3UPZA

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with bumpless bki analog uw1243
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
464
structure length
458
Chain Sequence
TAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple Determinants for Selective Inhibition of Apicomplexan Calcium-Dependent Protein Kinase CDPK1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
total genus 158
structure length 458
sequence length 464
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2011-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3upzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3upzA01
1Q3WA 4EWHA 5J7HA 1NVRA 4HCUA 2XIXA 5G1XA 5HE2A 2QOKA 5EW3A 4V05A 3MVJA 3QCXA 4YTIA 2QG7A 4GSBA 4Y95A 1DS5A 3EFJA 3QTXA 2VAGA 4C59A 2NNWB 2ITUA 4AGCA 4EC8A 4OTPA 4UB7A 4USEA 1RJBA 3P5KA 4P5ZA 4QQJA 2I0YA 3F5GA 3SW7A 4ZS4A 4GVAA 3UNKA 2VV9A 5LMKC 3ZUUA 4D58A 2QNJA 5T6KA 3SHEA 3V5WA 3T9TA 4QP3A 3VS4A 3DDPA 4RIYA 3KRRA 4C8BA 3LJ0A 5EG3A 4GG5A 1UU3A 3D15A 3RAKA 5HORA 2ITXA 4FG9A 3ZCLA 2HOGA 5KHXA 1Q8ZA 5JGDA 4BCPA 2XIKA 4JG6A 2JLDA 3WYXA 4XOZA 4G5PA 1KE9A 5CF8A 4OUCA 4C4FA 3C0HA 2VTQA 4IC8A 4QTAA 4BKYA 1H0VA 3FPQA 4CNHA 3PFQA 3MIAA 4GFMA 4ZSJA 2VWUA 3BV3A 3OBJA 4PTGA 2WQMA 4X2KA 3PJCA 4YZDA 5HNBA 4QD6A 1YWRA 3G0FA 4DTKA 2OF2A 2WAJA 1PMEA 3OW3A 3H10A 4WKQA 4A4XA 2FA2A 4KS8A 2J0LA 2VTHA 4ZTSA 3JR1A 3C4ZA 3JY0A 3OXIA 1XJDA 2LGCA 1Z9XA 4CG8A 3Q6UA 3B8RA 3QRJA 4J7BA 4E8AA 3JVSA 1OVEA 1U54A 4FNYA 4DFUA 2VTMA 4KBKA 4LQMA 5HE3A 5AV1A 4R1YA 4G3EA 4X0MA 2W5AA 2YACA 1M2PA 3BBTB 4D4SA 4DGMA 2WEVA 3C4XA 2X6EA 5LVPA 1FVVA 4EH7A 3JUHA 2V55A 3NR9A 4PF4A 2BDFA 1DAWA 3I0OA 1Q8UA 4FSZA 4JDHA 5HG5A 2GCDA 2JKOA 1JKSA 1YXXA 4PL5A 4FTKA 4ARKA 3A99A 2XJ0A 5L6OA 3PJ2A 4RQVA 1UU8A 4O7LA 2XKEA 2X2KA 4MXZA 4V0GA 4NTSA 4I5CA 4OBOA 4DBNA 5L2WA 3QTRA 5CSXA 4F08A 1MP8A 2XA4A 3HEGA 1R0PA 4FSNA 3CTQA 4FK6A 2GNFA 3NUXA 3UDBA 4D4YA 4U3YA 4KRDA 3F3VA 4D5KA 2WMXA 4OBQA 3W2RA 3N4VA 2CNVA 4O22A 2C47A 2I7QA 4FA2A 