3DZOA

Crystal structure of a rhoptry kinase from toxoplasma gondii
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
370
structure length
348
Chain Sequence
NLYFQGFRGTDPGDVVIEELFNRIPQANVRTTSEYAADSLVSTSLWNTGQPFRVESELGERPRTLVRGTVLGQEDPYAYLEATDQETGESFEVHVPYFTERAIKQMKEEVLRLRLLRGIKNQKQAKVHLRFIFPFDLVKDPQVLSRFFLYPRMQSNLQTFGEVLLSHSSTHKSLVHHARLQLTLQVIRLLASLHHYGLVHTYLRPVDIVLDQRGGVFLTGFEHLVRDGASAVSPIGRGFAPPETTAERMLPFGQHHPTLMTFAFDTWTLGLAIYWIWCADLPNTDDAALGGSEWIFRSCKNIPQPVRALLEGFLRYPKEDRLLPLQAMETPEYEQLRTELSAALPLYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel structural and regulatory features of rhoptry secretory kinases in Toxoplasma gondii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Toxoplasma gondii
molecule keywords Rhoptry kinase domain
total genus 97
structure length 348
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14531 Kinase-like Kinase-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dzoA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dzoA02
5CEPA 2GFSA 4HGLA 4DH8A 4AZTA 3HV3A 1UU3A 1FMOE 2VRXA 4FKOA 4V01A 5HG7A 2R3PA 2IVUA 3KK9A 3OP5A 4FOCA 3FLQA 1FOTA 4Z3VA 3SG8A 2J0LA 2O2UA 5BMMA 4M66A 2XM9A 3O17A 3UOLA 4XCUA 3G33A 4EWHA 1JLUE 1IR3A 1OIYA 3MFUA 4FTOA 4KS8A 5AUZA 3R1YA 4ZLZA 5LVMA 1DAWA 2NP8A 4B8LA 4DH7A 4P2KA 5IUHA 4YJQA 3N51A 4EK8A 1YHSA 3UPXA 3NPCA 3R22A 3LFNA 4G3CA 3QD2B 5EFQA 3DQWA 3JVSA 4E93A 1J1BA 4ZJJA 2NO3A 4KWPA 4CTCA 4YLLA 5HQ0A 1REKA 2WTJA 3ORTA 4JR3A 4ZY4A 2W7XA 4DTKA 1YWVA 3K2LA 2QOCA 2W4OA 5IDPA 2QHMA 3LXNA 4WRSA 2XH5A 3H9RA 2C0TA 1JKLA 1MQBA 3R83A 3WZJA 4O7TA 3ANRA 3E8NA 4KINA 4ID7A 3BBWA 3DZQA 3KMUA 4ANBA 3DLSA 1JKKA 3CBLA 3MFTA 5KMLA 4AGDA 1JOWB 1VJYA 5AV3A 3DB8A 2XF0A 3I0QA 3PXQA 3V51A 1UU7A 2H34A 3GCPA 4BKYA 3JY9A 4KRCA 3D5WA 3UMXA 4QT1A 3HMNA 3LCTA 4O0RA 3KXHA 3ORLA 3EFLA 2R0IA 3COMA 3RWQA 3Q6WA 4E1ZA 1V0OA 2IN6A 1QL6A 4NYEA 3LIJA 4XX9A 4JQ8A 4QMTA 1Q62A 3VQHA 3V8WA 4ITJA 2CKEA 3LZBA 5IF1A 2WKMA 4XG4A 5C26A 4EEVA 3HDNA 2WMAA 4I5CA 4OAUC 3U6HA 4YUQA 3G90X 3LFFA 3AD5A 3H0YA 4NM5A 5KZ0A 3PVWA 4D58A 4GIHA 3QRUA 1QPDA 5IMEA 4QMMA 