3EQPA

Crystal structure of ack1 with compound t95
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
274
structure length
268
Chain Sequence
LTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification and optimization of N3,N6-diaryl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-3,6-diamines as a novel class of ACK1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Activated CDC42 kinase 1
total genus 83
structure length 268
sequence length 274
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3eqpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3eqpA01
4MYGA 5EHOA 2C5XA 4BGHA 3Q9ZA 4JX7A 4J97A 3U6IA 3LCDA 1Q24A 1OIRA 2G01A 5M09A 3E7VA 4D4SA 3TIZA 4ZSAA 1OKWA 4USDA 4AFEA 3FMKA 2UV2A 2JFLA 3PXFA 4FX3A 5E8ZA 4QP2A 4Z55A 1FGKA 4GYIA 5DRBA 2W99B 3OF0A 5AV2A 1ZYSA 1YVJA 4DINA 1U4DA 4YJNA 1B6CB 3HLLA 5AP2A 5IQIA 2Q0BA 4A06A 4QT1A 4BCPA 5CT7A 4RIXB 4UEUA 5FBOA 3LZBA 5AP5A 5LOHA 4EH6A 4ZLZA 5K5XA 5HKMA 3CJFA 3LFBA 3HZTA 4KBAA 5FTGA 2BDFA 3LIJA 3VWAA 1J7IA 2NPQA 2W5BA 3U51A 4DC2A 4ONAA 3FMNA 3VBXA 4ZY4A 4C3FA 3DAJA 3TTJA 4QNAA 2W1FA 3KCKA 5CLPA 5AMNA 2QNJA 4D9UA 4NL0A 5KHXA 2QU5A 3I1AA 2C6DA 3OFMA 2WFYA 2JDSA 3GQLA 5BVWA 4WUAA 3VS7A 3ZBXA 3ZMMA 5HIBA 1SZMA 3U55A 5EFQA 4GJ3A 4IJ9A 4XG9A 4FKUA 5IUGA 4GFMA 4O1OA 1PKDA 2R3NA 3A2CA 4LL0A 4U8ZA 2BRGA 3TEIA 2WMAA 3WARA 4F64A 3CR0A 5IG1A 2RG5A 4WG3A 3QTWA 4MXCA 4XLVA 3OC1A 4JBQA 3JR1A 3PJ8A 3OXZA 4NTSA 5CZIA 4CTCA 4CV8A 3LQ5A 3PJ3A 3PWYA 5CWZA 5D12A 2C5YA 5HNGA 3O50A 4C4JA 3F3TA 4YLKA 3TJCA 3NCZA 4NFNA 3LJ1A 5DT4A 5AIKA 5HLPA 3T9IA 3UGCA 5HTIA 4DLJA 3F5GA 3ZM4A 2WTJA 3JYAA 4LRJA 5HX8A 5IH6A 2CKQA 3NIZA 2BAKA 5CU3A 4GS6A 4I6FA 3GENA 3FSKA 2GNLA 3F61A 1YI6A 2RFNA 2VO3A 3PPKA 3OUKA 5AM7A 4FKRA 4FSRA 4XP3A 1NY3A 3BHTA 4IIRA 2WMWA 2V0DA 4MD8E 1R78A 3EYHA 4EOKA 4UYNA 3N4VA 1KOAA 4O7YA 4C7TA 2R2PA 3ODZX 4Y5HA 4JG8A 3THBA 3BIZA 4QP3A 3CGOA 2V7AA 3G6GA 4QPSA 5AP6A 4FODA 5GHVA 3REPA 4E26A 5IMXA 2WXVA 3DKOA 5JGBA 3N4TA 4CV9A 4ZJJA 4XV2A 