3TCPA

Crystal structure of the catalytic domain of the proto-oncogene tyrosine-protein kinase mer in complex with inhibitor unc569
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
287
structure length
256
Chain Sequence
LEDVVIDRNLLILGKILGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of Novel Small Molecule Mer Kinase Inhibitors for the Treatment of Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia.
pubmed rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Mer
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 256
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3tcpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tcpA01
4L01A 3QD2B 2UW5A 1YVJA 1ZMUA 2VTTA 3NPCA 4LV5A 4XLIA 1OPJA 2WQBA 3ZM9A 2OK1A 5TE0A 4IAIA 4AOTA 5C4LA 2X7OA 1R0PA 3ET7A 4U43A 3RWPA 3VF8A 4D1XA 3ID6C 3LQ3A 3BEGA 2JDSA 4OTWA 2VWVA 4BDJA 4JQEA 5M51A 4HJOA 3PXFA 4O7WA 3D5XA 3FYKX 1X8BA 1V0BA 4DAWA 3C5IA 5F94A 3IGGA 2JIVA 5CWZA 3NR9A 2QR8A 4O0SA 3QTIA 4ITHA 4QYYA 4OTFA 4S32A 2W06A 3VS6A 3KULB 3BLHA 4F9WA 3C4XA 3LXLA 2UV2A 4RA4A 3ZMMA 1Z5MA 3G6HA 5JFSA 5K4IA 1ZZ2A 3A7JA 3ATTA 3I1AA 1XKKA 4DLIA 3COMA 2G9XA 1JVPP 3PSDA 3G9LX 4ORKA 4ZMFA 4M69A 1M7NA 3KXMA 4FIEA 4TYHA 1FGKA 1J3HA 4D0XA 4QYGA 2XNMA 4AOIA 4CCBA 3PP0A 3R9NA 2ZMCA 3LIJA 3ZBXA 4BWKA 4DBXA 3FL5A 4J98A 3ZFXA 3KN5A 3E8EA 3VUTA 2PMNX 2WIPA 4EZ7A 3CD3A 4U5JA 4PL3A 3OTUA 2VO3A 4NYEA 4DH8A 4Y85A 4IE9A 3BV2A 3VS3A 3HMMA 4ACHA 1R1WA 4MD9E 3FDNA 2ITUA 5BUIA 3FXZA 3KXHA 5HCZA 1PXNA 2VAGA 3PYYA 5IDPA 3R7YA 3UQCA 1BLXA 4RIWA 4ZTHA 3HAMA 2YA9A 4HVSA 2J0KA 4WO5A 1H24A 4EC8A 2RFNA 2F49A 3QWJA 2QLQA 4A7CA 2B54A 2OU7A 4FT9A 4C37A 3BQRA 2VUWA 5A4QA 2CDZA 2HY0A 4NJ3A 3IO7A 2OZAA 3D5VA 3QRTA 2I7QA 2VGOA 1MUOA 3AT3A 3OC1A 3C13A 4FTUA 5JT2A 4GS6A 4C59A 1H07A 5KX8A 5AUUA 3KCKA 3R8VA 4F9YA 4BDKA 2I1MA 1H1PA 5IQGA 2CKOA 4EHEA 3NUAA 2BR1A 3GU5A 3QTRA 2YISA 4C4EA 2ITXA 4F4PA 2X6EA 3BU6A 2VWBA 2PVKA 1ZRZA 1J91A 2UZOA 3TT0A 4C0TA 3R0TA 3LFCA 3R2YA 2C6LA 2GNLA 3PWYA 5HIBA 1J1CA 