3DDPA

Structure of phosphorylated thr160 cdk2/cyclin a in complex with the inhibitor cr8
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
298
structure length
297
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/cell cycle
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title CR8, a potent and selective, roscovitine-derived inhibitor of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 297
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ddpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ddpA01
2RF9A 2GS7A 4FV2A 4BGHA 2JAVA 3EFJA 3VS6A 3ALNA 4RRVA 4D55A 2OZAA 2AUHA 4FNZA 3TKIA 5KCVA 2WZJA 3R8MA 4F08A 5B2LA 4WO5A 4QTEA 1OL2A 2PVHA 4QYHA 3FMDA 1O6LA 4RWJA 3ZTXA 4AUAA 5KKRC 4RC4A 3DCVA 3TUCA 3EQRA 3ZONA 5LVLA 3R9OA 4GH2A 4ZMEA 3GENA 3COKA 5J87A 3MFSA 4MEDA 1JKKA 2WU6A 3D9VA 2O63A 3IW7A 3D7TB 4W4YA 4X3FA 3COIA 4X7QA 2EU9A 2WGJA 3ZSIA 4IDTA 4UZHA 4Z9LA 5E8TA 3SV0A 1U59A 4CXAA 5AP5A 4H3PA 4BI1A 4AU8A 5H9BA 3G0FA 2V7OA 2YLFA 4R1YA 4NIFA 1Y8GA 2W1ZA 3QX4A 4O0WA 4D1ZA 3DQXA 2EUFB 4LGGA 3QWJA 4JLCA 2VTOA 4KRCA 4UXQA 1W84A 5E8SA 3T9TA 4C38A 4CFMA 5F9EA 3Q6UA 3LKMA 2PVNA 4YC3A 3LMGA 3SQQA 5ITAA 1TKIA 3R7EA 1W82A 3PDTA 4IDVA 5C01A 3LVPA 4IC7A 5K0XA 4U81A 1XJDA 4LQMA 3PYYA 3R28A 4RWKA 1KE7A 2I0VA 3RPYA 2WMQA 4M3QA 4EK3A 3R73A 3RK9A 4XG2A 4A7CA 2PUPA 2CCHA 3ZRLA 2GQSA 5CU3A 2C3IB 2RKUA 2CKEA 4CRLA 3E92A 4OTPA 5JSMA 4AGUA 5HLNA 2BFYA 4JG7A 2OF2A 2O8YA 2F2UA 3IDCA 2HENA 2R0IA 3MIYA 4BHZA 1NVRA 5H8GA 3S95A 2J6MA 2ZV9A 4AZSA 3NVMB 3KVXA 4RLKA 2W96B 1Q4LA 5KMIA 3HMIA 4I24A 2X0GA 3MA3A 3LCSA 4ZSEA 4TWPA 5AUXA 4CG9A 2QKRA 3UO6A 1FVTA 4IX3A 5JN2A 4YJPA 3CGFA 3O7LD 3Q2MA 3PJCA 5M51A 5KX8A 5CAUA 5AP4A 2PL0A 2PVKA 3AC3A 4AA4A 1R1WA 2Y8OA 5AM7A 3VAPA 4GSBA 1YDRE 3C4EA 1ZOEA 3HRBA 2FSMX 4XV3A 1XQZA 3E88A 2J5FA 2YM3A 3DOGA 2BHEA 3FY0A 4H39A 4GEOA 3ORTA 2YM7A 5AP1A 3UIXA 3C7QA 4GK2A 3BWJA 3RTPA 5AWMA 2F7EE 5HVJA 1APME 1Z9XA 3W2PA 1XBCA 1J7LA 4U3ZA 4I3ZA 2VWZA 4LGHA 4RPVA 