3UVPA

Human p38 map kinase in complex with a benzamide substituted benzosuberone
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
348
structure length
334
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Targeting the Hinge Glycine Flip and the Activation Loop: Novel Approach to Potent p38 alpha Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 334
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3uvpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3uvpA01
3COKA 1J1BA 2YIQA 3G6HA 4IQ6A 3WE4A 2XIKA 4F6UA 2QHMA 3R2BA 2YDIA 1WVXA 4CCBA 1MQ4A 4LUDA 1NVSA 4NZWB 2IZRA 3W33A 3P4KA 2VTMA 4D9UA 3ZEWA 3D94A 4ZTSA 2QCSA 3P7CA 4L00A 3SGCA 3I5NA 5TT7A 4FSQA 4ZTQA 2I1MA 2VD5A 5E91A 4RT7A 4UALA 4B7TA 2GSFA 5ETIA 2G2HA 3PVBA 3M1SA 3NZ0A 3VS6A 2HY0A 3R9NA 1XH4A 4O0XA 3COHA 3ELJA 5CAOA 4LL5A 2G15A 1JBPE 3O51A 3V5PA 2VN9A 2XKFA 3PXQA 2QOFA 4IM0A 4C36A 3UVRA 4GSBA 5L8LA 3IK3A 3NUAA 4EH3A 4WA9A 5GJDA 1JKLA 3DXQA 4KUJA 5D1JA 1XHAA 4FSNA 1OKWA 3W16A 3R30A 4B9DA 2OWBA 3F3VA 4ANLA 3GQIA 4FSTA 2F57A 4DG2E 3C0GA 4FR4A 4WBBB 4AA5A 4FZAB 2X7FA 2HIWA 2YZLA 4PTCA 3FI3A 4ITIA 2KULA 5AWMA 1BYGA 3I6WA 5CEKA 1IEPA 1Q97A 2Z7RA 3SW7A 3A99A 3NNWA 3VUKA 3FEGA 2OFVA 4NU1A 2ZVAA 2WQEA 3JYAA 3LFCA 4H05A 2WMQA 4KB8A 3WYYA 4DHFA 4EK4A 4ZLOA 3QKLA 4DC2A 4ACDA 4Q5HA 2QI8A 2F4JA 4ANNA 1ZY5A 4A9TA 3O17A 4KIKA 4FEXA 4AZTA 4E8AA 3FE3A 4O0WA 3ZSHA 4O0RA 5A9UA 4BL1A 4ZMFA 4QP9A 5CF4A 3CXWA 3NGAA 4GFMA 4U3ZA 5HX8A 2R3HA 4DGGA 3E3PA 1R1WA 3IGOA 3OS3A 5EKOA 4R3PA 1YKRA 1F3MC 1Q8YA 3L9LA 3PG3A 4MTAA 5A3XA 2WO6A 4U7ZA 4JBQA 2VTLA 2XMYA 3DAKA 3EFWA 3MFRA 4E6CA 2BRGA 5HVYA 1JLUE 2C47A 1CDKA 1MUOA 3MY1A 3QHRA 2C69A 5CASA 1BKXA 2UVYA 3KN5A 2X8DA 2ZOQA 2YCRA 3VS7A 3NCGA 3QZFA 4AU8A 4HVIA 4JXFA 5HLNA 2HK5A 3ZZEA 2VO6A 5LVNA 4ZTHA 3FSKA 2HXQA 3BYOA 5IG1A 4IANA 3PLSA 1VR2A 2W05A 4HNIA 3O2MA 2BZIB 3EYGA 5FM3A 2C0TA 3RZFA 2QONA 5EG3A 4O7ZA 1W98A 4R3CA 3TKHA 4IAFA 4XBRA 4UBAA 3F3WA 4FIEA 5EM5A 1JAMA 5HIDA 1FBNA 4BHNA 2PULA 4G6NA 1B38A 