3ZFXA

Crystal structure of ephb1
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
283
structure length
267
Chain Sequence
AKEIDVSFVKIEEVIGAFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Completing the Structural Family Portrait of the Human Ephb Tyrosine Kinase Domains
pubmed doi rcsb
molecule keywords EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 267
sequence length 283
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zfxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zfxA01
3M2WA 1QPEA 3W2OA 4HOKA 5BX0A 2EB2A 1KE7A 2R3KA 3EWHA 4IEBA 5AP4A 2BZKB 4BIBA 5HTCA 5DLSA 4OTQA 3VUHA 2ZM1A 3ERKA 4DINA 1OGUA 4TN6A 4UBAA 4FEWA 2HOGA 4JG8A 3NYOA 3R9RA 3GCVA 1JVPP 2HENA 4KBCA 3EYHA 3EQGA 3DFAA 4XP2A 5L6PA 2WZJA 4EK6A 4D5HA 3MJ2A 3V04A 2YZLA 3BBWA 4CFUA 5H3QA 2HY81 3TM0A 4J95A 3LZBA 4MF0A 1CSNA 3OW3A 1ND4A 4FICA 5M09A 3LFCA 4W9XA 4MXXA 3UOKA 2Z2WA 1U54A 2GTNA 1OL6A 4WNPA 2Z7SA 2ETKA 4YLKA 1FBNA 3D7TB 3HV5A 3JVRA 4TYGA 4FKQA 4QOXA 5HE1A 3BU5A 4ITHA 5FM2A 4YO6A 1STCE 4RQVA 2ZB0A 4Q5EA 4PPAA 5ACBC 5AV2A 4JG6A 3FY2A 4RIWA 2ZV9A 4I6QA 5CNNA 4DC2A 5ANKA 3FXZA 4CD0A 4UWYA 5M44A 3F3TA 4AN3A 3I7CA 4QP6A 3FSFA 3HECA 3ZSIA 5ANGA 2UW3A 2UW0A 4ZS4A 4RWIA 3E87A 4EWHA 1I09A 2XBAA 4TXCA 5IA3A 3PVUA 2B7AA 2OG8A 3F9NA 3KRRA 4ZLYA 2WFYA 4YC3A 4O7ZA 4CZUA 1YHVA 4W4YA 3BELA 4CRSA 3QCQA 3ZUVA 3DB6A 4HYSA 4IM2A 4RIXA 1LUFA 5HQ0A 3UYSA 3E8NA 4G16A 1ZYLA 3MA3A 1JBPE 4CLJA 3UQFA 3V3VA 5HO7A 3U55A 1MRUA 2F57A 4RX7A 5HGIA 3BPRA 4K6ZA 3ACKA 1YWRA 1BKXA 5EG3A 5C26A 4FEQA 4I23A 4BCJA 2QLQA 5CZIA 3UPXA 4G9RA 4HYIA 5CF4A 4DGGA 4S32A 1OVEA 3Q53A 4XCUA 3KQ7A 4X3JA 3ENHA 5HTIA 4EC9A 1PYXA 2RF9A 3BYVA 4LL0A 4NT4A 2QU6A 3FZTA 1HCLA 4QP7A 3P7AA 1QPCA 3S4QA 4E7WA 3BIZA 1L8TA 2QQ7A 5HX6A 4B4LA 2E2BA 5D9HA 2XZSA 3QQFA 2PL0A 1YHWA 4YJNA 3UP2A 2FGIA 3LM0A 2X8DA 5KO1A 4PP9A 3CY2A 3UQGA 3BGQA 3BBTB 1M17A 3K3JA 2Z02A 1BLXA 4P2KA 2YERA 5EM5A 3M42A 3DAKA 3TCPA 4FTCA 1IAHA 1UA2A 3PJ2A 2VNYA 4JQ7A 