3N9XA 3DDPA 3QKMA 3KRXA 4LYNA 2C5NA 3GP0A 4C02A 4JDHA 4JS8A 4NW5A 2OIBA 3FMDA 3DFAA 4PMPA 5JZJA 4M8TA 3NS9A 1MUOA 3PIYA 1ZMWA 1PXMA 2PE2A 2PUIA 4IVAA 1H26A 3I5ZA 3FE3A 2IG7A 3MN3A 2GS2A 2UW6A 4FT7A 2JIIA 5KBQA 4CNHA 2X6EA 3MGYA 3Q2MA 4UEUA 4V05A 3UC4A 3MY1A 3VHKA 5H8BA 3VIDA 2BKKA 4D2TA 3SRVB 4D2SA 3F88A 4FR4A 4GUBA 2I0HA 1SNUA 2B9FA 3LM5A 3MSSA 3DXQA 2WQMA 4GG5A 5ACKA 4GW8A 5IEXA 5HCYA 4U44A 2JAMA 2FGIA 3U8WA 2Y6OA 3KEXA 1CKJA 3MIAA 4G3EA 5CF4A 1OL6A 3FKOA 3U9CA 3F3TA 1U5RA 3LCKA 1K2PA 2OXXA 3A61A 2X81A 3OF0A 4G16A 3Q4TA 4H58A 3M1SA 4CSVA 3P7CA 3S0OA 3MH2A 4L44A 4RVMA 4YNOA 4EZ3A 3VRZA 3NYXA 4I6HA 5M51A 3Q04A 4WUAA 4H05A 2XIRA 3BWJA 2YM7A 3QQJA 2YWPA 1KWPA 4E5WA 1UWJA 3O0GA 4BB4A 4ANOA 3IS5A 4UN0C 1VZOA 2DS1A 4EONA 4QPMA 5LQFA 5JFXA 4CG9A 3O96A 5HG9A 3GCUA 3R7EA 3OTVA 2PMNX 5KMJA 5AP3A 4Y46A 4BTMA 3QRTA 2VNWA 4RWLA 3RPVA 4AT5A 5JFSA 3I81A 3EZRA 1OPJA 4PP7A 5JN2A 2YLFA 2BFXA 4YZDA 3V5QA 2QOFA 4R5SA 2UW4A 4JBPA 2PMIA 5H8GA 4CXAA 3PXKA 3QHRA 3VUHA 1Q8UA 3VJOA 3CJFA 4KSQA 1JVPP 5IQDA 3EN4A 3MPTA 3QYWA 4LRKA 4O7ZA 3LQ3A 3E8EA 3R7YA 5AAEA 2BTSA 1KE7A 4C2WA 3CTHA 4IWDA 1Q61A 3EYHA 3QTXA 4AX8A 2QLQA 4ZTQA 5IH4A 4JRVA 5F94A 4FKTA 4TKSA 1G8SA 2QOHA 4MXAA 4PMSA 3S00A 3FLYA 3BU6A 4F4PA 2X7FA 2YITA 4KA3A 5BYYA 4GYGA 3EQFA 2PSQA 5E8UA 4HGTA 3GXLA 1UNHA 3PLSA 3UO5A 2C3KA 5K4JA 3QA8A 4H39A 3OCTA 4FTAA 5ANJA 3FKLA 2OI4X 5DGZA 4C4GA 4P5ZA 4RFYA 4MXCA 5FM3A 4WA9A 4O81A 2X39A 3FI2A 1GIIA 4FL1A 2OXDA 3O7LD 3SOCA 2XIKA 3BLRA 1YHVA 3F66A 3NEWA 5HICA 5AUTA 5EQYA 2YCRA 4JG8A 3G2FA 3T3UA 5C4KA 2IW8A 4U42A 1VR2A 5DPVA 3A7HA 3ODZX 3TN8A 4F99A 5A54A 4O7SA 1W84A 3ZO4A 4BDIA 4NM7A 4JVGA 4CFVA 2GNLA 3RM7A 4ANSA 4F9YA 4GK4A 2BFYA 4G3GA 1OL1A 5IQBA 4O7LA 3NUPA 4YHFA 5CZIA 5CEIA 4EWQA 4RJ7A 1M52A 2VTPA 3IG7A 2PVHA 2E9OA 4RX9A 4A9TA 2WTVA 2WXVA 4HYUA 4QD6A 3MESA 3CKXA 4WNOA 2WTDA 4IVCA 3QRJA 1KE6A 3EHAA 4U43A 5E9EA 3HECA 3VUTA 2W4JA 3FZOA 2CSNA 3E64A 4BF2A 4BCFA 2OKRA 4ZAUA 5GZAA 1Y8YA 2ZJWA 3R0TA 1NVRA 5TR6A 4YLJA 5FBOA 2O0UA 3TUCA 3FPQA 2J0MB 3ORZA 4NCTC 2C6LA 3DFCB 5KMKA 4FEVA 3TUDA 4YTHA 2WMBA 3FKNA 3TV6A 3BLQA 