3ET7A

Crystal structure of pyk2 complexed with pf-2318841
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
273
structure length
261
Chain Sequence
GIAREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRTRLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Trifluoromethylpyrimidine-based inhibitors of proline-rich tyrosine kinase 2 (PYK2): structure-activity relationships and strategies for the elimination of reactive metabolite formation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein tyrosine kinase 2 beta
total genus 73
structure length 261
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3et7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3et7A01
5CWZA 4IC8A 3VIDA 4EOKA 2RIOA 2SRCA 4FZ6A 4JIAA 4AS0A 3AOXA 2CGVA 1OVEA 5AR2A 2UZDA 4E6DA 5M4CA 1BL6A 4AW0A 3LFDA 3FI8A 1O6YA 3KXNA 5LMKC 4KSQA 2YM3A 2ITTA 2QLQA 3AT2A 4R3CA 2GQGA 5GJDA 3BLQA 4WG5A 5M55A 4BDAA 2UVYA 2Y7JA 2YCFA 1ZLTA 2WQNA 5KMMA 4FMQA 3SVVA 3CR0A 3AC1A 4YJQA 3IW7A 3O96A 4RX9A 5B0XA 4OTRA 3W2RA 3LQ5A 3CD8A 3DT1A 3D7TB 5HTBA 4O96A 4PDYA 1FGKA 1QPJA 1U5RA 4RC3A 3BCEA 4J1RA 2Z60A 3CGOA 4JJRA 3V51A 4RLLA 1PMUA 5IQCA 2J9MA 3DAJA 3DJ7A 4E6QA 3G5DA 3CLYA 3NW7A 3EQIA 4ACMA 4U44A 4D4SA 3NVKI 3HMOA 3IQ7A 5J9ZA 4MEDA 5CEMA 3F82A 3ZU7A 1OL1A 1XHAA 2WMUA 1PXMA 4BCPA 4GL9A 3P1AA 2A27A 1WVXA 5K5XA 3A8WA 2RGPA 3IW4A 2R0UA 3V6SA 5IQEA 5HIEA 4RIYA 2IN6A 4JG6A 1H1WA 4FSMA 4L42A 5HNBA 4PPCA 2B0QA 3UP2A 2XK6A 3DFAA 4FTOA 5CU0A 4G1WA 1WBTA 3DLZA 2R3IA 4FL1A 3NUPA 5FP5A 5A46A 1ZY5A 3UPZA 2ITWA 5AUVA 3ERKA 3QQFA 2JDTA 3W32A 1Q97A 4CFUA 3OP5A 2QCSA 5DNRA 3R7UA 4GYIA 1YVJA 2BDFA 5E1EA 4C57A 4I24A 4AA0A 3EQCA 4S34A 4AFEA 3SV0A 2HXLA 4BKJA 4DC2A 1JKTA 3E63A 3UDBA 5BPYA 1KV1A 4HGLA 2HW7A 2CKEA 4QP2A 1P5EA 4JS8A 3MH3A 2R3PA 2VZ6A 3BYMA 3EHAA 4DN5A 4U7ZA 2GHMA 4ZY6A 3RWPA 1UU9A 5EK7A 5AP5A 4BWXA 4MNEA 1R3CA 3VJNA 1Z57A 3ZLWA 2ZDUA 2PVFA 2R3MA 4DFYA 1U5QA 3I7CA 3HDNA 1P4OA 2R3NA 3TNPC 4C34A 3AXWA 2GPHA 1XWSA 4RJ4A 4O82A 4R5YA 3R28A 4EORA 2O0UA 3PWYA 