3A8XA

Crystal structure of pkciota kinase domain
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
343
structure length
334
Chain Sequence
MDPLGLQDFDLLRVIGRGSYAKVLLVRLKKTDRIYAMKVVKKELVNDDEDIDWVQTEKHVFEQASNHPFLVGLHSCFQTESRLFFVIEYVNGGDLMFHMQRQRKLPEEHARFYSAEISLALNYLHERGIIYRDLKLDNVLLDSEGHIKLTDYGMCKEGLRPGDTTSFCGTPNYIAPEILRGEDYGFSVDWWALGVLMFEMMAGRSPFDIVGSTEDYLFQVILEKQIRIPRSLSVKAASVLKSFLNKDPKERLGCHPQTGFADIQGHPFFRNVDWDMMEQKQVVPPFKPNISGEFGLDNFDSQFTNEPVQLPDDDDIVRKIDQSEFEGFEYINPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of the PKC-iota kinase domain in its ATP-bound and apo forms reveal defined structures of residues 533-551 in the C-terminal tail and their roles in ATP binding
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein kinase C iota type
total genus 102
structure length 334
sequence length 343
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.13: Protein kinase C.
pdb deposition date 2009-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3a8xA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3a8xA01
3OBGA 4DITA 3VIDA 4D2VA 5A9UA 4LRMA 3V6SA 4HCUA 4FKRA 4QPAA 4E5BA 5BX0A 3UIUA 3EQFA 2JKMA 4W8DA 5KNJA 3AD4A 1R1WA 3PIZA 4S30A 5CX9A 5DNRA 5FGKA 2CKEA 4NFMA 5IMXA 2ITQA 4FL2A 2PSQA 4MNEA 2BZHB 1SM2A 5AP6A 3TUDA 3ENHA 3EZVA 1KV2A 4NTSA 5E8XA 3OEFX 3UC4A 2OIQA 4EORA 4TKSA 5AFVA 1UA2A 5L6WL 2FA2A 4QTBA 4BDBA 2R3LA 3MSSA 4AE6A 2VTNA 4DFLA 2QKWB 4R3CA 4HNIA 3CCNA 5I5ZA 5FEEA 3RWQA 3UPZA 3VUDA 4IXPA 2GDOA 2UZUE 2R7BA 1DI9A 2GNFA 2CN8A 4X3FA 1HCKA 5KBQA 4JLCA 3ZC5A 4HPTE 2QOCA 1GIIA 4EH7A 3W2OA 4YTHA 4C61A 3UTOA 1R39A 3LXKA 5FM2A 3COMA 4FI1A 1KE9A 4EOJA 4CRLA 5A4TA 5DRDA 3O2MA 4UMPA 2O64A 4APPA 4YLJA 3K3IA 3VS0A 5J1VA 4Q5EA 2BDWA 2PZYA 1OL5A 3HMPA 3ORIA 3DBFA 4WG5A 4Z9LA 4YR8A 3F69A 3RK9A 3HGKA 4NCTA 4XH6A 1Q8YA 1XKKA 5FP5A 1FOTA 2PTKA 2W5BA 4RFYA 3VRYA 3W2CA 4EK3A 3O8UA 3MY0A 3KF4A 2P55A 2GNJA 2SRCA 3QCXA 1FMKA 4JAJA 4JBPA 4TW9A 1B6CB 3LCSA 5LVPA 1M14A 3NWWA 1TKIA 3WF6A 4BY9E 4K0YA 4DTBA 4WBBB 3R9RA 2GMXA 4OTIA 1UWHA 2XS0A 4WA9A 1E1XA 2QOHA 4KBCA 2WEIA 4IWQA 5AP7A 3RPRA 5KCVA 