3UDBA

Crystal structure of snrk2.6
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
306
structure length
275
Chain Sequence
LPIMHDSDRYELVKDIGAGNFGVARLMRDKQANELVAVKYIERGEKIDENVKREIINHRSLRHPNIVRFKEVILTPTHLAIVMEYASGGELFERICNAGRFSEDEARFFFQQLISGVSYAHAMQVAHRDLKLENTLLDGSPAPRLKIADFGYTPAYIAPEVLLKKEYDGKVADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDPEEPKNFRKTIHRILNVQYAIPDYVHISPECRHLISRIFVADPAKRISIPEIRNHEWFLKNLPADLGQSIEEIMQIIAEATV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular mechanism for the inhibition of a critical component in the Arabidopsis thaliana abscisic acid signal transduction pathways, SnRK2.6, by the protein phosphatase ABI1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase SRK2E
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 79
structure length 275
sequence length 306
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3udbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3udbA01
1LPUA 1M7QA 4DINA 3AT4A 3DJ6A 4V01A 1JSUA 5CEPA 5JGBA 5IQHA 5IA3A 5HORA 4XG7A 5E8WA 3QXOA 4TNBA 4YLLA 3GCPA 4H36A 5D41A 5HNGA 4AZVA 4FZAB 4YLKA 4FT7A 5CANA 1RQQA 4FT3A 4FKQA 5CSHA 3FMDA 3Q4CA 4R7HA 3UO6A 5AA9A 1YHWA 3W10A 4K33A 3RP9A 5BVEA 2JDSA 4GJ2A 4ANNA 4CFVA 3D15A 4EH2A 1VR2A 5AP4A 3VS7A 4GUBA 4OAUC 3ZM9A 3EQIA 1NVRA 4GEOA 2BRBA 1JWHA 2OWBA 2QOHA 5BMMA 4W4YA 3HMOA 5I9UA 4PMPA 2E9VA 4G3CA 3MFTA 2GFSA 5HTBA 3N4TA 4RWJA 5EI6A 5HLPA 4C3RA 4HJOA 4B9DA 5CU4A 1UNGA 4AN9A 4O83A 4DT8A 4C2VA 4YUQA 2B52A 4WSYA 3D7TA 5ANDA 4KA3A 5L2TA 4IAZA 1OITA 4G16A 1ZMVA 2J0KA 3EN4A 4JT3A 2XJ1A 5HE1A 2Y6OA 4F63A 4K6ZA 3DBDA 1FGIA 3CQEA 4I5MA 5FTOA 3GQIA 3KK8A 4GFMA 3P08A 4IVDA 3GCVA 3QHWA 3ZLXA 3LMHA 2VTPA 3L9PA 3EQGA 4D9TA 5TOZA 3OUKA 4AW2A 5CU2A 4ACCA 3QLGA 4I4EA 1GNGA 3QYZA 5IF1A 1Q41A 1U59A 5CEMA 3FDNA 3I6UA 4TT7A 5KCVA 2R7IA 2R3GA 2RKUA 2XCKA 4R8QA 4E4NA 4EH8A 2X8EA 4IAKA 1IEPA 1XH5A 5FG8A 3R83A 5KKRC 3M1SA 4M12A 3S1HA 3V3VA 1U5QA 4F1TA 4NKAA 4RIXA 2C6IA 3AC8A 3R8VA 2W4JA 5B2LA 5CLPA 4JG7A 4RFZA 1H0VA 2ZM4A 4LGDA 4E73A 3V5QA 4DEAA 4IACA 4XYFA 3FMMA 2VTOA 4DHFA 3VS6A 4G6LA 