3TCPA

Crystal structure of the catalytic domain of the proto-oncogene tyrosine-protein kinase mer in complex with inhibitor unc569
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
287
structure length
256
Chain Sequence
LEDVVIDRNLLILGKILGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of Novel Small Molecule Mer Kinase Inhibitors for the Treatment of Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia.
pubmed rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Mer
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 256
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3tcpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tcpA01
5IA2A 1OKZA 1ZYSA 4FSWA 5IEVA 4DG3E 4ZJVA 5D10A 3SG8A 3E93A 3QCSA 4C58A 4CEGA 3KMWA 4GSBA 4M13A 4XG8A 5ACBC 3LMIA 5CF5A 5FXQA 4DFBA 1CM8A 2YZAA 3ZO3A 3PPKA 4DEDA 2WMBA 4IMYA 4PTGA 5EI8A 5J7HA 3DLSA 4GG7A 4O21A 4F63A 2IVVA 4D28A 4GVAA 3RM7A 1OB3A 2WOUA 4Y95A 4UY9A 3DU8A 4J97A 4N0SA 3UNZA 4AA5A 4CZTA 3O7LB 1HCLA 4OW8A 4NFMA 4CMOA 3PYYA 3Q9XA 2R3LA 3C4ZA 3ZCLA 5CZHA 4DG2E 4M7IA 3NWWA 4I93A 4BZNA 5HBEA 5KMMA 4YZDA 2QOHA 4FEVA 3QQLA 4X6QC 4YJOA 3VHEA 4MD8E 4AUAA 1OPKA 1YVJA 2WMAA 4EOLA 5J95A 3ZM4A 5LQFA 4WRGA 3O50A 1CTPE 2YM8A 4RIWA 3UIMA 5KMLA 2QOKA 3MFRA 4P2KA 4QMYA 3ZEPA 3GU8A 4CSVA 2X8DA 2W05A 4ZTNA 3BPRA 3KY2A 3KVWA 4L8MA 5JEBA 5KBQA 5C03A 3TNPC 4LOQA 5JH6A 4FIHA 1CSNA 2FSOX 2QU6A 2BZJA 4U80A 2BR1A 3U6HA 3C4CA 3A4PA 2GNJA 2F7EE 5KZIA 3GEQA 3MB6A 3ULIA 2QU5A 3OT8A 4TWCA 4Y83A 5EM7A 4J95A 4FBXA 3FMKA 3SD0A 4AE9A 5I5ZA 4CVAA 1PMUA 1YI6A 3TIZA 4EHEA 3P0MA 4PDSA 4C33A 3ZU7A 2O63A 4Y72A 4O7TA 3PJCA 3RVGA 3PLSA 5CEMA 2WTIA 2C3IB 3QXOA 4B99A 4CFFA 4JBQA 2EXCX 3EQFA 4N70A 5AUUA 4HVSA 4YP8A 5AAGA 4JQEA 3DDPA 3V8SA 5HIEA 4KD1A 3E62A 3L8PA 2OJ9A 4PDYA 3ORTA 5HD7A 4K18A 1ZY4A 4L45A 3UOJA 4IX5A 2I40A 3ZUUA 3U4WA 1YDTE 3OWPA 2HY0A 3D5WA 3ZEWA 3QTUA 4D2PA 4O0RA 4XV9A 5DRDA 3QFVA 4OBQA 5HE2A 4M69B 3G15A 2YFXA 3RGFA 4E6AA 3M11A 3D5XA 5H8BA 2J9MA 4BGHA 5DVRA 3FI4A 1OBGA 