3A62A

Crystal structure of phosphorylated p70s6k1
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
288
structure length
263
Chain Sequence
KIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCHFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of human p70 ribosomal S6 kinase-1 regulation by activation loop phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Ribosomal protein S6 kinase beta-1
total genus 80
structure length 263
sequence length 288
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3a62A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3a62A01
1BYGA 3QA0A 4DFUA 1O9UA 4CFWA 4KRDA 4GJ2A 5T6KA 3N51A 4FYOA 4XNEA 4AN2A 4RC4A 4D2VA 3Q4ZA 1CMKE 4XOZA 1OL2A 2CLXA 4R8QA 4I5PA 5LARA 3TZ8A 3SGCA 2I6LA 2PUUA 4X21A 3DJ5A 4KINA 4YNEA 3ATTA 4FSMA 4BL1A 4O83A 2CCHA 2QHMA 2Z60A 4RA5A 3UC4A 5T68A 3PXZA 3H9RA 3SW4A 2NNWB 2B9FA 4AA0A 3U51A 4E6AA 2J90A 1QCFA 2BDJA 3OXZA 4G16A 4BI1A 2VO0A 3FI2A 1YOMA 2I0VA 4M14A 2QOFA 2BRGA 4GH2A 2OGVA 4RPVA 2JD5A 5HO8A 3W8LA 3ORTA 3AT2A 3JXWA 3R8PA 2C0IA 1KOBA 2IG7A 2UZWE 1TVOA 4GVJA 3A99A 3F82A 2GCDA 3HMPA 4OR5A 4TYJA 4PPBA 4PP9A 3TUDA 2C6IA 3E63A 1VZOA 4ALVA 3G9NA 4FF8A 4WUAA 3CCNA 3BCEA 2C6LA 4FNXA 4Y46A 5AUYA 1W98A 2P0CA 4IE9A 3ZO4A 4AZSA 3T8OA 4B99A 3Q3BA 3AGMA 3G9LX 3HKOA 4F70A 3LQ3A 2B1PA 2PZIA 4FTLA 1M52A 2WD1A 2ZV9A 4I93A 5D12A 3OT8A 4C61A 4EH3A 5L2TA 3EZVA 3G33A 5J9YA 4P5QA 5LWNA 2YWVA 3TV7A 3P9JA 3QD3A 4F0FA 5ETIA 3VUKA 4I4EA 4HPTE 2FGIA 3UYSA 1SMHA 4CZYB 3W2QA 4I21A 4KABA 1O6YA 3O8TA 2A4LA 3ZO1A 4QO9A 5LMBA 1K3AA 2PUIA 4UYNA 4BHZA 3I5NA 1R78A 3AC8A 3I60A 3K2LA 5FQDC 3ZOSA 4DAWA 4CZUA 3DDPA 5CSHA 1J1BA 1XJDA 4FV8A 3WILA 5CS6A 3VBYA 2GU8A 4A9SA 1QL6A 1Y8GA 4YZMA 1FMOE 4FZDB 5AJQA 4APCA 3UP2A 3LVPA 3DQXA 3UP7A 5CXZA 1E1VA 5AP6A 5HG9A 4FK3A 2R3KA 4GFOA 4CYJA 4DT9A 4FC0A 4G6OA 5A3XA 4AP7A 4V05A 1GJOA 5AX9A 2IZRA 3UVQA 4DEEA 4R3CA 4D4RA 1CDKA 5IA1A 2GNFA 3ZRLA 3OY3A 2O0UA 1ZYDA 4OT6A 2VTHA 3MTFA 3VBXA 2WGJA 5E90A 3ANQA 3IS5A 4UWYA 