3SC1A

Novel isoquinolone pdk1 inhibitors discovered through fragment-based lead discovery
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
287
structure length
278
Chain Sequence
QPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIKENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDETCTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSNFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYDFPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel isoquinolone PDK1 inhibitors discovered through fragment-based lead discovery.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 278
sequence length 287
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3sc1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3sc1A01
4R77A 2J51A 2C6MA 5GJGA 3VS0A 3PP0A 3VC4A 4CFNA 1V0BA 4J53A 3KRRA 4FIHA 1NY3A 4EUUA 3E8NA 4DAWA 5EI8A 3CQEA 3MH3A 1PXNA 3U4UA 4ASXA 4MK0A 4EH7A 2VWIA 2W1HA 3L8XA 2J0LA 4EZ5A 3Q4ZA 5CU2A 3UO5A 2VRXA 2PULA 5L8KA 4R5YA 5AAFA 5C9CA 3KMMA 3Q04A 2JITA 1MRVA 5KMKA 1S9JA 4MTAA 5L4QA 3HMNA 3NPCA 5HIDA 4BGQA 5M55A 1ZYLA 1YWRA 5HCZA 3UBDA 4XBUA 3L1SA 4EBVA 4NT4A 3OOGA 3DQWA 2GDOA 3QRUA 4EK6A 3HP5A 4FKVA 3MBLA 2HW7A 2YCRA 4FSNA 1NXKA 1YDSE 3NLBA 4XUFA 3OBGA 2PUNA 2W5BA 4D1ZA 4F6UA 1H1PA 5A4QA 3JPVA 4C59A 2PU8A 2O5KA 3OCSA 1Y8GA 1SMHA 1YXXA 3VNTA 1DS5A 4O0UA 2CN8A 4OT5A 5L2SA 2ITYA 1Q61A 3R9NA 5GINE 4FIFA 5DA3A 3HMMA 5HLPA 1M17A 3LCKA 2WNTA 1ZYCA 4BCGA 2LGCA 4I20A 4G3FA 4WSYA 5HESA 2IW9A 3ULIA 2X8IA 5IG1A 3F5UA 1H0WA 2VTSA 4TNDA 3P79A 4BWXA 5CYIA 3IK3A 4Y95A 3VS3A 3OCTA 2CNVA 4DINA 3LCOA 3E7OA 3FMMA 4YZNA 3CXWA 5K3YA 4FMQA 4EONA 1UWJA 4FTQA 3K54A 4FV4A 4ZMFA 1ZARA 2YHVA 3NGAA 3T9IA 2UZBA 5IH5A 4AU8A 4U6RA 4TT7A 1JVPP 4ZSJA 2GHGA 4B99A 3NUAA 2OXDA 1Z9XA 4EZ7A 4W4VA 2PL0A 2YM6A 2ZM1A 4AF3A 5H8BA 4I23A 3NR9A 3ZOSA 3AMBA 2PVJA 1PYEA 4WSQA 1OKVA 4DGLC 2ETMA 3ORKA 2CGWA 2UUEA 2C6DA 4LGGA 3TZ8A 5BVDA 4U97A 2IW8A 2JIVA 2EXEA 4ZJVA 5ANKA 3BYSA 2CGUA 4JBQA 3CQUA 4DGGA 4D4YA 2XMYA 4RFMA 3ANQA 4GG7A 5KUPA 3I7CA 1UNLA 