3EQHA

X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (mek1) in a ternary complex with u0126, adp and mg2p
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
343
structure length
314
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of MEK1 Binary and Ternary Complexes with Nucleotides and Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
total genus 97
structure length 314
sequence length 343
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3eqhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3eqhA01
4ACGA 2HELA 3D15A 4O84A 4ZSAA 2QOQA 1WMKA 2BZHB 1OIYA 4BICA 2O8YA 5LWNA 2RFDA 5BUIA 2XNEA 4QMQA 2JDTA 2JD5A 4GSBA 3GEQA 3G0EA 2A4LA 2UW3A 3MVMA 2BPMA 2P0CA 4QTEA 4JOAA 2XF0A 3OCGA 1BLXA 1OPLA 3HP5A 4JI9A 5J9ZA 2FB8A 3MJ1A 4FKTA 4WA9A 5HX6A 3AT2A 4M68A 4M69B 3EFLA 3DKFA 4QRCA 1BX6A 4C3RA 2CN8A 4F6WA 5FWKK 1OM1A 1Y8YA 3VUTA 1JKSA 4LRJA 4A9SA 3CTHA 3HV3A 4GCJA 2WQMA 4J98A 2QCSA 3PE2A 4IVCA 3NCGA 4FTIA 4BCGA 4V0GA 3CTQA 2EB2A 1DI9A 4XV2A 5HNBA 5DEYA 5KCVA 3R04A 4FL3A 2OSCA 4RJ4A 4IAIA 5CQWA 2IW8A 4J99A 4U5JA 4HYUA 2QOHA 2ITOA 5C9CA 4LQMA 3HMMA 4USFA 1CTPE 2VWXA 5HZNA 4IM3A 5H8BA 3Q3BA 3I1AA 3I6UA 5B2KA 1TQMA 3JYAA 5JFXA 1ATPE 4JG7A 2O2UA 4RMZA 5A14A 1H28A 4C57A 2ZJWA 3LM5A 3WARA 4FZAB 2UZTA 3N4VA 3LIJA 3RZFA 4EK5A 3KVXA 4I92A 2I0VA 3A8WA 4PDPA 4KIKA 3BELA 2BCJA 5FQDC 2BROA 2PU8A 5K3YA 4DHFA 3C4ZA 4AE6A 3G5DA 5J1WA 1L8TA 4RWJA 3DK6A 3G6GA 3KN5A 4AP7A 3PSDA 2XK6A 4FV5A 4C62A 4D55A 4HVHA 4KS7A 3C9WA 3MFSA 4Z7GA 5ACKA 1OPKA 4ZY4A 5LVOA 4DH5A 2YLFA 3E7VA 3I7CA 5CS6A 1H24A 3L8VA 3PXQA 2XCKA 2WELA 4I93A 4MF1A 4RJ5A 4TTHB 5CT0A 1I09A 4K8AA 4K2RA 1A06A 5CNOA 4C4IA 3ZC5A 2VU3A 3PY0A 2PVLA 4HYHA 4IZ7A 4BZNA 3IW5A 5JZJA 2XBAA 2JITA 3R2YA 4BDCA 5FTGA 3TIYA 2F7ZE 1UU8A 4G6LA 1SMHA 4RJ6A 4DF3A 