2CN8A 2YZLA 1SMHA 2ZYBA 2HYYA 1YXTA 1W7HA 3DTCA 5A46A 5IH4A 4DEAA 4P5QA 1NY3A 5JRQA 4GG5A 3AC4A 3ANQA 4U45A 1KE9A 3FMHA 4M15A 5CAQA 3DQXA 4EOJA 4QMWA 1R0EA 2CGVA 2WAJA 2XIKA 3GCUA 3OCGA 3TJCA 2R3KA 5C03A 4DC2A 3HAVA 4BY9E 4FSWA 5ANEA 4OTPA 2VO0A 3R9HA 1QPCA 3HV6A 2OIBA 3D7ZA 4MQ2A 4QMZA 4IFGA 3MH1A 2E9OA 4N70A 5FG8A 5LCKA 4CFFA 5JK3A 4PP7A 3DCVA 5B0XA 3K5UA 4CG8A 5IQAA 4MXXA 4MX9A 1ZMVA 5EYMA 1Q62A 3IONA 4RIYA 3LZBA 4I41A 5M08A 1FMKA 1ZYCA 4QYFA 5KZ0A 2IZTA 1ZY4A 3I6UA 1PJKA 1XH5A 2QC6A 4FICA 1YOMA 2HWOA 3II5A 3QD4A 2W5HA 4RX7A 5HGIA 3DS6A 5J1VA 4IAKA 5BYZA 3VRZA 4FK3A 4R3RA 3V5LA 4KBKA 5CF6A 4BCJA 4JG6A 4O0RA 3N4TA 4ZY6A 3EN5A 2E9VA 4OT6A 4O7RA 3QCYA 3GNIB 2F9GA 4FI1A 4EC9A 5IZFA 2GQSA 5EOBA 4YURA 1S9IA 3JPVA 4BZNA 3LCTA 5IMEA 5CQWA 3GFEA 5DPVA 1G8SA 2X8DA 2VN9A 2YM8A 4FT7A 3TUBA 4RX9A 2PHKA 1CKPA 4O0UA 1XQZA 3U87A 3V3VA 4IM0A 3M42A 1PRYA 3NAYA 2VTRA 2PL0A 3FLNC 4EYMA 3F5PA 3FMEA 5DYJA 2BHEA 3VBWA 3B8QA 3MB7A 5IA5A 4ZY4A 3D7TB 3MPMA 5DHJA 2VV9A 4BTKA 4HZRA 4XH6A 4NSTA 4V05A 3F3VA 4LV8A 2F7ZE 5CSXA 5IQFA 1UU9A 4C3FA 2HY81 3KF4A 5J8IA 2JFMA 4ERWA 2OIQA 2PE0A 5HU9A 2Y4IC 5JFWA 2Q83A 3KULA 4O7VA 2YJRA 2BRNA 3M11A 2W4JA 4IBMA 2W7XA 4OGRA 3KQ7A 3KN6A 1KE5A 1Q99A 3GVUA 5FXSA 4FTAA 3EQFA 4RIXB 3FBVA 2C1AA 1LEZA 5CU2A 4DBNA 2JC6A 2QHNA 3KRLA 3PLSA 4NM3A 3O71A 3PTGA 4RG0A 5HE2A 2CNQA 4WUNA 4XBUA 3VW6A 4QTDA 3QCSA 4O84A 2CLXA 4FEQA 3C0HA 3ZSHA 5K4JA 2XBJA 3G51A 2IW8A 4X3FB 2C3IB 4A4LA 2WKMA 3IW6A 2O2UA 2O65A 3ZS5A 4BIEA 4XG6A 2GSFA 4TNBA 5CZHA 4YHTA 3WF6A 2OJGA 2QU5A 4G9RA 3IDPA 2J0MB 1UNGA 3FHRA 4GSBA 4LGHA 4FA2A 2QHMA 4NWMA 3PG1A 4ZTQA 3UO4A 3RPRA 4AUAA 2OXXA 3I79A 2PYWA 2E2BA 3JR1A 3WF5A 5EDQA 4KABA 5M4IA 3DJ7A 2WTKC 5CQUA 4AN2A 3IPHA 1PXIA 3NCGA 3TNIA 2XVDA 5CEMA 3UG2A 2WMVA 4NTTA 3ZDUA 1OI9A 4J71A 5FM2A 3LM0A 3EIDA 2CNUA 4CXAA 4V0GA 4D9TA 2IG7A 3BYVA 3ZLSA 1A9UA 4R78A 4EQCA 1Y8GA 4C4JA 2J2IB 3LCSA 4MXOA 2I0VA 2V55A 2CHLA 3OXZA 4CNHA 2HZ4A 4NFMA 4O6EA 2PZ5A 1MP8A 3BCEA 3NS9A 3QQGA 3ORTA 4G3FA 4IZ7A 4WSYA 2C5XA 