3E62A

Fragment based discovery of jak-2 inhibitors
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
293
structure length
291
Chain Sequence
RDPTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEKVKEPGESPIFWYAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIELLKNNGRLPRPDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Fragment-based discovery of JAK-2 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK2
total genus 99
structure length 291
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3e62A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3e62A01
3MW1A 2X7GA 5IQEA 2GSFA 4CFWA 3AGLA 3OWJA 2PU8A 4GYIA 2C6LA 5EYMA 2ZOQA 3W32A 3WZKA 4BBMA 3LHJA 5HORA 1PMNA 5AUYA 5M56A 4B8LA 4W4VA 3QYWA 4KIOA 3TWJA 4F08A 4GU9A 2W9FB 4Z7HA 3ATTA 3EHAA 4FSWA 4QP2A 3CJFA 4YHFA 4KBCA 1YXSA 4Y8DA 4YR8A 3BCEA 3C1XA 3NGAA 3FI2A 3RPRA 4AZEA 2ITTA 1B6CB 3U6JA 5TOZA 3NUYA 5GINE 3VS3A 1JNKA 2BDFA 2HOGA 1CM8A 5FTQA 2PVRA 2X0GA 3QA0A 3BWFA 3BELA 4K1BA 4AQCA 3L8XA 4ERKA 4TYJA 3BV2A 3QWKA 3FZTA 1H24A 3AGMA 4D28A 1J7LA 2YM4A 4YBKA 2DYLA 1URWA 2NNWB 5CEOA 2UZVA 5AFVA 4FZ7A 1SNXA 2ITOA 1FQ1B 3GCUA 4C7TA 1FMKA 4M13A 1QL6A 3MYGA 4TN6A 4RWKA 3GU6A 4O7RA 2ZJWA 4WG5A 4FEWA 1OPKA 4WUAA 3MFTA 5IKWA 5C01A 4HW7A 5FM2A 4O7WA 4DA5A 4C4IA 3VIDA 2X81A 5AP2A 4D1ZA 3CR0A 1FPUA 4FMQA 1BI7A 3ORZA 5HICA 4PPCA 3OC1A 5H8BA 2CHLA 3VS1A 4DBXA 4XMOA 1WVYA 5EH0A 3GCPA 3SRVA 1OUYA 3PJ8A 1RW8A 4QTAA 4F4PA 4F7NA 2OJ9A 4CGAA 3OW4A 3V5JA 1T45A 3DK7A 4FE2A 3UG1A 5FLFA 2FUMA 2OLCA 2R3PA 4YZCA 3QD2B 3QQKA 4CYJA 3ODYX 4B7TA 5K4IA 5IA0A 4HVGA 2QU6A 2FO0A 5A54A 1YVJA 1ZOGA 1OPJA 5DI1A 2YCSA 4RG0A 1JAMA 2O8YA 5LMAA 3LFQA 3BEGA 4YZ9A 5EI6A 4Z3VA 5F4NA 1XR1A 3JS2A 4MD8E 5AADA 4G9RA 4AT3A 3L9NA 5KZ0A 2DUVA 2X7OA 3ZONA 4AA5A 4UXLA 3H9FA 3PFQA 2VWIA 4BCKA 3FJQE 4ZLZA 1MRVA 3D7TA 1PF8A 1Q3DA 2Z7SA 4RC4A 4S31A 3GI3A 3U55A 3DKGA 3VJNA 2ONLC 3CGOA 3I6UA 3PA3A 5F95A 4CXAA 2PYWA 5AP6A 4F6WA 4JQ8A 3PXZA 5CU6A 5GZAA 4EOSA 2GQSA 1H1SA 2HY81 