3V04A

Discovery of novel allosteric mek inhibitors possessing classical and non-classical bidentate ser212 interactions.
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
322
structure length
289
Chain Sequence
MELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMAVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFPPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Novel Allosteric Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase (MEK) 1,2 Inhibitors Possessing Bidentate Ser212 Interactions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 289
sequence length 322
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3v04A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3v04A01
5IQCA 4AA0A 1A06A 3A2CA 4FSYA 3MN3A 4EJ7A 4QMWA 3D5VA 1L3RE 3F3WA 4YPSA 3CQWA 4BN1A 4O82A 4WG3A 4ENXA 4ZTMA 3P9JA 4NJ3A 2XIZA 1PW2A 1OIYA 1YW2A 3BGZA 3VS2A 2YJRA 4K8AA 3VUIA 4K1BA 4EK8A 4BDAA 3U6HA 2V7OA 3OROA 5AP3A 2PULA 4GVJA 4F7SA 4BI1A 3D5XA 2WD1A 4H3PA 1AGWA 2XKCA 3D15A 4DG3E 5JZJA 4ASXA 5CI6A 3DOGA 4IDTA 4OTFA 5BYZA 4FZAB 4JXFA 3C4WA 1GAGA 4NW5A 4UBAA 4HVHA 2YIYA 3IDPA 4FT3A 3UGCA 2VV9A 2IO6A 5C9CA 4A9TA 2WIPA 1Q8ZA 4OTPA 4X2JA 3KB7A 1U4DA 5AUZA 2FSTX 4IWDA 3VBQA 4ZSAA 3O96A 2GNGA 3QCXA 4BC6A 2OK1A 4IAIA 2W4OA 3ERKA 3OUKA 4FT0A 5B2MA 2RG6A 4Y83A 3ZO1A 1UU8A 3CE3A 4EKKA 5K0XA 1Q8YA 2JAMA 4MWIA 4J52A 4DBNA 3VJNA 3TZ8A 2RFEA 2PVKA 5M4IA 2HOGA 4I22A 4EOOA 3MFSA 4PY1A 3T3VA 3BU6A 3LXKA 4IDVA 2A2AA 4HCTA 5JSMA 2X8DA 4IZYA 4TTHB 4C3RA 5L2WA 2QVSE 2UZNA 1CMKE 5DR2A 5EW3A 5A4CA 1ZRZA 5DI1A 4XG7A 5FM3A 2WTWA 3LCKA 3D7TB 3OXZA 5HO7A 3FLQA 1J1CA 3IW8A 3NAXA 3ZRMA 4ZY6A 3VS4A 1YQJA 3AT4A 2YJSA 4DFXE 3PY3A 4RJ8A 3VC4A 3PTGA 4ERKA 2CPKE 5DR6A 2WQEA 2Y6OA 4RIYB 2RFNA 3OW3A 4JRVA 4L42A 3LE6A 4Z7GA 3E62A 3V5TA 3MVLA 2X8EA 4FVRA 2PE0A 5J1VA 3ZHPC 2CGUA 1KE8A 2V5QA 3U9CA 3UODA 2WMVA 2ZDTA 1RQQA 3CKXA 4XHKB 1ZYDA 4IIRA 4KBAA 4PX6A 3KXHA 5LQFA 4H3QA 5L2SA 4BTJA 2FSMX 3O8UA 5IDNA 2F4JA 5AUTA 5AUYA 4O7YA 5LVOA 4IADA 5BPYA 1OVEA 