1FVVA 4UXQA 1B38A 5T3QA 4NL0A 3K2LA 5CEPA 5AM6A 5I9WA 1JSVA 3NVMB 2C1BA 4YU2A 3QAME 4FTQA 3FZSA 1BI7A 5D7VA 2UZBA 2J5EA 4FZ6A 5ITAA 1WZYA 1RJBA 1Q5KA 3NRMA 3F3ZA 4CMTA 3UYTA 4IB1A 5HTCA 1OL2A 2W1FA 4LI5A 3DBFA 2ITWA 2BRBA 3LE6A 4AA0A 5BVFA 4BVUA 2VX0A 5HO7A 2BCJA 5ANOA 4I5PA 5HVJA 4U6RA 4XP2A 4FEWA 2PZPA 4H3QA 3KKVA 1SVEA 1MQ4A 3BBWA 1WCCA 2GDOA 3DBCA 3WYYA 2BVAA 2HIWA 2R3QA 3QHWA 3VHEA 1SVGA 2PE1A 4WT6A 3EOCA 5JSMA 1IAJA 4QYHA 3Q6WA 5B2LA 5LVMA 4WNPA 2YIQA 2NRUA 1H1WA 4E7WA 4CKIA 2XCHA 3TNWA 2FUMA 4D2TA 4RJ3A 4JQ7A 2RKUA 2BKKA 4FZAB 4PQNA 4I20A 5EHYA 4R5SA 4ZTSA 3D14A 3TKUA 3VUHA 3EB0A 3O0GA 2W1GA 3QF9A 1YWVA 2P2IA 2DQ7X 4FKSA 4O1PA 4XG3A 2QURA 3V51A 1ZOHA 3HMPA 2A2AA 3HDNA 1I44A 2Y4PA 3MVJA 4C61A 5I9XA 3AGLA 3D9VA 3SVVA 2WNTA 1FOTA 2C6MA 4H3BA 4C34A 4X21A 3BWFA 2C0OA 3MA3A 3GENA 1OMWA 3NCZA 2XCKA 4U3ZA 4U79A 3QC4A 4QMYA 4U97A 3KRRA 4FNXA 4MBJA 4QMSA 5ETIA 2CMWA 4O7SA 1MRUA 3GU8A 4LMNA 3UG1A 3WI6A 5E4HA 4GJ3A 4FV4A 1OBGA 3WIKA 3BGPA 1DI9A 3NAXA 4NTSA 5C8MA 1YOLA 1K9AA 2JFLA 3Q4ZA 5DT3A 2FVDA 5LMKC 1OB3A 2IVVA 3ENMA 3R00A 3F9NA 3FLSA 1FQ1B 3OFMA 2DYLA 3F5UA 4GCJA 3RZFA 4LUEA 4W4VA 3UOKA 5E9EA 3TACA 4D4YA 4EH9A 5EW3A 3QZFA 5DI1A 5JEBA 2ZV2A 3MIYA 5HBEA 1URWA 2UVYA 3TIYA 2FYSA 3TNHA 3ZFYA 2Z7SA 2Z8CA 4K1BA 5HIEA 3L9LA 4IX4A 2W99B 5HLPA 1M2QA 5DRBA 2I0HA 2C5OA 3P08A 2RFSA 2XNPA 1A06A 1H8FA 3H4JA 2JKOA 3OTVA 1SNUA 1LPUA 3LCDA 3AC1A 1PXKA 3OCSA 2ITNA 4FZ7A 4N6YA 3VHKA 3FAAA 3VQHA 4DCAA 3ACKA 1Q61A 2Z60A 5IEYA 5ETCA 1UWHA 3JYAA 1JKKA 3KCFA 2J0JA 2OICA 4ANNA 5EYDA 5BVWA 3R8LA 2XYUA 3G9NA 3U6HA 4ANLA 2XS0A 1PKDA 3NNUA 3N51A 5HESA 5I9UA 4WBOA 3OW4A 1Q8YA 3LXKA 4TN6A 2VNWA 4HCTA 2WFYA 4WUAA 1KWPA 5DH3A 3TZMA 4PMSA 4R1YA 3RHKA 4ZZOA 3W8LA 3FI8A 4I6BA 5AR7A 3PP1A 4KIQA 3ODYX 4X2KA 5JZJA 3CKXA 4MXZA 4WOVA 2GFSA 4HNFA 4HZSA 2ETMA 2JKQA 2OFVA 4L3JA 4DTKA 3P78A 1QPEA 5AUZA 2J51A 4Q5EA 4O86A 3CE3A 4BTFA 4QPMA 3FLZA 2XK6A 4BDCA 1YXVA 2VX1A 2XIYA 2RGPA 3FPMA 4KIPA 5A9UA 4XEYA 5H3QA 4ZZMA 5BMMA 2QOKA 3PA5A 4GYGA 3LQ5A 