3D9VA

Crystal structure of rock i bound to h-1152p a di-methylated variant of fasudil
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
SFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of dimeric ROCK I reveals the mechanism for ligand selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Rho-associated protein kinase 1
total genus 108
structure length 400
sequence length 400
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3d9vA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3d9vA01
4O0VA 4RFYA 3G90X 3I6WA 5HBJA 5LVOA 4R78A 2RL5A 1WBPA 1ZMWA 4Y5HA 4BF2A 3NW5A 4ITHA 3TDVA 4DA5A 3KL8A 4WUAA 2PVRA 3LPBA 4A4OA 4EOKA 2IVVA 3WBLA 4C62A 2BROA 4J8MA 4YTIA 3WF8A 4HYUA 4BBEA 2R3RA 3ZOSA 2C3IB 4GKHA 3ZTXA 2PY3A 5IKWA 5FM2A 4ACHA 2O63A 3GU8A 4FSMA 5EYMA 3DBFA 3I0OA 2C3KA 3UOJA 3R1YA 3GGFA 1CDKA 3ZC6A 3RAHA 5AEPA 2OJ9A 4GFOA 4RIYB 4HPTE 5G1XA 2A4LA 4IM3A 1MQBA 4W8DA 4DEGA 2FB8A 1YXVA 2GU8A 1H00A 2WMUA 3TNWA 4GUEA 4V0GB 5AV1A 5JQ8A 5H3QA 4LI5A 4AA5A 4EH2A 3QZHA 5AP7A 5EFQA 5KZIA 3TN8A 1ATPE 1CKIA 3PP0A 4G2FA 1JKKA 1WFCA 2H6DA 5FEDA 5FXQA 4PDPA 5CVFA 3VHKA 3SRVB 4EK3A 2YM6A 4FIHA 4J8NA 4IWOA 1V0OA 5FBOA 4QMZA 2W06A 2C6KA 3R01A 4JX7A 5FBNC 3UVRA 2FSOX 1GY3A 3ERKA 4JOAA 1YKRA 3DDQA 4KKGA 4YBJA 4G3DA 4NCTA 2OJGA 1DAYA 3IG7A 3Q6UA 1MRYA 4EI4A 3FI4A 4F70A 5C01A 2PVLA 4YZCA 3N4UA 3IS5A 4JNWA 1XH5A 5CAQA 1AGWA 3BHHA 5M4CA 1PHKA 3DJ5A 4W4VA 5I9YA 3P7AA 3DBCA 5AR4A 4GK3A 5CNOA 1A9UA 3R1QA 2OI4X 4IAKA 3IOPA 4NKSA 2KULA 5ANOA 1Q24A 3CKXA 1UVRA 3CD8A 3COIA 1PMUA 1PXLA 2R3OA 2O0UA 1OL2A 2JBPA 4L68A 5IUGA 3BKBA 3NIZA 3TJDA 4C34A 3PXKA 4EEVA 4CEGA 2PYWA 5LVLA 4ALUA 5E8XA 3IGOA 2XM8A 3A8WA 3R1SA 5EG3A 4A9SA 4TNBA 2EXCX 2QG7A 2OK1A 2XJ2A 5HD7A 4FYNA 4OTQA 4YLJA 1UU7A 4YNOA 4RJ7A 4N4SA 1WMKA 1MQ4A 4MXYA 4I6FA 1YDRE 2VX1A 4UYAA 4CFMA 5AP4A 3BCEA 1YQJA 4C36A 3V5PA 1VR2A 5IEXA 5HG5A 1XO2B 4I0SA 5A9UA 3LXLA 4FSWA 2OW3A 3MPMA 4RJ4A 3A7IA 5EH0A 4OTGA 5BVWA 3R83A 5JFXA 3EQCA 3D5XA 