3T3VA

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with bumped kinase inhibitor, rm-1-87
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
463
structure length
453
Chain Sequence
AIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMSMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
publication title Multiple determinants for selective inhibition of apicomplexan calcium-dependent protein kinase CDPK1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
total genus 158
structure length 453
sequence length 463
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3t3vA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3t3vA01
4IADA 5CVFA 3THBA 3PVUA 4Y46A 3WZDA 2CDZA 3ROCA 1H08A 3V5PA 2XJ2A 5H8GA 3QTUA 4OTHA 5E8XA 4OBQA 3WF9A 4LRKA 3ZO2A 4D2SA 3EQIA 2OO8X 4BI1A 4DEHA 4ALVA 4GKIA 3ORZA 4FSQA 3M2WA 3V51A 5IQGA 3I60A 1Q8YA 4AA5A 1Q24A 3OXTA 4RT7A 3D14A 5CT7A 4GSBA 4YO6A 4JG7A 3FPMA 3GENA 3Q52A 2YIXA 3R7UA 3W55A 1ZY4A 4DHFA 1KOAA 1PMVA 3F7WA 3LCSA 2Z8CA 3R7EA 3VW8A 3M1SA 2W5AA 3E64A 2WPAA 2XBJA 3CKWA 5EDPA 1LEWA 4EHGA 3ATSA 4RIYB 3D2KA 3AD4A 2C69A 2YZAA 2F7EE 3QGWA 3QLFA 4GK2A 4BGHA 1TQMA 4F7LA 4QYFA 4J98A 5FWKK 3IONA 2PE0A 2QONA 3NZ0A 1PXOA 4IB0A 4D2PA 4R5SA 1R39A 4BWKA 4RIWB 4FSYA 3H9RA 3FMDA 5HBHA 4IANA 4O0XA 3EZRA 4EQCA 3U87A 3SXFA 4MD8E 4OTFA 1BMKA 5DVRA 2YZLA 2WOUA 2QVSE 3ALOA 5KMLA 2CPKE 4DAWA 4FE2A 3HZTA 2RL5A 4KWPA 1GZOA 4XLIA 5A4CA 3KC3A 4Z7HA 3UG1A 4QMQA 1YDRE 1WFCA 4Y73A 4DG3E 5BYLA 3MIYA 3CJFA 3ORNA 3QRJA 2C6KA 4MQ1A 3P78A 1ATPE 5AUUA 1RQQA 4KNBA 1R0EA 3ZDIA 2B53A 3GT8A 2HZ4A 3A99A 3QBNA 3VC4A 5K4IA 4F6SA 4NZWB 4D4YA 4I5CA 3DBEA 4IVAA 2QLUA 1HCLA 1R78A 2G2HA 2WQOA 4HPTE 3ZUTA 4CZTA 4IZ7A 1YDSE 4D1SA 1JWHA 3IW5A 1OI9A 4X2GA 2R3FA 1FINA 1XWSA 5AR8A 4EOKA 2RF9A 1I09A 4X3JA 4D4SA 5J8IA 1CKPA 3QTIA 4FV5A 4R77A 2BRBA 1FBNA 4M3QA 4O0RA 1Y6AA 3KRWA 5EYKA 2OGVA 2R3LA 4APCA 4U40A 5BQ0A 4JVGA 4R3PA 4GUEA 3WF8A 3SKCA 4NW6A 1OBDA 3F3WA 1V1KA 4L68A 4H36A 5IA3A 4FSMA 2IG7A 4S30A 4QMZA 