3V8TA

Crystal structure of interleukin-2 inducible t-cell kinase itk catalytic domain with thienopyrazolylindole inhibitor 477
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
264
structure length
238
Chain Sequence
GSVIDPSELTFVQEIGSGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAES
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title X-ray crystallographic structure-based design of selective thienopyrazole inhibitors for interleukin-2-inducible tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
total genus 70
structure length 238
sequence length 264
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3v8tA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3v8tA01
4HYUA 4OTDA 5KMKA 4PNIA 5I4NA 3FXXA 4ZMEA 5DT3A 2Y4PA 4RA4A 2VUWA 5DT0A 5CVFA 5C03A 4PMPA 3R9HA 1QPEA 3C13A 4GG5A 4FOBA 4FSNA 2YLFA 4FVPA 1MP8A 2UW9A 4JG6A 2YEXA 4JIKA 5HNBA 5CF4A 5IA0A 3CJFA 4K11A 3KXHA 4MK0A 4U40A 3JPVA 3K3JA 3O51A 4FOCA 4YJTA 1SVHA 2XIYA 3PY0A 1UA2A 2P4IA 4IX5A 2YABA 4K2RA 5LMAA 4F7NA 3R7OA 1VJYA 2QURA 2UVYA 4L46A 4LM5A 3EQIA 3QKMA 2GU8A 2C5OA 5FTQA 1W8CA 3ORNA 3VUGA 4MXZA 4IB0A 4QYEA 4RJ4A 2J0KA 3EQRA 5CEKA 4RJ7A 5E8UA 3P7BA 4O7TA 1OI9A 5CXHA 2WNTA 3ZUTA 2GNLA 3KXNA 1OBDA 1PW2A 3OTVA 4IWQA 3QTRA 5ICPA 5LMBA 3DCVA 2PVHA 2VTPA 4LMNA 5FTGA 2HXLA 3F3ZA 4XG3A 2PE1A 4LOPA 3R21A 3CD8A 4DFYA 1UNHA 3AD5A 3FLZA 4O0SA 4TWCA 3W55A 4Z7HA 3P23A 3GENA 4XOZA 4Z3VA 5AWMA 4AT3A 4EOIA 3W32A 4RLKA 5CQUA 5EHYA 3RPYA 3OBJA 3A7FA 3OBGA 3W2RA 5BYYA 4EEVA 4AS0A 4DGOA 3NNWA 4PWNA 4HVSA 3M11A 1AQ1A 4EOPA 4GT5A 1M2RA 4LRKA 4A07A 2Y4IB 3KU2A 1VR2A 1F5QA 5DN3A 5JFXA 4XS2A 5HG9A 2C0OA 3QD4A 4DEAA 5H8GA 5C26A 1J1BA 1K2PA 5DI1A 4GW8A 3R9RA 2Z7RA 2B0QA 3SXRA 3TNQB 5CSVA 4IE9A 4D4YA 2XZSA 1NA7A 2Z02A 4MNEB 1JKSA 5AUZA 5GNKA 4JI9A 1ZMUA 3CR0A 4JBPA 3QUEA 5L2IA 2VWUA 