3ZLXA

Crystal structure of mek1 in complex with fragment 18
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
344
structure length
312
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMAVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Use of Virtual Screening and Differential Scanning Fluorimetry for the Rapid Identification of Fragments Active Against Mek1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 1
total genus 101
structure length 312
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zlxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zlxA01
1ZLTA 3C4XA 4GK4A 2E9NA 3EQBA 4ENYA 4BDIA 3DU8A 5HBJA 3BV2A 3WYYA 2J7TA 3E93A 3W2SA 2WEIA 4FKGA 3VS3A 1JNKA 5HE1A 2WQBA 3R8UA 4BDBA 2PY3A 2YLEA 2J50A 3D4QA 4Y46A 2ZV9A 1ATPE 2C6MA 4EOLA 2GS7A 2ITNA 3L8PA 4CT2A 3SG9A 3MN3A 4RIOA 1OPJA 4BFMA 3EN7A 2R3NA 3W2RA 4CTCA 3EFKA 4FTCA 4NZWB 4TN6A 1P14A 3TV4A 4DEAA 4XX9A 4PTGA 1Z9XA 1OECA 3FMLA 5DE2A 1PXMA 5FTQA 2VO6A 1H26A 1DI8A 4CEGA 4BBMA 4I0SA 3U4UA 5BVOA 3R01A 2BZKB 2GQRA 4CFXA 2J0IA 1KV1A 5DT0A 4LV8A 3OTUA 1LEWA 4M66A 3P08A 4QMUA 1QPEA 5BVEA 4ASEA 4O7VA 4DLJA 3D2IA 4QRCA 4C61A 3CTHA 4WUNA 4CTBA 4O81A 3KRLA 3SKCA 4FV1A 2HYYA 3DJ7A 4G9CA 1YI3A 3R00A 4OLIA 4UWYA 5CQUA 4AXAA 2XKCA 3DBDA 1NW1A 4D2RA 2WMWA 3PXKA 5D7AA 3DDPA 3LXKA 4MVFA 3EZVA 4M97A 4GEOA 1OKVA 3P7CA 4FSTA 4AT5A 4MBIA 4BYJA 4FKIA 4AN9A 4XH6A 4GIHA 5EYCA 5KMOA 3LXPA 2BIKB 3UYTA 1DI9A 2EU9A 2GNLA 3K54A 4XJ0A 3CQWA 3MVHA 5M06A 3JVRA 3R7EA 2Z60A 5EM7A 3ORPA 1H4LA 3A61A 4F0IA 2VTAA 4QMNA 3R8ZA 4PTCA 5AP2A 2FSMX 5E90A 3VW6A 3NNUA 3AMBA 1URWA 3WZKA 2XCKA 3FKOA 2J0KA 4QOXA 4IX5A 3NUSA 5LVNA 3CD8A 3QZIA 1MQBA 2BDWA 3N51A 4C37A 3EMGA 1Q3DA 3T9TA 3FYKX 4V0GA 1OL7A 4JDHA 4NM0A 4WG3A 1XH7A 5AM6A 3PFQA 5ANOA 3JYAA 3DOGA 4EQMA 2HOGA 3QRUA 1U5RA 