3DLZA

Crystal structure of human haspin in complex with amp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KGPVPFSHCLPTEKLQRCEKIGEGVFGEVFQTIADHTPVAIKIIAIEGPDLVNGSHQKTFEEILPEIIISKELSLLSGEVCNRTEGFIGLNSVHCVQGSYPPLLLKAWDHYNSTKGSANDRPDFFKDDQLFIVLEFEFGGIDLEQMRTKLSSLATAKSILHQLTASLAVAEASLRFEHRDLHWGNVLLKKTSLKKLHYTLNGKSSTIPSCGLQVSIIDYTLSRLERDGIVVFCDVSMDEDLFTGDGDYQFDIYRLMKKENNNRWGEYHPYSNVLWLHYLTDKMLKQMTFKTKCNTPAMKQIKRKIQEFHRTMLNFSSATDLLCQHSLFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and functional characterization of the atypical human kinase haspin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase haspin
total genus 112
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dlzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dlzA01
4EHGA 1YI4A 4Q5EA 5A14A 4CZTA 3F9NA 1OM1A 4TT7A 4U44A 3GEQA 4GVJA 3R6XA 3ACJA 1URWA 3GCVA 4BCGA 1XJDA 4RFMA 3ZM9A 5FUTA 2RKUA 2WO6A 3OBGA 3D14A 1ZWSA 4G3FA 4K33A 5ETCA 3T8OA 3V5WA 2PVRA 2CN8A 2X9FA 3PVWA 2C5XA 2VGOA 1XBBA 3GCSA 4LM5A 5BVNA 4FMQA 5J5SA 1BMKA 4EOJA 3PPZA 4WUNA 2QHNA 3PIXA 3BWFA 4O7YA 4J95A 4LI5A 3IW4A 3HP5A 4IVDA 3WF8A 1XH4A 2PZ5A 3ZUVA 4UWBA 3NR9A 2X1NA 4RLLA 3ORTA 1SM2A 5IMEA 5C03A 4DITA 4GFGA 4EKLA 5BQ0A 3LCDA 4C4IA 3EFKA 4ITIA 4I21A 4M97A 4K8AA 3VO3A 2UZVA 4GCJA 4UV0A 3VUIA 3ZONA 1AQ1A 2QKRA 3DBDA 5JSMA 2PZRA 3K54A 4F70A 3OUKA 4Q9SA 2XNNA 2WMBA 1H0WA 4X6RA 3KRRA 1G8SA 2QOKA 4HVGA 3B8QA 2CHLA 1KSWA 2ZB0A 2ITXA 2FO0A 4FG7A 3G5DA 4ACCA 1PY5A 3D5XA 2E2BA 4L52A 4Q5HA 2V7AA 5BVKA 3P9JA 2YLEA 5HCZA 2CCHA 3R73A 2G9XA 4UMPA 2B1PA 1QPDA 3T9TA 3U9NA 4AAAA 4CVAA 1PMEA 4KIQA 1YI3A 2DWBA 3K3JA 4FKUA 2WU6A 5GIOE 2HZ0A 2DQ7X 1ZMUA 5IPJA 5L2SA 5HE1A 5LCKA 2AC5A 4MD8E 1LUFA 1MQBA 2FA2A 5FRIA 3N4VA 3WZDA 4OTWA 4ENXA 1QMZA 2W0JA 3GQIA 2GQGA 2YA9A 4YZDA 4OTHA 5EM6A 2OIBA 2UZDA 2ZJWA 3FL5A 4MBJA 2JBPA 2J0JA 4QMYA 5I9UA 3PVUA 2OLCA 4YURA 2SRCA 4PMTA 3R1YA 3ZFXA 5A4QA 2BAQA 4GEOA 2IPXA 1PXJA 2W1DA 4M0YA 3O23A 3OFMA 4RJ8A 4WBBB 4ANQA 5IQHA 4J7BA 4JJRA 4Z7HA 4FIFA 3MIAA 3PY1A 3ZUTA 2BR1A 