2BTRA 2C5NA 4NYEA 1YKRA 4FSYA 4AFEA 2C6MA 2YDJA 4O84A 4ITHA 5HTCA 2F9GA 4YMJA 3IGGA 4XLVA 5AP7A 4CFVA 2KTYA 3R0TA 5EM6A 3SG9A 2X1NA 3MFUA 1DAWA 3NEWA 1DAYA 4FKUA 4QMVA 3F2AA 4ACHA 4YO4A 2JIVA 5HVYA 2JIUA 5GHVA 4F1MA 3MTLA 4UB7A 2C3KA 2QOQA 4I20A 4XP2A 4YJTA 2Y4IC 4E3CA 3DA6A 5M51A 2QO2A 4FSRA 4DFLA 4AZSA 1UU3A 3KXMA 4KWPA 4PF4A 4ACDA 4XLIA 4DEAA 4BWXA 5GZAA 2HZ0A 4KIQA 4O0WA 5AUZA 5I9WA 4FSNA 4XV3A 3PDTA 1WBVA 3TNQB 3GU4A 3D4QA 1GZ8A 3OWKA 3ZYAA 4BGQA 2WMTA 5IMXA 1APME 2JIIA 2ITXA 2X7GA 4EZ7A 5L6OA 4QMOA 3B2WA 2ERZE 2C6OA 4O7LA 2I6LA 1DI9A 3EB0A 4YZ9A 1DS5A 3QD2B 4R5SA 4BHZA 5M06A 4LUDA 3ATSA 4CLIA 3BYSA 3V04A 3NVMB 4AS0A 5IQBA 4DLJA 2C6IA 3R8PA 4EWQA 2C5YA 2OFUA 2YM7A 4YGAA 3DBQA 3FLSA 4JQ7A 4P7EA 5HE0A 3PJ2A 1UKHA 3LVPA 3BWJA 1B6CB 4WA9A 2BZKB 4BTKA 4EKKA 2C0OA 1DI8A 2VTLA 2YCRA 5HZNA 4JX3A 5DEWA 4EUUA 2WPAA 3RNYA 4QP6A 1FGKA 3AD6A 3BHUA 4RQKA 4Z9LA 1YWVA 2RF9A 3S2PA 3RJCA 3A60A 3CR0A 2X7FA 3KULA 3QZGA 3R7YA 3LM5A 2PUNA 3OY3A 2XRWA 1SM2A 4TYHB 3VS3A 3VW8A 2VTHA 1KE8A 1CDKA 3Q32A 4FTCA 5HHWA 3RWQA 5AUWA 1XR1A 3K54A 2YIRA 4MKCA 4G1WA 4AQCA 2J0LA 2ZVAA 4X3FC 3CQUA 3TDVA 2F4JA 4OTPA 4OTWA 5G6VA 2XEZA 5LMKC 2XNMA 3VQUA 4Q5HA 4BB4A 4U42A 2CGVA 4R8QA 3NUNA 3I7BA 3OXZA 1I44A 3PA3A 4D1SA 4YTHA 1Z9XA 2HW7A 5TT7A 3WF5A 2GMXA 4JOAA 5HBHA 3R7GA 4W4WA 5GNKA 1ZOEA 4IHPA 4RA4A 3A7HA 2W1GA 4K9YA 3VF8A 3ZC6A 4DHFA 3ATTA 2W7XA 4CG9A 3JPVA 3AD5A 4L43A 1FVRA 4AGDA 4B0GA 1XH8A 5AJQA 5A4TA 5J79A 1BI8A 2OWBA 2RGPA 4AU8A 5HEZA 3A7IA 3AT4A 2O5KA 2Z7QA 3EMGA 4GK3A 2PVKA 2QURA 4LGDA 3FLQA 1L3RE 2ZDTA 3QALE 1IASA 3F5PA 1OPJA 2BDWA 3QC4A 4A9TA 4U41A 4EOJA 4FA2A 2UW9A 3KXHA 3UZTA 1IA9A 2QC6A 3LLTA 1WCCA 3QTQA 3EN7A 5C4KA 2BRHA 4FV9A 4BRXA 4Y5HA 5LMBA 4MXYA 4NUSA 4RX9A 4ALUA 4U44A 2PTKA 3VS2A 3UOLA 4IJPA 4NIFB 3C0HA 2XBAA 3HLLA 5EH0A 3NW7A 5HG7A 4MBIA 4IZYA 3NNVA 1MP8A 2FSTX 5ETFA 3VUKA 4YLJA 4Z16A 3OROA 4LUEA 4O0SA 3L8XA 4QTCA 2R3IA 4AE6A 5FLFA 3R8MA 5CU4A 5DNRA 3MIAA 3E87A 3UGCA 4O6EA 4DEHA 3O8UA 2SRCA 4NH1A 2VO7A 5CEKA 4KABA 4Q5EA 