4TXCA 4MXCA 4LRMA 4EWHA 4RSSA 4XH6A 5CTPA 3D5XA 3RALA 2BMCA 2G2HA 4CXAA 5AP3A 1ZYJA 2HZ0A 4TYIA 1GOLA 2G2IA 4PUZA 4CMUA 1SM2A 4LOQA 2XH5A 2WTKB 5FM2A 2OO8X 2W4KA 3VBXA 5FTOA 4EZ5A 4LMUA 4A9YA 2Z7SA 1SVHA 4TL0A 3ZLYA 2YERA 3TUBA 4O81A 2W1FA 3QCQA 4DFNA 5EQPA 1R78A 1OBDA 4O22A 4YO6A 5L6OA 4AZVA 2C68A 4G9CA 2HWOA 2FSTX 4E3CA 2X7FA 5CAPA 4XG4A 3GC8A 4OAUC 4NEUA 5LCJA 4O86A 4W8DA 1O9UA 4E73A 5JSMA 4P5QA 3IDBA 3II5A 5AUWA 2LAVA 1H8FA 3OBJA 5GJFA 4ZXTA 3KULB 3V3VA 4AACA 1BYGA 3QQLA 4WRSA 5H8GA 3HAMA 3QKLA 2PHKA 3F9NA 5L6PA 2BRNA 3QF9A 1SVGA 1KE8A 2YAAA 3GI3A 3NPCA 1I44A 5AP6A 5F4NA 4E26A 5K5NA 2UV2A 4FYOA 4CQGA 4D2PA 3ZO2A 3RM7A 4C2VA 3BHHA 3OCBA 3QAME 3S2PA 1JBPE 3RAWA 3C51A 3PJ2A 4XV9A 4CFVA 4GU6A 4J99A 3R1QA 4C3RA 5C01A 4MXXA 4O7NA 3QGWA 4FV7A 2BALA 3U8WA 2Y6MA 4U81A 4XG3A 3QTWA 3R6XA 2A0CX 3C0HA 4X2KA 3TV6A 2PMIA 3A99A 3PZEA 4IWDA 1ZOGA 4UWCA 3JYAA 3P0MA 1M2PA 4FKVA 5FTQA 3IOKA 3DNEA 3HV7A 3TV4A 5I9YA 3JPVA 3UJGA 1NA7A 1UNGA 2J0LA 3FMJA 2OZAB 2BIKB 4FYNA 3E3BX 4FKOA 5E1SA 4ZSLA 3HLLA 2NRYA 4ITIA 4U45A 3R1NA 5CX9A 2FSMX 3W16A 5L2TA 5LVMA 5AIRA 4C8BA 1PMNA 2BZHB 5JH6A 2JBOA 4ZK5A 5BMMA 4XS2A 1ZY4A 1K3AA 4M69B 2PE2A 3ENMA 3QD0A 3UO6A 4FZ7A 3ZUUA 2VU3A 4PTEA 1E1VA 3LVPA 4EHZA 4F7SA 2RFEA 2XYNA 4W9XA 5AR3A 2IVTA 3I1AA 3OW3A 5HESA 3SXFA 1SYKA 5H3QA 4DTKA 5CEOA 4ANLA 2IVSA 2WKMA 4EOOA 4X3FA 4IX3A 4A9SA 2QHMA 3VULA 4JNWA 3GVUA 4E4LA 4R6VA 5JZNA 2ITNA 5LJJA 1BUHA 4ARKA 4Z7GA 2UW3A 4BDDA 4EQMA 5A6OA 3EN9A 2PE1A 5IZFA 4YNOA 4RX8A 3UIUA 3DA6A 3HA8A 2BPMA 3EQPA 4E8AA 4MX9A 3E8EA 4O6EA 3E8CA 3LJ0A 3DXQA 5HO8A 5HG8A 4MD9E 2HWPA 2O3PA 5ANDA 4D2RA 3BGQA 3E88A 3AGLA 2QO7A 4U9AA 5EDPA 3VRYA 4AGUA 3L1SA 4TRLA 3RNYA 4DGOA 4GRBA 1OPJA 3NUUA 4FKTA 2X2LA 2REIA 3ORKA 4IACA 5M53A 3DTCA 4X2JA 4EK8A 4R7IA 4J53A 4ANNA 3GENA 3OS3A 3PDTA 4KD1A 3MY5A 3LKMA 2G2FA 4C4JA 5LVOA 3RAHA 2OFUA 3E92A 4HCVA 1PRYA 4O7WA 1H24A 2YZLA 1JOWB 5AADA 4CV8A 4U0IA 1OITA 3UOJA 2QG7A 1DI8A 4V04A 2V22A 3QWJA 4GMYA 4FT5A 4DCEA 3QZHA 3CTHA 3D94A 4I6BA 1I09A 3ORNA 