3BRBA

Crystal structure of catalytic domain of the proto-oncogene tyrosine-protein kinase mer in complex with adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
287
structure length
260
Chain Sequence
NKLEDVVIDRNLLILGKILGEEFGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGLSMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural insights into the inhibited states of the Mer receptor tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase MER
total genus 83
structure length 260
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3brbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3brbA01
3CQEA 4U44A 4FUYA 3C5IA 2ITZA 3RCJA 4IM2A 3QKMA 1OL1A 5GINE 3OCBA 4TNDA 3V5WA 2RL5A 3GOKA 5EQPA 1CM8A 3DQXA 2VWIA 4PDSA 3QLFA 4WG3A 4BCNA 3CXWA 4RZVA 1WMKA 4QTDA 2XIYA 4LMNA 5AM6A 4U0IA 4P7EA 5JFWA 2ZV2A 4RX7A 3T3UA 3V5TA 3W33A 3QCQA 3IG7A 5M09A 4DC2A 2PE2A 3OS3A 4K6ZA 1WAKA 2CNVA 3A4PA 3UNJA 2XJ0A 4YZMA 4EZ5A 1PYXA 4FTRA 2VTAA 2FO0A 4MH7A 5CT7A 3R7EA 4RIYB 4DGMA 4K0YA 4F0FA 1DS5A 4I6FA 5IQBA 1MP8A 4AOJA 2ITXA 3ORKA 2ESMA 4IWPA 4B8LA 5A4TA 1XBBA 2PUNA 4PUZA 4WD5A 1K3AA 4IFCA 3SX9A 4A7CA 5AAEA 4R6VA 2A27A 3V6RA 4K33A 4EH8A 5BNJA 5K0XA 1B38A 3ZO2A 3BU6A 1ZOHA 3ZZEA 2AYPA 3SRVB 4B99A 3ZZWA 3SG9A 4TWPA 5AR4A 4CNHA 2WELA 3A4OX 3FMKA 3AT2A 4R77A 4QPMA 5I9YA 3KCKA 3T3VA 3VWAA 4QYHA 2V5QA 4YBKA 3ZUVA 3BE9A 3MVHA 1XH8A 2PY3A 3PFQA 3ERKA 4FF8A 4FSYA 4YHFA 3TWJA 4F1OA 4EHEA 3UO6A 5JSMA 3VVHA 5EM7A 1UU8A 4GVAA 3BQCA 4RA5A 5HLNA 3ELJA 4XRJA 1Z57A 2UW4A 4LRJA 1CSNA 5BYYA 4LFIA 5EK7A 3U6JA 1PMNA 5AUVA 5FRIA 3TZ7A 3F66A 1XH7A 2BAQA 4HCVA 5IISA 5E8ZA 3UIMA 4I92A 1XHAA 2C5XA 3HP2A 1H27A 3GP0A 3BHYA 3AC1A 3FQHA 4OTIA 1K2PA 3DK6A 4ONAA 4X0MA 3QU0A 3TNWA 3OTVA 4F6WA 3P23A 3H0YA 4PTCA 3IO7A 4ZTMA 2OXYA 3W8QA 4O91A 3AD6A 3IDBA 4JX3A 4UBAA 4FV8A 3VW8A 4DT9A 4ENXA 4JBOA 2YJRA 3TACA 4E6AA 3ORPA 3MYGA 3QWJA 1OBGA 2W4OA 4MBIA 4Y46A 4CTCA 4O82A 3ZLSA 5C4KA 4O38A 2OWBA 4Q9SA 3BEGA 1YDSE 4KIKB 5KMIA 4XOYA 2ZMCA 4B0GA 5BVWA 1IA8A 1P2AA 