3VQUA

Crystal structure of human mps1 catalytic domain in complex with 4-[(4-amino-5-cyano-6-ethoxypyridin-2- yl)amino]benzamide
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
280
structure length
258
Chain Sequence
ECISVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQPDGTVNYMPPEAIKDMSISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQIQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Diaminopyridine-Based Potent and Selective Mps1 Kinase Inhibitors Binding to an Unusual Flipped-Peptide Conformation
doi rcsb
molecule keywords Dual specificity protein kinase TTK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 258
sequence length 280
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2012-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3vquA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3vquA01
4LOPA 3G6HA 3DAKA 4YTCA 3KU2A 4RJ6A 1KSWA 3GENA 3OCTA 2WQBA 3EQFA 3K5UA 3VNTA 2BKZA 4IACA 4PMTA 4AOTA 2QOFA 2H6DA 5IQHA 2J0LA 2WMRA 3FY2A 4RA4A 1ERKA 3W16A 2C30A 4UMRA 1ZY5A 3RWQA 2YCSA 2CHLA 3EN7A 3W2RA 3LXNA 3OEFX 5AP2A 5FDPA 2RFDA 4DN5A 4YC6A 2VUWA 4QD6A 3QZIA 4QPAA 2G1TA 3JY0A 3VS2A 2XA4A 4CCUA 5FM2A 4EH6A 4MNEB 1QPJA 4IZAA 3K5VA 4E5WA 2QG5A 5HVYA 1TQMA 2IZSA 3UGCA 4E6AA 4EJ7A 3K3IA 3I0OA 2DWBA 2VRXA 4IX3A 2JKOA 2YERA 5E8YA 4Y5QA 5KZ0A 2R2PA 4YZCA 1S9IA 4AZWA 5HBHA 3V04A 1JQHA 5A6OA 1YI4A 4MEDA 4BCHA 2Y6OA 3C1XA 2JAVA 4W4XA 4CEGA 4UMPA 4U9AA 5J1WA 2BROA 4EH2A 3BU6A 4BTJA 4IVCA 2E9PA 3RAHA 3THBA 1MP8A 2R7IA 4ZS4A 3KRRA 1UKIA 4I24A 3UOJA 2VTLA 2B0QA 3RI1A 2WAJA 5AR5A 3JS2A 4U97A 1SMHA 2GHGA 4UXLA 4NTTA 4ZP5A 1YKRA 4NUSA 4MTAA 2CPKE 1JSVA 5LMAA 4U43A 4L7SA 4Q5EA 4KSQA 1W98A 3ZC6A 4AT5A 4RWLA 1BKXA 2YDJA 4EKLA 5LMKC 2WTVA 1PMNA 3DA6A 1G3NA 5T68A 4RJ8A 4IAIA 4RZWA 3FMKA 2JAMA 3RMFA 3VN9A 4TKSA 2ZB0A 5A4CA 4R77A 2HELA 3DXPA 1WVWA 