4FGRA 4RJ6A 5A9UA 3E88A 2JAVA 4WNOA 1ZZ2A 4JIAA 4D4VA 2YZLA 1FMOE 4TYEA 4YC3A 3RP9A 3VUHA 2FVDA 1ZOEA 2VU3A 4XP0A 4HCUA 4C4EA 1O6KA 4R1VA 4D2TA 3L8VA 4IC7A 1ZY5A 2V22A 3BU5A 5D11A 3KY2A 4YLLA 5TKDA 2QO2A 4ZTLA 5BUIA 3E62A 2CMWA 4J7BA 5CF5A 4AGDA 5IA1A 3IPHA 1SVEA 4W4YA 4MF0A 2RSVA 3T3VA 3ZTXA 2BDJA 2A19B 2C0IA 2V5QA 2W7XA 3FZRA 4C4FA 4ERKA 3FEGA 4BI0A 2OJ9A 2XJ1A 4FZDB 3N4VA 4IZYA 4OAVB 4J96A 3A2CA 3DOGA 4FEXA 5D9HA 4FI1A 4FTCA 3V8WA 2GQSA 2PMNX 2G1TA 1U5RA 5E8VA 3ZO4A 3DFAA 3Q52A 4QTCA 1OB3A 4QD6A 4TWNA 1BI8A 2J6MA 3NCGA 3UMWA 3WF6A 5L2SA 4DTKA 4RRVA 5LMKA 5M4UA 1B39A 3S4QA 5IQGA 2QI8A 5IQHA 1BX6A 2GTMA 5FBNC 4QMUA 4KS7A 4HVGA 3OROA 2FB8A 3LJ2A 4GK2A 1L8TA 4D5KA 2CNQA 3HAVA 2BMCA 4UWYA 2C6DA 4O7ZA 3F2NA 3M42A 2CKQA 3OWJA 4MVFA 4KUJA 1ZXEA 3LXLA 4HW7A 2HZNA 5IQEA 3HMIA 3VRYA 3R8UA 4CYJA 3RZBA 3PZHA 2W0JA 3PE1A 3NR9A 5EW9A 4ANLA 4BR3A 2EXMA 5C8MA 2W96B 3COIA 4EZ7A 2BALA 3FHRA 4U81A 4DH3A 5ANGA 4DH5A 3VULA 5AP1A 1XH8A 3NIZA 4OTWA 1G3NA 3MB6A 3HL7A 4CFXA 4MH7A 4F7LA 2H96A 1Q41A 2ITOA 3VS3A 5AA8A 2C68A 2J0IA 2VZ6A 3COMA 3PSDA 3E5AA 3I5NA 3O7LD 1GZKA 3QGWA 4GMYA 3WIKA 3ZONA 3Q2JA 2ITXA 5IEVA 3D7TA 2HZ4A 4YJSA 3SHEA 5KHWA 2JIIA 3QZHA 2OWBA 3R7GA 4K1BA 5E8WA 2OICA 3T8OA 4DFUA 2VV9A 4DGMA 2J90A 3W2OA 4BKJA 5DRDA 4AGUA 4U97A 5M57A 3IW4A 3CKWA 3RAHA 3QWKA 4FICA 3CGFA 2WMXA 4JG8A 3DAEA 2BAQA 3DBCA 5TO8A 4QTDA 4BZOA 2WU6A 1UU7A 2WMAA 4NM3A 4O0UA 5FWKK 4NU1A 2C5VA 4ASZA 1WBPA 4AZEA 1XH4A 4HJOA 4QMMA 4FEWA 3MBLA 2C47A 3F7ZA 5FLFA 5ANJA 4I24A 3BHTA 2QLQA 4E3CA 4EYJA 3ZFYA 2X4FA 5AAGA 1ZWSA 5BYLA 2XBAA 4RC3A 1BI7A 1Z9XA 4OBQA 4QTAA 4CMOA 1UU9A 5J5SA 3RHXA 4G9RA 3LFBA 4EWHA 2R7IA 2VTJA 5BVFA 2C3LA 5AA9A 3UP7A 3VUDA 5A54A 2CGUA 5AV2A 2QKRA 1U54A 3EN9A 2WTWA 3W2QA 2WAJA 3CTQA 2X39A 3V5JA 3VUIA 4BCIA 3UPZA 2KULA 5KMLA 1LR4A 1Q97A 4ZSLA 5A14A 1S9JA 2BCJA 