3FZOA

Crystal structure of pyk2-apo, proline-rich tyrosine kinase
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
272
structure length
262
Chain Sequence
IAREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural characterization of proline-rich tyrosine kinase 2 (PYK2) reveals a unique (DFG-out) conformation and enables inhibitor design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
molecule keywords Protein tyrosine kinase 2 beta
total genus 81
structure length 262
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fzoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fzoA01
3DDPA 4ZSJA 1JKSA 2QOBA 5CAUA 3QQLA 5L3AA 3KB7A 3ZXZA 5E8SA 1K9AA 5CLPA 2VNYA 3ZDUA 5CX9A 3W2QA 4A4LA 3O71A 1ZZ2A 4DEBA 4ZTLA 3PXYA 3DBFA 4FZFB 4L45A 5FDPA 3PJ8A 5EOLA 4E4MA 3R9DA 2RF9A 3SXFA 4DCEA 2YWVA 2KTYA 3JR1A 5IU2A 2BVAA 2R3PA 4JDHA 2PVHA 4LI5A 5K9IA 1H27A 2WOUA 3CJFA 1BMKA 4U5JA 2UUEA 2XJ0A 3H10A 4G9CA 1KOAA 3HRFA 4RC2A 3UZRA 1OB3A 5KZ0A 4JBVA 4V0GA 3QQKA 3R8VA 3WIKA 5IH6A 2C6LA 2BKKA 5IQHA 4BKZA 4J99A 4IWOA 4ZZOA 2A1AB 4R7IA 3E92A 3HP5A 3QTSA 5L6PA 4IAAA 5C4KA 1X8BA 3AMBA 3K54A 3PXRA 2CHLA 3QHRA 1JPAA 3DOGA 5AUWA 3BV3A 3V3VA 4DAWA 3D5VA 5GNKA 3RAHA 2PWLA 1Q5KA 1FGKA 2XF0A 3BU5A 3MYGA 3RGFA 3VS7A 4E5AX 5AV2A 3C4WA 3R1QA 4GUEA 2W17A 2QR7A 5L2QA 4CXAA 2X2LA 3CKXA 4FKJA 1O6KA 5AP7A 3FL4A 2J2IB 3MY5A 2YJSA 4KB8A 4KWPA 4R8QA 3ZM4A 4R1VA 4DT8A 3TV4A 4ZLOA 5TKDA 5I9ZA 4G3EA 3RKBA 4GMYA 4ZZNA 3ITZA 2PMIA 4BI2A 4ZLZA 1KWPA 4ACMA 1CKJA 4RJ6A 3OCSA 4PPCA 4ASEA 2QC6A 3MI9A 5ACBC 4EH9A 2DWBA 5FM2A 3PA4A 4QMQA 3VUDA 2YAAA 3BLHA 4JRVA 4TWNA 1ZMWA 5A3XA 5KZIA 3OWJA 3ZFMA 2ZM3A 3QWKA 4AF3A 3L1SA 4I5HA 3MVJA 4AT4A 4OT5A 4U42A 4CKIA 5HI2A 4ZLYA 5B7VA 3A7IA 4FSTA 5LVPA 4DH3A 2OSCA 3EQCA 3W32A 4M0YA 4FI1A 2XZSA 3BYOA 3MIYA 3CCNA 5H3QA 4O7NA 3BX5A 5TO8A 3HMPA 1DAWA 2Y4IB 3DA6A 4D4VA 2YIWA 5AUVA 3VBXA 4FEUA 4X6QC 2ZVAA 3BHUA 3U6IA 4U97A 4PV0A 4NT4A 3SG8A 3D83A 2PULA 3IPHA 3OMVA 4FK3A 3FE3A 5AV3A 1BYGA 2RG6A 