2OJIA 2HZ4A 4QP8A 5TO8A 4CKJA 5J7BA 2QLQA 1VZOA 4Z55A 3L9PA 1FMKA 2X8EA 2UZDA 4L01A 5DMZA 3HYHA 4A9RA 1M2RA 2YZLA 2PE0A 2R3FA 3I4BA 3KVWA 2OH4A 4MNEA 3C7QA 3KRWA 3SW4A 1KSWA 3L9NA 3UOJA 2C5VA 1UNGA 2VUWA 3R1QA 5M53A 2V55A 1LR4A 3C0HA 3TJCA 1OB3A 5IQBA 1Y91A 3TZMA 1H01A 2W4KA 2YCFA 3JR1A 4CV8A 1XKKA 2XM8A 4E6DA 4LV8A 3POOA 5HCXA 5LCKA 4CFNA 2FSLX 5CF6A 4GL9A 4XV1A 4O0XA 1W0XC 2BTSA 2G9XA 5HX8A 1GNGA 4EHEA 4C7TA 4IB0A 2XM9A 3H4JA 1WVWA 3O23A 2BAKA 2G2HA 3OROA 3TUCA 5EYDA 3C4WA 3UDBA 1R1WA 3RKBA 4J97A 3A99A 4FSZA 4JL9A 2YM4A 3A2CA 4O38A 2WOTA 4IACA 2UV2A 2BRGA 4LG4A 4ZTHA 3QRUA 3DAJA 4CT1A 3TL8A 2YEXA 4TYJA 1PXLA 4FTJA 2VWIA 3BZ3A 5A4CA 3TZ8A 3K54A 4FGRA 3GU6A 2XYNA 3SRVB 4I22A 4C0TA 1XJDA 3QUDA 4USEA 3BLRA 4CYJA 5AX9A 2ERKA 5IA2A 2XIZA 4YZCA 5AX3A 5L2QA 2WZJA 4PQNA 2HW6A 4W4YA 5AP2A 5HVYA 2ETRA 4AGCA 4DA5A 4WNKA 1OI9A 2HZIA 3FC1X 3OZ6A 5AP7A 3ZXTA 4I21A 4U79A 4BKYA 4LMUA 3ZZWA 5FUTA 3ZO1A 3DKGA 3BHVA 3GVUA 3SA0A 2PMLX 4F9CA 1J7UA 5FEQA 1OUYA 5BUJA 1IRKA 2WU7A 3R01A 4G6OA 3VBYA 4YJPA 4GU9A 3RNYA 4A9TA 4O7WA 4CV9A 1REKA 2QHNA 5AV4A 1U59A 1YVJA 4D1XA 3NVMB 4RA4A 1VYWA 1NVSA 3AC3A 1OMWA 3C4EA 2JDVA 5CT7A 4DGNA 3Q52A 5EM6A 4FTOA 4QMOA 4YTHA 1BKXA 1PXIA 3DK7A 3S95A 2QKRA 4UN0C 4AW1A 4DFLA 3CQEA 2CCHA 3BYVA 5DT0A 4IHPA 5HG9A 4DH8A 3C1XA 4ACHA 4QTAA 2GQSA 3WBLA 3EKKA 3QGYA 4BDKA 4CT2A 4HVIA 4EK3A 2QLUA 4RQKA 5AP5A 4E5BA 5F9EA 2WMBA 3F61A 5GJGA 3UE4A 1MRYA 5J5TA 4JRVA 4RX7A 4XP0A 3O7LB 3QQUA 3BEGA 3EB0A 3I6WA 3L1SA 3LXLA 4QYGA 3EN4A 4GG7A 2VX3A 3NLBA 3RAHA 2R3IA 5AR2A 2H8HA 5HLWA 3VO3A 4GUEA 3QL8A 3OMVA 4UX9A 4AZEA 2W5HA 3VS2A 3D83A 4HNFA 3Q9ZA 3IDPA 3ZLWA 1ZLTA 5CU3A 3H3CA 4ZTMA 3ORKA 3PY3A 3EHAA 4RRVA 1GIJA 1L3RE 5CNNA 4AT4A 1B39A 3V04A 3T3VA 2XEYA 3ZUTA 1U5RA 2PSQA 4K6ZA 5J87A 4ANMA 2VO3A 5I9YA 2X1NA 