2YA9A 3S3IA 3NW5A 5KMMA 1OIUA 4CMUA 4ENXA 3NAYA 3OWKA 4MBLA 3KA0A 4FEWA 2BZJA 3ORXA 4FTQA 3RJCA 3RAWA 4DG2E 3OHTA 3AD5A 4UEUA 4KB8A 4GT3A 3ZUUA 3FLZA 4YHFA 2OXDA 4OR5A 2C3KA 4BZNA 4E73A 1Y6BA 4EH7A 3PWYA 4PDSA 2QOBA 4DCEA 1SYKA 4LV8A 2H96A 3EQBA 3KREA 3V8SA 2WHBA 3BYSA 3D5UA 3QGYA 3ZFMA 3IOKA 4U8ZA 1QMZA 3I81A 3DXQA 5BUJA 4BFMA 4HGSA 3ID6C 2QKWB 4LGDA 4IW0A 5BVOA 2HIWA 1QL6A 4CRLA 4EOSA 3C0IA 3I60A 4R7HA 2R3QA 4EOLA 4HCVA 3UNJA 5EI6A 2BDJA 3UVRA 4AX8A 4EUTA 3KN5A 1SNXA 4J71A 1BMKA 3MA6A 3P1AA 5CU3A 4ASDA 4CLJA 3FL4A 3LQ5A 2WXVA 1FBNA 3FQSA 3AGLA 1DM2A 4L01A 4W9XA 3A60A 2C0OA 3DK3A 3LXKA 4FSTA 4UYAA 2WOUA 4WO5A 4ALUA 4DH7A 4E6QA 2HXQA 3D14A 5EDRA 5JRSA 4ZZMA 4BB4A 5IDNA 2OH0E 5CSVA 2GDOA 2QU5A 2UZVA 4GYIA 2XEYA 5CF5A 3FSFA 3GUBA 4M84A 5DG5A 2BFYA 4BDCA 5IUGA 4QT1A 3QRTA 3AC4A 4DLJA 5AEPA 5KMKA 3NCZA 2GQGA 4DG3E 2DYLA 3W8QA 3FLYA 5EHYA 4AQCA 3UZTA 4EEVA 5D12A 2VTMA 3P86A 4FTUA 4FV3A 4AOJA 4DA5A 1V0PA 3ZONA 2X4FA 3FE3A 2BRMA 2F49A 4QMYA 2H34A 4KKHA 4IX5A 4XG2A 2E9OA 3AGMA 3RPVA 4AXAA 4CVAA 1UNGA 5E8ZA 2A2AA 4FG7A 3VJOA 5KE0A 5AV3A 4OUCA 2SRCA 4YNOA 4XEYA 4AT4A 3QRJA 2NRUA 3CJFA 5FP6A 3TKIA 5EH0A 5JFSA 1B6CB 2VTNA 2W5AA 3DPKA 1OECA 3D5WA 1YHWA 5IEVA 2I0EA 2DUVA 4LL0A 3BIZA 5LCKA 4O0YA 4UMUA 2XF0A 4Z9LA 4ORKA 4TWCA 2JIIA 3TIYA 4FV0A 2WMXA 1PKGA 3GU5A 3HV5A 4D4YA 4J52A 1H00A 1R1WA 2KTYA 4H39A 5CF4A 3BGZA 2Q0NA 2VWZA 4NCTC 2REIA 1VEBA 2R0IA 3I7CA 2XVDA 3EMGA 2VU3A 4DLIA 3QTRA 3O96A 5BUEA 1LP4A 1MRVA 4KBKA 4CQEA 3DV3A 3R7UA 1H1RA 3C4WA 4D0WA 3H30A 4CFVA 4E1ZA 4Q2AA 4DFBA 2ZV8A 3IONA 5HE3A 4Y5HA 5CAUA 5EOLA 3O0GA 3NZ0A 3F3WA 4DGOA 4QYYA 3CKXA 3DB8A 4HCUA 3MDYA 3WZKA 2UW0A 4WRGA 1J7IA 3OXTA 3WBLA 4AUAA 3FMHA 5FEDA 1H01A 1CDKA 4QTBA 5EYMA 3A4OX 4UWBA 3LFQA 4JBQA 4FKIA 4O0TA 3GNIB 3P4KA 4K8AA 3MFRA 3Q6UA 5C8MA 2XK7A 3R02A 3UDBA 3ZFXA 5CQUA 4BDAA 1UU8A 4X6RA 4KUJA 