3TNQB

Structure and allostery of the pka riib tetrameric holoenzyme
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
334
structure length
331
Chain Sequence
EFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure and allostery of the PKA RIIbeta tetrameric holoenzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein kinase, cAMP-dependent, catalytic, alpha
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 98
structure length 331
sequence length 334
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2011-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3tnqB01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tnqB02
4F70A 4O21A 2I40A 4F9WA 5C01A 3G9NA 3KMWA 3EZRA 5BUIA 5F4NA 1GAGA 5KE0A 3L9PA 4E20A 2PPQA 2XIYA 4BCNA 4USEA 2IZRA 3OWPA 3PPJA 5I9WA 1UKHA 4E1ZA 4NK9A 5LVNA 4D1SA 2GFSA 3V3VA 3OFMA 4KKHA 4CMUA 4XCUA 3DLSA 3OROA 3I81A 1ZOEA 4CGAA 3Q60A 3MGYA 2QOIA 3ZS5A 4P4CA 3NGAA 4Q9SA 3VBWA 1H0WA 4DH3A 1GIHA 3FWQA 3I0OA 1FBNA 4EH4A 4TWNA 3VF9A 3G0EA 4ZZNA 4JAIA 3EYHA 3PXYA 3FYKX 2Y4PA 2WHBA 2YDJA 3GT8A 4U0IA 2OXYA 3ITZA 4YJNA 4XRJA 1P4FA 4ENYA 4QT1A 5A4LA 2PUNA 4CSVA 3AMAA 3W8QA 2ZM3A 3MBLA 3AMYA 5G1XA 4ANSA 5FXRA 2BIYA 4U45A 5I5ZA 2XVDA 1O6YA 5HBJA 3QALE 4DEIA 1YVJA 2R3OA 2V62A 5C8MA 4CG8A 5BVWA 1W84A 3P4KA 4K11A 4MTAA 2G2IA 1PF8A 4A4LA 1UVRA 3MFRA 1MP8A 3TZMA 4H58A 5DOSA 4FKLA 4X3FB 2QLUA 4BKZA 3R28A 4EZ7A 2W1ZA 2YM6A 3EFJA 3EFKA 5J9YA 2HK5A 2X8IA 3B2WA 3KVXA 4QNYA 3DFCB 4B8LA 5IQEA 4PRJA 5KBRA 3ALNA 1URWA 1XQZA 2ZJWA 4I0RA 3PWYA 4JQ8A 4KSQA 5B2KA 5JZJA 4ITHA 4FTJA 4GYGA 4JIKA 2OJ9A 1Q8UA 4EOOA 2IVSA 3T3UA 5JH6A 4G3GA 2UV2A 4JG8A 1A9UA 2A1AB 2PE2A 3BI6A 3T9IA 4JBOA 4RJ5A 3HMPA 5JRSA 2HELA 4RA5A 4FKTA 3DZQA 2GHGA 4JRVA 3V5LA 4CZYB 5A54A 4J97A 4C02A 5CEQA 3CPBA 4RZVA 3F3TA 3T3VA 4E6CA 5AP4A 3R1QA 3FXZA 4DH5A 1XBBA 5HQ0A 4F1TA 4EEVA 3PY0A 4K1BA 4RX5A 4O96A 3R30A 4XRLA 3UZPA 3TNWA 4CT1A 3UVQA 3BZ3A 4IW0A 3BYUA 4YJVA 3SHEA 3TTJA 2R3LA 2X9FA 4MXOA 5EK7A 2W5HA 3GC8A 4BDHA 3HRCA 5T3QA 