3AT3A

Crystal structure of ck2alpha with pyradine derivative
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A detailed thermodynamic profile of cyclopentyl and isopropyl derivatives binding to CK2 kinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 113
structure length 332
sequence length 332
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3at3A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3at3A02
4RWKA 2GS6A 4I6HA 4U9AA 1AGWA 2PVKA 4V01A 1XWSA 3BX5A 2WHBA 4EH4A 5AP5A 2XNBA 5F20A 2J0LA 4M97A 3RTPA 3BHTA 3MDYA 2VTNA 3H0YA 3DU8A 5IQCA 3MGYA 4NCTA 4O0WA 2VWVA 1WBWA 2HCKA 3G9NA 1A9UA 4O1OA 4YHTA 1FVRA 3KRJA 5FRIA 4QMZA 2OF4A 2VTLA 4QOXA 4D1ZA 5KKRB 5I3OA 3IO7A 3DAKA 3LZBA 4CRLA 3GOPA 4TNDA 4DG3E 4F9YA 4CV9A 5AEPA 1ZY4A 2SRCA 2OW3A 4S34A 3FSFA 4D2TA 2BZIB 5DHJA 2F7EE 3MIYA 5FWKK 4M69B 5CVGA 3B2TA 4I92A 2BCJA 4JDJA 2C5VA 2CKEA 4F4PA 2C3JA 3ORKA 3ZHPC 3CE3A 4C34A 3UVQA 3OCGA 4LGDA 3ENMA 5DFPA 4A06A 5EM8A 1BLXA 3DB6A 3KEXA 4IE9A 4S30A 3U9NA 3ZSHA 4AT3A 1CDKA 3FZRA 2A27A 4FTAA 2QLUA 5DEYA 3Q2MA 1Q8TA 3PXQA 3CSVA 4GL9A 3P7BA 4N4SA 1KE9A 2XIYA 3RK7A 5CU0A 3U6IA 4M15A 2W1ZA 3BGPA 4I4FA 4UXQA 3QYWA 4UV0A 4QNAA 5IDPA 4CGAA 3GB2A 4YSMA 2HW6A 4NW6A 3R8LA 4YJQA 1Q8WA 5KCVA 3ZS5A 3DK6A 3IW5A 4DITA 5M53A 3VAPA 3DBFA 2UZBA 3DNDA 4NFMA 3H3CA 5JFXA 3WI6A 4YJTA 3LFEA 5IISA 4RX9A 3QQFA 4ZTNA 1SZMA 4ALWA 5L2IA 3R7GA 4NTSA 4CFWA 4FIFA 4E7WA 4JT3A 4K18A 4DEGA 3LE6A 5IU2A 1S9IA 3E3PA 2J90A 3LXPA 2ETRA 2YN8A 2R3RA 2Z8CA 3UOKA 4LUEA 3VS6A 3R63A 2OXDA 4O2ZA 4O81A 3MYGA 3LXNA 2CJMA 3QTZA 4BCIA 2FA2A 1J7UA 3QZFA 4O6LA 4YPSA 4YR8A 4MAOA 4FEUA 4RA4A 2BAJA 3WYXA 3H9FA 5IEXA 1O9UA 4WNOA 4I20A 3O23A 4JG6A 4WRGA 2CNVA 5EI8A 3KK8A 5J9YA 4KRCA 3BELA 4EJ7A 4DEEA 4MKCA 3DXNA 3PSBA 4I24A 5IEYA 3HLLA 1XH9A 3QHWA 4HNIA 2HK5A 2RG5A 2XBAA 2ZV9A 3P0MA 4LUDA 5HTBA 2IW8A 5BVEA 1U5RA 3PJCA 4ZTHA 3HDMA 1WBNA 1YXTA 5KMLA 3ET7A 3L9PA 2BROA 3WZUA 3VS5A 4AZEA 1S9JA 2C6IA 4JI9A 