2C5VA 4KA3A 2BMCA 2QQ7A 5GJDA 4GU9A 4D1ZA 2XNBA 3F7ZA 3WZEA 1OMWA 4YC8A 2ERKA 3HA8A 2J0JA 4G2FA 5EDPA 2YFXA 4WSQA 3SLSA 3R22A 4RZWA 4J95A 2J90A 3U55A 1M7NA 2NPQA 5HU9A 3RPSA 1OIRA 3RALA 3UG2A 4DEIA 2GNHA 4EI4A 2H9VA 2QU6A 4RA5A 4BDDA 3FUPA 2JKQA 4RSSA 5CALA 3RZFA 5C4LA 1H8FA 2PUNA 1IAHA 3DGKA 5H8EA 4MD9E 4BIEA 4C4HA 3ZO4A 2BRGA 4FTJA 2OZAB 1OPKA 3V51A 5M44A 2WTIA 4WA9A 4BBMA 4PDPA 4ZXTA 4YNEA 4YPDA 1YDRE 2BDWA 5L2IA 2O8YA 4CCUA 2OLCA 3NCZA 4BCKA 5KZ0A 5A54A 1P4OA 5E8TA 2WMWA 4JR7A 1QPEA 4BBEA 4FEVA 2QG7A 3IS5A 2JFLA 3A61A 1PMEA 3V6SA 4TZRA 4I6HA 2UW7A 3HLLA 3AGLA 3Q53A 4BDIA 2JD5A 4G6NA 4D9UA 4EOQA 4BL1A 3KF7A 1XR1A 4UEUA 2ZJWA 3UG1A 4BZNA 5A3XA 4DAWA 5HTIA 2CKOA 2J0IA 2O0UA 2UW9A 4BICA 4ZJIA 4CXAA 1SMHA 2C6TA 4JBVA 2C0OA 2ZVAA 3DFAA 4EQMA 5JFWA 5FGKA 3E87A 4J71A 4D2TA 3W33A 4DCAA 3CS9A 4PNIA 3EQDA 3TDWA 2UZLA 4BCIA 4Y73A 2C6MA 2ZV2A 5CS6A 1FINA 5KHXA 3ZS5A 2YIRA 3BPRA 3HMOA 4U3ZA 3V5LA 2IVVA 4EH7A 5C27A 1NY3A 4UV0A 5IQBA 5CNNA 3I60A 2CLXA 4O7WA 4RLLA 3DK3A 2ETMA 3R8UA 4YJSA 5TO8A 4U81A 1PMNA 5I9UA 3R2BA 5EHYA 3NIZA 2W1DA 2QOQA 4PDYA 4U45A 3TZ9A 4W8DA 4OR5A 1Q8UA 3FY0A 3R1QA 4OTIA 5CEOA 2CGVA 5TT7A 1OKWA 3F82A 3ULZA 1WVXA 3FZPA 3RCDA 3ZBXA 4BIBA 1FVVA 2BRMA 2HZ4A 3GC9A 1BX6A 2XB7A 4RJ3A 4D58A 4TYGA 3C0IA 5HOAA 3QZFA 3HAMA 1H07A 3IKAA 2Z60A 2C47A 2QOLA 5K0KA 3OEFX 3UOKA 4ZSGA 3Q2JA 1GIHA 4RQKA 2RIOA 3ZSIA 4IANA 1Y57A 4AA5A 3H4JA 5IEYA 4K11A 4F99A 4JVGA 2YIWA 3S3IA 4NCTA 2CNVA 2PHKA 4PMMA 4JT3A 1Y8GA 5B7VA 3NSZA 3CR0A 3JR1A 4ACCA 5L8KA 5D7AA 4FUYA 4F9CA 3GXLA 4DEDA 4TWPA 3D94A 3Q9YA 3MVJA 4TWCA 3AXWA 5EKOA 2R64A 3BGQA 1DAYA 5CSXA 3FHRA 1H0VA 2C69A 4OTRA 5D41A 4ALWA 3RPRA 4AZTA 4F0GA 5HICA 3RMFA 3G0EA 4FR4A 3HV7A 1M2PA 4XRLA 4P4CA 5HU3A 2W1HA 3BYVA 1W7HA 3QD3A 3QQGA 4FEXA 4JAIA 4PTEA 4KBCA 5GJGA 3I1AA 1ZMVA 3MB6A 4O2ZA 2ACXA 5JQ8A 3UIMA 4ERWA 4ANMA 3QYWA 3VS5A 3B2WA 4FF8A 4F7JA 4AAAA 3PE2A 1UWHA 3FC2A 4A9SA 3QUEA 1P4FA 3MW1A 3D83A 4JI9A 4FKPA 3CIKA 3DBFA 4FT7A 5KX8A 1NT2A 3DY7A 1HCKA 3LXLA 3SOAA 1LP4A 4K6ZA 2PZ5A 4CMOA 