3FC1X

Crystal structure of p38 kinase bound to pyrimido-pyridazinone inhibitor
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
348
structure length
330
Chain Sequence
RPTFYRQELIWEVPERYQNLSPVSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Evaluating the molecular mechanics poisson-boltzmann surface area free energy method using a congeneric series of ligands to p38 MAP kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 104
structure length 330
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fc1X02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fc1X01
4XCUA 3OCSA 3QL8A 4F1TA 2W1EA 5HHWA 4A06A 4MCVA 3MH0A 4RFMA 3VN9A 5AM7A 2LGCA 2PVNA 2QG5A 3IONA 3PA5A 3FC1X 3HV6A 4I21A 5GJFA 1XWSA 3V6RA 3V8TA 2WMQA 4L3PA 3E5AA 2UZTA 4V01A 1OBGA 2B9HA 3OG7A 2OF2A 4MF0A 4U5JA 4C4EA 1REJA 5C8MA 4QRCA 3QBNA 3Q3BA 4PDPA 1TQMA 5IZFA 3H10A 3HKOA 2IW8A 2R3OA 3OP5A 4BL1A 1UNLA 4G6NA 3KVXA 5CVFA 2JDVA 5FEEA 4O2ZA 4AGDA 4O6LA 5IH4A 5D7AA 4EEVA 5EM5A 1P4OA 4IXPA 1KUTA 5HLWA 4W9XA 4AT4A 3E8CA 5L2TA 1VEBA 3IW7A 4JS8A 4KRDA 2CCIA 5J9LA 4ACDA 5K4IA 3SQQA 5IQDA 1H07A 3BCEA 3COKA 4X3FC 4XV1A 5E9EA 3KL8A 3POOA 4QMMA 4RX7A 2C0TA 2Y8OA 1E1XA 3MPMA 4EK6A 3ZSHA 1K3AA 4IAYA 3T9IA 2Y0AA 1YOLA 4Q2AA 3DDQA 3FKLA 3TNWA 5CXHA 3EIDA 5LXMA 4QQ5A 4TYHA 4EYMA 4RIYA 3FV8A 3SRVA 2VUWA 2C0IA 5GNKA 5GZ8A 5AAGA 3VS7A 3F3UA 3IG7A 1J7IA 4GRBA 4JIAA 3MTFA 1ZZLA 3CTQA 2XIRA 1H8FA 3CXWA 5CT7A 3NUUA 2JD5A 3D5UA 3IDCA 1STCE 1H1WA 3H3CA 5FDPA 5GIPE 3BV2A 5LVLA 2QQ7A 4ASZA 2VWIA 4RZWA 2GHGA 5EYMA 2XK9A 4BCKA 4QP9A 5EQEA 2W4KA 3GU7A 3MIAA 1H0VA 3NCGA 3IW8A 4ZIMA 3LFEA 3R7UA 4E4LA 1YDTE 3EZRA 3CLYA 3O50A 1YXXA 2AUHA 3LHJA 4KAOA 3U8WA 4FIGA 4Z3VA 3VIDA 4QTEA 4C02A 3PUPA 3VAPA 4TYIA 2EUFB 4FICA 4ORKA 2VTSA 3CGOA 4FIJA 4IEBA 2OW3A 5HTCA 2PVRA 1FPUA 3VO3A 5AA8A 4R3CA 2VX3A 4HJOA 5HCXA 3DAEA 5KE0A 2WTWA 1YDRE 3DKGA 2XKCA 2OXDA 2BRHA 3ZC5A 1OUYA 5EI6A 5DT4A 4DEGA 1DI8A 1GIHA 1OB3A 2EVAA 3U4UA 2ETMA 3CCNA 4QMVA 3WF5A 3QKKA 1DM2A 