3HA8A 4B6LA 3AMAA 4FT7A 4UZDA 4L53A 1TKIA 3UZPA 2JGZA 3I4BA 2BRBA 1G5SA 3SAYA 3AQVA 2LAVA 3FI2A 4IFCA 5HU3A 4LMUA 5ETCA 5HKMA 4X2JA 3U6IA 3OW3A 4YJNA 3O51A 3A8XA 4QP1A 3FQSA 1PY5A 2WU6A 3DTCA 2BAKA 3NYVA 4X2NA 1YI4A 4WT6A 3RNIA 4BRXA 3W2QA 3DXQA 4IJPA 2IZUA 2W1ZA 4JDKA 4RG0A 4L3LA 2VTNA 3ZO4A 1PMEA 5ETIA 4ERWA 3IECA 4PPCA 4N57A 4NH1A 4YBKA 1QPJA 2XNNA 3R9OA 3W8QA 4ZLYA 2XVDA 2OIDA 2X0GA 4FUXA 3LFEA 4I5HA 3RHXA 4BDFA 4C3FA 4RQKA 4RGJA 5GNKA 4F7LA 2OXXA 4C3PA 2PSQA 2HELA 3TT0A 2OF4A 4JDIA 3UOKA 5A54A 2F2CB 2WO6A 4QPAA 4FIEA 3HAMA 4R7IA 3VUTA 2P33A 2QOOA 1OL2A 4LQMA 3ZDUA 4FICA 4BKZA 3GFWA 1IRKA 2QVSE 3ORTA 4GK4A 3AMYA 4GW8A 4X2GA 1IA9A 2CKEA 2XNEA 2FSLX 4XJ0A 1H1QA 4ZTQA 4GFOA 1WBWA 1CKIA 3LFAA 3SA0A 4EH3A 4GCJA 3ZMMA 4TWNA 4RQVA 5LMKC 2XNBA 4HZRA 2VX0A 2VU3A 2YERA 2XYNA 4LI5A 3UC3A 5JZJA 4ZS4A 4JQEA 1GJOA 2OKRA 3I5ZA 4YZCA 4D1XA 3LXNA 4FIJA 4EHEA 3E93A 4D5KA 4RJ6A 1VEBA 3IDPA 4DEEA 3CJGA 4CG9A 2A1AB 4DFUA 2Q0NA 2PVYA 3O7LD 4PL4A 5IA5A 4IE9A 5DPVA 1VR2A 3RM6A 5JH6A 3A61A 1H4LA 3C4EA 2ZM4A 3PJ1A 5CX9A 2OI4X 3C4FA 3QLGA 4CFVA 2UZEA 4O0VA 3FLZA 4BC6A 3A7HA 3EOCA 4EOOA 3SW4A 2QOQA 4QQ5A 4QMXA 2YZAA 1URWA 4PP9A 4O7LA 5CAPA 3GC7A 3E7VA 4P7EA 4QMOA 3RPOA 1R1WA 4DG3E 4R1VA 2QOKA 5LVPA 2UZNA 4B4LA 1STCE 4FG7A 4FBXA 3ZFYA 4IX4A 5KBQA 5B7VA 3D5WA 3M2WA 1G8AA 5C01A 4NZWB 5ACKA 5HLNA 5IUGA 5HG7A 4AZWA 3BZ3A 1AQ1A 1J3HA 2C30A 2XRWA 2ZV2A 4I5PA 5T68A 3V5LA 3RK7A 1XWSA 5CEKA 5A4EA 4Z9LA 3LZBA 2WEIA 3F3WA 5I9VA 5ANOA 3KCFA 1YDTE 3D94A 1PYXA 1JWHA 3F5GA 4GT5A 1ZMVA 4QMSA 4UN0C 5AEPA 2BRHA 3NEWA 4G6OA 1OL6A 3ZLWA 3BYVA 3MPMA 3KF7A 3GQLA 2EWAA 3KXHA 3TXOA 5D7VA 3G15A 2AUHA 1R78A 2QR7A 4AE6A 5AA9A 3C5IA 5IMEA 4C4EA 2CCIA 2YDJA 3ALNA 1GZKA 4BICA 1OITA 4GH2A 5ETFA 3GUBA 3R7OA 3AC2A 2PWLA 4DYMA 2C0TA 5LCKA 1OECA 2XIZA 4E73A 4O7SA 2HAKA 4OTWA 3C4ZA 3JY0A 4XG4A 3R6XA 4P4CA 3V5JA 2DWBA 3MN3A 1UVRA 3ZSHA 4BDGA 1V0PA 3TZ9A 5HI2A 3Q96A 3BLHA 3BKBA 2YIWA 2OSCA 3FZOA 3PZEA 2VTOA 1CSNA 4G17A 4CD0A 5CEMA 1OUKA 5I9YA 3MTFA 4IX5A 2Y9QA 3O71A 3OZ6A 5CSHA 3TZMA 