1JSVA 4OTWA 1SVGA 5CEOA 2PVNA 4F09A 2VWVA 4J8NA 4JX7A 2W1ZA 5J9LA 2HCKA 2BROA 2X2KA 3EN5A 4BBFA 3QALE 4QP1A 5D11A 3VF8A 4O0SA 2VO7A 3OEFX 2XIYA 1WAKA 3V3VA 3LM0A 5HO8A 2HZ4A 3QAME 4Y83A 3B2WA 4UN0C 5CAPA 3WIGA 4OTGA 2QC6A 2C5OA 3GU7A 4IZYA 4BYIA 3ANQA 4H58A 1Z5MA 4I23A 4FKVA 2WMBA 2VGOA 2BPMA 4IACA 1YWNA 3L8VA 2XB7A 4YBJA 5I9ZA 4DN5A 2JLDA 3HV7A 4ANMA 2C5XA 4EKLA 2E2BA 3PPZA 3KRJA 3ORXA 1DS5A 3CTHA 3CKXA 1XQZA 1W82A 1UKIA 4Y85A 3A60A 3NEWA 3DXPA 3SRVA 2Y8OA 3ZM9A 3FPMA 3BHTA 5AR2A 3RAKA 4QMMA 5CQUA 3UNZA 3ZLSA 3MH1A 4C4IA 4TWPA 5IA3A 4X7QA 2IW6A 3LFBA 3M42A 4ID7A 4PDSA 3S2PA 4RJ7A 3ZO1A 3ZSGA 2W1IA 4BCNA 2NP8A 4EH4A 3ZMMA 3QGWA 2X2LA 2GNGA 3KL8A 3LMGA 4OAUC 4CTCA 1XBCA 2BAQA 3AC1A 3BE9A 3OW4A 5FTGA 3LM5A 4DEAA 1A06A 1R3CA 3R63A 3NUNA 4BGQA 3MW1A 2PZRA 3PPJA 4N0SA 4ENYA 4AF3A 4D1XA 3MY5A 4OLIA 4RVKA 4U79A 4WNPA 4L01A 5M51A 3FC2A 4BC6A 4IW0A 4U45A 3WE8A 3UMWA 4AT5A 1S9IA 4EH7A 4BI2A 3LLAA 2B9FA 3GU4A 2VTQA 5DYJA 4WRGA 5KUPA 4X2GA 1H00A 1R78A 4L67A 3HX4A 2OH4A 4GIIA 3EYHA 2JAMA 1HCKA 3NR9A 4AW2A 3NDMA 4EHZA 3R8PA 4G9CA 1WVYA 3TXOA 4C3PA 3QTSA 2R3NA 4QNYA 3LZBA 2OGVA 3WILA 4F6SA 2BVAA 2XKEA 4MBLA 5C8KA 4XNEA 2J0KA 5L2QA 4WG3A 4X6RA 3TKIA 1BI7A 5HHWA 3KXMA 3QZGA 3DTCA 4EWQA 4IWDA 5CF8A 3GC8A 1ZZ2A 4UXLA 3QX2A 4FL2A 5F4NA 2VO0A 4FVQA 2CCIA 5IPJA 1I44A 5M09A 1PXJA 5IDNA 3P08A 4WNMA 3D7TB 5DWRA 3BV2A 2UW3A 3A2CA 2J9MA 3FY2A 4V01A 5IEVA 5M07A 4DGMA 4TRLA 5L2SA 3L9MA 2X1NA 1K2PA 2P55A 3LVPA 3TJCA 2PWLA 4JQ7A 5CT0A 4IZ7A 2FVDA 2H6DA 1JKKA 3QHWA 5GZ9A 5HNBA 3DFAA 1H4LA 3KEXA 3HMIA 2QOKA 4YTCA 5JRQA 4DT9A 1YI4A 2CDZA 5E8VA 1L3RE 5AP0A 4FEVA 3DBEA 2P4IA 4LFIA 3MVHA 4QTDA 2I0HA 3O7LD 2FSOX 4D58A 3DTWA 5J1WA 2HAKA 3HMMA 3ORKA 5I4NA 1SNUA 4EQUA 2W4JA 2W1FA 3KC3A 3ZO3A 3LW0A 5DVRA 4TWCA 3ZRMA 2H9VA 4O0TA 1NW1A 2Y4PA 2I0YA 5J9ZA 2IZTA 3NYOA 3FMMA 3O8UA 4Q2AA 5I9YA 4EH8A 5BYYA 2I0VA 2EXMA 4FV2A 2XIRA 4F64A 4WG5A 3WBLA 4EH9A 3MB7A 3R7VA 4EZ3A 3EQBA 4BIEA 2YWVA 4JX3A 4W4XA 1CKIA 3TG1A 2ZV2A 2XNNA 4FTQA 2A4LA 3EQDA 