3H9FA

Crystal structure of human dual specificity protein kinase (ttk) in complex with a pyrimido-diazepin ligand
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
280
structure length
260
Chain Sequence
FQSMSVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQPDGTVNYMPPEAIKDMSKISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Small-molecule kinase inhibitors provide insight into Mps1 cell cycle function.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity protein kinase TTK
total genus 78
structure length 260
sequence length 280
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2009-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3h9fA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3h9fA01
3GC8A 3MA6A 2XIKA 4IWPA 3ZZEA 3KXNA 5KMJA 3HUBA 3WIKA 2PE0A 5M4UA 4NEUA 3VUIA 4II5A 5HTBA 1Q8ZA 3BHVA 5HLNA 2QHMA 2O65A 4MD7E 4HGSA 3RVGA 3T9TA 4W9WA 2C5YA 4H3QA 4WA9A 3F69A 2ZB0A 3GCSA 1LPUA 3NSZA 3RINA 4EKLA 4KUJA 4PY1A 3LFCA 4WNOA 4F08A 5A4EA 3V5PA 5IQAA 2E9NA 3SQQA 4DFNA 5K9IA 4QMOA 3BLQA 4G6NA 4FTNA 4D28A 2WQOA 2VO3A 3LJ0A 5CT0A 5HCYA 2XIZA 3KRJA 3LHJA 4YLLA 5EG3A 1V0OA 4DFXE 4D9TA 2X39A 3NCGA 4GEOA 2RG6A 2OSCA 3PRIA 3QRTA 3V5JA 3LVPA 1J1BA 3UVRA 1MQ4A 5B7VA 5HHWA 2W5BA 2IPXA 3EHAA 4JG6A 2JIUA 2VZ6A 5IZFA 3QQHA 1BMKA 1CKPA 2WPAA 3EQDA 2YIWA 4B4LA 2CKQA 3E63A 4ZJJA 3FMLA 3QUEA 5KKRB 3DFAA 4FT7A 3BQRA 3LFDA 3VS7A 4D1XA 5L2TA 4W4YA 5EQPA 3RNYA 3I5NA 3WF8A 3DKOA 2BDFA 2NP8A 4QMUA 1WZYA 3K54A 3N9XA 2HWOA 2R3HA 4GFOA 3MV5A 4AW2A 4DINA 2C5OA 4FNYA 4FEXA 4QO9A 4QTCA 1GY3A 3H4JA 4FG7A 3PIZA 5L8LA 1GNGA 4U42A 5BVWA 4FTRA 5L6OA 5J9YA 2GFCA 3P78A 4IB5A 5CAOA 3F3ZA 4BB4A 1ZAOA 4R1VA 1WVYA 2HXLA 3DQWA 3V6RA 3KMMA 4EK3A 3FQSA 4YZCA 3OP5A 3NW7A 2B4SB 2WO6A 5ANOA 2C6OA 3EQHA 2ZV2A 3MS9A 3PP1A 3UBDA 2PMIA 4DYMA 3NYOA 2E9PA 5C26A 