3PA4A 3LFCA 4I22A 4EUUA 1DI9A 3R8LA 2XK4A 3ODZX 2YZAA 3N51A 3O23A 1XBCA 3TZMA 5C1QB 4IB1A 4GFGA 4GYGA 3DLZA 3QALE 3VC4A 1I09A 3FLNC 3TXOA 2WMSA 2ZV8A 3FYJX 3IDBA 4IIRA 2UW5A 4N0SA 5L6PA 1XBAA 2JAMA 3QQJA 2ZV2A 4DT9A 4RWLA 4RVKA 3AGMA 4BHNA 3VQUA 3KN5A 4O84A 3EZRA 1XH6A 3CC6A 5HBJA 5JGAA 5HCZA 5EYMA 1XBBA 2XK6A 4KIPA 3ORZA 5E91A 4NUSA 4YJUA 2QG7A 5IG1A 4CXAA 3FZPA 3QD3A 4M68A 2ITWA 4L7SA 2OH0E 3T3UA 4KAOA 3DV3A 3H4JA 4I92A 3VHKA 3MJ2A 4QQCA 1IG1A 5ETAA 4XH6A 4A06A 3TZ7A 1NVRA 2BRMA 3R8ZA 5JH6A 3ACKA 2HOGA 4S30A 2P0CA 4NFNA 3Q9WA 4DG3E 3GU7A 4YJOA 1Y8YA 1J7IA 2FSTX 3RHKA 1CDKA 2VD5A 5AJQA 5JFWA 4K9YA 4RQVA 5LWMA 5KUPA 3UOKA 1ATPE 4E5BA 3LJ0A 1XJDA 3ROYA 3TNHA 2X8EA 3F6XA 4FT3A 5CTPA 2IG7A 4ZY4A 5FXSA 4ZSEA 4P7EA 2IWIA 3QBNA 1KE5A 4F65A 4IB3A 5IMEA 2WHBA 3QRUA 3MI9A 4NKAA 3BGZA 3LFNA 2CN5A 4FKWA 3R0TA 3VBTA 3LQ3A 2FO0A 3FL5A 5CZIA 5EK7A 4FE2A 1OMWA 2GS6A 1QPJA 3NW5A 3SRVB 4E8AA 3FMMA 4V04A 2RF9A 2I0EA 2OFUA 4XCUA 2YJSA 3FI3A 4N4SA 3LAUA 2IZRA 4R5YA 3TNPC 5CYIA 4O82A 4NL0A 5F20A 5KBRA 1PHKA 5D12A 4RFZA 3VNTA 3WZJA 5KBQA 4DBXA 5M07A 2CLXA 3RBWA 3FMDA 3I0QA 1BL7A 3EQPA 5LWNA 3LFDA 2OK1A 1Y91A 2W4KA 3SW7A 5HNIX 1SM2A 1ND4A 5I5ZA 5J8IA 3PUPA 2CGXA 1ZYCA 3PXYA 3UQFA 3PIZA 2CPKE 3VN9A 4OBPA 2I0VA 4JR7A 4UMRA 4W4WA 5BPYA 1H26A 1IA8A 2W05A 2Z8CA 4DTAA 4BTKA 1ZY4A 3P7CA 2W06A 4A7CA 2UZNA 2WGJA 5KZIA 1Q24A 4GSBA 3GQLA 4AACA 1FMKA 4L6QA 4K33A 3UP2A 3MA3A 2WTDA 3MV5A 2YACA 2J5FA 4D1XA 1M7NA 4QTEA 4UMPA 1FOTA 2YA9A 5HOAA 4H36A 4IM2A 5D7AA 3BBTB 3WE8A 2AC5A 4OTGA 3QZGA 3LCDA 3D7ZA 4WRSA 4YSJA 5CASA 4AN2A 3JXWA 5LVPA 3GCSA 4MEDA 4FA2A 4A4LA 1HCLA 3BYSA 4CMTA 3UZTA 1Q62A 4E6QA 4PMMA 3E64A 2B9HA 4ZP5A 5HORA 3QD2B 5KMMA 3E8CA 2X6DA 4X2FA 3DZOA 2XNMA 3KMUA 3RALA 4APPA 2VO6A 2QU6A 3ENHA 5BVWA 4FKSA 1GNGA 5A4EA 4M0YA 4XG6A 1H1RA 2HK5A 3HKOA 5AR7A 4CZYB 1NVQA 