1J7LA 1AD5A 3JXWA 3RK5A 3TL8A 3O8UA 4BDKA 4JBPA 5GIOE 1Q8WA 5DBXA 3NW7A 4MD7E 2R64A 4EOIA 1F5QA 4APPA 4R7IA 5FD2A 4LL0A 1PJKA 4AGUA 4RMZA 4PDSA 4M8TA 4L7FA 4XG4A 5LVPA 3KK8A 5AV4A 4O0XA 4BDJA 3KN6A 4OTFA 1OBGA 5HTBA 3F82A 3QUDA 4C37A 4L3LA 5IH5A 3QUEA 3EQGA 2PE1A 3OW4A 4RGJA 4XHKB 3OOMA 4NTSA 1FGIA 3IG7A 3LIJA 3TWJA 3VQUA 4MXCA 5JEBA 4HCTA 1ZZ2A 3GC0A 3NIEA 2ZM1A 5FM2A 3ORLA 3LFQA 4M0ZA 5DHJA 4C0TA 4QD6A 5D41A 4AOJA 4A9RA 3DZOA 2P33A 4QMLA 4EYJA 2C0OA 2XRUA 2OG8A 3A4OX 3COKA 4OTWA 1BUHA 5DR9A 1ATPE 3TIZA 2GHMA 3DLZA 3VS5A 4CFFA 3F5PA 3DXQA 1V0PA 2XM9A 4QPAA 2WTWA 3SDJA 2QG5A 3UMWA 4LOOA 3A99A 2E9PA 4EQCA 4PTEA 4PV0A 3EN7A 4BCIA 2AUHA 2O3PA 2R3RA 3HX4A 4N6ZA 3N4UA 3SQQA 3LFSA 2E9OA 3IW4A 4GK2A 4GKHA 3FZ1A 2OO8X 4K9YA 2YWVA 3BYVA 2ZV9A 4CZUA 1BLXA 1XBAA 5L6PA 4X3FC 1H28A 4BB4A 4H3QA 3RPYA 4L7SA 4BDDA 1H0VA 4BI0A 3HA8A 3NEWA 3DDPA 5M44A 2OJFE 2OJIA 3ZONA 5AR4A 2UZVA 4RWKA 4BCMA 2WOUA 3QL8A 5C4LA 2B9JA 3R04A 2V7OA 4KSPA 4UZDA 3VS7A 4PMPA 4DFLA 4PMSA 3QQJA 3F69A 3UJGA 1GOLA 4FC0A 4ID7A 5CT7A 2W9FB 1YI3A 4DEBA 2FYSA 3RHXA 3G15A 4TNBA 3ORPA 3OXTA 2F49A 3QCSA 5HLPA 4BCHA 5C8NA 5I9VA 2RKUA 3GENA 2JBOA 4H05A 2B4SB 2NO3A 3LFAA 5HO7A 2YHVA 4O0RA 3R9NA 4ARKA 2GMXA 2DQ7X 3NUYA 4FKUA 4U3ZA 2VWZA 4V0GA 2QC6A 5HNIX 3QD4A 4V05A 1IA9A 4CKJA 2YERA 5J1VA 5J95A 2G2FA 4I6BA 3LCOA 3AD5A 4IAYA 5M06A 4UV0A 4UMRA 1OUKA 4AXAA 3EQHA 3AD4A 5BVOA 3PG3A 3VN9A 4FTRA 3D2IA 4OR5A 4DTKA 1TKIA 4O0WA 4G3DA 4EOKA 5GJGA 2VO6A 3HYHA 4MYGA 4D4VA 4KIPA 4BL1A 2X0GA 1JSUA 1ZARA 3Q9ZA 4YHFA 2XJ2A 1LEZA 1Y91A 2UW7A 5T68A 3W8LA 1YXUA 2CLXA 4IDVA 3V01A 4EK4A 5AAGA 3U6IA 2QHNA 2YABA 3WF8A 4OTRA 1PXKA 3BCEA 4XG6A 4W4WA 5FQDC 3BHVA 3NLBA 3DT1A 4MVFA 4YTIA 1UU3A 4JQ7A 4YC6A 5A4TA 5ANGA 2YDKA 3KULB 4QMXA 5D12A 5DIAA 1UV5A 2VTJA 4TWPA 4FNXA 5M09A 4E5AX 2WZJA 3GNIB 3EN4A 3VUMA 3QZHA 3QQKA 1KUTA 2UZTA 4C57A 5DR6A 3OG7A 2OIDA 2ZB1A 4B0GA 5DEWA 4NKAA 3LXKA 3O96A 2PVKA 4UWCA 5CVGA 3EKKA 4V01A 3V8TA 4FTOA 2ITPA 4IAZA 5LVOA 2W4JA 2X2MA 4EZ3A 2OZAA 4BZNA 2FA2A 