3C4CA

B-raf kinase in complex with plx4720
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
275
structure length
258
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGSGSILWMAPEVIRMQDSNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELARELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of a selective inhibitor of oncogenic B-Raf kinase with potent antimelanoma activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords B-Raf proto-oncogene serine/threonine-protein kinase
total genus 61
structure length 258
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3c4cA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3c4cA01
3EFKA 3UJGA 4F1TA 3OW4A 2J4ZA 4L3PA 4TL0A 2Z7LA 4FKSA 5F1ZA 4XBRA 5IQHA 3G0FA 3PIYA 4RIYB 4I1ZA 5FUTA 4QNYA 4KUJA 3R01A 4OBPA 5BVOA 4A4XA 4GH2A 5J5TA 3EL8A 4PP7A 5KMOA 3GU8A 5KNJA 4YZDA 3TKIA 3L8PA 4DH3A 4FEVA 4C2VA 3OXTA 4EZ3A 2R3FA 5BUEA 4OT6A 3KRRA 2PTKA 2ZOQA 3E7VA 5HLNA 3ZMMA 3EHAA 4G1WA 2C5VA 3P7CA 3Q2MA 2R3JA 2V62A 3R71A 4TTHB 4Q9ZA 1KOAA 1KWPA 3IQ7A 3ITZA 3PPZA 2WFYA 3V5JA 1URWA 4NM5A 3ZTXA 3HV4A 4JDIA 3ZUTA 4F1OA 5A54A 3DB6A 2R3GA 5IEVA 1HCLA 2ITQA 3QU0A 5AFVA 4J98A 1BLXA 4X6RA 4IX4A 3UODA 2VGPA 5FRIA 4CNHA 4M97A 5AR7A 2OW3A 5IEXA 3GT8A 4G5JA 2WOUA 3B2WA 4PV0A 2YCRA 3NNUA 3FKNA 3FLWA 2VTIA 1XR1A 3BHVA 3WZJA 3E3BX 3S3IA 3W2OA 4BDIA 5EYMA 3NNWA 3GCUA 4ANBA 2JKMA 3KB7A 1F0QA 4QMMA 3PVBA 3PXFA 3ZU7A 2CNQA 2PPQA 3WZEA 2ACXA 3BV2A 3FC1X 4UWYA 4APPA 3MJ2A 3KN6A 4UWBA 5G1XA 4LUDA 1IEPA 3D9VA 4FSYA 4II5A 3GP0A 3WIGA 4CZYB 4ZLZA 3GI3A 3A61A 3MVHA 1VYWA 5CLPA 2A0CX 5A4EA 1U46A 2UUEA 3O71A 5DE2A 2IO6A 2WQMA 2CKEA 3C50A 5LWNA 3V6SA 2PE2A 3MFTA 4AGUA 3LCTA 4QMPA 3W2PA 3PSDA 3KRWA 5BVNA 4D0XA 3I5NA 4JVGA 4ALVA 4F99A 4FV4A 2E2BA 2GFSA 4PDSA 3V5PA 3HUBA 5CQUA 2WIPA 4PL5A 5DEYA 4EHZA 3CIKA 4V0GA 3FZPA 5LCKA 4MXCA 4OUCA 5AX9A 4FOCA 2A19B 2PMLX 1RJBA 3HKOA 4QQCA 4ACCA 4V01A 3VN9A 4ENXA 4D2SA 1K9AA 4L45A 2YN8A 2QR8A 3LCOA 4WBOA 4E3CA 4UEUA 3HA6A 3KXHA 4O1OA 2X9EA 4MBIA 