3GC7A

The structure of p38alpha in complex with a dihydroquinazolinone
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The three-dimensional structure of MAP kinase p38beta: different features of the ATP-binding site in p38beta compared with p38alpha.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 349
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gc7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gc7A01
4G17A 3ZLSA 3MH2A 5E9EA 2BZIB 5GIPE 2ZVAA 3ORTA 3DJ6A 4GK3A 2G2FA 4KRCA 4IX4A 4MQ1A 3R2BA 3AGMA 2VWZA 4FMQA 4JDHA 5E1EA 3LQ8A 3FWQA 3HDNA 4K0YA 3KXXA 5AV0A 3SRVB 1FVVA 3WBLA 2ZDUA 2XBJA 4D2RA 1CM8A 2IG7A 4I22A 2J5FA 4ZJIA 1G5SA 3N9XA 4M69B 3QTXA 4RFMA 3UOLA 5AR7A 3DXPA 2XKFA 4AT4A 2OWBA 5AP5A 2E9NA 3C5IA 2UVZA 1R3CA 4F9YA 3LXPA 4JS8A 4ANMA 5FTGA 4OTQA 3VS0A 3VUTA 4L67A 4PDOA 3LJ0A 3WIGA 3CR0A 2Y6MA 3QFVA 1SNXA 3R22A 1AD5A 4J97A 2OSCA 4FA2A 3CLYA 2JITA 3P0MA 4H3PA 3QU0A 3R9DA 4FOCA 3ZZWA 3IDPA 2VX3A 2GHLA 5AP4A 2FSLX 2VNYA 4JBVA 4X21A 5ANKA 3MIYA 4NL0A 4FKUA 3NAYA 4BGHA 3F2RA 2XNOA 3KXHA 3FZ1A 3U87A 2PE0A 3PZHA 3BQCA 3V5TA 1F3MC 3ZO1A 2XS0A 3GXLA 4D58A 2H96A 2C6EA 3W8QA 4YU2A 3ORLA 1GY3A 3ZS5A 3R9RA 3LZBA 2Y7JA 2R3IA 5CLPA 2J90A 4EZ3A 4CEGA 1KE7A 4I94A 5CF8A 2ETMA 4L68A 3IDCA 4XG9A 5HHWA 2F9GA 4G6OA 3LPBA 4XMOA 4AU8A 4QMNA 2C6LA 3T3UA 1L3RE 2UV2A 4QP3A 5AM6A 4CSVA 3VUGA 2HZIA 4BDEA 4PP7A 2CGVA 4WG4A 2BHHA 2P3GX 1WAKA 5JFSA 2HIWA 2P0CA 3FZSA 1OL2A 3KCFA 2W96B 4RIYA 3QTUA 3SKCA 4A07A 4DHFA 5JFWA 4YZ9A 1WFCA 4O7YA 4U79A 3ZBXA 4B8MA 3S1HA 2F4JA 4FGBA 3HX4A 2H6DA 3EFWA 1CDKA 3F3TA 4IADA 2C6IA 4QP9A 4BI0A 3HNGA 3R1QA 3NWWA 4IQ6A 4UMTA 2JKMA 3FBVA 5BYZA 4IWOA 5IUIA 4I6BA 2BHEA 4L01A 4PTEA 3ZFYA 4ALUA 1P4FA 2Y4PA 3TNPC 2UZLA 3NUNA 3GCSA 4ERWA 2JKOA 4K6ZA 3OROA 5GJDA 4QMSA 4E5WA 2XF0A 2C4GA 3R8UA 3G90X 5J1WA 4DTBA 3MFTA 2YZLA 3VS1A 3MWUA 3NYOA 3SHEA 1UU3A 5EFQA 2JIVA 3HMPA 5EKOA 3CE3A 1OM1A 4M0ZA 4NH1A 4X2NA 4W4WA 4R7HA 2PVMA 1GZNA 