3VQHA

Bromine sad partially resolves multiple binding modes for pka inhibitor h-89
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
344
Chain Sequence
AAAKKGEQESVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Anomalous dispersion analysis of inhibitor flexibility: a case study of the kinase inhibitor H-89
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 113
structure length 344
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3vqhA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3vqhA02
1FOTA 3R02A 4RRVA 5DLSA 2VU3A 4H05A 4UWBA 4U6RA 3PTGA 3NAXA 4DT9A 5GJDA 2Y0AA 1M52A 5HG7A 2I0EA 5DR6A 2WU6A 3MI9A 5IMEA 1JSVA 4XG7A 3T9TA 4Q5HA 2VGOA 1NT2A 5JEBA 1M2RA 2ITVA 2EUFB 3FQSA 2UW9A 3P7AA 2FA2A 2P4IA 3OCGA 4RA5A 4FV0A 4MXCA 3BX5A 4OT5A 4PDOA 4CFXA 3ZM9A 3GFEA 4PMSA 3KRXA 3ZONA 4YO4A 3BU3A 4GYGA 1ZYDA 4DTKA 1Y91A 4HGSA 4J8NA 2H6DA 4AP7A 3DBFA 4U8ZA 2GQRA 2GTNA 3BGQA 4IVCA 4MQ2A 4BGGA 4EJ7A 3OW3A 2O8YA 3SXRA 5CAUA 4G34A 2XIXA 4LGGA 3C4WA 4RLKA 2G1TA 4FV2A 4YBKA 3VS3A 2WTJA 3D83A 2CLQA 4FT0A 3DZOA 4G1WA 3E3BX 1PMNA 3E93A 1WVWA 3BLHA 5A54A 3UZPA 2G2HA 3L1SA 3ROCA 3MVHA 1OGUA 1WVXA 2WTCA 5HG5A 4X6RA 3R8LA 4RX8A 3VAPA 4A7CA 4C3PA 4F70A 3KA0A 3BQRA 3LM5A 4A9SA 4JR3A 5HX6A 3AC5A 3UO6A 3ATSA 3ZYAA 5L2SA 5IISA 4MXXA 2OG8A 4DHFA 3VS0A 2CPKE 4XG8A 4D9TA 4EH4A 4F7SA 3ODZX 4MXAA 4F9AA 4HVIA 4K6ZA 5M08A 3F6XA 5CSWA 4ASXA 3OY3A 4M66A 4YZBA 3DTWA 3NNUA 2C6KA 2G15A 2YABA 5DVRA 5A9UA 1YRPA 4ID7A 4E7WA 2PE1A 2OZAA 4FEQA 5CALA 4FSTA 1V1KA 4L3JA 3V5WA 4HPUE 3U6JA 3NRMA 4M12A 4TNDA 3D5UA 4ENYA 3W32A 4GH2A 3WI6A 1I44A 4U79A 5BNJA 3G5DA 3V6SA 2QKRA 4PP7A 4XRJA 3VULA 2RFNA 4RX7A 3QTSA 4GV1A 4UY9A 4R8QA 5FXQA 3R7VA 2VWYA 3IKAA 5GJGA 2R3RA 4CZUA 5BMSA 3H3CA 3W8QA 2W1CA 3MPAA 4I24A 2UVXA 5HIBA 1TKIA 2KULA 3B2TA 3G0EA 4NSTA 4CG9A 5ETAA 5A4TA 4AWIA 4C61A 4I4EA 1G8AA 2VGPA 5HG9A 2VWBA 3HAVA 2H96A 3RHKA 3R2YA 4GIIA 1BL6A 3QQJA 4QTBA 2X2KA 3T3UA 4DINA 2QLQA 3NIZA 3QA8A 4RIYB 3G33A 