5FDXA 2LAVA 3OXIA 2I40A 2YN8A 3WYYA 2UZOA 2WIPA 4FKUA 3N4TA 2F9GA 4P7EA 4F65A 2BAKA 3RGFA 4DLIA 4C3FA 3F7WA 3H30A 4B8LA 4LUEA 4EC8A 3UNKA 2VN9A 4BDJA 2HZIA 3IW7A 3QTIA 4C8BA 5E9EA 3CPCA 2FH9A 2VWUA 3GU6A 3JY9A 1Y6BA 3DAKA 3ACJA 3U6HA 4X3FC 5EQEA 3I7BA 3ORNA 4OGRA 4J52A 1LPUA 3RAKA 2CGVA 3ROCA 4BCNA 4QYGA 3SLSA 3NEWA 5AADA 3TACA 4DGGA 4USEA 3QU0A 3ZFXA 5EI2A 3TWJA 4KIOA 4IWQA 4DEGA 2VTLA 2GHLA 2QR7A 3QFVA 3QQKA 1ND4A 4PPAA 4PL3A 5I9ZA 1UKHA 4GFMA 4PTCA 1OKWA 4J8NA 3CE3A 5C01A 3PA3A 3U8WA 5BVFA 5KKRC 2XRWA 4GL9A 4F09A 2CKPA 4AWIA 5C1QB 2WTKC 3R01A 5GIPE 4WNOA 2IN6A 3PPZA 4FTAA 4EHVA 3RM7A 3R83A 2JGZA 3OW4A 4HYSA 4U97A 1YI6A 3SV0A 2C5OA 4FL2A 3F3UA 3U9NA 3LKMA 5L2QA 2A27A 3HVCA 4FSQA 3V3VA 3SHEA 2JKQA 4MXYA 3QC4A 2YAKA 3HGKA 4U6RA 5HE3A 4RIYB 3OOMA 5IH4A 1LEWA 5FEDA 4C4GA 4TNBA 3NNUA 4R7HA 2BFYA 4FKOA 2UW3A 3G6HA 4ZZMA 1KE5A 3KXXA 1QPCA 4UMUA 4FV4A 2OJ9A 4RGJA 4X2FA 4GVAA 4USFA 3QALE 3R9RA 3E7OA 3TXOA 2GHMA 2PPQA 2ITYA 3EFLA 3CQEA 4TYEA 3HEGA 4OAVB 4FV3A 2UZUE 5EHOA 4OTRA 5H3QA 3VQUA 4ALUA 4FIJA 2Y8OA 4EZ3A 3DFCB 5TR6A 4UMRA 3UZRA 4NJ3A 4EH9A 4EHZA 5HX8A 3PTGA 3PIYA 4FT5A 2VTMA 5EI8A 4FVQA 4CTBA 3JYAA 4LV8A 3C5IA 4QNYA 3LXNA 4BC6A 4CKRA 3ZU7A 3A7GA 4FICA 3S4QA 3KU2A 2GFSA 1KSWA 5M55A 5LCJA 3LFNA 3GCSA 3UTOA 3SG9A 4UXQA 3GI3A 4EH2A 3I7CA 3ZSHA 3MH3A 4Z3VA 2ZOQA 2BFXA 2FYSA 3D2IA 5HVYA 4D5HA 5BX0A 1PRYA 3GC8A 4HYIA 3VBTA 2ETKA 3W2RA 5A4LA 1OUKA 5G6VA 4FZFB 5CZHA 3EFJA 4DC2A 5HU3A 2ZM4A 3VQHA 4JLCA 4IDTA 3DXPA 1XBAA 3NYXA 3BYSA 3RZBA 3T3UA 4B0GA 1KWPA 4BIBA 4DE4A 4F9BA 2XKDA 3WF5A 5AFVA 2BKZA 4IH8A 4JIKA 3ZZEA 4J71A 1I09A 4DEHA 4D2PA 5LVOA 4E4LA 1FVTA 5E8TA 4FEXA 4O22A 5CTPA 4FL1A 4OTHA 5DLSA 5KHXA 3LW0A 4RVLA 3E8CA 1XR1A 2C1BA 4OUCA 3V5JA 3O2MA 2HZNA 3DBCA 4F9WA 1KOAA 3PPKA 4XS2A 1OITA 3C7QA 4QQ5A 1ZZ2A 5JZJA 1CKIA 4AN3A 4FKIA 4WA9A 5F94A 3TZMA 3G0FA 2WELA 1IA9A 1ZWSA 2BZKB 2SRCA 3KA0A 4IWDA 1IR3A 3BHHA 3DTCA 4U8ZA 2XNNA 4BTKA 4JDIA 2BCJA 3KRXA 4F6SA 2WFYA 4RQVA 4YZBA 3DKFA 4GU9A 4JXFA 