1FMKA 2QOHA 2ZM3A 3AD6A 2WGJA 5J9ZA 2WTDA 3I81A 3N51A 3Q5IA 3ZLWA 4MBJA 2W4KA 3MYGA 4AN3A 4RVTA 4OLIA 2QU5A 2GFCA 4IM3A 3BBWA 4PNIA 4BZNA 2XNMA 3TUBA 1BKXA 4DA5A 3MV5A 5EKOA 3NIZA 1FGIA 3BBTB 3NX8A 4MXXA 3R21A 3WARA 5CU2A 3BGZA 1UU9A 1REKA 1JPAA 5CVGA 3I6UA 2BHEA 1FQ1B 2XB7A 3RPRA 3SAYA 2G2FA 3RHXA 4B0GA 2W05A 3ZBXA 1JSVA 2RG6A 2W4JA 3C0IA 5FTGA 4IC7A 4I6HA 4E3CA 5DBXA 4FTUA 3HGKA 2XBAA 5LVPA 5I4NA 2H8HA 2QG7A 1JVPP 1Q62A 2CGXA 1OKZA 2W9FB 4FZ6A 4WBBB 2W96B 2W5HA 4EOIA 2XK7A 3PTGA 4RFMA 3ROYA 3BLQA 1JNKA 3I1AA 3HUBA 1YXVA 2X7GA 3ANQA 1JKSA 4KKGA 3FMEA 5JGBA 4EK3A 4LI5A 5BVNA 3HV5A 4L9IA 4FV6A 4O0WA 2J2IB 3MVMA 3NSZA 4BL1A 4C8BA 3G15A 5BVKA 4QQ5A 4NWMA 4EBVA 3BQCA 2PVYA 3W33A 2WMVA 1LUFA 4U5JA 4RQVA 2X81A 2QOIA 4MH7A 4N57A 2DUVA 3MVHA 4BCOA 4FL1A 4QP9A 3K5VA 3BU5A 4RFYA 2CMWA 3QD0A 3ULZA 3RZBA 2YIQA 3IKAA 2BFYA 2VD5A 3AC2A 3NYXA 3LQ8A 4HGEA 3VJOA 3F5XA 3ALNA 4G3CA 4A9UA 4IVBA 5TT7A 5IU2A 3OWLA 3D5WA 3QQLA 3BKBA 4X7QA 5KMMA 2XNNA 2JC6A 3MY1A 4EYMA 1U54A 4UN0C 4HCTA 4RWLA 4B8LA 1WBSA 3QKLA 4TWNA 2ZYBA 5HE3A 4O91A 5I9UA 5AA8A 5JFVA 2I0VA 3DV3A 2IN6A 3EJ1A 4JBVA 4U79A 3EL8A 1A9UA 4CT1A 3QX4A 3M11A 3KN5A 4CRLA 3DXNA 3OCTA 4P5ZA 3TNQB 3Q53A 3UJGA 5JFWA 4IXPA 4IB1A 1YOMA 2W1CA 1BUHA 1E9HA 3MH2A 1GNGA 3HDNA 4R1VA 1OL1A 5KMJA 3U6IA 4UXLA 1VEBA 4YTIA 1DM2A 3UO5A 2ZM4A 2VTQA 4WKQA 5KCVA 1R3CA 3ITZA 3FMJA 4YLLA 5H8EA 3CEKA 3PSDA 5B7VA 5L8KA 5EI8A 2QODA 4FEUA 3GCVA 4FTIA 5E92A 1RDQE 4IWOA 4U41A 2YAAA 1H1RA 2XF0A 3AGMA 3AT4A 5EW8A 3E3PA 4NM7A 3NEWA 3PJ3A 3WE4A 3PG1A 5AM7A 4XHKB 2W1GA 4CG9A 4UALA 2W0JA 5CU6A 4HCUA 3EQFA 3RK5A 4DEAA 3HP5A 3SC1A 4CNHA 4RX5A 5A6NA 5AV4A 1PKGA 2VWZA 4GFOA 2XJ0A 5JK3A 4M15A 3HRFA 2BAQA 4PRJA 4APPA 3IDPA 4YC6A 3VRZA 3GFWA 2BR1A 3C4ZA 4M8TA 2WELA 1NVRA 4EK5A 3H4JA 2ONLC 5E8UA 1ZRZA 3F3UA 5M4FA 4UMTA 1BL6A 1MRUA 4IX6A 3I4BA 4D0WA 4RJ6A 4F65A 1UKHA 2CHLA 2J7TA 3HP2A 4C62A 4G31A 5L6OA 2FGIA 2XS0A 3BCEA 3R2YA 4IAZA 4OT5A 1GZ8A 5EYDA 3DQXA 4JAIA 1IRKA 4AN2A 4I4FA 4TPTA 5T6KA 1PXNA 4ITIA 3BQRA 