4XP0A 3I0OA 3FYJX 4N4SA 2R3JA 3NCGA 3FI8A 3ODYX 2ZOQA 4RFZA 5ANOA 3H3CA 5HG7A 5HNGA 2YITA 1CKJA 4O96A 1ZRZA 2VNWA 3WBLA 5ETAA 3BU6A 4V0GA 5HE0A 1SVGA 3C51A 3SD0A 3Q52A 2C3JA 4Q2AA 5T3QA 4QMWA 3EN7A 3VF8A 3SVVA 2OZOA 2JDSA 4I4FA 5EW8A 4FKLA 3C50A 4F9BA 3VJNA 3AMYA 4G6NA 2JFMA 1OI9A 2V0DA 2W05A 3UOKA 2CCIA 3AC2A 4BHZA 5HICA 2BKKA 5CF6A 4I6HA 1PMNA 3ORXA 3DS6A 1DI8A 3P4KA 3JPVA 4TL0A 4NU1A 4EOPA 3RK7A 3QA8A 1R0PA 4C2VA 3PA3A 1FQ1B 4NKAA 3GCPA 3QTSA 4QRCA 3C0GA 4RWKA 3QKLA 2CMWA 4RIOA 3W2QA 3UZTA 5J9YA 3E63A 3CD8A 3E7OA 3FQSA 5AA9A 3LMHA 3O2MA 3UBDA 3VF9A 5HG5A 3UOHA 3E8DA 3TI1A 1L8TA 4Y72A 3D0EA 5BNJA 5JK3A 2C1BA 2V5QA 3I7BA 3VN9A 2WELA 4D4RA 5C8NA 2R3NA 3KVWA 2QOLA 5JKGA 4I5CA 1GY3A 4GIIA 4ALUA 4CZYB 2OO8X 4EOLA 1XH8A 3R0TA 1LR4A 4JNWA 1H4LA 4FSMA 4EQCA 4FSYA 2NRYA 2XBAA 5E8UA 5EW3A 1Y8YA 4BC6A 4CMUA 2W9ZB 4IWOA 2OU7A 4QTEA 3BELA 5HQ0A 2ITQA 4O7TA 4IB0A 5EFQA 1Q97A 4YGAA 4CTBA 4ZJJA 5I5ZA 5HG8A 3FPQA 4BDEA 3F69A 4F4PA 2GHGA 1WAKA 1CSNA 2ITNA 3LZBA 1FPUA 1YI6A 5TT7A 3S2PA 4ZTMA 1H01A 2OIQA 2X8EA 2XNMA 2YCFA 4PUZA 3SOCA 5A4EA 1YDTE 2UZLA 5JN2A 5DI1A 4ANNA 4AZTA 1FINA 4UYNA 4PPBA 3A7IA 4GYGA 4ZSAA 1XH7A 1FMKA 4UZDA 4JDHA 3S3IA 3QC4A 5IUHA 3FQHA 5AUWA 1UNHA 3KFAA 1PF8A 3NGAA 3QX4A 4UYAA 4D2PA 5KHWA 4DLJA 3R8ZA 4CQEA 5F94A 1UU7A 2ERZE 3UQGA 3HUBA 4JQEA 5E8VA 4QTCA 5DG5A 1ZOGA 3EQFA 4U9AA 4L44A 3E8CA 4QYYA 1H24A 3O50A 5C4KA 2W1HA 3Q9WA 1XBAA 3V5QA 4XX9A 3A7FA 3QHRA 5M56A 2QLQA 4JI9A 4FUXA 5H9BA 4A9UA 3TUBA 2XP2A 4UWYA 3PXZA 3AD6A 4RZWA 5C4LA 5BX0A 4MEDA 4DG0E 5CEQA 3R30A 4ZS0A 4ASDA 4XG7A 4UY9A 4FZAB 4IM0A 4PPCA 2W4KA 3BHHA 2H96A 5E92A 3ULIA 1O6KA 3FLSA 1OL2A 2A19B 3R8MA 3RHKA 1OMWA 3UVPA 4DGOA 4E26A 5B2MA 2OFVA 2O0UA 3SV0A 3IOKA 4BDJA 3PA5A 3W1FA 4CCBA 5A4CA 2WNTA 2XUUA 5ANEA 1PXOA 3E7VA 3QQKA 4MBLA 3DXNA 4IC7A 2C5VA 3BWJA 2X4FA 3A60A 4J99A 4NW6A 3BYOA 3QQUA 3E64A 1H1WA 4FNYA 2PMIA 4R5YA 4EZ5A 4FL1A 3HGKA 3DFAA 2E9OA 4DTKA 5J9LA 3I1AA 2ZB1A 5HO7A 4EHEA 4FKWA 4XHKB 4EWQA 4TTHB 2GFCA 3JVRA 3ZSIA 3C5IA 3FXWA 2CGUA 2IZTA 4JDIA 4O0XA 2ETKA 