3FMDA

Crystal structure of human haspin with an isoquinoline ligand
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KGPVPFSHCLPTEKLQRCEKIGEGVFGEVFQTIADHTPVAIKIIAIEGPDLVNGSHQKTFEEILPEIIISKELSLLSGEVCNRTEGFIGLNSVHCVQGSYPPLLLKAWDHYNSTKGSANDRPDFFKDDQLFIVLEFEFGGIDLEQMRTKLSSLATAKSILHQLTASLAVAEASLRFEHRDLHWGNVLLKKTSLKKLHYTLNGKSSTIPSCGLQVSIIDYTLSRLERDGIVVFCDVSMDEDLFTGDGDYQFDIYRLMKKENNNRWGEYHPYSNVLWLHYLTDKMLKQMTFKTKCNTPAMKQIKRKIQEFHRTMLNFSSATDLLCQHSLFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Human Haspin with an Isoquinoline ligand
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase haspin
total genus 112
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fmdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fmdA01
4L9IA 2XH5A 3R9NA 4NZWB 4B6LA 4YPDA 2QOFA 2B9IA 3WF9A 3M42A 3DXQA 3GC7A 4RC4A 5AM6A 3GCQA 2RSVA 4C2WA 2O8YA 4Z9LA 5H8BA 5LOHA 4N6YA 4O7RA 4C02A 4E4MA 3KRXA 3HV7A 4AZTA 4EHZA 2VTSA 2OJIA 4Z16A 3PSBA 5CX9A 5AWMA 4WSQA 5M53A 3CEKA 4DINA 4G6NA 1YKRA 3WZJA 1IAJA 2R7BA 4C61A 4FTUA 1FVVA 2CGXA 1YOMA 3UE4A 3ITZA 1F3MC 2OWBA 4FZFB 5EKOA 5M4FA 3DKOA 5KBQA 2QOLA 4ASZA 4QMWA 4KINA 4WHZA 1OKYA 2HZ0A 2A1AB 2R5TA 3HP2A 4M0ZA 2CN8A 4FL3A 4C62A 1M2QA 2IVTA 3DY7A 3WZKA 4PDYA 4H3QA 4N70A 2JFMA 3IPHA 4F7LA 5F9EA 3EB0A 4XV1A 5FXRA 2UV2A 3OWJA 3V51A 3BU5A 4X3JA 3FAAA 4D2TA 2ZB0A 2BZIB 3EN4A 3A8WA 5CF6A 3D5VA 4DHFA 4NCTC 3W2PA 3Q2JA 3C5UA 3BE2A 2J51A 5IMXA 3R8ZA 4RQVA 2SRCA 3ANRA 4UMRA 1QPCA 3NMUF 3DJ5A 4KRCA 3KN6A 1CKPA 1K3AA 4WG3A 2C6EA 4E6CA 3LKMA 2XKEA 3QGWA 4Z55A 2REIA 4TWOA 4JIKA 3OXTA 4QRCA 4G34A 4RRVA 3WF7A 2V5QA 4L00A 3HNGA 2BZHB 4QPSA 4L8MA 5IH4A 5B2LA 1Q4LA 5IH5A 4ANMA 3A4PA 5J1VA 5ANKA 3QHRA 1I44A 5HIEA 2P0CA 4AFJA 3QTQA 4RX7A 1W0XC 4EQUA 3MDYA 2AUHA 3ZH8A 4EWHA 2GS6A 4XBRA 3FZPA 4QMSA 1JPAA 1ZOHA 4XCUA 3T9TA 4FG7A 5GJFA 3TI1A 1BKXA 4O7NA 3R22A 5EOLA 2WKMA 2XRUA 3E7OA 4IBMA 1ZMVA 5J9YA 5KHWA 3ZM9A 3DAJA 3O7LB 4QP3A 4OBOA 3LCSA 2UW9A 1PRYA 2XNEA 4V0GA 1PHKA 2E9VA 4Y5HA 4JG7A 5EW8A 4PX6A 5HG5A 5DOSA 4ZJIA 