4FR4A 3KMWA 1UU3A 2B4SB 2J6MA 3LVPA 4IVBA 5I3OA 4ZIMA 1H27A 4JQ8A 4BCMA 3HV7A 5DR9A 2OLCA 2QONA 4HYSA 2C3KA 2G15A 2YEXA 4XOZA 4JDJA 2OF4A 4RFMA 5BVNA 3PLAE 1B6CB 5AX9A 1ZLTA 5KO1A 5EM8A 3SW7A 4YLJA 4MVFA 3FI8A 3LE6A 4L7SA 5AMNA 2C3LA 1XO2B 3V04A 4USFA 2ERKA 4FIFA 2PK9A 4PUZA 4YTIA 3UOLA 3ZEWA 2G2HA 4F7JA 5ICPA 3PVGA 3W32A 2ETRA 1R1WA 3TM0A 3LZBA 2XJ2A 4NH1A 4YJRA 4H3BA 3ZM4A 3R2BA 3QTUA 3MSSA 1JAMA 2CNVA 2VO7A 2XK8A 2VTQA 4I6FA 4EOIA 3QHRA 1OECA 4DCEA 1SVHA 4NM3A 3ORZA 4RC3A 3HV6A 4XLIA 3UVRA 2NRUA 3PVWA 5M4UA 2HK5A 2BKZA 1QPJA 4J8MA 3DK7A 2Y8OA 3I0OA 1FVRA 3U87A 3U9NA 4X3FA 3BEAA 1S9JA 3ZU7A 3OWKA 4LV5A 3I6WA 3VF9A 3P9JA 2X8DA 3MH3A 5EW3A 4IZ5A 4JG8A 5CEIA 2DS1A 3P7BA 4GU9A 4WG5A 5IDNA 5HTIA 1WBOA 2C4GA 5C26A 3PWYA 2WTVA 3I7CA 5D1JA 2DWBA 3H10A 5HHWA 4F9BA 5EHYA 5FXQA 3DKCA 4JAIA 4DT9A 4O86A 3RK7A 4QQ5A 5AV0A 3VQHA 4FSYA 3EHAA 5J87A 3IDBA 3DNDA 3QL8A 4XRJA 2BRNA 3NNWA 2HXQA 5L2IA 3E5AA 1MQ4A 4X2NA 4DEEA 4ORKA 4EJ7A 4M15A 1XJDA 4LRMA 1W8CA 2GTNA 5D12A 5CXZA 1STCE 3DFCB 3E88A 4NZWB 5IQIA 2VTIA 1UA2A 4O96A 1OL1A 3Q4ZA 3R21A 4KB8A 3LW0A 5L6WL 4BYJA 3BBTB 3VW6A 4BCIA 4F09A 3A8XA 1OKWA 3KFAA 4FKGA 4BDJA 1A48A 4IM0A 3VAPA 3S3IA 5I9YA 3HKOA 3MFSA 3CTHA 4BCKA 1KE5A 4X2GA 5HICA 4J97A 4XG4A 4EH6A 5A46A 2CNUA 1F5QA 2PE2A 2X7GA 4FTOA 2QOQA 3DB8A 2WMSA 3OC1A 4G1WA 3HV5A 4LUDA 5HO7A 4ZMFA 3HRBA 1XBCA 3NAXA 4BDEA 2BZHB 3CC6A 2XK3A 3BHVA 4UXLA 1YI4A 4BWXA 2FSOX 3C4CA 5AAEA 5IG1A 3KXZA 3ZFXA 2R3FA 2R0IA 4GT3A 4FTUA 4BHZA 4FTAA 5H2UA 4Z9LA 4EOJA 5KX8A 3BEGA 1M14A 3PXRA 5TT7A 3DXPA 3OCBA 2PL0A 2C47A 4RJ3A 4X3JA 3NUNA 2VRXA 1BYGA 1P4OA 2IO6A 2Y6MA 1YOMA 2B9FA 3MDYA 4ZOGA 3DBFA 5FBNC 5CF6A 2ETMA 3FMNA 5FTGA 2YCQA 3UNKA 2FSTX 4CCBA 3IK3A 1KSWA 3QF9A 4FL3A 4I4FA 4K2RA 5A54A 4QP3A 3VUIA 4C4IA 5GZ9A 4I0SA 3ZFMA 3UQGA 4RX7A 1Q8YA 3MIYA 2ITWA 4YJPA 4QPMA 4NIFB 4AZWA 4FYOA 3WILA 4BB4A 1H1SA 4MKCA 4UYNA 3R22A 3PPKA 5EW9A 3BHHA 3Q9ZA 1Z5MA 2J0IA 3QFVA 5FWKK 1GIIA 3V01A 3WZKA 3H9OA 2PZRA 4FV8A 2R2PA 3SHEA 3QCSA 4KIOA 3FSKA 2UW3A 5BNJA 1KE7A 4DEDA 2PVNA 1ZWSA 2YM4A 1M52A 3NMUF 3QKLA 1TVOA 5DNRA 3OOGA 2JC6A 2ETKA 