4XG3A 4UBAA 4XP2A 1WVYA 4B99A 4BKJA 5KHXA 4RQKA 4USDA 4E7WA 2FGIA 1JKTA 4XG4A 2J0IA 3GI3A 4EHGA 5M53A 4O38A 5EOLA 1ZOHA 4FV5A 4G9CA 1JKLA 4WIHA 5EDPA 2W1CA 2H9VA 4ZSAA 2BPMA 3QZFA 5BNJA 5LVMA 3E8DA 2C6OA 2BDJA 3E92A 1PXKA 1WBNA 3HLLA 5D9HA 4U40A 5DT3A 2V5QA 3GVUA 4EQMA 4EYJA 2QG7A 2WMRA 2YZLA 3DY7A 4MNEB 1SMHA 3VRYA 2O64A 4EBVA 2QR7A 3ZYAA 4NM5A 3EMGA 4C4JA 2C3LA 3B2WA 3WE4A 4BCMA 1UVRA 3PSDA 4FEUA 4UZDA 3EN7A 3DTCA 2EXEA 4RVKA 2XBJA 2QC6A 2PE0A 2HZ4A 2PUIA 1S9IA 3FPQA 4UX9A 3IDBA 3MWUA 5GJGA 3D5WA 3UMWA 3OBGA 4CVAA 3NMUF 3FI3A 4FSMA 5AR8A 3QQUA 2GTNA 5BVNA 3QD4A 3EJ1A 4TNBA 4QMPA 3O7LD 4IAKA 2YWVA 4O7ZA 4N6YA 2QOIA 4AW0A 2GPHA 5EKOA 2R3HA 3KU2A 4DINA 2OJ9A 2LAVA 4IX3A 3QALE 4AZSA 5M4CA 3R9NA 2OBJA 3C7QA 4AOIA 1ZYSA 2VTHA 4WG3A 3ZH8A 3GGFA 4IX6A 4PTCA 2GTMA 5I3OA 4F63A 4TN6A 2PSQA 4D2PA 3R1NA 5E91A 3EQDA 4CKIA 3FMHA 2B53A 4IWQA 2X2LA 5KHWA 5JZNA 2XK6A 3IQ7A 1OUKA 5EHOA 3W2SA 3WIKA 3NPCA 2CNQA 3BU5A 5IQCA 3ZFXA 4IBMA 4NFNA 3KGAA 5DR9A 5HG8A 1Q8WA 4YURA 3ODYX 3TV7A 4AW2A 5IQBA 4IACA 1T46A 4ZS4A 5M08A 3V04A 3GNIB 2YA9A 2BAJA 3F7WA 4L7SA 1J1CA 3ACKA 3F3WA 5CEQA 3VS0A 3W1FA 1OECA 3O7LB 4RZVA 4YZ9A 3ALNA 3RCDA 2UUEA 4HNIA 2PZYA 4IVAA 1H28A 4FTJA 5BVKA 3WYXA 1IA9A 4NM3A 4NKSA 3BE2A 4XG2A 1AD5A 2YN8A 3MVJA 3QCSA 3UGCA 1Y8YA 4TL0A 5FG8A 1PXOA 5BUIA 1UU3A 3ZLWA 4LL5A 1P5EA 5GINE 3DQXA 3EN6A 5AR3A 1BLXA 3FXWA 3ZO4A 4BYJA 3FZRA 1U4DA 3EYHA 2YCRA 1IA8A 3WF9A 4YPSA 4C4IA 2OH0E 3LQ8A 4F6SA 3ZCLA 4TTHB 3KY2A 5J1VA 3GC9A 2UZWE 2WTIA 3DPKA 4HZSA 3R0TA 2X8EA 2VO6A 4IX4A 3ZFYA 3TEIA 1Q8YA 1Q3DA 3F2NA 2PVLA 2BR1A 3ZBFA 3KMMA 3LZBA 4KBKA 3VS1A 2O3PA 4ALUA 5CS6A 2V62A 3LM5A 3V5LA 1JPAA 4F64A 5LMKA 3ROCA 1Q61A 3RPVA 2XCKA 2GHLA 1PMEA 4B0GA 4BBFA 4LMNA 3A8XA 4KSQA 3NW7A 5CNNA 2X7OA 3PXKA 4GJ3A 1WAKA 4EOOA 4QYHA 5E8XA 1YXVA 3F7ZA 4H36A 4F7JA 1SVEA 3ATSA 1IEPA 3HAMA 4FIIA 1URWA 3M2WA 2GS2A 4CYJA 4ZTHA 4G31A 4HYSA 3I5ZA 1TQPA 2YFXA 4MXOA 4MNEA 1BX6A 1HCKA 4USFA 4O0YA 1H08A 1R0EA 2JBPA 3AC3A 3S95A 3JY9A 3VUKA 