4QP9A 4WKQA 3E8NA 3UO4A 5CZIA 3CC6A 5IZFA 3U9CA 2HWPA 5HQ0A 3M2WA 2OSCA 3V6RA 5M07A 3U6HA 3VF8A 1JPAA 4RA5A 5CT7A 3UTOA 4AF3A 4L00A 5BYLA 4DH5A 4LG4A 1YXTA 3CY3A 5EK7A 3Q4ZA 4O7TA 2I1MA 2WTKB 5CSVA 2F9GA 4F08A 3EN7A 4FG8A 4R8QA 5L6OA 2Z8CA 5CEOA 4GKIA 3DCVA 5CSPA 3BLHA 2ITOA 3CCNA 3RK9A 3R7EA 1G5SA 3QWKA 4AGCA 3NNXA 2HAKA 4BCFA 3GU5A 3EN9A 3LQ8A 4NW6A 4YP8A 5C4LA 3UQCA 3S95A 3MBLA 4KKEA 4I21A 1J1CA 5EHOA 5GNKA 4JG6A 2ITVA 3QRTA 3I0OA 4QTCA 1FQ1B 2BAKA 2Y6OA 2Z7SA 3MY5A 4R78A 4RWLA 2W99B 3OOMA 2ITUA 4C61A 4CKIA 5BNJA 5BYZA 2OIDA 3QXOA 4Y8DA 3P7AA 2BKZA 4FL2A 2WMWA 3TDVA 4O7SA 5KBRA 2RIOA 4MNEA 3O50A 1WBOA 3R02A 3O8UA 4QOXA 4YJQA 1AGWA 4DC2A 2PE1A 4M69A 4BGGA 1M2QA 4H58A 5BPYA 3JY9A 2Y7JA 4FTRA 3C5IA 5A4TA 3KY2A 4LV8A 1GNGA 4TPTA 2HYYA 3I81A 4JQ8A 1UU7A 3M42A 4XLVA 3NYOA 3ZRKA 4EOSA 3BBWA 5DT0A 3W55A 3UZRA 2JBOA 3EKNA 3UIXA 4KIOA 3LZBA 4FKUA 2NPQA 4ZMFA 3VO3A 2YM4A 4YJVA 2Z7RA 4FT9A 2EUFB 3P78A 4D2WA 5EYKA 5LVPA 3AC3A 2OO8X 4O0RA 4UX9A 3R7VA 1XJDA 2ZYBA 2PUIA 2CDZA 4G3FA 4O6EA 5C26A 2XF0A 4FKPA 4EOJA 3KK9A 2HY0A 2E9UA 3II5A 2CLQA 2J90A 4IDVA 3ZFYA 3MVLA 5LMKC 5AP3A 2ZM3A 2BUJA 4LM5A 1R78A 3QCQA 4JDHA 4E93A 4FV7A 4Z16A 2NRUA 4E4XA 4R1YA 3G2FA 3TCPA 4CFMA 2PMNX 4EOMA 1YHSA 2QHMA 4GKHA 4IBMA 4JR7A 2HXQA 4CLIA 4EK3A 1PKGA 4V05A 3EN6A 4EORA 4MEDA 4NU1A 4XYFA 3IGOA 2GDOA 3IG7A 3QFVA 2OLCA 2J50A 2QHNA 2W1HA 3A4OX 5EW9A 4FG9A 4HGLA 1UU9A 1Q97A 4JAJA 4IW0A 2VNWA 3ZRLA 4IVBA 5AA9A 3RTPA 5HLWA 3H9OA 3DLSA 1OB3A 4OBQA 5C9CA 4BHNA 3NZ0A 1U54B 4EONA 4R3CA 2WZJA 2YISA 4JBQA 3O2MA 5CEPA 2BROA 4G6LA 4QD6A 3WF6A 3UNKA 3LFAA 4BCJA 3L9LA 4X6QC 3KF7A 3SXFA 4KBCA 2YCSA 3TL8A 5D11A 5E8TA 3UYTA 4K18A 4FKJA 4MXYA 1QPJA 4XG3A 3LMIA 1SMHA 1JQHA 2UW6A 4IWOA 4JX7A 2GHGA 4ID7A 1YXUA 4LL5A 4WA9A 1H1PA 4FNYA 4JBPA 4HCTA 4R5SA 3NUYA 3G90X 1DI8A 2X0GA 3RWPA 5HCXA 2XP2A 3E8DA 5IA0A 5F4NA 4GCJA 4DFNA 4EK8A 5L4QA 2YZLA 1KV1A 4EH7A 3HV7A 3UO6A 1VR2A 3F7WA 4LI5A 1FVTA 2X8EA 3E5AA 4PQNA 2RFSA 3MYGA 4FKVA 1IASA 3LQ5A 4DFXE 1NW1A 1GAGA 5KCVA 