3RI1A 4GIHA 3C0GA 2GU8A 3I6UA 3LLTA 4AZVA 2DUVA 3OFMA 4HW7A 3LCKA 4JOAA 2BZIB 3PVGA 3F9NA 2R3PA 3PSCA 1K3AA 2QNJA 3ANQA 3FQEA 4XOYA 4ANMA 4BHNA 4UMRA 3UG2A 4FSMA 1TQMA 4U43A 4MCVA 1W82A 3LXNA 4WNOA 1BL6A 1I09A 2UW8A 1ZYLA 2W9FB 3OHTA 4I41A 4CZUA 4OT6A 2CN5A 1OUYA 3HRCA 2CNVA 4D1ZA 1Q24A 2OIBA 2W06A 2XCKA 2UZBA 3JY0A 3Q4CA 4DT9A 2GS7A 4QPMA 2YWVA 3KF7A 4U7ZA 5AIKA 2WMVA 5TT7A 4NFNA 4PY1A 3QWJA 4J95A 1BI8A 4I23A 3E8CA 2NPQA 4CYIA 4TNBA 3FMLA 5HBHA 4Q9SA 4RQVA 3SLSA 4UMUA 2X4ZA 2I0YA 4NJDA 5LVNA 4UZDA 3F5UA 3FMMA 4F6SA 5FDPA 4FZDB 4FICA 3DBDA 3P5KA 4D55A 3KN5A 4AOTA 5E8YA 4ACHA 4I92A 3VO3A 3BEGA 5JMSA 1L3RE 2XYUA 2WHBA 1H1PA 3DKGA 3UIBA 1OIRA 4BCQA 3LQ3A 4FIGA 2IVUA 4IVAA 2V0DA 3DXQA 5AP2A 3SQQA 3R71A 4RPVA 2C6TA 3OXTA 1Q8TA 4NM7A 3LKMA 2GSFA 1YDSE 3A7IA 4XBUA 4YUQA 3L8SA 3QALE 4ZJIA 1OIUA 3V04A 3AMBA 5C26A 5HE1A 1Q8ZA 2BR1A 2YIQA 3BCEA 3MGYA 3NX8A 3Q96A 4FV0A 4RZWA 4YJRA 5GNKA 2IVVA 3KVWA 4FV5A 2ZV8A 3A7JA 1V0OA 2IN6A 3HMOA 4MNEB 4V04A 4Z16A 5K4JA 4F99A 5JH6A 2GQSA 4Z7GA 3A60A 4WSYA 3DA6A 2UVZA 3C4CA 2ZOQA 3OP5A 4LQMA 2PUPA 5D7VA 5DT0A 3G2FA 4BCIA 3UZRA 5C4LA 2UVXA 2R3FA 2VX3A 4Y46A 3RTPA 3EOCA 4FL1A 4FV2A 3FLSA 2XNOA 4BRXA 4MBLA 2WTJA 3OXZA 5L8JA 3NVKI 2XB7A 5DHJA 4G2FA 2I40A 2VWWA 3RM6A 3ZLYA 2JAMA 4X3FB 2ETRA 5B2KA 4DEHA 1GZOA 5E8SA 4F7NA 3B8QA 5M09A 2XIYA 4O7YA 2CMWA 2GNHA 3R7OA 4GVJA 3BHTA 5M4UA 4RVKA 1LEWA 3TIYA 5HG5A 2FSTX 4FTKA 4FTOA 1E1VA 3MBLA 3EFKA 4EOQA 3E64A 3WF9A 3GOKA 2BALA 5B2MA 3S1HA 3JS2A 4DAWA 1V0PA 3ZO2A 5CU0A 3HVCA 4DGLC 2DWBA 3P7BA 1ZZLA 3QCSA 5EYCA 3DOGA 2NNWB 5ANOA 1U5RA 2YIRA 1H08A 3HZTA 3OW4A 4EK4A 4BTJA 4FA2A 4L46A 3TNWA 5CZIA 3UMWA 3ZZWA 3D83A 4NT4A 4FTLA 4PP9A 2B54A 3TACA 3OT3A 2C6LA 1VYWA 5JGBA 4BBMA 4BWPA 1EH4A 3VF9A 3QRKA 2QCSA 4G3DA 4IAKA 3FLZA 4YJPA 5FTOA 3ZHPC 5AM7A 4FSTA 5HCZA 4P2KA 5CNOA 2PVHA 5J1WA 1WVWA 4D4YA 5CI6A 4OTRA 3QUDA 1JBPE 3MH3A 4F7JA 4M15A 3VBTA 5IH6A 1CDKA 3BZ3A 5CF6A 2PE2A 1LP4A 3E92A 3SOAA 3CQUA 3UP7A 2XIXA 5HX8A 3QGYA 1W84A 2EB3A 1P5EA 4RGJA 5L2WA 4PTCA 2YAAA 4RX8A 4G31A 5J5SA 3F7WA 2H9VA 5I3OA 3IDBA 3G0EA 4XOZA 4RX9A 3VBQA 4K1BA 2PMIA 3GFWA 5LCJA 