3G51A 4DYMA 2BZHB 1A06A 2RIOA 3ZLWA 5EDRA 4CMTA 2WU7A 3Q32A 5CEKA 2UVXA 4K9YA 3I0QA 3TUBA 2OXXA 5E8TA 4XG9A 2JIVA 4BL1A 2WMAA 2X2LA 3OG7A 1IR3A 4TYJA 4B8MA 3LKMA 3C0IA 4ZLZA 3MH0A 3CR0A 2QO7A 3Q04A 4RX9A 4CSVA 3R6XA 3NCZA 4NYEA 2NO3A 2BZKB 3QLGA 2X81A 4AW2A 4DEHA 3QD4A 4B8LA 3VQUA 3MH3A 5F20A 3NUSA 4YZNA 3ZRLA 2W7XA 3IW8A 5BMSA 1O6LA 3FE3A 4IVBA 4FTCA 4K77A 1J7LA 3OCSA 3FKLA 1JBPE 2FA2A 3DY7A 5BNJA 4FKPA 4D5KA 4FV5A 3EJ1A 3MFTA 4C4IA 2XKDA 2UV2A 2CCHA 3R7IA 2CPKE 2EXMA 2BAKA 3ANQA 4TWPA 5HGIA 3FEGA 4OUCA 2IZSA 2QO2A 3NX8A 4J96A 3HDMA 2Z60A 2QOFA 3QTUA 3RHXA 4MH7A 4N6ZA 4D9TA 5E90A 2XBJA 2YM4A 3E8CA 2ZJWA 4FI1A 5ACKA 3VF8A 3UNZA 4CCBA 4DGNA 3EQFA 4RT7A 4U79A 5M08A 4LMNA 2BIKB 4NKAA 3DAJA 3KKVA 3F66A 4QD6A 3C4EA 3MFRA 5E8ZA 4PDSA 4MXCA 3S3IA 4BTKA 1FPUA 2C68A 3C5IA 3RAKA 4L00A 2XNNA 3ZO1A 4CVAA 3HP2A 4OTRA 4RX7A 3T9TA 5M56A 2WTJA 3CLYA 4PL3A 3PVGA 2GTNA 4CRLA 5DT4A 2GSFA 2ZV2A 3EZVA 3PA5A 5F9EA 4TPTA 3RM6A 3FQSA 3UIMA 3V6RA 5HESA 2VO3A 4G1WA 4O0YA 3FUPA 5GZAA 3BV2A 3F7WA 3CJGA 3E64A 4QMVA 4GW8A 4R3CA 5AUUA 2QOCA 4FV9A 3PWYA 1G8SA 2X8DA 4EONA 2OF2A 2EWAA 3TV4A 3WF7A 1TQIA 5E91A 3O51A 4HVIA 3PLSA 3QHWA 2Z8CA 4IZ5A 4JRVA 4MXXA 2PVKA 3B2WA 2C0OA 3PJCA 2XK7A 2WKMA 4FX3A 4BCHA 4F99A 1OKWA 3AC3A 3GXLA 3U4UA 3UOLA 3V5WA 4QMNA 5AAEA 4BWPA 1OL6A 4O21A 4QP2A 2P55A 3ORLA 4UY9A 1OPJA 4I1ZA 2C1BA 2XK3A 3P08A 4QT1A 4DFNA 2JIUA 4O7SA 4DT9A 4O2ZA 2GHMA 3FLZA 3EOCA 3AC4A 4JI9A 4BCFA 3S1HA 5AV4A 4AZVA 3W8QA 1B38A 4LOPA 2ITUA 5DYJA 4EQUA 4IX5A 2JFLA 3AG9A 2E9UA 4YHJA 1F5QA 3TI1A 3FMKA 3L9NA 4DCEA 3ZHPC 4E20A 3FMJA 5JGAA 5J9LA 2VTIA 1J3HA 2ZMCA 3IDPA 3PWDA 2ZV8A 3DBDA 4W4XA 1PMNA 4C35A 4FZ7A 4ZXTA 4NJDA 4I3ZA 3DJ6A 3FZPA 4MXOA 4BTMA 3VS0A 1BKXA 2PZIA 3OWJA 4RJ8A 4C2WA 4D2WA 3A99A 4FNYA 5CY3A 3HAVA 4GT4A 4IX4A 5CANA 2JITA 2W5HA 3RPRA 2XNGA 3CCNA 4A7CA 1Y57A 3PIZA 2E9VA 3ZRKA 2P33A 5D9HA 4FSRA 4CT1A 1Q4LA 1H25A 4QP6A 1RE8A 3PVWA 4DFZE 4FKVA 2PUUA 5CU3A 4LOOA 4YO6A 5EI2A 4DFLA 4EOIA 4F08A 