3SW4A

Crystal structure of the cdk2 in complex with thiazolylpyrimidine inhibitor
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
298
structure length
279
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CDK2 in complex with a thiazolylpyrimidine inhibitor
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 279
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3sw4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3sw4A01
4XS2A 2X9FA 1H28A 3NEWA 1ZOGA 3D5WA 4GIHA 1U59A 4DTKA 2HW7A 4K8AA 2R3HA 2WMUA 2BDWA 4CFMA 5J1VA 4IJ9A 4JAJA 3WZKA 1Y57A 3LFSA 2AC5A 1ZYCA 4ID7A 3SQQA 3ZOSA 4FKVA 5AV4A 1H1QA 2A19B 3BEAA 3BU6A 5M4CA 1ERKA 1OITA 4HYSA 5IEYA 4F08A 4PL5A 4DBXA 4DITA 3GU8A 2GQSA 2GNIA 1AGWA 4RWIA 5I3OA 4A9SA 3B8QA 3LXPA 4G34A 3QD3A 3EN7A 2GQGA 2YCFA 3ZH8A 1ZMVA 1JSVA 2V7OA 5CU3A 3W10A 4USEA 5JEBA 4FKOA 4Y5HA 4PDOA 5FTOA 5DBXA 3KRLA 1KE6A 3R00A 1YXSA 4OBQA 3DJ5A 3COHA 3QHRA 3N4VA 2A4LA 2ZVAA 3DAEA 3FLQA 4G3GA 5C8NA 3PY3A 2HXQA 2W9FB 1Z57A 4EUTA 4MXCA 5HG5A 3CXWA 3VC4A 1JNKA 2X1NA 2O3PA 4TWNA 1GY3A 1ZZ2A 3W32A 3DS6A 5EW8A 2ITTA 3MW1A 1XO2B 4BKYA 5EKNA 3P78A 5BVEA 4BDAA 5KMOA 5BMMA 3F61A 5M55A 2FGIA 3GT8A 3VS1A 1NW1A 4B7TA 4GFGA 5DGZA 2CKPA 4QQTA 2JBOA 3NNUA 3UPXA 3MIAA 1OL2A 2B53A 1Q99A 1FMOE 1W8CA 4FV2A 3V5TA 1STCE 3LM0A 5M56A 2I0VA 4PMTA 4XV2A 5E8XA 2YM8A 3QYWA 4AE9A 5G6VA 2BMCA 2I0EA 3BI6A 2VU3A 3QTWA 3C4ZA 3PZEA 4HJOA 5M53A 5HHWA 3QALE 3LMIA 4AW1A 2DYLA 5CZHA 3RPRA 1K3AA 4RG0A 3KF4A 4FTQA 4LMUA 4CT2A 1O6LA 3HV7A 2ITWA 4BF2A 4GU6A 3RTPA 2XF0A 3ZEWA 2CNVA 2CN5A 5C03A 3HL7A 4G31A 3RI1A 3UPZA 1MRYA 4EC8A 3QLGA 4EJNA 2XM9A 2PZRA 4DFBA 5CEOA 4D2SA 3MFSA 2B7AA 2F57A 5CAVA 3PXQA 4YZ9A 1JLUE 2ZV7A 4C58A 1J7LA 1W82A 2XJ1A 2PYWA 4EOLA 3E8DA 2XK7A 4XG8A 5FLFA 4F9AA 2KULA 3O96A 1JKTA 3OMVA 2O63A 4KKHA 3WE8A 5HNBA 4IHPA 2BILB 5B0XA 2PVHA 5E8UA 5JGAA 2B52A 1OECA 2XVDA 3VUKA 4A9YA 4AZFA 4DG2E 5JFWA 3OTUA 3R63A 5EH0A 3UO5A 3V01A 5HD7A 4Q9ZA 2WMVA 