2Z02A 3W10A 3R2BA 2ONLA 4HNFA 4GFGA 3JPVA 4JJRA 3VS2A 2R64A 3W32A 1S9IA 4EH3A 3VRYA 5JRQA 4XV3A 1DM2A 3HV6A 3V8TA 3POOA 2XYNA 2UZEA 5GIOE 4PDOA 5IUGA 4EOKA 4C4JA 1XH4A 2VGPA 2JFMA 5LVLA 4CFNA 4A07A 3Q96A 2BIKB 1LEWA 2X4ZA 4PTCA 4OW8A 5J79A 4W8EA 3C4ZA 5IH5A 5ETCA 3Q9WA 2OG8A 5LOHA 3UPZA 2CKPA 4YO4A 2J0IA 3ZEWA 3ZSIA 5L6OA 4X2NA 4QMVA 4J52A 4X3FA 5DT4A 2QLUA 4PL5A 4IZYA 3VUDA 3TTJA 2PMOX 2JDVA 3Q3BA 4J97A 4DG0E 1Y8GA 4LV5A 3LVPA 4XUFA 4BVUA 2J9MA 4H3PA 4KRDA 1YXXA 5AV4A 4JX7A 2BZHB 3EFKA 2WEVA 3BI6A 1FVRA 1Z5MA 3E8DA 3VUMA 3S1HA 4XG3A 3UE4A 4EK6A 3TT0A 2XJ2A 5M57A 1PXNA 3ROYA 2W1ZA 1F5QA 3DAJA 1ZY5A 4JXFA 4AU8A 3LCOA 4TRLA 2I7QA 5AFVA 3TV4A 1URWA 1FBNA 4J53A 4U41A 3ZLWA 3WIGA 3DT1A 3QZHA 4RIOA 4FKSA 3WBLA 3EQGA 2GPHA 5IUIA 1OMWA 5ETAA 1OUKA 2C5XA 3LFQA 4YC3A 2OW3A 5DG5A 3PSDA 1XH9A 2OJ9A 4ZZNA 3VW8A 2IPXA 1P4OA 2ZDUA 3PY1A 5DR2A 3VO3A 5JMSA 4WIHA 3NCGA 3NW5A 4MVFA 2WMWA 3FI4A 5ANGA 4N57A 4R77A 3GENA 5C01A 1Y57A 3R1QA 3RPYA 3FPMA 1OPKA 3QKLA 2EVAA 1K9AA 3MB6A 4X2GA 1FQ1B 4FICA 3OBJA 4I0TA 5E8WA 3LQ5A 1GIHA 3VJNA 1OIUA 3ZLYA 2FSMX 2VTOA 3Q53A 4ITHA 4TNBA 4BTJA 4C7TA 5CY3A 2FB8A 2GQGA 2HZ4A 3GC9A 2CGWA 2PZRA 5M07A 1TQIA 2ITNA 2XA4A 3MVHA 4FNWA 2BRHA 3DNEA 4L8MA 2PVLA 2XNPA 1H1QA 3MW1A 2OZAA 4FUXA 5L2TA 4U80A 3LXKA 4M0ZA 4XG7A 3HRCA 3TJDA 3EFWA 3UYTA 4QP7A 1F0QA 1OM1A 2ETMA 3P78A 4OTQA 4F0GA 5K5NA 2B52A 5FUTA 2UZDA 3SLSA 4CT2A 4TT7A 3ACKA 3QUPA 1NY3A 2XEZA 2JKKA 3DCVA 3REPA 3B8RA 2QOBA 3BWFA 5JRSA 2QO7A 4RIXA 4WG3A 3WF6A 2B7AA 3S4QA 4KBAA 4IBMA 4L42A 4DLIA 4WT6A 4QPAA 2VO6A 3TDVA 1FMKA 1IEPA 1OECA 3MH0A 3H9FA 3L8VA 4IE9A 4L3JA 1TQPA 3P79A 1KSWA 4LGHA 3WE8A 4R3RA 1PY5A 3P7BA 3E63A 4IQ6A 4FTMA 2ITTA 3HV4A 2GMXA 4RBLA 3TACA 4IX6A 2FSLX 5F4NA 4GK3A 2JKQA 4DFYA 5HORA 4FE2A 4EK5A 4DFUA 3ORPA 2YDIA 3QD3A 1ND4A 3HA8A 3NUNA 3HUBA 2PUPA 3D2KA 4TYGA 5EHLA 4IAKA 1JSTA 3EZVA 3Q4CA 4L46A 2C68A 4JQEA 3O8UA 2RGPA 4AF3A 5B7VA 2W5BA 4BI0A 1IASA 5EYDA 2PZPA 1PMNA 4IAZA 3TXOA 2P2IA 4AQCA 4HYIA 3VUKA 3T8OA 4GIIA 1H8FA 2G2FA 4L7SA 1H24A 3WF5A 5M08A 1YRPA 2RF9A 2Y8OA 1ZLTA 2RIOA 3CLYA 3MH3A 4RG0A 3ZUVA 2OJIA 