4KBAA 4YZDA 5ETFA 4RWLA 3EMGA 4E6DA 2O3PA 3BYMA 3ET7A 3DLZA 3ZXTA 2A4LA 5D11A 4PDYA 1F0QA 3C5IA 4BCQA 5J1VA 1PMUA 4O27B 4MXYA 2W1GA 4FTIA 3Q6WA 5ETIA 5GIPE 3ZOSA 5CF6A 1IAJA 4F1MA 5HEZA 5AP0A 4BZOA 2WU7A 4QOXA 2VD5A 5AEPA 4XEYA 5EM7A 5FEEA 3DZOA 5EHYA 2R3QA 3AT3A 4V04A 3LFCA 4IE9A 4MXAA 4XG8A 3ELJA 3IK3A 4ANMA 5I9VA 1Q97A 4XG3A 3L8VA 3VS4A 3KRWA 3Q3BA 4I22A 2VTTA 3VUMA 3ZCLA 3UTOA 2XIXA 2VV9A 4BDHA 3BV3A 4D0XA 4BCIA 4UX9A 4K0YA 1R0EA 3R1QA 3PG1A 3FY2A 3O50A 4WHZA 4D5HA 4Y5QA 2P2IA 4X3JA 1PXMA 2VTJA 2PSQA 2BRHA 4IVDA 5T68A 4YJRA 4ACMA 2IW6A 1WVXA 4ACDA 2YITA 3W2PA 4O7YA 3ZBFA 1KE9A 3OOMA 3RVGA 4XH6A 2WEIA 3V5WA 4PTCA 5FUTA 4OBOA 4HYHA 4PMPA 2GHMA 3HP2A 4C57A 3QTXA 2JDVA 5KKRB 4J96A 3CY3A 3RM6A 4OTFA 4F99A 3RAIA 1E9HA 2YM7A 3U6IA 4IX3A 4V01A 3BHYA 2RSVA 4YTFA 4UV0A 4HJOA 4U9AA 3PG3A 3PXKA 3NSZA 2XB7A 3PWDA 1SMHA 3PWYA 4R5SA 3WYYA 3KXNA 3KULA 3GGFA 2BDJA 2W7XA 4TTHB 3SVVA 2V7OA 3OP5A 2UUEA 4BGHA 3AC5A 3P9JA 2JKKA 3FMJA 3HGKA 3R8ZA 5CEMA 3PZEA 3KQ7A 1KUTA 2BAKA 2X6DA 4RJ8A 3H4JA 4FR4A 4IAAA 3UOKA 4CKIA 3RCDA 1YRPA 2GNHA 5AR5A 2ZV9A 5IMXA 3QTQA 5CAOA 2QLQA 4LI5A 4MNEA 5DT0A 3RJCA 3ZC6A 3V6RA 3T3VA 2BZJA 5GJFA 1XBCA 3NMUF 4NM3A 5DVRA 5CU2A 2OJFE 1NT2A 1ZYCA 4YHJA 5AR3A 3NUUA 1FVVA 3MDYA 4UALA 5G6VA 5A6NA 4QQTA 2P55A 4XV9A 2XEYA 3F5XA 4I94A 5L8KA 2SRCA 5ANOA 4N6YA 3LZBA 4U44A 5IH5A 3FMNA 2J9MA 1YOLA 2X2KA 4U40A 5BNJA 2B7AA 4JDKA 5HBJA 5C4KA 2Y4PA 5AUUA 1MQ4A 4IB0A 3CKWA 5EYCA 4N4SA 4AT4A 3U54A 1YOMA 1H01A 4FV3A 4M97A 3LLAA 3S0OA 2B9FA 4APPA 4BCFA 5CVFA 5HOAA 3FYJX 4FV1A 3UVQA 5M53A 5H3QA 5CNOA 1OL5A 4LM5A 5CQWA 2VX0A 1JOWB 5E91A 5LMBA 1UNGA 2G2IA 4BWPA 3DKOA 4O0YA 4EZ7A 2C6OA 1H1QA 1YWRA 4AGUA 1XKKA 1GOLA 2PMOX 4GRBA 1OZ1A 2PMIA 3Q4TA 1ZAOA 3ZRKA 1YHVA 3ZZEA 4ENXA 3B8QA 1ZOEA 3ZC5A 4J52A 4AX8A 4FYOA 3SOCA 2F49A 4ZSLA 4CFNA 4YLJA 5EOBA 2JGZA 4HYIA 5M07A 3R02A 1PRYA 2OZAB 3VS6A 4M15A 2E9OA 4KKEA 4BR3A 2GDOA 1YDRE 2E9VA 3ZUVA 1Q8UA 3TTJA 1H0VA 3POZA 3OHTA 2WTDA 2J0JA 3EQFA 3FMKA 1SVHA 3NNUA 