4LRKA 4MH7A 5EFQA 4EEVA 2RL5A 1U54B 4QQ5A 3RKBA 2UW4A 3IDCA 4N6ZA 2UVZA 4R7BA 2BHEA 4KWPA 3KXXA 3Q9WA 2J0IA 4F9WA 4AWIA 4QYEA 5A4CA 2BUJA 2YM3A 3NW7A 1SVHA 3L1SA 4XG7A 1JVPP 2ONLC 2UW9A 3KRWA 4Y46A 4QP6A 1WFCA 4JOAA 3QWKA 3LMIA 4LOQA 5DT3A 1ZY4A 3BELA 4GL9A 2V62A 3RAWA 4G3DA 4RC2A 3EN9A 4NK9A 1LEWA 3FPQA 3G9LX 3E92A 4FV6A 5CT7A 1E1VA 5AIRA 1K9AA 2JD5A 2X4ZA 3FLYA 3H9RA 3ODZX 2GNHA 1JPAA 2XIXA 2YIWA 4H3PA 5AUWA 1J7IA 3FI8A 2GHGA 5A46A 4F08A 3LHJA 4RFMA 4Y5QA 3BU6A 4YLLA 1ERKA 2R3KA 2XUUA 2F7ZE 3E8EA 4EH5A 4FV8A 5K5XA 4C0TA 3IW6A 3BHUA 4GUBA 3Q2MA 3H10A 3C4CA 4L52A 4BWPA 1ZOHA 2BFXA 2ITUA 3EH9A 3W2OA 3V6RA 4I92A 4J96A 4L45A 4AGCA 4FICA 3VHKA 4DA5A 1E9HA 3G33A 4C2WA 3R01A 3U4WA 5IUIA 3BQCA 3NRMA 3NYNA 1P14A 2A19B 2BRHA 5T3QA 4CFXA 4XMOA 3BZ3A 2R9SA 3TNQB 4CZTA 2GFSA 5J8IA 2ACXA 2YIYA 3AC4A 4EOIA 3R2YA 4KRDA 4UB7A 1MRUA 2YIRA 3W2CA 2ITNA 3FLSA 4OAVB 2JDSA 3GT8A 2AC5A 4GFGA 3VS1A 3FUPA 4E5AX 4IVDA 4F0GA 4PL3A 2XIZA 4C59A 2Z7LA 3ALNA 3CGOA 2XNBA 3R73A 5DR9A 4S32A 5H8BA 3QKMA 2XNOA 2VTRA 1Q99A 4FYOA 3RCJA 5LMKA 3SG8A 2VAGA 3PZEA 4AGUA 3RPSA 3MIYA 5CZIA 5HO7A 1W0XC 4EYJA 4AFJA 3VQHA 4TXCA 4ZTLA 1OIYA 2YDJA 4EK3A 5BPYA 4HPUE 2J90A 4FSRA 3FZRA 4OTDA 4FKPA 5CLPA 4ZLYA 2R64A 2VWIA 3QF9A 4PDPA 4ERWA 1KOBA 3I0OA 3EIDA 3D15A 4L42A 1VYWA 4ANOA 2UZLA 1WVWA 4U44A 2YCQA 4AZSA 5IH5A 1A48A 4D4SA 3F6XA 4GT4A 3MTFA 3RVGA 1PKGA 4FSWA 5DN3A 4ZIMA 4CMOA 3L9NA 3SXFA 4BI0A 2CLQA 3OBJA 2UVXA 3HEGA 2F2UA 3QKKA 2WGJA 4CKRA 5CX9A 4D9TA 3OT3A 5IKWA 4DFXE 3GC7A 3MFTA 4C3FA 5D7VA 1JQHA 4F9CA 4MD8E 3UOHA 2PMNX 3KFAA 1JKTA 1OIQA 3EZRA 4GU6A 4MBIA 2PTKA 4YZ9A 4ZTNA 4DLIA 2WMTA 4ZLZA 5EYCA 4R77A 3QRUA 4RZVA 4BN1A 2Y7JA 4JIAA 2OO8X 3PVGA 4JVGA 3FV8A 2Q0BA 3TKUA 2UW6A 3F9NA 2RIOA 3LCOA 5CSHA 4TPTA 3ZH8A 4CCUA 5KMIA 5L2IA 4BCJA 4EH2A 3FKLA 3AG9A 2GU8A 5E8TA 4G9RA 3LXKA 3NW5A 4G3FA 5EI8A 2CGXA 4BYJA 5JFVA 4U80A 2ITVA 3TN8A 1H28A 4IZ5A 3PSDA 3Q32A 2QG7A 4X3FC 4AFEA 4PWNA 3UQCA 1XO2B 2YHVA 3PIZA 4GRBA 4CD0A 3OXTA 4Y8DA 4MF1A 1SM2A 4BF2A 