3F69A 4FSNA 4NIFB 1JNKA 4BN1A 4Y73A 1GNGA 1IR3A 3HDNA 1H1RA 1ZARA 3G0FA 3QWJA 5IDNA 3FE3A 3O96A 4PMTA 4AAAA 4EZ3A 1SVGA 5H9BA 3U51A 3R8UA 2UZVA 4R7HA 1Q5KA 4CRSA 3PVWA 4G3CA 3M1SA 4EK3A 3TZ9A 5J87A 5CALA 3V8SA 2HOGA 4C38A 3WE8A 3LMHA 4FOBA 4DT8A 2XIKA 1ZLTA 3BHVA 3HKOA 3QQGA 5E8TA 4C62A 4FV0A 4FT7A 2J5FA 2ZB1A 4JQ8A 3OD6X 5HHWA 4PY1A 5B2KA 3ETAA 2FB8A 4CFMA 3RK5A 3JS2A 3QUDA 2X0GA 2O63A 2UVXA 2XEYA 3LFBA 3B8RA 4CKRA 2A19B 4GG7A 4I1ZA 3KMUA 2W4OA 4JLCA 1NY3A 4G6OA 3EB0A 5JGAA 1R1WA 5GZAA 1BKXA 2XRWA 3PP0A 1OUYA 3ORNA 3PXYA 4LV5A 1NT2A 4W8EA 2BUJA 4IAYA 4L45A 4UZHA 2WTDA 3Q5IA 4FIEA 3TM0A 2PVYA 3SG8A 4FT5A 4D55A 1WBSA 3EN7A 3EN9A 2VWIA 3FZPA 5CEIA 4YTIA 1V1KA 1FQ1B 4YUQA 3SXRA 5FEEA 4BGHA 5AP6A 4IAZA 2R0UA 4FV2A 3PWDA 4RJ5A 3ZSGA 3QA0A 2YITA 3MTLA 2Z7RA 4RVKA 3EN5A 3ACJA 3TKUA 3BQRA 2E9NA 3CD3A 4JDIA 4ZMEA 2F49A 3PTGA 4ID7A 4YBKA 5C8MA 5JH6A 5IF1A 2VAGA 5T6KA 4RWJA 3TDVA 4FV4A 4BI0A 4E1ZA 2H8HA 5BNJA 2B9IA 4LGHA 5DWRA 4B7TA 5J7HA 3ZFMA 1M2RA 4KAOA 2X6DA 3LXLA 3UZRA 3DZQA 3O0GA 1UNLA 1XBAA 2PE1A 5K9IA 5EYMA 4FK6A 4B0GA 4C3PA 2WTWA 3WARA 2YIXA 3PWYA 2XF0A 5HO6A 4CFUA 4IB1A 5KZIA 3ZXZA 4U7ZA 3PUPA 3UNKA 3PSDA 3MN3A 4OW8A 4BGQA 2W4KA 2CCIA 5BUJA 3QC4A 2P3GX 4ZTQA 4B8MA 4ASXA 4BZOA 1H00A 2QC6A 3UIBA 3BPRA 1UNGA 4WHZA 2W0JA 2R3PA 1DM2A 1Q41A 3SX9A 3L9MA 3Q4CA 3MVMA 3QTRA 4BDKA 4H1JA 4F9AA 5I9YA 4DTAA 5GIPE 3PDTA 1H26A 3GUBA 3PJ2A 5AX9A 3TT0A 3PIYA 4BIDA 4Q9ZA 3EN4A 4FSRA 4JG8A 4M0YA 3F5PA 4LFIA 4OLIA 4YJVA 3F6XA 3ANRA 3FL4A 4PPBA 4EOOA 4JNWA 4XP0A 4Z7GA 2GHLA 2XK8A 2IVSA 3A7GA 4QMMA 1IA9A 4KS7A 5GJDA 4WSQA 1KUTA 4ZS0A 5J8IA 5AM6A 2X2KA 3KXNA 3A99A 3FMKA 4RIWA 3AT2A 4QMXA 4RBLA 1XH6A 2WMQA 3OZ6A 4OT6A 3D7TA 5E8YA 2RIOA 3ZH8A 3NMUF 5JGDA 4H36A 1ZRZA 4XMOA 4L53A 5TT7A 5FTQA 4ACDA 4EBVA 4EHZA 3EFJA 3NR9A 1R0PA 4C37A 2W9ZB 3PJ8A 3BLQA 5E8WA 2PY3A 4BDAA 1PW2A 2RL5A 3NYNA 5I0BA 4P5QA 3MIAA 3G51A 4HPUE 3T3VA 1DAYA 3EL8A 4NU1A 2YZAA 4G31A 3C51A 4NW5A 5HE2A 