5DWRA 5BVWA 2W05A 1BI8A 1H08A 2Y8OA 2BAQA 3AC5A 2BAKA 1YI6A 5LQFA 2GHMA 2ZV8A 5M53A 4PPBA 1H07A 4I5HA 4RVLA 4CCUA 1GY3A 4D2VA 3PE1A 3BGZA 3R7YA 4E26A 2WTIA 4JRNA 4FL3A 4IAIA 4FKJA 1YOJA 4PMPA 4D1XA 3KXNA 1FMOE 3VUIA 4FIIA 5J95A 4AQCA 4BWKA 2GNLA 4WHZA 4CMOA 4YTCA 1KE6A 4RX5A 5GJDA 2IZRA 2BALA 3OF0A 5EM7A 4BCIA 2C68A 3ZEPA 4CKIA 4DLJA 2WMXA 4C7TA 4G3FA 4LV8A 3SLSA 3UG2A 4DG2E 2X0GA 1PRYA 4EQMA 4FTLA 4D0XA 4DGMA 3NUNA 2F7EE 1WAKA 4PUZA 5F95A 2IZSA 1Y91A 5CSPA 3O23A 5FEEA 5L2QA 3OBJA 4W4VA 3R22A 3PXZA 4CCBA 4R7IA 1OKYA 5GIPE 2WTKC 4LOQA 2BCJA 4FKOA 1BX6A 5BVNA 3F5PA 2F2CB 3FLYA 1A9UA 3PIYA 1H00A 1TQPA 4C2WA 4KIKA 2HWOA 4HGTA 2XRUA 2XCHA 3L9NA 3PPZA 4GUBA 4KAOA 4D2WA 1OUKA 4O7LA 4IVDA 4MTAA 5HD7A 1JAMA 3ZUTA 2HZ4A 4FODA 4KIPA 4J7BA 4BYIA 2OFUA 4ITJA 4MF1A 3OTVA 4OBPA 5EKNA 4I1ZA 1IA9A 4FTIA 5HBJA 2X6DA 3A61A 4FKIA 1JSTA 4O96A 4IX5A 5F20A 2QOQA 3D9VA 1LR4A 3E5AA 1R39A 3ELJA 3QKLA 4JBPA 5CTPA 3TZ9A 3ZO2A 3DZOA 4UWBA 3BRBA 4FI1A 3FEGA 4L7SA 4EUUA 3TDVA 2Y7JA 3L8XA 3PVWA 4MBLA 1PXJA 5HLPA 3BWJA 3RPSA 3UPZA 1ZMUA 5JRSA 4RJ3A 5CSVA 3R2YA 4CKRA 4OBQA 5LVPA 1GIJA 4UZHA 2ZJWA 3MWUA 3HLLA 3PJ1A 4F9WA 2IPXA 5D7AA 4TY1A 4TWPA 1YOLA 4PTCA 3LKMA 1E9HA 4L7FA 4BCPA 4E4XA 4RRVA 2WOUA 3OBGA 3QRIA 1JOWB 3KY2A 4FKSA 3V5PA 4IFGA 5HTBA 2WMVA 4FZAB 3OVVA 5C4LA 3E93A 4AAAA 4Y5QA 4AGCA 2WHBA 3D0EA 4PL3A 2PVRA 3K54A 2C6IA 2WTKB 4U8ZA 2DQ7X 3NSZA 4JG7A 5A4EA 3MESA 5CEMA 2A0CX 3IQ7A 4EEVA 3E8EA 3VC4A 4IB5A 3ZEWA 3O2MA 5HCYA 1WBWA 4BL1A 5CLPA 2W1HA 3FZOA 3UE4A 1UU3A 4A4XA 3QD4A 4D9UA 5KCVA 3QU0A 2FH9A 2C0OA 3POOA 4W4XA 5M55A 2F9GA 1S9JA 3GCPA 1UNLA 2V0DA 4DH3A 3PXFA 1CTPE 2R3OA 2VTJA 4H1MA 3BHTA 3H9OA 5B7VA 2XJ1A 3TXOA 3R9OA 5AP7A 4AF3A 4BHZA 1PXKA 4KBKA 4BVUA 2FSMX 1TVOA 2YIYA 3CQEA 4ZY6A 3GENA 5E1SA 5EI6A 3V51A 3NEWA 5J8IA 3RPRA 3MH2A 5AX9A 4FUXA 2HYYA 2ZV2A 2ZYBA 4QP1A 4EHEA 2PU8A 1PXOA 4EYMA 2WMBA 3NUUA 1WZYA 3PZHA 3WZDA 4E73A 3TUBA 4FV3A 3JS2A 2WGJA 3DU8A 4EBWA 5JRQA 4Z9LA 4MHAA 5AA8A 2QO7A 