2O65A 3UG2A 3BELA 4JIAA 3OMVA 4FSUA 3I6WA 2UW4A 3E5AA 4J8NA 5TE0A 3OHTA 2YLEA 3SKCA 1OECA 4HJOA 1NVRA 3GU7A 4KSPA 4KAOA 2ONLC 1Q5KA 2BUJA 4ZTHA 2B9HA 4MAOA 2F7ZE 3W10A 5TF9A 3ZEPA 1UWJA 2X81A 2IVUA 2YAKA 3A61A 3NEWA 3WYYA 4D55A 1JKLA 2R0UA 4GT5A 4RX8A 1VR2A 3GUBA 5T6KA 4AE6A 2X39A 4F63A 4QQ5A 3ZO2A 4RJ6A 2GNHA 3FLQA 5CSPA 2X8DA 5HHWA 3UZRA 5JKGA 5CT0A 5HZNA 3NIEA 4Y5QA 5HG9A 2X1NA 2JDOA 4IAFA 5AAGA 2ERZE 4QMLA 4E5AX 4PDSA 5HGIA 4ZS0A 3ERKA 3ORKA 2C5YA 4JOAA 3OW3A 4GFMA 3MH3A 1P4FA 4XLIA 2BAJA 2FB8A 2BFYA 3I5ZA 3PVGA 4IH8A 1WBOA 4OW8A 3EIDA 3FXXA 4G9CA 3KRJA 2NO3A 4GIIA 5M4IA 4EEVA 5CU2A 2WOTA 5DRDA 2X7OA 2QU5A 3KXMA 3UYTA 3HECA 3R7GA 3E8EA 1K2PA 4NIFA 2VTNA 4MQ1A 2BDFA 1H25A 2Z7LA 4BBEA 3FKNA 3BQRA 3GXLA 4P7EA 5AM7A 5AR3A 4AF3A 3F5PA 4ZZMA 4RJ3A 4BYJA 3ZLXA 2VTOA 3MY5A 4F7JA 2RG5A 4CMTA 3TL8A 3TG1A 4JAJA 3OG7A 2VU3A 2OFUA 2HW6A 2QI8A 1XWSA 5FBNC 1J1CA 5A6OA 4CGAA 5ETIA 4HCVA 5A6NA 3DXPA 1WBVA 3DDQA 4X2KA 5CANA 3PA3A 3SXSA 2PVNA 2ZDTA 3JVSA 3Q4CA 3UG1A 2PU8A 4APPA 4DBXA 3F69A 4IC8A 4LV8A 3ZBXA 4XG8A 3O23A 3O50A 5HEZA 2JAVA 4EUUA 5K9IA 2OZOA 1JSVA 4IWPA 4XP2A 3LCDA 4RVTA 1W7HA 4EH7A 4WBBB 3Q4TA 3CGOA 4A9SA 5AR2A 4BDGA 4E20A 3IOPA 3O8TA 4BL1A 3C5IA 3LCOA 2V22A 5IA2A 1YWRA 4AA5A 5BUEA 3NUSA 2YDIA 3AD4A 1GAGA 4FSRA 2C30A 4GJ3A 3IGOA 5JRQA 3QRIA 4OR5A 2ZAZA 2JAMA 2J0KA 5F1ZA 5F95A 1PYXA 2A0CX 3D5XA 3MVMA 4IQ6A 4KB8A 4NWMA 2GNJA 3GFEA 3QTZA 2XJ0A 2GFCA 2WU7A 1DAWA 3QQKA 5FD2A 3LQ5A 3CTJA 4XYFA 1Q8ZA 4FT5A 3L8PA 4NSTA 1WVYA 4MVFA 1PMVA 4OT6A 5CVGA 5IUHA 4KIQA 5CSVA 4FZ7A 5I9ZA 1QMZA 3E87A 4YZ9A 3NRMA 4RFYA 4PL5A 5CAOA 1IA8A 3ANQA 2OXYA 2GHGA 3V5LA 5J5SA 4E6DA 3BHUA 4FIIA 3ORIA 3TKIA 4IMYA 2I0YA 4PUZA 5DT3A 4X0MA 3BGZA 3LOKA 5ANGA 2B54A 3ZOSA 4F6WA 4YTHA 2ZB1A 4FKVA 3RWQA 5AAEA 1GY3A 4KBKA 4X7QA 5IQCA 1TKIA 4FTAA 3PXYA 5AR7A 2EB3A 3EQDA 4DGGA 1OL5A 3R7OA 3F61A 4D58A 2O5KA 5TR6A 4IDVA 3ACKA 3FQHA 4AP7A 4W4VA 3P1AA 5HNGA 1SNUA 3DT1A 2BRMA 1HCKA 3QALE 3H0YA 4FG9A 4WG4A 5L2WA 4BCJA 1UU8A 4BHZA 2A4LA 2WMWA 1YW2A 4D4VA 2B7AA 4B8MA 5CEPA 