4OTQA 4BF2A 2QHNA 3CP9A 3FI3A 4DT9A 3WI6A 5DRBA 3NS9A 4EWHA 3E3BX 3AD5A 3O0GA 4O1PA 4AX8A 3M2WA 5M51A 4ZTSA 4UEUA 4WRGA 2X2KA 3RPVA 3IDPA 2JD5A 4EOSA 2WTDA 4BDAA 5HO7A 4CRSA 1T45A 1JKLA 3BU3A 3ORIA 4X3FC 3WZDA 4AP7A 4D4RA 1OPLA 4WRSA 5B2KA 5IA3A 4D5HA 3FMLA 4K8AA 3KRJA 4LGDA 1PXOA 2B54A 2GU8A 4IMYA 4HYIA 3UIXA 5L4QA 1YI3A 2C6TA 4IW0A 4XV2A 5CSWA 2DYLA 4JDKA 4ZAUA 2R3JA 4OAVB 5HCYA 1OL1A 1S9JA 4ZJIA 1NA7A 3ZCLA 3KXHA 4BDEA 3LCOA 3LFSA 4O27B 5EDQA 4F1TA 4A7CA 4UALA 4XV3A 5CNNA 2Y4PA 3LFCA 4PDYA 4RLLA 2GMXA 5EW9A 4F70A 3NVKI 1BL6A 4WG5A 4WNOA 4MH7A 1WBSA 2ZJWA 4JL9A 4P4CA 4FSNA 1SVGA 3IOKA 5EFQA 4WSQA 3MPTA 5EHYA 3TT0A 5FTGA 3D2IA 4KKEA 4IBMA 4YJUA 4C58A 4DYMA 5AJQA 4KINA 5HU9A 3PWYA 4YBKA 5ITAA 2PYWA 5HQ0A 2ACXA 3EN6A 4FSRA 4I0TA 3BE9A 5AP3A 1YDRE 4JLCA 3GU4A 3SW7A 2VTNA 3IG7A 4S33A 4JVGA 5ANEA 1MRVA 1ZXEA 4DFNA 4GFGA 4E20A 2Y7JA 3TNQB 4G3FA 4PPAA 5KMLA 4FYNA 3TJCA 2JBOA 3OS3A 1QPCA 2FSTX 2W1CA 4RX8A 4PP9A 1ZMVA 3MFRA 3MESA 4WNKA 3PLAE 4BDGA 2C30A 1BKXA 3ORKA 4K77A 1U4DA 5AV4A 2VX3A 4X3FA 4Y85A 3ZUVA 4FVRA 3PYYA 3F3ZA 1H1RA 2X8IA 3FI2A 3NCGA 4MXOA 5E1SA 5EDRA 5FEEA 4DFXE 3BV2A 3PXKA 4EEVA 4RX5A 4IAYA 4FIHA 5D11A 2EXCX 4IM0A 2UZDA 3BGQA 4WNPA 3Q04A 5GZ9A 5A4LA 4KABA 2QLQA 4O96A 2J0LA 3QCYA 4W4YA 3UG2A 3ZRMA 3HA8A 2Z7RA 2X0GA 3CEKA 4GJ2A 2OI4X 4UZHA 3SX9A 5F9EA 3FEGA 3PPZA 3I7BA 5HE1A 4J1RA 1IASA 1M7QA 5FXRA 1WZYA 3C50A 3BGZA 3A2CA 4C4HA 5HX8A 2NRYA 3T9TA 3R1NA 1ZY4A 4EYJA 2OLCA 5EHLA 5AEPA 4DTAA 3QGWA 1STCE 3VJOA 4IM2A 3AC8A 2P4IA 2WTCA 3C4FA 2QI8A 4YC3A 4AACA 1H07A 2W96B 5L2WA 5CU0A 3KKVA 2QVSE 3E8EA 3RPRA 5AUUA 5M57A 4C0TA 2IW9A 3PVUA 4RX9A 4JBOA 2QD9A 3HMNA 4JQEA 3Q32A 3OW4A 2VV9A 3ZDIA 3KU2A 2C47A 2JEDA 1FOTA 3L9LA 4FKGA 2GNIA 3IW7A 3BQRA 1OL5A 5CEIA 2R0IA 4C2VA 4AGDA 3EL8A 5GZAA 3FMMA 2WB8A 3BIZA 3CY3A 2WEIA 3VS3A 4QMVA 1L3RE 4EUUA 3O96A 4FTMA 4FSYA 2X7OA 4LV8A 3LAUA 4ZTMA 4EH6A 4FTOA 5E8TA 2Z7LA 1XJDA 2YJRA 4K18A 1KE5A 4EQMA 3WF5A 3NUYA 3HNGA 1JVPP 1PKDA 4TY1A 4AE6A 2W9FB 2VTJA 3GNIB 