3P7CA 4KB8A 4LOPA 5LMKC 5JRSA 4FSTA 2GNJA 3QAME 4MBJA 4KKGA 4EQMA 1UWJA 2R5TA 3FL4A 5AWMA 4JAJA 1Q8TA 2C6KA 3IDPA 3LW0A 5CX9A 2I0EA 2UW4A 5CEPA 3PTGA 4RIYA 3PJCA 4O7NA 4EOPA 5JFXA 4C34A 2X6EA 3E5AA 4FYNA 4HYSA 1NW1A 2IVUA 2PE0A 3BQRA 3P7BA 4YJTA 2J0KA 4K11A 4CQEA 5ANEA 4O21A 5B2LA 4TNBA 2QKRA 2YJSA 4CLIA 4QYGA 3U6HA 4S2ZA 3WE8A 2Y4IC 5HIDA 4RVMA 1L8TA 4NFNA 4M0ZA 3DLSA 3U8WA 1QPEA 3KRJA 2NRYA 3R9HA 4YURA 5B0XA 3G5DA 4XUFA 4UYAA 2WXVA 3SDJA 4L45A 3QTIA 3QFVA 1PXLA 4QP6A 3GT8A 4EH2A 1YOJA 2X1NA 3DDPA 4OR5A 4LYNA 5JGBA 1M7NA 4MH7A 5A4CA 5D7AA 5IMEA 4IW0A 2ZV2A 3ANRA 4FODA 3AQVA 3ZHPC 1O9UA 3S95A 2W1ZA 4HCTA 2BFYA 4HGEA 5EM8A 5LCKA 1YXUA 4EOMA 4MXXA 4FV0A 3ZM4A 4F9AA 2Z60A 4I0TA 2P33A 4WNKA 5J87A 5HCYA 5IA2A 5IH4A 4UBAA 3NEWA 2BDWA 4AGWA 3W8LA 3WZEA 4YTHA 3FLYA 3MSSA 3IOKA 1XJDA 4ASEA 2OF2A 4O0TA 4KD1A 4E4LA 2BHHA 4C02A 3KKVA 2OIQA 5J95A 3HDMA 4IZ7A 2ITQA 3CQEA 3D0EA 3FHRA 3GU7A 3DV3A 4L3PA 2PUPA 1U54B 1UU7A 4RSSA 3A61A 4PNKA 4IX4A 5FXSA 4FIJA 5FQDC 2VWWA 4JDJA 2ZYBA 4LGDA 1K9AA 4O7LA 2C6EA 5CTPA 3TNWA 4QNYA 2ZV7A 3LXLA 3E62A 4DTKA 1LPUA 2A19B 4XBUA 4U7ZA 3BKBA 1L3RE 2QG7A 4O7SA 4FSQA 4ZIMA 4EK3A 4M14A 2AUHA 5HLWA 5LQFA 3R1YA 5AAGA 2YABA 1JSTA 4EK6A 4IQ6A 4RJ4A 2W1DA 1XH6A 3PXRA 4CFUA 3GCQA 4L42A 5H2UA 4ACHA 5IQFA 3E87A 5CAUA 2WOUA 2FH9A 3WI6A 4WOVA 5DNRA 4EH4A 3O51A 1XH9A 2H96A 5M4UA 2BIKB 4D2PA 2GMXA 2I0VA 3GFWA 3O8TA 4FTJA 4H39A 3VS7A 1ZYLA 2V0DA 3Q5ZA 3NYNA 4WSQA 4F9CA 2ERZE 4YJUA 3UQFA 3QCXA 4LMNA 3UOHA 3TCPA 4H1MA 3F2RA 1XH8A 3SKCA 3VQUA 4D2RA 4D4YA 3LOKA 3MA6A 5HD4A 3RM7A 5GZ9A 3SC1A 2CKPA 4ZZNA 2B0QA 3G6HA 5DPVA 3ZSHA 3O0GA 2QOKA 4R1YA 4D2SA 4UMRA 3TEIA 2XRWA 4RA5A 4CZUA 2J50A 2W99B 4FIFA 4BDGA 3FC1X 4O0UA 4U80A 4C4HA 2IPXA 5T6KA 1MP8A 1DAWA 1J1CA 3EQPA 4FL1A 4I24A 4NL0A 1UKHA 3WIKA 2G2HA 2LAVA 5M57A 2IWIA 3F88A 3MY5A 3F7WA 2WTVA 2GS2A 3OTUA 3E8EA 3LFEA 3OWPA 4C62A 4D4VA 4ZTHA 3Q9XA 4PL4A 4OAUC 4E6AA 3MH2A 1M17A 3R7UA 4ARKA 4TWOA 1S9IA 2JDOA 5AIKA 3D94A 1IA8A 3FPMA 3FXXA 3EQCA 