3F5UA

Crystal structure of the death associated protein kinase in complex with amppnp and mg2+
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
293
structure length
279
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKPPQFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insight into nucleotide recognition by human death-associated protein kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Death-associated protein kinase 1
total genus 93
structure length 279
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3f5uA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3f5uA01
3E8NA 5ETAA 3ODYX 3FZSA 3UO6A 3O8TA 4ZP5A 1CM8A 3AMYA 3O96A 3P86A 4IB5A 3VBTA 5LVOA 4EJNA 4OTRA 3DFAA 4WHZA 2YJRA 3OCGA 3V51A 4RIXB 1BMKA 4L3PA 3TJCA 4YMJA 4OGRA 4B0GA 2WQOA 3UZPA 4IC8A 5FTGA 2X6DA 5JKGA 5H9BA 2I0YA 4CZTA 3ODZX 3DY7A 4CZYB 4IB1A 2GSFA 4MD9E 2A1AB 4RWJA 4QNAA 4FSNA 4F9CA 2R3OA 3KXXA 5A4LA 3LZBA 3MH0A 3BU6A 3FZOA 4KWPA 2VTPA 2IW9A 2PHKA 3JVSA 2YM8A 3DZOA 1UV5A 3K54A 4LRKA 1WBPA 4O0UA 3R8VA 3UMXA 4CKJA 4ZS0A 5AUTA 4JG6A 3EB0A 2QG5A 2X8IA 2ZOQA 3CTJA 3BU5A 3H30A 4KAOA 4O2PA 4UXLA 1GY3A 4N6YA 3VJOA 4CFXA 2OIBA 3LLAA 1OKVA 4FNWA 1M2QA 4PDSA 3O8PA 4LQMA 3W2SA 3KRJA 4L53A 3MJ1A 3SQQA 3V5JA 4RQVA 1SVHA 3DBCA 3PXYA 3O8UA 2JAMA 4AGUA 4YURA 3OT3A 5I9XA 5HI2A 3U54A 2VWWA 3L9MA 2ITZA 3LM0A 4YSJA 3BYVA 3EZRA 3CPCA 4H3BA 2JBPA 4JLCA 2UW5A 2V55A 4JVGA 5H8BA 2BKKA 2AC3A 2PWLA 2Y8OA 3FI4A 3OWKA 5BUJA 3HRCA 2J90A 4IX5A 4AE6A 5M09A 4C59A 4HYIA 3HDNA 2PY3A 2C5XA 2QHMA 5BX0A 4XBUA 2R0IA 3R63A 4L67A 3CPBA 3Q5IA 3EMGA 3R8MA 4JG8A 3TCPA 3TZMA 1DAWA 4FMQA 3KK8A 3F3TA 5ANEA 2B9IA 5EKOA 3ZBXA 2Z2WA 4TYIA 5E1EA 4YBKA 4YUQA 4RJ4A 5FWKK 4YU2A 2QR7A 2XYUA 3FL5A 1YVJA 2O63A 4J52A 4LL5A 3ZRLA 4KNBA 2VAGA 2I0EA 3EHAA 3LW0A 5BNJA 4W9WA 3CTHA 1ZY4A 3PVWA 4ZSLA 2X9EA 2W99B 5L2WA 2XM8A 2BDJA 2X1NA 3EWHA 4AAAA 4AT4A 3F61A 5M4FA 5ANKA 2OK1A 4MYGA 4MWHA 5HVJA 3VULA 4D4SA 4EK4A 3U51A 4QQCA 3PE2A 4YHJA 5EHOA 4W4XA 4FUXA 4U9AA 