1M17A 3F3ZA 4Z7HA 1QPDA 5IMXA 2YCFA 4KBCA 3ZEPA 2QKWB 4QTBA 3K5UA 4L68A 1RJBA 1ZYJA 3LAUA 3FLSA 4IZYA 4P5QA 1UU7A 3R1NA 3VULA 2YFXA 1OMWA 3HRCA 4QYYA 3MESA 4O7VA 3VUHA 1YW2A 5LMBA 5HE0A 2HW6A 3MV5A 3HV3A 4QD6A 5HVJA 4ZY6A 3ANRA 3ZOSA 4AU8A 2BZKB 2W9ZB 3P0MA 4HCUA 5DA3A 2W1GA 4HCVA 5DBXA 4UMRA 2XK9A 3T8OA 4G3GA 5F4NA 2PMLX 3TI1A 3EN7A 3F82A 2QU6A 3LCDA 1Q4LA 3EQRA 4V0GA 5IA5A 1DM2A 3TNHA 2F57A 3KVWA 3QQLA 2J51A 4FTMA 2XK4A 1ERKA 4MQ2A 1LEWA 1OPLA 5TF9A 4AT3A 3TT0A 4AZSA 4FV1A 5A4QA 3A7JA 3JYAA 1G5SA 4MD7E 3PA5A 2CCHA 4IANA 2Q83A 3V5JA 1YHVA 2C5YA 2ITQA 3E8CA 4JLCA 5AR3A 4AS0A 3CD8A 1BL6A 3FBVA 1W83A 4WUAA 3KRRA 2QOKA 3QUEA 5JH6A 3ALNA 4RIOA 5AAFA 3DDPA 4QYEA 3IO7A 5AR7A 5BYZA 4GIIA 2YDJA 4K11A 3FXZA 4U43A 3CKXA 2IWIA 4GJ3A 2W4KA 2W5HA 3D2IA 3NLBA 3FZOA 5C8KA 3LCSA 2QD9A 3OG7A 3ZRLA 2PHKA 5AV3A 2C6DA 4NFNA 1OIYA 2AC5A 2XB7A 4FT5A 4CFMA 4EK5A 2PUNA 4IAFA 3NUPA 4RSSA 4MBLA 2C5VA 4FUYA 5DYJA 4O7TA 3EN9A 2F2CB 3MFUA 4YZCA 5DFPA 3FKLA 5GNKA 3IOPA 3QQJA 5E91A 4FSMA 4CFXA 3KKVA 4NJDA 5JZNA 1DI8A 5IEVA 4ASZA 1U4DA 1WBWA 2PE1A 1QPEA 1M7NA 1ND4A 3ZCLA 2UZDA 1IASA 3FLNC 2Z2WA 3KCFA 3Q52A 1H08A 1PMNA 3N4VA 3BBWA 2W1IA 4I93A 4KS7A 4PQNA 4NUSA 3BX5A 4I23A 3RK5A 3FMEA 3RHXA 4BCGA 3MVLA 4JVGA 3PY0A 4O1OA 2OIBA 4UZDA 2O65A 1YWNA 2WXVA 2GHLA 4FG8A 3DBCA 5HIBA 2CKOA 1SNUA 3ORMA 4TYGA 1ZY5A 5IQEA 3L9NA 3V51A 4XHKB 2OF2A 4YJUA 4EOQA 3W18A 5CNNA 3VUTA 5HU9A 2VTLA 2VWIA 3TV7A 5EQPA 3U6HA 3ZSGA 1RW8A 4WIHA 3JS2A 1NY3A 5DI1A 4BDAA 1O9UA 5ANGA 3OCTA 3I5NA 4CT2A 1GZOA 2UW7A 3LFSA 4FTQA 5CZHA 3UIBA 2OZOA 5M44A 3FPMA 3PY1A 3AMAA 4CYIA 2VTSA 3C13A 4NT4A 4F6SA 5CASA 4H3QA 2Q0NA 4BZNA 4DGGA 4FIJA 3AGMA 4Z55A 3F3UA 4D28A 1OL5A 2R0UA 1JBPE 2VO3A 4B6LA 4AW0A 2ZDTA 3KXGA 2B7AA 4BZOA 3HL7A 3BE9A 2OXYA 4O27B 1GJOA 4EOLA 3JVSA 3WZEA 2CPKE 4OAVB 3ZSHA 4U80A 4ZJJA 4BC6A 4O7LA 3H30A 3OVVA 3W2CA 2QU5A 3ZONA 2HWOA 4FF8A 3CE3A 4O0WA 2C3IB 2BILB 5GJFA 5T68A 4ANBA 1OBDA 4FE2A 1CKPA 5J9YA 3BI6A 5HOAA 2RL5A 3PFQA 3VBVA 3NYOA 1GZKA 3QQGA 4KUJA 4X6QC 3HECA 2J0MB 4ALVA 3MPAA 2WTKC 3NNVA 2YHVA 4IQ6A 3POOA 5FDXA 1JNKA 3COKA 3DV3A 3ZFYA 3O0GA 