3QFVA 4XG4A 1PJKA 4G6NA 3A2CA 4FMQA 2QKWB 4QYGA 2IW9A 4DEBA 3ALNA 4DEDA 2PZIA 3E87A 5H8EA 3QC9A 2BAJA 2R3LA 3DZQA 5EHOA 3E7VA 2C6EA 3RMFA 3WF8A 5L6OA 4W8EA 1UNLA 4R3PA 5IA0A 2SRCA 2Z2WA 3P78A 1H01A 5EKNA 5HG7A 2ZAZA 4L6QA 2PMIA 3QBNA 4JX7A 4DCAA 4J95A 4EL9A 4Q5EA 3FZPA 4G3CA 3Q6UA 4TYJA 4OTRA 1YI4A 2JDRA 3F5XA 4KIQA 1JSTA 1JLUE 4LV5A 5J87A 4ACGA 2ONLC 3FLYA 3DNEA 1Q8WA 4WOVA 3Q5ZA 5L6WL 4APCA 4CYJA 4KKGA 3GC0A 3QGYA 4YP8A 5EFQA 3ZBFA 3IONA 4NU1A 3LFEA 3KULA 2C5OA 4QMLA 4WSYA 3RPVA 3G0EA 2GNLA 3CIKA 2C0OA 4Q5HA 4P5ZA 3ROCA 4BDJA 5LVMA 4XHKB 3CGOA 5DRBA 2BFXA 5ANOA 5ACBC 4MNFA 3DB6A 5K0KA 3SXRA 4D2PA 4RC3A 4UV0A 3BHVA 4ZTQA 1MUOA 1MRYA 3QD2B 5A14A 3W8LA 1WBWA 1VR2A 2YACA 4M0ZA 2YM7A 5FWKK 4S34A 1BLXA 3NUSA 2JIVA 2PVJA 3BBWA 4GV1A 3RALA 1FGKA 3ATTA 3D7TA 3R6XA 2J51A 5HQ0A 3AMAA 3KEXA 3KL8A 3VRYA 4ZTLA 3ZM9A 1URCA 3NLBA 3RAKA 4DTAA 4BIEA 1WBSA 3L9PA 3EFJA 4JG8A 4C58A 1ERKA 3UQFA 4QQCA 2W06A 3DY7A 2IN6A 2OIQA 2E9VA 5CQUA 3ZMMA 4TRLA 3FKOA 5DEWA 3B8RA 3BGQA 4YGAA 4DCEA 4FKVA 2QONA 4FIEA 1H08A 5KMNA 1YWRA 2IZSA 5CSVA 3GU4A 4IX5A 1Q8ZA 4QMQA 2PULA 3OCGA 2G9XA 3ZRLA 5LVOA 2G2HA 4A9TA 3QYWA 2QODA 3KC3A 3QUDA 1A9UA 4QTBA 1YWNA 2O64A 4L67A 2PMNX 2PYWA 3OD6X 2B7AA 3DKCA 4M12A 5HEZA 5BVEA 5AAFA 4C02A 4UX9A 3HUCA 4XJ0A 4ACMA 5ANJA 2W0JA 4FV6A 5DG5A 4AGWA 3DXNA 4AW1A 4BDIA 4G3GA 3C4CA 1G3NA 4EH6A 3TTIA 1ZYLA 4FSZA 3PVUA 4LOQA 5HLPA 4TT7A 1U59A 5CZHA 2IW8A 4H36A 4BICA 5C8NA 3C0IA 3R28A 3I81A 4O0RA 3WE4A 4MCVA 1ZYDA 3MPMA 4UMPA 4HJOA 2CSNA 4RX5A 4CZUA 4U7ZA 5IUHA 4MD9E 3IW8A 3OWPA 1BMKA 4GVJA 3MV5A 4XV9A 4O2PA 2QG5A 5HZNA 5KE0A 4BL1A 3QQUA 2X8DA 3QD3A 4QP7A 2ZV8A 4M67A 5CF6A 3NVMB 5M51A 3QTQA 3HAMA 2J7TA 2X0GA 1XQZA 3DJ6A 1J3HA 1K9AA 5FEEA 2WU7A 3THBA 4DEIA 5IEYA 4CD0A 3R8MA 5E7RA 1KWPA 2JDVA 5LVPA 3WZKA 3MVMA 1A06A 3MFUA 3MVJA 1W7HA 1RQQA 3KF7A 2ZDTA 3PLSA 4YJNA 3NNWA 5IQIA 3HZTA 3MIAA 5I5ZA 3ACKA 5IZFA 4AP7A 3AG9A 5E8VA 4AZWA 4X2FA 4JQ7A 5BVFA 5M4IA 4XNEA 2WD1A 3KXZA 3TNHA 4ZZNA 3PSDA 3JVSA 5JRQA 4V04A 2EXCX 3SHEA 2J0KA 