5AP0A 1FGIA 2C3KA 3PG3A 3TZ9A 4TY1A 4V01A 3QQJA 3R6XA 5TKDA 3D5XA 3QTIA 5KKRB 3EL8A 4XG2A 4XEYA 4TPTA 5ANDA 5EYDA 4O27B 2OZOA 4CVAA 4EBWA 4ZJJA 4AGWA 2VWVA 4NK9A 4FTMA 2R3KA 3VUHA 2B0QA 3QGWA 5J9LA 2VGOA 2CCHA 2VWUA 4JQEA 4JRNA 4ZP5A 4FNZA 3Q5IA 1GAGA 4D2SA 5KBRA 3R7GA 1DAWA 4QMTA 4DBXA 3GP0A 3QD3A 3BHYA 1YDTE 2OF2A 2WQMA 5DT4A 3KXGA 3VC4A 3NAYA 3FY2A 4FV8A 5B7VA 3LAUA 4Y73A 4JT3A 4FKUA 1AGWA 3RPOA 3PDTA 3FUPA 2R3JA 2REIA 4FF8A 3QQGA 4JRVA 4NW5A 3HECA 3QX2A 2HENA 4KSQA 4GU9A 3IW8A 4AOJA 3OF0A 4ITJA 2WTCA 3SV0A 2OSCA 2XNMA 3AMYA 4BGQA 5IA3A 4GYIA 1SVHA 2UZNA 3IDPA 3QRUA 5ACKA 4F9WA 4MX9A 1NW1A 4L9IA 3ZM4A 4G3EA 2XNGA 1YHWA 2IZRA 3E8DA 5CQUA 3B2WA 3LCOA 3E3PA 4XCUA 3DDPA 4QMVA 3JXWA 5GHVA 1PMVA 4I5PA 4XP2A 4BN1A 2BFXA 3ZFXA 2A4LA 4G1WA 3O7LB 4EK5A 1LPUA 1OKYA 2ACXA 2JDTA 3TV4A 5AIRA 3LHJA 3QRTA 4I3ZA 4UYAA 1GNGA 3HMMA 4JX3A 5CEIA 2GPHA 4XV1A 2UW0A 3BGZA 3VS6A 3GEQA 1ZLTA 3QD4A 4PL3A 5T6KA 3KULA 4RA4A 4B6LA 2A1AB 1ZMUA 4E6QA 1CMKE 3Q9YA 4DINA 5KHXA 4FG8A 3DGKA 5FM3A 5JRSA 4ZTHA 1JKLA 2XK6A 4FK6A 4M3QA 2YAKA 5L8LA 4IM0A 5EKOA 3TDWA 3LPBA 4M66A 2KULA 1PKGA 4N4SA 4WUAA 3P0MA 2BKZA 1M2PA 5KMKA 4QYHA 4FOBA 4TT7A 4LOOA 4OT5A 5ETFA 4GUBA 4FKVA 3I7CA 5HIBA 4HVGA 4H05A 2H34A 4RIOA 1YHVA 3CQEA 2F49A 2GQGA 4KKGA 2IW8A 5I9XA 5K4IA 3AC3A 2XBJA 3OTUA 2V7AA 4EEVA 1FGKA 4L3JA 3EQIA 3PJCA 3GOPA 3CTQA 3A4OX 4NU1A 2JGZA 3R83A 4BCGA 5EM6A 4GMYA 4CT2A 4Y83A 3I7BA 4RVLA 5L4QA 1XH7A 1R78A 4MD9E 2PE0A 2XK4A 3EQBA 3G6HA 5HU3A 2YDJA 1YWVA 4FKJA 4A9UA 1Q5KA 4B0GA 4APCA 2XJ0A 3NYOA 4PL5A 3MESA 3DLSA 1WVXA 5DLSA 1AD5A 1BMKA 4QP6A 3FL5A 4CFMA 3UG1A 4LL5A 3W33A 3FLQA 5IUGA 4FSNA 3DT1A 2VU3A 3JY9A 3ORLA 4YC6A 3LMHA 1WBPA 3DXPA 3F66A 3G51A 5I9VA 5J9ZA 1OKWA 3QHRA 1K2PA 3V8TA 2VNWA 3U9NA 3ZMMA 3W10A 4OAUC 3BYMA 1OIQA 1R0EA 5LVOA 4E20A 4DT8A 4O7SA 4O0TA 4GYGA 2CGXA 3WF7A 5LMKC 4XV3A 3QCYA 5D41A 3HL7A 2ZJWA 2CGWA 3EQGA 3FAAA 4EK8A 5IPJA 1JKKA 2WAJA 2XK9A 4BGGA 4D2WA 4BZDA 3QAME 4EOPA 1Q61A 3DNDA 1M17A 4R3PA 4YHJA 3NVMB 1Y6BA 2XRUA 4MYGA 2W9ZB 2UZOA 1XJDA 1ZOEA 3Q9WA 4BZOA 4KRCA 5I9UA 4D5KA 2C6EA 3EFLA 3L9LA 3SG9A 4MF0A 4DTAA 3KY2A 