4ERKA 3GU4A 4GCJA 4D9UA 3HVCA 5FEQA 4I5PA 3QHWA 4UXLA 1WAKA 5FG8A 2JDSA 4YNOA 1OVEA 4MD7E 4D2SA 3S00A 4R3PA 3V5TA 4F65A 3EZRA 4YJVA 2OH0E 3CEKA 5ANIA 4F7JA 2FSTX 3W55A 2O3PA 3DBFA 5CAPA 3C13A 5IUIA 4JAJA 5M55A 4J53A 2XIRA 3V5JA 4RC3A 1MP8A 3E3BX 5JQ8A 3WE4A 1CTPE 4NTTA 2QC6A 3QX2A 4ANBA 5AADA 4F63A 2PTKA 3R7IA 3HMMA 3NIEA 3PY1A 1WVWA 3A8WA 3GOPA 2IVVA 3CTQA 4Q5HA 3ZFXA 3D5UA 4APCA 5GINE 3LCSA 5DHJA 4DEEA 3PUPA 5JQ5A 3BE9A 3W2PA 5BVDA 5CF6A 4RX8A 5HBHA 3HUCA 5BUEA 2OF4A 2QO7A 4CQGA 3VS1A 5LMBA 3B8QA 5DG5A 5IDNA 3BWFA 2PMLX 2WU7A 4FSZA 3OCGA 4NIFA 4QQJA 4YHTA 5IKWA 4R78A 3R8MA 4JRNA 2C0IA 3NW6A 2I40A 5AV3A 5KMLA 1Q8YA 3C4EA 3FXWA 4UV0A 5AR4A 4TNBA 4YO4A 3H9OA 1R1WA 2FVDA 3HV3A 4IMYA 5J95A 3WZJA 4DEGA 3KXNA 1BI7A 1RE8A 4BDGA 1WBPA 5DGZA 2GNFA 3VHKA 5CU6A 2ZAZA 4D2TA 2ITZA 4NL0A 4BIDA 3SQQA 2E2BA 2QOBA 3VBQA 2Z02A 3JR1A 3ZO2A 2CSNA 4Y73A 3FJQE 3OHTA 4DTAA 3PZEA 2IWIA 4X2NA 5M57A 1SNUA 4AA5A 5HVYA 3SD0A 3BPRA 3Q4ZA 2QI8A 4GYGA 4ZTHA 2QCSA 5GZ9A 3ZFYA 4C4EA 4O7LA 4BWKA 2GNHA 3DCVA 4FVRA 3MTLA 4NTSA 4R7BA 4D4VA 4Z7GA 3AC2A 2BHEA 2EWAA 3F61A 4LL0A 5EKNA 3P7BA 1AQ1A 4QMTA 4YBJA 4HVDA 4UZHA 4DG0E 4C58A 1SVGA 3A62A 4PL4A 1WZYA 3FSKA 5HD7A 3P86A 3SRVB 3M11A 1H01A 1UV5A 3EIDA 3UZPA 5CT7A 3PRFA 2W96B 4X21A 3IW4A 4IX4A 4QO9A 4HPTE 2R3RA 5IDPA 2PUUA 1QPDA 3PJ2A 4GVAA 5EYKA 2PVNA 4YNEA 2P0CA 3C4FA 1CSNA 2W99B 5KNJA 4BWPA 3CBLA 3M2WA 2PE2A 4ZJJA 4XUFA 1JSVA 3GFWA 2YA9A 5I9ZA 4PPAA 4X2FA 3V8WA 2PK9A 4FKLA 4A9YA 2C5YA 4EH6A 3LFDA 4KABA 5HTCA 5KBQA 3A7HA 2O2UA 5M4IA 3KGAA 4BF2A 4CLJA 3KU2A 4RJ5A 2RFSA 4A7CA 3QA8A 2CMWA 5KMJA 5HQ0A 3ELJA 3EFJA 2YLFA 1XH4A 4IB5A 4O0RA 4RVMA 1Y8GA 3C0HA 1UVRA 4XNEA 2C0OA 4AGUA 3P0MA 5C01A 3ZRMA 3C4CA 5AR8A 4ZEGA 4QMXA 3DGKA 5D12A 3D15A 3ZDUA 3KL8A 4PNIA 4JDJA 3IDCA 3EQRA 3HDMA 1FVVA 2XM9A 3AQVA 