3ZDUA

Crystal structure of the human cdkl3 kinase domain
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
309
structure length
297
Chain Sequence
MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYNKIAMREIKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTDIYDDEVATRWYRAPELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELKAKLLQEAKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Human Cdkl3 Kinase Domain
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE-LIKE 3
total genus 89
structure length 297
sequence length 309
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zduA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zduA01
1REKA 3FBVA 4AZEA 3U8WA 3MSSA 4AW2A 5HIEA 4RSSA 5HEZA 2CGXA 4OGRA 4ASDA 5A4LA 4C7TA 3AD5A 5E91A 4O7YA 2BAQA 4X6QC 4HW7A 4G3DA 1JQHA 3ENMA 5CT7A 5A14A 2B9HA 2GNFA 2IVUA 3E8DA 2W1EA 3EH9A 4F4PA 3OF0A 3R9DA 4FK3A 3UTOA 3K3JA 1Q24A 2H96A 4LV5A 4WOVA 1QPCA 5KO1A 5L2TA 4FSQA 2C6KA 3L9NA 3H10A 3HMPA 3TZMA 4FV1A 4O22A 4M84A 3PZEA 3P4KA 2WMRA 3GU6A 4U45A 4BGHA 4PMPA 5M53A 5IEVA 4W4XA 5CSWA 2F2CB 2X4ZA 4KNBA 3PXZA 2PZPA 3FMKA 4QP3A 2X2LA 4RIWB 4XV2A 3WZEA 3TIZA 4AZSA 1PKDA 4EQUA 3C9WA 5IKWA 3PXYA 4RWKA 2W05A 4Z7HA 1YDRE 3O8TA 5AP4A 5M4UA 1H25A 2WZJA 4U3ZA 3OUNB 3UYSA 2GHLA 1F5QA 4YNOA 4I92A 2WMAA 2XIZA 4KKGA 4PWNA 4TWNA 2BTRA 4YLJA 2BPMA 1ZWSA 5HG5A 4BCMA 3OG7A 2CHLA 3NAXA 1WMKA 3A7FA 4S32A 3RAHA 4L42A 4PMTA 3O8PA 5H9BA 3GB2A 1NT2A 2VX1A 3R8PA 3PVUA 4DA5A 3IKAA 4PRJA 5K4JA 3F66A 4KSQA 5GNKA 4DGGA 2UV2A 5HG9A 4EHZA 3EMGA 3TZ9A 5AA9A 2J5EA 4I5HA 3BU5A 4C02A 2UW5A 3N4UA 3KXHA 2XNOA 3FYJX 4FTLA 5DR6A 5CENA 5M08A 4JBPA 4UMUA 3BZ3A 5JGAA 5LWNA 3G51A 1JKLA 3D7ZA 3SXFA 5T68A 3LCKA 2XH5A 5EHOA 3K5VA 4ITJA 5HX6A 4WNOA 2KTYA 2YIRA 4GS6A 3QTUA 1YWVA 3R8MA 1OVEA 5CAUA 5J5SA 1QPJA 5I9WA 4CZTA 5LCJA 3I1AA 4J52A 2C5OA 3PP0A 3FQSA 5DMZA 1H24A 2WO6A 3QUDA 5F95A 5B7VA 3RINA 3RGFA 1U5QA 4EH2A 4O6EA 3A7IA 2XS0A 3GFWA 3MFUA 5FEEA 3MVLA 4M8TA 4D5HA 4K1BA 3C4WA 4F9CA 5L2IA 5A46A 5CVFA 