5AUTA 1H25A 3IOKA 1KWPA 4RFMA 4EOQA 1W98A 4LQMA 2WXVA 2OF2A 3BLRA 5DA3A 5I0BA 4O0TA 1CM8A 3P0MA 3TKUA 1FQ1B 3NYNA 5EM5A 1KV1A 3DFAA 3ZC6A 2OKRA 3F5UA 3LJ2A 4JI9A 3OMVA 1IAJA 3E92A 3UVPA 4H36A 3NUPA 5HU9A 4ZJJA 2ZVAA 4CFXA 3KQ7A 4KWPA 4QOXA 4YC3A 4QMQA 3RWPA 4JDIA 2RGPA 4I5PA 1YXTA 1OMWA 3ENHA 2W06A 3QC4A 4YSJA 3PXKA 2XNEA 2UW5A 3DS6A 3AQVA 4FZAB 4PDPA 5DG5A 5IA5A 4AA4A 3QD3A 2PMOX 1QPDA 4GUEA 4C3PA 4QQJA 3HMIA 4YZBA 3BQRA 5KNJA 1J1CA 5FM3A 4YU2A 4AT5A 3QX2A 2GPHA 5KMNA 3C13A 4AGCA 4QTEA 2UW9A 3KKVA 4ZXTA 3N4TA 3OT8A 3QRKA 3HV3A 4DG3E 1BKXA 5CEOA 2H34A 4HYHA 4D1XA 2GTMA 2HW7A 2R3QA 3CGFA 4EHZA 5HU3A 4IADA 3AT2A 3JVRA 3U9NA 1HCLA 4FV5A 3LKMA 3JUHA 4IIRA 2Z60A 4PL3A 4ZTSA 2QU6A 4FTMA 3TXOA 4HPTE 4HCVA 5KMKA 4YZ9A 3ULZA 3C0HA 4IAIA 5JGAA 3ORIA 5L8KA 4ZMFA 4AA0A 3SD0A 2GS2A 3PP0A 5I9XA 4XS2A 4YC8A 5K9IA 3F66A 2FUMA 2Q83A 1GZKA 2BR1A 4IM2A 2JDRA 2HZNA 2RF9A 2I7QA 4FL2A 4QMPA 4R8QA 4RIYB 3QTWA 3QD2B 5CALA 4C61A 5A4CA 5K5NA 4QTBA 5M51A 1E1VA 4ANNA 2WIPA 2R0UA 4NIFB 4DYMA 5K4JA 1E1XA 3BYOA 3F3UA 4USFA 3QQHA 3O23A 3V5PA 3MWUA 4M69B 3ZRMA 3EQIA 5BUEA 4DTBA 2HZ0A 4PL5A 3DK6A 3PFQA 3EN6A 4D0XA 3FEGA 2YIYA 4I21A 3GCSA 1G5SA 3VUGA 3N4VA 2F57A 3C51A 4U44A 5H3QA 4DCEA 1U5QA 2I0HA 4JT3A 1OPLA 4BI1A 5HE3A 4LYNA 2YFXA 4L53A 4Z7GA 3R8ZA 5A9UA 2B9FA 3FZOA 4WG4A 4EWQA 3ENMA 5CZIA 5ETCA 3SXFA 2VWYA 3FBVA 3DXNA 3HDNA 2VU3A 2W96B 2WMXA 1P4OA 3AGLA 3HVCA 4GT4A 4ZSLA 3VS0A 4DAWA 1GNGA 4ACDA 3LLAA 4K8AA 2GNLA 5L8JA 4FE2A 4FV8A 5LVLA 3ZO4A 3D7TA 1KSWA 4LFIA 3ELJA 1RQQA 5FTGA 4PY1A 1OL7A 3QRIA 4DT9A 3UP2A 3Q4CA 4S32A 1Z57A 4ALWA 2BAKA 4FZDB 2B52A 3OY1A 3R1SA 2GQRA 3DAJA 4BKYA 3NDMA 2YAAA 2ZYBA 4C7TA 4O7RA 4FTIA 2X4ZA 5DGZA 4QTCA 3DKGA 4WRSA 4Q5EA 4G3EA 3R7GA 3K3JA 3E93A 3VUDA 4RVKA 1WVYA 2VTTA 4C58A 5ANOA 5CSPA 3ID6C 4GL9A 1H08A 3BU5A 3HV7A 2QOFA 2VTOA 3LXNA 5HCYA 4BCGA 4BYJA 5I3RA 1M2QA 3W55A 4PDYA 5FUTA 4WO5A 3OEZA 4YMJA 2UZNA 3VF8A 3UQGA 3TZ8A 2X4FA 3OD6X 5L2TA 3EQCA 2SRCA 1PKGA 1HCKA 2UZDA 2WO6A 4D1ZA 2CN5A 3UVRA 5ETAA 2BILB 