1YOLA 2ZVAA 1Y6AA 3KK9A 2C5VA 4FT0A 4DFUA 2Y4IB 5IA0A 4E4LA 5AP1A 3PE1A 2Y7JA 3PY0A 3QQHA 4ENYA 2HXQA 3PSBA 5AUUA 4WG4A 2OW3A 4ZLYA 2E9VA 3F3VA 4KAOA 3RINA 3D2KA 4YNEA 3Q32A 4F9BA 4GT4A 4BTMA 5IG1A 2IVSA 2ZV2A 4N6ZA 3TKHA 3PSDA 4IVBA 1Z9XA 2CPKE 4ID7A 5JZJA 2ONLA 4F70A 4DFZE 3R8MA 4X7QA 3UODA 3SG8A 3FZSA 3DK6A 2YHVA 3EYGA 1H1WA 2FO0A 5AAFA 2ITVA 4I4EA 3EKNA 3NAXA 4IAIA 4G3CA 3CP9A 1XH6A 4FKTA 4EH2A 5CNNA 4DCAA 4CMOA 4DA5A 5ETAA 3KULB 4WNPA 4CXAA 3UVPA 4F09A 4IX3A 1WCCA 3NR9A 4FZ7A 5A4EA 3MFRA 4A7CA 1ND4A 4XJ0A 3TN8A 3CY2A 2X6DA 5LWMA 3CPBA 3QXOA 5EW3A 2W1DA 1XH5A 5KMOA 2WOUA 2QODA 2R64A 5CF5A 2ZMCA 3PXZA 1SMHA 2UW3A 5JFWA 4R7HA 2HZNA 2W1EA 5CEKA 2OG8A 2RSVA 3MW1A 4C02A 2NO3A 2W1GA 1BKXA 3EH9A 5A4CA 2UW6A 4C0TA 4DEAA 2QKRA 1JKSA 3DKOA 4FV4A 3W2RA 3GXLA 4TYJA 3I0OA 5GZ9A 3UIXA 2QOBA 2ITOA 1A48A 2WU6A 4O96A 4KINA 4RWKA 3HYHA 1OMWA 1M52A 2R3RA 3SA0A 4PDOA 2XEYA 2X2MA 4KUJA 4K9YA 3ATTA 4G3FA 4NH1A 2YCFA 5CWZA 4DLJA 5LMBA 4MWIA 2YLFA 3VWAA 3V6RA 4BDFA 3R04A 2PZRA 1OPKA 3MVJA 1JNKA 4FYOA 3WZJA 4ACGA 2UZVA 1UNGA 2ZYBA 2WIHA 2G01A 3QTZA 4YSMA 3KRJA 4P7EA 4XG3A 3B8RA 3HRBA 4QP9A 4BB4A 4CFXA 5L6OA 3I4BA 3QA8A 5HTCA 3OY3A 5AAEA 2QHNA 4JQ7A 4EWHA 5HESA 4BKZA 4UWCA 3LFSA 2VUWA 4GT3A 1OB3A 4K11A 3ORMA 1HCLA 3UQGA 2GHGA 2UZEA 1XBCA 4F9CA 3GCQA 5L2TA 4BTFA 2OFUA 2YA9A 4TZRA 5EW9A 5TOZA 4J53A 3QLFA 4AA4A 3OCBA 2J0LA 2CHLA 1X8BA 1YWNA 4GK3A 4CKIA 3E8EA 4NSTA 5EI2A 3KXZA 4C38A 3QHWA 3D2IA 4HVIA 3Q2JA 4MF1A 4E5WA 2UW5A 4QOXA 2Z7SA 3EZRA 3Q3BA 1CSNA 2XNEA 4BCHA 3BU3A 3UJGA 5IISA 4K77A 3EQPA 5EM7A 3UPXA 4UN0C 5AEPA 3TUCA 5M57A 3R21A 3P7CA 4FVQA 4IAAA 3V8SA 4KA3A 1UNLA 3ALOA 4J8MA 4RJ6A 5L2QA 4D2PA 5G1XA 2BRGA 4EUTA 2WMUA 3ZUTA 5BVOA 4IVDA 4N6YA 3VUGA 2QU5A 2VTMA 3PJ2A 4RFZA 3P23A 4IAYA 3LLAA 2A27A 5IMEA 3ZSGA 1O6KA 2UZWE 2VO3A 1ZOHA 4EBVA 4FTAA 4G3GA 4YMJA 2ITUA 2VNYA 3BELA 1DM2A 1PMUA 3DZOA 2XNBA 3MPMA 4TTHB 3VF8A 2Y4PA 2IVTA 1Y91A 4QMXA 2YN8A 4ZY4A 4IAZA 5HCXA 1JSUA 3OT8A 3FC2A 4MXYA 5HIDA 5DN3A 4XNEA 4DH5A 2QQ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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