5FTQA 4FA2A 2QO9A 4QRCA 4PMTA 4E5BA 2PTKA 4RZVA 4FTCA 2I7QA 4ZJVA 1CMKE 4BGQA 5BYLA 3I6UA 5FEDA 3F2RA 1BYGA 3DJ5A 4U5JA 2WIHA 4JXFA 3GEQA 4FTAA 3CBLA 4I6BA 3D5UA 3ORNA 3R2BA 3CIKA 5BVKA 4EUUA 5AAGA 4B6LA 3D2KA 3F3WA 3MB6A 4WUAA 3LPBA 4FIHA 4PPBA 2X0GA 4BKZA 1PYXA 3QBNA 3QQLA 4ZTMA 5IZFA 3UIUA 5CQUA 5DNRA 4J8NA 1Y8YA 3EQGA 1XH5A 4J7BA 5TKDA 2QU5A 3OOMA 5HCXA 5J1VA 2FSLX 3FQEA 3ZYAA 4FEUA 5IQEA 3TI1A 3ID6C 2CDZA 3KN6A 3G15A 3IDPA 4TWOA 5DR9A 5CSHA 4ZMFA 4K9YA 5IQGA 4FTOA 3K5UA 2FGIA 4F64A 3FLNC 5IU2A 2UZOA 3NIZA 3PXQA 2O5KA 2XKFA 5TOZA 4FKPA 4MHAA 3C0HA 2XVDA 4AN9A 4FKTA 4WOVA 1IG1A 3NUAA 4YZMA 4TXCA 4FNXA 1W84A 4EH7A 3IPHA 5DEWA 4QP6A 3E7VA 1OKZA 3KK9A 3IOPA 5FXRA 1RJBA 4WUNA 5AR5A 5K5XA 4BR3A 5I9ZA 3DLZA 4FV3A 3FPMA 4QQ5A 4ZTLA 4RX9A 4AA5A 1ZMUA 4X6QC 3HMIA 3QC4A 3ALNA 4AT5A 4EHZA 1JSVA 3Q4TA 4WKQA 4Z7GA 5JFWA 5JT2A 5E9EA 4F99A 3TDWA 3ETAA 4E5WA 3AC5A 5F9EA 1TQPA 4QMMA 1AGWA 3LCKA 5DFPA 4GEOA 4NTTA 3MJ2A 3KB7A 4LOQA 5IMXA 3MTLA 5L2SA 2ACXA 3KVWA 4FV1A 5L8LA 2VWBA 2W1GA 5EHYA 5HD7A 5ITAA 3EN5A 1V0BA 3I81A 1OB3A 4ID7A 3VUTA 4HGSA 3UVRA 1HCKA 5D9HA 5L3AA 3P7AA 5HGIA 5CY3A 3DXNA 3PJCA 4G3DA 5ETFA 4A4LA 4FKLA 5EM7A 1WBWA 2VU3A 3EQPA 4U42A 4GV1A 3C4EA 4XRJA 5C01A 4N57A 2DQ7X 4FT7A 4FZDB 4JG7A 3UO5A 2GQRA 2X2KA 1PMVA 4YJOA 3FMLA 3GXLA 4IHPA 2HYYA 4D2PA 4FOCA 5DIAA 4O7ZA 4EH3A 1L3RE 4NTSA 3Q3BA 3ZBFA 2I0HA 3ZMMA 4HZRA 4L7SA 2C4GA 3DFCB 3FYJX 5CEQA 4JBPA 1AQ1A 3VBWA 4D0XA 5CAUA 4A9SA 4NKSA 5CSVA 3ZTXA 1P5EA 3N4UA 4M67A 3R00A 3N4VA 3QQKA 2NPQA 1H26A 5E4HA 5HX8A 2BTRA 3UYTA 4YJQA 5CXZA 2HW7A 4NH1A 4LRJA 5IDPA 4D5HA 2RL5A 2YCQA 3FLWA 3PLSA 4FSMA 5J5TA 3BGPA 1K2PA 5BYZA 4EOLA 1H1SA 3ITZA 5L4QA 2R3MA 3BBWA 1DS5A 3IW6A 4GT5A 4RLKA 5LQFA 3RPYA 4JAIA 1OKYA 1OL2A 4FV7A 4DGLC 3DBDA 4MD7E 4FTNA 3R2YA 5I5ZA 3KGAA 2BFYA 3ZO2A 3QWKA 5JGBA 3C4XA 3WF7A 1LEWA 4F4PA 1XH7A 3FKNA 4OAUC 3LM5A 3RK5A 3IGGA 2OJGA 4QP4A 4DH3A 4FKQA 3R9HA 3ZO4A 4FYOA 3S95A 4C2WA 4EWHA 3PA3A 2XIRA 3TEIA 3MIYA 3OHTA 5JH6A 3F2NA 3NYOA 3NUNA 