3H9RA 3KA0A 3TNHA 2GNIA 1UWJA 3CPBA 4X2KA 3VWAA 4DLIA 3I0QA 3OY1A 2C6OA 5EI6A 1JBPE 3AD5A 4LFIA 2JEDA 2VX3A 2WTKC 2JFMA 5AUTA 3E8CA 3ZSHA 2EXCX 4DH3A 3CSVA 3RM6A 4G17A 4DFBA 3AT4A 3TG1A 4EWQA 4EHEA 4O0UA 4FVPA 1TKIA 3TNWA 3WOWA 3ENMA 4TW9A 3HV7A 4CMTA 4XV9A 4ORKA 3CGOA 1WBWA 3FLNC 4D5KA 3P7AA 3EWHA 3QQHA 3KB7A 5AMNA 5AUXA 3A4PA 5JSMA 1FINA 5FEDA 5HE3A 4IZ7A 4YZ9A 3CJFA 5AR5A 4O21A 5M4UA 1V0BA 3PVBA 3VAPA 1QPCA 4ANLA 4ANQA 2BMCA 3DXQA 3ULZA 3ODZX 4F6WA 4IWOA 4B8LA 1KE7A 2ZV7A 1W83A 4DEDA 2IVUA 2BUJA 4X6RA 5EYDA 5KBRA 4G1WA 4ZSJA 4AN2A 5BQ0A 1Q5KA 3LJ1A 4CXAA 1IA9A 4YURA 1ZY4A 3UOJA 3Q96A 1L3RE 3TDWA 5JRSA 4D1ZA 3RMFA 3K3JA 1JWHA 3QCQA 4U44A 5L3AA 4IACA 4TYHA 3G6HA 3KXXA 3I6WA 3KVXA 3LCKA 3LXNA 4O27B 2X39A 3UZRA 2B53A 4IC7A 4MXOA 4YJRA 4F1TA 4CFFA 5LVMA 2OIQA 3BYOA 3U87A 3LW0A 5ICPA 4ZS0A 3IONA 4APPA 1IAJA 4RT7A 4OAUC 1PYXA 1GZKA 4FIIA 2OW3A 4BC6A 5IH5A 1GY3A 4HYIA 2PMNX 3WZUA 5LQFA 5LVPA 4O83A 2B4SB 1K2PA 3QQLA 4TYEA 5HLPA 4IAKA 3RAWA 1Y8YA 3FE3A 4MNEA 4OTPA 2VWUA 4FTTA 4K1BA 4EONA 3Q4TA 3MI9A 4S31A 5H8GA 3W2CA 3OW3A 3KY2A 3VS6A 2WAJA 4F70A 3C4WA 3DAEA 3RPSA 3F9NA 4JDIA 3DPKA 3UOHA 4E8AA 5BNJA 4QYYA 1GAGA 2BRNA 3RINA 4ZLOA 1PYEA 3UZTA 3ZM4A 4EK8A 4D4RA 2WQOA 3ZO4A 4W9XA 2E9OA 1H1PA 4XG9A 1BL7A 3LVPA 4BDEA 5ANEA 4ENXA 4UWCA 4ZMEA 5I5ZA 4FSNA 4AZFA 2F4JA 3QCSA 4FTJA 3F88A 5AR7A 4FGRA 5CWZA 3HX4A 2CJMA 4GG5A 4GT5A 2WQMA 2WZJA 3EQFA 1OIRA 4F4PA 2CGXA 4FTLA 1TQIA 5B7VA 3JY9A 4QYFA 3UP2A 2C0TA 2OZAB 2QOIA 3PSBA 5IQGA 3RNIA 4QP8A 3IG7A 1I44A 1LP4A 2HZNA 3LPBA 3W2QA 2W5BA 4D4SA 4DYMA 4IX3A 4YPDA 3VF9A 2GS6A 2F2UA 3I81A 2FA2A 5DT3A 3QFVA 4YMJA 4GRBA 4FIEA 4U3ZA 4NSTA 4RFMA 5J7HA 4DGGA 3LXLA 3FY2A 2IW9A 4HGLA 3MW1A 2GNJA 3R63A 1KE6A 3PIXA 5CVHA 5AEPA 5LVOA 4KSPA 4E5WA 4EYMA 2YJRA 1NVQA 2WQNA 4FTKA 4HYHA 4EOPA 