5EW9A 2BRBA 2JKKA 2UW9A 5E90A 3MFTA 3FEGA 3R63A 4LGDA 2PVRA 3W8LA 4FTJA 4BDBA 3F2RA 4DT9A 3OY3A 1JKTA 1G8SA 2VO6A 4AGDA 1Z57A 4FL2A 4FGBA 3PSBA 2XK6A 1GZOA 4IXPA 3RP9A 2ZMDA 4LRJA 5I0BA 3MPTA 5M07A 2BIYA 2PVFA 3TUDA 3HV3A 2PVLA 5AV4A 3QALE 4WIHA 2RG6A 1FVRA 2J2IB 3C7QA 4FKVA 4KBCA 1Z5MA 3AD4A 2OGVA 5FGKA 2IW8A 1H0VA 5IU2A 1JNKA 3D5UA 2A27A 5LQFA 2QU5A 3IS5A 2V0DA 1PJKA 4CFMA 1IAJA 2FUMA 5D9HA 4ZTNA 1G5SA 2R2PA 4GYIA 2O64A 5LMBA 4O81A 4AN9A 2JDRA 4QMLA 5HNIX 1SVHA 3AC1A 4ITHA 4AOJA 4HVSA 3PTGA 3ODZX 1JSVA 2SRCA 4UALA 4Y5HA 3HKOA 4EOMA 5I4NA 2HCKA 3LCDA 4RFZA 4RWLA 4UWYA 4WT6A 4YJPA 4K6ZA 4O7SA 4FNWA 2YIYA 5AEPA 3SW7A 5HLPA 3BQCA 2NPQA 2XK4A 4RIYB 4QOXA 4HGSA 5C03A 3FMHA 3L8XA 3S4QA 4CMUA 3I79A 3KGAA 4IAZA 4FG8A 4DEEA 2HXQA 2X8IA 2XNEA 3U6HA 4S34A 4LL0A 3OROA 4MCVA 3GU5A 2C5YA 4WHZA 1Q8WA 4V04A 4HPTE 2F9GA 5IMXA 3ZC5A 2GU8A 2WTIA 4XP3A 5C27A 1XH5A 4TWPA 4BI0A 2R0IA 3FE3A 2P4IA 4NZWB 3KXNA 4BZDA 4EQMA 3IPHA 4ID7A 5HKMA 3TZ7A 5ETCA 3UQGA 4PTCA 5IEYA 5ANEA 2UZLA 2OFUA 4C59A 2Y4IC 1PMUA 3QZIA 2LGCA 1GIJA 3F5PA 3A99A 3COIA 4UXLA 4EL9A 4FIIA 1WBSA 2QO2A 1REJA 3TWJA 1E9HA 2ZVAA 4CMOA 3Q9YA 4JR3A 5AMNA 5KHXA 1YXTA 3R71A 3QZGA 3BU6A 4EUUA 2HZIA 4HVDA 2WU7A 3P1AA 2JFMA 4JVGA 1OI9A 4MBIA 4EOLA 4ZEGA 2O0UA 2QO9A 4K8AA 2OU7A 1BKXA 2PE1A 2FSOX 1PXNA 3ITZA 5FXQA 4DTBA 2C3IB 4A7CA 3PIYA 4KWPA 3TUBA 3VS2A 4YZNA 4QP7A 2Y9QA 2VTHA 3W2SA 3P0MA 5FG8A 2WMUA 1V0PA 2J90A 2ITNA 3G0FA 3ENHA 2GCDA 3ORNA 4YZBA 4ASXA 4BIDA 2RGPA 3MTLA 2F49A 4O7NA 3UC3A 3Q04A 4EH8A 3DKOA 2YHVA 3AT3A 3MBLA 5EI2A 4N57A 3GC7A 2IZSA 2BDFA 2OF4A 3MGYA 5AM6A 4ANNA 4KINA 4L7SA 3SG9A 4RA4A 4RC3A 2YJRA 2FVDA 4YO4A 2ITUA 3GQIA 4NEUA 3S0OA 3DBCA 4RVKA 4L7FA 5AR5A 3HDMA 4FV7A 5AR4A 1Y6BA 4L46A 3K54A 3NUUA 3VO3A 4R7HA 2YZAA 3L1SA 5FD2A 4FZ6A 5DLSA 5K5XA 4J99A 4XUFA 4QNAA 3SHEA 3ORLA 3Q2JA 4HOKA 2PPQA 4FTNA 3HA8A 4O91A 5HHWA 3DAJA 3PJCA 4L9IA 1ZYJA 4TZRA 5HU9A 3G90X 3CGOA 4E8AA 5CYIA 4QQCA 3QRJA 4N0SA 3QD0A 4C57A 1J1CA 4M3QA 3DBEA 3ORPA 5AM7A 4NTTA 4I94A 3G0EA 