3GCSA

Human p38 map kinase in complex with sorafenib
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
348
structure length
331
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKSQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGTRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSLESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of a fluorescent-tagged kinase assay system for the detection and characterization of allosteric kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 109
structure length 331
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gcsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gcsA01
1CSNA 1U46A 3ATSA 5LVOA 3HMIA 3ERKA 4OTDA 5EW8A 3FXXA 5IISA 1ZY5A 4BBEA 5JT2A 5KMOA 3L8VA 3QCYA 4FL1A 4ZZOA 2OF2A 4CFWA 5EDPA 4XV1A 2WQMA 3MN3A 1P2AA 1OIQA 2YABA 3BEGA 3NEWA 4B8LA 5D12A 4TKSA 3QQFA 3UZRA 4A9UA 3ZZEA 3FY0A 4YTIA 3POZA 4DFLA 4JBVA 1JKTA 1W82A 2ITNA 3OTVA 4GG5A 2FSOX 4NUSA 3LKMA 2PVHA 3PJCA 5A4TA 5HORA 2VO6A 3LJ1A 4ZSJA 4YTFA 3QL8A 4I23A 4IFCA 3BYSA 3G5DA 4K11A 3UBDA 4CV8A 5A54A 4D1SA 5CAQA 4ERKA 1UA2A 4QMVA 4FF8A 3F7ZA 4IAAA 3UO4A 3V6SA 5A14A 3DK3A 4GJ3A 5AM7A 1V1KA 5M56A 4PMPA 4MH7A 4FSNA 2QKRA 2FUMA 4R77A 2WTVA 4AT5A 5FXSA 4F9AA 5E90A 3W10A 4I4EA 4HVSA 5CSVA 4E6AA 1AD5A 3MB6A 1JVPP 4FKUA 2IW8A 2X2KA 4RIXA 5AAGA 3ROYA 1BMKA 3HUBA 5CVHA 2F2CB 3DCVA 4CYIA 3ODYX 4XLVA 5J7HA 4E5BA 4ZTNA 2BUJA 5I9UA 3UJGA 3QZHA 4DG0E 4L3LA 2UW3A 5DRDA 4M66A 3DJ6A 4MK0A 4ZIMA 5CALA 5KMLA 5IA1A 2XIKA 1H27A 3WZKA 3ENHA 2H34A 1BKXA 2JBOA 4EONA 2UZWE 2O2UA 4GH2A 4XG9A 2X0GA 3SRVA 3C4CA 3Q2JA 1CM8A 4DFNA 3L9NA 4QMWA 5IQHA 3M1SA 4XOZA 1V0PA 2YDJA 4FZ6A 4OBPA 5AP6A 5EOLA 5HOAA 3O17A 4D28A 4DBNA 4XV9A 3KMWA 1O9UA 4FEVA 4GKHA 3BQCA 3NCZA 3AC1A 4JOAA 4ASZA 2PY3A 4A07A 3ZOSA 3HKOA 1ZAOA 4EH5A 1PMUA 4QQJA 4G6OA 4BIBA 3VUIA 3D83A 4APPA 3ZYAA 4CV9A 5I3OA 4FIJA 1UNGA 3VVHA 2FB8A 3WZEA 4QP4A 5E8ZA 5CXZA 4AW0A 2CKOA 4GFGA 4FEWA 4HGTA 2YN8A 5HTCA 2JDOA 4TYEA 4WSYA 3UOHA 4QO9A 