1KUTA 5C4LA 5JGDA 5C8MA 4BDHA 3HECA 1GIJA 4FE2A 3ORTA 2G2IA 5AP0A 4N6YA 5HEZA 3FLNC 4DN5A 3P9JA 3ZUTA 3BPRA 3HKOA 2ITTA 2B9HA 5EG3A 3RPSA 3OT3A 4Q5EA 2HAKA 2G2HA 3UO6A 2ITXA 4MD7E 4OTQA 5CU6A 3JUHA 4O83A 1Q8TA 1PHKA 5HLWA 1XBAA 3ZLSA 3OBJA 3QTQA 4IBMA 4ZSGA 1YDTE 1YHSA 4U3YA 4MAOA 3FQSA 3MIAA 4E4XA 1KV1A 1F5QA 5AIRA 5HESA 1W84A 4JIAA 5FLFA 1DAWA 3SV0A 4LGGA 4GVAA 4O1PA 4ARKA 4GMYA 1OMWA 3MB6A 3NYNA 3UNJA 3CQUA 3F2RA 4RIWB 4FG9A 5B2LA 2ZV2A 1VEBA 3GXLA 4CSVA 3G33A 1VR2A 3O7LB 1GJOA 1XBCA 2WAJA 2QKRA 2ITNA 2XIXA 3ULIA 4CD0A 3VQHA 1Q5KA 1H4LA 1V0OA 4JXFA 3ELJA 5CXZA 2XYUA 4BDIA 2VTIA 3NGAA 4XMOA 1KE9A 3PG1A 2FB8A 2F2UA 2PVFA 4IC8A 3LMHA 3QUDA 1XBBA 5TO8A 3R7UA 2C30A 2E2BA 4FTTA 4D28A 3F2NA 4BZNA 4TYIA 4AA4A 3L9NA 1V0PA 4PQNA 5J1WA 3I0QA 3LW0A 1WVXA 4G6LA 4Y85A 5TF9A 5FEEA 2VO7A 5HO8A 2QC6A 3KXNA 4Z3VA 3CE3A 4WG5A 2XNPA 4U43A 3CY2A 3DBDA 2YISA 5EQPA 4O2PA 3ZOSA 1P5EA 3IGOA 4JAIA 3HYHA 2W1CA 4BDFA 1JWHA 2YFXA 3LFSA 2PVKA 5G1XA 4CYJA 2QHNA 3VF8A 4FYNA 2J4ZA 4KD1A 4ZS0A 1OL1A 2BROA 3G0EA 3JS2A 4FSYA 4L44A 5H3QA 4E6QA 4FGRA 5L4QA 2XIKA 4FV9A 2YLEA 4I23A 3NAXA 5CTPA 4RSSA 1W0XC 4RIOA 3UBDA 4ERKA 4KINA 4DH5A 1PXKA 3QKLA 4G3EA 3QKMA 5KKRB 2PVJA 1PXOA 4ZY6A 2R3JA 2YWVA 4DGLC 1ZOHA 2QOHA 3IDBA 2BZKB 2QOQA 3BGQA 5EOLA 3WF6A 2R7IA 2JFMA 4EBWA 1J7UA 2VAGA 1GY3A 2FSLX 2ZM3A 5JN2A 4I4EA 3E3PA 2A1AB 2WMUA 3WILA 5HI2A 1TQIA 4TWNA 3HNGA 4YJUA 5GJDA 4CQEA 2X39A 4IAKA 4KA3A 4TRLA 4XP0A 4FTRA 5AP3A 1FQ1B 4JLCA 2YJRA 4MQ2A 2OJIA 5EHLA 4ZOGA 3FZOA 4I0TA 3GOKA 4I21A 5DGZA 5I9XA 4I0RA 1KE7A 1U46A 5HNIX 4L3PA 4RVTA 3CPBA 1PMVA 4A9YA 2VWUA 4ANLA 5E7RA 2J51A 5HE2A 2XK9A 2Z7QA 4USFA 2HIWA 4QP4A 5D11A 4I0SA 4YPSA 4MHAA 1JVPP 3OBGA 3D7ZA 2XF0A 3H3CA 2VTTA 5LMAA 5KCVA 3DNDA 3W2PA 2GHMA 4MQ1A 1BX6A 3DXNA 2BDWA 5HG7A 4IWOA 3V5QA 5A4CA 3VBQA 3DKFA 2WU6A 2F7ZE 3GT8A 5JK3A 3UG1A 4F6UA 2FSOX 3CQWA 3RVGA 2JAVA 4AUAA 3UO4A 4MEDA 3LVPA 3TL8A 4YTHA 2VTOA 1XH9A 4XJ0A 3GQIA 4D2VA 4ENXA 5DWRA 4L3JA 3LCKA 3COKA 4YHFA 5DIAA 2QVSE 