2QR8A 1Q3WA 2C5NA 3EWHA 3D0EA 4TWCA 2P33A 3GU6A 5IQDA 4IEBA 3TTJA 5A4EA 5J9YA 4FT7A 4EHGA 4EONA 4FNXA 3M11A 3PDTA 3AOXA 1V0BA 3NSZA 2VGPA 4W9XA 4G3DA 3TKHA 4B8MA 3HDMA 3RWPA 4BICA 2XYUA 4BZNA 4NIFB 4IC8A 4ZJIA 3ZFMA 2GDOA 4AOTA 3OWLA 1M17A 4R7BA 2XRWA 5AMNA 2RIOA 5IH6A 2R3JA 2QD9A 4HYIA 1R39A 1CKIA 3NW5A 3RALA 4BGHA 4PTGA 4GYGA 2CKEA 3C0GA 4C38A 2WQNA 5A4TA 3MB6A 3QRKA 4RJ5A 4FKTA 4YHFA 2YM5A 3KRRA 1ZXEA 2Y4PA 3A61A 2WMXA 4FF8A 3FYKX 5I4NA 5BPYA 3IS5A 3VW8A 1PHKA 5KMLA 5CLPA 5CXHA 3SG8A 3MPMA 2UW6A 3BX5A 3HAMA 1JQHA 3NCGA 5IEXA 1AD5A 4WKQA 3W2QA 3JVRA 1OVEA 3WIGA 2VTOA 3IGGA 2XEYA 4Q5EA 2OIQA 3R1SA 5F4NA 4C4IA 4EWHA 2VWWA 3ORXA 5C8MA 3GOKA 4JNWA 4EH7A 1Q8YA 4IX6A 2ZB1A 2WFYA 1PMEA 2WQBA 4XCUA 4LV8A 5T3QA 2VNWA 2BFYA 4BDDA 4BDGA 4U3ZA 2BVAA 3PVBA 4FKSA 5M4IA 4DFZE 5LWNA 3CY2A 2YZLA 4AGCA 1URCA 4WG5A 3BLHA 5D10A 3ZSHA 5HVYA 2C1AA 4AT5A 2W1ZA 2X2KA 4FEUA 2EVAA 1ZY4A 2X81A 1XHAA 3BLQA 3DCVA 3KY2A 3LCDA 3O7LB 4O0TA 5CSPA 4ZTQA 3CJFA 1YW2A 3GNIB 5DA3A 3UIBA 3QAME 2Q83A 3BGZA 4A4OA 1OZ1A 2IW6A 3QTIA 3RPYA 2O5KA 2QU6A 3RCJA 3B2WA 5ETFA 3W2OA 4ASZA 3OWPA 2F2CB 2YFXA 5BUIA 3OY1A 1YHWA 2CMWA 5EQPA 5M07A 4QQ5A 4GJ2A 4L7SA 5JKGA 4JQ7A 4OTWA 1WBTA 2PVJA 2WIPA 2YAAA 3F66A 2WTKB 5HE1A 4DLIA 4E1ZA 2JD5A 3EKNA 1QPJA 3HRCA 3QZHA 1GIIA 5DRBA 5HBEA 3VS2A 3L9LA 4E8AA 5GIOE 3LFAA 4U9AA 4EOQA 4J96A 4R7IA 4CYJA 2G2FA 5CF8A 5FUTA 4EORA 4M97A 4QPAA 2BUJA 3IECA 4WUAA 4D58A 4F1TA 1Y8YA 5AX3A 4RLLA 5CU2A 3CQEA 4BCOA 3HKOA 3VS4A 4NEUA 1Q3DA 3MSSA 4H3QA 3MGYA 3TUBA 2YCSA 4QPMA 1UV5A 2I40A 2WIHA 3WYXA 5D41A 4ZOGA 3RINA 4O7TA 3KK9A 3MH1A 2OH4A 1XR1A 2OLCA 3OWJA 1MRVA 3EFKA 5IMXA 5I5ZA 3KXNA 2B9JA 3C1XA 2ACXA 2B9HA 5C27A 5AR8A 4IFGA 5FP6A 2UZUE 4ANNA 3ZUUA 4EOJA 5M09A 5K9IA 3F9NA 4RX7A 1GOLA 3DT1A 1WCCA 3KXZA 3P08A 4NUSA 2X2LA 3QXPA 5FRIA 4TYGA 2Z8CA 4ZTSA 1HOWA 1ZRZA 5FXSA 1ZWSA 2XIKA 5ANOA 2C0TA 5IQHA 2PUUA 4WRGA 5CNNA 4P7EA 2J51A 3QQFA 3UG2A 5KMNA 4I94A 1ZARA 2YITA 1PJKA 2W06A 1P2AA 