5B2KA 5EM6A 5AIKA 1APME 2XNPA 3F5GA 4D55A 3BU6A 1XH9A 2VTLA 3UIMA 5JFVA 3GCVA 1XH4A 2CLXA 3FKOA 4QP4A 1YRPA 1BL7A 4CFVA 4EBVA 3R8ZA 3COHA 4AACA 4X3FA 4AOTA 4C58A 2R7BA 3HRFA 2WMQA 1VJYA 3OHTA 4H36A 1BYGA 2H6DA 4M12A 4PPBA 4F70A 4J96A 1LR4A 4EJNA 2JDTA 1DM2A 4DYMA 4AA5A 1JKLA 3RINA 4AE9A 3DNDA 1QPEA 5HX8A 2F7ZE 4ZZMA 1A48A 3H3CA 1NY3A 3TV6A 1FVVA 2GNIA 5KMMA 4X7QA 4O7RA 4Z7HA 4JOAA 4C7TA 4G17A 2ERKA 3AD4A 2YDJA 1U5RA 1H4LA 1SVEA 2I0HA 3DT1A 3EMGA 3HV5A 4XRJA 1BKXA 3DBFA 2QCSA 3GGFA 3KN5A 3L9PA 4RBLA 4YJRA 3REPA 1WZYA 5ACKA 5EYDA 3S2PA 3UOJA 3V51A 5AV4A 1VZOA 1TVOA 1RDQE 2YLFA 3FMHA 4BDBA 2AC3A 5HLPA 1UV5A 5GINE 2VUWA 4RC2A 4D5HA 3Q6WA 4Q5EA 2XNGA 4DH7A 5HBJA 5HORA 5AR4A 1OUKA 2V22A 3RAWA 2OJFE 3W10A 4TYHA 3ATSA 3TACA 3QD4A 2X39A 4FGBA 3TTJA 3VW6A 5CY3A 2J5FA 5DNRA 4ZS4A 5FEQA 3HLLA 3GFEA 3OT3A 2FYSA 2B52A 4FT7A 4IDTA 5FXQA 3SQQA 4GIHA 4RZWA 4AA4A 4GV1A 4FNZA 4GVJA 2XK8A 2XZSA 4ANOA 5AADA 3H4JA 4CMTA 2QOCA 3GC8A 5DEWA 4RQKA 3BWFA 3BHUA 5M09A 2JAMA 3T3UA 4CFUA 2C30A 4OTGA 3N4TA 3ZO3A 4B8LA 3BE9A 4IACA 4ZTNA 4BIBA 1M14A 3TN8A 2B7AA 3RBWA 4U6RA 1UNLA 4HZRA 2YERA 3BQCA 2WNTA 4AW5A 2VX0A 4JXFA 2PE0A 3PXYA 5IDPA 2OFUA 2PVJA 3HVCA 3RNIA 3PSBA 4U41A 4EOPA 3MWUA 3G5DA 4FSUA 4FTMA 4Y72A 3ANRA 4F0IA 2QODA 4FEUA 5I5ZA 5L8KA 1Q8TA 2Y6MA 3LE6A 5T3QA 3TZ9A 3PWDA 4AQCA 5EOLA 3VIDA 2A4LA 4FT0A 3FLNC 3GOKA 4DEBA 4OTRA 5DR2A 1GZ8A 3U8WA 2Y4IB 4XH6A 2XM8A 3CTJA 4WG3A 3C1XA 4FK3A 4JRNA 3QZIA 4IX3A 4DGMA 1B39A 4QTDA 1U59A 4OW8A 2Q0NA 4FEXA 4DF3A 3MFUA 2UW3A 3A7IA 3QZGA 2ZDUA 4AGDA 3RJCA 2IVVA 4QMQA 4QQJA 2OJJA 2W1EA 5DA3A 2HENA 2XA4A 5J9LA 1H27A 2CKQA 3BPRA 2YDKA 1KV2A 3QYWA 4XMOA 3VVHA 3E64A 2ESMA 3FI8A 1SNUA 4FUXA 3VS7A 5E8WA 1OIYA 2I0YA 5H8GA 5AP1A 2WAJA 1WMKA 3R7YA 2CSNA 3ORPA 4O7VA 2ITWA 3D5WA 2F2UA 3P23A 3ANQA 4C4FA 3NRMA 4X2JA 2XNNA 1Q61A 3UBDA 3R8LA 4D2RA 5KMJA 2REIA 3R2YA 3P86A 5AA8A 4PDYA 3VQHA 1OKYA 2GTNA 2OF2A 3MY0A 3DJ6A 3TKUA 2CGWA 2GNGA 3Q3BA 3DBCA 3U9NA 3HGKA 3CD8A 2HZIA 5DT4A 4AZSA 3F3WA 1ZOGA 5HE1A 4MHAA 