4JG6A 3JS2A 3FSFA 2VWXA 5EYKA 3VS0A 5GJGA 3NYVA 5DEWA 3KF4A 4RJ7A 5CAPA 4ZTMA 5LVMA 3LCTA 5EYCA 4I22A 4IADA 4MVFA 2J0IA 4BDHA 3TUBA 5L4QA 3DK3A 4KAOA 3WZDA 2VWIA 4UALA 1GZKA 3TL8A 1M2RA 2PTKA 2JIIA 1BI7A 4KKGA 4A06A 3VUTA 4ZK5A 2ZV8A 4ITIA 2HIWA 5HVKA 4MF0A 1MRVA 3EQRA 4N70A 5KMNA 2X4FA 3KXMA 5CI7A 4Y8DA 3BQCA 3HL7A 4K2RA 4ONAA 3CD3A 4A9TA 2VTPA 2PMNX 2WB8A 2WU6A 3A2CA 3O71A 3ALOA 5CY3A 4BCFA 3HP5A 1IA8A 1ZY4A 3NW5A 2W1DA 5HO6A 3QUDA 3CP9A 3HAMA 1ZRZA 4BDFA 3HV7A 3F88A 3GCQA 4BIEA 5M4UA 2VTJA 3C50A 4U79A 1YVJA 3WF7A 3CQUA 2RG5A 4RIXA 1ERKA 4C4JA 5I3RA 2WQNA 3L8VA 5M56A 3JVSA 3V8SA 5JH6A 3UPZA 2FA2A 3DNEA 4F9AA 4FV6A 3R7EA 1U54B 3WI6A 4RFZA 2JKOA 3DKGA 3D94A 3MVLA 2C3LA 4M69B 1PXJA 1SVHA 2WU7A 5EYMA 4JT3A 5HCXA 1ZMWA 2C0TA 3QD0A 4O1OA 4NU1A 5HCYA 1QMZA 3OUNB 5DN3A 5FTOA 3UDBA 5ACBC 3U4UA 3FEGA 2JKMA 5KMOA 2DUVA 2V0DA 1U54A 5IG1A 4Y73A 4QMVA 2V55A 4CGAA 4XUFA 3GC9A 2UW9A 2X2MA 4KSQA 4GT3A 3OS3A 3PJ8A 4YC6A 4JG8A 4NKAA 5HBEA 5J9LA 3COKA 4YJVA 4CFFA 2VTRA 4OBQA 1YQJA 5I9YA 2XNGA 3LZBA 5DG5A 2ESMA 2G2FA 4XJ0A 1S9JA 4WNMA 4ERWA 5IDPA 1OIRA 4CKIA 3FL4A 3MSSA 4A7CA 3NVMB 3LMHA 3LHJA 4F7SA 3Q6WA 2E9NA 4MCVA 3MH0A 2EXMA 2WTDA 3EYHA 3BYOA 4RLKA 4XBRA 1IEPA 4ZTSA 4HZRA 3UVPA 4CNHA 5HLPA 2PVKA 5EI6A 3IGGA 4O0RA 2X2LA 4RJ8A 2WEIA 1PMNA 1YI4A 3PZEA 2PY3A 3UIBA 2GSFA 1Q8UA 2ITQA 4PTGA 4FTRA 1P4FA 3F66A 2ITUA 5CU2A 4ANLA 3WF9A 5KBRA 3UO6A 2XNBA 2B55A 3UIXA 5EQPA 3QUEA 3NPCA 4WNKA 3IW4A 2CKQA 2ZB1A 3RPSA 5JN2A 1WFCA 4RFMA 5CASA 4JR7A 3IKAA 2BIKB 2O2UA 4FV7A 3Q52A 4O0TA 1PMVA 4BCQA 5HE0A 4FGRA 3QX2A 5JRQA 4EH7A 3AC1A 3WYXA 3MPTA 3W32A 2VTQA 4EI4A 4JBPA 4ZXTA 3G15A 5DR9A 4AA5A 3R2YA 4O38A 2JKKA 4WD5A 4QMWA 4BYJA 4HCVA 5LCKA 3E8EA 1ZLTA 4FTQA 4R78A 1OGUA 3PUPA 3KCKA 2XEZA 3LQ8A 4UMPA 5HG8A 4I0RA 4QYFA 4D2SA 1K2PA 4QPAA 1YW2A 4D4VA 1B38A 4YBKA 4D2TA 1ZMVA 4FSTA 4L52A 3EQPA 2QG5A 4MBLA 4EOPA 3AC5A 4IVBA 3EZRA 3ZC6A 4FVRA 5C03A 3ANRA 4H3QA 3F3TA 4HYUA 3EWHA 3S3IA 4PPCA 5BUIA 5H8GA 4DGLC 4OTGA 3KRJA 4DFXE 