5CSHA 4AX8A 5CI7A 3CS9A 4CTCA 5L4QA 1P14A 3RCDA 4DG0E 1UU3A 3MVJA 3U87A 4HVGA 5L6OA 3R8PA 3ORTA 5HO7A 3JVSA 1VEBA 5KMNA 4H1JA 3VWAA 3HMOA 5HE3A 2YLFA 2RF9A 2V55A 2JGZA 3MWUA 3PZHA 3D5XA 3D5VA 4KIKA 4NU1A 4FTQA 3ZDIA 3KMMA 5DMZA 3GUBA 3SHEA 3Q60A 4U40A 3KRLA 4DH3A 3QXOA 3CQWA 4IM0A 5GIPE 3FYJX 3R71A 4EH5A 1X8BA 3KULA 4FX3A 4WUNA 2WMBA 5HLNA 5HLPA 3JVRA 4XS2A 5HHWA 5FEQA 4ZLOA 4QQJA 3DA6A 4PL5A 1ZZLA 3BYMA 1YWRA 3G6HA 3BE2A 4X2KA 5BVKA 3MVLA 4HJOA 1YW2A 4O0VA 1B38A 1LP4A 4IM3A 5C27A 4D28A 3E8DA 3MFUA 4MH7A 5TOZA 3KF7A 1UVRA 4FR4A 1IAJA 2ZV7A 2J50A 1R0EA 3N4UA 3OCSA 2DYLA 3UZTA 4YNOA 5TKDA 4ZAUA 4FKWA 4ALWA 4WG4A 4CRSA 3U9CA 2QOCA 3BV2A 3OFMA 3PA3A 4LGHA 2OFVA 2R3MA 4DEDA 3N4VA 3BYUA 3NYNA 3ZO2A 2FB8A 2QO7A 3V01A 2YCSA 3HDNA 4NW6A 5DOSA 2X9EA 3NUXA 3R1NA 4K1BA 1OM1A 5HCYA 2B7AA 3MJ2A 4YJUA 3ORNA 2YN8A 4FL3A 3TZMA 4ZSEA 4IH8A 4RIXB 1OL6A 4IAIA 3FSKA 3BV3A 2ZJWA 4XRLA 4DGNA 2R2PA 3HRCA 2OJGA 3UIXA 2V7AA 2ETMA 3CGFA 5JFXA 4GK2A 3MJ1A 3IW7A 3F5GA 4RVLA 4F4PA 4BGQA 5M56A 1T45A 3HEGA 3A7FA 3VS1A 5JFSA 2ITZA 1L8TA 4H36A 3W33A 2Q0BA 3B8QA 2R3KA 5HD4A 3RAHA 3OUNB 5KX8A 4ZY6A 3DZQA 2C5XA 2XKFA 4FZDB 4FTAA 5L6PA 2W4JA 2XVDA 4Z7HA 3AT4A 3I6UA 4O0YA 1PMVA 4KBKA 5FM2A 2PUUA 5H8EA 3LFAA 4BDGA 4E4XA 2PMIA 5EYCA 1Q8YA 4KKGA 2H34A 2VTQA 2ZOQA 3OWJA 4G17A 4ENXA 5TT7A 4D2WA 2J7TA 2X8EA 2NRUA 3H10A 4YNEA 3WZKA 2IVTA 5AA9A 4I5MA 4NEUA 3EQGA 5E8XA 2VTMA 2OLCA 3WZUA 4JL9A 2YM8A 3IW8A 3R6XA 4O7YA 2OXXA 3AT3A 3HRBA 4QP8A 5EQEA 4BDBA 3AC3A 5IUHA 5IA0A 5E4HA 3R7EA 3QTRA 2UZBA 3NYVA 4XEYA 2WNTA 3TJCA 4YP8A 4GJ3A 4E73A 3R1SA 3IONA 3KKVA 1SVEA 4F9BA 4ANOA 3EYGA 1DS5A 2HAKA 3R0TA 4FV1A 3DQWA 4G6OA 1WMKA 5LARA 4E26A 5B2MA 3BLRA 4I6BA 4IJPA 3Q5IA 2W5BA 2IJMA 3R00A 4CQEA 3QRTA 3F2AA 4TZRA 2W1FA 2W1IA 3UO5A 2PVKA 4K8AA 4M97A 3W2SA 1FGIA 1ZOGA 3UP2A 2BDJA 3DNEA 4TYIA 4FIEA 5HIEA 4BB4A 4N70A 3GOPA 3OMVA 3CIKA 3ZSHA 3S0OA 3BWJA 4I6FA 4HYSA 4IJ9A 3PXKA 1LPUA 5BMMA 5F9EA 4RGJA 2Y6OA 4GVAA 4IB5A 4PNKA 4U43A 3T8OA 