3T8OA 4JL9A 4GL9A 2C5NA 2XYNA 4GS6A 5DN3A 5ETFA 2I7QA 3HRFA 2CGVA 4G6OA 3N4VA 3R8PA 3LFNA 3ZBXA 2RSVA 2HWPA 4C33A 2H34A 4IVBA 3G0FA 4R78A 4PY1A 3KVWA 1PHKA 4FSTA 2QOFA 3F61A 4EH9A 4QMXA 4O1OA 3LFCA 4ERKA 4YZBA 4D1XA 4YJOA 4QP4A 4PMTA 5HGIA 4IB1A 3WYYA 4E6AA 2QOOA 3UIBA 1XH4A 3MB6A 3UJGA 3UPXA 3H9OA 4F6UA 4LRMA 2HXLA 4PF4A 2H96A 5IUGA 3GC8A 2CJMA 4E26A 4AG8A 4X3JA 3P7AA 4CEGA 3I6WA 3MH3A 3COMA 2GCDA 3V5QA 2YDKA 5JZJA 2C0OA 2R64A 4E73A 5I3RA 3EQPA 4C36A 5CEPA 4FKWA 2ITOA 2YERA 3Q4UA 2X0GA 4OR5A 4KD1A 4XG8A 4QMNA 4EQUA 3FKOA 3QRUA 2Q0NA 3VWAA 5AUWA 4R7HA 3TZ8A 1PKGA 3LXKA 5HLPA 4FGRA 2IN6A 3ANQA 2G2IA 4IADA 3RK7A 4JRVA 2UW8A 4WA9A 2FA2A 4B8LA 5BPYA 4LV8A 3VQUA 5KX8A 2VNWA 2YDJA 2W5HA 4Z55A 4BHZA 4FT0A 2ZV8A 3QGYA 3ZEPA 5TT7A 2W06A 2B1PA 2EWAA 3OY1A 4ZTLA 5HU3A 4ZTRA 3FJQE 2Z60A 3QRJA 2VTTA 3ZUVA 5ETCA 4JOAA 2VTIA 5HVYA 1I44A 5K9IA 5DPVA 3REPA 4BZOA 3ALOA 2GNIA 4E8AA 3E8EA 3F3VA 4YZNA 2XIKA 4OW8A 2B9JA 3SD0A 3R30A 3M11A 2PVKA 4L3JA 4C3RA 3NLBA 4PDSA 2PL0A 4WSYA 3TZMA 3TIYA 4FKQA 5AP0A 3LCSA 4MQ1A 3U87A 1IG1A 3MYGA 4C62A 3QD0A 1RDQE 4EOJA 3ELJA 1WBSA 2CCHA 2VTRA 5BYZA 3QUPA 3ZMMA 1M2QA 4CTBA 3ZUUA 1ATPE 2ZB0A 4I6HA 4CFWA 2BDWA 4DH7A 4JRNA 3KREA 2YLFA 3LXPA 3BU3A 4D55A 4G3FA 3HGKA 4P2KA 5IEXA 1B39A 2PMIA 3FQEA 5H8GA 2VWVA 5ICPA 4OTPA 3VS6A 2JC6A 4LM5A 1GZNA 3A7FA 3H30A 4ZJJA 1SM2A 2OIQA 3WZUA 4AUAA 2OJIA 4II5A 3GCPA 2OH4A 1ZMWA 4U9AA 4W4XA 5L2WA 4P5QA 5FXSA 2GNLA 2C5XA 2HW6A 3F3TA 2YJSA 2IZUA 4XP0A 5AEPA 4CCBA 5FXRA 4Y8DA 4YTIA 3PJ8A 3ULZA 4BKYA 5DLSA 4FTOA 1A9UA 3F5XA 1MQ4A 4FNWA 5H8BA 4O84A 4BCJA 4D9UA 3WZDA 4CMTA 3LJ1A 4FKLA 1YHWA 3QA0A 4KKGA 3VC4A 5CEMA 1DI9A 2XRWA 3P9JA 2WU7A 3R8ZA 2OJFE 2GU8A 3G6HA 3PA4A 4FG7A 2VTNA 3FSKA 5HE1A 2CNVA 1E1VA 2Q83A 2HELA 4R5YA 3L9MA 5ETIA 5IA1A 4YC6A 1UA2A 3OS3A 1KOBA 4GKHA 3CS9A 4FVPA 4FTLA 3LQ5A 2IVUA 4DG0E 5CNOA 4BRXA 5FTGA 4O82A 4FZ6A 5KMMA 2REIA 1O9UA 1OL2A 3FL4A 4MD7E 3HUCA 1T45A 4G2FA 4DITA 1OL5A 4AGCA 3GFWA 1IR3A 3W32A 2Y4PA 1UWJA 3CKXA 3MVLA 