3FQSA

Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with r406
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
277
structure length
268
Chain Sequence
VYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNEGHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights for design of potent spleen tyrosine kinase inhibitors from crystallographic analysis of three inhibitor complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
total genus 92
structure length 268
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fqsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fqsA01
4WSQA 3QL8A 3OBGA 2QO2A 1J1BA 5KMNA 1ZXEA 5BYLA 3KK9A 3R8PA 2BCJA 1H08A 5FTOA 3E62A 5CAVA 5JFSA 4O81A 3O7LD 4JR7A 3TZMA 5M56A 1TKIA 3HMIA 1E1VA 3Q32A 4H3PA 4M0ZA 3UO4A 3ZHPC 4HOKA 3LCOA 2FO0A 4A4LA 5CQWA 3R7YA 5FEQA 5JSMA 3Q2JA 4E3CA 3HV7A 3DNEA 2JC6A 3PIYA 4QMYA 4BGHA 5KMJA 4MX9A 5G1XA 3C5IA 3FC1X 5AR8A 4IACA 2UUEA 4I5CA 4YBJA 3PTGA 3ZFXA 5DT0A 3EYHA 3RPVA 4EOOA 1O6YA 2VX1A 1GZOA 3Q4UA 2WTKC 5CTPA 3TTIA 4ZLYA 3F5UA 4E26A 5IQAA 3QAME 4E73A 2HWPA 3K3JA 2QU6A 5J79A 5LMAA 3JS2A 1WBPA 4J1RA 3LHJA 4O38A 5AP0A 4ANBA 4TRLA 3R9HA 4AZTA 2R3QA 3MH2A 1J91A 2OU7A 3QA8A 4ALUA 2OXXA 5IU2A 2XEYA 3KMWA 5AUZA 1WBSA 4I93A 4TYEA 2YJRA 5AM6A 4FT5A 3OOGA 4M12A 1BI7A 4W4XA 1BX6A 1QPEA 5KE0A 3UIBA 2BRBA 3UP2A 3I60A 5HO7A 3ZDUA 2BTRA 1U4DA 2WZJA 2ZOQA 2QU5A 3QRTA 3AC3A 5F94A 1VR2A 5J9ZA 4OTWA 4S33A 5CSXA 5BQ0A 4JXFA 5KKRB 1JNKA 3BLHA 4U42A 3FZSA 5E8ZA 4S31A 2R0UA 4FSTA 2QR7A 3R21A 1M14A 3OMVA 3Q4TA 4I23A 4UV0A 1NT2A 3LLAA 4BTFA 5BVKA 5AFVA 1PKGA 3U4UA 4RFMA 4L00A 4KKEA 4I5HA 5DEWA 4AAAA 2R3RA 3G5DA 4X3FC 2JIIA 4FSYA 3HGKA 4EOJA 3LFDA 5LVNA 3DKCA 5EQYA 3UMXA 2QLQA 4MF0A 5KX8A 4R77A 2OO8X 5CF4A 2UVYA 5C4LA 3ZEPA 3EZVA 1M17A 2W1EA 4FIIA 3FMHA 4FSMA 2XM8A 