2QODA 2VNWA 4PX6A 3O50A 4KBCA 4RJ5A 4ZJIA 1BUHA 4L67A 3EH9A 3I0OA 4IB3A 4F7NA 4LRMA 3ORTA 4DH3A 4R78A 2G2IA 3HX4A 5JQ8A 3JS2A 1OUYA 4R8QA 3ORKA 5CS6A 4DG3E 5CAVA 2GDOA 1OL5A 1XBAA 2X0GA 2JAMA 3QKMA 2C5NA 4M13A 4QMYA 4S2ZA 3RPSA 3WBLA 4F6SA 3FY0A 5KUPA 4RIOA 3VBVA 5L8KA 2JBPA 4FKQA 3BQCA 4CKJA 3R9OA 3Q4CA 1HCKA 1H26A 3NR9A 3FZRA 3QTIA 1A06A 3TIYA 5EDRA 4AE6A 4EZ5A 1Q4LA 4RWJA 5I3OA 4Y85A 3T9IA 4BCMA 3VS1A 3R7OA 5HG7A 2SRCA 2H96A 4QQCA 4UALA 4YC6A 5CZIA 4EONA 4UN0C 4PMSA 3NAXA 4ITIA 2IJMA 2QO2A 3EN6A 5J9ZA 5AA8A 2J0IA 4XLVA 2BTRA 5CU6A 4IWOA 4EL9A 1YHWA 4XJ0A 4EZ7A 2OKRA 5ETFA 4FYOA 4JR3A 4AT4A 4R5SA 4RC4A 4ALWA 1OECA 3O8TA 3JUHA 2GQSA 2C1AA 4C37A 3R9NA 3QX2A 4IHPA 4MKCA 4BCHA 5HOAA 3Q9XA 4QYHA 2JDVA 2BDJA 3E88A 3BE9A 1OKYA 3L8SA 5A14A 3CTHA 3PIYA 4TWNA 5E90A 4C2VA 5TR6A 3COIA 3IS5A 4C33A 4HVHA 4RBLA 4EUTA 3DBQA 3QYWA 3MH0A 5M09A 2CDZA 4USDA 3W2OA 5DT0A 2XRUA 5AUVA 3B2WA 2XRWA 4E93A 5IEYA 4FSQA 1IA8A 4F1TA 3CQWA 4ZS0A 3BZ3A 3BGQA 3FE3A 3BPRA 3RI1A 1DAYA 4FEUA 1GZKA 1NT2A 1BL7A 2RFNA 4AGCA 3CQEA 3R8UA 1YQJA 4C3RA 1CMKE 3K3JA 4TYHA 4GUBA 5FM3A 4O0TA 4X6RA 3V8SA 4GRBA 2VAGA 1IAHA 2QU6A 3ENHA 2XJ2A 4L01A 5EYDA 3UIBA 4LOQA 3ZO1A 3U6JA 4Z16A 2FO0A 3PLSA 4PDPA 4XV3A 4FGRA 3BYSA 5L2IA 1T46A 3ZRKA 4RC2A 3KVXA 3W16A 4DTBA 3G9LX 5DN3A 3RHKA 3GU5A 2RF9A 4RVKA 5AV2A 1QL6A 3QQFA 4BFMA 2XH5A 3TG1A 5IQHA 3BI6A 3KXHA 5ANDA 1XH4A 3A8XA 4GVAA 4IEBA 4NM3A 1FVTA 3TI1A 3VRYA 4GS6A 5AEPA 2JFLA 4U41A 4H58A 1W82A 4D4VA 4TN6A 2V7AA 3PSCA 2PPQA 5I9UA 2BHEA 3B8RA 3UNKA 2ITUA 3VF8A 3CD3A 4RT7A 3DLZA 4FTQA 4FEQA 2UVZA 1U46A 3BIZA 1YHSA 3FSKA 3GENA 3QTRA 4XG6A 2PVFA 2PMOX 1PXNA 1JOWB 1Q97A 1HCLA 4OTPA 5HCZA 4FKIA 2X4ZA 5K5XA 3NX8A 4B8MA 4D2VA 2W9ZB 3PSDA 2R3QA 5H3QA 3QYZA 4U97A 3OZ6A 4BCGA 3EMGA 1A48A 5CF8A 3A62A 3KRRA 3LCTA 2X2MA 4K6ZA 2XNEA 4KS7A 5FUTA 3FHRA 4DAWA 