3I4BA

Crystal structure of gsk3b in complex with a pyrimidylpyrrole inhibitor
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
361
structure length
359
Chain Sequence
SMKVSRDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
publication title Structure-guided design of potent and selective pyrimidylpyrrole inhibitors of extracellular signal-regulated kinase (ERK) using conformational control.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 359
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3i4bA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3i4bA01
3ALNA 3G0EA 3NAXA 5CU4A 3ZSIA 4E73A 1ZARA 4KIKB 4FTCA 4FUXA 4TNBA 2WOUA 3LVPA 4U97A 3THBA 2PL0A 4BB4A 1ZMUA 3FYJX 4C59A 3MIYA 3H4JA 5ANKA 4CLIA 4ORKA 4EOQA 3Q4ZA 2IW8A 3F5UA 2V55A 4M0YA 3O50A 1F3MC 5E8SA 1IAHA 5HIBA 4NW5A 1XH6A 1IEPA 3ANRA 2YITA 4MWIA 4U9AA 3FXXA 3G51A 4EWQA 3GCQA 3IDBA 3OS3A 4MQ2A 4OTFA 5AUZA 2GU8A 1ZYJA 3KN5A 4CQGA 3LFBA 2HENA 2JFMA 5K0XA 3KMMA 5GHVA 4ACDA 1JSUA 1BL6A 5HEZA 5HLNA 3GBZA 5DN3A 5HVJA 2CKEA 1O6LA 3CTHA 4TL0A 3EN7A 4FEVA 4IHPA 2VTNA 5CSPA 4MNEA 4IX5A 3V6RA 4AE9A 2WAJA 3QRTA 3DXNA 1NA7A 4F0GA 4EOOA 4PF4A 3GCVA 4IX4A 5AX9A 3NYVA 4LUDA 3HRFA 3PZHA 3LMIA 3QF9A 3HMMA 2I6LA 4FKTA 4QP4A 4ZIMA 3HMPA 3GU5A 5HESA 3RALA 2R3PA 4A9UA 2WMAA 1OL6A 4M97A 4G5JA 4Q5HA 4UXLA 3V5QA 3RP9A 5FEDA 2C6KA 1Y57A 4ZLYA 3LCOA 5DVRA 5E8ZA 4P7EA 3QQHA 2VTTA 3TNWA 3QQKA 2HZNA 4IVAA 3REPA 2BKZA 2UV2A 1F0QA 3QYWA 3W2OA 5IH6A 1ZWSA 4D2PA 2Q0NA 2HOGA 3LXNA 3OXIA 4FTMA 4QMLA 3A7FA 4TT7A 5HGIA 5C26A 4O7LA 3ROYA 4JS8A 3E64A 3DZQA 4NSTA 4PUZA 3DB8A 3QTIA 3BYMA 2VO6A 3FMMA 5EW9A 3CJFA 4BHZA 5JRQA 2ESMA 1YXVA 3VS1A 1XQZA 4LOQA 5A54A 5GZAA 5L2IA 3UC3A 5H8EA 4PMPA 5L2TA 4FT5A 1DI9A 2WFYA 2X9EA 1H28A 3VRYA 1JAMA 3P7BA 3VW8A 3UPXA 1Q99A 5CAUA 3I6UA 3ELJA 4L6QA 4I1ZA 2C6MA 4PMTA 5TR6A 3AD5A 5K5XA 4ACCA 2HY81 4BCIA 5CT7A 2YAAA 5E8XA 3HLLA 3UC4A 2VWXA 2JKMA 3HV6A 3KVXA 4IZYA 4DTKA 2Z8CA 4RWJA 3PJ1A 1V0OA 4NM0A 2NRUA 4EH3A 3L9LA 