1OZ1A 5CI6A 5HBHA 4AZSA 4I93A 3VBTA 1JKKA 2QOBA 3Q5ZA 3TUCA 4L9IA 2GFSA 1K2PA 3DJ5A 3BU5A 3QA0A 4RWJA 3HMPA 4FV4A 2BMCA 4Q5EA 3RM7A 3VBYA 2CKOA 4H58A 4D2SA 3N4TA 4TRLA 2YEXA 4FT9A 3RTPA 4O84A 4JQ8A 4YJRA 2E9UA 5D7AA 4RBLA 4YO4A 2CGXA 5DI1A 4AA5A 4JRNA 3AC8A 5EQPA 3G90X 4EOMA 5HU9A 3POZA 4KAOA 3Q4ZA 4FGRA 4HVHA 4ENYA 4FIGA 5KMOA 3EZRA 5CXZA 4XBUA 3FC1X 4JI9A 3OFMA 3BYMA 4IEBA 4HVDA 3FSFA 3G6HA 5AM7A 3QD0A 4KKHA 4I6HA 5CASA 3LLAA 1P5EA 2XRWA 4FKTA 4CKJA 3R30A 4ZY6A 4EOOA 4CRLA 4CZTA 4FSRA 5DT3A 4D0WA 4NKSA 4QMPA 4A9TA 4E93A 1PHKA 3MPAA 2CLQA 3DU8A 3LFBA 3PE2A 4UZDA 2H6DA 4FIJA 1JVPP 3ZLWA 4F7NA 4KINA 5FEDA 3BU3A 4EK5A 3AOXA 4BCFA 4BIDA 3B8QA 4PV0A 4Z55A 3LCDA 4GU6A 2VTAA 2WMSA 5FQDC 2Q83A 4LGHA 1MUOA 3ZFMA 5B0XA 3ZO3A 4AZEA 4M3QA 4C33A 4RVLA 3UGCA 1JSTA 2XBJA 1XH7A 3KXMA 3NS9A 4AW5A 4F0GA 2EUFB 1PF8A 4L3JA 4FTNA 5FBOA 4PPCA 3ROCA 5HX6A 1UU7A 2A27A 3KREA 3DB8A 3NVKI 4K8AA 2VWYA 3TN8A 4ACGA 3JYAA 5D7VA 4D4VA 3LFSA 3MSSA 4QMMA 2JAMA 5LMAA 3LFEA 4QP4A 3UOJA 5HVJA 4M69A 4AA0A 4P4CA 2IW8A 4BTFA 3VS5A 5A3XA 2XS0A 3H9OA 3BCEA 2VTJA 4GW8A 4O1OA 2R3PA 3R0TA 1W8CA 2CNQA 3R00A 4MXXA 2IW9A 3R8VA 2O8YA 2Y6OA 5A46A 3Q2JA 4X3FB 2J5FA 3F82A 2FVDA 4IAAA 3ZC6A 3OT3A 3TI1A 3TV6A 5EW8A 3UG1A 4BC6A 2UZVA 4LV5A 4UN0C 3C13A 4RJ3A 3E64A 4M12A 2Y4IC 3NEWA 3HUCA 4I23A 3NW6A 3WZKA 3ZZEA 1XWSA 4N57A 4EORA 2YM8A 4AU8A 4H3QA 3HKOA 3LQ3A 2YITA 4L00A 2UVYA 4QPMA 4I94A 4RC3A 4RIWB 4DT9A 3ENMA 2UZEA 4A4OA 2XJ2A 2QKRA 3DBDA 4R5YA 4HZSA 2XNPA 3FV8A 2O2UA 4DEBA 2FUMA 5AP1A 3A7FA 1ZYCA 4IZYA 2Z60A 5CTPA 3N9XA 5H9BA 4E5AX 2OU7A 2XEZA 3O23A 4DT8A 5EH0A 4WT6A 3UNJA 3Q9XA 2QO7A 2XEYA 5IEYA 4YTCA 4ASZA 1OB3A 4XH6A 3QUPA 5KHWA 2PMNX 4J99A 3RK7A 4TTHB 3KK8A 3ACKA 4S32A 1V0OA 5LVLA 4ANLA 1QL6A 2YERA 2WPAA 3WZEA 4K33A 4USFA 3SC1A 3BYUA 2XK8A 4AXAA 4NW5A 2CGUA 3VRZA 1VYWA 3NX8A 2OJ9A 3QUDA 2IZRA 3QRTA 4JNWA 5AP7A 4TWOA 1H07A 3E8CA 4XG6A 4DH8A 5FP5A 5M55A 3E5AA 3E3BX 3SRVB 5IUHA 3A8XA 3CPCA 5BMSA 2PUPA 1H00A 3S1HA 4II5A 1PXIA 