3W2CA 5KBQA 2J51A 1Y57A 4C58A 2Y0AA 4D5KA 3PJ3A 3R1QA 4I94A 1YOMA 5CEIA 1Q8ZA 2ITUA 2RG5A 1H28A 5HEZA 1M17A 4RJ8A 3NNVA 2IZSA 3E8EA 4APPA 3CSVA 2B52A 3Q9ZA 2RFDA 5LMKC 3JYAA 2OLCA 4N6ZA 3LFEA 5IA4A 5EYCA 3OT8A 3GU6A 3NNXA 2JIUA 5HNBA 3R7OA 3ANQA 4TKSA 3EFLA 2J0JA 4PNIA 4O0SA 1K3AA 4AZTA 3C7QA 4NW5A 4O0WA 5CAPA 4YJTA 4DEBA 1E1VA 3QXPA 5AV0A 3W55A 3SV0A 4O7YA 1NY3A 4MCVA 1REKA 4PMMA 2C6IA 4JBOA 5ANIA 3BLRA 3R7YA 4E5AX 3VW6A 1Q61A 3CQUA 2W7XA 4YJSA 2R3JA 2WZJA 3O7LD 4FSTA 5LVMA 4NU1A 4FICA 4EJ7A 2R3GA 4K6ZA 1V0OA 2UV2A 2YLEA 4ZY4A 5LWNA 3AT2A 5HTCA 2YM7A 1OPLA 4BDFA 3MDYA 4HVIA 3MPAA 4BBMA 5ACBC 4CFMA 1JOWB 3WE8A 1PJKA 2R3FA 3KREA 3EL8A 4O21A 3TTJA 3MPTA 4BCHA 5DN3A 5HE0A 4BCOA 5HVKA 3LFCA 2YZAA 1U59A 2GNIA 2GDOA 2W5AA 3HMOA 3MVMA 3ZSIA 4O81A 3QUPA 2FA2A 4CNHA 2YM5A 4DLIA 1Z9XA 3QCSA 4U97A 1KE5A 3W10A 3BYUA 4U40A 1YHVA 2ITQA 3HP5A 3ZO1A 1TQMA 4F63A 1F3MC 2G2FA 4E7WA 3MN3A 3ZUVA 2VTOA 4A9TA 5KMLA 4RIYA 3RM6A 3UIBA 3COKA 3EZVA 3CQEA 2C6LA 4YLKA 3VUIA 3AC2A 3DBQA 4GSBA 3QCYA 4FTRA 2HAKA 4F9AA 2R4BA 2YITA 4HZSA 4Q9ZA 3MFSA 1V1KA 2F57A 2Q0NA 5KHWA 2UZTA 4AA0A 4HGEA 2VNWA 5A9UA 3P78A 4IQ6A 3P7BA 1NW1A 4R78A 3FI3A 4OW8A 5FBOA 4AZSA 1VEBA 4EOSA 4NZWB 4QYHA 2QU6A 4QOXA 4FIJA 5L6WL 3E5AA 2RKUA 3NSZA 3R01A 4AX8A 3OWLA 3A62A 4II5A 2WU7A 2XIKA 1JKTA 2XRUA 5HVYA 3AXWA 3LJ1A 4P2KA 1WVXA 3PPKA 3MFTA 4GG7A 2QOFA 3ZU7A 4EH4A 1J7IA 4ANBA 2XNBA 2H9VA 3OBGA 4RT7A 2YM4A 1OI9A 3E8DA 3PVGA 3W2QA 2VO3A 3QYZA 4AGCA 3F88A 3IONA 2OZAA 5M55A 3D4QA 4AOJA 3MA3A 4BVUA 2PULA 3Q6WA 4XG4A 4A07A 3EOCA 2V7AA 2QC6A 3NYVA 3QCXA 4KIPA 3QLGA 4JDHA 1Q8TA 4MWIA 2W1EA 3BYMA 4ZAUA 4YJNA 4FIGA 5EYDA 3R83A 3HV7A 2CNQA 3NGAA 4IACA 3KXNA 3QKKA 5E1SA 4ANQA 1REJA 4J71A 5CYIA 4RLLA 1H27A 3UBDA 3UNJA 4ASDA 4M68A 5AR8A 4LOPA 2HENA 4QPSA 5E8YA 5L2QA 5A54A 2OGVA 4C7TA 1YDSE 1GAGA 1OIUA 4KSPA 2WXVA 4UBAA 4RJ7A 1J7LA 2UW7A 3UVPA 3H9RA 4JQ7A 4RG0A 3REPA 5HOAA 4DEEA 1OBGA 5AMNA 3R21A 4Q5HA 4X6RA 2QVSE 3GFEA 2UZVA 1RDQE 4MQ2A 3U8WA 3CTQA 3R1YA 3MY5A 