5ETFA 5B2KA 1W83A 5K0XA 2X2MA 4ARKA 3RALA 3FZPA 3OXZA 5BVFA 5I9WA 1OL7A 3PZHA 5TE0A 3ZO4A 1DI9A 3OUKA 3RMFA 1OUKA 4JL9A 3MYGA 4YTFA 3KREA 3PG1A 1FVVA 2VNWA 4YP8A 2ZM1A 4YO4A 4JI9A 4J53A 2PVRA 4Z7GA 3G15A 3AMAA 3PXFA 2GTMA 4Z55A 3GUBA 4CQGA 3BWJA 4DFYA 4E3CA 4WUAA 3D14A 4YTHA 1WBTA 4E6AA 5D41A 4MNEB 5ETCA 2BZJA 3IGGA 3TDWA 4BIBA 1XH9A 4NM5A 4BCOA 3DBCA 3DY7A 3F5PA 3DDPA 5LARA 4QP4A 3U6HA 4KBKA 3U87A 3E8DA 1I09A 3E63A 3IQ7A 3CP9A 3UPXA 5CSVA 3ZZWA 5BVNA 2CKOA 3KMMA 4X21A 5BMMA 3PIYA 2O5KA 4O2PA 4RSSA 4O2ZA 3COIA 3BYVA 3BRBA 1Q4LA 5LXMA 4E5WA 4DF3A 1XH5A 2ZV7A 4CV8A 1Q3DA 5AFVA 1ZZLA 3V8WA 1OL5A 3IW5A 4QNAA 5JT2A 3Q9XA 4W9XA 2XK6A 3ZLYA 4E26A 3S1HA 4IWOA 5DGZA 2RF9A 4C35A 1JKSA 2YERA 5IQHA 3UJGA 4IX6A 5TKDA 3VBTA 3LJ0A 4PDOA 2ITYA 4XHKB 5CAVA 5M08A 4JG7A 4GG5A 4Z9LA 4BDEA 4TTHB 3R21A 4CT2A 4FUXA 1WMKA 3RPYA 3PVWA 3AC8A 4PPCA 3FLWA 4J99A 4USEA 5AX9A 5C26A 1PMNA 3C4WA 1WBSA 3ORNA 2PMOX 3F66A 2YFXA 3WZUA 1H0WA 3PY0A 1UNLA 3R1YA 4FKUA 5CF6A 5HBEA 2JIUA 3BHYA 2JITA 4EBVA 5FEQA 3AD6A 3ZUTA 4F7JA 4PF4A 4YJRA 5IISA 1GY3A 2I0EA 4R5SA 3EL7A 3QQHA 4JQ8A 4C8BA 4C57A 4XYFA 3K5UA 2Q83A 5AP6A 2R3LA 1UU3A 4FTJA 3HV5A 1OL6A 4CLIA 2ETMA 4FX3A 5KNJA 2DWBA 4O0YA 2QR8A 3KVXA 4ORKA 3EQIA 5JMSA 4A7CA 4KIOA 5HE1A 1W7HA 2J0MB 2YCFA 3TI1A 4DE4A 2A2AA 3Q96A 5JK3A 2F2CB 1QPDA 1LR4A 2WU7A 1YVJA 4FKLA 4GK4A 4E73A 4RGJA 4FV4A 1O6LA 4HPTE 3RTPA 3ZM4A 4BI1A 2X4FA 2QU5A 3Q52A 2CHLA 3OC1A 2WQBA 3R8VA 5EH0A 4C38A 5IH6A 3HUBA 3T8OA 1H1PA 4LGGA 2RG5A 4XP2A 3IOKA 4GG7A 1GZKA 2GDOA 4HGTA 2YN8A 3GU6A 2YACA 1DI8A 4WSYA 4EHGA 1XWSA 2JC6A 4X2KA 5AP1A 4I6FA 4MXCA 3SAYA 3OMVA 3TV6A 3W2PA 4XG8A 4BDHA 2VX0A 1GZOA 3K3JA 5HEZA 4NWMA 3ZC6A 2J5FA 3KCKA 2R3IA 4UMRA 4TYIA 1YXVA 2XM8A 3MBLA 4XLIA 3SLSA 3UO4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4L43 A;  5G1X A;  5C9C A;  4QMY A;  3P5K A;  4M0Y A;  1GZN A;  5HOR A;  3UTO A;  5T6K A;  4KKG A;  2VTJ A;  2IN6 A;  3QCQ A;  5HI2 A;  2IVT A;  3P79 A;  4PP7 A;  3GFE A;  5CQW A;  5FXQ A;  1L8T