4I4EA 2Z60A 3M42A 3SDJA 4D55A 4BTJA 3GGFA 5AIKA 5DE2A 5LOHA 4ANOA 5F20A 2OZAA 3NW5A 5AV2A 2ZYBA 1LEZA 4X2JA 2PE2A 4BYJA 5AP0A 5JZNA 4A9TA 2R3PA 3HRBA 4C3PA 2O2UA 5DNRA 2VTOA 3NIZA 5HE3A 4BKZA 4AXAA 3QBNA 3G51A 2C4GA 3C5UA 1P14A 2C6LA 2VWBA 4FVPA 4RQVA 3UIBA 5EHLA 3EKKA 1Q8ZA 2QU6A 2ZVAA 3QX2A 3QALE 3OP5A 4PDSA 3VBVA 4DG3E 5CANA 5K0XA 3FZPA 1KE5A 4FTQA 3LFCA 3V5PA 3V04A 5HKMA 1G8AA 3OEFX 3PIYA 4I92A 4ASEA 2WEVA 4ASZA 4CMOA 2F9GA 3NEWA 2VTTA 2XNGA 2Y7JA 3PZEA 3G2FA 2VWWA 3PZHA 4FKVA 4GV1A 3VC4A 3DKCA 3PSDA 4I0SA 3G15A 4D5HA 3JR1A 4B4LA 1YXXA 5FD2A 1PYXA 5J7HA 5IQIA 3CGOA 2A2AA 3MY5A 4FC0A 4CGAA 1E9HA 3KK8A 4E4XA 4ANBA 5EQEA 4PMPA 4RJ7A 3C0IA 1ZYLA 1XBCA 4DT8A 3E87A 5AP1A 3WF7A 4EK8A 3OTVA 3ZYAA 4YJOA 1MUOA 4MXOA 5IEVA 4GG7A 4FE2A 4FK3A 2HENA 3G6GA 1KOAA 4GSBA 2BUJA 5AAGA 3PTGA 4E5AX 2Z02A 2CLQA 2YCRA 2PL0A 3R21A 4MXYA 2F2CB 5A9UA 1KOBA 3BQCA 1OL7A 2XK9A 4OBQA 3RK5A 2UVYA 3FI2A 2GQRA 4EHZA 4QP7A 2ZMCA 2XF0A 5BVOA 3A61A 1YDRE 2BKZA 2PZIA 3JVSA 2VGPA 5HIBA 1CKPA 4BYIA 4AU8A 4EOQA 3PRFA 3KCFA 3QQJA 4BCKA 4JG7A 4YMJA 2I0EA 3D2KA 3MH2A 2QOHA 5CSXA 3Q4TA 4BDBA 2Q0BA 2RG6A 2C30A 2XK3A 4NK9A 4Y95A 1OL5A 1H1QA 2EB2A 2G2HA 3DK7A 1PKDA 4R3PA 5BUJA 4LRMA 4USFA 1H1PA 5CU3A 1YOMA 2WTVA 4ACDA 4MNEB 3DV3A 1UA2A 2X7GA 2X7FA 5AP5A 3ZH8A 2BRNA 2QI8A 1R1WA 4X2FA 5KMKA 4GJ2A 5LQFA 3F5PA 4E6AA 3MPAA 5HBJA 4C37A 1Q62A 4ZS4A 2HAKA 3EQIA 5FXRA 4BR3A 3DFCB 3RPRA 3EFWA 5KMNA 2G1TA 3KF4A 3H9FA 3IW5A 3UNZA 4BCJA 5LWNA 3DT1A 4QYGA 3O51A 3JYAA 4RGJA 4FZ6A 2XNEA 4Z7GA 5AV1A 3CEKA 3PVGA 2XYUA 4BBMA 4AQCA 2CN5A 1M52A 5C8MA 4BFMA 3Q6UA 4FGBA 3ZO4A 3ZC6A 4WSQA 3O8PA 3UC4A 2XB7A 4X3FA 2IG7A 1R0EA 2H34A 3AD5A 4BCMA 2BFXA 5IZFA 3BHUA 2WMWA 3MDYA 2YDKA 1UKIA 3THBA 3EQCA 1FBNA 2VO3A 3UVRA 4V0GB 4QNAA 3MFSA 3RGFA 4JT3A 4O82A 3VUDA 5KKRC 4FKOA 4LUEA 4JDJA 3COHA 1U59A 1BLXA 4DGLC 4EUUA 4LV8A 2WMUA 5JQ8A 2PZYA 2CKOA 3DXPA 2W9FB 2YZAA 3OT3A 3RZFA 1IA8A 2WMAA 1GIHA 3H4JA 4O2PA 2FSOX 3ZZWA 2ZDTA 3LQ8A 5EHOA 5DR9A 3ZDUA 4F0GA 3CLYA 3LJ0A 3NW6A 4CZUA 3A7HA 1GIIA 4H3PA 4MF1A 