1FINA 2NP8A 3F7ZA 2VZ6A 3ALOA 4YSMA 3MW1A 4O7LA 2WZJA 3AMYA 4O0VA 5E8TA 5ANDA 5EYKA 2VO3A 1JBPE 5F94A 1JKSA 3E8CA 4S31A 3ITZA 2JAVA 3R2YA 4BIDA 2I0YA 3GT8A 2YIYA 5EDQA 4EKKA 4X6QC 2XM9A 2CJMA 3HUBA 3IOPA 3CTQA 4U42A 4RIXB 4GJ3A 5HIDA 4BWXA 2C6IA 4P90A 5AWMA 1H00A 2GNHA 2WKMA 2YISA 3PXYA 3IOKA 4JQEA 4I5CA 4UXLA 3DNDA 4G2FA 3ZSHA 3R7GA 3PWYA 1PXOA 2EUFB 4A07A 5C1QB 5M4FA 2OLCA 4R7HA 5CI6A 2DYLA 4XG2A 2VWUA 4XEYA 3VUDA 3DTCA 4OT6A 4FK3A 4FK6A 5BUIA 3JY0A 2QLQA 5D11A 4CFXA 3CR0A 5LJJA 2HZNA 3OXIA 1PXMA 3R7YA 5CU2A 5FDPA 3EKNA 1JKLA 5BUJA 4RRVA 4XV2A 3OUNB 1CDKA 1U54A 1OUYA 3LJ1A 3DU8A 3G33A 5DFPA 3HMPA 3ULIA 2CLQA 3MGYA 5J1VA 5J9LA 1P5EA 3QRJA 4FG8A 4IX4A 3FWQA 4GG7A 4GUEA 3ZONA 3ZBXA 5I9VA 3S95A 5FEQA 4EHGA 3G5DA 1PXNA 3L8SA 4PPCA 5AR2A 3QTUA 4IDTA 4UYNA 4ANQA 4U97A 3HV4A 2BRNA 2X6DA 2YLEA 3O7LB 4L53A 5L8LA 2I0EA 2VTIA 2XNEA 1PY5A 4FVQA 4K2RA 3PJCA 1O6LA 4WA9A 3I4BA 5AV2A 2JBOA 5GJFA 4ZLZA 5IA1A 3TDWA 3DJ5A 3FYJX 1U46A 3RZBA 5CAPA 4EH4A 1UA2A 3OW4A 3RZFA 4A06A 4G5PA 4YUQA 3QZHA 5M53A 3R7VA 4D4RA 1KOAA 2WEIA 4ZIMA 3NNXA 3S4QA 3AD5A 2WEVA 4OBPA 4AOIA 4RLLA 5HG5A 4BKZA 3NUXA 3GENA 4QMSA 3CC6A 3R21A 2F7EE 2P3GX 2WMAA 2WQNA 4GFMA 1H0WA 1Q3WA 2QU6A 2Y4PA 4PV0A 5DR9A 3PVGA 4FIHA 4FZDB 4Y5HA 4EWQA 3ENMA 4F99A 5HE0A 2CCHA 2JAMA 4ACHA 2B4SB 1KV1A 3MH3A 4CFNA 4KS7A 4R3CA 2G01A 3GOPA 1PMVA 5G6VA 2GS7A 1WVXA 4O7RA 2CGWA 3MB6A 4AT3A 3SW7A 2QVSE 3LLAA 2J50A 2I0VA 4HNIA 4ZTRA 1YVJA 4DEGA 3DA6A 4RIOA 2OFVA 3IGOA 2VTSA 3M42A 1Y6BA 3MI9A 3LZBA 3DV3A 4XG7A 2BPMA 4MTAA 4FEWA 3SXFA 3GI3A 4JXFA 5FEDA 5IQFA 3GFWA 3BV3A 4O84A 4ALUA 4DFUA 2F9GA 4FGBA 4E73A 4EHVA 3POOA 3FSKA 3ENHA 3MJ2A 4BWPA 1ZWSA 3KRJA 1Y8YA 5HNBA 4YZ9A 3EMGA 5HO7A 3DFCB 3BGPA 2YABA 4RIWB 5E1SA 4AX8A 4CFUA 4NL0A 1SNXA 5FXRA 4AA0A 2XNGA 4OW8A 2XB7A 4NTSA 5AUZA 5G1XA 1IASA 3NUNA 2Z7LA 3WOWA 3HA8A 5KHXA 4CG8A 5AP1A 4XRLA 2C4GA 5CQWA 3LMGA 4NW6A 2OFUA 1ZYCA 3VBQA 1XO2B 1LUFA 5ETFA 4EI4A 3RHXA 2P0CA 4YZBA 4ERKA 5KX8A 3LQ3A 3DJ7A 4YC6A 4EOQA 4R8QA 4FTCA 4DYMA 2AC5A 4IHPA 5IUIA 