4BBEA 2IG7A 5L8JA 3QALE 5AAGA 4LFIA 4JQ7A 4QP4A 4KABA 3DKGA 3TNQB 1Y91A 3LJ0A 4TYGA 2GHMA 5FQDC 2H8HA 5KHXA 4CV8A 3Q53A 4UBAA 2JFLA 3UIBA 4F63A 3BGZA 1H28A 4DG0E 2CMWA 4EQMA 1YW2A 2XIXA 5AX9A 3CC6A 4UB7A 3FZTA 4C62A 3MI9A 1ZOGA 3SLSA 3EL7A 3Q60A 3LFCA 5J9LA 1P5EA 3OG7A 4GU9A 4BWPA 4HVGA 2QD9A 5DT3A 3VF8A 1YOJA 3H4JA 1Q41A 4IB1A 1O9UA 1KWPA 4FODA 4O22A 4YJPA 3CP9A 5DRDA 4EOJA 4DTAA 1B39A 1M52A 2WQNA 3QTWA 4G3CA 4PTEA 4BBMA 2BCJA 2PMIA 4DEBA 5BVNA 5IU2A 3N4UA 2X9EA 3QYZA 2JAMA 4ASEA 4FV8A 2G2HA 2J5EA 2EB2A 3F88A 3UQGA 5FEDA 4IWQA 5JFXA 2OFVA 3BHUA 3F82A 3PPZA 1YXUA 4WBBB 5DR9A 3G6GA 3IPHA 5EM7A 2WMQA 4FTUA 3K5UA 4AT5A 5E8VA 3QC4A 4O6EA 3OEZA 1TQIA 2RF9A 4JNWA 3TEIA 3RZFA 4ANLA 1ZAOA 1ND4A 2X8DA 2NP8A 5AP6A 4EH2A 4EZ3A 4MBIA 4AWIA 5KMIA 3S4QA 2FSMX 3F2AA 3RBWA 5CI7A 4AGUA 3RPSA 3SVVA 4APPA 3P23A 4DFNA 4XCUA 3ZM4A 5HTBA 4E26A 5C4KA 3A7IA 3D2IA 1MQ4A 3ZRKA 3Q9YA 4BCJA 1PXKA 5FWKK 3FBVA 4O38A 3R28A 4YJRA 3W16A 2C5VA 3TNHA 1PMVA 5CSVA 2X81A 2UZUE 2Z7RA 3VULA 4B0GA 3O23A 2PPQA 2C6KA 4MD7E 5B2KA 4KB8A 4KKGA 1P4OA 4A06A 4CMUA 4CKRA 3IDBA 3VIDA 3W2OA 5GJFA 5KNJA 4LUDA 4EEVA 5LWMA 3VQUA 3IW8A 2C68A 3CR0A 2JFMA 4AZVA 4ZXTA 3KFAA 2B9JA 5CU6A 4NTSA 1AD5A 5FM3A 4JIAA 1BX6A 1Z5MA 4G9RA 4P5ZA 4Q5HA 4EH8A 3EQIA 3S00A 4K9YA 5I9XA 4DGNA 3LE6A 5HBHA 3KXMA 5EDRA 4FR4A 1KUTA 1GZ8A 4G3DA 2I6LA 3QUEA 4JX7A 4QPSA 4C33A 4C0TA 5ETAA 5J8IA 3HMOA 1W98A 3L9PA 1XH7A 3UG1A 4RX7A 5H8EA 4IM0A 3R2BA 4YLLA 4PDYA 4IACA 2XEZA 5T3QA 4ZY6A 1WBOA 3QWKA 3OT3A 2QKWB 3RNYA 3COHA 3TV4A 3HUBA 5C1QB 4YTIA 4M3QA 3V8SA 4N6ZA 5K4JA 4L46A 3UVRA 2R7IA 3DS6A 4YTFA 1G3NA 2H6DA 4FV3A 4FVQA 2BMCA 2Y6MA 4FYNA 3R1QA 2C3IB 3DDPA 5HTIA 2V7AA 1I44A 5EYMA 4C02A 3VS4A 2PUPA 3CTJA 3C0IA 3DK3A 4LL5A 3U54A 3ZZWA 1M2RA 2A2AA 3F9NA 3HMIA 4IZAA 4GK3A 2P2HA 4AZFA 4D4SA 4YZ9A 4F6SA 4JRNA 3AD5A 2RL5A 1Q8WA 3EQGA 3F6XA 2R3OA 4KS7A 4IB0A 4XRLA 3WOWA 4N4SA 1PXOA 3FXXA 2BAQA 3R9RA 1YXTA 3PA4A 4E5AX 4O81A 4QYFA 4OT6A 4UY9A 3G2FA 4M7IA 4MXXA 3LAUA 4GFMA 4PMPA 5BNJA 1H24A 3QKKA 2WMRA 3E8CA 1WVXA 