2ITVA 5IA0A 2QI8A 1UVRA 1YWVA 2JITA 3HP2A 3GU6A 3FY2A 2OFVA 5TKDA 3OS3A 4MEDA 3BLHA 3EB0A 4CFXA 4PP7A 4RX9A 2ESMA 3ZEWA 4ONAA 5IA3A 2YM4A 4EJ7A 1JNKA 2R3GA 3KL8A 1H00A 4E26A 2WQEA 3FI2A 3R1NA 2P2IA 3UIUA 3V5WA 4OAUC 4R7BA 4V0GA 3D5WA 3DBEA 1MRYA 4WSYA 5JGBA 3VUGA 4ANLA 3RM7A 3PXYA 1YI3A 3C50A 3EQBA 5FBOA 4E4LA 1WBPA 2QOHA 4ALVA 2QC6A 4EH8A 4D4SA 5A4LA 3LZBA 2UZOA 3Q2MA 4JNWA 4FEVA 1GZNA 3NYXA 3SOCA 3ZHPC 1TQIA 2WTCA 3QTSA 5C8MA 4DLJA 1T45A 4AFEA 3Q32A 4LRKA 5AAEA 5L3AA 4O84A 1BYGA 4BDIA 4DHFA 2W1IA 4I94A 4RJ7A 4KB8A 3QZFA 1VYWA 3ZXTA 3H9RA 2PE1A 3FV8A 3I7BA 1KE5A 3FXXA 2VU3A 3G15A 1SVEA 1YKRA 3Q6WA 2C68A 2R2PA 2QO7A 4EQMA 2F57A 4DGLC 3V3VA 1CSNA 4HVIA 4EI4A 4U40A 2XM8A 2VWWA 1I09A 2P3GX 5I5ZA 5JH6A 1YXUA 2JD5A 3SAYA 3SX9A 4G1WA 2VO6A 2YM6A 4HPTE 3P0MA 5DHJA 5B0XA 4OR5A 3UIMA 3WOWA 3DOGA 3DK7A 4GUEA 2R3RA 4AW1A 3KVWA 4A06A 2PZYA 1OPJA 3NUPA 4CYJA 3VS5A 3W2PA 3TUDA 3OCGA 4UZDA 4M0ZA 4O0VA 3GUBA 3FI4A 1JBPE 3F5XA 4PTCA 3E8CA 4ZLZA 4MVFA 4GCJA 2PE2A 4RLLA 4BCPA 2QOIA 3U51A 3U4WA 2YIQA 3AMYA 3PZEA 5C01A 4AN9A 3FMDA 2PYWA 3UO4A 5I9YA 2R3NA 4DTAA 2IW6A 2XEYA 3ZMMA 3PG1A 4AW0A 3MGYA 2W1DA 4FIFA 4YPSA 4KINA 1ND4A 3CJGA 2IVUA 2XS0A 4MK0A 4RVLA 4M69A 3UPXA 4L7SA 4AG8A 4XV9A 1H1SA 1SZMA 1ZYJA 2BAJA 2Y4PA 2PZPA 3AC8A 1OKVA 3EOCA 3DAKA 3Q96A 4G3FA 4NW6A 5GZAA 3CBLA 4FX3A 1WVXA 3KULB 1YDRE 2A27A 4APCA 4ANBA 4FIHA 5AJQA 3LPBA 2CGUA 5CU4A 2ZV9A 2F7EE 2XM9A 3MPAA 4EOOA 1JPAA 4NKAA 2YFXA 1STCE 1XO2B 2B7AA 5K0XA 2JIIA 3RMFA 3VAPA 2XEZA 1UNGA 4WRGA 2PULA 1KV1A 2C6MA 2JIVA 3PY0A 5FTOA 3D5UA 4IFCA 3L1SA 4XV1A 3A8WA 4F64A 2X6DA 3NMUF 2EU9A 4Y8DA 5CX9A 1YWRA 2WAJA 4RIYA 4G31A 4DT9A 3OW3A 4WBBB 4EH4A 4FV5A 1JWHA 4FV0A 4UWYA 4IWDA 5IMEA 4U81A 4G3CA 4NSTA 1LEWA 3HDMA 1SVGA 3N51A 2I0VA 4FL1A 3C4CA 1CKJA 2XK7A 2Z2WA 3MH3A 1BI7A 4R7IA 4ASEA 5I9XA 4YJVA 5AP0A 