3H30A

Crystal structure of the catalytic subunit of human protein kinase ck2 with 5,6-dichloro-1-beta-d-ribofuranosylbenzimidazole
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The CK2alpha/CK2beta Interface of Human Protein Kinase CK2 Harbors a Binding Pocket for Small Molecules
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 108
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3h30A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3h30A02
2Z60A 3DT1A 1B6CB 3GBZA 3RPRA 3KRRA 5BVEA 4LUEA 3KRLA 2C0TA 4CNHA 4CKJA 3D94A 1OUYA 4ZTSA 3A99A 4O6EA 5DLSA 4AGUA 5A4LA 4J7BA 2B4SB 4W9XA 4QMOA 4GJ3A 1XH4A 4CXAA 3NR9A 1JQHA 3R30A 2RFDA 5DBXA 5HE1A 3P08A 5M55A 5DRBA 1UU8A 2F2CB 4J8NA 2VX0A 3ZMMA 4EYMA 3C13A 1HCLA 3LCOA 4WG5A 4NM7A 5BX0A 1REKA 1K3AA 3WYYA 1R0PA 4OAUC 3B8QA 3MH1A 2W4OA 4PNIA 2XBAA 3LKMA 4V04A 4CMTA 3GXLA 5HE2A 4L7SA 2XIYA 4ACGA 5HTIA 2VO3A 2VTTA 3D7TA 4RIXA 3ZDUA 2OG8A 3Q52A 4R77A 4ZY4A 1OM1A 4QP2A 3LJ1A 4JVGA 2XIKA 3WF9A 3FMKA 1WMKA 1QMZA 2JGZA 2WMQA 3TJDA 4RC4A 4QMYA 4FV2A 4JDIA 4YJNA 5I3OA 5C1QB 5IQBA 5AR5A 1Q62A 4MD8E 3UVPA 4B7TA 1JAMA 1I44A 2IVSA 4OBQA 4YJQA 4GUBA 3UMXA 3AT2A 3FI4A 3ZZWA 3U6JA 1QPDA 3BRBA 3R0TA 4AFEA 2B54A 4DF3A 3Q3BA 4TYIA 4C38A 2GMXA 3SHEA 1S9JA 4LRJA 2X9EA 4EK5A 4AN2A 5DGZA 1Y6AA 4J99A 4PMTA 5HOAA 1YWRA 5LWNA 1MQBA 5DE2A 5HG8A 3RPYA 3ZSGA 2GQSA 2YIYA 4AG8A 3KMUA 3BWFA 4BTMA 2YM4A 3JR1A 4FKUA 3V8SA 4F7SA 3TDWA 4K1BA 4WNOA 3R8ZA 5E8SA 4YNEA 5FDXA 3GEQA 1LP4A 4CMUA 4GIIA 4O1PA 4RVKA 5CEQA 5IU2A 4TNDA 2YWVA 5JGDA 3SOCA 4BCKA 5C4LA 3IKAA 4PV0A 4KIPA 5CNOA 1YI4A 4FTOA 2XK7A 5KE0A 3GCPA 3QTIA 5LOHA 3ORXA 1OKVA 4TT7A 3MH3A 4XHKB 5HNIX 2UZDA 3PWDA 4CLJA 3V8WA 2IZTA 2BIYA 2NNWB 5CVHA 4GFOA 3Q04A 5DEWA 2A4LA 3LW0A 4UMPA 4AA0A 4YJTA 4LV8A 2QU5A 4HGTA 4FV5A 4HZSA 4GK4A 4NUSA 4UYNA 4E4XA 3MV5A 4L67A 5EOBA 5H2UA 2W1IA 4GT4A 3EYHA 5C8KA 4ZIMA 4EOOA 3FKOA 4F09A 2JKKA 3L1SA 4XOYA 4BYIA 1W8CA 5CT0A 4ZTQA 3VBYA 1KSWA 4YTCA 3C51A 