2PWLA 2QI8A 2V0DA 5EM7A 3CQWA 4MTAA 2W9FB 3R7IA 2YIYA 2R3JA 2RSVA 2B1PA 4WRGA 3F2RA 4JX7A 4FV9A 4QMUA 4XHKB 4FSMA 5KUPA 3OWLA 1XO2B 4FOBA 3LW0A 5L6WL 1WZYA 4NCTC 4ACHA 4PY1A 3TV4A 4GFOA 4PDSA 4YTFA 3QGWA 4ZLZA 3QKKA 4O7ZA 3CIKA 4IADA 3G51A 3GCUA 3PJ3A 3R7GA 1WBOA 3ORPA 4KIQA 4EH2A 2Z7SA 4M97A 4YJSA 4XG9A 4FKSA 1LR4A 2C6MA 2BCJA 4YZNA 4Y5QA 2VWBA 3KXXA 1W82A 4FV1A 3NUSA 1FGIA 3UBDA 3CP9A 4I21A 4FKOA 3AC2A 4E7WA 3DTWA 4J96A 5CZHA 4QMOA 3NUAA 4CYJA 3UP2A 3QQHA 3QD4A 2C69A 3DBEA 4MNEB 2A1AB 2EB3A 5M07A 3LFFA 3OWJA 5IQCA 4Z7GA 5CYIA 3AC4A 1GIHA 5LJJA 4BY9E 2WMTA 2HY81 3GU5A 1XKKA 5K4IA 4NWMA 2XM8A 5EHLA 2XVDA 5IMXA 3HUBA 2BHHA 4EH9A 2YAKA 1A48A 3IG7A 2EVAA 4MD8E 4XLVA 3O0GA 4L3PA 5E8ZA 4KKGA 4DF3A 5L8JA 2BVAA 2C3IB 4QMZA 3KFAA 4CFNA 3EHAA 4OTRA 3ANQA 4LRMA 1UVRA 2X39A 4YSJA 3KXZA 5A4CA 5BVDA 3UC3A 3C4CA 4H36A 3AT4A 3CKXA 4BGHA 3C0IA 3DLZA 3TIYA 3I60A 4EH3A 5CANA 2Y0AA 2O5KA 4FIEA 2VD5A 2OJIA 4GIHA 3QFVA 5HVYA 1ZMWA 4JS8A 3QQLA 4B8LA 1UWHA 2JC6A 5F4NA 5BUJA 1E1VA 5GHVA 4EK8A 4EK4A 4O7SA 3NIZA 3PIYA 4C7TA 4EHZA 5CSPA 4QPSA 4CGAA 4HCVA 5BMMA 2PVJA 4YNEA 2GFCA 4O0WA 5ANGA 2AUHA 3PYYA 4D55A 2R3RA 4ZJVA 2DQ7X 1CM8A 4Q5HA 3WARA 1VYZA 4FKIA 3EH9A 4AUAA 2OK1A 3HYHA 3D7ZA 2CKQA 3PSDA 4RIWA 2IZTA 4EKKA 5M51A 3THBA 4C61A 2XYNA 2B4SB 2JBPA 1JPAA 4G9CA 3EB0A 4DFYA 4O7NA 3FXWA 2W1IA 4AT3A 1XQZA 5FTQA 5M08A 4CLIA 4UYAA 4AT4A 3IW4A 4EOJA 3QL8A 4ANNA 3TCPA 3RAHA 2GS2A 4NM7A 5E1SA 5C8KA 4M84A 2WTCA 3BZ3A 4JIAA 3RM6A 3ORXA 5CY3A 4BKJA 4AE6A 4L53A 2C3LA 1NT2A 1U4DA 4BCGA 3EN7A 3U4WA 4N6ZA 1ZYSA 4O91A 2O64A 4NH1A 1W0XC 5CEIA 1MQ4A 4YC8A 3DJ6A 4PL4A 5AV3A 4BR3A 2CCIA 5DT4A 4FTRA 3OZ6A 2GNGA 4I1ZA 4MBIA 3VQHA 4HGEA 4NT4A 2W7XA 4L67A 1KE7A 1VZOA 3SRVA 3VS6A 5J79A 2BPMA 3PA5A 4NL0A 4TNDA 4JT3A 1FMKA 3UVRA 1H08A 4JAJA 3RAWA 4BZNA 1PXPA 5K5XA 2V62A 4PMPA 2QC6A 4YLKA 2YHVA 5K5NA 3K5UA 4GUEA 5AR8A 2R4BA 2GSFA 2OBJA 4DH5A 5I9VA 5AUUA 4NFNA 3PXZA 5EQEA 2R3GA 3BGQA 5D10A 4EYJA 2X8IA 2BDWA 4G3GA 4MXYA 3T3UA 2W5HA 4PUZA 