3UTOA 2FSOX 2IZSA 3K2LA 3KF7A 1FVVA 4ZJVA 1NY3A 5GINE 3G90X 2OJJA 4B7TA 4FG9A 5DWRA 3FI8A 2C6EA 2R3OA 2ZJWA 4FR4A 4EKKA 4A9UA 3UOHA 4MCVA 4RWLA 2GNGA 4U5JA 3F9NA 4XH6A 3U9NA 2A4LA 4X21A 5HVYA 3WF7A 4BVUA 3W18A 5HZNA 5GIPE 4XMOA 2CNUA 2ZMCA 3COMA 5IISA 4FSZA 4O0UA 1FQ1B 2R0UA 3KCFA 5JFXA 1MRUA 3Q04A 4Y83A 4L52A 5BX0A 1IRKA 3F88A 4AGDA 3E8NA 1PY5A 4IAYA 4RFYA 4FV4A 2E2BA 2ITXA 3C5UA 2H6DA 3PPZA 3V04A 4A9TA 3QKKA 2HELA 2YISA 4I6BA 4I5PA 4M14A 4PDYA 5M4FA 3EYHA 5A4QA 3NYNA 1ZYSA 3TNPC 3W10A 2XMYA 2AC3A 3RAIA 4OTFA 2ONLC 3HV7A 2HWPA 5JRSA 2YITA 4TNDA 4ZSAA 5IMXA 5FTGA 4ZY6A 3FMJA 4TYEA 2XCHA 1H27A 4RJ4A 5CU2A 3REPA 4GIHA 2OXXA 2YCRA 4D2SA 4YZ9A 4ACGA 5FEDA 5J7HA 1LUFA 4W4XA 2YZAA 3LAUA 4G17A 4HGEA 4GK4A 4W4VA 4L9IA 4HNFA 1YXTA 4LOOA 3R8LA 4DEAA 2BFXA 3PY1A 4O82A 4XV2A 5HO7A 4CGAA 4PV0A 4K77A 2PL0A 5LCJA 3QWJA 4UMTA 3KB7A 4YTCA 4EOQA 3HDNA 4V01A 4ZTNA 1QPCA 3FL5A 4PPAA 4IADA 4WUNA 1YRPA 5CEIA 2J0KA 4CRLA 3HUCA 5FTQA 4I92A 1FOTA 3AMBA 1PXJA 4DGMA 3LFSA 3NNXA 3Q5ZA 2G2FA 3QF9A 4IFGA 5TOZA 4ALUA 3MSSA 4BIDA 4GJ3A 5L4QA 3OWLA 5CQUA 5LVOA 2YERA 4WUAA 4JAJA 5CWZA 4X3FA 3UGCA 4YBJA 5AFVA 3KXGA 2R9SA 4LGHA 2OH4A 5FDPA 5C4LA 3MFTA 1XH5A 2BZJA 4FV8A 3C51A 1PXIA 5AUXA 2JKKA 3EQCA 5AR7A 4O2ZA 5KCVA 2BMCA 4QMSA 2QNJA 4IMYA 4RRVA 4K33A 3LCSA 4FVPA 4G2FA 4HCUA 3ZONA 2WTKB 3VC4A 2BR1A 2XB7A 3QRUA 3R9HA 3OTVA 4BRXA 1KWPA 4JLCA 4QOXA 5J8IA 4U80A 4CQGA 5E7RA 3R8MA 3NUSA 3CQUA 3FC2A 5HNBA 4GL9A 3CGFA 3D5VA 3U8WA 4FKLA 3AC4A 3CC6A 1W7HA 1XH9A 3FLNC 5AUTA 2UW3A 4DFLA 5JSMA 1H24A 3ZDIA 2B55A 5FBNC 4FKRA 3FMNA 1J7LA 3VUDA 4EORA 5F94A 5JFVA 5C8KA 4C3PA 2YJRA 4HYSA 4O21A 3GCVA 1SNUA 2WTVA 2W96B 2GU8A 3LJ1A 4Q2AA 5HG5A 3ZRMA 3UC3A 1PMUA 4BCKA 4ZTRA 3O8PA 4O91A 2GNLA 4X3FC 3F3UA 2UZLA 4FSUA 4J95A 4YJNA 5DI1A 4EYMA 2WEVA 4JOAA 1W0XC 3PWDA 2WTWA 5AUUA 3KN6A 5DOSA 1Q3DA 