3AG9A 3MH3A 4BRXA 4XG6A 4YC8A 3ORNA 5AUYA 5BUEA 3TZ7A 1KE9A 5E8ZA 2JKOA 3IGOA 4L6QA 4EK5A 2X4FA 2OH4A 4AGDA 2BZJA 2AC5A 2YWPA 3ET7A 3HDMA 4RBLA 2J0JA 4TYHA 2HIWA 2G01A 3RNYA 4FSWA 1O6YA 1V1KA 2NP8A 2QLUA 3MFTA 4OTHA 1KV1A 2JITA 5KMOA 2ITPA 3PA4A 4GH2A 1JWHA 2F7ZE 4FV2A 2EXCX 3P7CA 4BKZA 1OPJA 2J2IB 4EOIA 2HXQA 3GXLA 3VS2A 4EHGA 4ENYA 2R0IA 4FTUA 2P4IA 2W99B 3RVGA 3UP7A 4RZVA 3RPVA 3TNHA 2Z7RA 4EOPA 4FKLA 4IQ6A 4RA5A 4OTFA 4NW5A 4FYOA 4C59A 1A06A 3BV3A 1UKHA 3KU2A 3OMVA 2RSVA 3FKNA 1Y8GA 4QMWA 5FQDC 4O0UA 1Y6AA 4XOZA 3WI6A 2I7QA 4MXZA 3NR9A 5M57A 3V8TA 4AP7A 1M7QA 2C5VA 2CDZA 5G6VA 3QXPA 2JIIA 4IMYA 4KS8A 1Z57A 4C4EA 5A6NA 4XG9A 4O7YA 2J5FA 3P1AA 4JIAA 5AUVA 3UQCA 4BZDA 2OKRA 2Y0AA 4XG2A 1GZKA 5EK7A 4L44A 4HVHA 5B2MA 3RCDA 3D2IA 5I0BA 3Q4UA 2XCKA 4DBXA 3QRUA 4L01A 5JFWA 3DTCA 3PLSA 1DAWA 5AUWA 5DR2A 2FA2A 4QYFA 3ZYAA 4EH9A 3Q3BA 4K2RA 4LRMA 4CMTA 1XH4A 4PDOA 4USFA 2CMWA 4ERWA 3COMA 4B0GA 4D9TA 3CEKA 1CDKA 4GYGA 3K5UA 2J6MA 5T68A 3UJGA 3D5WA 3DXNA 3QWJA 5HCXA 5A4QA 2ZDUA 5C03A 3FL5A 4ZXTA 4JVGA 3ULIA 5GIOE 2Y4IC 4FOBA 4IZ5A 4WKQA 3ODZX 3DOGA 2YDIA 4IZAA 3P9JA 2B9IA 3F69A 4N6YA 3OW4A 4QPSA 3VAPA 2XH5A 3FLWA 4EKKA 4ZZMA 4BCOA 2VN9A 3C0IA 3MH1A 4G6OA 5DT0A 2X9EA 2VZ6A 3ZHPC 2WMSA 2XNGA 3MJ1A 4ZSJA 4M8TA 5CAQA 5M06A 1FGIA 3NW6A 5AX3A 4BCHA 4FE2A 2PZPA 5IU2A 3NX8A 4KRCA 2A27A 4L53A 4C33A 5JFXA 3RKBA 4V01A 3VUKA 4WIHA 4I21A 3RWQA 4EONA 3MFSA 2VTLA 3PY1A 3VQUA 4CYJA 2UW4A 3H0ZA 4O1PA 3Q2MA 1YDRE 3WOWA 3OZ6A 3KFAA 4FTOA 4M14A 5DR6A 5F1ZA 4CT1A 2RG6A 2WO6A 3F3VA 3DZQA 3LQ5A 4I20A 4YP8A 5CS6A 5KKRC 4RQKA 4AOIA 2PZ5A 4JX3A 1XQZA 4YJSA 5AV1A 1XBCA 3ZFXA 3QUPA 3A60A 4KINA 1GNGA 5AR7A 4WSYA 3OOMA 2B9JA 3OT8A 4PL4A 4N4SA 3GFWA 2ERKA 4WG5A 5FTQA 4K11A 3ZU7A 5I9WA 5JEBA 5E4HA 4DBNA 4G6NA 3CQWA 3BZ3A 5IQCA 4HZRA 4UB7A 1URCA 2WIPA 3HMMA 5HNGA 3UNKA 4OTWA 3AD6A 3ZS5A 1OL7A 4NIFA 3NLBA 1V0BA 2BIYA 4ZOGA 3SDJA 3WBLA 4WA9A 3MS9A 3W1FA 4O6LA 3CR0A 1A48A 2Y4IB 1PKDA 3FZSA 1ZYCA 2YIRA 5T6KA 