4U8ZA 2FYSA 2ITYA 4E93A 4J8MA 3RAWA 1XWSA 2YERA 4PTEA 2JLDA 1CM8A 1MRYA 3FLYA 3MWUA 2QOKA 2YABA 4QMXA 4XEYA 5AM7A 3MH2A 1JQHA 3DXQA 2VTSA 3NRMA 1M2RA 4RZWA 4EH5A 1BUHA 4YTIA 4FE2A 1R3CA 3CS9A 4U9AA 5IA1A 5JT2A 4GV1A 5HE3A 3NW5A 2XK8A 4Z7GA 2DS1A 2ITNA 2Z8CA 5AIKA 3D0EA 4G17A 2E9UA 4KIOA 4LQMA 3DJ7A 5L2TA 2PMOX 2H9VA 1VR2A 1F3MC 3A7HA 3NW7A 3OF0A 4XV9A 4AQCA 3DBDA 4PMPA 3SD0A 5I3RA 2C6DA 3UTOA 3WF9A 3A7JA 3D9VA 3C0IA 4RWJA 4J53A 1JSUA 2W9ZB 2HK5A 4OUCA 3RK9A 4FA2A 3VIDA 5JGBA 4G3DA 5LQFA 3KXGA 4YJVA 5E9EA 3I81A 3NVMB 4I5CA 4FTJA 4IX6A 2C3IB 3RI1A 4AA0A 3TV7A 2R2PA 4N6YA 3PJ3A 4O91A 3TNIA 3R01A 4APPA 4FV8A 2W4OA 4I20A 4V04A 4AZSA 5FRIA 4LMUA 5AX3A 1Q41A 3O23A 2OF4A 1NVSA 2OU7A 4I5MA 5HVJA 5L6OA 2QOFA 5AX9A 4E4LA 2YM7A 2GQSA 3CQEA 2IVVA 3QUPA 1GZOA 5HHWA 2VTMA 5HO8A 5CAVA 5AR3A 3RAIA 3NDMA 4IANA 2GHLA 2F7XE 3QKMA 1TQPA 2AUHA 1H26A 2AC3A 3TACA 4DBXA 4IVAA 4HCUA 4E4XA 4BYIA 3HL7A 5HLNA 4X2GA 3EB0A 2ZV9A 3QUDA 2FVDA 4YTCA 5IPJA 2PHKA 3HDNA 4D4YA 3FQHA 4PRJA 4D0XA 1SNXA 2X81A 3DJ6A 2VNWA 3F3UA 4HPTE 3GQIA 4MQ2A 3AC3A 4O6EA 3C5IA 3CY2A 2XNMA 2FGIA 2QOLA 3RINA 3F5PA 2ETRA 1JKKA 4JNWA 1A06A 4FUXA 3UYTA 2UZWE 4OW8A 2XMYA 5I9WA 5HG8A 1FMKA 2XVDA 1Y6BA 1AQ1A 4PDOA 4FZ6A 5DLSA 4C2WA 4ASZA 3R7EA 5DE2A 1RDQE 3E3PA 5L8JA 4TN6A 4YUQA 2Y4IC 4ANNA 1OITA 5IG1A 4YGAA 4G5PA 3V5TA 4R78A 2CPKE 1ZMUA 5CANA 2OJ9A 3CGFA 3GUBA 2BIYA 3BEAA 5F4NA 3CPCA 5M07A 4U80A 4AAAA 2YCSA 1KV1A 1OBDA 1YKRA 3PSBA 4IAZA 3IOPA 3COIA 5C26A 5AFVA 1NT2A 4MD7E 2Y0AA 3K5UA 3G33A 3B8RA 4U3YA 2OKRA 3TZMA 2ZMDA 2HELA 4QMNA 2HY81 3U9CA 4LOOA 4IQ6A 4L67A 3ZRKA 5DMZA 3A61A 3R28A 4I5PA 4PMMA 4BHNA 4F6SA 4CGAA 4AGWA 3HV3A 3PUPA 4R3PA 2Z60A 3QD0A 3AOXA 4UWYA 1L8TA 2VGOA 2QOOA 3VHEA 4FT3A 4YHTA 1YWNA 3FZSA 3R02A 4IZAA 4D0WA 4DBNA 3QQHA 5BUEA 3T3UA 2HW7A 3P08A 3DK7A 3K5VA 5AV1A 2PVRA 1H1WA 5DEWA 4I0RA 4FV7A 3Q9XA 2YCFA 2I40A 4P7EA 5BUIA 2UW8A 4I21A 3D7ZA 1F0QA 3DBQA 4FEVA 1M14A 3OEZA 3R21A 2B52A 2XM8A 3WZKA 2OH0E 3VW8A 3Q52A 5EM5A 3FHRA 4LOQA 4II5A 