4B6LA 4XP2A 2OZAB 5BPYA 2CNQA 4YMJA 3TKIA 4BIBA 3JY0A 5EHOA 2GHGA 2WPAA 2A2AA 2R3GA 2WGJA 3EQHA 3QALE 2X6DA 5AUUA 2YHVA 3O51A 4RIXB 1U54A 2I6LA 5KMIA 4MF0A 4FTLA 2F4JA 4I5PA 4RZWA 4DAWA 1GZNA 4EJ7A 3HEGA 3OOGA 3VWAA 3UG2A 5K9IA 2WO6A 4HYHA 4NM3A 4BCHA 5K0XA 5KMNA 2W1EA 3BQCA 5M53A 1MRYA 3BYSA 3FLSA 4FV9A 2BTRA 4D1SA 2PULA 4EH9A 4FEUA 5IQHA 2UW7A 2EXCX 2GHLA 4GL9A 4EJNA 1NT2A 3W18A 2R3QA 1PXJA 3MWUA 4FVRA 4AOTA 5HO6A 4XLVA 3U51A 3PZHA 5IH6A 3UQCA 4R1VA 5DLSA 2WHBA 3R21A 3RHKA 4RIWA 4BIEA 1LP4A 3LMGA 3V01A 2E9PA 1WBVA 4G3DA 3KXGA 5AP0A 4BCKA 4BL1A 3A62A 3PPKA 4MBLA 3OHTA 4TW9A 4ZTLA 3SKCA 2I1MA 3DXPA 2EXEA 3LW0A 4HW7A 4R6VA 4BDBA 2GU8A 4GU6A 4EK4A 5IA1A 1RQQA 3F3VA 3TKUA 3IECA 3IW5A 4XV1A 5FXSA 4FG9A 2AUHA 5HEZA 3MVLA 4ONAA 2JDOA 2YIQA 4YU2A 1TVOA 4I24A 5IDNA 3H10A 3QZIA 4MK0A 3U4UA 2PYWA 4YC8A 2OXYA 4D2RA 2KTYA 1U54B 4YLKA 4F7SA 2J2IB 4O38A 4E5BA 3LCSA 2HXLA 2YJSA 3A60A 1YXSA 1CMKE 3EKKA 1G3NA 2A19B 2C3JA 3G51A 4FKJA 4KIPA 4YO6A 5LMKA 4FV3A 4CMOA 3R7VA 3D7TA 4EOMA 3HYHA 4EK3A 4KKGA 5DR9A 5EOLA 2W4KA 3W55A 2HW7A 4CMTA 1JKTA 2GHMA 4XV9A 4CZUA 5EDQA 4FKRA 4O7RA 3QXPA 3IDPA 3QTQA 4RJ8A 4UBAA 2UVZA 4AT4A 4PNKA 3QX4A 4UMPA 4O82A 3TNHA 3GC7A 3QCXA 2RFSA 2Q0NA 3I7CA 4QMUA 3A2CA 4X6RA 3V6RA 3WIKA 4DH5A 2YISA 4O2PA 2Z7RA 1JNKA 2W99B 4TWOA 5D9HA 3RTPA 3BYUA 3WOWA 4EH5A 5FG8A 3OVVA 3EH9A 2CMWA 2V5QA 4WD5A 1CSNA 3PE2A 3M2WA 4UMUA 4RJ6A 4EHGA 5F20A 1XWSA 4RIWB 4AG8A 1NVQA 4BCMA 2ETKA 3SV0A 1ZYJA 1ZYCA 1LR4A 2QG7A 4ZJVA 5AR3A 4BZOA 4CQEA 4ASXA 5KCVA 1H25A 4Z9LA 4ACCA 1OGUA 2H8HA 3UOKA 4EUUA 5FD2A 1KOBA 4IVBA 2FA2A 1J1CA 5JQ8A 4A9YA 3CJGA 3IKAA 4DE4A 3VBWA 4LMUA 4RJ4A 2WQBA 3C4XA 3HVCA 4O83A 2VNYA 5CAOA 3LMHA 5FEQA 4GFMA 3CD8A 4YPSA 3QYZA 3DTCA 4O7NA 3LOKA 4G2FA 3PWDA 2F57A 3I60A 4IVDA 5D10A 4G9CA 3SG9A 2DWBA 2XK6A 5AMNA 2C0OA 2QD9A 1ZOGA 4U3ZA 1MP8A 4QTBA 3VUGA 2H9VA 2QKWB 3D7TB 4XRJA 3VW6A 3D15A 2FSOX 5FDXA 3DAKA 3OBGA 4GG7A 4FTKA 2QU5A 4QTCA 3TV7A 3GEQA 3FMEA 3AGLA 2XUUA 3OMVA 1OZ1A 3CGOA 3KA0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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