2J0LA 4S33A 3E87A 4WO5A 5EI2A 2Y4IB 4AA0A 2YIYA 4QOXA 4GIIA 1YHVA 3NVMB 3AC5A 4OTDA 4KIOA 2C6EA 4RIWB 2W1FA 2UW0A 4ACMA 2JIUA 3H4JA 2EXMA 3UVQA 3L9NA 3S0OA 2W5BA 4CLIA 4I93A 4LG4A 1NW1A 1OBDA 4E3CA 3ETAA 3F2AA 2A4LA 3L9PA 3BHUA 3NX8A 5EYCA 2OU7A 2UW5A 3ZLXA 3L8VA 1R1WA 4RJ3A 5H8EA 1W82A 5C01A 4PNKA 3DAJA 4N57A 2HENA 4HGSA 4D2TA 2UV2A 5J5TA 3KA0A 1M14A 3OWJA 3IPHA 4XLVA 3WARA 2BVAA 1Q99A 5J7HA 1O6KA 4QPAA 2F57A 1ZAOA 2CGUA 3R7GA 4Z9LA 3LJ0A 3K5VA 5L8KA 1YQJA 5A4LA 4RIXB 4FIHA 2EB2A 3OCBA 4FT7A 2E9NA 3TUBA 3OXZA 2C6KA 2XRUA 4HVDA 3M1SA 3VBXA 1HCLA 2PVFA 3LFDA 3MH2A 5L6WL 3FZPA 4XG7A 3E88A 4MAOA 4XP3A 3ZRMA 4F0GA 4S2ZA 3VBQA 2ITYA 4Z7HA 5A4TA 4ZY5A 4HVGA 2ITQA 4RC2A 3BYMA 4BIBA 4NCTC 3VUMA 3ZM4A 2CMWA 2ZV2A 4ANLA 2FH9A 2J0JA 3RNYA 3EHAA 5HLNA 4LGGA 5HBEA 4IMYA 3UQCA 1JLUE 3BIZA 4I22A 4WKQA 5LVPA 1K9AA 2PE2A 1KE8A 1YWVA 2XCHA 4F6WA 3FLYA 3VUDA 4BI0A 4DCAA 2R7BA 1BL6A 3CKWA 1SYKA 4FK3A 4ACCA 1P14A 4J52A 4CT2A 5CAOA 4NFMA 3K54A 4GT4A 1CKJA 3BLRA 2QKRA 5BUEA 1NVQA 2QONA 3BLHA 5DEWA 1W98A 2XIZA 1Q97A 4BDCA 5L6PA 1QPDA 2ITVA 3G9NA 4EH7A 4YLLA 4AACA 5FEDA 4ONAA 3HRCA 3L8PA 5AP1A 5HZNA 4O0XA 2ITXA 5AFVA 3PWDA 4FKRA 3OUKA 1XQZA 4QP6A 2WO6A 2C1AA 3V3VA 4OTIA 2W4OA 1FVTA 3BX5A 3CD8A 3DFAA 4TYEA 5HOAA 4EH4A 5AR4A 4ASDA 4IVCA 5IUIA 4A07A 4BDDA 5A6NA 4GKIA 5AAEA 1U59A 2XB7A 3Q4TA 4KWPA 5JFWA 3TNHA 5C27A 5FBNC 4N4SA 4JAJA 4WG4A 5C03A 3Q4ZA 2VGPA 4J71A 1IAHA 3UO4A 2RF9A 4K33A 1F5QA 4K11A 4C37A 4TWCA 5AP5A 2I40A 4IM3A 3RPYA 4M69A 4BDHA 5HU9A 3A61A 3PXZA 1ZMVA 3JUHA 5H2UA 4G16A 5AA9A 3FDNA 2YABA 5C8NA 2VWBA 3FMNA 3WF8A 1WBOA 2ZM3A 2YCSA 4DEEA 3DA6A 4DF3A 4E5AX 2F49A 5E8YA 3GBZA 1BKXA 2FB8A 4FV6A 3AC4A 4KINA 3ERKA 3HEGA 2PZRA 2PUUA 2PVMA 4J7BA 5HESA 2R4BA 3O23A 3MBLA 4MXAA 3DZOA 1TVOA 4IWOA 2G01A 4H3BA 3RK5A 2OI4X 4I5PA 1NA7A 4FZDB 3POZA 5J7BA 5J9YA 2C6IA 4W4YA 3SG9A 1URCA 4EK5A 1OPLA 2DUVA 5FXQA 2A27A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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