5EI2A 3EQCA 4BL1A 4OR5A 3AMAA 4IFCA 2HZ4A 3O8UA 3VBWA 3FDNA 3ZO3A 3REPA 2GNHA 2OBJA 3OUNB 1ZYSA 3Q04A 4CTCA 3EQDA 2VTRA 4JQEA 2BMCA 3LFNA 3MH1A 4OTRA 4EYJA 5D11A 4ALVA 3KCKA 2BRNA 2CHLA 3TG1A 2BZKB 1OKYA 4MBIA 4ZSEA 3UNJA 2GSFA 1APME 3KF4A 5EW9A 5HNBA 3HZTA 5M4UA 1DI9A 4MX9A 3F3VA 2ZM4A 4QP8A 4XOYA 2BALA 4PV0A 2ACXA 2XKEA 3OCBA 4KD1A 1PMVA 3L9NA 4NJ3A 3F2RA 3DAEA 2WTIA 2R5TA 4G3GA 4KIQA 4DH1A 2JAMA 2PVLA 4EH9A 4ZY5A 2YLEA 3CC6A 2XCHA 3PRIA 4U97A 4AW0A 3EYGA 4GRBA 4IVBA 4QPAA 4O7LA 4G2FA 5GINE 1OGUA 3CJGA 3GP0A 3PXKA 4JBVA 5D10A 3BU3A 3ZYAA 3ZC6A 4MD9E 3ZCLA 3I81A 4BCMA 2C6MA 1OL1A 4J96A 5KE0A 2OXYA 4FKRA 4D2RA 2PK9A 4DG0E 3LAUA 2OFUA 5FM2A 1W0XC 3FLYA 2F9GA 4M3QA 5HO7A 4FGBA 4IWPA 3RAWA 4CV8A 4LL0A 3I5ZA 3RBWA 4Y85A 3VF8A 2Y4IB 1K9AA 3FLNC 2QKRA 2QONA 4R7IA 4U45A 4F1TA 3QX2A 3TJCA 2RKUA 3PLSA 2YJSA 3DTWA 2XJ2A 2RG6A 3CGOA 2W96B 3AC2A 4IWOA 4QPSA 4BIEA 4IAAA 1PXPA 4XP2A 2H96A 3JY0A 3V3VA 3R22A 4J53A 4BIBA 3COHA 5CSPA 2BDWA 2C68A 2GNJA 2J5EA 2UZDA 2VTQA 2X4ZA 1EH4A 1UKIA 3JVSA 4LMNA 4AXAA 5IEVA 5E8VA 1R39A 2WEIA 3FLSA 2WQOA 4FL3A 4RQKA 3SQQA 5LMKA 3PPZA 3K3IA 2YZLA 3IW7A 3OROA 4OAUC 4IMYA 4EOJA 5L8KA 4FSUA 3IGOA 2YDIA 3FYJX 3P5KA 5IA1A 4L9IA 5HCYA 2R3GA 4L42A 3UGCA 4M67A 3UO4A 4EH7A 2C5NA 5CEMA 4JIAA 1H27A 1SNUA 1IRKA 3DDPA 4KRDA 5JKGA 4FEXA 2XRUA 4QP1A 5HORA 4X0MA 4UZDA 4AGUA 4E8AA 4GUEA 2NNWB 3MS9A 2WOTA 4FBXA 4R8QA 3VS3A 3MPAA 3UG2A 3E92A 3E88A 4H3QA 3NLBA 2Z7LA 2EVAA 3ORXA 4I4EA 2JBOA 4BTKA 3HX4A 2R4BA 4R3RA 5HE0A 2YFXA 1J7LA 4HVSA 3LJ1A 5HD4A 5CAQA 3OWLA 3ANQA 3O2MA 2ITXA 3UNZA 2YIQA 3R71A 4FV9A 4FVRA 3BKBA 4KIKA 3ZONA 2X7GA 4I5HA 4BBFA 4MXCA 3ZRKA 4YZCA 5K4JA 4N6YA 2QODA 2QHNA 2V22A 5KHXA 2WQBA 1LEZA 3VS1A 2C6OA 4ANNA 5DT4A 3P78A 3PFQA 3V8TA 5F4NA 2ERZE 4PP7A 3VBQA 1ATPE 4G16A 1IASA 3E7OA 4I5PA 2GDOA 4G6NA 5LVPA 1FPUA 1JQHA 3GGFA 3QQLA 2JIIA 1R78A 4E6QA 1K2PA 2R7BA 3C4FA 3EL7A 1OIUA 1WBOA 4QTCA 3CBLA 1XH4A 5EI6A 4DGGA 4WO5A 2QOCA 2XS0A 2W1FA 