4E6CA 1LEWA 2W5HA 5BYLA 5DEYA 4ZSAA 3FZTA 5HNIX 4N0SA 4E4XA 3OXIA 5AUYA 2UVYA 4L01A 1VYZA 1PXIA 2YIXA 5AA9A 2XS0A 5BVDA 4FEWA 4S32A 2PULA 3I60A 2BAJA 4O0VA 3ULIA 2IVTA 4X3FB 4DH8A 4QTAA 1VZOA 3TXOA 3FAAA 3WBLA 2UZWE 2G1TA 1KWPA 4X2GA 4CV9A 1HCLA 5KE0A 3BQRA 1LPUA 4MBJA 4OTFA 3GU5A 4FV5A 2ZDTA 5CS6A 4XOZA 2JFLA 1W7HA 3BBTB 3A7FA 3F7ZA 3OROA 4IANA 5AV0A 3D7ZA 3ERKA 5I9UA 5AAFA 4ARKA 1L3RE 5ETAA 4FTIA 3FMMA 2UZVA 4MHAA 3RZBA 3V04A 4ANSA 2WNTA 2ESMA 3B2TA 3W55A 5CF6A 5ANJA 3GU7A 4KBCA 5L6PA 2Y6OA 3RK9A 4UN0C 3I7BA 3FMEA 3VIDA 3GC0A 3NUXA 3CP9A 4S2ZA 4A9UA 4ENYA 5JGBA 4AFEA 4BDBA 3PUPA 2WTWA 5DFPA 5LMAA 3QKLA 4EK5A 4X3JA 2GQRA 1WVYA 4YJNA 2W96B 1OKZA 4FYOA 2HELA 1YOJA 5HEZA 4FIJA 4TYHB 4J8NA 5CAOA 4IE9A 4AGWA 3TIYA 5HICA 4KAOA 4USFA 3OT8A 2XJ0A 4C62A 3LLAA 2E9PA 3RCDA 3KN6A 5LMKC 4HCUA 3DZQA 4O7VA 1XBCA 3OC1A 3RNYA 3W8QA 4BR3A 5HQ0A 4RX9A 3TI1A 3VAPA 4O6EA 5A4LA 4P5ZA 3G9LX 4DHFA 2J5EA 2PK9A 3G6GA 1FOTA 3DFAA 5FEEA 3VBWA 4DEAA 4BBMA 4RJ4A 4IADA 2UW9A 4W8EA 4YTIA 3K3JA 3ALNA 4IZAA 4DT9A 3PG3A 4L3JA 4E4MA 5KMMA 5J87A 4FTOA 4BGQA 1ZYJA 4FK6A 5A54A 2YDKA 2HOGA 3E87A 4U79A 4FL1A 5CSVA 2EWAA 2BR1A 1PXNA 4NTTA 4EOIA 3BWJA 3FZ1A 5FG8A 4N4SA 4GW8A 2QOCA 4EK8A 5EM7A 3GQIA 4E6DA 3COKA 2YISA 3OXZA 3KU2A 5FBOA 4RWLA 3KREA 4AN3A 3IW5A 3HAVA 3FV8A 4UWBA 4EH4A 4F0IA 3DAJA 3TV4A 3Q2JA 2OJGA 2PVFA 1SMHA 2O8YA 5LXMA 3THBA 3S0OA 3DOGA 2IVUA 3PYYA 4D4VA 3HMOA 3PWDA 5C1QB 2IVSA 2Y6MA 3PXRA 3PXFA 4QMSA 4XEYA 2Y4IB 4DEBA 2P0CA 5JT2A 5B7VA 3NIZA 5A9UA 3WILA 4E93A 4DCAA 3KF7A 3HLLA 1NVRA 3RWQA 1IG1A 4PMPA 2C0OA 3RVGA 3B8RA 4FVPA 3QWKA 4JX3A 2XEZA 3D5UA 3EFJA 3SXRA 3E8CA 4DFNA 4FT3A 4QTDA 1LUFA 3C51A 3DKCA 4IAIA 2PL0A 3RMFA 5CU6A 3QL8A 5AP7A 5HIDA 1V1KA 3NDMA 4FKWA 5HCZA 3PIYA 2HZNA 1RQQA 2QCSA 2W1FA 3HA6A 4O7SA 3AD4A 5L4QA 4GMYA 3FMKA 2E9NA 3C7QA 2PZ5A 4O0WA 3JXWA 4A4XA 4DBNA 2BZIB 5F20A 3NAXA 4JIAA 4CZUA 3DLZA 4C37A 4L68A 4UMQA 3QYZA 3F69A 3VVHA 4D9UA 4Y8DA 4V04A 4CLJA 2CKOA 