4D55A 2B1PA 4IAYA 2YIYA 4NYEA 3W8QA 5JMSA 3OW3A 1OL6A 2GS2A 2XZSA 2Y8OA 3CGFA 2HENA 3PRFA 4BDEA 4CXAA 4RVLA 4KSQA 2VTSA 2WNTA 2C6KA 4YGAA 5EHYA 4OR5A 4PDPA 3HX4A 2Z7SA 3EKNA 3FI4A 3L8XA 3ZUVA 2W1IA 4RVKA 4KIKB 4U40A 3W1FA 3FZPA 4C2WA 1UV5A 3GI3A 2PY3A 3OT8A 2F9GA 5BVNA 4ALVA 1KSWA 4AOTA 3WF5A 4WO5A 5KNJA 3Q6WA 3IGGA 4W8DA 2H8HA 2W1EA 1PXLA 1ERKA 3ZCLA 4EUUA 4I94A 4QTBA 5I4NA 3KMUA 3A61A 4PTEA 4X3FC 4PTCA 5HLNA 1IEPA 2F49A 3P4KA 5LMKA 3RAIA 2Y4IC 4XP2A 2GQGA 3W2SA 4CZYB 4F1OA 5CU4A 5E91A 3VUHA 3ETAA 4TYEA 3V6SA 3QFVA 3PVWA 3NUSA 3P7CA 5DYJA 3BHYA 4IX4A 3FE3A 5DA3A 5DR6A 2YZLA 3SOCA 4FTUA 4NT4A 5CX9A 4GT4A 1ZYLA 2OIQA 4FTQA 5EI6A 2OF2A 3FEGA 3VJNA 4RJ4A 1P2AA 2DYLA 4G3DA 1FVVA 4P4CA 4FKPA 4QQJA 5J5TA 2H96A 4JDJA 2FA2A 3WE8A 4PP9A 4UWYA 3RK9A 3TACA 2X7GA 2XRUA 3E63A 4UX9A 5I9VA 3VUDA 3IOKA 4TY1A 3MH1A 5CI7A 3ZRLA 4B6LA 4ZTMA 1VZOA 3BELA 5M53A 4EK8A 3IQ7A 3NWWA 1XH4A 2VWXA 3Q32A 2NO3A 5DMZA 5LCJA 1YW2A 4LV8A 2UW5A 5ANOA 3OD6X 4K6ZA 4FVPA 4FKIA 3VUGA 4I5HA 2UZEA 4G3CA 3VULA 4PP7A 1ND4A 2ZDUA 3DS6A 3WF8A 3MN3A 3KREA 3LKMA 2ITOA 3BHHA 5HVYA 2O64A 3VBYA 5CY3A 1OL5A 5J7HA 5CVHA 3RPVA 2YLFA 2UZBA 2IW9A 4NW6A 1OPJA 2YCFA 4E6CA 3AMYA 3GBZA 4RWJA 2V55A 5DFPA 2C6OA 3IW7A 3MVHA 2QOOA 5JZNA 5ACKA 5DN3A 3TV7A 4A9RA 4W8EA 4HZSA 4IXPA 3BI6A 4DTBA 3QD0A 3NRMA 5CQUA 4ERWA 3W8LA 1QCFA 4MBLA 3FWQA 3FUPA 4K77A 2RF9A 1U5RA 4F1MA 4EOMA 1WBVA 4TT7A 5FTOA 4A7CA 3FPQA 4CFMA 3U9NA 3R7IA 1PRYA 2OG8A 3OP5A 3QYZA 4L00A 3RGFA 5M51A 2X6DA 1ATPE 3KF7A 3LFAA 2GS6A 3IG7A 1WAKA 4XBRA 3QZFA 2I0HA 4JT3A 3SLSA 2ZYBA 4EHGA 2GHLA 4OW8A 3BYUA 4IZAA 3UC3A 3R83A 2XNEA 3EFLA 2C5VA 3CLYA 3UOKA 3A60A 1JNKA 4RX8A 3EL8A 3ZXZA 1CKJA 3D9VA 3UYTA 3CTJA 2R3QA 2OXYA 3NCGA 1YHWA 3BLRA 2ETKA 3EHAA 4UXLA 3RAHA 4D4YA 2YN8A 5HU3A 4YZBA 3UO5A 3D0EA 3OWLA 3PLAE 2PSQA 1Q97A 4UB7A 1XKKA 1RE8A 3DDPA 3ORXA 4FC0A 1XWSA 4CZUA 4IEBA 2R3RA 2YM5A 3ZRMA 3UZRA 1FINA 3ZXTA 3R1QA 2YDKA 2X2LA 4AG8A 1UU9A 4ZTQA 4Z7GA 5B0XA 2XKEA 4TYHB 4YBJA 4ALUA 1XH6A 4PTGA 