1GNGA 2F7EE 4HPUE 2J2IB 3NIEA 5E8YA 4DEDA 4O7VA 2ONLA 3ORKA 4RFMA 3OUKA 1EH4A 1Q61A 2QO9A 3R2BA 2FSTX 2RG5A 4Y72A 1H4LA 1OI9A 1U59A 3KXXA 4IQ6A 1XH6A 4YZMA 4FA2A 3HZTA 4FODA 4ALVA 4FEVA 3P1AA 2UZBA 4FICA 2IZRA 4UN0C 3OFMA 1NVRA 4TYEA 2BRGA 2F57A 3RNIA 4U3YA 4C02A 4CQEA 4EHGA 3OHTA 4OBQA 4DEEA 3I79A 2Z7QA 4A06A 4JDKA 5EM8A 4M0ZA 2X6EA 2YIQA 4RLLA 4O86A 3OC1A 4NM5A 4FV1A 4I6QA 4GU9A 5AAFA 2OICA 4OLIA 3R7UA 4WD5A 3HUBA 3UC4A 2PWLA 1FGKA 2P2IA 4TXCA 4NJ3A 4ZTRA 3S00A 1G3NA 4UMUA 3ID6C 3ZFXA 2G9XA 3A7FA 4BHZA 2J0MB 4LRJA 1Y8GA 5HX8A 4O0TA 4C3RA 2XIRA 3D0EA 4G3CA 4OTFA 4DGMA 2NRYA 3EN4A 2XNEA 4RVMA 4AOJA 4QP7A 2GNFA 3SHEA 4I20A 3UIBA 2IVSA 4WSYA 5FTGA 5D1JA 3E8EA 4FVRA 2QOHA 4MTAA 3ZO4A 4D58A 3R8MA 5KX8A 2FUMA 5L2TA 4N57A 5GJGA 5M51A 5KUPA 1KE7A 3U87A 5A46A 5CZIA 4LGHA 1NW1A 5IUHA 4R7IA 2OKRA 3UG2A 1H0WA 5CALA 4GG5A 4GFGA 3IW7A 1WBNA 5CAPA 5I0BA 3KK9A 3W8LA 4F1OA 1KV2A 3H0ZA 5EW9A 2RFNA 1CTPE 4WHZA 2F2UA 5C4KA 5EOLA 2WOUA 3A7HA 4BDIA 4O0WA 4D1XA 3BI6A 1UNGA 2ZMDA 3UO5A 2X6DA 4Y8DA 3OP5A 5HNIX 5E1SA 4IX6A 4NTSA 2A27A 2IVTA 4D2TA 1YXTA 1YDTE 1HOWA 2GPHA 2WHBA 3MN3A 4M7IA 4PUZA 4CZTA 4Z16A 4EOOA 4ORKA 3FQEA 4JVGA 3L1SA 3PA3A 5HX6A 5JGBA 4UMTA 2YWPA 2W1EA 2IW9A 5J5SA 3QQJA 5IISA 4OW8A 3NUXA 2WFYA 4X2NA 2BRBA 5HLWA 3LJ1A 2LGCA 1Y6BA 1ZMVA 4C58A 2QOBA 2XK4A 3KULA 4M14A 1W82A 3C4WA 4QP4A 2YM3A 5EM7A 3V51A 2YACA 3A8XA 4LQMA 4BDDA 3U9NA 3EN5A 3LZBA 4KIOA 3DKOA 2R9SA 2X8EA 2CKEA 4XMOA 5HNBA 4RMZA 3SXSA 2ONLC 2GNGA 3KRRA 4JQEA 2P2HA 3VULA 3NNUA 4DE4A 4EOLA 4QMLA 4I24A 4D1ZA 4GCJA 1YW2A 4GSBA 3ZFYA 4BCMA 4D2SA 4XG8A 3BGPA 4OGRA 3AT4A 4IAAA 2WB8A 2XA4A 4AZSA 3QALE 4YJOA 1OBDA 4C8BA 3E7OA 3UVPA 3QRUA 3F5GA 2ZDUA 4C3PA 5DWRA 3KXMA 1XH8A 2YCSA 4AW5A 3QQFA 2BMCA 3QTSA 3CGOA 3KXHA 4O7RA 1PXIA 3BEGA 4Y85A 3HUCA 3R04A 4C4FA 1ZMUA 3BPRA 4DF3A 4WRGA 4CV8A 5IQIA 3QRKA 4TY1A 4IJ9A 3FKNA 2BZIB 1BI8A 4L46A 3E3PA 1PXKA 3K3IA 4OR5A 5DFPA 3KXZA 3C9WA 2J7TA 2PMNX 3PDTA 4FUXA 2WXVA 1H07A 4ITJA 4FSYA 