4BY9E 3HUCA 3H9OA 4FX3A 3QC9A 1WBNA 4KIKB 3UODA 2JDVA 1REJA 2GS2A 2PZIA 3QTXA 4L01A 4FKIA 5B2KA 1JOWB 4W4VA 3TV4A 4AW5A 4RPVA 1J1BA 4BBFA 4AFJA 4FMQA 3MJ1A 3I6WA 4NL0A 3H0YA 4O7WA 5AR4A 2XNOA 4B99A 4HVHA 1MRYA 2Y4PA 1U5RA 4ZSLA 4E8AA 1Y8GA 2P2IA 2RIOA 4TZRA 3QUPA 2XCHA 5DG5A 2UVYA 1W0XC 3RPYA 4WNKA 5DT4A 5E8ZA 2W1FA 2E2BA 2XNBA 4O2PA 4XG8A 5CNOA 2UZEA 3LFBA 3OZ6A 4H1JA 5HLWA 5JMSA 2A27A 1PW2A 3ORXA 2VU3A 3TJDA 2QO2A 1LPUA 4GVAA 4XG3A 2JDSA 1YWNA 4K8AA 4CRSA 4AOJA 4O7TA 3GEQA 2QKWB 3GU7A 3OBJA 3LVPA 5DLSA 3CR0A 5EHOA 4GT4A 4A9TA 3OUNB 5BUIA 2WQBA 4G3FA 1SNXA 4TYIA 5GHVA 3HAVA 3QRTA 3PIZA 4F0IA 4QTBA 2UW4A 4DLIA 4LOQA 2J0JA 3UP7A 4CCUA 3IOKA 4QPMA 2XNGA 1H1WA 2IVUA 4FSRA 2XM8A 1PXLA 4ASZA 2ZAZA 3P5KA 4M66A 1F5QA 2X4ZA 3TNIA 2JFLA 2OG8A 5BX0A 4KINA 4O7YA 4RC2A 3R1QA 3BYVA 3BEAA 3LLAA 3VUIA 4YTCA 4EONA 3IW8A 3GU4A 3W1FA 2PY3A 5AP5A 4L3PA 4PDPA 4EH3A 4MX9A 5DR2A 3CE3A 3RPSA 3P7BA 5EH0A 4RWKA 2HELA 5CASA 4YUQA 1GZKA 5HNIX 5D10A 1H26A 2J4ZA 4D5HA 4IJPA 5CNNA 3U54A 3MY0A 2QHNA 4YJNA 3N9XA 3LAUA 5HE0A 1G8SA 4FTTA 5BPYA 3ZH8A 2GPHA 2R5TA 4K9YA 4KKEA 2OXDA 1U59A 3ELJA 3MTLA 4V0GB 3BGQA 2O8YA 4FT5A 2X0GA 4IVDA 4CMTA 5IQCA 2YDKA 2R7IA 4AS0A 5CYIA 4DFNA 3DZQA 4CFFA 3ZYAA 4JG8A 3W8QA 5AFVA 2F7ZE 3UZTA 2IVSA 5FEDA 4BYJA 1OPLA 3C4WA 2C30A 2QOLA 5T68A 4RQKA 2YISA 2IPXA 4CSVA 2HK5A 2QCSA 4JX7A 4EOJA 2Y8OA 3RMFA 4AT4A 2NNWB 3FMHA 5CXZA 4CV8A 3QXPA 3CKXA 3RKBA 5IEVA 3BZ3A 3GC0A 5C4KA 5GIPE 4XH6A 2YERA 3LFEA 3PVWA 5FTOA 2PUNA 3E63A 5AAEA 2VTOA 1CTPE 2ONLA 4O1OA 4G6NA 1NY3A 4BTKA 4P4CA 3PVGA 2WMWA 3SOAA 2X9EA 3A7HA 3LMGA 3P23A 4WA9A 5LXMA 1UU8A 4YC3A 1OUYA 3QRUA 2XK3A 3K54A 2C47A 3CPBA 3ZC6A 3S1HA 3MA3A 4P2KA 4YHJA 3O71A 3QYWA 3PXKA 1WZYA 3E7VA 5J87A 1UV5A 2VWBA 4DGOA 4U8ZA 2R3MA 4RLLA 4UXQA 2XK4A 5BVDA 4ORKA 4E6CA 3CIKA 4TN6A 2ETRA 3MFRA 3ORLA 3R71A 5LVNA 4Q2AA 4BCQA 3ATTA 2YWVA 1Q8TA 4EOLA 4O86A 2OJIA 2XRUA 2R3RA 4BN1A 5HE1A 4X3FB 3KMWA 3ZSGA 4X6QC 4X6RA 3BHYA 2ZJWA 4USEA 5IZFA 1NVQA 5L6PA 3DZOA 4QPAA 4AACA 3R1YA 4KS8A 