2YIWA 1SVHA 4DH7A 1M2QA 4JRVA 3HX4A 4PL5A 1JSVA 4QYEA 2IVUA 2HIWA 4O0TA 3U55A 2WMVA 3DZOA 3CGFA 3MTLA 3UYTA 4EEVA 3NVKI 3V5LA 4C0TA 4V04A 2VTSA 4FKSA 3QFVA 5HVYA 5BYYA 2FSTX 2QC6A 4A4LA 3S1HA 3FSKA 4E73A 2J4ZA 3SXSA 3FZ1A 3IOPA 3Q3BA 4PP9A 1M17A 2WQBA 5E1SA 3ZXZA 4CCUA 4DBXA 2PMLX 4U3YA 5GJFA 5GINE 5CEPA 3ZFYA 2IO6A 2X6EA 4YUQA 2AYPA 4RIYA 2E9PA 3AT3A 3AT2A 3ULZA 4BCPA 3DA6A 4QO9A 3KKVA 5DA3A 5LVOA 5CU0A 3EYHA 3QWKA 5TO8A 1ZYDA 2O63A 3MW1A 4EBWA 4FVRA 5EYKA 3FMKA 2JC6A 5CVGA 5KCVA 3R2YA 5HG9A 5AV0A 5ICPA 1H25A 3I7CA 1UWHA 3P23A 4IADA 5H8EA 3VBYA 2UW4A 4X7QA 3SQQA 5JRQA 4DC2A 2R3OA 5EI2A 5CSPA 4ITJA 1JKSA 5AUUA 3G90X 2QG5A 4YHTA 2YAKA 3JY9A 3HV5A 3C4WA 4RX8A 2I0HA 3EZVA 3QF9A 4FG9A 4AW5A 4CKIA 3UZRA 2RFNA 4O7WA 1WFCA 4JR7A 3RMFA 5IDNA 4XBUA 4XV1A 4F9WA 4JQ7A 4IM3A 2VWIA 5CU6A 4EK5A 3I5ZA 4PTCA 4QMZA 3W10A 3HV6A 2YJRA 4AT4A 4BGQA 3MS9A 3TWJA 4O7ZA 4J8MA 1UV5A 1OKZA 4KINA 2HCKA 3BLRA 3KMUA 3PSCA 1OIYA 2JDOA 5IQGA 3FKLA 2NNWB 1F0QA 4GK4A 2RFDA 4UB7A 5I0BA 5KNJA 4ZEGA 5E90A 5KMIA 4ZOGA 4KNBA 1YXVA 2WHBA 3P7BA 4ZP5A 4JVGA 2FVDA 2GNLA 3GXLA 3AG9A 3KA0A 3HMIA 2ETRA 3NZ0A 4OT5A 3F88A 3VUKA 5L8KA 2X6DA 1MRUA 3D83A 4XMOA 4H39A 4EH8A 4ZMEA 1M14A 5HBHA 2C3LA 4BF2A 3MV5A 2Z8CA 3NYVA 4NKSA 4W8DA 5AMNA 4CFVA 4L7SA 3UPXA 5AEPA 3SHEA 2XIZA 3MJ1A 3C4CA 3PXRA 4FEQA 4BCOA 5EDQA 4IBMA 3R7EA 5JFVA 1P2AA 4XRJA 4U80A 2WTDA 4MTAA 1GZOA 3HA6A 1BX6A 4QNYA 3D9VA 5DWRA 3DGKA 4A4XA 1XH5A 4C59A 4C33A 3VS6A 3W16A 5F1ZA 4Y83A 3WIKA 1Q8UA 3QD2B 5DOSA 3CC6A 4DH3A 2OK1A 5CWZA 5I3OA 4D4SA 5L8JA 5HGIA 3U4WA 3AT4A 2OZAB 3FV8A 3I4BA 2WD1A 4M14A 3S0OA 2VWYA 3AGLA 3F3TA 3GI3A 3DK6A 2RL5A 1CKIA 4K2RA 2W4JA 4RVTA 5EK7A 2UW8A 2GS7A 3R8VA 1V1KA 4EH7A 3FQEA 4PDOA 1E1VA 4JOAA 5FTGA 4PDPA 3GP0A 3KXZA 2R7IA 2AC3A 2IN6A 3P0MA 4JS8A 1P4FA 1ZYJA 3KXMA 3VULA 5CALA 1OIQA 4AGWA 5L4QA 3BLHA 3C1XA 3MA6A 5I9YA 4GW8A 4IB3A 4BKJA 1A48A 4H1MA 2KTYA 4PDYA 1L3RE 4JG6A 5KMJA 3UO5A 1YKRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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