3RP9A 3UIMA 2BTRA 5DH3A 3OF0A 2PPQA 4B0GA 4N57A 4CYIA 3IECA 2IVVA 4GT3A 2HK5A 3UNKA 2BRGA 1REKA 3Q3BA 4KIPA 4EUTA 3H0YA 4XG4A 3HMOA 4MXCA 3RNIA 2UW0A 3AT2A 4ACMA 2BKKA 1JSVA 3TNPC 4ZIMA 4I21A 4QMXA 2W4OA 2UW6A 4GMYA 4OTGA 4AP7A 4FIIA 1V1KA 1PMUA 3EYGA 2W1DA 3D14A 3PXYA 4UWYA 5AV3A 3ZZEA 4IEBA 1W7HA 5J8IA 4C35A 3MESA 5AR7A 3C0IA 2QOIA 3EQCA 5IA1A 2XBAA 4RFZA 3TNIA 4L7FA 5EW8A 4KKGA 5M44A 1OGUA 2OH0E 4Z7HA 5KMNA 2C0OA 3W8QA 3BYSA 3GOKA 4JVGA 4V0GB 3KFAA 4GS6A 4U42A 4YPDA 4EKKA 3RCDA 3UC3A 2YIWA 3KRRA 4XG9A 1YWVA 4W8DA 3OT8A 2YLEA 3E7OA 3ANQA 2I0HA 4U45A 3R1SA 2W1HA 3HMMA 4I0RA 1ZRZA 2XMYA 5IISA 3SKCA 3V5JA 2X8EA 3F82A 2C0TA 4R7BA 2ZDUA 4AZTA 1URCA 2G15A 4NM3A 3HEGA 3W8LA 4II5A 3HUCA 2P55A 4ZP5A 3AG9A 4F7NA 4OTFA 3P23A 1XBAA 2QO7A 4FK3A 1BL7A 1Q24A 1GOLA 2PTKA 3VS0A 1YXTA 2PVJA 4YNEA 5FEQA 3RPSA 4C62A 3QKLA 4CV8A 2BALA 1Q8WA 4F63A 3O0GA 3OXZA 2BRBA 1V0OA 5FP5A 3F3WA 1S9JA 3OROA 4EK6A 4EOSA 4UWCA 4S32A 1PXMA 2RFEA 3RMFA 3PFQA 4I5HA 5CT7A 4H1MA 2W05A 2OZAB 3SHEA 4BF2A 5HOAA 4F1TA 3BLQA 3NX8A 3VS3A 4G16A 1JOWB 4JRVA 2WQOA 4NWMA 1ZYJA 3FHRA 4HGEA 5DE2A 3O51A 4FSUA 2XK4A 4LFIA 2EB3A 5CASA 3BI6A 4FV8A 4IAAA 4RIXB 3PP0A 2ACXA 4JBOA 2O3PA 3GVUA 4QP4A 3DZQA 4DLIA 4DA5A 3ZBFA 4IFCA 4C2VA 4X3FB 1L8TA 3LFCA 5IQAA 5HVYA 4B8MA 1OUKA 3VBTA 1ZY5A 4K8AA 4Y46A 4Y5HA 3QQJA 4CRSA 4EORA 2JKMA 5IQIA 2O2UA 2R64A 4F6UA 3PPJA 3U87A 5LMKC 3DA6A 4C7TA 4XMOA 3HKOA 1H07A 2Z8CA 2Z7SA 4KIQA 2FSOX 3B8QA 1J3HA 2JGZA 2Z7LA 3DKCA 3T3UA 2GFSA 4ORKA 3NPCA 1FMOE 2W99B 2WTJA 3A8WA 3ZXTA 5KNJA 3FXZA 4IM3A 3GBZA 1UVRA 2RFSA 3QTXA 2ITQA 5FWKK 5CVGA 4C34A 2JEDA 1H0VA 4IJ9A 2C6TA 5HIEA 3R63A 5KO1A 5HICA 2J90A 1OPLA 3R8LA 4Y8DA 2A0CX 3NW6A 4RG0A 3BGZA 4EOLA 4C4HA 3VVHA 2UW3A 5FLFA 3LFDA 1KOAA 4JT3A 4DEGA 3FXXA 5AFVA 4IAYA 3FSKA 5CU0A 4B99A 2YHVA 2B54A 2ERKA 4IZ7A 5AP7A 3O2MA 4U9AA 3FZPA 3QZFA 4XOZA 2YM6A 3QZHA 4X6RA 4L43A 2F9GA 3IOKA 3PY1A 4M8TA 4F99A 4FTQA 4MCVA 2HW7A 3CY2A 3DAEA 4BTKA 4FSRA 4IX6A 4ZXTA 3DK3A 4FIGA 