3SX9A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with bumped kinase inhibitor, rm-1-132
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
466
structure length
457
Chain Sequence
HSTAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiple determinants for selective inhibition of apicomplexan calcium-dependent protein kinase CDPK1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
total genus 161
structure length 457
sequence length 466
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2011-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3sx9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3sx9A01
3D7ZA 1XH9A 1ZY5A 4D55A 5C03A 4C4GA 2G2HA 2ZVAA 5FLFA 2WHBA 3WI6A 1OGUA 3CY3A 2IVVA 3UJGA 3C13A 2WFYA 3QKLA 5FDPA 3WIKA 5J7BA 5KMLA 4K8AA 2EXEA 2IVUA 4HYIA 4S34A 5LWMA 4L52A 3P4KA 4OW8A 4B0GA 2Y6OA 2CN8A 2R3KA 4DAWA 3UPZA 4BZOA 5CU2A 5DR9A 3WZJA 3A7FA 3AD4A 3Q9XA 3ZXTA 5IPJA 4MTAA 1UWJA 1YDTE 3MA3A 2QI8A 5I9ZA 4YJVA 3CSVA 2XEYA 3F3TA 5FTQA 4ZSAA 2ZDUA 3GP0A 4FZAB 3KXMA 5DRDA 5GZ8A 3SLSA 4FSRA 5CSVA 5E8WA 3P5KA 4ZTRA 3FMHA 1UWHA 4XH6A 3QZIA 4C3FA 4QYYA 5IQHA 3A8XA 3D7TA 2W17A 3B2TA 4EUTA 3PG1A 5T3QA 3UNKA 2BRHA 2XNOA 4BDHA 4I5CA 5BNJA 1CDKA 1V0PA 2FSTX 2F7XE 3GCSA 5DG5A 2VRXA 1KV1A 5KKRC 4I4FA 4UMUA 3PIXA 3BWJA 3AT2A 2X2KA 1G3NA 3PIZA 3P79A 4RA4A 4F9BA 4AQCA 3QGYA 1ZAOA 5GIPE 3V5JA 2CNQA 2C3IB 1UNLA 2YLEA 4FV6A 4D4SA 5E9EA 2R3QA 4OGRA 4OUCA 4U81A 5CXHA 1W8CA 2XKDA 1Q8UA 4FEWA 1HCKA 3DNDA 3FSFA 4KS7A 5E91A 3UE4A 4XP0A 3CJFA 3VO3A 4CSVA 5CS6A 3L9MA 3OCBA 4M68A 4P7EA 5HG9A 3CLYA 2WMAA 2VWBA 3SHEA 4FKOA 4QYGA 3OFMA 2RFDA 3SVVA 2OIQA 4FSMA 5DFPA 3PUPA 4AS0A 3KXZA 1GY3A 2VWXA 4TL0A 5ANKA 4IDVA 4NK9A 4PMSA 5HG8A 4PDYA 3DAKA 3H0ZA 4JG6A 4MNEB 5FXQA 3BHYA 3RAWA 5GHVA 2I7QA 1MQBA 4FKRA 3RNYA 3R30A 3V51A 4WG4A 3OEFX 3TKIA 5DEYA 3V8WA 3FI8A 3C4EA 5CVHA 3GCUA 3QLFA 4BBMA 2IVSA 3NUUA 1ZYLA 4OT5A 5L6OA 3WE8A 5CAVA 3KRWA 3HX4A 3GCQA 1FVTA 4C35A 5L2SA 4LRJA 5L8JA 3G6HA 2VWUA 3VUHA 4ACDA 2GHGA 