1IG1A 3PY1A 5HBEA 1URCA 4D5HA 4ZSEA 3I1AA 4H39A 4K8AA 5B2LA 2VGOA 4RFMA 3WZJA 2I40A 2HW7A 5HGIA 1FMOE 3B2TA 5CSWA 4YP8A 3TZMA 3LFDA 4UZHA 4DHFA 2GS2A 2WTJA 3MSSA 5B7VA 4C4JA 5AM7A 3C4XA 3SQQA 5IG1A 3NUXA 4MHAA 2XIRA 4RX5A 4FV8A 4CV9A 3GFWA 3BYUA 3FAAA 4R78A 1Q3WA 2VWIA 3E5AA 4X3FA 3CQUA 4LFIA 3OCGA 3CQWA 3EQGA 5CWZA 4L3LA 4HVSA 4IC7A 4L68A 4DT9A 5DFPA 4FKWA 2CPKE 3QZIA 2B0QA 3F61A 4LOQA 4EUUA 4LV5A 3W2RA 4D1XA 1H1SA 1PXIA 4WG4A 4JL9A 5ETFA 5CVFA 3SXSA 5EM8A 5GJGA 3T9IA 4BWKA 4BZNA 5HORA 4O86A 2V0DA 4C4IA 4BDBA 2A27A 3DV3A 3Q2MA 3KL8A 1EH4A 3NCZA 4GG5A 3LCTA 3RAKA 3WZEA 4XEYA 2KTYA 3GNIB 4L6QA 4MCVA 3MJ2A 1NVSA 4U97A 4ALUA 1UKIA 1YXXA 2GQRA 1BYGA 5HIBA 5CAOA 4RJ7A 2REIA 3EOCA 2QCSA 3MVJA 3R1NA 2R64A 5JZJA 4QTEA 3EQRA 3P7BA 4FTRA 3W18A 5DEYA 4OT5A 4IBMA 2BFYA 4KRCA 4Z3VA 2XCKA 3VRYA 4H3BA 3CJFA 3DPKA 3OW3A 2PVJA 4A9TA 1PW2A 5AUTA 4X21A 4YLJA 5A14A 3GP0A 3OWPA 4DGNA 4BCQA 3G33A 4MQ1A 4X7QA 2YERA 4WBOA 5F95A 4RX9A 3BCEA 3PLSA 4FC0A 4ZY5A 3LQ3A 5EYMA 4H05A 4MXZA 2GHMA 2RKUA 4QTDA 2YJSA 3UO5A 1RE8A 3P7AA 2CN5A 3ZSIA 1Q3DA 4DH7A 3O50A 1ATPE 4AOIA 4AN3A 2XS0A 1SM2A 3EKKA 2H6DA 2ONLA 4AAAA 2WNTA 1MQ4A 4P4CA 4PTCA 5BVKA 2R9SA 3SKCA 1U54B 2Z2WA 2VTSA 1G8AA 4FTQA 3UIUA 1E1VA 3WZKA 4BCGA 5J9LA 3HZTA 5L2SA 3VAPA 4F6WA 1PKGA 5IA4A 2VD5A 3EQCA 1OKWA 2UZWE 4ZLZA 2C0IA 3PE2A 4S32A 4UBAA 5AUUA 1NY3A 2R3IA 5C8NA 2VNWA 2PUUA 2R3GA 4R5SA 1QPJA 2J9MA 1JLUE 4RQVA 2CGWA 5HO6A 3MIYA 4FV6A 1O6KA 2IW9A 4AA5A 5LVPA 2BIKB 3BYSA 1XR1A 5M4IA 4QO9A 5JFWA 3VNTA 2BKZA 3WI6A 4EBWA 2BTSA 3MB7A 4NKSA 1AD5A 2WTVA 1GZNA 2JDTA 3GB2A 4G1WA 2HCKA 3R6XA 4DH1A 4HYHA 4OR5A 2E9OA 3G5DA 4AZEA 3LJ0A 3U54A 4CYIA 1GNGA 4GFMA 3LQ8A 4BN1A 4CEGA 4I92A 4HYIA 2W4KA 3NNUA 1ZOGA 2ESMA 2H34A 4YTHA 2Z7LA 2QONA 3K3IA 3REPA 3EN7A 3F3TA 4FVRA 4W8EA 1TQPA 1KE5A 2OK1A 4EHZA 3UOJA 4DN5A 3R9DA 4TWPA 4FYOA 4QMSA 2ZOQA 3MY0A 4NIFA 4DEHA 4EHEA 3UZTA 3VO3A 4IHPA 4PF4A 5CEKA 3C5IA 3PY3A 4WRSA 1XO2B 1H08A 4L53A 1JSTA 4OTRA 