4XP2A 2C5NA 2ZM3A 5CAVA 4X7QA 1DI9A 2C5VA 4DG0E 1GAGA 4DTAA 3T3VA 3RHXA 3RPVA 5AR7A 5GZ9A 5E8YA 3V6RA 2GNHA 4RX8A 4NFMA 1PXLA 4AS0A 1H07A 4RIOA 4K8AA 3HUCA 2GNIA 4Q5EA 3QZIA 5DRBA 4MAOA 2WQEA 3QTSA 4K18A 5KZIA 4GYGA 5EM5A 2XF0A 1Q62A 3I0QA 5DBXA 5EFQA 5DNRA 2J51A 5FBOA 1FVRA 2BHHA 3EQBA 3UC3A 4JBQA 5JGDA 2VU3A 5DPVA 4HCTA 2NRYA 3H9OA 3R1QA 2VD5A 3KN6A 4MQ1A 2F7EE 3AD4A 4Z9LA 3BELA 5IQAA 3NAYA 4XG4A 3FI4A 1BL6A 3D14A 2OLCA 3KXGA 1ZARA 4AOTA 4ZLZA 1CTPE 4YO6A 3RBWA 3KMUA 4HGTA 4WNPA 5M51A 5D9HA 3HDNA 2UZDA 4JOAA 4O0YA 1GZOA 2PE2A 2RKUA 3NYOA 4QYEA 4S2ZA 5J95A 4ACGA 4ALWA 5IUGA 3BWJA 4EK3A 3ORXA 4AZEA 2A19B 4EQMA 1WBWA 2IVUA 2O5KA 5CVHA 4NWMA 5EM8A 5JEBA 5DEYA 4AQCA 5BUJA 2XB7A 3LXLA 3PZHA 4H3PA 4QT1A 5E1SA 4J53A 4O91A 3VS7A 3NUAA 2W4OA 3AC2A 3CBLA 4E6CA 5LJJA 1H8FA 4GIHA 1UU8A 4C62A 4EBVA 1OVEA 2CDZA 3OZ6A 2CNVA 1V0BA 4EK6A 4IAAA 2UZLA 3A61A 2PMLX 4TKSA 5FUTA 5EM7A 4U41A 2R3GA 4JNWA 4O1PA 1YOLA 3HYHA 3D2KA 2PZ5A 2PVMA 4PMSA 2ZDTA 4JDKA 2BDWA 4G2FA 4C34A 4RRVA 5ANOA 4NCTA 1VR2A 3L8XA 3OBGA 4JG7A 3TJDA 4Z7GA 1GIJA 3IDCA 1WMKA 3QGYA 4EOSA 5CU0A 4FEUA 1JPAA 2PSQA 4M68A 2OZAB 1XBCA 4V0GA 3LM5A 4XHKB 1XWSA 3FXXA 2GTMA 2ACXA 3HNGA 2GQSA 5EDQA 3EL8A 4RZVA 1Z57A 3PIXA 1OL5A 2G15A 1NXKA 4FSNA 4QTAA 1Q97A 4RLLA 4F63A 2G9XA 4O2PA 4ASEA 5FWKK 4TL0A 2ONLA 4ZOGA 5J1VA 1DS5A 4HCUA 3WE4A 4EHGA 4K0YA 3KVWA 5A9UA 4AT3A 2W4KA 3MIAA 4LI5A 2QG7A 4NYEA 3FYJX 2QQ7A 4G1WA 2XIYA 3NGAA 3RAWA 4ZTQA 2GS2A 4K77A 3UODA 3WOWA 4YURA 4M0ZA 4GKHA 1XKKA 4LOQA 4UEUA 2OU7A 2VO6A 2RL5A 4U9AA 3MW1A 5KUPA 2AC5A 2YM4A 5FTGA 3N4UA 1W7HA 4IAKA 3TEIA 3K3JA 1H25A 3P7AA 4AX8A 3DLSA 3VVHA 4OTIA 4LFIA 1UU7A 4QTDA 3EQFA 2X9EA 4G6LA 5CAUA 5M06A 3VNTA 4EUTA 2J0LA 2BZJA 4BFMA 2GHGA 4IMYA 3D5XA 4Y83A 4C35A 4CFUA 4K9YA 5GNKA 1YI3A 3BHTA 4KWPA 3VUMA 5BVKA 4EEVA 3SX9A 3NCZA 4BKJA 3VO3A 4AFEA 3SOCA 3VUGA 2WNTA 4AT4A 4NUSA 2WMUA 4GK2A 4FIIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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