3LMGA 1WZYA 2DQ7X 3U8WA 4EOPA 1VJYA 2X8IA 5J79A 4GVJA 3U9NA 3R71A 1H08A 2W7XA 3PLSA 1OBGA 4U7ZA 2W9ZB 3MWUA 1KWPA 4MXYA 1KV1A 4IVBA 3R7EA 4ACDA 3QTIA 4NZWB 4BVUA 4FSUA 4CZYB 4IWOA 3AC8A 5HCZA 3MYGA 4PMTA 1RQQA 3ZU7A 3UPZA 4MXZA 5I5ZA 5J1VA 1Q62A 4CGAA 3E8NA 4MX9A 2GDOA 3QFVA 2VGPA 4XS2A 4IBMA 4ZOGA 4ZY6A 5IF1A 4YZNA 3F69A 4BDDA 3DBQA 4AU8A 4HGEA 3LVPA 1BUHA 4D0XA 3FZRA 3LCKA 5JGDA 3Q4TA 1Q8ZA 3Q6WA 2OI4X 4YZ9A 3FKOA 4WNOA 5DH3A 4UZHA 3WZDA 3S3IA 2XEZA 4YJRA 4F70A 3OWJA 4L44A 4PY1A 4WRGA 3RP9A 5K5XA 2PK9A 4R6VA 4B4LA 4U41A 3PXZA 3MH3A 3UC3A 3UJGA 3MW1A 4DGGA 3NUNA 3VW8A 3SGCA 3CEKA 1H4LA 3E8EA 3KC3A 3QF9A 4GJ2A 4L67A 3OWLA 4F1TA 4XLIA 3P79A 4QMTA 3W10A 3AMAA 5IA1A 4BCFA 3UO4A 4OTFA 3WE8A 3ZTXA 1H27A 2W17A 2XBJA 2Y8OA 3QKLA 5HO8A 2XK7A 4O0WA 1S9IA 1YW2A 4XYFA 2WXVA 4UYNA 5CI7A 5DBXA 4ZTRA 3NRMA 3GC8A 4GG5A 2WO6A 2VX0A 3HMPA 4P5QA 4XBUA 3UIMA 4YJTA 2CJMA 2EXEA 5E8SA 5IA4A 5C4KA 4K18A 3R1SA 3UG1A 5M51A 3F2RA 1PF8A 2IW6A 3UC4A 4OR5A 4UWYA 2F57A 2BDWA 2PL0A 4NH1A 3HX4A 5E1EA 4O96A 4D5HA 2BAJA 2HK5A 5A6OA 1TQPA 5DR9A 3OUNB 2RL5A 4PV0A 4ZZNA 2FYSA 3QALE 4A9YA 4EOIA 4BF2A 4ZLOA 3ROYA 4AGWA 4NFMA 3ZDIA 1TVOA 3TWJA 4HYIA 2QOCA 4KBAA 5KBQA 4YC3A 4EONA 3LKMA 4BTMA 2RG6A 4TKSA 5BVWA 3R63A 2GPHA 2R3OA 4O0SA 4FG8A 3RCJA 4NFNA 2XZSA 3UOKA 3GXLA 4PTGA 3HAMA 2XNNA 4AZWA 1JKTA 5TF9A 4BYIA 3HLLA 4L6QA 5AUXA 4Z3VA 2B9IA 5CEOA 3BHTA 4C2VA 4BWXA 4C36A 2BKZA 3FMMA 1O6YA 4ITHA 4M3QA 3JPVA 5JGBA 3COHA 3EFKA 2W1EA 4D2WA 5HE0A 2WKMA 1YI3A 3G51A 2JFMA 3OXTA 3EQFA 4QQTA 4EJ7A 4D4YA 2F7EE 1APME 1PMEA 2R7IA 2C3LA 3CY2A 4E5AX 5CEQA 3NYXA 4Y83A 4XOZA 4C4EA 4E73A 4O1PA 5HD4A 4D4VA 4N6ZA 3SHEA 3Q5IA 5A54A 2IZUA 2Y4PA 2V62A 4GW8A 4FVPA 1LP4A 1ZYLA 2RG5A 4YO6A 3FPQA 4CMTA 5FDPA 2BKKA 3NUAA 2XJ2A 1SVEA 2EXCX 3ZSIA 2OZAB 4NWMA 2UZEA 