3OXIA 4WG5A 1UNLA 1WBOA 2BALA 4FZ7A 4G5JA 4KINA 5CQWA 3A7HA 5HVKA 3UQCA 1KV1A 4QP9A 4OTQA 3TNIA 4MQ1A 3SRVB 4ALVA 4F99A 5M4UA 4ZTMA 5M07A 2YLEA 2LAVA 1APME 3TI1A 1KE7A 2PZPA 4MX9A 4L45A 3TNWA 2PVRA 3EN4A 3PDTA 1J1CA 4YR8A 5A4LA 4QYGA 4XG6A 3L8VA 3SD0A 3NUNA 2XP2A 3C7QA 3IO7A 2PZ5A 3L8PA 3QCQA 2C6KA 4G9CA 4E8AA 4F9BA 3AT3A 5DT4A 3P7BA 1X8BA 4O2ZA 4JDHA 3ZH8A 2CJMA 1ZMVA 2F57A 4AACA 5IPJA 3ATTA 4QQ5A 3MVHA 4BIDA 1OIRA 4IJPA 4TYEA 4H3QA 3UIUA 2F2UA 3LCSA 3MBLA 3TV6A 3U54A 1SVHA 2B4SB 4Q5HA 5D7VA 2CGVA 1WBWA 2PVKA 3H9OA 4FKVA 4BBFA 2YJSA 3FLSA 3IGOA 4LRJA 2WKMA 5EQPA 3R1QA 5AR8A 2VZ6A 5EFQA 4ZTQA 1W7HA 4JQ7A 4F7JA 5HZNA 2YFXA 4BVUA 5IMXA 3IW6A 1E1VA 3IW8A 4FUYA 1Q5KA 3NSZA 5E91A 2CNQA 3GCSA 4I6QA 2O2UA 1KE5A 4FKPA 5DN3A 5KKRC 3PZEA 3ET7A 2GS7A 4XP2A 2WTCA 4PDYA 4FBXA 4CFUA 4JL9A 3RAKA 2GNIA 3E64A 4RVMA 4EBVA 2R3GA 4H3BA 3GC9A 4RQVA 4X2NA 4MD7E 5JGBA 4M66A 5DRBA 3POZA 3PWDA 3U51A 1UV5A 4I5MA 4HZSA 1Q8WA 4FC0A 2B53A 2PUNA 4WRSA 4YTFA 4D1XA 4M97A 1PXMA 4M0YA 3VWAA 2XNMA 3UC3A 5BMMA 1URWA 3Q9WA 4M7IA 5BYZA 4NW5A 3FHRA 4W4VA 5CAQA 5IH5A 4FEXA 2O65A 4FEVA 4H1JA 3NNVA 2JDVA 1DS5A 5JZNA 3Q3BA 4FKRA 4L8MA 4BCOA 3E8EA 2P33A 4GK3A 5HU9A 4WSYA 4S2ZA 1NVSA 1XO2B 3NWWA 4YZ9A 3DK6A 5TE0A 4QP1A 4HYIA 3VO3A 4ACHA 3W8LA 2YWPA 3NS9A 4ZMEA 2XNGA 3C5UA 1BL6A 4AU8A 1ZARA 2WD1A 3DCVA 3EN5A 4EK4A 1H28A 4WNMA 1UWHA 3TNHA 5EI2A 5DT3A 3FMEA 4HNFA 4F1MA 1XBCA 4ZTNA 3UOHA 3EOCA 2I1MA 3WF6A 3R83A 1H07A 5EW8A 3U55A 4BCQA 3U9NA 4GCJA 4AE6A 2RSVA 5L6WL 2PZYA 3W55A 2R3NA 3HKOA 3L9PA 4I0TA 4F7SA 4GVAA 5D41A 3VQHA 4CZTA 4WKQA 5C1QB 2G15A 3TUBA 2VTSA 1YDTE 2I0VA 5J87A 2Y6MA 3HMPA 3Q9XA 4EBWA 4I4FA 1UWJA 2YLFA 1Q8UA 4D4VA 3DBDA 4JIKA 4C4EA 4RC4A 4AGCA 3MY1A 3IPHA 4IJ9A 5T6KA 3AC8A 5DT0A 5E7RA 3VS1A 1WVXA 4K11A 4RX9A 2HZ0A 3H0ZA 5CY3A 2FGIA 4BCKA 1WMKA 1KOBA 2I6LA 4YZMA 4R3CA 5L4QA 3ORNA 1J7UA 2VTJA 