5LVNA 1H1QA 4FNYA 3RCDA 5TOZA 5GZAA 2Y8OA 5HLNA 2A19B 4FSRA 4YZNA 2ETMA 5IQFA 2R3PA 4U81A 4DFZE 5JGAA 2P3GX 5EQPA 2YIRA 3W2QA 5HD7A 5L6OA 1RDQE 3AC2A 3ZEWA 4AZWA 5JKGA 4BCHA 2JKQA 3DT1A 1R1WA 4NW6A 5BUJA 2Z8CA 3QKMA 4NWMA 2C4GA 3JY9A 4RFZA 5TO8A 4PP9A 4FTTA 3VJOA 5D7AA 4Z7HA 2E9VA 3CCNA 3SOAA 2B54A 3QU0A 2OSCA 5F20A 4OUCA 4X2KA 3TM0A 1XH9A 4ZSAA 5BUEA 2JEDA 4P7EA 4RMZA 1PXIA 4N6YA 5F9EA 3NUYA 2IZSA 2J5EA 2XF0A 3ULZA 2IWIA 4ZSGA 4HYUA 4AN9A 3F69A 4ZZMA 5FGKA 5E4HA 3KA0A 2VGPA 3GCSA 5EYDA 3MPAA 1Y8YA 1OKVA 2UZOA 4EZ3A 4KS7A 3MA6A 2QKWB 4DTAA 4QT1A 4TYGA 3PE2A 4OGRA 4WT6A 3GU7A 2VTOA 4QQCA 4RC2A 3QKKA 2WB8A 4KIKB 3WI6A 4B9DA 3E8DA 2WELA 3FWQA 1J3HA 1XBBA 3H10A 5IKWA 3Q04A 4X0MA 3FI2A 4JRVA 2UW7A 4FTOA 3FUPA 5C4KA 3EWHA 3NVKI 2QOKA 3A7HA 4D55A 1H25A 2C30A 1GZNA 2QQ7A 4PL4A 5HNBA 3MH2A 4O1OA 3UDBA 3ZO4A 4E7WA 2XNPA 5BPYA 4C4FA 5C9CA 5B0XA 3EOCA 5M44A 4Z9LA 4O7SA 3D15A 4RX7A 4BKYA 3KULA 2EVAA 3BGPA 1E1XA 4L53A 3VHEA 2P2HA 3GVUA 2HELA 2QONA 1ZARA 5I4NA 2QNJA 3VS4A 1NT2A 1OMWA 5CI7A 3TV6A 3HAVA 4LUEA 4R7IA 4ZJVA 3DPKA 3R7VA 5AIKA 1H24A 2OH4A 2BKKA 4V05A 1PXJA 3SVVA 4YNEA 4A9SA 2C69A 3PIZA 1TQIA 3HA6A 1WVWA 4IAIA 4O0RA 3BI6A 2PVYA 3QTIA 5AADA 3R7GA 5HE1A 2PE2A 3WZUA 5EYKA 3UPXA 4FTKA 4C02A 3HV6A 3A60A 3GUBA 3RM6A 4CG9A 1WZYA 4CT2A 4E3CA 1OECA 4NM5A 1W8CA 1SVHA 4O0WA 1V0OA 3TTJA 4MEDA 3RNIA 5HNGA 3MBLA 4I24A 2XK3A 4IXPA 3SG8A 1A9UA 3D5WA 3OWPA 5FD2A 4LOOA 3SV0A 4AOIA 1XH6A 3QALE 3EQBA 5H8GA 3QD0A 3EJ1A 3EFJA 3D0EA 4V0GB 2YJRA 3EFWA 4CYJA 2GU8A 2ZV2A 4RFYA 3HECA 1CKPA 1YOMA 2PUIA 3FC2A 2JDSA 3ZC6A 5J9ZA 2F49A 2RFEA 4JQEA 3R22A 4FL3A 3FXZA 4FSMA 2YIWA 4I20A 4NT4A 4DEHA 2UVZA 2CGUA 4AS0A 4I0TA 2CPKE 2G01A 4A4OA 5M4IA 2I0YA 3C50A 3CPBA 3I7BA 3QXPA 5AR3A 4E4LA 1BI8A 2UW5A 4B99A 5ICPA 5E1EA 3F88A 5M09A 1OIRA 2XJ2A 4FKLA 3T8OA 2BDFA 2W9ZB 4RFMA 4C4EA 4XX9A 4E26A 4RJ3A 1JNKA 3NS9A 4FIEA 4EOSA 4DFUA 2C68A 3LVPA 4AZFA 5A6OA 2OIQA 2R3LA 1MP8A 2RSVA 5F95A 4BDIA 5CAOA 4IAZA 1SM2A 4JX3A 4KINA 4C59A 2QR7A 