3VS0A 5AUZA 3E62A 3O50A 3PE1A 2XB7A 2RFSA 5ANEA 1OL6A 3GU7A 4JQ7A 4YJOA 4FT0A 2XKFA 3ANQA 3QAME 4ZSLA 2B9FA 4M69A 4DFXE 4RC4A 4P2KA 5GINE 3UMWA 2GU8A 4EH3A 4OTIA 3GQIA 3DAEA 3H9OA 1JSTA 2EU9A 3FQSA 4LM5A 4ORKA 1H26A 4QMSA 5ETFA 4B7TA 2I7QA 4RVMA 5A46A 3GOKA 5FGKA 4IWDA 1Z9XA 1PHKA 5HG8A 4UALA 3CKWA 3DDQA 1AGWA 4JQEA 4H39A 4QMYA 5KNJA 3AXWA 5D7VA 4L42A 4M67A 4ERKA 2XK8A 4CZTA 2R3GA 2W5BA 2ZDTA 4FOCA 2Z8CA 4E3CA 2FUMA 4KWPA 4YPDA 3FYKX 4C35A 5JT2A 2J50A 3QTZA 4OT5A 2XRWA 5DIAA 3FKLA 5I9VA 5CU0A 2VWBA 2WQNA 4XG7A 3DAKA 3BU6A 4PTCA 4IEBA 2VX1A 4MQ1A 5K9IA 3EJ1A 3WF9A 4MXXA 4BWPA 3KF4A 5KKRC 5CSPA 3CQUA 3RTPA 3MJ2A 3DV3A 3OUKA 2PPQA 4UWCA 4CXAA 3ROCA 4O7LA 3TM0A 3LE6A 4G6NA 2FSMX 3TN8A 3FLWA 3KF7A 4PPAA 5IH4A 4F99A 2WOUA 2YCSA 3CS9A 1Q61A 3COKA 4BTJA 3SLSA 3M42A 5J7HA 1YHWA 2G2IA 3RPSA 4PMPA 5DOSA 3PUPA 4C3FA 2BAQA 4PDOA 4OBOA 4EHGA 3V8WA 5AIKA 4RX5A 3DKOA 4X2FA 1STCE 4YP8A 4BTKA 3PXKA 4QYHA 5ETIA 3K3JA 5ETCA 1OL2A 3NNXA 1RDQE 1F3MC 4II5A 4FUXA 4FT7A 4BTFA 4FI1A 2X4FA 4IXPA 2VWZA 5EM8A 5JMSA 4F9BA 3HV4A 1I44A 2IO6A 3D7TB 4U81A 3ZYAA 3MI9A 4IAAA 3VRYA 5AADA 4S30A 4XNEA 5HESA 5AJQA 3P23A 3WILA 4FSTA 2C6KA 4EQCA 4GT4A 3FL4A 1H1QA 4GK2A 4PNIA 2GQRA 3GENA 3HRBA 3R7GA 3R0TA 4FKOA 4FVQA 5BYLA 3GCVA 5TOZA 5CEPA 3Q60A 3OCBA 5CEKA 4LOOA 4RWIA 4EOOA 4E6QA 5JFVA 3ORNA 1Q5KA 1NY3A 4LGDA 4M0YA 4QTCA 4YJSA 2WHBA 4EH6A 3TT0A 4ZP5A 2CPKE 3IECA 3UZTA 2WTIA 4FYNA 2O63A 4CEGA 2AC3A 2QC6A 3F2NA 3ORZA 3V5LA 4DEAA 3ORLA 2ITPA 2P4IA 4C33A 5IDNA 3ZS5A 3DU8A 4F7JA 3DTWA 3EN7A 2R4BA 2IWIA 5ANDA 2OJGA 3NR9A 4X3FC 3MPMA 4ZS0A 3MESA 2VTTA 3GFEA 2BR1A 1K3AA 3F7WA 2PULA 4I41A 4ZTQA 2I0YA 3V5PA 4EWHA 1EH4A 4FTAA 3TNPC 4JNWA 2O65A 3KU2A 4IZ5A 4O83A 4HZRA 3CKXA 2J9MA 4L43A 4FE2A 3ENHA 1W82A 3SRVA 2GNJA 3GU8A 4EHVA 5JEBA 4PMSA 4EWQA 