2Z7RA 4F08A 2VAGA 1U4DA 2ITTA 3NW6A 3VUDA 2UW0A 4F6SA 5EFQA 3TJDA 5CY3A 3DBEA 1NXKA 2OH4A 5HE3A 3F3TA 4QQCA 3ZSHA 4O0UA 2XZSA 3BX5A 4IVBA 2DWBA 3E8CA 4MVFA 5M4FA 1QPEA 5TT7A 4G9RA 1HOWA 1I44A 5HG9A 1H1SA 1H08A 3A8WA 3EN6A 4OGRA 2UZLA 3GCSA 2R4BA 3PLSA 5FXSA 4H3QA 3ZLYA 4AW5A 2GQRA 3VBXA 3TV6A 1KSWA 4GFMA 4GU9A 3SDJA 5HU9A 4XUFA 5BVWA 4UN0C 2WMWA 2H9VA 2C6EA 3DNDA 3E3BX 3HGKA 4YP8A 5I3RA 1UNHA 2OU7A 4MD7E 4EORA 4CLJA 4A07A 4CQEA 5HHWA 3B8RA 2QR8A 2CNUA 1Q61A 2G9XA 4A06A 3CPBA 3HNGA 4B8LA 4BTJA 4GCJA 2C6LA 3DK6A 4UY9A 3PSCA 3BE2A 4UZHA 5HORA 4IWOA 5I3OA 4D0XA 2OW3A 3OBJA 3FPQA 4LL5A 3BHTA 3LCKA 4LGDA 3LXKA 5M08A 5LARA 2CPKE 2VD5A 4FKRA 2UZEA 3FL5A 4KRDA 3QFVA 2C5YA 2YHVA 3UVPA 1UVRA 1FMOE 4JIAA 3OG7A 4PPCA 4RIWB 5ACKA 4YC8A 2J2IB 2RGPA 4BF2A 4I94A 2W99B 4FV5A 3ZO3A 4NKSA 4PP9A 2IZSA 4P5ZA 3CPCA 2ONLC 2GQGA 2DYLA 1YW2A 3O7LB 4GT3A 1H24A 2ITXA 3OTVA 4JNWA 3UG1A 3LCSA 4CKRA 3SXFA 2NRYA 2YM7A 5L2SA 1J3HA 2ZB0A 3WI6A 4AN3A 5A4CA 3NPCA 5LVPA 5AX3A 3FAAA 3GOKA 3QZIA 5BUIA 3PA3A 4E4LA 4FBXA 2PVRA 1KUTA 1MQ4A 5BYLA 2XCHA 3F3WA 4I6FA 1YRPA 4EONA 2PE1A 4C62A 4O7SA 1PMNA 2J90A 3I0QA 4F63A 3ID6C 4CZUA 2HWOA 4O83A 3D7ZA 3PIZA 4JXFA 4YSMA 2BHHA 4UX9A 2QG7A 2FGIA 2B54A 4DEIA 4DTAA 3RCJA 4WBBB 2JKKA 2CLXA 3D5XA 4RPVA 3BELA 2B9FA 2XJ0A 4FC0A 4FMQA 4LOOA 4K77A 4R7HA 2ZOQA 2IWIA 3ZMMA 4EEVA 3U4WA 2GS7A 4IIRA 3OC1A 4TPTA 4N57A 4G2FA 4J52A 2ZMCA 3JYAA 5EYKA 1SMHA 3LQ3A 4G16A 4YUQA 1IA8A 3OHTA 4FG8A 4QP8A 2UVYA 3P7AA 3A60A 4S34A 4V0GB 5J8IA 3C4ZA 5IG1A 4MF1A 2B9JA 3AC4A 3CP9A 3ZUTA 3G2FA 1QPJA 2VTJA 4CYJA 4U8ZA 3MPTA 3I81A 4EYJA 2JFLA 2F4JA 5H9BA 2IW9A 4ALUA 5J87A 3LCTA 5A4TA 4YJQA 2P4IA 4J99A 4FA2A 3LLAA 3EZRA 1P4OA 4JR7A 3D9VA 3MY5A 3KY2A 4X21A 4XG6A 3DJ7A 5D41A 1ZLTA 2BRNA 4F6UA 3MFUA 3O23A 4A9TA 3R7YA 4V0GA 2IN6A 3WE8A 2CGXA 2XS0A 2UVXA 1QPDA 4DGLC 3WIGA 3UQFA 3G90X 5A9UA 4KBKA 3Q6UA 3OCTA 4JQEA 3BHYA 2NNWB 5KKRB 3JVRA 3D7TB 1QCFA 4UB7A 3LFAA 4RJ4A 5HVYA 1XH7A 4C7TA 4HPUE 4RJ8A 5GNKA 2I0YA 5CAVA 2BHEA 