3HV6A 3VBXA 4C02A 4E1ZA 4O81A 4U44A 5AP6A 5AAGA 1UU8A 4EYJA 2J0LA 4IIRA 2EUFB 4RA4A 3NCZA 4EQCA 5CEIA 2ZB1A 3DJ6A 4QMMA 4O82A 3FC2A 4LGHA 4DEEA 2YCQA 5J1VA 4WRGA 2RFNA 3DQWA 4G2FA 3FQSA 4ASZA 4NJ3A 4X6QC 3RINA 4DYMA 2ITWA 3FYKX 3NUXA 4PMTA 2QO2A 1PF8A 3IONA 4FKRA 4UXLA 5EM6A 2YM8A 5BVEA 4BTKA 1ERKA 3AOXA 4NH1A 4QMYA 5HG8A 3IECA 3FZ1A 4KA3A 4IJ9A 2B9HA 2X9FA 3GFEA 3I6WA 3F2AA 5EOLA 2B0QA 3UZRA 3C4ZA 1QCFA 3ORZA 4J1RA 2XS0A 2JBPA 3I60A 2X1NA 4QMXA 3IKAA 4WD5A 1IEPA 2BR1A 4FV5A 4ZSLA 4MK0A 4C4JA 4YZBA 4A4LA 3H9RA 4DG3E 1PHKA 1BYGA 4L43A 2VWYA 4FSTA 5I9VA 4ZMEA 5ACKA 4AWIA 4UN0C 4FTAA 3HV3A 2C30A 4D28A 4JQ8A 2CCHA 3PRIA 2X8EA 4DGOA 1OI9A 3QCYA 5CEPA 4L3LA 3IO7A 3P08A 3R30A 3VBTA 1EH4A 3BLHA 5AV3A 3EFWA 2X39A 4K1BA 1Z5MA 3AT4A 1H1PA 5DEYA 2X2LA 4PQNA 3B8QA 3Q6UA 4ACMA 2I0YA 2OK1A 3VF9A 3SW7A 3W55A 2DWBA 2OWBA 4A9TA 1XBBA 2GQGA 4L00A 3FSKA 2XKDA 4O0WA 4TNDA 3BWFA 3ZO4A 4KSQA 5D41A 3ZMMA 4X3FB 3R8ZA 3LMIA 2XIZA 3MFRA 1ZAOA 3R7VA 3QTSA 2V7AA 5C4KA 1OKVA 2CGUA 4QMZA 3QTIA 4TW9A 2JD5A 3G2FA 5FEDA 3R9DA 3TN8A 3ZZEA 4Q2AA 3BCEA 3A8XA 5A9UA 2WB8A 3HNGA 3LFFA 4MXCA 3ZO1A 5HO6A 3GU5A 4JXFA 5GZAA 1UKIA 4TZRA 4PX6A 3DNEA 4KNBA 1ZMWA 4LGGA 4FYNA 4YLLA 5HE2A 4AT5A 2XIKA 4D55A 4FV9A 2Q0NA 4MEDA 4FSQA 3QTRA 4CT2A 3I5NA 3LOKA 5CT7A 3ALNA 4MH7A 4AN9A 4MKCA 5FBNC 4DTBA 4ZTHA 4EWQA 2JGZA 2C1BA 4J99A 2QCSA 3QUEA 3QCXA 2QOHA 3OCTA 4GV1A 5HZNA 2R9SA 2VTMA 3L8PA 4EORA 4FZFB 3IOPA 4MD9E 3LMHA 3KCKA 3SXSA 2WQNA 1ZMVA 5EQYA 4DF3A 2F2UA 3F61A 4HCUA 4FT3A 5HOAA 2IW9A 4CVAA 1YI4A 4O91A 2YAAA 3GGFA 3SAYA 3EZRA 4RLKA 3GCSA 3FXXA 1Y57A 4DT9A 4BDHA 5IEYA 4S30A 4QMOA 1REKA 2ZAZA 2XM8A 5HLNA 3FI8A 3BLQA 4MBIA 2VTOA 3KRJA 5CANA 4O2PA 3Q9ZA 3LXPA 3S95A 4ZSAA 5KBRA 2BRBA 3GQLA 4QP2A 4EC8A 3BQCA 1OBDA 4FSNA 2VO0A 4R8QA 1K9AA 4RT7A 4NM3A 3TKHA 3P5KA 4GG5A 3UO5A 1NW1A 3UBDA 5AEPA 3TNWA 5LVMA 4UALA 5LCKA 2H8HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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