4CYIA 1Q8WA 3I6UA 4J98A 4RPVA 1JWHA 3IDPA 3A7JA 3AD4A 1M2QA 4MD8E 3KK9A 3UJGA 1P2AA 3REPA 2R3JA 2Y0AA 2JLDA 2E9OA 3L8XA 4JBQA 1KE9A 3A8XA 5HHWA 5G1XA 4W8EA 1OVEA 2V55A 5K9IA 3RM6A 4C38A 3KXMA 2YIXA 2GNGA 3BWFA 2ZAZA 4RWJA 4B9DA 3FBVA 3KFAA 1Q3DA 4E5WA 1ZYDA 2LGCA 5D10A 5AV4A 5HZNA 5IA3A 4FKPA 4O96A 4O2PA 4QMPA 2EXEA 2YIYA 3PG3A 4CCBA 4KA3A 1V0PA 4NWMA 4AZWA 4FKRA 3DU8A 2R7BA 4JQ8A 3BPRA 4I41A 4JJRA 5TR6A 2QOFA 3DJ7A 4GJ2A 4W8DA 3TJCA 4CLJA 1ZARA 3C0GA 2QOQA 1NT2A 4NZWB 5JRSA 3GOPA 1PY5A 4LOOA 2JFLA 4AX8A 2PZIA 3DB6A 2PVJA 3RPOA 3FYKX 5LQFA 3N4UA 1TQIA 4FZ6A 3G33A 5CVHA 5AEPA 4I93A 2PHKA 3PJ8A 3CCNA 4JDHA 3FQEA 2BILB 4O22A 4MYGA 3FY0A 3MPMA 2BIKB 2VX1A 4J52A 4S2ZA 1YWNA 3B8RA 3ORXA 3D14A 5HG5A 1MRVA 4IX4A 3TL8A 4XG2A 5L8KA 4K77A 2OIBA 2YIWA 4U43A 3RVGA 3RNIA 3ZUVA 3Q3BA 5AMNA 3R28A 2HY0A 4FZAB 3THBA 4A9YA 3QC9A 4RLLA 3K2LA 4RIYB 4GKHA 1G8AA 4QYYA 1OUYA 2WTIA 4D2WA 4P4CA 2BHEA 4JL9A 4P90A 5AP3A 1UU3A 3WE4A 3OY1A 3IOKA 5BQ0A 3NAXA 2Z2WA 4F9AA 1KOBA 1YHWA 3DKCA 3FMLA 4GV1A 2IZSA 4I1ZA 4R77A 2W1GA 4ITIA 2BKKA 4QMYA 2W4JA 3KXZA 3R01A 4AZVA 5HTCA 2F57A 4O2ZA 3DY7A 5KMNA 3KL8A 4YZCA 3D94A 5HLNA 1XO2B 4ZTQA 4O0XA 5IU2A 2WQBA 3PDTA 4ASDA 3GCQA 4DTBA 4M69A 5LOHA 4X0MA 2KTYA 3F3UA 3QTQA 4UXQA 1QCFA 3U55A 4FG8A 4QP3A 3KGAA 3PY3A 4OR5A 2ITNA 3GFWA 4BF2A 3IW5A 5LVNA 2CNVA 5AADA 4QP9A 3LFEA 4EL9A 4E6CA 2OIQA 2HYYA 3FPMA 1GY3A 5HO8A 4DFLA 5ETCA 2J4ZA 4EK6A 4FYNA 2C5XA 2FH9A 3GP0A 3VS4A 2FYSA 5C27A 1J7UA 4RQKA 4DCAA 5IPJA 3WI6A 4R5SA 5DGZA 1WVWA 4AW2A 3U6HA 2E2BA 3KKVA 2XBJA 3BGPA 2H8HA 3BX5A 3OT3A 3BYOA 2QR8A 5EW8A 4BCMA 4ENXA 5M53A 2IO6A 2HENA 2ZB0A 5BUJA 4J97A 3QTXA 3DDPA 5LARA 1OL1A 2CNUA 4ZLOA 2QNJA 4L53A 2JKOA 4P5QA 4A4XA 4EORA 4MAOA 4KABA 4AA0A 3H0YA 4C37A 5EM8A 4FTKA 5B2KA 2WTKC 4QMQA 4UZHA 4FKUA 4UB7A 4UYAA 4MCVA 4YC8A 3GCUA 4QP7A 4A9RA 5E8TA 4AGWA 