1CKJA 5ETFA 2R3KA 2HW6A 2GFSA 4JRVA 3UC3A 3BRBA 4PMSA 2YM8A 4L43A 4L00A 2QO2A 2C5OA 5L2TA 3PJ3A 5HHWA 3DAJA 4FIHA 4F09A 3GEQA 4YZMA 3HV6A 4EEVA 3OFMA 2QQ7A 4M84A 3D7TA 5JRQA 3SW4A 3BZ3A 5BVKA 3AC1A 3OTVA 3RTPA 4D1XA 1H1QA 1F3MC 2A2AA 2IZSA 4P7EA 3G15A 4YU2A 2R4BA 5AM7A 5A9UA 3HEGA 3I0OA 3EYHA 4RZWA 2KTYA 5IEVA 4DGMA 2PVMA 2WGJA 2YWPA 2JIUA 5JGBA 3S95A 3UO4A 3KULB 2PUNA 3VS5A 4MAOA 3FMEA 1GIJA 2V62A 2VTQA 4FTUA 4XS2A 5D10A 4I0RA 5HX6A 4KIKA 2VX0A 4O82A 4BTFA 4IB0A 3T9IA 4F7LA 3ZH8A 3G90X 4QMLA 1UU8A 3DKGA 5J87A 4AAAA 4C34A 2GFCA 4BDCA 4J98A 2OZOA 3N4VA 3CCNA 2OIDA 3A4OX 4WG4A 4HOKA 2OF2A 2JIIA 4PMTA 2UVYA 4JAIA 5FXQA 3ZMMA 1S9IA 1ZYSA 3V5LA 4ZTSA 4DCAA 4NH1A 2C5XA 5EH0A 3ODYX 2WMQA 1Z5MA 4LMUA 2BPMA 4J8NA 2PMOX 5C27A 4K0YA 2HY81 4L6QA 5LMKC 3H0ZA 3ZBXA 4CRLA 3KRRA 3BWJA 3IGGA 1YHVA 3C5UA 3AC4A 5D1JA 2ONLC 5FBNC 4A9UA 3MWUA 1NY3A 4FR4A 2UW9A 2WPAA 4WNPA 3CKXA 3EQGA 1H28A 4IAIA 4RJ8A 5LCJA 3QUPA 4H05A 5IG1A 2YM7A 5HVKA 5LJJA 4U40A 3O71A 2XNPA 3ZYAA 4R3CA 5AP7A 4CT1A 4FZFB 1M2QA 1BI8A 3SG8A 2J5EA 4YJUA 3QTZA 4QTCA 4J97A 2WMXA 4CRSA 3DLSA 4M68A 2C3KA 4QP9A 4D2WA 4AQCA 4Z7HA 3LFBA 2FSOX 2BAJA 5CAOA 4AFJA 2O64A 3RP9A 5CSXA 2ITPA 2E9PA 3EQCA 4PMMA 1ZYCA 5EQPA 4DFZE 4ZIMA 3F7ZA 4IWDA 3GCSA 4JBQA 3Q9ZA 1I09A 1ZYLA 4QT1A 3SA0A 3V5PA 3W8QA 4C62A 2P2IA 4U80A 2A0CX 4TY1A 3TIYA 4EJNA 3T3UA 3ZUVA 3QTWA 4RC2A 2HIWA 3ORZA 1W84A 3F2AA 5GJDA 3QUEA 2XRUA 5HCZA 4USEA 4D0WA 2GCDA 2CN8A 4ITJA 3Q6WA 4IIRA 4YLLA 5F20A 3Q2JA 4PV0A 4NFNA 2EUFB 3P23A 3LQ8A 3FMDA 3A99A 3AD4A 3WARA 4BHNA 2LAVA 2ITVA 5JFVA 2F9GA 2B7AA 3V8SA 2ZV2A 5AR3A 4E4MA 4O6LA 2KULA 2Y8OA 4O2PA 3TJCA 4O1OA 3FKNA 3GBZA 2G15A 4MF0A 2B9IA 3FC2A 2W1ZA 4RQKA 3PE1A 3OC1A 2G2FA 5HICA 4CV9A 3LHJA 2WELA 4FTOA 3RWPA 2PVRA 5AUVA 3OCTA 3CQUA 3HRFA 2ETKA 4EUTA 3FHRA 5I0BA 3UIUA 