2X6EA 3EQBA 4RJ5A 5HVJA 4ERWA 3OOGA 3L9LA 2Y9QA 2YWPA 4ALVA 4GFOA 4LM5A 3GU5A 4RZVA 4BYJA 4IM0A 2BRNA 3BIZA 2Z7RA 5IDPA 2PWLA 4OR5A 3EYHA 4YNOA 5L8LA 1W8CA 5CVGA 5AADA 4QT1A 1XWSA 3KRLA 4AA0A 5JFSA 3UP7A 3NIEA 4M69A 4FTKA 2JDTA 3GUBA 3BHHA 1XBBA 2OZAA 4BVUA 4WSYA 3HMOA 3GU6A 4L9IA 4FT5A 5IEYA 5H8EA 3CE3A 3V51A 4I5HA 3RK7A 4AG8A 3VBVA 5H2UA 2O8YA 3QHWA 4FSQA 4W4VA 3U4UA 3WE4A 4IACA 1YHVA 2BAJA 4UMQA 5CT0A 4D4VA 2BILB 4EWHA 4DCAA 4EC9A 1ZARA 2FA2A 2WQBA 3ET7A 3UZPA 2XIXA 4D2SA 2OW3A 1JVPP 1TVOA 2J6MA 4QMLA 1P4FA 3DY7A 4QP1A 4FE2A 4TN6A 3FKNA 3W1FA 4CTCA 4AT3A 4C2WA 3IS5A 3NX8A 1UU7A 3Q9YA 5HD4A 4D9UA 3AMBA 1ATPE 3OCTA 4HCVA 4YBKA 4BDBA 4UYAA 3PIXA 2Y4IB 4XBUA 3NYOA 4J53A 3E88A 3TJCA 4YTIA 2IZTA 1YDSE 2OI4X 3O51A 4DE4A 2OU7A 4ENXA 4EJ7A 3WARA 2ITOA 3BBTB 3BLRA 5DBXA 5AV3A 1JKSA 5CEQA 4PTEA 3R8ZA 3UYSA 2R3MA 3NYXA 4TYJA 4UZDA 5LXMA 3ERKA 4BI1A 4GT4A 4FEWA 4JAJA 3DKCA 3RPYA 5EOBA 3LCSA 4BDKA 4FTTA 1OIQA 3FZ1A 4GUBA 4FODA 4NSTA 4BC6A 5BVOA 3WIGA 3R9RA 1B39A 3EWHA 4FC0A 3FI8A 3CEKA 4P4CA 4BWKA 3HEGA 5BUEA 3Q5ZA 2YM6A 4PPAA 2BKZA 5CS6A 4OGRA 5D9HA 5CANA 4I6QA 2YABA 4AZWA 3UO5A 2XH5A 2OIQA 4D4YA 4L7FA 3OTUA 5AR4A 3TCPA 1BLXA 4IFGA 3F2NA 3IG7A 3QKKA 3D5UA 4C7TA 4YSJA 3QF9A 2R7IA 4QPSA 2W4OA 4FT9A 3QD3A 4H58A 3UVPA 2XNNA 4CFWA 1A48A 2WD1A 3ITZA 4HYUA 5C8NA 2HY81 3Q4CA 2V55A 2QG7A 3N4TA 4FICA 1PXLA 1UU8A 1P4OA 3NUXA 4CCBA 1R1WA 3UPXA 3ZONA 3NDMA 2UVYA 3FPQA 2GPHA 4AX8A 2ONLA 4YBJA 3BYVA 3BGPA 3PP0A 3CS9A 3U51A 4K6ZA 2PZYA 3LXNA 4C2VA 4UWYA 4HYIA 1PXOA 2WXVA 3LCTA 4DGGA 2Z7SA 3CXWA 1JNKA 3G9NA 5CVHA 3A4OX 3U87A 4A06A 1G8SA 4DN5A 2WTKC 4E4XA 3KXXA 5CTPA 3PXRA 5JRSA 3D15A 4G6OA 2G9XA 2W0JA 2XB7A 1PMEA 2PZRA 3EN5A 4QNAA 3VBWA 4DFNA 3TUDA 4D4RA 3BYOA 4I3ZA 3VS1A 3BHVA 4BDGA 5C27A 4QTEA 5A9UA 1BKXA 2OIDA 4O2PA 1YI4A 4GL9A 2YWVA 4WNOA 4RBLA 3NGAA 1FVVA 4I1ZA 3ZUVA 5L2TA 1FGIA 3FL4A 3OXIA 3AC8A 2JKKA 1Z57A 4J8NA 1REJA 1WZYA 3MH3A 4JG7A 2JFMA 3KRJA 4QP2A 1PF8A 3ORMA 4XG2A 2UW8A 5KMOA 1PY5A 3FZOA 2R3GA 4F64A 1H1WA 4HYHA 