4DEDA 4MBJA 5BUEA 3MH1A 3G90X 1LP4A 1DS5A 5M51A 2OJJA 3QL8A 5FBOA 2IZTA 4O7SA 3UZPA 1TQPA 3WF8A 3ZSGA 3VS1A 4C4IA 4IVBA 4HOKA 3UVPA 2XIZA 4BKYA 3R9OA 2YDKA 3QC4A 4XP2A 3TUCA 4EJ7A 1FINA 3ALOA 5HVYA 5TT7A 1Z57A 4HVDA 4DEHA 1BKXA 2F2UA 2QOOA 5JZJA 1NY3A 4YSMA 4RWKA 3R63A 4D1ZA 3FAAA 3SVVA 2C6TA 4I4EA 3A60A 4ZEGA 3LFFA 4NCTC 1QPCA 3ACJA 4BWXA 4QPSA 4WUAA 4Y8DA 1R78A 2XP2A 4ZSJA 3KRRA 3SQQA 3RK5A 3ODYX 2PE0A 4FKOA 1BMKA 1H07A 3QX4A 4NTTA 3HRFA 1IEPA 3VVHA 5J1WA 3M1SA 4DLIA 4ERWA 5M4IA 3FZTA 3QUPA 4YTHA 3PVBA 5CEPA 5ANIA 4FKLA 1R0EA 2BIYA 3RTPA 4DG2E 2V7OA 3W33A 3VW6A 3LOKA 4LGHA 5CU4A 3BYVA 3TTIA 4C4JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HYU A;  4OTD A;  5KMK A;  4PNI A;  5I4N A;  3FXX A;  4ZME A;  5DT3 A;  2Y4P A;  4RA4 A;  2VUW A;  5DT0 A;  5CVF A;  5C03 A;  4PMP A;  3R9H A;  1QPE A;  3C13 A;  4GG5 A;  4FOB A;  4FSN A;  2YLF A;  4FVP A;  1MP8 A;  2UW9 A;  4JG6 A;  2YEX A;  4JIK A;  5HNB A;  5CF4 A;  5IA0 A;  3CJF A;  4K11 A;  3KXH A;  4MK0 A;  4U40 A;  3JPV A;  3K3J A;  3O51 A;  4FOC A;  4YJT A;  1SVH A;  2XIY A;  3PY0 A;  1UA2 A;  2P4I A;  4IX5 A;  2YAB A;  4K2R A;  5LMA A;  4F7N A;  3R7O A;  1VJY A;  2QUR A;  2UVY A;  4L46 A;  4LM5 A;  3EQI A;  3QKM A;  2GU8 A;  2C5O A;  5FTQ A;  1W8C A;  3ORN A;  3VUG A;  4MXZ A;  4IB0 A;  4QYE A;  4RJ4 A;  2J0K A;  3EQR A;  5CEK A;  4RJ7 A;  5E8U A;  3P7B A;  4O7T A;  1OI9 A;  5CXH A;  4LDT A;  2WNT A;  3ZUT A;  2GNL A;  3KXN A;  1OBD A;  1PW2 A;  3OTV A;  4IWQ A;  3QTR A;  5ICP A;  5LMB A;  3DCV A;  2PVH A;  2VTP A;  4LMN A;  5FTG A;  2HXL A;  3F3Z A;  4XG3 A;  2PE1 A;  4LOP A;  3R21 A;  3CD8 A;  4DFY A;  1UNH A;  3AD5 A;  3FLZ A;  4O0S A;  4TWC A;  3W55 A;  4Z7H A;  3P23 A;  3GEN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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