4XS2A 2PTKA 4BIDA 5FLFA 5LVOA 2X8EA 5HOAA 4O7WA 3RAWA 2IVSA 5K5XA 1YRPA 1J7LA 1KE9A 1FVRA 5HE0A 4D5HA 3HRCA 3TWJA 5EQYA 2SRCA 4ACGA 5IDNA 4FG8A 3AT2A 3NNUA 5EDPA 2WMBA 5EYKA 3KB7A 5AMNA 2X9FA 2WXVA 4MAOA 2HK5A 2PMLX 2RFEA 3MB7A 5HGIA 3PXQA 4RVKA 1L3RE 2X39A 3Q9WA 5M4CA 4AZSA 4EC9A 3LFQA 2W5AA 3AT4A 4AE9A 3ZXZA 5HZNA 2OZOA 3EN4A 3UE4A 2W5HA 2I40A 2XK7A 2ZV9A 4NM7A 4CEGA 4N6YA 4Y5QA 5EKOA 4UALA 3R1SA 4R3PA 1ZYJA 1YWVA 2OGVA 4TWOA 2OFUA 5HNBA 1F5QA 4U9AA 2OJIA 4NSTA 3FAAA 4JQ8A 3D15A 3SGCA 2XJ0A 5HO8A 3A4OX 3DLSA 3L9MA 3MH1A 4O82A 4GKIA 3Q9XA 1B38A 5H2UA 3ATSA 5AX3A 2BAJA 2BPMA 5AV3A 4CQGA 4CRLA 2R5TA 4U44A 4UZHA 5HIEA 4OAVB 2C6EA 3SHEA 4HCVA 4C37A 2P3GX 2WQEA 4TY1A 2WMUA 4PQNA 3GEQA 3POZA 5C4LA 3JYAA 2EXCX 5ANIA 2OLCA 3ZXTA 1J7IA 4FK6A 2YM5A 1BKXA 3KXNA 1U59A 2HY81 3DAKA 4IM3A 1KV1A 4ZJJA 4GK2A 3BGQA 4IBMA 3ET7A 1YQJA 5K5NA 3HGKA 3NUNA 4YLKA 3QD4A 5FM2A 5BUEA 5M53A 4WG5A 4FNWA 5AADA 4MHAA 4C8BA 3UZRA 3E5AA 5CU4A 2H9VA 3FMLA 3R2YA 4QP9A 4UMPA 2XIKA 3PVGA 4HYIA 3LLAA 4IEBA 3CBLA 4RC3A 5EHOA 4BCIA 4JS8A 3MVHA 5DMZA 3P4KA 4JDJA 1X8BA 5EW3A 3TTIA 4BYIA 3T3UA 2XKEA 5HORA 1RJBA 4ITJA 4KNBA 3VBXA 4FL1A 3R22A 3BIZA 5HICA 3QKMA 5EOLA 3LMGA 2VWUA 5L6PA 1HCKA 2Y4PA 4WBOA 4KAOA 3FC2A 3NYXA 3QX4A 2XIRA 1ZYDA 4DH3A 1FINA 2GS2A 3ACKA 4FX3A 4GSBA 3MSSA 4K2RA 3PWDA 2JDTA 4KKHA 2WQBA 3QA0A 2AYPA 1OKWA 1O6LA 4JX3A 5L2TA 3LXPA 4G1WA 1KOAA 4WUAA 3RCDA 5LCJA 3N4TA 2F7EE 5IISA 4Y46A 3ODYX 2GNFA 4YZBA 4LM5A 2CLXA 2VV9A 3HP2A 1DM2A 3MDYA 1H1RA 3V5PA 3DXPA 4KRCA 5L3AA 3NSZA 4L3PA 2NO3A 3KMUA 4FKLA 3GBZA 4IWDA 2GQRA 3U51A 2I1MA 2PVLA 5JK3A 4DH8A 1PMUA 2NPQA 5M56A 4O7ZA 4FKIA 4G5JA 5HG9A 4HYHA 3FMJA 4TWPA 3U4WA 4FKOA 2QOIA 4I24A 3UOHA 4DEDA 4DBXA 1MUOA 3BV2A 3Q9ZA 3WARA 3OY1A 2XK3A 4ANBA 3FDNA 4QMUA 3LCDA 2YN8A 3AXWA 4WHZA 3TV7A 2J0KA 2ERZE 4MCVA 2HW6A 5J95A 1OKZA 5F9EA 3HDNA 3A60A 3WIKA 4BCMA 4C4HA 4AGDA 4FV0A 2B9HA 4V05A 3POOA 4FL2A 3AC8A 4G31A 3WI6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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