5A 3ETAA 4AACA 3FZ1A 2ESMA 5FRIA 2C5NA 4GVAA 1Q97A 4IM3A 4WRGA 2PPQA 3PE1A 2VTTA 5KO1A 4MXAA 4R3RA 5LARA 1UKHA 2B7AA 1BL6A 4MBLA 4P90A 5JGDA 2UZDA 2XJ1A 2X39A 2OJIA 2WIPA 5HE1A 3TV4A 4EHGA 2OIBA 3KN5A 1E1XA 3OOGA 5JGAA 1OIRA 2ZAZA 2QOFA 4BWPA 2R7IA 2UW4A 3F88A 3KKVA 2NRUA 5DEYA 2I0YA 3GI3A 3MESA 4O0WA 3BQCA 2GS6A 3FPMA 3E8EA 2B53A 3MTFA 2YIRA 4NH1A 4KABA 5BPYA 4KSQA 1E1VA 3W2QA 4CMTA 2JDOA 4FV0A 3VF9A 3W1FA 1KOAA 4QP8A 3KMWA 1ND4A 4BTJA 4FNXA 4XBRA 3OWKA 1F3MC 1W8CA 3JXWA 3G0EA 5DI1A 5TF9A 3TI1A 2QO2A 4I93A 3UVPA 3UP7A 2Z02A 2I40A 4FIHA 3QCYA 4TL0A 2VWZA 2Y7JA 3ELJA 2R3PA 3HEGA 2JC6A 4LQMA 2HK5A 3FI3A 3ZM9A 4PTGA 3R8UA 2Y0AA 3DJ5A 2CCIA 3LFCA 4EEVA 1WAKA 3PIZA 4XV2A 5CQWA 4TWPA 5L6OA 5CF8A 4DTBA 3C4CA 4XG6A 4CFVA 1QMZA 4D55A 4USEA 3OCGA 4IANA 3MVLA 4JAIA 3UZPA 4CQEA 3R1QA 4P2KA 4L3LA 3G6HA 4U43A 4YJNA 4FBXA 2PVRA 3WYYA 3HUBA 4TYGA 4H05A 2W7XA 3D5WA 3U4UA 1LPUA 2CN8A 3SXRA 4IB1A 4EBVA 4QQTA 5JSMA 4NFMA 5HNGA 1YVJA 4YNOA 1H00A 4QNYA 2XB7A 3RZFA 4G3EA 5IQCA 3ULIA 3LQ3A 2OXYA 3RBWA 4FTOA 4XJ0A 5DOSA 4RFZA 3O7LD 2ITVA 5AA8A 5EOLA 1KE6A 2YERA 3V04A 2J90A 4M66A 3DXNA 1BI8A 4FG7A 1SNUA 2B4SB 4K8AA 4MXXA 4XV1A 4QP4A 4AGCA 5IH5A 4QT1A 2A19B 5HE0A 4UX9A 3MV5A 4J8MA 4KIPA 4QO9A 1KSWA 4PV0A 2XJ2A 5IISA 3O7LB 3BYUA 2JIUA 4PPCA 3PZEA 3R7YA 3KVWA 5M56A 2UZUE 4IX6A 3E64A 4UMQA 4V01A 4UWCA 4DHFA 2OF2A 2VTRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P08 A;  3NAX A;  3AKK A;  3IW5 A;  4FSU A;  4HYS A;  4RBL A;  4LUD A;  3RAW A;  3SW7 A;  3R8Z A;  2EU9 A;  3R8V A;  5IUH A;  4KNB A;  2XBA A;  1YI4 A;  4QTD A;  5K9I A;  1H26 A;  1OPK A;  4UWB A;  2WKM A;  3ZO3 A;  1I44 A;  4RZV A;  3VNT A;  4Z3V A;  1UNH A;  3PXK A;  3PY1 A;  4FKV A;  2Y6M A;  1OUK A;  3SHE A;  3CR0 A;  5L6W L;  4E26 A;  4MKC A;  3DK3 A;  4C8B A;  2RKU A;  5HG8 A;  3TDW A;  2PZ5 A;  4TYI A;  3W2P A;  1FVT A;  4O27 B;  4OAV B;  5GIP E;  3KB7 A;  4UMU A;  1SNX A;  4QP6 A;  5AV0 A;  3LAU A;  4L52 A;  4DF3 A;  4G6O A;  3FI4 A;  5FQD C;  5D1J A;  5HLP A;  4DH5 A;  4JDI A;  4EK3 A;  1GZ8 A;  2F2U A;  4U9A A;  3EWH A;  3CSV A;  1PME A;  3SOC A;  2VTN A;  1SMH A;  4GJ2 A;  1OL7 A;  4BDK A;  3OXT A;  4DEH A;  3I5N A;  1XBC A;  4DFL A;  4KD1 A;  3ION A;  4IC8 A;  1H28 A;  2ITP A;  2UZW E;  4NEU A;  4NW5 A;  4PQN A;  5CX9 A;  1FBN A;  4YC3 A;  3OWL A;  4DIN A;  2IJM A;  4CCU A;  4XX9 A;  1ZMU A;  4G31 A;  3EQF A;  4FA2 A;  1YOJ A;  3IG7 A;  4B4L A;  4ZZM A;  3BBW A;  4NWM A;  2CKO A; 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