3D5VA 3MS9A 3QZHA 3LFDA 4GS6A 2OO8X 3MIYA 4FKWA 5ANDA 5JGAA 1XH5A 4NM5A 2YJSA 4CG9A 5A9UA 2IW6A 5AUZA 5KKRB 3GCVA 3IOPA 2C5OA 3GUBA 4IC7A 2OFVA 2NO3A 4IACA 5AV4A 3R8PA 1PXMA 2OSCA 4DFUA 5ANJA 3EIDA 2VWYA 5DR6A 2VN9A 3KQ7A 5DRBA 2R7IA 4AE6A 4OTQA 4ZEGA 3FEGA 4QMTA 3NW6A 1ZYJA 1GZ8A 2RG5A 3Q5ZA 4QTAA 4F6WA 1JKLA 4RSSA 3ORMA 1F3MC 4FNYA 1OIRA 4D1SA 3QX2A 4ITJA 4E7WA 4G6NA 3EL8A 1XHAA 3FDNA 4XP2A 3H9OA 5CEMA 4Z7HA 4PMTA 3MVJA 4XV2A 4PTCA 2YM8A 1UV5A 4FKPA 2XYNA 3E8CA 4S30A 3PJ2A 3PJ8A 2X0GA 4ASDA 4MF1A 2X7OA 4E5AX 1MUOA 5IQEA 1H28A 3FMNA 5HNBA 3OP5A 2C6EA 4QMPA 4AGCA 1H25A 4AZTA 4DGNA 4FL1A 2QO2A 4FK3A 3IW6A 3FV8A 3H30A 4J7BA 4OBPA 3R21A 4BR3A 5HO8A 4BBFA 2XNGA 4X3FB 4KNBA 3SGCA 1FOTA 1H26A 3LQ8A 4FTNA 5LARA 3MVHA 3ZH8A 3VS4A 1M2PA 2X4ZA 4L67A 2C6TA 2RF9A 5HTBA 4TYHA 3NS9A 5I9YA 4MXAA 3KKVA 3KU2A 2X9EA 4IMYA 4QMXA 2XIYA 5FD2A 4RLKA 4FTMA 4U9AA 2PMOX 4Y83A 2OGVA 5IMXA 4EONA 4D4VA 2EB3A 3UOJA 4FV0A 4MXXA 3BGQA 3QCQA 2QODA 4QNYA 5CNNA 3HKOA 3NRMA 4D0WA 4DFXE 4F9YA 5FTGA 3ZM9A 4NKSA 3NMUF 4UBAA 2XUUA 3RPRA 4R1YA 2ITWA 1R1WA 4OTIA 2HY81 3IPHA 3SAYA 4IB0A 4R1VA 3GC7A 2UZNA 5JKGA 3OG7A 3RM7A 5EDRA 2UZWE 3G9LX 4MF0A 5HU3A 2OF2A 3BELA 3RNIA 4RZVA 3W10A 2PZPA 4R7BA 4NZWB 4I6FA 4DGGA 2JDTA 5L3AA 5HE3A 1PXPA 3GNIB 2G2FA 4O0SA 3NVMB 1V1KA 4TZRA 2W5AA 5DMZA 4QPAA 5FBNC 4ORKA 4APCA 4EK8A 3MY5A 4BI2A 3O96A 3NNXA 3G0EA 3Q4ZA 4U44A 3EFWA 3I4BA 4QQJA 2O3PA 2EB2A 3DXNA 5CAUA 5K3YA 3C9WA 3HV5A 5M55A 3R9DA 4YZDA 2G9XA 4EKLA 4UYNA 3K2LA 3SDJA 2ITZA 4IAYA 4D5KA 2WD1A 3D94A 4EQUA 1FGIA 2CLXA 3DFCB 4FTQA 2WEVA 3R8VA 1TQPA 4KBAA 4U45A 5AIRA 4LM5A 5HBEA 4AFEA 5J1WA 4I4EA 3I5NA 3FSKA 3TJDA 5IA3A 4D28A 3FC1X 1LPUA 5LMAA 4NU1A 2YAKA 5AAFA 3L8PA 4RWJA 4H39A 4HGTA 4D2TA 4JBPA 3AOXA 3GQIA 5DR2A 4EH4A 2PE0A 4KIKB 4X2NA 3E3BX 4O83A 4D2WA 2C3JA 4YJTA 4BCPA 1PMUA 1ZOGA 4YHTA 2WTJA 4HW7A 4JQ7A 3WBLA 3IQ7A 2VTAA 3CKXA 1QL6A 3D4QA 1XBAA 2RFNA 2YISA 3EFJA 3OROA 3CJGA 5FRIA 3BLHA 4RT7A 2IW9A 3JUHA 3L9NA 1BX6A 4HGEA 3TIYA 3GVUA 3BBWA 2Q0BA 