1U5RA 4ALUA 5B2MA 4O0WA 3HAVA 3EQIA 4YZNA 4WG3A 4OT6A 3RK7A 5CAQA 4IIRA 5CEKA 3NUAA 4G6OA 3QD4A 2R3QA 2WMRA 4M97A 4B0GA 4RLKA 3MVMA 2IO6A 3ZXTA 3TWJA 2XRWA 4O7WA 3KULB 3Q9YA 5EI8A 3WIGA 2HXQA 3GOKA 1WBVA 3V5PA 5HKMA 3EZVA 3O8TA 5AUTA 4G6NA 4BZNA 1TQMA 3P9JA 5CSVA 5HIBA 5K5XA 4YJOA 4DITA 1F5QA 3UC3A 2X8EA 3DBEA 3DXNA 3HDMA 3FC1X 4XNEA 5EYMA 4L3JA 3ZLXA 5KMMA 1JOWB 2JDTA 3R8LA 4E1ZA 2ITQA 2BKZA 5IQCA 3NNWA 4EK4A 2UZEA 2UW4A 4C37A 2UVYA 4RWLA 3EH9A 1SM2A 3TXOA 4YO6A 3UOHA 2RGPA 2OXXA 4QP8A 2UW6A 2J6MA 4MWHA 3TNPC 3NWWA 3F6XA 4GW8A 2W1DA 4I6QA 2C3LA 3AT3A 4LRKA 3UC4A 1GZNA 3IK3A 3Q9WA 4S31A 4QP2A 5J5SA 1XHAA 1YOJA 2YDKA 4F6WA 4YLJA 5K0KA 2ITXA 3KXMA 3DGKA 4FTCA 3N9XA 4U41A 4RFZA 4RFMA 4F1MA 3P4KA 3U55A 3FAAA 4IHPA 1LR4A 3II5A 1OL2A 1V1KA 3EZRA 3QYZA 1PMVA 5GIPE 1JSVA 3GCSA 1OZ1A 1UKHA 5BUJA 2YITA 4BR3A 5AAEA 4MK0A 4RVMA 4DH8A 5KBQA 5CSHA 2C5OA 4HCVA 4ZY6A 2R5TA 2P0CA 4EORA 2GFSA 3BHVA 3ORXA 3GC8A 4CLJA 3U6JA 3A99A 3F7ZA 5KCVA 2QCSA 3MTLA 4O0XA 4TKSA 2HWPA 4APCA 2C3KA 1XH7A 4FNWA 4FMQA 2VTQA 4RPVA 3NLBA 2XK4A 3U9NA 2XNGA 4EOIA 4EOQA 2R7IA 5TT7A 1U5QA 4TPTA 2VGPA 3WE8A 5IZFA 2F2UA 4L00A 3L9NA 3RPOA 1H01A 3U51A 5J8IA 5HD4A 3Q4TA 4I3ZA 4L3LA 3MFTA 4D1XA 2UV2A 4LUEA 1W83A 4OTRA 4BCGA 3I1AA 2GHMA 2WXVA 3T3VA 3UG1A 1MRUA 2IW8A 3GCVA 3OOGA 1ZARA 3MPMA 3UVQA 3ALOA 4D2RA 4K0YA 2J9MA 3SDJA 2E9NA 5TR6A 1YXSA 4MXCA 4PPBA 5DIAA 4FODA 3HRCA 4FGRA 2X8DA 4FV5A 4ACGA 5AP0A 3ID6C 3NYVA 4O21A 2JDRA 4FL2A 4H3BA 2B7AA 4O84A 3F9NA 4G1WA 4F9AA 3MY0A 3QQJA 4WO5A 2F4JA 1O6LA 4QYGA 3BBWA 2XK7A 2JKQA 1UNLA 3PLSA 1O6YA 4TYEA 3GB2A 5IF1A 5AAFA 4Q9ZA 4DF3A 1J91A 4DH5A 1BLXA 3FLQA 5KO1A 3UGCA 3D5WA 4OTIA 4GVJA 5JMSA 4S2ZA 5H8BA 4F9BA 4ZSEA 2C4GA 3TEIA 3U8WA 1ZOGA 2CSNA 5J95A 1PYXA 4BIDA 4MNFA 4IDVA 3D5XA 5GZ8A 3ZFXA 1GIIA 1OM1A 3E5AA 1ZZLA 4KBAA 4BC6A 4C57A 3PDTA 5I9UA 3QTIA 2DQ7X 3FPQA 2W4KA 3IGGA 4RIYA 4QMUA 4RVKA 3PA5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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