5ETIA 3QQGA 1FGIA 1IG1A 2J6MA 2QOHA 3FUPA 5JK3A 4QMOA 4MXCA 1OL2A 3MPMA 1ZXEA 4A9SA 3BU6A 3IO7A 4I22A 3MTFA 1XHAA 5HD4A 4U45A 1W7HA 1H25A 4YJSA 1GIIA 3FKOA 3UGCA 4JDHA 5HLWA 5CU2A 4LUEA 2CGWA 4DFUA 4FIGA 3IPHA 4E5BA 2EWAA 4FG7A 3MJ2A 4Z7HA 2C5XA 3SXRA 2HY0A 2OJGA 3I4BA 1U5QA 5H2UA 4EK5A 3I6WA 5I9WA 5M07A 2QHMA 4NM3A 4KS8A 4X3JA 4DF3A 4D1ZA 2BRMA 2X7GA 4XLIA 3VUHA 4M14A 4CZYB 3D2IA 3AT4A 4D4VA 1IASA 1Q8WA 2BUJA 2GSFA 4MQ1A 5E8UA 4ZTMA 1R1WA 2HW6A 3ZC6A 2ZDUA 5FGKA 3VIDA 3WZDA 2GNJA 3KULB 2QURA 3LFDA 3TCPA 4GFGA 3EQCA 3E93A 3TDVA 1RE8A 4G31A 4J7BA 2XK6A 4EQMA 4FV7A 4IWQA 4EHVA 5M06A 4EK3A 3NZ0A 2W1GA 3PJCA 5CT0A 1NY3A 2C3JA 3U87A 3ZRLA 3F2RA 3MB7A 3ZHPC 3A99A 3NWWA 5CZHA 5CEMA 3HUBA 5FTGA 3QZFA 4FVPA 5BPYA 3MFRA 4KKGA 4YBJA 1ZZLA 1R0PA 1RJBA 4EOJA 3FY2A 5EKOA 1FINA 2HXQA 3MB6A 4PL5A 3R8MA 3ENHA 2IZRA 3DB6A 3Q4TA 5DE2A 2QR7A 3OY1A 1OKVA 5A4LA 1YWVA 1Y6BA 4JBVA 4QMNA 3V5WA 3V51A 3GU7A 5LVLA 3LPBA 3C5UA 4K6ZA 4EH9A 4YJVA 3NX8A 3C4WA 3OWPA 2WTCA 2PK9A 3KF4A 4QP3A 3E88A 3FBVA 4AQCA 4H1JA 4Z3VA 2WNTA 5D1JA 3DBFA 3QHWA 4Y73A 3U9CA 1ND4A 3MIAA 3RK5A 3PRIA 4ALVA 4D4YA 3BYVA 2F2CB 5B2LA 3E8NA 4PPAA 4D2SA 4ENYA 3KEXA 3PFQA 4ZLOA 5EI2A 1Q8YA 5HG7A 1J1BA 3RK9A 2WGJA 4R7BA 4DT8A 5LMKC 2CN8A 4RBLA 3FHIA 2B53A 4XCUA 3Q5ZA 4ZK5A 4F1TA 2Y6MA 2I0EA 2ITVA 4FKUA 1OUKA 3ZM9A 3MS9A 3WYXA 4FTUA 2UZOA 3WYYA 3KU2A 3IW6A 4O1PA 3VW6A 4AOTA 4B8MA 3FZSA 4X3FC 2BILB 2OJ9A 3L9PA 4AACA 4C4JA 2CKOA 3ZLSA 4TWCA 3A7JA 3NAYA 3PSDA 4IVDA 4CFFA 2VGPA 4FSQA 3TDWA 5I5ZA 2Y7JA 4AOJA 3GC9A 3H9RA 4E4XA 5AUYA 4RWKA 2WELA 4F09A 2XIXA 3ITZA 4BWKA 4C2WA 4RIYB 5CS6A 5ICPA 4JX7A 3ACJA 4S32A 5TF9A 3KRRA 3TJCA 5IA4A 3EMGA 1BI7A 3PG1A 4BCMA 4Y72A 2WQBA 4FSTA 2PUUA 4RX9A 4XV9A 3R8LA 2J0MB 1YOMA 4G3DA 4YJTA 1PXLA 1ZRZA 2QOBA 3HV3A 4IWDA 5FM2A 4I0SA 2I1MA 1UNLA 4RFMA 2VTLA 4BIEA 2QOLA 3PXQA 2VZ6A 3QALE 3F88A 4MK0A 4HNIA 4PY1A 3DAEA 3PZEA 5HI2A 5C4KA 1JVPP 3PVUA 4FZ6A 4K11A 1BI8A 3C51A 4RIYA 4CCUA 2H8HA 2HIWA 3NEWA 4U7ZA 4MBIA 4C57A 4D9UA 