5ACKA 4B8LA 1H26A 3PJCA 4GEOA 3DTCA 4C59A 2OICA 3QD4A 3IECA 4BDAA 4C57A 4EJ7A 3CIKA 5I9XA 3U87A 4UMRA 3CPBA 3COIA 4L52A 3F5XA 2C3JA 1QL6A 4KD1A 3ANQA 4NW5A 3EHAA 3QCQA 4WNKA 4I0RA 5HD7A 2PPQA 2YM8A 4C4FA 1OBDA 4KB8A 3ZU7A 2CN8A 4EI4A 3V5PA 3NVKI 1ZOEA 5FP5A 3QWJA 2WZJA 3D5XA 1H27A 1ZYDA 5E1SA 4QNYA 1BI7A 2R7IA 4NCTA 1OBGA 2J2IB 4LI5A 2WMVA 4BBMA 4NJDA 3OXIA 2VGPA 2X4ZA 3Q32A 4TTHB 5L6PA 1Y8GA 2R0UA 3TIZA 3W2PA 4D1SA 3GOKA 3NPCA 2VTLA 2PVLA 4HYUA 4DC2A 5BPYA 4KNBA 2GFCA 1PJKA 3NYVA 4FOBA 3P1AA 4XBUA 3NAXA 4M12A 4FT9A 2XBJA 4MTAA 3QQKA 3EL7A 1JNKA 3KCFA 4I6QA 4O2ZA 3Q2JA 2QG5A 4FKQA 1YQJA 4BTJA 3PXQA 4M13A 3UP7A 1UVRA 5DH3A 3T8OA 4ZZMA 2I1MA 3IDCA 3ORPA 4U40A 5CU2A 3UZPA 3MH2A 5EYCA 2NO3A 3ZSHA 3U6HA 2C6MA 3R8MA 1M2PA 2YWPA 3DA6A 4C34A 1H25A 3PP0A 4QPMA 2YIQA 3QQGA 5EI2A 4BCNA 3KULA 1UNGA 2VV9A 4DTAA 5LCKA 1URWA 4U81A 4KBCA 3AC4A 3HAVA 3GC0A 3LLAA 3NSZA 5HO8A 3A8XA 4Q5HA 1J91A 2PE2A 3Q9WA 4K18A 1XHAA 1UU7A 4XV2A 1H28A 3HMIA 4D4YA 4TYHA 4CKRA 4R5YA 3HMPA 3V5LA 3C5UA 4APPA 2PZIA 3NGAA 2F2UA 4A07A 3RPVA 4UWBA 5KHXA 2G1TA 3KN5A 3RNYA 2BRMA 4PRJA 4RWKA 3BX5A 3FLNC 3F66A 4BWXA 4E1ZA 4DTBA 4L42A 3C4FA 5ETAA 2C5YA 4X3JA 3FQSA 4RVTA 4C2WA 4U3YA 3LCSA 4FKSA 3GT8A 2GS6A 3SGCA 2C6LA 3RZFA 2HZIA 3PIYA 1YOMA 4ALVA 4JBOA 4D4VA 3LXLA 3RPOA 1U59A 5JFVA 4QQCA 5GJDA 3UJGA 2W7XA 2RFEA 4LMUA 3BEGA 2VWYA 3DFAA 2XNMA 4ZJJA 1IEPA 4IJPA 3ZC5A 2HY0A 3TL8A 4BDHA 2UVYA 1V1KA 3M11A 5BVWA 5IQAA 4KRDA 1PRYA 3PXYA 4YTFA 5DPVA 3T9TA 1DI8A 3DK7A 3HAMA 5BYLA 5CX9A 3NRMA 1GIHA 2Y4IB 4EOSA 4XP0A 3VUKA 2F49A 1J3HA 4Y8DA 4Y85A 3EN4A 4UXQA 4FKVA 5M57A 5CF8A 4OTQA 4L45A 4GFGA 4X2KA 2OIBA 4HCVA 4IWQA 3BU3A 2O5KA 3FPMA 3Q5IA 4KWPA 4OGRA 4IH8A 4GW8A 5K5NA 2PMNX 4YJRA 2RIOA 3QTQA 2ZYBA 5HX6A 3E63A 4ZZNA 2UZNA 2GNLA 1TVOA 2WMUA 5JFSA 2R7BA 2Y9QA 3A7IA 4O21A 3HA8A 5D41A 3NX8A 5J1WA 4FG9A 4M97A 4FEVA 4FK3A 4DGGA 3I0QA 1Q4LA 4GU9A 4AZFA 3ALOA 3H30A 5BVOA 5JK3A 4O7WA 5T3QA 2G2FA 2OWBA 4KABA 2PL0A 2WQNA 