2C68A 2WMQA 2YJSA 4JDKA 4O22A 4G3DA 4X7QA 4F0FA 1UU3A 4GW8A 1OL5A 1H00A 1OZ1A 3A7IA 1A48A 4YZNA 4YO4A 3MWUA 5KNJA 2WQEA 1K3AA 2CJMA 2IW6A 3EZRA 4FZDB 3VAPA 4DFNA 3DAEA 3PUPA 5HBJA 1IASA 4XS2A 3D83A 2P2HA 3ALNA 3F66A 3KC3A 3QTSA 2HZ0A 4O0TA 1DAWA 2C47A 1KOBA 5L6WL 4BN1A 2G01A 2PUUA 1TQMA 3ETAA 5D10A 3SHEA 4BDIA 4IJ9A 4NU1A 3PZHA 3FQSA 4FTCA 4XG2A 3RHXA 2HELA 1PMVA 2R3OA 4BCOA 4KD1A 4TWCA 2AYPA 3UODA 4CLJA 4I93A 4EBWA 3QXPA 4L53A 1NXKA 4M0YA 3S4QA 4QTBA 5A4EA 5FDXA 4K0YA 4D1ZA 4IFCA 5FEQA 4IAFA 4BI2A 2GNIA 3NYOA 4XV9A 1G8AA 1UNHA 4FSTA 5LVPA 2YFXA 5E8YA 4EBVA 3NW7A 2V62A 5ETAA 4FODA 2OH4A 3L8XA 2EXCX 4KBAA 5AR2A 3PY1A 1K2PA 1BYGA 4FKIA 2O8YA 3CBLA 3SA0A 3P79A 1XR1A 3W2PA 4FTMA 4BCPA 4MXAA 5HO8A 3ZONA 4BDDA 4PDOA 3KREA 3VUIA 3VUGA 5AR3A 4GEOA 4Y46A 1WBWA 1OKVA 3QKMA 4FR4A 4KNBA 3C0GA 4RJ7A 4APCA 3UO6A 4AGDA 5CXZA 4DEHA 4FKPA 3SQQA 2XJ0A 3RKBA 3LJ2A 4BCGA 4BRXA 3R8UA 4OBPA 4FGRA 4UZHA 4G5JA 4F7JA 4JQ8A 2ONLA 4J8MA 4YZDA 4AGWA 2PVLA 1RE8A 3C4CA 3A7HA 1SYKA 4F63A 5D7AA 3LFNA 3OMVA 2ZB1A 4IANA 2QQ7A 4S2ZA 4BDHA 2O3PA 5DN3A 4BBEA 5FBNC 4YJRA 1G3NA 1XH9A 3CLYA 4UV0A 4G3GA 5GJGA 5HG7A 3W2SA 4GKHA 1U54B 3UOHA 4D0WA 4U0IA 3O7LB 4KS8A 3DBDA 4E4XA 2Z02A 2PVMA 4RFYA 4BYIA 4CTBA 2W4OA 2R7BA 3PXQA 3FJQE 4IMYA 3NIEA 4DITA 4BCMA 4RJ6A 5LVOA 3MJ1A 5H8GA 4P2KA 5EW9A 1UU7A 4I4EA 3RMFA 4PDYA 4YBJA 4BBMA 4LOOA 2CKEA 3JVSA 3QTWA 4YNEA 3BEAA 3SC1A 1KV1A 1YXSA 2G2IA 3WBLA 1PMEA 3OBGA 5CT0A 2IPXA 4AZEA 2XK7A 1H01A 3H9RA 2VNYA 3R9RA 5DBXA 3UVQA 1QPJA 4MF0A 4E26A 1OUYA 2J5FA 2YIWA 4L8MA 3QQKA 3B8RA 4WRGA 5I9YA 4W8EA 3D0EA 3BX5A 3EQRA 4FT5A 3WF8A 2P0CA 5I5ZA 2J90A 3FZRA 3VBTA 2ITPA 4M12A 2PUIA 3RBWA 5GHVA 4A4OA 3LMGA 4NKAA 4DH3A 5TR6A 2VTAA 2W4KA 5FUTA 4J95A 4Q9SA 2J4ZA 3NX8A 4G17A 5TO8A 3W16A 4E6DA 3FYJX 1ZYLA 3A62A 2UW8A 4IVBA 4KKGA 2UW9A 3ALOA 1YDTE 3FMNA 4JR3A 3PJ1A 4TW9A 2Q0BA 2WTJA 2WEVA 4U41A 3ZOSA 3U4WA 5ICPA 2HZNA 3LW0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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