5JFSA 5CZHA 4Y5QA 4YUQA 3CEKA 4O7TA 1Q61A 2WTDA 4TN6A 4DH7A 3K5UA 4AT5A 4Z55A 1GZKA 2PVNA 3V6SA 5E7RA 4BHNA 3A2CA 3QTRA 5DEYA 1YWRA 2BILB 4YPDA 3E7VA 3EQGA 1H8FA 4DGMA 3JUHA 1GZ8A 2QLUA 2YERA 4IJ9A 4TPTA 4IAFA 1BL7A 4NJ3A 4P7EA 4I6HA 4PDSA 2F7ZE 5AP2A 2CGVA 2WMBA 5JQ5A 4Q5EA 4RRVA 3ZS5A 5IEXA 3BE2A 1AGWA 3PRFA 4L3JA 3RNYA 5I9XA 3LMIA 3FXZA 4CRSA 4W8DA 5AV2A 4OTRA 3NPCA 4XRLA 5HD7A 3FJQE 2UZWE 1SNXA 5CU3A 4FEVA 3HAVA 3ORKA 4O83A 3EQDA 4GUEA 1VYWA 2C5VA 2Q0NA 2ZYBA 3OCGA 3R7YA 4FKRA 3SKCA 5J9ZA 5EW3A 1M2QA 4QTDA 3DB8A 5A4QA 3TKHA 2CGWA 3IONA 4MD9E 2J0LA 1ZY5A 2HOGA 4G3FA 2W5HA 4MXXA 4OBPA 4X3JA 3SXSA 5CVHA 3MPAA 3KY2A 5C8MA 1NW1A 2Z8CA 3PXKA 2QO7A 3FL5A 4G3EA 1GNGA 3ZSHA 4AT3A 4CKJA 4NM3A 4OR5A 3PPKA 4EHGA 4HYHA 3WYYA 3EZRA 4AE9A 5IQCA 1HCLA 3KXMA 5EH0A 5M55A 2Y6MA 4ORKA 3GCUA 4RIXA 3V5LA 3VRZA 3BPRA 4RJ8A 4QYFA 3F5XA 4L3LA 1WFCA 2VTJA 5K5NA 3ZRMA 1A9UA 5BX0A 2WMWA 4K33A 4BKYA 2C0OA 4F70A 4KB8A 4RVTA 1ATPE 2IWIA 1STCE 4WRSA 4GKIA 3CR0A 4O1PA 1J3HA 3VS7A 4GL9A 2W7XA 5K0XA 1SYKA 1YHVA 4BCGA 3R6XA 4W4WA 4YSMA 5C01A 3MA3A 4YZ9A 3HVCA 1V1KA 3FMEA 3QRKA 4ACMA 3JR1A 3KRRA 3ZM9A 5CLPA 4X21A 2YDIA 2CPKE 3OC1A 5KMKA 5JMSA 4OAVB 4PPCA 4BYIA 4BCKA 5AP7A 1UNHA 3PSDA 4BWPA 3DBQA 4QO9A 2XMYA 5JGBA 1BX6A 2QD9A 2PMIA 4IWOA 4AT4A 1YI4A 4QRCA 4YTIA 3ZSIA 4BI2A 2WMXA 4A06A 4QTAA 2E9PA 2W9ZB 3UPXA 3TN8A 2XKCA 4XG4A 3RZBA 1ZRZA 5IQGA 4K77A 4G6LA 4OTHA 4RGJA 4YP8A 1RDQE 3IW5A 3PJ1A 4HVGA 5CF5A 1J7UA 5LWMA 4MVFA 4AX8A 3MV5A 4G17A 2IN6A 4C4IA 3C5UA 5A4CA 3BLRA 2YACA 4CG8A 4BDAA 3PUPA 2GQSA 2JITA 3NNWA 3QD4A 4FTCA 2XIYA 1YW2A 4R5YA 5IQIA 3CLYA 3KEXA 3UZRA 4TTHB 1OKYA 2ERZE 3UVRA 2J9MA 4R5SA 3LJ2A 4FTIA 1OKZA 3QHWA 3HMNA 1KE9A 3FKNA 4DCEA 4D5KA 3HL7A 2GS2A 4O7LA 2CCIA 5HE0A 3F7ZA 1YOMA 1UWHA 5HCYA 5JK3A 1K3AA 1ZXEA 4CFVA 1HOWA 3KCFA 4MQ2A 5CVGA 3VBTA 5JGDA 3KXXA 4JQ8A 1S9JA 2GTNA 1KE6A 2W9FB 4N4SA 1WBPA 5CF8A 1JOWB 5E8YA 3TACA 3UNZA 4P5QA 3RK7A 4CKIA 3JXWA 4IANA 4FT7A 3E7OA 3NS9A 4U80A 4F0FA 3BLHA 3DTCA 3KF7A 3NDMA 3ZSGA 4FF8A 3BEGA 