4QQTA 2CDZA 4L45A 3VUTA 1H4LA 1UWHA 3BE9A 3PIYA 1YI3A 1XBBA 3R7YA 3ODYX 3FZSA 3U4UA 5EI2A 1M7NA 4U41A 4NJ3A 5IPJA 3CSVA 2FUMA 4KD1A 1KWPA 3UPXA 3OD6X 4FOBA 4MAOA 3RHXA 4BWKA 3HVCA 1M14A 4ERKA 3F2RA 3TUBA 3K5VA 3UOKA 4O7LA 2QNJA 4AW2A 2GDOA 4LFIA 1S9IA 2BVAA 2XRWA 4EOKA 2E9NA 1U59A 2FYSA 4O22A 5K3YA 4BCHA 2Y6MA 1IAHA 5M55A 4C4FA 2WMRA 4FSNA 2WU7A 5AUTA 4E5WA 1W82A 5CANA 4JDKA 3ZEWA 3H0ZA 4WA9A 4RIYA 5JQ8A 3PSCA 4BDEA 3M2WA 3NDMA 4BTJA 4FTJA 3NZ0A 1YHVA 5KE0A 3SQQA 3PPKA 4C8BA 5T6KA 5IMXA 2HY0A 4ZMFA 5ANDA 3LCOA 1PHKA 5AEPA 3BI6A 1REJA 2B4SB 1J3HA 4I1ZA 4A06A 1YWVA 1U4DA 4YZMA 4Y8DA 3HP2A 1BMKA 4EL9A 2PZ5A 3LFQA 3NWWA 1Q97A 3CC6A 4KBAA 4D4RA 4O7WA 2BFXA 3A7HA 5DR2A 3BU5A 3Q4UA 2WOTA 3G0FA 1PXPA 1R0PA 3R9HA 4EHGA 5CASA 4GL9A 3U9NA 3DFAA 4M3QA 2EB2A 3ENHA 2VNYA 2ZV9A 5J5TA 4M13A 1MQ4A 4E6QA 1OB3A 1W83A 2V0DA 2WHBA 3PFQA 4M7IA 4BDAA 2H8HA 2OBJA 2X1NA 3LHJA 3PIXA 4IAFA 4BYJA 4C37A 4R7BA 1YKRA 4GK3A 3RI1A 3QD3A 2B54A 3FC2A 5IQFA 1H0WA 2QVSE 3C4EA 3SX9A 4CLJA 5J9YA 4R5SA 1OUYA 4PPBA 1HCKA 5CQUA 2OO8X 4WT6A 4XBUA 1JKSA 4JT3A 3DT1A 4WNOA 4NTSA 4D9UA 4BIBA 3UNJA 4WNPA 2OJ9A 3BWFA 4EH6A 4PV0A 4RBLA 1YXTA 3EQHA 2XNBA 1O6YA 3NUPA 2V22A 4GKIA 3B8RA 2Y7JA 3HX4A 3Q9YA 3P78A 3FLWA 3CJFA 4RIXA 2PVYA 3T9IA 4BVUA 2XBJA 3BBTB 4TWOA 4E6AA 3MN3A 4DEBA 4YZDA 4EOOA 3UNKA 3BYVA 4RC2A 4I20A 4YJSA 3WARA 4WO5A 4C4JA 4W8EA 3UP7A 2XCHA 3VUHA 2XA4A 1Q62A 4FKUA 2I6LA 3DNDA 5HE0A 1QCFA 3ZLYA 2OIDA 3FLSA 5EW8A 4L7SA 4LL5A 3TV6A 1JQHA 2F7XE 3F5PA 4FZ6A 1LR4A 3DB6A 3PA4A 5F1ZA 3UVPA 4O81A 2C68A 4NIFA 4HGTA 3BCEA 5CS6A 2FVDA 2C3KA 3VQUA 2ITQA 4FG9A 5A6NA 4YUQA 3NUYA 2YM7A 2BRNA 5FLFA 3P7BA 5LVMA 3NUSA 1E9HA 4ZSJA 5HESA 2YIWA 3TUCA 2REIA 4BYIA 3I0QA 5I9WA 4IZ7A 4PMTA 4JQ8A 3ORLA 4F64A 4JJRA 4PUZA 4C2WA 5BPYA 3N4TA 4L53A 4OT6A 3TM0A 1FMOE 5T3QA 5AUUA 2F4JA 1WBVA 5FTGA 4I41A 3ATTA 2OXDA 1TQMA 4FTIA 4HPTE 2WTKB 3B2WA 5KBRA 1PW2A 4YMJA 4I22A 4JS8A 3LM0A 2XYUA 3TNPC 5AUYA 4CCUA 4Y46A 3DXNA 2B0QA 2HZ4A 3A60A 