1YHWA 5AUZA 5BYZA 2EUFB 4Z7HA 2ZV9A 2A19B 1LUFA 3BGZA 4FTKA 4JL9A 2C3LA 5LWMA 5CZHA 3WZEA 2J5EA 1J1CA 3QHRA 2IZUA 5IU2A 3UDBA 4A9UA 3H9FA 4ACMA 4DEBA 4F0GA 1XBBA 3Q2MA 4BKZA 5CQUA 1FVVA 3MB6A 4RLKA 4JIKA 1CM8A 4MXAA 2QC6A 2O65A 3LXKA 3VAPA 4MNFA 4ASEA 4RX5A 2PL0A 4IVCA 5TR6A 3ZDIA 5AP2A 4PDYA 4JDIA 2CLQA 4C4JA 2HXQA 4UBAA 3PY1A 4J98A 2O8YA 3PE2A 3IW6A 1H1QA 3O0GA 3VUKA 4D2VA 5CVGA 3E8NA 4RZVA 4FIFA 4DFBA 1PXOA 5CASA 4MNEB 5CSPA 4NW6A 2PZPA 1ZLTA 3C4XA 2XRUA 5D12A 3KMMA 3FXXA 4LUEA 2IWIA 3AC2A 1T46A 4ANOA 3UMWA 4AZEA 4GMYA 4CMUA 1IEPA 4WG3A 5AWMA 4TYHA 5DRBA 5FRIA 2J0KA 4YJQA 2YLFA 3E62A 3HYHA 3UQCA 4HYSA 4AGUA 4I0TA 2WIHA 5CI6A 3R7OA 2XF0A 3GI3A 2IW6A 5ANGA 1GAGA 5HU3A 3FLNC 2W4OA 2ITVA 3WOWA 1NVSA 1W98A 2O2UA 3F82A 3FZ1A 5E7RA 3EN7A 4DEAA 4I93A 4F7LA 3DBQA 4EHZA 4PWNA 3AC5A 3OOMA 4GYGA 3G33A 3FLWA 1Q8TA 4EKLA 5JGDA 2ZB0A 4IFGA 2HZNA 5GZ9A 4L3PA 2YHVA 3EQDA 3PSCA 4IH8A 4RA5A 1U4DA 3AMYA 3UO6A 3DZOA 3MIAA 3NUUA 3EHAA 4L44A 2R2PA 2XKEA 3RALA 5JK3A 3NNXA 3KRXA 4Y83A 1XHAA 3CKWA 3FHIA 3G9NA 4GKIA 4MBJA 2W1IA 4X3FB 3FPQA 4CFXA 3Q60A 3VNTA 1UKHA 1Y8YA 5L6WL 4Q5HA 4G17A 2GTMA 2JBOA 3OT8A 4BN1A 5A6OA 2YITA 3P7BA 4RVTA 5IMXA 5DEYA 4AAAA 2OFUA 5HO6A 3SXRA 1K3AA 4JR3A 3MI9A 2YDJA 5TE0A 4WT6A 2C6DA 4FOCA 4WOVA 2W0JA 3IKAA 4Q2AA 4G3EA 2ZOQA 4Z9LA 5BUEA 1WBVA 2XM9A 5E8WA 4BRXA 5M57A 3TCPA 2OBJA 2X1NA 3G6GA 1I09A 4XCUA 3ZSGA 4XBRA 3SG9A 3KF4A 3IOKA 1ZOEA 3P23A 4FT7A 3A4PA 4EH9A 3UQFA 2XCKA 2GHLA 4MWHA 3SOAA 2PVYA 3NEWA 1TKIA 3PFQA 2C0TA 2PTKA 4QTEA 2B9IA 5CXZA 4EK4A 2CNVA 4FSQA 5HO7A 2R3NA 5FDXA 4WSQA 4GJ3A 3COHA 5L2SA 5EQPA 5HICA 1H1SA 4R5YA 1M2PA 1OL1A 1U46A 3A7GA 3DTCA 4USDA 3RTPA 5BX0A 2OSCA 2G01A 3R1NA 3ENMA 2FYSA 4DCAA 4MD9E 1PKDA 2PUNA 3LLTA 3EQRA 1CSNA 4L8MA 4W4WA 3ZO2A 2WQBA 2WTKB 2ITQA 2XYUA 3UO4A 5HD4A 4IFCA 3AT2A 4J97A 4PY1A 4DITA 3BQRA 5B0XA 3F7ZA 4O6LA 1SYKA 3IGGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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