1U46A 2CSNA 2Y8OA 1YHVA 4AT3A 4E6CA 2OXDA 2XNBA 3MIAA 3FUPA 3CJGA 3FC1X 4U5JA 4ZIMA 2UW7A 4PP7A 1M7QA 2YCRA 4MHAA 4FOBA 5CQUA 4ANBA 2PUPA 2QODA 4ASZA 2HELA 3TJCA 2O64A 2PZRA 4R7BA 3WBLA 2E2BA 5DI1A 4PMMA 4BCKA 1YWVA 2XIRA 3BU5A 3NUNA 1BMKA 3LXLA 4IZ5A 2XM8A 5ANKA 3RPYA 3THBA 4YSJA 2WPAA 2GS2A 1VYZA 2OKRA 2YFXA 4ZTNA 3U54A 2HYYA 2VD5A 4FKUA 2G1TA 5JEBA 4DH7A 4O27B 4IX4A 1YI6A 1GZ8A 2J5FA 3CPBA 4MH7A 4QQJA 2XCKA 4ANSA 4DEIA 3R9DA 2PVYA 3LCTA 3UPXA 3R22A 2NP8A 3C1XA 3I5ZA 4LRKA 5F20A 2Q0BA 3R04A 3RMFA 5K4JA 3UC4A 4ZTMA 3DK3A 3LIJA 4G9RA 5HCZA 2EVAA 4RC2A 2NRUA 5HVYA 3LFEA 2B9JA 3EIDA 4FTKA 5CLPA 2V55A 1GIHA 2Y9QA 1OUKA 3FLZA 5E4HA 4IAZA 3GUBA 1JNKA 4AWIA 4YURA 4FV3A 3VNTA 4FBXA 3R83A 3VQUA 3BYUA 1RJBA 4ZAUA 5M56A 2DS1A 2BTRA 3LXPA 5IF1A 3G0EA 5CU2A 3WYYA 3A7IA 3TG1A 3WIGA 1G8AA 4F6SA 3VJOA 4EUTA 1Q3DA 2QKWB 2UZVA 4G6OA 3OROA 3KGAA 1U54A 5EOBA 4K33A 5M08A 2RFDA 1Y91A 4CVAA 4D0WA 4PDSA 5C4KA 2YJSA 4EWQA 4PX6A 4FVQA 4M3QA 4NU1A 3WILA 4CEGA 4QQTA 5A4EA 2PVNA 1STCE 4NUSA 3MBLA 1WZYA 4RJ7A 1ZZLA 3OTUA 5AX3A 2R4BA 2UW9A 4WNMA 4RPVA 3QTQA 1KWPA 2B9FA 2HK5A 2GHLA 3G33A 2R3JA 4J71A 1AGWA 3MJ2A 3MFRA 3BYOA 4G3FA 2XBAA 2FSLX 4Y72A 1JVPP 2XEZA 3G9NA 4W4VA 3ZM4A 3ZEWA 4O6LA 3G9LX 4IVDA 4L3PA 2IZUA 1ZOHA 3QKKA 5FEQA 3IECA 4UBAA 4C4HA 4YLLA 5JQ5A 3DXPA 1PXOA 3P5KA 5E8YA 3SQQA 3LHJA 3CGFA 4UV0A 5F95A 4FK6A 5HBEA 5ACBC 3UVQA 1Y57A 4IZ7A 3LFNA 5DR6A 1PHKA 3E93A 3NNVA 3CP9A 1IASA 3AMBA 5HICA 4D4VA 5KBQA 3ZC5A 5CAQA 3PG1A 1FBNA 4Z9LA 4F9WA 4OT5A 2H34A 4H05A 2IO6A 3QQHA 4MBJA 3QRUA 4DFZE 5KCVA 2BUJA 4QMSA 4LI5A 4IB3A 4ITHA 3H9OA 1ND4A 2I0HA 3RINA 3TKIA 3EQDA 4MVFA 4FNWA 3R01A 5CXHA 4JBPA 3EQFA 4ZSEA 2J5EA 4QP8A 4DT8A 3LJ1A 3CKXA 4LM5A 4AU8A 2WMVA 4ERKA 5HG5A 5DMZA 3QHRA 3R7OA 3MW1A 1QMZA 4C4GA 3BEAA 3PY3A 2JDSA 4F9AA 3LE6A 3OTVA 5CZHA 3PY0A 4QP4A 1XH7A 4DGGA 3SA0A 4APCA 2OI4X 4EOSA 2VTNA 4HOKA 1P4FA 4WSYA 2C0TA 4IMYA 5TT7A 2QKRA 3ZMMA 3V5TA 5LWNA 1H25A 3AMAA 4ACCA 1ZMUA 2I40A 4A9UA 5HORA 1NT2A 3F3UA 3DJ6A 3FJQE 4HPUE 4Y85A 5HU9A 2OJJA 