2XJ1A 4QP6A 4CZYB 1AQ1A 3AD4A 2WXVA 2EXEA 2JFMA 2QLQA 3PP0A 4GK3A 4MXCA 4O6EA 3ZEPA 3QGWA 1P4OA 1WBTA 3NUUA 2F2UA 2XBAA 2VTIA 2W5HA 4TWCA 1URWA 1ATPE 4ZP5A 1Y91A 4XP2A 4CVAA 3VVHA 5HKMA 5JMSA 2YACA 4RFMA 2GHLA 4PQNA 3R7GA 3PA4A 2CGWA 2UW9A 3E64A 3HA6A 2VNYA 3DTWA 4O6LA 4X2FA 5HORA 3UZPA 3EL7A 3E93A 4JDIA 1YDTE 4XCUA 5IPJA 5HX6A 3NAYA 3NW5A 1W84A 4UWCA 3T3VA 1YWNA 3JY0A 3VS6A 2I0YA 5J9LA 4U8ZA 3LMGA 5E8XA 5HE2A 3A4OX 2W9FB 3ORMA 5J95A 3S4QA 4AF3A 1GOLA 2QOKA 5G6VA 3GQLA 3QZGA 4C8BA 4OTDA 3SLSA 2WMRA 1G8SA 4J97A 3WARA 4X2KA 5AAGA 3UVQA 5AX9A 2QOCA 2YLEA 3CPCA 3FMHA 4DTKA 2R0IA 1M2RA 4EK4A 2GPHA 4HCVA 4DBXA 2ZV7A 3DK3A 3RPRA 2CN5A 3DQXA 3TNQB 4NK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GC8 A;  3MA6 A;  2XIK A;  4IWP A;  3ZZE A;  3KXN A;  5KMJ A;  3HUB A;  3WIK A;  2PE0 A;  5M4U A;  4NEU A;  2AEG A;  3VUI A;  4II5 A;  5HTB A;  1Q8Z A;  3BHV A;  5HLN A;  2QHM A;  2O65 A;  4MD7 E;  4HGS A;  3RVG A;  3T9T A;  4W9W A;  2C5Y A;  4H3Q A;  4WA9 A;  3F69 A;  2ZB0 A;  3GCS A;  1LPU A;  3NSZ A;  3RIN A;  4EKL A;  4KUJ A;  4PY1 A;  3LFC A;  4WNO A;  4F08 A;  5A4E A;  3V5P A;  5IQA A;  2E9N A;  3SQQ A;  4DFN A;  5K9I A;  4QMO A;  3BLQ A;  4G6N A;  4FTN A;  4D28 A;  2WQO A;  2VO3 A;  3LJ0 A;  5CT0 A;  5HCY A;  2XIZ A;  3KRJ A;  3LHJ A;  4YLL A;  5EG3 A;  1V0O A;  4DFX E;  4D9T A;  2X39 A;  3NCG A;  4GEO A;  2RG6 A;  2OSC A;  3PRI A;  3QRT A;  3V5J A;  3LVP A;  1J1B A;  3UVR A;  1MQ4 A;  5B7V A;  5HHW A;  2W5B A;  2IPX A;  3EHA A;  4JG6 A;  4O4F A;  2JIU A;  2VZ6 A;  5IZF A;  3QQH A;  1BMK A;  1CKP A;  2WPA A;  3EQD A;  2YIW A;  4B4L A;  2CKQ A;  3E63 A;  4ZJJ A;  3FML A;  3QUE A;  5KKR B;  3DFA A;  4FT7 A;  3BQR A;  3LFD A;  3VS7 A;  4D1X A;  5L2T A;  1ST0 A;  4W4Y A;  5EQP A;  3RNY A; 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