2X6DA 4QT1A 3QZFA 4F1OA 4PPBA 4CV9A 4DFBA 2WMAA 1Q3DA 2BCJA 2QOBA 3QKKA 3TZ8A 2OGVA 3F3ZA 4MD9E 4AN3A 4O7VA 3BGQA 4HOKA 2XNNA 3FL5A 5IQHA 4XG6A 5FXQA 4BTJA 4Y95A 1J1BA 2W1IA 3KFAA 3PP0A 5GINE 2BIYA 2PVYA 1FVRA 2OF4A 4CT2A 3PG1A 3V6RA 4A7CA 2VNWA 5GHVA 4DG2E 3UOLA 4DG3E 4ALWA 4IX5A 1WBPA 1JKSA 3G51A 3OEZA 1GIJA 3A60A 2B0QA 2OJ9A 3UQGA 2C0IA 3MPMA 4EH9A 5K0XA 4QMUA 1OIQA 2WIPA 2QG7A 4C35A 3TDWA 5J8IA 2UW0A 4DEEA 2J9MA 2PVMA 4L67A 4A9RA 4QMPA 2O64A 3VQUA 2C5VA 2PUUA 4USDA 2YCSA 5LVPA 3VUMA 2ZM1A 3T3UA 1KE8A 5HCYA 2V62A 2O0UA 3CBLA 4J71A 3FJQE 3D7TB 5KCVA 5AX9A 5D7AA 3COMA 3R8UA 2XYNA 4O0WA 5HD7A 4F70A 2R4BA 3TV4A 4BHNA 4FTRA 4K1BA 4U7ZA 5IQIA 4AN9A 2Z7SA 4FUXA 2LAVA 4DFZE 4O27B 5JK3A 5FUTA 4NW5A 4RIWB 2V7AA 3HP5A 4LOQA 5EI6A 5EW9A 2J0JA 3WI6A 5JMSA 2QOHA 1ZY5A 4ONAA 4EZ7A 5D41A 4DFLA 3PPZA 2R3FA 5M08A 2PMIA 3KQ7A 4QMVA 2YIXA 4S30A 3RALA 1KE5A 2BZKB 3ZCLA 3PE1A 3VS2A 1Q8UA 4L43A 2HAKA 3ZTXA 5IQDA 4IB5A 3PXZA 4QO9A 1W8CA 2JEDA 2C1AA 5LVOA 5IA0A 3HRBA 1H1RA 2VTTA 4WNOA 3RI1A 1U59A 3ZEWA 2C6DA 3RBWA 3KXXA 3QLGA 2R3IA 4FUYA 4KBAA 2P2HA 4EWQA 5HICA 5TT7A 4BWKA 1REKA 5AAFA 4AN2A 2HCKA 3ACJA 1Y8GA 5J79A 2GS7A 3F5UA 4MXAA 3QCQA 4S33A 2WNTA 4QTEA 3ZRLA 4D2VA 3AC4A 4ACCA 3OOMA 5EFQA 3B2TA 1YI6A 3EN7A 1YDRE 1Q8TA 1E1VA 3HEGA 3ZDIA 3LLAA 1OPKA 2F2UA 5KHXA 4IB3A 4TL0A 4J8MA 3OF0A 2R3KA 3AMBA 4U44A 5CU3A 4RIYB 3EQRA 4CVAA 3R1YA 3E92A 4O6EA 3BLHA 3PY0A 2FGIA 3BZ3A 4U3ZA 4J7BA 1Q8YA 3N51A 5HX8A 4Y73A 5AUVA 2R3OA 1W83A 3SAYA 5JGDA 3FLYA 2YM7A 4FVQA 2VRXA 5T3QA 4K0YA 2VUWA 4G1WA 1ZLTA 3R63A 4XRJA 3UMWA 3BU3A 3CQUA 2VTIA 1M7QA 1BL6A 3F3UA 4R5SA 3R8VA 3RPYA 3AQVA 2Y6OA 3MTLA 4AW5A 2W7XA 2RGPA 3FLWA 5C1QB 3F3WA 3IQ7A 4EQMA 3CSVA 3R7VA 4KSQA 4YPSA 3NUAA 4QMXA 2V0DA 3WYXA 4FL2A 4UWBA 5AUZA 3WILA 4AT5A 2PSQA 4I92A 4O7SA 3LCTA 2RIOA 5H8GA 4O0SA 4EOQA 5HE1A 3TTJA 4CKIA 1SMHA 1JNKA 4RFZA 2ITZA 2Y6MA 1YHWA 3MI9A 3MVJA 4BB4A 1PXKA 1UNGA 2EUFB 4D0WA 2WMUA 3CJFA 4FBXA 3SV0A 4RFMA 4D28A 3F7ZA 3GOKA 3LJ1A 4IW0A 4EH8A 5KMNA 5EK7A 4I4FA 3S0OA 5A46A 3FSFA 3QD2B 