4DGLC 2WOUA 3E93A 4D9TA 2ZDUA 5HO7A 4DTBA 4DLIA 2VGOA 2QVSE 1UKHA 5K0XA 1PXMA 1BI8A 2YJSA 5FM3A 3KCKA 3ZEWA 1P2AA 4DEAA 5KBRA 4DFBA 5L3AA 5IEVA 2QLUA 2R3KA 2QKWB 2RFEA 4AG8A 4O7RA 2XKFA 4WG3A 4FT5A 3ZO2A 4NIFB 3BWJA 3DPKA 2R9SA 3GENA 5CF4A 3M2WA 4MNEA 1ND4A 3RPVA 4FODA 4L52A 3UC4A 5JQ8A 4MF1A 4K77A 5IA0A 5IKWA 3VUGA 4X3FC 3CJGA 2R3OA 4ACDA 3DAKA 3EOCA 1OPKA 4FUXA 4F65A 3P08A 1XBCA 4CT1A 3CXWA 2GPHA 3GUBA 2BTSA 3KVWA 2OXYA 4W4WA 4BF2A 4ALUA 3RPOA 2JIUA 1L8TA 4KS7A 3QTSA 1TQIA 4YJNA 2W1DA 3QZIA 2GNJA 5E9EA 4L8MA 1YI3A 4WA9A 4JLCA 4YC3A 3R02A 2WMVA 2VZ6A 1O9UA 3QC4A 4JX3A 4FIHA 5EYCA 1G5SA 4ACCA 3NGAA 5AR3A 2BAKA 4IAZA 5CEKA 1OL2A 2E9VA 3V5JA 1YXUA 3DB6A 3ID6C 2X0GA 3SA0A 2R7BA 3DLSA 5IA3A 2R5TA 5AUWA 2XUUA 4LV8A 3UPXA 1WVWA 2IVVA 4U79A 4FTOA 5D1JA 4HVIA 5FEEA 4AN3A 2W4JA 5A6OA 2BRBA 2YLFA 4GYGA 3RI1A 2QHNA 4UX9A 5E8UA 1MQBA 3IOKA 4WIHA 2WTJA 3FAAA 3PIZA 4MEDA 5C4KA 3I7BA 2GHMA 3QZFA 2CLXA 4CZYB 2RFSA 3WBLA 2C5OA 3DKOA 4KKEA 1OGUA 2JIVA 2AYPA 5EW9A 2C6LA 3QQUA 3FQEA 3HECA 4TYIA 4U42A 5DGZA 4EL9A 4R7HA 5KMLA 3ZBXA 4QMTA 3TIZA 2CGWA 2QOQA 2Q0BA 2YA9A 3QCQA 5I3OA 5FRIA 3Q32A 2QD9A 4NK9A 4XNEA 3K3JA 4X2JA 4G31A 1SVHA 4LMNA 5AIKA 3VNTA 4DEDA 1IAHA 5ETCA 4ZZMA 3ULZA 5M4UA 4UBAA 3IGGA 1R78A 3UQCA 2R64A 5K0KA 3FMJA 2HZIA 4H05A 4RMZA 3KRXA 3VW6A 4IFCA 5CI7A 5IDPA 3LFDA 3R1QA 3GC8A 2X8DA 1OIUA 4LRJA 4RPVA 4L3LA 4UEUA 4AGUA 1FVTA 1MRVA 4FBXA 4BCHA 5KMJA 3VBWA 3W1FA 5A4EA 4AFEA 2X4FA 5FGKA 4MCVA 4KIOA 5DA3A 3ZRKA 2JFLA 2YM4A 1H1PA 4USDA 4RIOA 4WUNA 2CN5A 4ZZNA 1DI8A 5A54A 5IA1A 1ZOGA 1RQQA 4HJOA 5CNOA 2EWAA 2R3NA 4F7LA 3TV7A 2GHLA 1WBWA 3ANRA 2HZ0A 3R83A 2EXCX 4FTLA 5K4JA 1B38A 3BYOA 3V5TA 4G2FA 3BLHA 2FSLX 3KQ7A 3A8WA 4UMUA 2E9NA 3CR0A 4QMLA 5HVKA 2OH4A 3UZRA 1T46A 3FMDA 2JEDA 1SMHA 4YMJA 2WZJA 3QUEA 2BRGA 3PXRA 4R5SA 4IB0A 4V01A 3L8VA 4PDYA 3CCNA 1JKLA 4KNBA 5GJFA 3C9WA 5LCKA 5IZFA 3SG9A 5HIEA 1WMKA 4U81A 4RVKA 4Y8DA 3S95A 1R3CA 3R7YA 3R1NA 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