5DPVA 3HA8A 3OEFX 3M42A 4I3ZA 2PUNA 2XK6A 4NW5A 3A4PA 2XBAA 3MB6A 5GJDA 1XH7A 2FB8A 2UV2A 4JDJA 2E9PA 2J2IB 2JKOA 3DQWA 4IW0A 3UPXA 4KIOA 3RAWA 4D5KA 4U43A 4J53A 2E9UA 4QMXA 4R5SA 3V01A 2JBPA 4QYYA 4YHFA 4KABA 4R3PA 4EK6A 4FF8A 4C3RA 4YJSA 5JGAA 4CMOA 2PE0A 4Y95A 4O91A 3C7QA 1IA9A 3PXQA 3BE2A 2Y6OA 3PJ2A 4NKAA 2VUWA 4OGRA 3C4CA 2RF9A 4BCMA 4U6RA 4E6DA 3EJ1A 3ACJA 3HRFA 4F9WA 3MS9A 4DTAA 4DEIA 1YRPA 5J5TA 3L9NA 5CXZA 4ZS4A 2YAKA 4PL5A 2A19B 3RTPA 5L2TA 2GNJA 2VZ6A 4NM3A 4UMQA 3R7UA 4TW9A 5BUIA 1DAYA 4LMNA 3R00A 5EM5A 4G3EA 5IUHA 4IC8A 4XNEA 1H25A 2ZB0A 2W05A 3CGFA 3G0EA 2Y7JA 4FSZA 3W2SA 4AG8A 3AMBA 2GTNA 4WHZA 4IMYA 4KBKA 4HGSA 4FV7A 5H9BA 2IPXA 1R3CA 2W5BA 2JDOA 4PQNA 5FP5A 3MPMA 4TWCA 4HVGA 3R6XA 4YP8A 4D9UA 3AQVA 5M57A 2E9VA 4C3FA 1J7IA 3GU7A 3UIMA 2G2FA 3PJ1A 1YQJA 4BDAA 1NVQA 5ANKA 3UPZA 5CU3A 4O7YA 5HG8A 5LVPA 4H36A 5JGBA 4RIXB 2OF2A 1GIJA 5IQGA 2DWBA 4AW2A 2WGJA 4JOAA 2BZIB 4RWLA 3RNIA 3S2PA 1Q3WA 3CPCA 2VGOA 3ZUVA 4Z7HA 5FXRA 2C6MA 4GU9A 3EKNA 2WMQA 4IDTA 3KFAA 2JLDA 3A8WA 4A9SA 4FA2A 4MWIA 3LFEA 5D7VA 2EB3A 4FKPA 2VTRA 1Q4LA 4ZJVA 2G2HA 3V6SA 4JBPA 4NKSA 3O8TA 4NU1A 3W8LA 2CN5A 3FV8A 5FGKA 3RWPA 3W1FA 5ITAA 1Q97A 4IM2A 5KBQA 5FDXA 1FQ1B 3BHHA 5IH6A 3N4TA 2EB2A 3MY1A 4QTDA 2PK9A 4KWPA 1J7UA 3GFWA 3KY2A 5IA5A 2W99B 4FT3A 2E9OA 4CNHA 2XIRA 2QURA 3DAKA 1Q3DA 4YHJA 5I9ZA 3PZHA 4HCTA 1QPCA 2REIA 4G31A 3CQWA 1YOJA 1B6CB 1NW1A 1VEBA 2C30A 2YCFA 2IZUA 1AGWA 5CVGA 3SXSA 4YLJA 4DITA 2XIZA 5CVFA 3C4FA 3H4JA 3RAKA 3QTQA 2QNJA 4C62A 5HLNA 4XLVA 1IEPA 3N9XA 3ZH8A 2Z7LA 3E5AA 4JAIA 3V51A 5ANIA 3DBQA 5A3XA 4C7TA 3V8WA 3QZHA 2YIYA 2FGIA 4EOMA 2CLXA 4J99A 3AD6A 4D4SA 5F20A 4JT3A 2WIHA 1DM2A 3TKHA 1JKSA 4M7IA 5ANOA 1G8SA 5FD2A 4TN6A 2C6DA 4F1TA 4FV9A 3S00A 5LWNA 2PTKA 3FLSA 4EONA 3BGZA 1JVPP 2XKDA 4S30A 5IUGA 4L44A 4USEA 4HPUE 