5HO7A 5LMAA 4YBJA 3V3VA 2PYWA 4JXFA 4O1OA 2R3GA 4TYJA 4BDAA 1JKLA 4EHVA 3FMMA 3VS7A 2OFVA 4HZSA 5C8KA 4M14A 3SAYA 5AUVA 4YTFA 5I5ZA 2QLUA 4LMNA 2ITZA 3RI1A 3BX5A 3FMHA 1KV2A 3CPCA 1MP8A 2BIYA 2W1EA 4FKUA 5IZFA 2CNQA 4MXOA 5CENA 4GJ3A 4NW5A 2ZYBA 4KD1A 4A9SA 1XBBA 4RMZA 5M09A 3ZC5A 5E1SA 4B7TA 4RIOA 3GT8A 3KK8A 3NNUA 3VUGA 2ZB1A 2XYUA 3IOPA 1YWNA 4XG7A 2W7XA 3A2CA 1SM2A 4D5HA 1WFCA 4C0TA 2KTYA 3CY3A 3GU6A 4FYOA 4P7EA 4J98A 4NYEA 2JKQA 3ACKA 1P4FA 4FZ6A 1YHWA 3C9WA 3KVWA 4H58A 2VUWA 5HBEA 4EYMA 3LXNA 4IADA 1XH7A 3POOA 4U8ZA 3NMUF 5D1JA 4QMMA 2E9UA 2Z02A 4IM0A 4RT7A 5AP6A 5EK7A 1PRYA 4Y5QA 5LCKA 3IPHA 3QD3A 2QC6A 4YZMA 4EOQA 5LARA 4D2WA 4DAWA 3ORIA 2VTMA 3G9NA 4JQ8A 4FTMA 1WAKA 3EL8A 3MVJA 3SC1A 3V5TA 3MY1A 3ROCA 5LVMA 3ZDIA 3NYXA 2VTIA 2KULA 3F66A 3G6GA 4G3GA 4BTJA 5JK3A 2OIBA 2Q0NA 5DN3A 4KS8A 3I7CA 5AX9A 1PMNA 3ORZA 3V8WA 3W55A 2YZAA 3TT0A 3R9RA 5DPVA 3Q2JA 3I6WA 5CYIA 4IBMA 3VUKA 5LQFA 4FKJA 3II5A 3M2WA 5HESA 3FZTA 4PNIA 1SVGA 4S31A 4EQMA 5HD7A 3FEGA 4QQCA 5IQBA 4X3FC 4O6EA 4L9IA 4ZTNA 4RX8A 2UZWE 1QMZA 2OGVA 3MI9A 4ANSA 4D58A 1W98A 2OZOA 3DT1A 1OKYA 2WHBA 5ANGA 3DU8A 4W9XA 3WOWA 3F3UA 1H25A 1P5EA 2UW7A 4DEIA 3OTVA 1UU7A 4UALA 3GB2A 3RHXA 3FPMA 4NTTA 4O0RA 4BDHA 2J0IA 2WQBA 1QPCA 3JY9A 5DEYA 2YAAA 2V55A 4FIEA 3WF5A 3P1AA 5DT4A 4U43A 1PY5A 2EXCX 4PTCA 3PWDA 5HE1A 3VS2A 3JS2A 3W1FA 3ZDUA 5EYKA 2PK9A 4C4FA 3MH2A 3LFAA 5GJDA 4JNWA 3TTJA 4ITIA 2WEVA 5GJGA 3KRJA 5IG1A 3R8PA 2BRNA 2VNYA 2VX3A 3GCUA 3A7IA 4PDYA 3E3BX 3C50A 2BAQA 2EXMA 4E4NA 4FIHA 3ZRKA 1OKZA 3UOJA 5F20A 4KIKA 4HJOA 5CY3A 3KB7A 3UIUA 3D0EA 2R0UA 2C1AA 4DFZE 3C4WA 4X6QC 2CKQA 2R7BA 5BUJA 2JIUA 4YJRA 3A8XA 4RA5A 4G5JA 2HIWA 5J95A 3VC4A 2X2KA 4XP3A 3BE2A 5HBJA 5BX0A 2C6KA 2VGOA 5EDPA 3KXMA 2A2AA 3PA3A 1KSWA 1UNGA 3CKWA 4B8LA 5KMJA 2OO8X 2BIKB 2IO6A 3GC9A 4WKQA 3TV4A 3VQHA 4KAOA 4K0YA 2XRUA 5BYZA 3DKOA 3TXOA 5K9IA 4BY9E 4PUZA 2HZIA 4WSYA 2OICA 3NEWA 5AADA 5EQPA 1FVVA 5H8BA 4DE4A 3VJNA 2ZOQA 2FA2A 5HZNA 1YDTE 