1FPUA 1XO2B 1H1WA 4G3EA 5EI6A 5EYCA 4L42A 5IA2A 4XX9A 2CHLA 2XKCA 2PVMA 3ETAA 5E8VA 4ZZMA 1ZMVA 3A61A 3KA0A 3NLBA 5HVKA 3F3ZA 1DAYA 4IM3A 5FLFA 4C61A 3ZO1A 1KE5A 3QTZA 3NGAA 4CFWA 3EL7A 5JFWA 2WQMA 3M11A 3AT2A 1CMKE 3F66A 5HE2A 2VV9A 2X0GA 4ZXTA 3L1SA 3SQQA 4NM5A 2YIXA 5L6PA 4O7TA 3NUUA 1WCCA 3D5WA 4U0IA 4C4FA 4GK4A 4MHAA 1H8FA 1GZOA 3UO4A 2W06A 2IJMA 3ODYX 2UZUE 2QQ7A 2XNEA 3KK8A 2OBJA 2W4JA 3MDYA 3QKMA 2W96B 3QLGA 3ORIA 3R7GA 4KBCA 3VS2A 4OT5A 4DEAA 5AM7A 2W5AA 1M2PA 2PTKA 3DJ5A 3JY0A 4WSYA 3T8OA 5AADA 3ZXTA 3H3CA 1Y6AA 5IQCA 3R9RA 2QO2A 2XH5A 4FNZA 1OPKA 2JEDA 4XLVA 2C6OA 4EOMA 3PDTA 2JAMA 2C0OA 4OTDA 4ANSA 5CANA 3PPKA 1M14A 3HMOA 3R7IA 3W2QA 4EH8A 3P79A 3F5GA 2VTHA 3LHJA 4I6QA 4FOBA 3RZFA 1IRKA 3GGFA 3UZPA 4DGOA 1OIYA 3NIEA 3UZTA 2B1PA 1S9IA 4YURA 1BX6A 4FKOA 3VUTA 5KMIA 2YDKA 4NTSA 1A9UA 3VS0A 4OTWA 1G5SA 2ZV7A 4NT4A 4WNKA 3TI1A 2VN9A 5KMJA 4M0ZA 2YACA 3W8LA 5J1VA 2XM8A 5AV4A 5JSMA 2QONA 2XF0A 3LKMA 4O7ZA 4YZMA 4DGGA 3V8SA 5IUHA 3QCXA 4IDTA 3MVJA 3PJ8A 1BKXA 4GT4A 5AP5A 4C35A 2GPHA 3UQGA 5F4NA 2VTPA 5K0KA 4F4PA 4F9WA 4PTGA 4BZNA 4BCGA 4QP6A 1LP4A 3ZM4A 1NT2A 3EQBA 3DGKA 3I7CA 3QZGA 1WFCA 4YGAA 4N70A 2BZJA 4BFMA 3QUEA 5JN2A 2HW7A 5BNJA 4FL2A 3NIZA 4DITA 3GP0A 4PRJA 1OM1A 3NUSA 2YIYA 3VS3A 2XK4A 4FK3A 2KULA 2F7EE 3KXGA 3C4XA 2ITYA 2BROA 3NYXA 2WEVA 3JVSA 2RFEA 1DS5A 4BTFA 3VQUA 1NVSA 2QLUA 4L45A 5CEPA 4YLJA 2GQSA 3G9LX 4ITJA 3AQVA 4WRGA 1P5EA 3LW0A 4IZ5A 5IH4A 5M53A 3VBQA 1XH5A 4YJOA 2W1FA 5D10A 3P0MA 4D4RA 4CKIA 2A0CX 3DXQA 4FSYA 4O27B 4F7JA 4JI9A 4MCVA 4FKJA 4EH4A 4MXYA 2CLQA 4FEXA 4YZBA 3ZEPA 2OK1A 4C3PA 3Q2JA 3KL8A 4GK2A 5CU6A 4BN1A 4WIHA 5IQDA 2PVFA 2X4FA 3SW4A 4I23A 4JBPA 4CV8A 5I4NA 3NYNA 4QTDA 2JD5A 4RIXB 3BBTB 4PTCA 5L8KA 3F2NA 3KRXA 4GVAA 3DBCA 4R5YA 4E8AA 3MV5A 2B9IA 4TYEA 2WMQA 4UYAA 4M66A 1YHSA 5EHOA 3SC1A 5CAOA 3CIKA 4UMUA 2E9VA 4GRBA 4E3CA 5M44A 4DFZE 3U6IA 3ZC5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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