4TYGA 4DEBA 3WOWA 3UPXA 4BR3A 1WBTA 4ANNA 2YZAA 4MH7A 2XNBA 3BHUA 4M69B 3OXTA 3ZM9A 3OWKA 4BYJA 2AYPA 4ZSJA 4ONAA 4S2ZA 3FMDA 3ORLA 4MF1A 4NM5A 1KWPA 5C4KA 1I09A 3DZOA 2QOIA 3ZFYA 2HW6A 1R3CA 3QU0A 3R00A 3ZS5A 4U7ZA 4EH7A 3HUBA 1BX6A 4F1TA 3RVGA 4BKYA 3EZVA 1H1WA 4FKLA 3TEIA 4TYEA 3PJ8A 4E5AX 1B39A 2Y7JA 3S95A 3VBTA 5KBQA 3F82A 1ZMVA 3VS3A 4AGCA 4ENYA 3GGFA 5IA2A 2VO0A 5CU4A 2C6OA 2YM5A 3ORKA 4B4LA 2GNJA 1SVEA 1FVRA 5EDQA 4H3QA 2JBOA 4KAOA 3PSDA 4O7VA 5GINE 5DOSA 2Z7SA 3KCKA 4DFZE 4Z16A 5HD4A 1XH8A 1AQ1A 1JBPE 2JKQA 4FSTA 1GIIA 2PVNA 4AN9A 3IO7A 1K2PA 4E26A 4HVIA 3DU8A 3PPZA 1Q8ZA 4IE9A 5EYDA 2DQ7X 3QLFA 3NS9A 5L2TA 3W33A 2GTMA 4LOOA 3RK5A 2A1AB 4YHJA 3NUAA 2IZUA 4FV0A 4A9SA 4FTKA 5D7VA 4XJ0A 3R01A 2X7FA 3IONA 4EL9A 3G51A 5L4QA 2BILB 3PG3A 4KUJA 3ZEPA 1YRPA 3EZRA 1KV1A 4IAAA 2EXCX 2IVUA 3EMGA 5GZ9A 3CY2A 3DB8A 4A9YA 2UUEA 4CFFA 4GVAA 5LVNA 2WTIA 2XM9A 3FDNA 2A19B 3QHRA 3R22A 5E8UA 2J51A 3RK9A 3CTHA 2UZUE 4ARKA 3ALNA 1V0BA 4A06A 4ANSA 1BLXA 4MXCA 4TWNA 5AV0A 3RPSA 2Q0NA 2CNUA 3ERKA 5CS6A 2ITNA 1WZYA 4FZ6A 3PP1A 1GJOA 1R78A 4YJVA 5CSHA 4CG9A 3VBVA 4G9RA 2OXYA 1PMVA 3FI3A 5AAEA 5M07A 2VTQA 3ET7A 4BKJA 2C47A 3FKNA 3LFNA 1ZY4A 3PXFA 3W16A 5HO7A 4G16A 2GFSA 3VUHA 4EH3A 5DYJA 3E93A 3OFMA 1OIQA 5AR4A 5B2KA 3O7LB 4YJPA 2PU8A 1ZLTA 2XJ2A 3E87A 1GZ8A 4RVMA 4X3FC 3DKOA 2RG5A 3PXKA 3V51A 4D58A 4D2SA 3QCSA 4FG8A 5CLPA 4EH5A 4F9WA 3A8WA 4QP1A 3MYGA 4AE9A 5AAFA 4YMJA 3ZUUA 3PY0A 2QQ7A 4FZAB 4M67A 5CAVA 5M4CA 1ZRZA 4E6CA 4YSMA 3TT0A 4Y5QA 4PL4A 5AR8A 4WSYA 3QQFA 5IA0A 2W5AA 4CFUA 3A4PA 4IZAA 3UVQA 2IWIA 1ZY5A 3JUHA 4IVBA 2GNIA 1KE7A 3BHYA 2YACA 5FP6A 5CAQA 3D15A 3ZUVA 4S34A 3C4CA 3KXZA 2JKMA 3GC9A 3LOKA 4FVPA 4E5WA 2CHLA 3EIDA 4DFBA 3CKXA 5IUHA 2V55A 2CGXA 4EOPA 4EHVA 4FI1A 4BGQA 3W2SA 2P33A 1W7HA 2Q0BA 3VHKA 5KCVA 1M7NA 3TM0A 2WHBA 3GU8A 4ZAUA 4PNKA 1J1BA 2YAKA 2PULA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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