3QD2B 3OOMA 3RAKA 4UWBA 2GFSA 2IZTA 2J0JA 4GEOA 4W4YA 3WZKA 5GZ9A 1Z57A 4IX6A 2PSQA 3OT8A 5IQDA 4NKSA 2PVNA 4KKHA 2CCHA 2IN6A 3TACA 5M51A 3G6GA 3Q32A 4ARKA 2YDKA 1MRVA 3MVHA 3PLAE 4YJOA 4TT7A 4AGDA 3ZFXA 3A7FA 4Y46A 5FD2A 1GZNA 2RFEA 5JRQA 3FZSA 4FK3A 5IA2A 3CCNA 4LRKA 4CNHA 1YWRA 2EB3A 4RJ8A 2XIXA 2HWOA 3QRJA 2R3FA 4BKZA 4BDCA 4K0YA 4MD8E 1U54A 4RVMA 5L2SA 2V62A 4JIKA 4D5HA 4DCAA 4MQ1A 4HYSA 1PXLA 3I4BA 2ITWA 3MPMA 4KBKA 4PTGA 4YJPA 3A7HA 5HEZA 4ENYA 1OVEA 3ZRLA 4O22A 3HVCA 3DFAA 4K8AA 1OI9A 3MJ1A 2XVDA 5CF6A 3R00A 3OY1A 3FI8A 2Z7SA 4GFGA 3WF9A 1OKWA 2XK6A 3O71A 4D2PA 2GHGA 3TJDA 2P4IA 3LOKA 4AW2A 3OUKA 2JFMA 4JX7A 4QP4A 4F65A 2HIWA 4IZYA 5KKRC 3QRKA 4TTHB 4DT9A 4CG8A 1YOLA 2VZ6A 2VNYA 3EQIA 4IVCA 4BWKA 4HYUA 4J52A 5J1WA 2YM7A 4HNFA 3Q9XA 2BDJA 2F4JA 4LGGA 5CSHA 1Y6BA 2PMLX 3IKAA 3U8WA 2OLCA 4FKLA 4WBBB 3R7EA 2HAKA 3TNIA 3ALOA 4DEHA 2Y0AA 1Y6AA 2OG8A 3CLYA 3MFUA 5D7VA 3MESA 3S00A 3Q53A 2X8DA 3W55A 5J95A 5CF4A 2GPHA 4RMZA 4AWIA 5HNIX 4N0SA 1IA8A 3KRWA 5B2LA 3ZSIA 4QQTA 1H01A 2UW5A 2RFSA 3ZZWA 2OWBA 4FKWA 4FIIA 5AR7A 4O0XA 4BDEA 2CN5A 1RQQA 2VRXA 3KRXA 2NRYA 5AIRA 4LL5A 2EXCX 4BDIA 4A9RA 4BTJA 4NL0A 3LFFA 5JGBA 4XEYA 5ICPA 4M66A 4MXZA 4I0SA 3R2YA 5BUEA 1OBGA 3LM5A 3D5WA 3FC2A 4FEWA 1NA7A 4ACHA 1ZY5A 3EKKA 4FNWA 2UZLA 5AM7A 5IQFA 3OW4A 4TZRA 5HESA 5CEQA 1ZOGA 3VVHA 3KXGA 3RK9A 5CZIA 2J2IB 4QMOA 2PL0A 2VX1A 2J6MA 2P55A 4PPCA 4E6DA 2CGVA 5ANJA 3WF7A 2OJJA 2C5XA 3HRBA 4IZ5A 4C4FA 5A3XA 2XEZA 2XK9A 3H9RA 3RINA 2W1CA 4G5PA 3RAIA 2YCRA 1OPLA 3E62A 3BHYA 5AR3A 3II5A 1UWHA 3LIJA 4QYHA 2PVRA 5D7AA 3Q4UA 4PWNA 4AT5A 3K5VA 3AGLA 5CAOA 4FKGA 2ETMA 3VS4A 1TQPA 4C7TA 2BKZA 3BRBA 4X7QA 3R1NA 4FKVA 5DE2A 3FMHA 4C0TA 4CMUA 3VS2A 2ZYBA 5CI7A 4U6RA 1PY5A 5DA3A 2ZVAA 2WMUA 4HJOA 4NM3A 3V04A 3R0TA 4FF8A 4ANMA 5CAUA 3JXWA 4GYGA 2A1AB 4XHKB 3VBVA 5BVWA 5HIEA 4H1MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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