2ZV7A 3I5ZA 2E9NA 3O8UA 3IPHA 1NVRA 1Q24A 3PVBA 3TIZA 4C61A 3FC1X 5KCVA 3L8XA 5C8KA 4OAVB 4ANNA 1YXSA 2JLDA 3EN6A 3DBDA 5AAFA 4ZTMA 2VTRA 3BBWA 2WMWA 4XBUA 4AP7A 3HMMA 2CNVA 4KUJA 2C6LA 1OKWA 2IO6A 2O63A 4EHZA 3BE2A 4L00A 2PUPA 3RINA 3R7OA 4FSQA 3AC4A 3DZQA 4FTRA 4UZDA 1Z9XA 4D4RA 1Y6AA 4KB8A 3W2RA 2C47A 1YI4A 5AMNA 3UGCA 3UMWA 3RZBA 2ZVAA 4MTAA 3NYVA 4L67A 4YP8A 1YRPA 4G2FA 4YGAA 2ZYBA 3QD2B 2FO0A 4WNOA 2OW3A 3QAME 1E1VA 4F6WA 3PXYA 4CFUA 3S4QA 5IQAA 2BFYA 1WBWA 4GT3A 2G2HA 3QD3A 3BEAA 2JDTA 5CEQA 4DLIA 4IBMA 4UBAA 2GNJA 3BKBA 3WARA 4MD7E 4U6RA 4P5QA 4Q9ZA 4IW0A 4APCA 4X3FA 4MQ1A 3FQSA 3D7TB 2V0DA 2YZLA 1OPLA 3K5VA 1Q97A 3PE1A 4FKPA 3KF7A 5CAVA 4JDKA 1LPUA 4LOPA 2HZ4A 1GZ8A 3KN5A 4U80A 2W1HA 3ORIA 3C4FA 2BZKB 4O6EA 1OVEA 3R2BA 4AW1A 3S3IA 3AC5A 2OH0E 4AFJA 4BGHA 3M2WA 3V8WA 3PTGA 5E8VA 4TWPA 3QYWA 3CQWA 4JLCA 1IG1A 3LE6A 3B2TA 4Z55A 1RQQA 3EFLA 4QTAA 4D58A 2ZMDA 3F6XA 2CCHA 4TYHB 2GQRA 4D2TA 3TUDA 2PMOX 4GW8A 5B2LA 3LMGA 3L8SA 4GU9A 5CU4A 5LMAA 3UQCA 3C5IA 3QTRA 3RKBA 3WYYA 1UU8A 1BX6A 2J51A 3FLQA 3QLGA 5HCYA 3FE3A 2WMBA 3ORKA 3OP5A 4FODA 4TNDA 1ZOHA 3VBYA 2XB7A 3KY2A 4BZDA 5B2MA 3PSDA 2RF9A 3QQUA 3K5UA 3PPJA 3R8MA 3QWJA 4QPSA 4QNYA 4QMOA 2YAKA 4IWPA 3OEFX 5J79A 5J1WA 4I5HA 5DHJA 3G15A 3UMXA 3QQKA 3KFAA 3V5LA 1H1SA 3PIXA 5IA4A 3MPMA 4HVIA 3HGKA 4O7LA 4Y46A 2QOIA 4LV8A 3LFFA 3UVRA 4PRJA 1PXMA 2B1PA 3BLQA 2VWWA 3TDWA 3CGFA 2RFDA 3TJDA 1BLXA 4PMMA 4NIFA 1MRVA 3LJ2A 4ZLOA 1NXKA 4L68A 5BX0A 3WF7A 2HENA 2XKCA 3LJ0A 2ZDUA 4JIKA 3FLSA 3GC7A 4YHTA 5L2IA 3CLYA 4EEVA 4FTJA 4FV5A 4R7HA 3PDTA 1H1PA 1YXXA 3G0FA 3KMUA 3OT8A 4M97A 4PPBA 3OC1A 4WUNA 4F9BA 1IASA 2WZJA 5DI1A 5AV0A 3P78A 4TYIA 5FTQA 3QCQA 4XV2A 4RC4A 4OTGA 5C03A 1DI8A 4CZUA 3EKKA 5DR2A 2QD9A 5CQUA 5EK7A 4C3FA 1MQ4A 4O2PA 3AQVA 1M2QA 4IVBA 4EK5A 1PXKA 3A4PA 3QD4A 4EK8A 5I3RA 4J98A 3GXLA 2VO3A 4XRJA 3IDPA 5DVRA 5ANEA 2ERKA 3CJGA 4RJ7A 4IX3A 5DEWA 2GNHA 2KULA 4QMYA 3THBA 4FV9A 3HMNA 3MFUA 3KXNA 4O1PA 1BL7A 1GOLA 3WF6A 4A7CA 2YIQA 4FTQA 2YLEA 