3HV4A 1H1PA 3R1NA 4GIHA 4W9XA 4EHGA 5F9EA 3BGPA 3G90X 5C8KA 2C5VA 4YJTA 2ZJWA 2QODA 3ZXZA 4F7JA 4G5PA 4BWPA 2GNFA 5EFQA 3OZ6A 3TUBA 3BBWA 3GOPA 4ACMA 1XH8A 4J7BA 2CKQA 5BVDA 5E8SA 2WQMA 3ET7A 3AMYA 4D4YA 5GIOE 5K5XA 1FVTA 5HTBA 5HICA 4PX6A 4F9YA 4HVIA 4QQJA 1NXKA 1JQHA 3SXFA 4WT6A 4X3FA 3L8VA 1MQBA 3GQLA 3DBFA 1FGIA 5AIRA 3UP7A 1W84A 3F5XA 4I5PA 5CENA 3FMLA 3PUPA 5GINE 4UX9A 5KCVA 1Q8TA 2VTQA 3FPQA 5IA1A 3OWLA 1URWA 5FEEA 3WZDA 4J96A 4XLIA 3FL4A 4L01A 5LCJA 4IC7A 4AFEA 3NW7A 3SG8A 3ZLSA 3R8MA 4FI1A 4YJVA 5K0KA 3TKUA 4FK3A 4D9TA 4BGGA 1W7HA 4C0TA 2VTTA 1OKYA 4XS2A 4HPTE 1WAKA 4R7BA 2RFEA 4RIXA 3V8SA 2B55A 1APME 1JSUA 3JY9A 3P0MA 4HYHA 1T45A 4KUJA 1QPJA 4HNFA 5IQEA 2ZV2A 4PPAA 2R64A 5IMXA 5LARA 5JKGA 3FKNA 1U5RA 1UNGA 2JDVA 4OTIA 2VWZA 1Y57A 5I9WA 1R39A 2X39A 4CRSA 4DGMA 2XNEA 4QNYA 1PMUA 3LXLA 4EC9A 5HG9A 1H26A 3CY3A 3FMNA 2YN8A 3W33A 5ANEA 2VTJA 2BDJA 5FXSA 1PXMA 2IZTA 3A7JA 4LV8A 3TIYA 4AGWA 3HAMA 1FMOE 3QX2A 3C4EA 4PWNA 3BWFA 1NVRA 4EQCA 1PYXA 3TZ9A 4OT6A 2W1DA 4WNMA 2VO6A 4FSWA 4L43A 4XBUA 4KKGA 3ZSHA 4F9AA 4ZLZA 4QP7A 3Q9WA 4Y83A 3ZRLA 3RCJA 3ZU7A 1O6KA 4BKJA 3R01A 3CD8A 3T3UA 5JEBA 3ULIA 5M4UA 2A4LA 3EL7A 2I6LA 4FIGA 4ANQA 2J9MA 4W4WA 3C13A 3F2RA 1XBCA 2C69A 4IVCA 4NEUA 2DS1A 2WPAA 3DTWA 4FKSA 2J0LA 4IM0A 3LKMA 3W32A 4APPA 1KV1A 3HLLA 2GQGA 3LE6A 3WF8A 2IVSA 3GCSA 3ROYA 2ZDTA 1YWNA 3PG3A 4QT1A 5BMSA 3PVWA 2F7XE 4MXXA 3R7EA 1YVJA 4TZRA 1KSWA 2W17A 1Q41A 2QI8A 3LFFA 4GK4A 2VD5A 3NUXA 3FLWA 5GHVA 3HMMA 4FT9A 4EH3A 4G9CA 2XNBA 5AWMA 2I40A 4Q9SA 5HVYA 2JAMA 3D5WA 3Q4CA 5AP2A 3AT4A 3I6WA 4CKJA 2VRXA 2XYUA 5FWKK 3W55A 2ZM3A 5L6OA 5AUWA 2WTDA 2XP2A 4HYUA 2UZBA 5AUYA 2I0YA 5BVWA 3UE4A 4YPDA 5AUXA 3PRIA 4TY1A 3SG9A 2XJ2A 3FLZA 4JBOA 2JD5A 5IEVA 3KC3A 1KOBA 4RZVA 4O7WA 1P4FA 4FTMA 3LCTA 4UZDA 5J87A 3PYYA 2R3MA 4KIQA 4K18A 