3ANRA 2YWVA 4EH5A 3E7VA 4H1JA 3U55A 4KIKA 3BYSA 3C4XA 1ZYSA 5GNKA 5HCXA 3H3CA 4FMQA 5F1ZA 3Q9YA 3AD6A 4QYEA 4LGGA 4NCTC 4PMMA 4UYAA 2QURA 2YA9A 3DJ7A 2XM8A 3HDNA 3DK7A 3TNHA 4YLJA 3UOLA 3L8PA 5DMZA 3I7CA 4CKJA 4YURA 3DB8A 3DXPA 2UZEA 1JWHA 4KS7A 5AIRA 2QR7A 5HO7A 5J9LA 2VTLA 5FBNC 4KUJA 4R8QA 2H34A 1CMKE 2ITNA 4LM5A 3VBQA 3ZU7A 4CFWA 2YIWA 3GU4A 5GZAA 1S9JA 3GFEA 3PFQA 5E8WA 4ITJA 3LAUA 1M2QA 5DLSA 4A07A 4KSPA 5KZIA 2IN6A 4FV8A 1IA8A 3CCNA 3DGKA 1L8TA 5DH3A 3NS9A 4IACA 1OKYA 3IOPA 1WAKA 2HZIA 1DI9A 4BN1A 1FINA 3ORKA 2QHNA 2WXVA 3KULB 4GT4A 4BWPA 2ZMDA 3QX4A 1BL7A 3MV5A 3OS3A 4IM3A 3U87A 4FGRA 3T8OA 2QOFA 1YQJA 2WU7A 2YCRA 3EH9A 5AWMA 4F6SA 2B9FA 3F6XA 3MWUA 3W33A 4JI9A 1IEPA 4ZP5A 3PP0A 4UWYA 3R83A 3QBNA 1FBNA 3LLTA 4BCPA 3AQVA 3I79A 3W2CA 4BTKA 2HCKA 5ANEA 2W1GA 4TZRA 3OZ6A 2W99B 3EMGA 2ITOA 3UQFA 4EK3A 2YIQA 4W4YA 2HWPA 5CEIA 4X6QC 2FB8A 4BDJA 1MQ4A 4DT8A 4OUCA 3PXZA 3VS3A 1UWHA 3PRFA 5CQUA 1DI8A 3D7TA 3R6XA 5AUUA 4FV9A 3VN9A 2VWXA 4IH8A 1LR4A 4MH7A 3DKOA 4N6ZA 3TT0A 4TYJA 3VF8A 2W1HA 3UG1A 1E9HA 3ZRLA 3ET7A 3UQGA 4PNKA 2C1BA 2A27A 4RFZA 2CNQA 1X8BA 3LFFA 3VS6A 3FE3A 5J9ZA 1XQZA 3HA8A 4QYFA 4H05A 2WOUA 4E3CA 3RGFA 2FO0A 2XKCA 4K77A 2SRCA 2J0JA 4JDKA 3I6WA 3LMHA 2XK8A 4PUZA 1UU7A 5M57A 1ND4A 3UIUA 4W4WA 4CCUA 2BTSA 5DPVA 4W4VA 2UVXA 5IDNA 2WTKC 4M7IA 1H1PA 2EU9A 4TRLA 4GUEA 4PQNA 5GJDA 3AGLA 4U6RA 1UVRA 3H9FA 2HK5A 3OCTA 4ONAA 4FKJA 3UNJA 5IA3A 1H07A 4FZDB 3PVUA 3MTFA 2F7ZE 3KK8A 3A8XA 1K2PA 2YERA 3CQWA 3VWAA 4B4LA 4U3YA 3O71A 4EC9A 5J79A 4G6NA 3VS5A 2UW7A 4RBLA 3AGMA 4JR3A 3BWFA 3R1YA 4JBPA 4J52A 5CVGA 4QMYA 2P2HA 3R30A 4RMZA 2F7XE 1ZOEA 2C6KA 4PTEA 1KE7A 4C4EA 4IW0A 2V7AA 3R7OA 4Y46A 3VBTA 5KBQA 4YJOA 2W5BA 4YTHA 3BIZA 3R9DA 3PPJA 5A6NA 5IQFA 5ANDA 5FM2A 2UZOA 2X0GA 4R78A 4W9WA 4XLVA 2JC6A 3FI2A 4NM0A 4A7CA 5I3RA 4WUNA 4UXQA 4UMTA 3H10A 4GRBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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