3IECA 3DAJA 3GB2A 4HNIA 1TQMA 4TRLA 1PRYA 1Y8YA 2PZPA 4JQ7A 2YWVA 2VO7A 5HG9A 4CZTA 3H10A 1PYEA 2ETMA 2QO7A 5HTCA 1V1KA 3S00A 2IJMA 3KA0A 4H3BA 2R5TA 4JBOA 3C0IA 1SNXA 4U9AA 3ORLA 3C4WA 3IDPA 3LXPA 4ZZNA 4ZLYA 3ZO2A 4CKRA 2PWLA 3KMMA 4N70A 3CKXA 3RHXA 3VUTA 3KCKA 3EFLA 3P0MA 3R22A 1A9UA 2OZAA 1ZY4A 5TE0A 2CKPA 2C3JA 2R3RA 2YITA 4QQTA 3E87A 5E4HA 3HZTA 3HAMA 2JBPA 4P90A 3QTWA 4O2PA 3BV3A 3QQHA 4YUQA 5IA2A 5EQYA 1JOWB 1W98A 3NGAA 2JDRA 5HEZA 3MTLA 4RJ5A 2FUMA 2A27A 2WTWA 4F65A 2IPXA 2P2HA 4RVTA 4MBJA 3RPOA 4XV1A 3T9IA 3UP7A 3AMYA 4JDKA 5DG5A 3VS3A 4E6QA 5CF8A 2UW0A 3DY7A 3ZFXA 2OH0E 2UW5A 4O81A 1Q3WA 2WMTA 4EK6A 5BX0A 3RPRA 4L3JA 5ITAA 5BQ0A 1U5QA 2YWPA 4DINA 4E6CA 4AE6A 3L1SA 1OKZA 3KVWA 3WF8A 4L7FA 2C47A 4JG7A 4EH9A 2CJMA 2XEZA 2X81A 2YLEA 3HRBA 3QLGA 4JS8A 1DAWA 2BIYA 4RFZA 3W2QA 3KXMA 5GZ9A 3QALE 3UO5A 4R7IA 5EW8A 1UWHA 3NYNA 2WGJA 3D2IA 3PIZA 2PUPA 3BGZA 5HTBA 3MTFA 5ANJA 3FXZA 3THBA 4HW7A 3U4WA 2WQOA 3MH0A 4MYGA 2O2UA 3E8EA 3QL8A 4YLJA 4QPAA 5GJGA 3VBTA 2I7QA 3UMXA 4ZK5A 5CAOA 2GTMA 4C4GA 4CZUA 4DT9A 4ZTLA 1WBNA 3Q96A 2R3PA 1OITA 2XJ2A 4K9YA 5DGZA 3PFQA 4FIIA 4UZHA 2ONLC 5CVGA 4ZTQA 3GUBA 2OI4X 2JDOA 3ALOA 3EIDA 1JSUA 4EK4A 5BVWA 2WPAA 4RIOA 4UMRA 1Q8UA 2UW8A 2B53A 5HO8A 4U3ZA 1ZYCA 3GFWA 4GU6A 3UOKA 4AS0A 2XK7A 4QYFA 2C6TA 5EG3A 4F9YA 5LJJA 5H8BA 2YAKA 3AD5A 1ZRZA 5HGIA 3D7ZA 4UY9A 3PRIA 2FA2A 2PK9A 4FL1A 4QP6A 5KMNA 2X2LA 4EUTA 2XKCA 4R7BA 3PJCA 4J99A 4G2FA 4ANMA 2IWIA 3IDBA 2JDSA 2OBJA 2Z7QA 4IB0A 1NXKA 3WYXA 4CYJA 5IA4A 5HG5A 5KO1A 5K4JA 5FTGA 3PA5A 4KIQA 3FSFA 4C38A 5JGBA 4L9IA 3UMWA 3KC3A 2PYWA 2O64A 4JJRA 3PIXA 3IW8A 1W82A 2JIIA 4GRBA 4QP3A 4QQ5A 3COIA 1YOJA 2WTKC 3ZRMA 3AGLA 1YWNA 5IISA 3MH1A 3MVJA 4S32A 2X8IA 3OBGA 3W32A 4D4VA 4EQUA 4F64A 5IF1A 3DV3A 2VWIA 4CFNA 1J3HA 5JMSA 4W9XA 2BCJA 3BRBA 3Q4CA 4LRJA 4Y5QA 1H28A 5FGKA 2J6MA 3LFFA 2YM3A 1YOMA 2G15A 4BDEA 2VWWA 3PUPA 4UYNA 4DBXA 2BIKB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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