3VBTA 4GUBA 4L01A 4BYJA 1TQMA 4RT7A 1U54A 4IB5A 4ITIA 4C33A 4AT5A 3PVUA 3DKGA 2GNFA 4J1RA 2BFYA 4YHJA 4ALWA 3GU8A 2XM9A 3Q04A 1WCCA 4QYEA 4UMTA 1J3HA 3AT4A 3OCGA 2PZRA 2R7BA 3NDMA 2H34A 4WNOA 3UOHA 2RGPA 3G0FA 3OHTA 4HGLA 2R4BA 5T68A 4KS8A 3QU0A 3OG7A 3K2LA 3V01A 3ZLWA 3U6JA 1ZAOA 2C47A 3K3IA 3R8VA 5CAPA 3PE1A 2GNGA 2WMRA 3IECA 4CMUA 4PL3A 1OL7A 3P08A 1KE6A 4PPBA 4FL2A 4ZSEA 5BVKA 1YI4A 2RFDA 3VRZA 3CKXA 4R3CA 3MY5A 4J52A 3VUMA 2VTPA 3E93A 4RFZA 4GT3A 2W1DA 3CJGA 4YC6A 3TNQB 2PUNA 3R22A 3DY7A 3RKBA 3KC3A 1UA2A 5E1SA 5HO6A 3ZZEA 2UUEA 3LFQA 4EJNA 3MESA 4YHTA 1SVHA 4APCA 5AP4A 5CAVA 3MY0A 2QU6A 5HNBA 4RRVA 5KMJA 4TNDA 4JIKA 1H0WA 4RWKA 5HE3A 3V8WA 4GFOA 2C68A 4EOJA 5JFSA 4BB4A 4IAIA 3ZYAA 1Z5MA 3D5WA 4MWIA 3FJQE 4U44A 1OKYA 5IUHA 4XG4A 3BEAA 1CTPE 2PUUA 5C26A 3CSVA 2GSFA 4L42A 3GOPA 2B9JA 2JDVA 4QMLA 3NYOA 4U97A 4UV0A 3R8PA 2ITZA 2XKDA 4EZ5A 5M4UA 4BCKA 5AR5A 3C5IA 5AV1A 3VAPA 5AR2A 2OZAB 1O6LA 3QC4A 3Q53A 5AR7A 5AAEA 3V04A 3W55A 1H8FA 4RJ8A 4NTTA 5FUTA 5JGAA 2JITA 4PF4A 5CSVA 4O7TA 3OEFX 3EMGA 5J87A 2RFSA 3GC8A 4Y8DA 3FQHA 4QP9A 4CKRA 4FIFA 3MFTA 4O2ZA 1YDRE 3KKVA 2VTRA 4EYJA 5IQFA 3C9WA 2OIDA 5LWNA 2QO7A 3PA4A 1DI8A 1M52A 3O51A 5KE0A 3T9TA 4J95A 4QMWA 3A7JA 5J8IA 5FEDA 3LLTA 5EKOA 4IB1A 3PPZA 4U79A 1ZY4A 3T3UA 1S9IA 4OTGA 1LEZA 3EZVA 3F6XA 2VTHA 4R5SA 3JY9A 4AT4A 2OJFE 5JH6A 3FLZA 2JKMA 3W10A 4HNFA 1GZNA 4ACCA 2VGOA 3NUUA 4ZZNA 4R6VA 3ZRKA 3DJ6A 4ZSJA 5I3RA 5ACBC 5AUXA 4U42A 3WZJA 5IMEA 4MH7A 1I44A 4IW0A 1WBOA 4D0XA 1E9HA 3U4WA 4FV8A 3R2YA 2JIIA 3FY0A 3SD0A 4UN0C 5IH5A 4YZ9A 3F5UA 5JT2A 2B52A 1CKIA 3Q2MA 5EDRA 5K9IA 3PIXA 4U7ZA 3MH3A 2WQOA 4FTNA 4IVBA 1T45A 4KSPA 4U3ZA 4IACA 4XLIA 3UOLA 4ANQA 1UVRA 2VUWA 3SXRA 4CRLA 4F09A 3U6HA 1E1VA 4XS2A 1JSTA 4G2FA 4ANSA 2Y6MA 3FDNA 3HRBA 3FXXA 3ORLA 4MNEA 5CEQA 4AAAA 5F1ZA 4NKAA 4KIOA 3RI1A 1TVOA 4IE9A 2PVHA 3BLQA 4OBQA 3TDWA 1U59A 4II5A 2X8IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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