3AD4A 4R5YA 4FK3A 3DAJA 3V8SA 3W55A 2CMWA 2WPAA 5JSMA 3QALE 3VS6A 2VO7A 1XHAA 1H1RA 5TF9A 3POOA 4YTHA 5AP5A 3W1FA 3EJ1A 4FIFA 4BTKA 4W8DA 4QOXA 4RQKA 5HLWA 4GW8A 5FUTA 3EN6A 4BI1A 5EK7A 4F63A 5EOBA 2VD5A 2PVJA 2GHGA 3O17A 5HO8A 3F2NA 5AP1A 2C5NA 5L3AA 3ET7A 3FAAA 2CGUA 4MF0A 2OKRA 1ZAOA 3C5UA 1OIUA 3TT0A 4LMNA 4D0XA 3LMHA 1CTPE 5DRBA 4YJRA 1KUTA 1OPLA 4P4CA 1H1PA 4Y72A 5F95A 4E3CA 5CSXA 3W2CA 3EB0A 4XP0A 4L43A 3LFCA 2YWPA 2JBOA 1SZMA 1ZYSA 3UOLA 3BQCA 5HVKA 4FSQA 3MPTA 4F0FA 4O6EA 5BUJA 3UPZA 1P2AA 4FKTA 4CFNA 5LWMA 1F5QA 5A4QA 3DY7A 3R7IA 2Y8OA 2B9FA 4LM5A 4Q5EA 3JR1A 3KREA 3FMJA 2HENA 4GEOA 4RZWA 5HBHA 4AA0A 1OBDA 1MRUA 3L8SA 3FY0A 4JI9A 4XG3A 3NW6A 5JFVA 1GJOA 3CTHA 3CTQA 2BAKA 5FEEA 5IF1A 3V6RA 4ZLZA 4R1VA 2XIZA 4D2SA 4RG0A 1UU8A 2OI4X 1YHWA 4X6QC 3LE6A 2J0LA 4I5CA 4DFZE 3UJGA 3TG1A 2E9UA 3QRKA 4B99A 3IW4A 3MTLA 3OXIA 3GFWA 4MBLA 5LMBA 2OH4A 2IZUA 4ACMA 4G5JA 2C5VA 4WRSA 4HNIA 2OSCA 4IX6A 4MXZA 5CLPA 4E6CA 1JOWB 5AV4A 2PU8A 2GNGA 3CD8A 1YVJA 3NX8A 5CU6A 4B8LA 3V5QA 4F7LA 4AZTA 1OBGA 4BFMA 3TZ8A 1ZARA 4V05A 5FBNC 4YR8A 3OW4A 4ZIMA 4BY9E 4BDHA 2R0IA 3HV5A 2CKEA 4QTAA 5DFPA 4ZXTA 2QO9A 2FSLX 3EFJA 4OTHA 3WIGA 3FHIA 4FICA 4YHTA 3RJCA 5IQEA 3C50A 4UWYA 4AQCA 3RAKA 2UW3A 3LJ2A 4ONAA 4S34A 3MB6A 4IDTA 4JRNA 3PJ3A 4YJVA 4C4IA 3QUDA 5CAQA 4DCEA 4FYOA 2BIKB 1CKPA 4R1YA 5IA2A 3ZFXA 4C02A 5KBQA 5M51A 3CQUA 5AAFA 1Q3DA 5D7VA 2YIRA 4DG3E 4WG3A 4FK6A 2UZNA 4QT1A 3MB7A 1A9UA 4G16A 2J5EA 4FL2A 4JLCA 1UU9A 4C2VA 5LMAA 4I94A 4FIJA 3BELA 2WEVA 1KE5A 3VC4A 4IX3A 1H28A 3P4KA 1O9UA 2ZV8A 3DDQA 4FV7A 4NM3A 4D1XA 3CPBA 4C38A 2WTKC 2AUHA 3H9FA 4GU6A 3S00A 1YI4A 5C01A 3I7BA 2YLEA 2ZM4A 3FSFA 3ZLWA 3HRFA 3EIDA 3FXXA 3W2RA 4NM5A 3WF6A 4QMYA 2XNNA 3EOCA 3SA0A 4NCTA 3ZBFA 3I1AA 3U4WA 4L3LA 4HGEA 5E91A 2AC5A 5AR7A 3QGYA 2ZVAA 3JYAA 4DEAA 4HCVA 3FZOA 3ALOA 4G3EA 4MWHA 4S33A 5ANIA 5G6VA 4C7TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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