4FA2A 4UZHA 4E4NA 4R5SA 4BDEA 4U3YA 2A0CX 4HNIA 5F95A 5K4JA 3VUDA 5IQIA 5DIAA 1RW8A 3VF8A 1JNKA 4O7NA 1DM2A 4FNZA 4JG8A 2VTSA 2W7XA 4A9YA 4L00A 3TG1A 3TDVA 1M52A 3K54A 2VGOA 3C7QA 5IH5A 4CFUA 4FIEA 5KZ0A 5IQBA 4RA5A 3AC4A 4BCOA 5BYLA 4IAZA 2VNWA 2WQNA 1RQQA 3NW7A 4QMOA 4ZZOA 3HV6A 4TNDA 1KE9A 1MP8A 4NCTC 3FMMA 2QKRA 3MN3A 3QCSA 4DTKA 4BY9E 2J0LA 4RFZA 5FP5A 3R01A 2CKOA 3NPCA 4LI5A 1XH4A 4U8ZA 5HG5A 5JSMA 3A2CA 4KBKA 3SXRA 4II5A 4YZBA 4V01A 3QFVA 5EW9A 3RAHA 4D2RA 1PJKA 4CGAA 3HL7A 2V55A 2WMTA 3KVWA 2OJIA 3DGKA 3LXLA 4YUQA 2R3NA 5TE0A 3I5ZA 2PTKA 4GG5A 4RWIA 4BYIA 2Y6MA 4CTBA 1CM8A 2YM6A 3OOMA 5CF8A 3FI4A 2RFSA 4FKIA 2FO0A 5A14A 2Z60A 3UG1A 1REKA 2R4BA 4RX9A 4OTGA 4MWHA 3DQXA 3IKAA 4E3CA 5TKDA 2UW0A 2E9NA 1VYZA 2JDSA 4QYHA 3PYYA 4RG0A 4BGQA 4BRXA 3A61A 3QQHA 2QC6A 4WNMA 1PKDA 4IX3A 4YTHA 3HLLA 2VO0A 5HE1A 4BHNA 4DFYA 3QTXA 4OTRA 3R8MA 2V22A 4EH6A 4HVGA 1SNXA 2BRMA 2UUEA 4FGBA 4BDCA 2QOCA 2OH0E 3RBWA 4EKKA 5CF6A 5J9YA 3UIMA 5EYMA 3CD8A 2OJFE 3QTWA 5M51A 3SG8A 1KOBA 3UZTA 4RC2A 3T3VA 5IUGA 2C0IA 2KULA 4FT3A 3DU8A 3EYHA 1L8TA 3DNEA 4Q9SA 4C38A 3QTIA 5EDQA 3IDBA 3VVHA 4G31A 5EKOA 4ZMEA 2FB8A 3NR9A 4WRGA 3RP9A 5BMSA 4IX5A 3HRCA 3MH3A 3ZRMA 5JFSA 2HCKA 2R64A 4PL4A 3QHWA 1UNGA 4UWCA 4IXPA 3CP9A 4L3PA 1H27A 3NNUA 4YBKA 3RTPA 4F1OA 3EQHA 1WVXA 3AT4A 4CKIA 3BV2A 2VWIA 2UZTA 3LCDA 5IKWA 4DEGA 1ZMVA 4PNIA 4TWNA 2BPMA 3QU0A 3MV5A 3MTFA 5IA5A 4JAJA 4Y72A 3CEKA 5KE0A 4EZ7A 5K5XA 5KMMA 3PXFA 4LFIA 3ZTXA 3SQQA 4XG4A 4J8NA 1DAWA 4FSQA 5HTIA 4HYHA 4XCUA 3ZCLA 1PXJA 5FQDC 4CQGA 2GCDA 3EQGA 4FG8A 4QQCA 2VO3A 4R77A 3BQCA 1PHKA 5L6PA 2UW6A 3DJ7A 3NNWA 2HZIA 3BYVA 3IW4A 4FIFA 3MFUA 3O8TA 3QD0A 3EOCA 2YIXA 3HP2A 2O63A 4K0YA 1P4FA 3E7OA 2W4KA 3CY2A 4O6LA 4G3FA 3OY1A 4MYGA 5EG3A 3RWPA 4EK6A 1ERKA 2C5VA 2Z7QA 4O7VA 5C4KA 1J7IA 3KN6A 4WOVA 5LCKA 3MI9A 1GIJA 1J1BA 2F2CB 3O7LB 5EH0A 4DT9A 3NGAA 4RIOA 1OI9A 5BQ0A 3F5GA 4BTFA 2J51A 1SVHA 3COKA 3OCTA 2XP2A 4UMTA 4DGLC 4M69B 4FZ7A 2XNMA 2YDKA 1XH7A 2ITOA 5J87A 5HLWA 1YOJA 5I9WA 