3IDBA 3BI6A 5D7VA 2PY3A 4YZBA 4DA5A 3LJ0A 1UNGA 1SVGA 2CMWA 3VJOA 1OI9A 4NIFA 3FZTA 4ANQA 3PXYA 2WMUA 2B4SB 2EXMA 4UMRA 1PJKA 3NUSA 1YWRA 5FEQA 3NCGA 2YISA 3UP2A 4C8BA 3IOPA 4RFYA 2BROA 1NW1A 3Q4ZA 5IZFA 2PE0A 3IECA 4ZTMA 4B4LA 4XYFA 3ETAA 1ZMWA 3LFNA 3MTFA 1LR4A 4E6DA 2XKCA 4NM5A 5AA9A 1MQBA 2PU8A 4MF0A 3RP9A 3W8LA 3K3JA 3NLBA 1V0BA 1M2RA 5EHYA 5M55A 2JDSA 2W1HA 3F5GA 5FEDA 4KS8A 2WB8A 5DEYA 3QCYA 4B9DA 4XP0A 4F7SA 3SLSA 4FKOA 4EK8A 5EHOA 2UUEA 4QP9A 1ZWSA 4NEUA 3RM6A 4YO6A 2R7BA 1OIYA 1XKKA 2XIKA 2YDKA 3OOMA 4F70A 5F94A 3R9NA 4USEA 3IGOA 3IW8A 1FBNA 1Q24A 2REIA 2F2CB 3GCPA 2WQEA 3VS6A 1ZMVA 2VTNA 4IAAA 5FG8A 3VBTA 2GNHA 4IB5A 3FMHA 4X3JA 5E8ZA 2OJJA 3NNWA 3OY1A 5HORA 2Q0NA 3W2OA 2VO0A 3NNXA 3LZBA 4DGMA 3ZRMA 3PA5A 2G2FA 3HMPA 4IB0A 3NYVA 2I0EA 1WBWA 4RC4A 2GNGA 3M42A 4CKJA 4I21A 1VJYA 4TWNA 4GS6A 3F3UA 3H9FA 1MUOA 4IVCA 4R7HA 3R8UA 4FL1A 4RA5A 4F7NA 4V04A 4CQGA 5AEPA 4BGGA 5M07A 4Z3VA 4PPBA 3DNEA 4NTTA 4N57A 3PY0A 4XV1A 4OTDA 4FIJA 4BCHA 3IDCA 3LMGA 4R7IA 1P5EA 3ACKA 1M2QA 3FKLA 5L8JA 4D2WA 3FEGA 1ERKA 1Q8YA 3O71A 3HMMA 4EH2A 2YCQA 2C6EA 5HI2A 3E5AA 3H9RA 3NSZA 4NKAA 4F08A 3KRRA 3TUBA 3ALNA 3P7BA 4E26A 3FUPA 3FLZA 1I09A 1TKIA 5A4EA 4PP9A 2ACXA 2W1IA 4EL9A 5M4FA 4TXCA 4UYNA 4KNBA 3VS0A 3RPVA 5A54A 3HUCA 3SW4A 3R7UA 3G2FA 5CI7A 2C69A 4BCFA 4W9XA 5DT4A 4AT4A 1YHSA 3R8LA 4V01A 3QWJA 3MV5A 2WFYA 4F09A 1XJDA 4FTOA 5CSXA 4ENYA 1IRKA 2J51A 5CU6A 4XRLA 3R63A 3QZFA 4O6LA 1ZMUA 2AC5A 2PVYA 4QYYA 4O83A 4ZEGA 1Q8ZA 3WF6A 4FKLA 4KKEA 2P0CA 2WZJA 4ZJIA 4EH9A 4AFJA 4RWLA 3LPBA 2QODA 4X2KA 2IZRA 3ENHA 5EI6A 5GIOE 2QOIA 3EQIA 1W7HA 3ANQA 3HP2A 1U4DA 4I4EA 4L67A 4DBXA 4BZDA 4EBVA 3KXGA 4GIIA 4TW9A 3QA8A 5E8TA 3CGFA 2QI8A 3VS5A 2GS7A 1GJOA 2JAMA 3DOGA 4J96A 4OBPA 4X3FA 3R9OA 1Y8YA 3PJ3A 2HAKA 4O38A 2GQGA 5LMKA 3Q9WA 4H3PA 4FT7A 1YXUA 5EI2A 5AWMA 2X39A 1VYZA 1MRUA 2WTKB 3ACJA 4YLLA 3GQIA 5EYKA 4RMZA 5KX8A 3V6RA 2YDIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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