3DLSA 4ANNA 4APCA 3CQUA 3ZSHA 3UMWA 3WI6A 3F6XA 3NCZA 2YA9A 4G31A 2IN6A 4YLJA 2OXYA 4CXAA 3U51A 2NO3A 5LVMA 4FVPA 4EH2A 1WBTA 3BLRA 4EC9A 4CV9A 3L8PA 5AIRA 4PX6A 2YCFA 3RAWA 4DC2A 4O1PA 3MFSA 5KHXA 4MVFA 4E4LA 1Z5MA 2OJJA 3NUXA 4ITJA 4Y72A 1NW1A 4EZ7A 5IMEA 2VNWA 5CAPA 4RIXA 4YJSA 4CNHA 3O17A 3QKKA 4AW0A 4KS7A 3E7VA 4F0GA 3ZUVA 4MBJA 3RMFA 2F2CB 3VS6A 3DK6A 4BCQA 3R8VA 5HOAA 4YP8A 3BCEA 3GQLA 3T3VA 5IH5A 5HVYA 1R78A 3PJ3A 4PL4A 1JVPP 3RPSA 4F7LA 4MXZA 2YERA 1APME 4JDKA 4IEBA 4FKOA 3KKVA 2CKEA 2DUVA 2VWXA 3TN8A 3VBQA 2REIA 4RJ4A 4TTHB 4DEEA 4EUUA 3CJGA 3FYJX 5M4FA 1OPLA 4O0SA 4IVCA 3EN7A 5FM2A 4RWIA 3DU8A 5JSMA 2VWYA 2B55A 2X8DA 3CP9A 3GU6A 4PMSA 1U54B 1Q8ZA 3QQLA 5E90A 5EM7A 3TJDA 3ZXTA 4F70A 3VBTA 3DFCB 3PJ1A 2PUUA 1OIUA 1KE5A 4ACHA 2W1CA 3C4XA 4PWNA 5JQ8A 1H00A 3LVPA 2ZOQA 4AT5A 1CKPA 4F08A 3MY5A 3PG1A 4BCKA 1SM2A 3P23A 2O0UA 5AAGA 3E87A 5E92A 4EHEA 3KVXA 4CQGA 4O0YA 4FSRA 5CEIA 4OTFA 1H07A 1ZOEA 5CEMA 2X0GA 3PLSA 3V6SA 4YLKA 3NPCA 4I6FA 5CAQA 4MXCA 2YAKA 2V7AA 2F49A 3LQ5A 2WMVA 3O71A 3E3PA 2PVKA 4FKJA 4MKCA 4QTCA 4E6DA 3DQXA 4RLKA 4MHAA 3BBTB 4KIOA 4MAOA 5CT0A 4EYJA 1IASA 1Y8YA 1PHKA 2YIWA 3F82A 3QTWA 3Q2JA 3W2SA 2PMIA 3BLHA 4YJNA 2OZAB 2X81A 3HRFA 1A06A 2Z60A 4E93A 4MEDA 4I5MA 4EH9A 4D5HA 5EK7A 4G3FA 5EQEA 2WEIA 2VTJA 1VYZA 4BRXA 5HE3A 4X2GA 1JSVA 4F65A 3F2AA 3SXSA 5TKDA 3AC2A 2ONLC 2BZJA 1JSTA 2PVNA 1ZXEA 4XV3A 3F2NA 4I24A 3CQEA 4J1RA 4NIFA 4DE4A 4IZYA 5JZJA 2PZRA 4QMZA 4AT3A 2GNLA 2WAJA 3ANRA 4CKIA 4FIJA 4D4VA 4GG5A 3W10A 5BYLA 4DGMA 4CG8A 2JBOA 2UZUE 3NZ0A 3LQ3A 3QWKA 4XOZA 2C3JA 5HO8A 4FSNA 3W2RA 2Z02A 4IZ7A 5AP3A 4N57A 1YXTA 5KKRB 5M4UA 2XYNA 2FSTX 2DYLA 4CZUA 1Q8TA 3DAEA 4Q9SA 5ICPA 2R3NA 3COMA 2X2LA 2CN8A 4U97A 5T3QA 5K4JA 3D94A 3SXRA 3MIAA 4MK0A 5IQIA 5JGBA 3G6HA 4UXQA 3VJOA 5KCVA 5M53A 5EHOA 2ERKA 5CYIA 3DJ5A 4G34A 3HMOA 3PXQA 4HW7A 4DH3A 3WYXA 3RKBA 4QMPA 4TW9A 3O2MA 3KC3A 4ZJJA 4YTHA 3MB7A 3WF9A 3N4TA 4O7ZA 1KV2A 1LEZA 3BX5A 4QNAA 