4TWNA 3ZLWA 2X7OA 3HRCA 5ITAA 3R9HA 3FQSA 3JPVA 4QYGA 2ONLA 5HNGA 3JVRA 3NUSA 4IX4A 3OOMA 2A27A 3ZTXA 4AU8A 4BDGA 4D2PA 4XP0A 3KXGA 4Z3VA 4ZTHA 5DG5A 3O71A 4U44A 4ZAUA 2ZOQA 3ORXA 4FZ7A 4N6ZA 4Y8DA 3IK3A 2OH4A 3BIZA 3DAKA 3DBEA 4YBJA 5J87A 5H8GA 3VS6A 5CEMA 3AG9A 4XLVA 4S34A 4AF3A 5FDPA 2EWAA 2CNUA 3ZLSA 4UWCA 3KRWA 1G8SA 4CT1A 4R3CA 3IQ7A 3MDYA 3NW7A 3U51A 5CAPA 2Z7LA 2ZMDA 3W2SA 4B99A 2OIDA 2Y4PA 5A4QA 3NNVA 4MAOA 1U59A 4F63A 4FEQA 3G90X 4KIPA 3V8TA 5J1WA 5AM6A 4G3FA 4YJOA 3DDQA 5AIKA 2HYYA 2REIA 3BX5A 2XCHA 3KN5A 1YI4A 2XMYA 3ACKA 5CTPA 5L2QA 1XKKA 4EHGA 4EHEA 2YDIA 4E7WA 4LFIA 5CVGA 4F09A 2G15A 2C1AA 3VBTA 3I79A 3UC4A 2JBOA 4DGOA 4ACHA 3ZC6A 5I9XA 4TNDA 2PL0A 3QRKA 4FIHA 5DRDA 5DYJA 3P4KA 4HJOA 3N4TA 1YWVA 4HNIA 1JOWB 1W82A 3SW7A 3MH1A 2B54A 5I9YA 1OIQA 3P5KA 2ZV7A 4V01A 1XBCA 2CLQA 4WG4A 2CMWA 4AE6A 4WO5A 5EYKA 3V01A 4O83A 3KL8A 1XJDA 5L8JA 4D4RA 4IAZA 1YXXA 4WRSA 2JDOA 4USDA 1M17A 5F1ZA 5BUEA 4CEGA 4O91A 3TWJA 1MUOA 4FTAA 3OS3A 3QXOA 5D12A 4FNXA 5D7VA 4S30A 5JFXA 3L9LA 3OWLA 3RINA 4GUEA 5AIRA 4RT7A 2KTYA 1PXPA 4QD6A 5M4CA 5IQHA 5LJJA 3UNKA 1PXLA 4ANLA 3MH2A 5FWKK 3ZRKA 3PXQA 5E7RA 3ZUVA 1IAJA 3MJ1A 3PXZA 4BCNA 5DEYA 4R6VA 3RKBA 3SVVA 4CG8A 1Z57A 2W1IA 3EIDA 4QP4A 3RCJA 5LVPA 3NYOA 4E3CA 4GFOA 3KRRA 5HIDA 2B9IA 2F7ZE 1URCA 2PK9A 4J53A 5FTOA 3U9NA 3L8XA 4V04A 3HDNA 4RX7A 4RFZA 4TYJA 4ACMA 2R7IA 4PRJA 4D2WA 5K5XA 4OW8A 1O9UA 2QOHA 3G51A 2G9XA 3KEXA 4HCVA 5CEPA 2XVDA 4B9DA 5LMKC 2J2IB 3Q4TA 3AC1A 4LRMA 3RK5A 3ZM4A 3OHTA 4OTWA 2PE1A 3KULA 3P78A 4IHPA 3SOCA 4FC0A 1Q8WA 1S9JA 3E5AA 1P14A 3ZU7A 3KXXA 3EQBA 3F6XA 4HYIA 5HCZA 3GU5A 3ET7A 2UZWE 1WVWA 3CQEA 4KWPA 1OPJA 3UJGA 2PZRA 4JS8A 3PUPA 4TW9A 3R00A 5HO6A 3VS3A 4UN0C 3QQJA 1ZYSA 3EQGA 1KOBA 3DJ5A 2C5XA 1Q97A 5KE0A 4YTFA 3GQIA 2VGPA 4R7HA 5DHJA 2BRNA 3MFUA 5BVFA 4FL1A 1SZMA 1YI6A 1GZ8A 2ZV8A 3M1SA 3PPJA 3R63A 1ND4A 3R6XA 4FV8A 5H3QA 2WZJA 3MPAA 3QQLA 3OCGA 5HBJA 5IA3A 3F61A 2UW4A 5B0XA 3PPKA 4FKWA 3EKNA 4E4LA 1JNKA 4I5CA 4XV2A 3PXYA 3LM5A 2XP2A 3Q4ZA 3I5NA 3ZDIA 3VW8A 