1DAYA 3IGOA 3FE3A 3HP2A 3MGYA 2FGIA 5LMKC 4JDIA 2H9VA 2WTJA 3F88A 2R7BA 4Q5EA 3FI2A 4FIEA 4O7NA 2GS6A 2C4GA 1ZZ2A 2GFCA 3FC2A 3UIBA 3H9RA 3QQGA 4J7BA 3ZLYA 4WIHA 3KXGA 5AR5A 1YOLA 4B8MA 5EK7A 4BGGA 1Q8YA 4QMVA 2J0MB 2WMQA 3DT1A 4MTAA 2X7GA 5EHYA 1UU7A 4O81A 3RBWA 2BZIB 3UIXA 2VTPA 3VQHA 3MA3A 4JBQA 4EYJA 2J2IB 1CDKA 5I9UA 5BPYA 3QZFA 4NU1A 4WBBB 4QO9A 4FEWA 2CGUA 2UZWE 1BI7A 4JT3A 5E8VA 4QPAA 2WEVA 2OF4A 5CYIA 3G15A 4Q2AA 4HGTA 4JG8A 1NVQA 4BHNA 4BDHA 5IPJA 3BBWA 4JR3A 5EDRA 1JLUE 3NUUA 3OS3A 3BX5A 4FL2A 4YJNA 5HVKA 4BBEA 3TDWA 2Y9QA 5AR7A 5M4FA 3SDJA 3DBDA 4RX9A 3TNWA 4DH1A 4DEGA 2BTRA 2CN5A 1B6CB 3NWWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ACG A;  2HEL A;  3D15 A;  4O84 A;  4ZSA A;  2QOQ A;  1WMK A;  2BZH B;  1OIY A;  4BIC A;  4FRF A;  2O8Y A;  5LWN A;  2RFD A;  5BUI A;  2XNE A;  4QMQ A;  2JDT A;  2JD5 A;  4GSB A;  3GEQ A;  3G0E A;  2A4L A;  2UW3 A;  3MVM A;  2BPM A;  2P0C A;  4QTE A;  4JOA A;  2XF0 A;  3OCG A;  1BLX A;  1OPL A;  3HP5 A;  4JI9 A;  5J9Z A;  2FB8 A;  3MJ1 A;  4FKT A;  4WA9 A;  5HX6 A;  3AT2 A;  4M68 A;  4M69 B;  3EFL A;  3DKF A;  4QRC A;  1BX6 A;  4C3R A;  2CN8 A;  4F6W A;  5FWK K;  1OM1 A;  1Y8Y A;  3VUT A;  1JKS A;  4LRJ A;  4A9S A;  3CTH A;  3HV3 A;  4GCJ A;  2WQM A;  4J98 A;  2QCS A;  3PE2 A;  4IVC A;  3NCG A;  4FTI A;  4BCG A;  4V0G A;  3CTQ A;  2EB2 A;  1DI9 A;  4XV2 A;  5HNB A;  5DEY A;  5KCV A;  3R04 A;  4FL3 A;  2OSC A;  4RJ4 A;  4IAI A;  5CQW A;  2IW8 A;  4J99 A;  4U5J A;  4HYU A;  2QOH A;  2ITO A;  5C9C A;  4LQM A;  3HMM A;  4USF A;  1CTP E;  2VWX A;  5HZN A;  4IM3 A;  5H8B A;  3Q3B A;  3I1A A;  3I6U A;  5B2K A;  1TQM A;  3JYA A;  5JFX A;  1ATP E;  4JG7 A;  2O2U A;  4RMZ A;  5A14 A;  1H28 A;  3TYK A; 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