1H0VA 4IC8A 3MA6A 4XG7A 3ZFXA 3F5PA 4R8QA 1OIQA 4JXFA 3PXKA 4MNEB 3I6WA 3AMYA 3IW8A 2EU9A 4OTWA 2VRXA 3MPTA 4R5SA 4LV8A 4FKGA 2WKMA 3CD8A 5IMXA 5JMSA 4EHVA 4FKLA 4FT7A 2X1NA 3GUBA 3UVRA 4EBVA 4EOIA 2GQGA 2WPAA 4ACGA 5BMSA 2QLUA 1BL7A 3H9FA 4FTKA 4P2KA 4FUXA 4FV2A 3LFQA 4YURA 4HYUA 3FMDA 3ORXA 3PA4A 1HOWA 1WCCA 4UBAA 5I3RA 4TL0A 3QA8A 3BPRA 1M2RA 4I4EA 4I0TA 1PMEA 2C68A 2V0DA 3R9NA 3F88A 3QD2B 4MXYA 4NEUA 1R39A 3VW6A 1OGUA 3C7QA 4I6QA 4R6VA 5HG8A 3IW4A 4JQEA 4WUNA 1ZRZA 2FUMA 3NNXA 4YC6A 4OLIA 4UMPA 1PXKA 3DBEA 5L8JA 5IH6A 3Q4CA 4A4LA 2UZWE 1VYWA 4KD1A 2YDJA 4GEOA 4X3JA 4YC8A 3VS3A 2YACA 4FL1A 2BTSA 3Q3BA 4QQCA 4IAKA 4FV5A 2QVSE 4L6QA 1NXKA 4BC6A 4BIDA 5KMOA 3PPZA 4ZLZA 3I5NA 4OGRA 4ZAUA 2CHLA 3ZEPA 3HGKA 3B2WA 4QP6A 4TYHB 4XHKB 4QOXA 4B9DA 3LCTA 2BPMA 3FLQA 1PW2A 1IA8A 4BI1A 2Z7SA 5H8GA 5TT7A 4ID7A 3I0OA 3NNUA 4USDA 2YCSA 2C0IA 4FGRA 4AW5A 2UZBA 3H4JA 4JNWA 4M0YA 4D55A 2A1AB 3D15A 2BZKB 3NCGA 3QKLA 4D28A 2YWVA 4RSSA 2PMNX 5GZ9A 4ANQA 3FLWA 2R4BA 4OUCA 5FWKK 1SZMA 4LGDA 1GOLA 4KS8A 3DOGA 4FSZA 3UOHA 3GCPA 3BYSA 3VBWA 2QOLA 5FP6A 5IEYA 4U43A 5M44A 3JY0A 4F4PA 5IZFA 3BYVA 3QKMA 4U3ZA 2P55A 4FNYA 2I0EA 4XEYA 5CT7A 1YQJA 3IECA 3OTUA 4F64A 3T9IA 3KRLA 2R7BA 2YLFA 4U5JA 4F9AA 2IO6A 3DV3A 4F6SA 2BIYA 3U8WA 3DKOA 2BDJA 2ITQA 4FNXA 5ANOA 1XBBA 3Q96A 5HCXA 4MX9A 3GP0A 1U5RA 4G6NA 4NJDA 2C5NA 4L53A 5IA2A 1F5QA 4EOOA 3JVSA 5EOBA 2R5TA 2X4ZA 3COHA 3RZBA 3TCPA 2PL0A 4C3RA 4Z7HA 3R1NA 3TUDA 2FA2A 1UNHA 3MA3A 4RWJA 3NSZA 4DN5A 4D2TA 2CLXA 2XCKA 3KRXA 3LFSA 5A4LA 4O6LA 4D9TA 1WMKA 2YISA 4OTPA 1P5EA 4BDJA 4MXXA 2VO6A 2R3MA 4ZSGA 4O81A 3HEGA 4FT9A 4IANA 5DEWA 1DI8A 5E8YA 4BYIA 4DEBA 2ONLA 2PVFA 5KUPA 1DM2A 1PXLA 4J52A 1T45A 2WMRA 4DH1A 2YN8A 3FDNA 4HYIA 1IR3A 3LMHA 3ZHPC 1XWSA 3RWPA 3V8TA 3W55A 3UQCA 2QD9A 4ALVA 2WFYA 5IISA 3GU4A 3D83A 2HW7A 3SOAA 2QR7A 1GNGA 4HOKA 4LUDA 4EOQA 4OTGA 2GS6A 3DDQA 4X2FA 2FB8A 2FYSA 2HOGA 3UVPA 4TNBA 3D2KA 3MTLA 3ZLYA 4BDIA 2YHVA 5BUEA 