4ZLYA 4IWPA 3KULA 4U3YA 2IG7A 2IW9A 3C9WA 3Q32A 4GK3A 4QMVA 3QTSA 3KN5A 2GU8A 5FBOA 4LUEA 4AAAA 4F4PA 3QRKA 3QAME 4PDYA 4WO5A 1NVSA 4E6AA 3OF0A 2BDFA 2FB8A 2OO8X 3TNWA 3D2KA 2YCRA 2QCSA 3FZ1A 1MQBA 2VV9A 3QQHA 4FIHA 2J90A 2V55A 4AXAA 4NCTC 4FV9A 4IZAA 3D94A 3E92A 4IX4A 3AQVA 4RBLA 3LLAA 3VIDA 5CY3A 1ZOEA 3CY2A 3TZ9A 4F9YA 2QO2A 5LVPA 4H1MA 3Q96A 4LOOA 3AC5A 4F0FA 4V05A 4EOPA 3G6HA 5AP3A 4CMTA 4O81A 4FZFB 3EH9A 2JGZA 4PL4A 4RVLA 3DTWA 1YKRA 5H9BA 3ZUVA 4QTAA 4DFNA 2W7XA 4MXYA 3SAYA 2WMQA 4IB1A 3VHEA 4AOJA 2BZIB 3EQFA 3U8WA 3I1AA 1GY3A 4UMQA 2X1NA 4YJOA 4KS8A 4FTIA 4IADA 3SW4A 4JI9A 4FTJA 4I6BA 3JY0A 1YXXA 2J5FA 4PRJA 4IAIA 3S2PA 3UNZA 3Q3BA 4EJNA 4FEUA 4BFMA 2HOGA 3P78A 5HLWA 4CT1A 2GNFA 1BL7A 4JRVA 5BQ0A 3F3WA 2YJSA 4L3PA 5G1XA 4AW5A 4WG4A 3NYVA 4UWCA 4IM2A 4ANMA 3OXTA 2VWVA 2ACXA 2G01A 5C1QB 1YHSA 3UBDA 4OR5A 4QTCA 3UC4A 3CD3A 4E3CA 4AFJA 4PWNA 2WMRA 4RIYA 2ZV7A 4FIGA 3RM6A 3R1SA 3KREA 2XF0A 3H4JA 4FV0A 4OLIA 4MNEA 4EH4A 2P2HA 4CGAA 1F0QA 3QU0A 3CPBA 5HD4A 3AXWA 4ZSEA 4U40A 1U5RA 5IH5A 2ERZE 4QMQA 4CV9A 4RA4A 4F70A 1YOLA 5JFXA 5AP1A 4F7SA 4MAOA 5M56A 4BI2A 4DH8A 2YZAA 3CKWA 4EL9A 3UQFA 4LYNA 4QYGA 3SXRA 3CTQA 2WOTA 2VTJA 2XZSA 2Y4IC 4FTRA 3QLFA 1Q8TA 4RMZA 5LARA 3A4PA 3BYUA 3KMMA 4HNIA 4PMSA 3R9HA 2GNIA 3LJ2A 4WA9A 2WQMA 3O51A 4YR8A 5CSVA 3KU2A 4FOBA 4G2FA 1IA8A 1HOWA 3PVBA 3R01A 2YM8A 2VWWA 3ZYAA 4BI0A 3G51A 1Y57A 3ROCA 2VWUA 2XK6A 1VYZA 3A61A 3DBEA 3IONA 2YWPA 3P5KA 4RWKA 3PWDA 5L2WA 1WZYA 3PJ1A 1G8AA 4I24A 3OZ6A 1IRKA 3F61A 3TKIA 3U54A 1DAWA 4YJSA 5IEXA 3UIUA 2YIRA 4HZSA 4LOPA 3WIKA 1H0WA 3ANQA 2ZJWA 3EL8A 4D5KA 2ZM1A 4DEIA 3UYTA 5DEYA 4EI4A 2I0HA 4BDCA 2Y9QA 3IG7A 3UVQA 1YVJA 3G2FA 3HMPA 4L44A 4QMWA 5C03A 5KMMA 5K0XA 5FP5A 2BZJA 5IKWA 3Q2MA 4FV3A 4WKQA 4IZ7A 3GC7A 2WMVA 4DH1A 4FA2A 2UZUE 5LWNA 3LFDA 5JKGA 5A14A 1R3CA 4IJ9A 3RI1A 3HP2A 4F7NA 2G1TA 2QVSE 4QRCA 3SLSA 3DKGA 4KD1A 3OOMA 2UW6A 1YWRA 4XV9A 3BLHA 3DOGA 2ZYBA 3P7AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LPU A;  1M7Q A;  4DIN A;  3AT4 A;  3DJ6 A;  4V01 A;  1JSU A;  5CEP A;  5JGB A;  5IQH A;  5IA3 A;  5HOR