4M66A 1XH6A 3VAPA 4TPTA 3KRWA 5M08A 4XNEA 4WD5A 4R7BA 3BBWA 3W2PA 5IQAA 5DYJA 3L8PA 2ITOA 2XBAA 3KXNA 5CTPA 3BGZA 3Q5ZA 4IX6A 5HO6A 2C5OA 4J99A 5AUZA 2OXXA 4U80A 4X6RA 2W4OA 4CNHA 5E91A 3HV5A 2Y8OA 3IDPA 3AG9A 4O38A 3W2SA 3UYTA 3L8XA 3PJCA 3GB2A 2XCKA 2XNOA 3F88A 3NW6A 3QLGA 3HEGA 1PXJA 1SVHA 4A9SA 4OGRA 5AX3A 2PL0A 2YCQA 3FSKA 4I0TA 2WMBA 5EQYA 2C6OA 4WSQA 5LOHA 5DT0A 2B54A 3R9HA 2XK8A 5AUUA 4G17A 2X7GA 1BL7A 4IE9A 5IDNA 4J53A 3MPAA 3KB7A 3R2YA 2XS0A 1BI7A 4BZDA 4GK3A 2R3KA 3QKKA 4ZSJA 3R02A 3DTCA 1H1PA 5K5XA 3KCFA 4PDOA 2IVVA 5FRIA 4EUTA 3D5WA 4F9CA 4FYNA 1BL6A 4IB0A 4IX4A 4UX9A 4CD0A 3FLSA 1M7NA 2R3HA 3WZDA 4P5QA 5GJDA 4TY1A 4KINA 2P55A 1IA8A 3D2KA 5FEDA 4AZFA 1WCCA 1JSVA 4Y72A 2B9IA 3Q9XA 5CVFA 1FPUA 4IZYA 2G15A 2NPQA 2YITA 3TUBA 1JWHA 2C3KA 3ORTA 3BQCA 1ZOGA 5FEEA 5CI6A 5HBHA 4GT5A 4F64A 3B8QA 3OTVA 3JYAA 5CF6A 2HXQA 1OKVA 2HIWA 3VNTA 3MPTA 4U5JA 2XJ0A 5AP0A 4G9RA 4RJ3A 4TXCA 5FWKK 3SRVA 3RINA 5JFVA 2VGPA 3IW5A 2A4LA 3Q6UA 2VWXA 4GFMA 4GKIA 4M97A 2JKKA 3DKCA 5D7VA 3ZLYA 4YURA 3A4PA 4G6NA 4XLIA 2IG7A 2YEXA 1YOJA 2W1CA 3C4EA 4TNDA 2BPMA 4RIXB 2QONA 1K2PA 3VS1A 4FYOA 2YIQA 4JDHA 1ZYJA 2VRXA 1Q24A 4UY9A 4BCPA 4C38A 3NAXA 4Y95A 1K3AA 3JPVA 3R21A 2ITWA 4E8AA 4PQNA 2BRMA 3W18A 5J8IA 3S00A 1OKWA 2XA4A 4FSZA 4NM3A 4O6EA 5AR7A 3PZHA 3FUPA 3G51A 3MS9A 3FLQA 3EWHA 3HKOA 4DFYA 4E26A 2VO3A 4BCFA 4FNZA 4IANA 4LOPA 5IEVA 5GINE 4ZJVA 3MPMA 3QZGA 4R7HA 3EH9A 4IMYA 5IMXA 3D5VA 4LL5A 2JDVA 4E93A 3DBEA 1SYKA 1MRVA 4UMUA 2VGOA 2PUUA 4BKJA 4GV1A 4USDA 3RPOA 4C4GA 4NZWB 3G33A 4BWKA 2R3PA 3M42A 4TYHB 5DN3A 3ZXZA 1ERKA 5BVKA 3UO5A 5CENA 4YZCA 3T9TA 4BC6A 1OL5A 4BDAA 1PXNA 4M84A 1O6LA 2CGXA 2QQ7A 1GIIA 3KRJA 3BHHA 4FSMA 1IASA 4NUSA 2H9VA 3SW4A 4F08A 2JBPA 5KMOA 3E3PA 2GS7A 3DPKA 4EH9A 2HWPA 3QCXA 3DQXA 4DT8A 5HVKA 1VJYA 4CFWA 1OUYA 1ZYSA 3ODZX 2YAKA 3BHYA 3Q96A 4FT0A 5EDQA 4APCA 5E8SA 3UZRA 3MI9A 4FF8A 5J9LA 3FMDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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