2OBJA 3QX4A 4BCPA 4AW2A 4DA5A 3HLLA 3POZA 5K5XA 3DPKA 2W1HA 3FY2A 4M84A 2VWWA 5I4NA 3FZPA 4NFMA 5HIEA 3W2QA 3Q04A 3U55A 2CPKE 3QZIA 2CKOA 4M7IA 2Y0AA 3R9OA 4IZAA 4DAWA 5EOLA 3DA6A 3RP9A 4GK2A 4ZEGA 4R3RA 4FT0A 5HD4A 5HKMA 3QX2A 4TY1A 3LFAA 5HQ0A 1ZYCA 1AGWA 5HCYA 3E3BX 3VN9A 3FHRA 5H9BA 3HRBA 1ZY4A 4C61A 1PKGA 4Q5HA 2O64A 4OTHA 3RK5A 2QURA 4CQEA 4C59A 3PA3A 4JT3A 3F61A 2JAMA 3SXFA 3UC4A 5AUTA 5FDXA 5M51A 1WVXA 3U9CA 3TV7A 3NAXA 5BVOA 3EQDA 5F4NA 1TKIA 2WQMA 3IO7A 1XJDA 3DLZA 3FUPA 5FXQA 3UP2A 5J79A 5CALA 1YI4A 3E8NA 4YGAA 5CXHA 3HVCA 2P33A 3OT3A 3V6RA 2IVSA 3BE2A 4D2VA 2GQSA 4C0TA 3MFRA 4BDHA 5IDPA 5LQFA 1GIJA 3VUIA 2BUJA 3LLTA 4NM5A 4QMUA 4RG0A 2AC5A 3CGFA 4TRLA 2HZ0A 1SYKA 4O0XA 4DFLA 3KN6A 1BUHA 4YZCA 5G6VA 4GJ3A 4DINA 4F63A 4GK4A 2GPHA 3JYAA 2WIHA 5LOHA 2X8IA 3NS9A 5AV1A 2ZB1A 3ALNA 3F3UA 3UPZA 5IQCA 1J1BA 3WZKA 4QP2A 3TNIA 1PXJA 3BYMA 4H39A 4IX6A 4ZXTA 2GU8A 2PE2A 2G1TA 4XLIA 4ZTLA 3V3VA 3PIYA 2F7ZE 2HY0A 4FKPA 4O2ZA 4CYJA 3MI9A 4EH5A 4E26A 3BIZA 2J0IA 2OG8A 3BU6A 4M13A 4KKGA 2VUWA 2UUEA 4W4YA 3LLAA 4A4OA 3MGYA 5K0XA 2BIKB 4EKLA 2ITUA 4ZS4A 3VUKA 4DT8A 3A8WA 4OTIA 4FYNA 3BHTA 5DR2A 2Z7RA 2X9FA 4XG6A 2GHMA 2W9ZB 3TIZA 2OJIA 4USEA 4KA3A 4FKQA 4FIFA 5TOZA 4KB8A 2WHBA 2O2UA 3C1XA 4RIWA 3FMKA 2PHKA 3F3VA 3P7AA 3P86A 4YZNA 3EKKA 5HIDA 2WTDA 3IG7A 3NDMA 3OD6X 2VTHA 2ERZE 3B8RA 3CCNA 4G3EA 5JN2A 2NNWB 3E63A 1LP4A 2YJRA 2ITWA 4FICA 3IS5A 3OW4A 2J0MB 3KULB 4GVJA 3Q9WA 1UWHA 5A14A 2C30A 4F6WA 4AXAA 2W7XA 2EUFB 4ZTQA 2PVHA 5HEZA 4IVBA 1REKA 2OF4A 3QTIA 3V5WA 1V0PA 3R01A 1UKIA 4H3BA 4L7SA 1P14A 2B1PA 3UIBA 4BYJA 2CLQA 2QCSA 3UOKA 3UP7A 2B7AA 4FG9A 4RVLA 2C69A 4EWHA 4KWPA 2X7OA 3RK7A 2ITNA 3TTIA 4BWXA 3UQFA 2OF2A 2PZ5A 3HV6A 3Q4TA 4K11A 2UW8A 2PVRA 3P5KA 4IAIA 3TUCA 4HNFA 4LM5A 5EHYA 5HG7A 4FKTA 5E4HA 2WU6A 3GVUA 2YZAA 2JEDA 2WTIA 3QC9A 5EDPA 4LL5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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