4AGDA 5J79A 4HNFA 5CVGA 3WI6A 4WRSA 2RG5A 2WO6A 3RAWA 1PXKA 5AM7A 5M07A 1GIIA 4AW5A 2R3NA 4RQVA 3B2WA 3ORXA 5IF1A 4GUBA 5HVYA 4R7BA 4LL5A 4YZCA 5CSXA 4X7QA 4EBWA 5JH6A 4OUCA 5E8YA 2PVRA 3WILA 4H1JA 4JR3A 2NO3A 4DG0E 4NH1A 1OPKA 2C6MA 5DT4A 4XV1A 5IU2A 3ZOSA 3LFNA 2C47A 4IAFA 4I6HA 3Q52A 1OL7A 3DXQA 3FJQE 3FXXA 3F3TA 4AXAA 3VN9A 1ZZ2A 2VX3A 3LQ5A 5GZAA 3WARA 5I3RA 5KMLA 3SKCA 4FSWA 2XCKA 3DT1A 2PU8A 5ANKA 4HCUA 4GIIA 3KY2A 4F65A 3GQLA 3UQCA 1PMUA 2W5HA 3QTXA 2IG7A 3V01A 3FL4A 4DINA 2JC6A 4L3JA 1Q3DA 3MWUA 5FM3A 4BBMA 5L2SA 3ULZA 4ERWA 4HOKA 3OT8A 2RFDA 4BTJA 1H07A 5H3QA 4ASXA 4FZ6A 3G0FA 3GUBA 4NK9A 4B9DA 3DLSA 5IDPA 4M97A 1UNGA 3O17A 3CD3A 4OTHA 3GC8A 4I20A 3DLZA 2VRXA 3EZRA 5BYZA 4E5AX 2BMCA 1O6YA 4LYNA 2ITYA 3DB8A 1WFCA 3CLYA 3KK8A 1NVQA 3F88A 4ITJA 4PF4A 4WT6A 4DH3A 4D9TA 3NUUA 4E3CA 4KINA 4FOBA 4NJDA 4ITHA 5LWMA 4YLKA 2YCQA 5KMJA 3V5QA 4Y85A 2R5TA 2RGPA 3TN8A 3QA8A 5JGBA 3C0GA 3JR1A 3UBDA 5CU0A 4CCBA 1MRUA 2VWYA 3O51A 2YCFA 4DAWA 3U6IA 2XJ1A 3ZSIA 5EDPA 2UV2A 4UB7A 4YJSA 5LVLA 4OAVB 2X9FA 3ZO4A 4CRLA 5KUPA 2GTNA 4H3QA 4IADA 4ZSLA 1CKPA 2HXLA 1PRYA 3HV6A 4Z3VA 3VBWA 3NX8A 2R2PA 3HMOA 3QKLA 3COKA 3BLQA 5M57A 2R9SA 4TL0A 2W7XA 2R3MA 3CS9A 4IZ7A 4QYYA 3N4VA 4RPVA 3C4ZA 3QHRA 4RWKA 4IZAA 5HE2A 4KKEA 3WYYA 4CMUA 2QU5A 3CQWA 2DS1A 2WTWA 3UTOA 3ZRKA 3V5PA 4GRBA 3R9RA 2ZV7A 4G3FA 3C4XA 3Q9YA 4E6CA 1Z5MA 3ZSGA 3SG8A 2HZ4A 3D5UA 4QRCA 4X6RA 4AT4A 5DEYA 2R3OA 4MEDA 3HGKA 1CMKE 3UODA 3F5GA 3P1AA 4E26A 1UV5A 5HVJA 5IA2A 2BZIB 2UZEA 5CAVA 2WQBA 3P86A 4NWMA 5K3YA 3R7UA 4RJ8A 5CEMA 3BKBA 4I6BA 5A9UA 2GNJA 3KULB 4JVGA 1L8TA 2ETMA 3FI2A 5K9IA 1OIRA 4QPSA 1JPAA 4Z16A 2RFEA 2P2HA 4IX6A 2O5KA 3RGFA 1Q4LA 1SVHA 5F95A 5C27A 2I7QA 2Q0BA 4GL9A 5T6KA 3RP9A 1GZOA 1YDTE 2JFMA 4F9CA 1ATPE 3MY0A 4O7WA 3LFAA 5E91A 5AR5A 1GJOA 3O8TA 5AUYA 3UPZA 2UW8A 3WF6A 5D9HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CQE A;  4U44 A;  4FUY A;  3C5I A;  2ITZ A;  3RCJ A;  4IM2 A;  3QKM A;  1OL1 A;  5GIN E;  3OCB A;  4TND A;  3V5W A;  2RL5 A;  