4CMOA 5BVFA 4C4IA 4DHFA 3B2WA 4I5HA 5FBOA 2OJJA 4KBCA 1HCLA 4IFCA 1T45A 1U59A 4FSUA 3PE1A 3EQCA 5LQFA 2OKRA 2W05A 3C0IA 3Q9YA 1O9UA 3FMDA 4Z9LA 4DCAA 4CZTA 3CKWA 3G33A 4MHAA 4CT1A 3FLQA 5IEXA 5FUTA 2BHEA 1UVRA 2DS1A 3KN5A 2ZM1A 4M97A 3KMWA 2OU7A 1QPEA 3JXWA 4HCUA 4D2PA 1J7LA 5BMMA 1WBTA 4EBVA 4EZ3A 5IQCA 5CU0A 3CR0A 3ERKA 3VUIA 2VTMA 2JBPA 3OBGA 3O71A 5L2IA 3HMNA 1OL6A 3DV3A 5AM7A 2GTNA 2UZEA 3Q9ZA 1LEZA 3VUTA 1I09A 5EDPA 3FQSA 4FKSA 2CCHA 4ZSEA 3QQGA 5AR3A 3ZDIA 1YDRE 3TKHA 4EWHA 2DUVA 5ETCA 5E8YA 4DT8A 4HPTE 5HCZA 4BKJA 2JBOA 3Q32A 3EN9A 4MQ1A 4EQCA 3RZBA 3EQFA 3PRIA 3ULIA 3LXPA 3VUGA 3P86A 4DC2A 4PMMA 4I41A 3R63A 2YCRA 3QGWA 1WBOA 4OTWA 3E64A 3KC3A 2C5NA 2W1IA 4IC8A 2QNJA 4H3QA 5BX0A 3FY2A 5CANA 5L2WA 3C4ZA 3QD3A 3ZU7A 5HOAA 4N0SA 3D2IA 4FMQA 4I94A 4OTHA 3OTUA 3A62A 2OZAA 4LMUA 2YITA 4N6YA 2W4OA 4QP9A 5B2KA 3P08A 3OC1A 3GU4A 4YO4A 1OM1A 3HRFA 4FSWA 1QCFA 3GXLA 3MY0A 5CYIA 5ANGA 4DEDA 4YGAA 5C26A 1WMKA 3FXWA 4FIIA 3TCPA 3KGAA 1OKYA 3OY3A 4CYJA 2X6DA 3P9JA 4IAAA 5HIEA 4PPAA 2X8IA 3HMMA 4Y73A 2R3GA 3FLWA 3FC2A 4DLJA 4IZAA 5ETFA 4BIDA 3E5AA 3MB7A 2YIWA 4ZSLA 2C4GA 4I23A 4X21A 4DITA 4QMZA 1JKSA 2BAKA 3IS5A 4JVGA 3LFQA 4C37A 5IF1A 1PMVA 3BU5A 3DZQA 2WU6A 4DE4A 2GU8A 2Z7SA 3EKNA 2JIUA 4O0YA 1JQHA 1H1QA 2XJ1A 4CFVA 2XEZA 3FWQA 4ZLZA 3TDWA 3AMBA 4FK6A 1ZZLA 3JS2A 3SXFA 4BVUA 4OR5A 5ANOA 2UVXA 3WZEA 1IEPA 3KXGA 2C6LA 2E9PA 3F2NA 1K3AA 4XG3A 1SYKA 2BHHA 1E9HA 5EKNA 4WG3A 4F64A 4O7TA 2BDJA 5IQAA 4OBOA 3OWJA 1JVPP 2ERKA 2YM3A 2C6OA 3AC5A 5HHWA 2C5XA 3OWPA 4HYSA 2ZV9A 3BGPA 4OLIA 1H1PA 3R7UA 5KMIA 2W5HA 2BKZA 1Y91A 4FOCA 2XA4A 3CGOA 4WD5A 1SVEA 5HE0A 3RAIA 3U4UA 2P4IA 5HQ0A 3V5LA 2B1PA 2Y9QA 3RM6A 4DBXA 5L8LA 4YNOA 3DXPA 5A6NA 5LMKA 4D4YA 5KNJA 3KRRA 3QXOA 4ITIA 3QQLA 4ZSJA 2QVSE 4CMTA 4USFA 1YXUA 1M14A 3T3UA 5JFVA 4RMZA 4BKYA 3UQGA 3QQJA 2FGIA 4H1JA 4EH8A 2AYPA 2B0QA 4FV1A 5LJJA 3DPKA 2WMWA 5ACBC 1U54A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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