4TTHB 5AX9A 1GZNA 3A7IA 3E3PA 3FQSA 1MRUA 3MVLA 5CLPA 4UMPA 2YM5A 3DV3A 4R7IA 3HYHA 1ZY4A 3OEZA 2QONA 5CSVA 5DOSA 3QYZA 4A9TA 3O0GA 3ZLYA 3NAXA 4XOZA 4AA0A 2EVAA 3OC1A 5DWRA 5HE2A 3NW6A 3UVPA 2QO7A 2ITUA 2VX0A 5HIEA 4GMYA 2ACXA 5L8JA 3MY0A 2UZWE 4E6AA 5GZAA 3W2PA 3CQUA 2IVVA 4UWCA 4PMSA 2PMIA 3GCPA 4C35A 3I79A 3VUKA 3GU4A 4UXQA 4X6QC 3RP9A 4FKIA 3OW4A 1GY3A 4GVJA 3ATSA 5E9EA 5FTGA 3WIGA 4ZAUA 3MA6A 4ZJIA 3QRUA 4USFA 3FKOA 4H3BA 4CKRA 2PUIA 4C38A 3UO5A 2UW6A 4P5QA 1Q24A 4EH8A 5IZFA 2CNUA 5CAQA 2DUVA 4GS6A 3KK8A 2R3LA 3GOKA 4RMZA 4C8BA 3WF7A 4ZMEA 4WG5A 3FZPA 4EI4A 4JDKA 4F4PA 3ZZWA 1CMKE 2XB7A 3UC3A 5GZ8A 2CSNA 5CEQA 3UGCA 4C4EA 2UZEA 2VO3A 4X2NA 5IQBA 4BY9E 1IAHA 4DCEA 1PMNA 4E8AA 4XG2A 2YJSA 3BHVA 1OIQA 4IE9A 3BLQA 4WRSA 3BYOA 3WIKA 4L68A 4V01A 2XZSA 3TIZA 4MYGA 2X9FA 1WVWA 2C68A 5IA0A 2CCHA 4YPSA 3PWYA 1OIUA 4QD6A 3WARA 3VQHA 4EQMA 1H07A 4DH1A 4XYFA 4QMMA 3P86A 5DFPA 2ITZA 2VX3A 3R8ZA 4CT1A 5IQIA 4TWNA 2J90A 2W4KA 4RRVA 1H8FA 4GRBA 2RFDA 4OLIA 5J7BA 4PPBA 2VO7A 2YM8A 5EW9A 4Z7GA 1OL6A 4ZS0A 5CU4A 3ZONA 3Q9ZA 4CLIA 2EXEA 4R78A 2UZTA 3BRBA 4DEGA 5KMOA 4KINA 3E7VA 4QP2A 3I7CA 3U9CA 1KE6A 3V5QA 3TDVA 1OITA 1XWSA 3LLTA 4F08A 5HOAA 3LQ5A 3BHTA 2HXQA 1Q8YA 2ITTA 2QCSA 3ZXTA 4FL3A 3ID6C 3RWQA 2ITPA 1URCA 2OF4A 1Z57A 2Y4IC 5K0XA 5IEXA 3P7BA 4CZUA 1U54B 1PXOA 3UQGA 4DGGA 4EC8A 3CP9A 5K9IA 5DMZA 3F82A 4DTBA 3M1SA 4KRDA 2WMUA 2J6MA 3LQ8A 4FEWA 2J50A 2XJ0A 3V5LA 5FLFA 4EUTA 3JR1A 4TL0A 1RE8A 1BI8A 4RJ7A 3ZC5A 5EYCA 3KCFA 2WQBA 3U8WA 2JGZA 5HQ0A 2PULA 3G2FA 2BVAA 3FLNC 1B38A 3H10A 3BYSA 3QD0A 4CG8A 4XV3A 3HMNA 4FOBA 5HD7A 3VF9A 4BC6A 5HORA 2EXCX 1ND4A 4G3GA 3ORZA 3ELJA 1QPDA 2J7TA 2CJMA 3FKLA 3IW8A 3OWPA 3UZRA 3NR9A 3KF4A 1V0BA 3D94A 5J5SA 5CNNA 5HE0A 5HIDA 1Y6BA 3KKVA 3PE2A 3DFCB 1M2PA 5D1JA 5HTIA 3N51A 4QYGA 4F6WA 2BDFA 2UZDA 