3GOK A;  5EQP A;  1CM8 A;  3DQX A;  2VWI A;  4PDS A;  3QLF A;  4WG3 A;  4BCN A;  3CXW A;  4RZV A;  1WMK A;  4QTD A;  2XIY A;  4LMN A;  5AM6 A;  4U0I A;  4P7E A;  5JFW A;  2ZV2 A;  4RX7 A;  3T3U A;  3V5T A;  3W33 A;  3QCQ A;  3IG7 A;  5M09 A;  4DC2 A;  2PE2 A;  3OS3 A;  4K6Z A;  1WAK A;  2CNV A;  3A4P A;  3UNJ A;  2XJ0 A;  4YZM A;  4EZ5 A;  1PYX A;  4FTR A;  2VTA A;  2FO0 A;  4MH7 A;  5CT7 A;  3R7E A;  4RIY B;  4DGM A;  4K0Y A;  4F0F A;  1DS5 A;  4I6F A;  5IQB A;  1MP8 A;  4AOJ A;  2ITX A;  3ORK A;  2ESM A;  4IWP A;  4B8L A;  5A4T A;  1XBB A;  3AKL A;  2PUN A;  4PUZ A;  4WD5 A;  1K3A A;  4IFC A;  3SX9 A;  4A7C A;  5AAE A;  4R6V A;  2A27 A;  3V6R A;  4K33 A;  4EH8 A;  5BNJ A;  5K0X A;  3UDS A;  1B38 A;  3ZO2 A;  3BU6 A;  1ZOH A;  3ZZE A;  2AYP A;  3SRV B;  4B99 A;  3ZZW A;  3SG9 A;  4TWP A;  5AR4 A;  4CNH A;  2WEL A;  3A4O X;  3FMK A;  3AT2 A;  4R77 A;  4QPM A;  5I9Y A;  3KCK A;  3T3V A;  3VWA A;  4QYH A;  2V5Q A;  4YBK A;  3ZUV A;  3BE9 A;  3MVH A;  1XH8 A;  2PY3 A;  3PFQ A;  3ERK A;  4FF8 A;  4FSY A;  4YHF A;  3TWJ A;  4F1O A;  4EHE A;  3UO6 A;  5JSM A;  3VVH A;  5EM7 A;  1UU8 A;  4GVA A;  3BQC A;  4RA5 A;  5HLN A;  3ELJ A;  4XRJ A;  1Z57 A;  2UW4 A;  4LRJ A;  1CSN A;  5BYY A;  4LFI A;  5EK7 A;  3U6J A;  1PMN A;  5AUV A;  5FRI A;  3TZ7 A;  3F66 A;  1XH7 A;  2BAQ A;  4HCV A;  5IIS A;  5E8Z A;  3UIM A;  4I92 A;  1XHA A;  2C5X A;  3HP2 A;  1H27 A;  3GP0 A;  3BHY A;  3AC1 A;  3FQH A;  4OTI A;  1K2P A;  3DK6 A;  4ONA A;  4X0M A;  3QU0 A;  3TNW A;  3OTV A;  4F6W A;  3P23 A;  3H0Y A;  4PTC A;  3IO7 A;  4ZTM A;  2OXY A;  3W8Q A;  4O91 A;  3AD6 A;  3IDB A;  4JX3 A;  4UBA A;  4FV8 A;  3VW8 A;  4DT9 A;  4ENX A;  4JBO A;  2YJR A;  3TAC A;  4E6A A;  3ORP A;  3MYG A;  3QWJ A;  1OBG A;  2W4O A;  4MBI A;  4Y46 A;  4CTC A;  4O82 A;  3ZLS A;  5C4K A;  4O38 A;  2OWB A;  4Q9S A;  3BEG A;  1YDS E;  4KIK B;  5KMI A;  4XOY A;  2ZMC A;  4B0G A;  4QEB A;  5BVW A;  1IA8 A;  1P2A A; 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