2QOHA 3ZS5A 3MPAA 1KOBA 2ZDTA 2C3LA 3VW6A 4FUXA 2JITA 4IQ6A 2FB8A 4MBLA 4N70A 4ZZOA 4DFLA 5CF5A 5E8TA 4AN9A 2EB2A 2VO7A 4MK0A 2OJIA 2VWZA 4MXOA 1IRKA 2OH0E 4BCNA 2PYWA 4XV3A 3S95A 4KBCA 2XNNA 1H28A 3ATTA 5BUEA 3VS5A 2PVMA 3FPQA 3HV6A 2X8EA 4LOOA 3W8LA 3ZYAA 4YTFA 2C1BA 2QOFA 2WIPA 3TDVA 5LVLA 5HLPA 2V7OA 2PMLX 5HGIA 5E8SA 1OGUA 3VUDA 4IVAA 4O7TA 3GU7A 4RVTA 5G1XA 1Y8YA 4DG2E 3SRVA 4J95A 4D1ZA 4I41A 4GK3A 5JGBA 3FI2A 4GYGA 5BVWA 3PE2A 4FC0A 4FNYA 4D55A 3I7BA 2X9FA 2BDJA 4IM2A 3GQIA 5GIOE 2XNGA 3E3PA 5EDRA 4GIHA 3QQGA 3MESA 1NW1A 3AC8A 3NZ0A 4PTGA 4ZTSA 5HEZA 4D4RA 3TT0A 2O8YA 4YJTA 3PRIA 2BRBA 4WO5A 4ORKA 2VWUA 2YM8A 4R1YA 4RWIA 3OY3A 2RL5A 3P7CA 5IEXA 2VV9A 4C2WA 1K2PA 5AM7A 5F9EA 3Q4CA 2Z2WA 1IA8A 3I0OA 4XBUA 1ZRZA 4UZHA 3E87A 3G0FA 4FNZA 5JGAA 5DE2A 4CZYB 4IXPA 5L6WL 4AOIA 2V7AA 4AW5A 4G3EA 4RVMA 3O51A 4JLCA 4YU2A 3RK7A 4YUQA 1RQQA 4XG6A 3WE4A 2B55A 4OUCA 4KS8A 3NMUF 2EXCX 4TPTA 1R1WA 5FLFA 5IUIA 5DT0A 4X3FC 3ZONA 5HU3A 3SX9A 4UEUA 3C5IA 4M15A 3EKKA 4YJOA 5K0XA 5IQIA 3Q2MA 4NCTC 5DVRA 4YZ9A 5CANA 2PPQA 1QCFA 2FO0A 3UMXA 2W5HA 4UMTA 2YLFA 2PU8A 2ERKA 4V01A 4LRJA 4F08A 1G5SA 3TWJA 3HRBA 4ZLOA 1YWNA 4AXAA 3PJ1A 2QHNA 4C02A 3DPKA 3M42A 4OTWA 4X6QC 2XK7A 3SOCA 1YDTE 5AFVA 1JKSA 2QONA 2RFSA 3O7LD 3FZOA 2DQ7X 2X6EA 5AM6A 1PYXA 2F2CB 4IEBA 4QP1A 4HZRA 1XBBA 4LGHA 4TNBA 3R8VA 4AT4A 2BKZA 2R3QA 3WF6A 3NNWA 5M51A 4F64A 4RX5A 4M14A 1Z5MA 3BBTB 2QOLA 4RLKA 1HOWA 4LQMA 4ZOGA 2YABA 2ITVA 5CSPA 4O38A 3A8XA 1KE5A 1WCCA 3BV3A 2YACA 4ACDA 3H0YA 3A62A 5HD4A 2PL0A 2JDOA 4Q5HA 2VO6A 1Q8ZA 1WAKA 2PZPA 3KXHA 4KRDA 4EQCA 4OLIA 3IOPA 3PIXA 3R8PA 4F7LA 2FA2A 3DQWA 3VBYA 3UQFA 4D2TA 3QYZA 4TYHA 2BHHA 5EW8A 3VF8A 5F94A 1L8TA 4ZJIA 5CS6A 4DFUA 4WD5A 1OKYA 2I6LA 3EMGA 4OTFA 1PMEA 3P23A 1TKIA 2ITQA 3ENHA 3I5NA 1ZYLA 4K1BA 2C3JA 5FDXA 5EHYA 4FTTA 4NK9A 3P7AA 2QVSE 3I81A 2WMBA 3HUCA 3ZXTA 3ZM9A 4M0ZA 2F7EE 3MY1A 3LCKA 4O0XA 2H96A 4ZLZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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