3BYUA 3O0GA 5FEDA 4WUAA 4QMZA 3Q53A 5K0XA 4M7IA 3ALNA 4O86A 3DA6A 4OTRA 4XP3A 4Q2AA 4AW2A 1FVRA 4C2VA 4KS8A 3KF4A 4AX8A 2J0KA 5DN3A 2OBJA 3VUMA 2IW6A 5GZ8A 4XEYA 4HOKA 3DJ5A 3U87A 5L2TA 1Q8ZA 4I4FA 1KE9A 1UKIA 4LM5A 3ZUVA 5GIOE 4JAIA 1JSVA 4WG3A 4MXAA 4KSPA 4WNPA 3TUBA 3K3JA 4L3PA 5FG8A 4BR3A 1J1CA 4TWNA 4Z3VA 3ZXZA 4C34A 3I4BA 2W7XA 3V5JA 4BGQA 4MHAA 3KVXA 4HJOA 2WQBA 3E7VA 4E4MA 3TUCA 1K3AA 2ZMCA 3ZM4A 2HY0A 4AGDA 2C5OA 3TT0A 4KABA 3FPMA 3VN9A 4BDAA 3IQ7A 5AUUA 1XHAA 5HG9A 4YURA 2ZV8A 2P55A 2FYSA 3QLFA 5HICA 4ASXA 4DC2A 3FKNA 1OPKA 4RIWA 4B8MA 4QMNA 4Z7GA 3O7LB 5CASA 4IZAA 1U5RA 3ATTA 3QWKA 4XG8A 2A27A 2VWXA 4JS8A 1YHVA 2CMWA 4NTTA 3RTPA 5KMIA 2B0QA 2XNNA 1IRKA 3BYMA 4YUQA 3N4TA 4WIHA 1OL6A 4MQ2A 3H0ZA 1FQ1B 3DV3A 1PYXA 5FDXA 2UW9A 2BDWA 1WBTA 3MSSA 4J97A 3OBGA 4IB3A 1H1RA 5EHLA 4CKIA 4CQEA 3UNKA 2C5VA 3C5UA 5JFWA 3PYYA 4CRSA 3MH0A 5LVPA 5TE0A 4D0WA 3QRTA 5CAUA 3SKCA 2OO8X 4FV0A 4RIYA 5DE2A 1FPUA 4UMPA 3QGYA 3EYHA 4ZTHA 3EQDA 3VBWA 1O6YA 2WFYA 4L46A 4GVJA 2OIDA 1W7HA 4U3ZA 4ACMA 3SRVB 2PK9A 4BI1A 3BHVA 3OOMA 4BL1A 3UOJA 2H96A 4K9YA 4YJRA 1ZYDA 3C0GA 4EHEA 3FAAA 3DY7A 5AUYA 3RCJA 3RK9A 2X4FA 4W8EA 5E8YA 4QYYA 2UZNA 4GVAA 2HW7A 3GC0A 4RRVA 3L9PA 2CCIA 2Q0BA 3HLLA 3M42A 5AP3A 2EB3A 5EFQA 2XIYA 3LM0A 4QMUA 3P5KA 2WQEA 3HP5A 4J96A 4RJ5A 4AAAA 3R0TA 1YOLA 4P90A 4CTCA 3FJQE 3KB7A 5CSXA 2PVKA 4NK9A 4S34A 3FI4A 3NAXA 3RPVA 3WF9A 4O7YA 1NA7A 2ZM3A 3MYGA 4TZRA 3R21A 3BHHA 3E88A 1PMEA 1XR1A 2X7GA 2O8YA 2PZ5A 4FKJA 2FSTX 2IVTA 2XH5A 5FBNC 3BHTA 3UIUA 2XNGA 5C8NA 3I6WA 1JBPE 2WTWA 4AN2A 3ET7A 4RJ8A 5M07A 5M08A 2ERZE 4O38A 1OIYA 4MXXA 2EXEA 4U41A 3VS0A 5F4NA 2DUVA 4ZY4A 1YDSE 4LMNA 5HVYA 4XH6A 3RM7A 3UOLA 4EYMA 3FMEA 4FKRA 3LXLA 4LG4A 5BVOA 1Q4LA 4EWQA 1WCCA 5CT0A 1KUTA 3QF9A 4MWHA 3ZDIA 4G17A 4MXZA 4YNOA 5EM7A 3PLSA 5JGBA 1ZZ2A 3DDQA 4HYIA 2XNMA 4YZMA 4NZWB 4FSYA 4BHNA 3DBFA 3CBLA 3BE9A 4PDYA 4YJQA 4DAWA 4RVKA 4R7BA 5GZ9A 3VUGA 1OBDA 4PMSA 3VWAA 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