1ZWSA 5KX8A 1KV1A 3GT8A 4FK6A 3DK6A 4MBIA 3TM0A 3HVCA 1ZZ2A 5HU9A 4UYNA 4FF8A 2XNOA 3V5TA 2Z7RA 3OXZA 2V0DA 3L9LA 4O96A 4EQCA 5IEVA 2VD5A 4J1RA 5J9LA 4RIYB 4UZHA 3ZFXA 5HZNA 2BPMA 2CNUA 2HWPA 4DF3A 4PL4A 2IN6A 4UWBA 4G3CA 5HD4A 2WMXA 4UMRA 5HBEA 1ZOHA 4AA4A 5DYJA 4XOYA 1H1PA 3TJDA 4KBCA 3UZTA 5M57A 3L8XA 2X7GA 3C5UA 3ZRKA 5EYMA 2F7XE 3F7WA 3PXRA 3G6HA 3C5IA 5IMEA 1TVOA 2Z8CA 4GK4A 5CU3A 5FUTA 4FKOA 1Y6AA 4Y83A 4EYMA 4IFCA 4JRVA 5AM7A 1Z57A 5CI6A 3A4OX 4GRBA 5A4EA 2CKPA 4LV8A 5EDRA 3AG9A 2JGZA 5DT0A 4CMTA 4CQEA 2EUFB 5LMAA 2BDWA 3KY2A 2ITPA 3FMHA 4E4MA 5EDQA 5JGDA 3BWFA 3VWAA 3JUHA 2OZOA 3GP0A 3SRVA 5C8KA 4FVRA 4FSYA 5FDXA 4FODA 3Q9YA 1O6LA 3GGFA 2XM9A 5HG5A 4O27B 1JVPP 1I09A 2PVKA 4NT4A 4E4XA 4KIOA 4LMUA 3FMKA 4GFMA 3OWJA 2DWBA 3L8SA 3VQHA 3R02A 5M4IA 1U54A 4L43A 3E3BX 4Z7HA 5EKNA 3FZTA 3U9CA 4DINA 3RAWA 2X8DA 5KUPA 5F94A 3JY9A 2XIXA 3R71A 5B7VA 5DA3A 5EM6A 2BRMA 2VO0A 4HYSA 5BYYA 2NO3A 3E62A 2CCIA 5BVFA 5IQDA 5IQFA 2CKQA 4F9YA 3BEGA 2YIWA 4G34A 4YC8A 4UMPA 3PXZA 4S32A 4IADA 4OT5A 3KF7A 3QHRA 3CLYA 3ZXTA 4BI2A 5FEQA 3UNZA 4YTFA 2A27A 4YBJA 4D1ZA 3ZOSA 3OROA 4CGAA 4M69A 4S34A 3D9VA 5CVFA 4D55A 2ESMA 5EDPA 4BBEA 1UKIA 4C34A 3UP7A 5GIOE 2Y9QA 3OG7A 4FKIA 5FDPA 4BZNA 1ZYCA 5ANJA 4Z16A 4G1WA 4W8EA 2VV9A 4IX3A 4DGNA 5J5SA 3KQ7A 2W9ZB 3CS9A 4AFEA 1JSUA 2VX1A 2VTSA 4CCBA 4H39A 2VO7A 3C51A 1MQ4A 2OJJA 4JX3A 4TT7A 3SDJA 1P14A 1YXXA 4MXOA 5EM5A 4C2VA 3HA8A 3ZDIA 4E1ZA 4EZ5A 3OW4A 3IGOA 4J8MA 4BDDA 4L44A 3AT3A 3VO3A 4AW1A 3LCTA 4U8ZA 2OJIA 3OC1A 3DNDA 5B0XA 2C6DA 2ITWA 3NCZA 4WNOA 4YO6A 5EW8A 3PY0A 4QTAA 1JPAA 3I5ZA 1RQQA 4FSWA 3BIZA 3QUDA 3LE6A 1PRYA 5GZ8A 2HZ0A 5K0KA 1BI8A 4ERWA 3R6XA 3KMMA 2XBAA 3E64A 4LUDA 3NAYA 3R1SA 4U3ZA 5H2UA 4KRDA 4I4EA 1P4OA 2GMXA 2IWIA 1JKKA 1XBCA 4DH5A 2IPXA 5C27A 4GIHA 4H3QA 1URWA 4NIFA 2PVLA 5I9UA 3TV4A 2OF4A 3SRVB 4X7QA 4WO5A 4JI9A 4C61A 4NCTA 5T6KA 5BVWA 3HEGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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