2NO3A 4EZ5A 2B9IA 3NNXA 5GZAA 3DXNA 5HG5A 5BVOA 1PMEA 4M13A 4ZLZA 1LR4A 1RQQA 3KC3A 4CVAA 3PIYA 5L8KA 3I79A 3G5DA 4MHAA 4O38A 3O7LB 4O0YA 4BDKA 3GQIA 4IVAA 4I6QA 3QLFA 4KBKA 1QPJA 4AOTA 4FT7A 2XIRA 2XS0A 1BLXA 4N6ZA 4X2NA 5EYMA 1PJKA 4FT5A 3QXOA 4DFNA 2PUNA 4YZ9A 4QMUA 3D2IA 2OXXA 5DVRA 5GZ9A 4DGMA 4FKOA 4LRKA 3F7WA 5IQEA 3HMPA 3TNHA 4ACCA 2R3OA 4C3FA 4HVSA 3LAUA 4FTAA 3D4QA 2UZLA 3PY3A 5A3XA 3KEXA 3MYGA 2HY0A 3OXTA 4RIWA 3U6IA 4MWIA 5B7VA 2X7GA 3I4BA 4O7LA 4RQKA 5J79A 2PE1A 3H3CA 3CXWA 4I20A 1TQPA 5CALA 4DINA 2BILB 4QP1A 3DY7A 4IZAA 4AA5A 3NUNA 3R6XA 3EFLA 3POZA 4FKQA 4QTBA 3ANRA 4GUEA 5LVOA 4DFBA 1Z5MA 3CE3A 4AFEA 1OIQA 4FNXA 5IQCA 4RZVA 3VF8A 3QCXA 4MAOA 1GY3A 3KMUA 3LFBA 3C4ZA 5E4HA 1WBOA 2WTDA 4RIYA 3R1NA 4CLJA 2W5HA 2GNGA 2XBJA 4UEUA 2J2IB 4ANOA 4QMQA 1UKIA 4YC6A 4BKYA 4C59A 3CKXA 3GCSA 3F5UA 4USDA 4ZY5A 4KINA 2IVSA 4YTCA 3DAKA 5LVPA 3KQ7A 4IB5A 4Q2AA 3FBVA 4UV0A 5HGIA 3SA0A 5CEOA 2FYSA 4IAZA 4G2FA 5EFQA 4IAKA 1ZYSA 1F5QA 4FSYA 3RZFA 3CP9A 5HQ0A 2WMWA 2QCSA 4J53A 4EONA 2C0IA 4W9WA 1WBNA 1BKXA 1AQ1A 4ERKA 4OTIA 1JQHA 4RBLA 2QHMA 4ZZNA 5AUTA 1YW2A 2ZM1A 4I5CA 2YIXA 1OPJA 4BIEA 5E8YA 3DDPA 3FYJX 3BYMA 3QALE 3U54A 1BYGA 2XIYA 2VAGA 4EZ7A 4F6SA 3T8OA 3R1YA 3HP5A 1GZ8A 2XK6A 5FXSA 1JAMA 3F9NA 3G90X 2PZPA 3F5XA 2CN5A 4BIDA 5JGBA 5KBRA 3U6JA 2PE2A 4D5KA 4PRJA 3BU6A 3BV3A 4DBNA 2HY81 1IR3A 3BCEA 3L8PA 4PPBA 1PXOA 3LW0A 5FDPA 2G9XA 3QD4A 3TG1A 4AW2A 4J52A 1OUYA 2IN6A 2QO9A 3HZTA 2WQEA 3R7YA 1H1SA 5IA5A 3ZFYA 4EWQA 4O7ZA 2YFXA 3OWJA 5IPJA 1OIRA 2PVFA 4HGTA 4N70A 4QP6A 2X6EA 5EM5A 5DT0A 1RDQE 1Y57A 2QOFA 3OWLA 1YQJA 4IZ5A 5DIAA 4IX5A 3RM7A 3QU0A 2X2MA 3ZUUA 5JFVA 1H1QA 4EH2A 3DBCA 2WMVA 2XUUA 4WNMA 5EYCA 3UOKA 4D9UA 2XYNA 2EB2A 4G6NA 3KK9A 4DH7A 2PU8A 2OLCA 4U3YA 4R7HA 4FTLA 4UMPA 1Q5KA 4QPMA 4ZJJA 4OW8A 5J7BA 3MH1A 5HIDA 2J50A 2XIXA 3LFFA 4TRLA 3RPRA 5K5XA 3KREA 2PMNX 3FSFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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