4FT7A 4YBKA 5CEIA 3RAKA 5LWMA 4LUDA 5HOAA 1LP4A 1ERKA 2UW5A 5HIDA 1WBWA 4HGLA 3HV6A 2XK4A 4FA2A 4AQCA 3BPRA 2ITOA 3TT0A 2C68A 2H34A 2QU6A 3OZ6A 3QD4A 2OF2A 1ZMUA 5FP6A 5ANJA 3VBTA 5FXSA 1ZYDA 4KBCA 3KXNA 4AGDA 2W1DA 3A62A 4C3FA 4AT3A 5TO8A 4BWXA 3QTSA 2R3GA 4S34A 1H24A 2WO6A 2GQRA 3COIA 3FBVA 3TZ9A 1M14A 4ZJJA 4U45A 4AOTA 2XP2A 4HVDA 4FTIA 1QPEA 4NTTA 2J90A 5DVRA 4XMOA 3RM6A 4C36A 2WAJA 3GQIA 4D1XA 1J7IA 4FGRA 4QYEA 4BGGA 1NW1A 4AE9A 1ND4A 3LFFA 3LMIA 3Q60A 2ETRA 5FDXA 5E1EA 3QYZA 3OWKA 3O96A 5M51A 5EI2A 1UNHA 3FWQA 5LMKA 4EJ7A 1H28A 4A4OA 4ZTRA 3D83A 4AZVA 1BX6A 3QTXA 3OY1A 2IN6A 2R3JA 4FX3A 4F7NA 3KRRA 2QR7A 4E5WA 3Q32A 3U51A 3WE4A 1WCCA 2OH0E 5DLSA 1H1PA 4G17A 4YJTA 2Y9QA 3NUPA 3CXWA 3HMOA 2P33A 3NW5A 2Z60A 4XOZA 4FNXA 4C38A 2XCKA 5CALA 3SG9A 4ALUA 2IZSA 2VAGA 2R3QA 3C0IA 4UXLA 5C8MA 4KUJA 4U40A 4IB0A 3KCFA 2YM5A 4AZFA 4CQGA 1YI3A 2EVAA 4NTSA 4DGMA 1DAYA 3FXWA 3QQUA 4U81A 2UW3A 5KZ0A 4R3CA 3TNWA 4AGCA 1SM2A 3KF7A 4FKRA 5HE3A 3BWFA 4TXCA 4LYNA 4TWPA 1JSUA 3L9NA 3A4OX 4FTCA 4EOOA 4FSZA 1UU9A 5H3QA 3A99A 3R73A 3LZBA 3TIZA 3RCJA 2XMYA 3ULZA 2F4JA 3HX4A 4RGJA 4R7IA 1B38A 2IG7A 5CU6A 2J2IB 4IC7A 4BDCA 5D9HA 1L3RE 1MRVA 2WOUA 2P2IA 3BRBA 1OVEA 3AC2A 4IEBA 4BFMA 3KXHA 1YRPA 4IX3A 4DFNA 5KMKA 3KXZA 5H8EA 4BWPA 4IZ5A 5L6OA 2W5AA 1PKDA 5CEQA 4FNYA 2UUEA 3GT8A 5BVNA 4I94A 5J5TA 3U4UA 4FV4A 4TY1A 3GQLA 2BKKA 4FK3A 3NW6A 5EKNA 2BRGA 2OICA 4D4SA 3LXKA 3UQCA 3OOGA 4O21A 5L4QA 3V8TA 2CN5A 2UW7A 4I93A 4WA9A 4W4YA 4FKOA 4U42A 4RLKA 3L9MA 4O96A 1UNLA 4FYOA 3PJ1A 5K3YA 5I4NA 4FV5A 4A4XA 5GNKA 4CCBA 3CS9A 3K5VA 5L6PA 3LMHA 1B6CB 3I0OA 1H00A 2EXEA 5C4LA 3OCBA 4FVPA 1BL7A 2XIXA 4BIBA 1Y6AA 3OBJA 3RPRA 3KF4A 3G6GA 3NWWA 3MB7A 3DAEA 2BR1A 4IM2A 4K9YA 4N0SA 4OTPA 3LJ0A 3VS4A 2BAQA 2NP8A 4JNWA 2J0MB 3FKLA 4I0SA 2XIKA 2E9OA 4JDKA 3TKHA 3LFAA 3QA8A 4H1JA 1ZZ2A 4KIKB 4FR4A 3N4TA 4DTAA 3MW1A 3P79A 4O6LA 5FEDA 2RKUA 5CVFA 5J9LA 2PL0A 2VX0A 4RIWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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