A;  4TYH A;  4HVD A;  2C6K A;  1RDQ E;  2H96 A;  4JS8 A;  2OZA B;  3PLA E;  2ITO A;  5B0X A;  2UZN A;  3SOC A;  3FC1 X;  4Y73 A;  1OPJ A;  2VX3 A;  2QG5 A;  4M69 B;  4RPV A;  4DYM A;  3DZQ A;  3FXW A;  1CKP A;  2WPA A;  5HLP A;  3RM7 A;  3OWK A;  3ZFY A;  2OJG A;  3UMX A;  1NT2 A;  4HYU A;  3DQW A;  3RZB A;  5E9E A;  3CSV A;  3QQF A;  3W18 A;  5I9V A;  3F7W A;  2YIS A;  5BVD A;  3QZH A;  2YZA A;  3LJ1 A;  2PVM A;  4CYI A;  2VTH A;  4OTH A;  5KCV A;  5JZN A;  3P23 A;  2YM6 A;  4I4E A;  3BGP A;  3BHV A;  2ITX A;  3OXI A;  4FZF B;  4MXZ A;  4IVB A;  4USD A;  5IMX A;  2XBJ A;  3FI4 A;  3QTQ A;  1MP8 A;  3LXP A;  2JIV A;  3LJ2 A;  3EHA A;  3GU8 A;  4RBL A;  3PA5 A;  1ZMU A;  4ACM A;  2BRN A;  2WOT A;  4DIN A;  4DFZ E;  1IA8 A;  4KSQ A;  4CSV A;  3P78 A;  2B54 A;  2B9H A;  4K9Y A;  5CU3 A;  4BDI A;  4BKY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3COK A;  1J1B A;  2YIQ A;  3G6H A;  4IQ6 A;  3WE4 A;  2XIK A;  4F6U A;  2QHM A;  3R2B A;  2YDI A;  1WVX A;  4CCB A;  1MQ4 A;  4LUD A;  1NVS A;  4NZW B;  2IZR A;  3W33 A;  3P4K A;  2VTM A;  4D9U A;  3ZEW A;  3D94 A;  4ZTS A;  3W0M A;  2QCS A;  3P7C A;  4L00 A;  3SGC A;  3I5N A;  5TT7 A;  4FSQ A;  4ZTQ A;  2I1M A;  2VD5 A;  5E91 A;  4RT7 A;  4UAL A;  4B7T A;  2GSF A;  5ETI A;  2G2H A;  3PVB A;  3M1S A;  3NZ0 A;  3VS6 A;  2HY0 A;  3R9N A;  1XH4 A;  4O0X A;  3COH A;  3ELJ A;  5CAO A;  4LL5 A;  2G15 A;  1JBP E;  3O51 A;  3V5P A;  2VN9 A;  2XKF A;  3PXQ A;  2QOF A;  4IM0 A;  4C36 A;  3UVR A;  4GSB A;  5L8L A;  3IK3 A;  3NUA A;  4EH3 A;  4WA9 A;  5GJD A;  1JKL A;  3DXQ A;  4KUJ A;  5D1J A;  2IEW A;  1XHA A;  4FSN A;  1OKW A;  3W16 A;  3R30 A;  4B9D A;  2OWB A;  3F3V A;  4ANL A;  1VLR A;  3GQI A;  4FST A;  2F57 A;  4DG2 E;  3C0G A;  4FR4 A;  4WBB B;  4AA5 A;  4FZA B;  2X7F A;  2HIW A;  2YZL A;  4PTC A;  3FI3 A;  4ITI A;  2KUL A;  5AWM A;  1BYG A;  3I6W A;  5CEK A;  1IEP A;  1Q97 A;  2Z7R A;  3SW7 A; 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