2WU7A 4I6BA 4RJ7A 2VAGA 4O6LA 3S00A 1Z9XA 3KCFA 4C02A 2BAJA 3R30A 4LOPA 4CZUA 3CPCA 3H10A 3ULIA 1H4LA 5CSVA 1G8AA 2OZOA 3SKCA 5L6WL 3BHVA 2VWIA 4G5JA 2SRCA 3MH3A 2WXVA 4IVBA 3E93A 4GS6A 4RQVA 2XM8A 3OF0A 3R7GA 4G1WA 5F95A 2ITQA 3BBTB 5EYMA 3PJCA 1H27A 2PUUA 4FTUA 4WNOA 4HVDA 2WMBA 2XRUA 1B6CB 3F69A 3VUHA 1V0OA 4NSTA 4RVTA 1JSTA 1OM1A 3PDTA 3GP0A 4DH1A 1BLXA 4GU6A 5AP0A 2VO6A 2YM5A 3NVKI 2C1BA 3O23A 4BZOA 3BRBA 4DF3A 1KE6A 1CKIA 2HAKA 2JKOA 4P2KA 1PXMA 5EFQA 5HE1A 5HVYA 3CJFA 1H1PA 1U5RA 4FX3A 5DNRA 3SW4A 2XIYA 4E6DA 4EKLA 4EZ5A 3FPMA 2O3PA 5CAUA 5FRIA 4J97A 4X6RA 5IQFA 4EH5A 2QG5A 5CT0A 2VTPA 4J8MA 4EOKA 5CF5A 5CSWA 5LVLA 4DFUA 4U7ZA 2O63A 3H0YA 4JIAA 1IASA 2WGJA 2C3IB 4XH6A 3RTPA 5ETAA 4EUTA 4F1MA 4DFBA 2GCDA 4GT3A 4M69B 4NT4A 4ANOA 2IVSA 4GW8A 4TYHA 1UNHA 4AW2A 5DT3A 4O0VA 3PY1A 4CYJA 2QO7A 2WAJA 3Q60A 1BKXA 5DFPA 4GJ2A 3W2RA 3WF9A 4QP7A 4FMQA 2H6DA 5JEBA 5HLWA 4PP7A 1M14A 3GU4A 4L8MA 3K3JA 2R5TA 4HNFA 3F5UA 5JGBA 2JDVA 3M11A 4LL0A 4KIKA 1DI8A 3GVUA 5CLPA 1VJYA 2HZ0A 3MPTA 3LLTA 3OY3A 5L6PA 3AC3A 3EWHA 5HQ0A 4UWYA 4BDBA 2XEYA 3PZEA 2EB2A 3ID6C 2I6LA 2W9FB 4FKSA 5J79A 3ZMMA 1TVOA 3BV3A 4AWIA 2CKPA 2CGXA 1Q99A 2UW0A 3CTJA 5LXMA 4I0TA 2UVZA 1OL6A 2ITPA 4FTOA 1QL6A 3ALNA 5IA5A 1CM8A 5DVRA 2HXLA 3MB7A 3RPYA 3P08A 4N4SA 3TTJA 4QPMA 3W16A 4D28A 3HP5A 4XX9A 3R7IA 5M55A 3JXWA 3PWDA 3QALE 3KK9A 4HVGA 3NZ0A 2WEVA 2GSFA 3P0MA 5E4HA 5EG3A 5T3QA 2VO3A 2PVNA 3CY3A 3UOLA 3HV3A 4U43A 3NGAA 1FOTA 1YWNA 2B7AA 3KVWA 4FIJA 4K77A 4O1PA 3DKOA 4AE9A 4AT4A 5AA8A 4TXCA 2WQOA 4CZTA 2OF4A 2Y4IC 3PA3A 4XV9A 2R3FA 4FSTA 4MXXA 4E73A 3MV5A 3QHRA 2PVFA 3NX8A 3RJCA 4FSWA 1RE8A 4EK5A 4NTSA 5I0BA 4IJPA 5AR3A 4L45A 5J9YA 3EFKA 2B4SB 4ZS0A 2OO8X 2YABA 5M07A 3OCSA 4FNWA 5IZFA 3C7QA 3TM0A 1F0QA 1VZOA 4JQ8A 2B55A 4HPTE 2CHLA 4ZMFA 4EOPA 4CZYB 4FTRA 4ZTQA 4MX9A 2HIWA 4HYUA 5HVKA 4CRSA 4C2VA 2VX0A 5I3OA 4C62A 4BB4A 2X9EA 2UW8A 2X81A 4JBQA 2GNFA 2BDJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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