A;  4XG7 A;  5E8W A;  3QXO A;  4TNB A;  4YLL A;  3GCP A;  4H36 A;  5D41 A;  5HNG A;  4AZV A;  4FZA B;  4YLK A;  4FT7 A;  5CAN A;  1RQQ A;  4FT3 A;  4FKQ A;  5CSH A;  3FMD A;  3Q4C A;  4R7H A;  3UO6 A;  5AA9 A;  1YHW A;  3W10 A;  4K33 A;  3RP9 A;  5BVE A;  2JDS A;  4GJ2 A;  4ANN A;  4CFV A;  3D15 A;  4EH2 A;  1VR2 A;  5AP4 A;  3VS7 A;  4GUB A;  4OAU C;  3ZM9 A;  3EQI A;  1NVR A;  4GEO A;  2BRB A;  1JWH A;  2OWB A;  2QOH A;  5BMM A;  4W4Y A;  3HMO A;  5I9U A;  4PMP A;  2E9V A;  4G3C A;  3MFT A;  2GFS A;  5HTB A;  3N4T A;  4RWJ A;  5EI6 A;  5HLP A;  4C3R A;  4HJO A;  4B9D A;  5CU4 A;  1UNG A;  4AN9 A;  4O83 A;  4DT8 A;  4C2V A;  4YUQ A;  2B52 A;  4WSY A;  3D7T A;  5AND A;  4DHI B;  4KA3 A;  5L2T A;  4IAZ A;  1OIT A;  4G16 A;  1ZMV A;  2J0K A;  3EN4 A;  4JT3 A;  2XJ1 A;  5HE1 A;  2Y6O A;  4F63 A;  4K6Z A;  3DBD A;  1FGI A;  3CQE A;  4I5M A;  5FTO A;  3GQI A;  3KK8 A;  4GFM A;  3P08 A;  4IVD A; 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 4USF A;  2ERK A;  4FIF A;  2PK9 A;  4PUZ A;  4YTI A;  3UOL A;  3ZEW A;  2G2H A;  4F7J A;  5ICP A;  3PVG A;  3W32 A;  2ETR A;  1R1W A;  3TM0 A;  3LZB A;  2XJ2 A;  4NH1 A;  4YJR A;  3TMO A;  4H3B A;  3ZM4 A;  3R2B A;  3QTU A;  3MSS A;  1JAM A;  2CNV A;  2VO7 A;  2XK8 A;  2VTQ A;  4I6F A;  4EOI A;  3QHR A;  1OEC A;  4DCE A;  1SVH A;  4NM3 A;  3ORZ A;  4RC3 A;  3HV6 A;  4XLI A;  3UVR A;  2NRU A;  3PVW A;  5M4U A;  2HK5 A;  2BKZ A;  1QPJ A;  4J8M A;  3DK7 A;  2Y8O A;  3I0O A;  1FVR A;  3U87 A;  3U9N A;  4X3F A;  3BEA A;  1S9J A;  3ZU7 A;  3OWK A;  4LV5 A;  3I6W A;  3VF9 A;  3P9J A;  2X8D A;  3MH3 A;  5EW3 A;  4IZ5 A;  4JG8 A;  5CEI A;  2DS1 A;  3P7B A;  4GU9 A;  4WG5 A;  5IDN A;  5HTI A;  1WBO A;  2C4G A;  5C26 A;  3PWY A;  2WTV A;  3I7C A;  5D1J A;  2DWB A;  3H10 A;  5HHW A;  4F9B A;  5EHY A;  5FXQ A;  3DKC A;  4JAI A;  4DT9 A;  4O86 A;  3RK7 A;  4QQ5 A;  5AV0 A;  3VQH A;  4FSY A;  3EHA A;  5J87 A;  3IDB A;  3DND A;  3QL8 A;  4XRJ A;  2BRN A;  3NNW A;  2HXQ A;  5L2I A;  3E5A A;  1MQ4 A;  4X2N A; 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