3I79A 4F63A 3SHEA 1M14A 2ZMDA 1REJA 2HW6A 4YJNA 3DDPA 5G1XA 3CTJA 4HVIA 1WBNA 2PVMA 2HWPA 2R3MA 5EM8A 2J51A 1M7QA 3HA8A 4E5AX 3VJNA 3SVVA 4TYHA 4DYMA 3A7GA 2P3GX 3QYZA 4I23A 4F9AA 5AMNA 4XG8A 3RTPA 2QOIA 3ENMA 2XBAA 3DTCA 5CNNA 4OAVB 3GU4A 3WARA 4EOIA 5HORA 2WB8A 3DQWA 3QKLA 1HCLA 2W1HA 2XKFA 2ZM3A 3TZ9A 2O0UA 3OUKA 3BU3A 4M14A 2JIVA 3C4XA 3D0EA 1P4OA 4JR7A 5E1SA 3WF5A 5DMZA 4ITIA 4O83A 3ORZA 4FSUA 4UMTA 1GZOA 5FD2A 4EONA 3AMYA 3T8OA 3NCGA 1RW8A 3UE4A 3VW6A 3W2SA 5BVNA 2UZBA 3EFLA 3R9HA 1W82A 4F08A 2XJ2A 4QO9A 3E88A 2QURA 3ANQA 4FKTA 3PA5A 1BUHA 3HP2A 3FV8A 4I93A 3MYGA 3Q60A 3HDNA 4QOXA 4YPDA 4ZY4A 4PP9A 4DEBA 5KKRB 2AC5A 3P08A 3S1HA 4QYEA 2Q83A 4C8BA 2CKEA 2HY0A 3CLYA 5ETAA 4QMMA 2CKPA 3K2LA 2YM3A 4ACCA 4NM3A 4KIOA 4X6QC 5HLNA 1YI6A 2I0HA 3R7YA 2EUFB 2R9SA 3MA3A 4C4GA 4USDA 4G9RA 5EKOA 4D1ZA 2V5QA 2X1NA 3G9NA 4GFMA 4I1ZA 4IZ7A 4FV2A 4O0XA 2PZIA 4JAJA 5HE0A 1JWHA 2WMAA 2VTQA 4ZLZA 4P5ZA 5H8GA 2VWXA 4E7WA 2JGZA 4M13A 5DWRA 4FA2A 4HVDA 1IR3A 1TKIA 3QC9A 5CANA 4RLLA 3W2QA 5CF6A 3M1SA 2BDFA 4S33A 3TDWA 4UZHA 4E26A 3KK8A 4PL5A 4BKJA 2FSTX 4RX5A 2R3HA 3EQPA 2VO3A 3OUNB 5BYLA 3O51A 3UTOA 4CYIA 3HMOA 3QD0A 5AM7A 3SW4A 3UOLA 5LQFA 4M12A 2A1AB 3O8UA 3F5XA 2IJMA 2C6EA 2FA2A 2ITYA 2UZUE 3EQDA 5DHJA 1ZMWA 4QYFA 4QMZA 1RQQA 1SNUA 1U5RA 5BVEA 3VW8A 3FZTA 5HCXA 5DVRA 5CF8A 4IVAA 4DFNA 3R1SA 4W4WA 4E4LA 1ZWSA 3LE6A 1OUKA 1DI9A 4ID7A 1O9UA 2C5OA 3V5QA 4IB0A 5M44A 2YIQA 2X7FA 4K33A 2WU6A 3GP0A 3OD6X 2UZLA 4E4NA 2P0CA 5AP7A 3F3TA 3GCUA 3NUPA 4IZYA 4X0MA 5FG8A 1YRPA 2AC3A 1JNKA 2J50A 3DY7A 2R3OA 2UW5A 2C3LA 3DNDA 5E8XA 1XKKA 3TWJA 4I6BA 3D7TB 3D2KA 4NFNA 3VS3A 5M09A 4JBVA 1U5QA 4ANBA 2BIKB 2PZRA 2VX0A 3NIEA 3VS0A 4B6LA 4QMLA 4BRXA 3TM0A 5CVFA 3RNIA 4JQ8A 2JKMA 3UO4A 3QCYA 4RWKA 4IAFA 3RALA 3MJ1A 3GQLA 1UKHA 4BYJA 3KC3A 5E8TA 4AZSA 2X7GA 3IECA 1K9AA 2AUHA 3BI6A 2VO7A 3LM5A 