5TKDA 4LOQA 3S4QA 2BKKA 4QNAA 4J99A 2G01A 3HMPA 3DPKA 5EHLA 5AUTA 4X21A 3LXKA 2H9VA 2JDTA 3PSCA 5FM3A 3TNHA 2CNQA 3O8UA 2OFVA 2C47A 4KIQA 1GZKA 4GJ2A 3TV4A 1CMKE 3D9VA 2PULA 5DLSA 4NTTA 2WQOA 4BCNA 4QMOA 4JQ7A 2XIYA 1YKRA 2GS6A 3EQIA 2XM8A 3COMA 2VTAA 1Q4LA 3A7FA 2WMVA 4G6OA 4AW5A 4O83A 1GZ8A 3KRRA 5L2SA 3LMGA 3VS5A 2C3IB 2XZSA 3N51A 3UVRA 4J98A 3PIZA 1Z9XA 1YXTA 2YISA 4XHKB 1W83A 3NWWA 1VR2A 4XOZA 2BKZA 2NPQA 5BUEA 3PP0A 3G15A 4O0WA 2ZV8A 3LQ5A 5CEKA 3MFRA 4FBXA 2ITZA 3TKHA 1JLUE 2Q0BA 4WRGA 5I0BA 5AUVA 5I9XA 3COKA 4PDPA 2PWLA 3D4QA 3PSBA 4IH8A 3O71A 5DRBA 5AV0A 4EK5A 4OT5A 2Z02A 2G1TA 3PA5A 3CQUA 1BL6A 4I20A 4D2VA 3ZO4A 4FL2A 4OAVB 3CD3A 4FL3A 2YZLA 5HTIA 4D2TA 4FTMA 4U97A 2WMWA 4IAFA 4OTIA 2JDRA 3OUNB 4LOOA 5HE2A 5CU3A 4FKSA 3TV6A 4AW0A 2E9PA 3KY2A 4FT0A 2OW3A 1HOWA 1OM1A 3ACJA 2R7BA 3DCVA 3UP7A 4GIIA 5CF4A 2JITA 4BIDA 5HBEA 5IU2A 3DAEA 5FBOA 4BBFA 4BHNA 5E8UA 5HX8A 4MHAA 2EXCX 2GU8A 4I4EA 3ALOA 5ANDA 4DHFA 2Z2WA 3DK3A 3RALA 4DH5A 4E4XA 5BX0A 3K3IA 2RL5A 4ZZMA 5B2MA 1OL7A 4AN3A 4RGJA 5F9EA 2ZDUA 5JQ5A 5IA5A 3HYHA 1AD5A 2VO0A 3GUBA 5E90A 5CAPA 3VBQA 2XK4A 4IFCA 2WMTA 3PXYA 4O2PA 1ZZ2A 4RIWB 3BLHA 5FEQA 2C6TA 4FG7A 4EH7A 4CFXA 4J8MA 3ORXA 4HPUE 5DG5A 3U4UA 1OGUA 2HW7A 3LCSA 4D0WA 1NY3A 3FV8A 3MH0A 1FGIA 3BQCA 4RX9A 3OEZA 3VS2A 2Z8CA 3WZDA 4NYEA 4JOAA 3H0YA 2I1MA 4D58A 5KKRC 4MCVA 3HVCA 4G1WA 3QQGA 3ZRLA 1PXNA 2ITNA 4FKRA 2PVKA 4R7BA 2BR1A 4FT9A 4I5MA 3SW4A 3UE4A 5J5TA 4HVSA 4AE6A 4BN1A 1JKLA 3GC9A 4LFIA 2X39A 4DFNA 5GIOE 4DGOA 2YZAA 4PPBA 3VF9A 1IG1A 3S00A 3HDNA 4ASXA 3AC8A 5JGDA 2VNWA 3PA4A 2IO6A 2W05A 5FTGA 2UV2A 3MI9A 2YAKA 1RDQE 4WG3A 5AM6A 3VO3A 4BCHA 4DINA 2XA4A 4C3PA 5D9HA 5AR4A 4WT6A 1H27A 3I6WA 2O2UA 4YBJA 1GIJA 2BPMA 4ZTLA 3W2SA 1PHKA 5CZIA 4C58A 1X8BA 4PF4A 3PVBA 4NKAA 1G8AA 3ORMA 3HRCA 2J2IB 3DK6A 3QUPA 3TG1A 2R3NA 5BVOA 3SA0A 3CXWA 5EDRA 4F65A 2OXYA 3QLGA 4F64A 4HZRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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