3JPVA 3PZEA 4RIWA 4EUTA 4ZJVA 4UWYA 3LZBA 4JX3A 4BDCA 3DLZA 1JKLA 3CP9A 4I94A 4C2VA 5BNJA 4CTCA 4PPBA 4U3YA 3NIEA 5LMKA 5ETAA 5HVJA 5BVWA 2WEIA 5ANJA 4BTJA 4RZWA 5LCKA 1TQIA 5K5XA 1P4OA 4W4WA 3I7BA 3DJ7A 3AD5A 1OL5A 4MXYA 3PXQA 1BYGA 5ANGA 3TJCA 4CXAA 4IQ6A 1FOTA 3A62A 3LMIA 2UW9A 2XEZA 4E93A 3P7AA 3IGGA 3OXIA 1H0WA 2VO3A 5A3XA 2ZOQA 5CU0A 3CPCA 4FL2A 3DXPA 2HXQA 5FM3A 3S00A 2IW9A 2OICA 3FXXA 2ZDTA 4FIGA 5CAOA 4NU1A 1OBGA 3ETAA 5JH6A 3MS9A 1V0OA 2YCFA 2X7FA 4BDKA 5JKGA 2VO6A 3EQPA 3R7YA 3ZLXA 4O7ZA 3CGFA 4MAOA 3CQUA 4QYHA 5L2QA 3F5GA 4YSMA 3ZZWA 3CD3A 4QMXA 4ZTHA 4D4RA 2ITWA 2NRUA 4AW1A 3UVPA 4L43A 3EYHA 3W2PA 4E26A 5IISA 4C4JA 2R3OA 2Y0AA 3GBZA 3Q9XA 3QTSA 3RK7A 4BBEA 3QCYA 5LVOA 4AGWA 3NUSA 5EQYA 5L3AA 4QP3A 3ORMA 2UZUE 4WG3A 2C6LA 2QO9A 3F9NA 1DI8A 3NPCA 4C33A 2UZVA 2VWXA 3PY1A 2XZSA 3R7VA 4C61A 2C6IA 5EOLA 4RLKA 5D9HA 5AP7A 2XIZA 2XIRA 2G9XA 1TKIA 4CLIA 4DFXE 4ITJA 4L7FA 4PP9A 4I6BA 3RINA 4N70A 3TZMA 2V7OA 2P2HA 3OHTA 3R73A 4CQEA 1M2RA 2QNJA 2UVXA 3GOKA 3IG7A 3MGYA 4F9YA 3HKOA 5LJJA 2PYWA 1Q8WA 4N6YA 4CT2A 2A4LA 2OJ9A 4S2ZA 4Y8DA 4ENXA 3F3VA 4LG4A 3WZUA 4AW2A 4YURA 2F57A 3QD2B 4LL0A 3DLSA 4FOBA 4G17A 4FTKA 3O7LD 3BLRA 5H2UA 2PVKA 4TYHB 2B0QA 3EQCA 4DT9A 5AV2A 3UC4A 5L8JA 5CEMA 3QAME 4HGTA 4FL3A 4F7JA 3HX4A 4HNIA 5EW3A 5C8KA 4JDHA 2Q0BA 2VX0A 1LEZA 3I5NA 3L9NA 5CAUA 5KHWA 1H24A 4DE4A 2PE2A 2IZTA 3BRBA 4DINA 4JQ7A 4A9YA 4NW5A 1W83A 3IDBA 4XP2A 4ZTLA 4Z3VA 2BHHA 5L8LA 3SOCA 4OAUC 4XS2A 3G90X 3EHAA 2P4IA 3PFQA 1U5QA 3O0GA 2W5BA 1K2PA 3JY0A 4CMUA 3MH1A 2XNEA 3R00A 4EH2A 4MYGA 4AUAA 2WMBA 3VS6A 5E1SA 4EHVA 4F1OA 2CGVA 3G0EA 3PRIA 4AP7A 3P9JA 2UW3A 3Q4UA 3GU8A 4M97A 1OITA 4ZTSA 5DN3A 4OTIA 1OPJA 1WBTA 2CGUA 5J7HA 4FKTA 3AC8A 3LLTA 4JBQA 4AOTA 4ZS0A 2ESMA 1OL6A 2YN8A 3A7FA 3V6SA 4U43A 3FKLA 2WTWA 3QCXA 4J71A 2W7XA 3G2FA 1BLXA 3LFFA 4G9RA 2ZVAA 2E9OA 3QWJA 1SVGA 4G1WA 5EG3A 3FKNA 4WIHA 2C3JA 3V8SA 2WU7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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