3MIYA 5B2LA 5L8KA 5A54A 1DAYA 3VUIA 4DBXA 3L1SA 3GBZA 3EWHA 4I21A 4RIXB 3PVBA 3LMHA 4JRNA 5L3AA 3VUDA 3N4UA 4ZJVA 3BX5A 2OBJA 3C13A 4AE9A 4I0RA 2XIXA 4FKUA 4R8QA 4B7TA 1K3AA 4FKWA 2YIRA 1O6YA 4OTFA 2X0GA 3GC8A 4Y8DA 4YSMA 3PP1A 3R1NA 5IISA 3CR0A 4FVPA 4NJDA 4DEDA 3NUAA 3H9FA 1RJBA 2ZDTA 2CNUA 3ZSIA 3QA8A 3U6HA 5DR9A 2FH9A 2JEDA 4Z55A 4WT6A 3AT2A 3CQEA 4AGWA 4EYMA 3NRMA 3NYVA 3PJ1A 4GEOA 4H1MA 1Q99A 3II5A 2C3JA 3QZFA 3R28A 4OBQA 2ZV9A 5LXMA 4GKIA 2X8EA 2BRNA 3ITZA 3Q32A 4AN9A 3CIKA 2VX3A 5AX3A 3VUHA 5GJDA 4X21A 3VBVA 4C4FA 5LJJA 4M68A 4BHNA 5F4NA 4W8DA 2E9NA 3F3UA 3NMUF 4X2KA 3R2BA 3BQCA 5ACBC 4EH3A 5HD7A 5E1EA 3VIDA 4DFZE 3LLTA 4P7EA 2J5EA 3I5NA 5FP5A 3FWQA 3P7AA 4FIHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LOP A;  3G6H A;  3DAK A;  4YTC A;  3KU2 A;  4RJ6 A;  1KSW A;  3GEN A;  3OCT A;  2WQB A;  3EQF A;  3K5U A;  3VNT A;  2BKZ A;  4IAC A;  4PMT A;  4AOT A;  2QOF A;  2H6D A;  5IQH A;  2J0L A;  2WMR A;  3FY2 A;  4RA4 A;  1ERK A;  3W16 A;  2C30 A;  4UMR A;  1ZY5 A;  3RWQ A;  2YCS A;  2CHL A;  3EN7 A;  3W2R A;  3LXN A;  3OEF X;  5AP2 A;  5FDP A;  2RFD A;  4DN5 A;  4YC6 A;  2VUW A;  4QD6 A;  3QZI A;  4QPA A;  2G1T A;  3JY0 A;  3VS2 A;  2XA4 A;  4CCU A;  5FM2 A;  4EH6 A;  4MNE B;  1QPJ A;  4IZA A;  3K5V A;  4E5W A;  2QG5 A;  5HVY A;  1TQM A;  2IZS A;  3UGC A;  4E6A A;  1OGY A;  3K3I A;  4EJ7 A;  3I0O A;  2DWB A;  2VRX A;  4IX3 A;  2JKO A;  2YER A;  5E8Y A;  4Y5Q A;  5KZ0 A;  2R2P A;  4YZC A;  1S9I A;  4AZW A;  5HBH A;  3V04 A;  1JQH A;  5A6O A;  1YI4 A;  4MED A;  4BCH A;  2Y6O A;  3C1X A;  2JAV A;  4W4X A;  4CEG A;  4UMP A;  4U9A A;  5J1W A;  2BRO A;  4EH2 A;  3BU6 A;  4BTJ A;  4IVC A;  2E9P A;  3RAH A;  3THB A;  1MP8 A;  2R7I A;  4ZS4 A;  3KRR A;  1UKI A;  4I24 A;  3UOJ A;  2VTL A;  2B0Q A;  3RI1 A; 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