4FV8A 4MD8E 1ZMUA 3WZEA 4BDCA 5DT4A 1XH5A 1FPUA 3GFEA 3AOXA 4O7SA 2QKWB 3ZBFA 3R9DA 3C9WA 1G8AA 4AOTA 3RALA 4B6LA 2XK3A 4NFMA 5LCKA 3PVBA 4E4MA 3PY3A 3BZ3A 4XV2A 5KBRA 4LL0A 4A9UA 2R3FA 3IW6A 3ERKA 1XQZA 2Z7QA 4EOIA 2C0IA 2H34A 3O17A 2JIVA 4DH5A 4DINA 5AP3A 4UMRA 3E8NA 5C8MA 1A06A 1UU8A 2UW9A 3RMFA 3Q96A 4GL9A 4K1BA 2JDTA 5EH0A 3ZZEA 1MRYA 5I5ZA 2OJFE 3NNUA 3GCUA 2P55A 3O2MA 3LOKA 3SOAA 1YHVA 4DG3E 3Q6UA 4XG4A 4G17A 2OSCA 2OK1A 3C4WA 4NM5A 1MUOA 2OKRA 4CFMA 4YURA 1YXVA 1Y91A 2GHGA 5E90A 5AV3A 2OG8A 3DQXA 5AR3A 2RKUA 4UALA 3ZUTA 4I4FA 4J98A 5CALA 5KMMA 3KXMA 3V5JA 1F3MC 4JL9A 5EYKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WSQ A;  3QL8 A;  3OBG A;  2QO2 A;  1J1B A;  5KMN A;  1ZXE A;  5BYL A;  3KK9 A;  3R8P A;  2BCJ A;  1H08 A;  5FTO A;  3E62 A;  5CAV A;  5JFS A;  4O81 A;  3O7L D;  4JR7 A;  3TZM A;  5M56 A;  1TKI A;  3HMI A;  1E1V A;  3Q32 A;  4H3P A;  4M0Z A;  3UO4 A;  3ZHP C;  4HOK A;  3LCO A;  2FO0 A;  4A4L A;  5CQW A;  3R7Y A;  5FEQ A;  5JSM A;  3Q2J A;  4E3C A;  3HV7 A;  3DNE A;  2JC6 A;  3PIY A;  4QMY A;  4BGH A;  5KMJ A;  4MX9 A;  5G1X A;  3C5I A;  3FC1 X;  5AR8 A;  4IAC A;  2UUE A;  4I5C A;  4YBJ A;  3PTG A;  3ZFX A;  5DT0 A;  3EYH A;  3RPV A;  4EOO A;  1O6Y A;  2VX1 A;  1GZO A;  3Q4U A;  2WTK C;  5CTP A;  3TTI A;  4ZLY A;  3F5U A;  4E26 A;  5IQA A;  3QAM E;  4E73 A;  2HWP A;  3K3J A;  2QU6 A;  5J79 A;  5LMA A;  3JS2 A;  1WBP A;  4J1R A;  3LHJ A;  4O38 A;  5AP0 A;  4ANB A;  4TRL A;  3R9H A;  4AZT A;  2R3Q A;  3MH2 A;  1J91 A;  2OU7 A;  3QA8 A;  4ALU A;  2OXX A;  5IU2 A;  2XEY A;  3KMW A;  5AUZ A;  1WBS A;  4I93 A;  4TYE A;  2YJR A;  5AM6 A;  4FT5 A;  3OOG A;  4M12 A;  1BI7 A;  4W4X A;  1BX6 A;  1QPE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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