3CXWA 4L68A 2BTRA 1CKPA 4K33A 3Q3BA 5HTBA 4FTMA 1OUKA 4ZTNA 4AP7A 5IQDA 2VTJA 4H3QA 4YJTA 1J1CA 3GFEA 3NS9A 4O96A 1KOBA 3RPRA 5KMNA 3T3VA 4FNYA 4WA9A 3GC0A 3MY5A 2CNVA 1ZMUA 2OJGA 3E63A 4YBKA 5GZ8A 4EKLA 3ITZA 3GU7A 4G34A 4YJOA 4KBKA 2PZIA 5CZIA 5ETAA 3VBVA 3ATTA 4IFGA 5C1QB 4I92A 3F3UA 4TWCA 4KRDA 4E1ZA 2WOUA 1IAHA 4BDJA 4JG7A 1ZWSA 2F57A 2WB8A 4YJNA 3CY2A 3GC8A 3S2PA 3I79A 4GIIA 5BYLA 3KK8A 5HG8A 4DTBA 3GGFA 4S33A 2I7QA 4HVIA 2R3LA 5ANKA 4AZEA 4PRJA 3BU3A 3FAAA 4FKJA 1YWNA 4L67A 4FT5A 3MPTA 3MVMA 1Q99A 4U6RA 4IVAA 1YOJA 3PG3A 4JIKA 4ZSLA 5IEXA 2BVAA 2XNMA 5J1WA 4R6VA 3UVRA 3OUKA 5CEOA 4OR5A 2NNWB 4V0GB 4A4XA 2ZM4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3PXK A;  5D7A A;  3DDP A;  3LXK A;  4MVF A;  3EZV A;  4M97 A;  4GEO A;  1OKV A;  3P7C A;  4FST A;  4AT5 A;  4MBI A;  4DDI A;  4BYJ A;  4FKI A;  4AN9 A;  4XH6 A;  4GIH A;  5EYC A;  5KMO A;  3LXP A;  2BIK B;  3UYT A;  1DI9 A;  2EU9 A;  2GNL A;  3K54 A;  4XJ0 A;  3CQW A;  3MVH A;  5M06 A;  3JVR A;  3R7E A;  2Z60 A;  5EM7 A;  3ORP A;  1H4L A;  3A61 A;  4F0I A;  2VTA A;  4QMN A;  3R8Z A;  4PTC A;  5AP2 A;  2FSM X;  5E90 A;  3VW6 A;  3NNU A;  3AMB A;  1URW A;  3WZK A;  2XCK A;  3FKO A;  2J0K A;  4QOX A;  4IX5 A;  3NUS A;  5LVN A;  3CD8 A;  3QZI A;  1MQB A;  2BDW A;  3N51 A;  4C37 A;  3EMG A;  1Q3D A;  3T9T A;  3FYK X;  4V0G A;  1OL7 A;  4JDH A;  4NM0 A;  4WG3 A;  1XH7 A;  5AM6 A;  3PFQ A;  5ANO A;  3JYA A;  2XAR A;  3DOG A;  4EQM A;  2HOG A;  3QRU A;  1U5R A;  4ERK A;  3GU4 A;  4GCJ A;  4D9U A;  3HVC A;  5FEQ A;  4I5P A;  3QHW A;  4UXL A;  1WAK A;  5FG8 A;  2JDS A;  4YNO A;  1OVE A;  4MD7 E;  4D2S A;  3S00 A;  4R3P A;  3V5T A;  4F65 A;  3EZR A;  4YJV A;  2OH0 E;  3CEK A;  5ANI A;  4F7J A;  2FST X; 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