5AP6A 4V0GA 5CNOA 4H39A 4MH7A 3OOGA 3O71A 3E92A 4K2RA 4C3FA 5FTGA 3ULIA 3ZMMA 4ZJVA 5C4KA 3ALOA 4U43A 5CX9A 3VRYA 1H1PA 5K3YA 1IRKA 3GCQA 4BDHA 2QR8A 3NMUF 4EORA 5D7AA 3ZRKA 3JVRA 5E8TA 4FKUA 5JN2A 4FEWA 1OGUA 1OMWA 4LRMA 5C9CA 4WSYA 3SXRA 3A8WA 3F6XA 4BDCA 2QR7A 4WRGA 4BI1A 2B1PA 1OITA 4CYJA 4F99A 1IA8A 3QUPA 4NFMA 4RJ7A 5K0KA 1B39A 3Q5ZA 3V5TA 4EHEA 4BVUA 4JDKA 3AC4A 3TNQB 3C4XA 4PTGA 5AJQA 5E4HA 3F2AA 2YLEA 4YZDA 2IW9A 3RAKA 4A9TA 2HW7A 3EZVA 4ARKA 2RFDA 3QRUA 3GC0A 4FODA 4GVJA 4DINA 4WG3A 1CTPE 4YC6A 3TXOA 3F9NA 4JBQA 2WQEA 3GENA 3W2OA 4TW9A 5IH6A 4FTUA 5E8WA 2JEDA 4NYEA 4JIAA 1DS5A 4RIWA 2XIKA 2F7XE 3H9OA 3G6HA 3PXFA 5AFVA 2ITVA 2FO0A 4EYJA 3L9LA 3VJOA 4C0TA 1H1QA 5AUZA 2GSFA 5G1XA 4PMMA 4F0GA 2CKOA 2Z7QA 3U4UA 3ORXA 5G6VA 1MUOA 1VYZA 2CCHA 5IH5A 3ROCA 3UNKA 3BYSA 3NSZA 4LL5A 4FR4A 1MQBA 4F9WA 5IDNA 4APCA 4BB4A 1LR4A 3UOLA 2W4OA 4DBXA 3R8LA 2OO8X 3LCSA 4PNKA 3ZCLA 2P2IA 5HBJA 5F94A 3R1SA 2OSCA 4O1OA 4I93A 4RC2A 3UO5A 2BTSA 5E8ZA 3A4OX 3C13A 4D1XA 5BMSA 1Q99A 2ITPA 4GVAA 3ZDIA 1W82A 1JLUE 3GEQA 3EL7A 5AV1A 1ZOGA 4QTEA 3DLSA 3HX4A 4X2GA 2ZJWA 5E1EA 5GINE 3R02A 3Q3BA 4IQ6A 5EG3A 3U55A 3GCVA 1L8TA 4ANMA 3Q6UA 3LXKA 3RAWA 2A0CX 3ZC6A 1LPUA 4N70A 4ZS4A 2VRXA 4PNIA 3LXNA 1UU3A 2JKQA 2GQGA 4MNEB 4OTGA 4TYIA 4CLIA 2V7AA 4ONAA 2C68A 2BKZA 3JVSA 2PWLA 4RQVA 1DM2A 3R83A 4ACGA 5DPVA 3RPRA 4EZ5A 3ERKA 3H3CA 3QKKA 3D83A 4DH3A 5FUTA 1OIRA 4I6BA 2P0CA 4FV6A 3EWHA 3CQWA 3KKVA 1OL5A 2YFXA 3RBWA 3QLFA 3PA3A 4FI1A 3F88A 3NEWA 4DG2E 4HGEA 3R7VA 3H9FA 4L43A 4UMTA 3F82A 5EI8A 3UVQA 3VN9A 5HO6A 2W4KA 1BUHA 3ZH8A 4XBUA 2UW8A 4O84A 2UW3A 5EM7A 2QOQA 1FPUA 5HNBA 3LFQA 4LGHA 1XJDA 1FBNA 4FTTA 3K2LA 4GG7A 2O3PA 4M97A 1AQ1A 5HIBA 5HQ0A 1LP4A 2OKRA 3OD6X 4A4OA 4D0WA 2HW6A 1O9UA 2PSQA 3R1YA 1ERKA 2B9JA 3CY2A 3BHVA 4LMNA 3M42A 5AP3A 4DEBA 2OJ9A 4IX6A 5LVNA 4NJDA 1Y8YA 2O5KA 3LQ5A 4M0ZA 3VUHA 5LCKA 3SA0A 3GVUA 3LCTA 3PJ3A 4O7WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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