3IW6A

Human p38 map kinase in complex with a benzylpiperazin-pyrrol
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
350
structure length
337
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKSQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGLVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSLESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-Throughput Screening To Identify Inhibitors Which Stabilize Inactive Kinase Conformations in p38alpha
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 337
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3iw6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3iw6A01
5ETIA 2YIQA 3LHJA 5ANJA 5KMIA 4HNFA 3NMUF 4ZIMA 4KB8A 5AP3A 2GQRA 5AR7A 4YJSA 4MBJA 4DITA 2FVDA 1W84A 3ZLWA 1PXNA 2BZIB 4MH7A 4I6BA 4OUCA 4BKZA 4F1MA 4BTFA 2JD5A 2X2MA 4JQ8A 2HWOA 2XEYA 5J7BA 2BAKA 2JDRA 4PUZA 4AGCA 4GMYA 3ZBFA 5AR8A 2RL5A 3AD4A 3WZJA 4GJ3A 5KBQA 3E92A 3WZEA 4BI0A 4D1XA 3K54A 4RGJA 3BGPA 3E8DA 4C34A 3BHYA 3VIDA 2ZDTA 3CTQA 4BZNA 3NNUA 4UMTA 5HVJA 5GZ8A 1JPAA 3OWLA 4S2ZA 4Z16A 4BZOA 1NY3A 3DZOA 4AZTA 4X0MA 4QT1A 1XQZA 4KUJA 3FZPA 3Q4TA 1TQPA 4HVGA 4GKHA 2IW9A 3KXGA 5M07A 1H1WA 4L45A 3HEGA 3T9TA 3DJ5A 2QOHA 3R73A 2DUVA 4IWQA 3QCSA 5IH6A 2UVXA 2J7TA 4FIHA 3LKMA 5JK3A 5LMBA 3ZTXA 2GU8A 1IASA 4GSBA 4QQ5A 1BL6A 1Q3WA 4XBRA 2Z7LA 2GS2A 5ITAA 4ONAA 3ORIA 1XJDA 5BUEA 4FKSA 1RJBA 1ZYJA 2ZYBA 4NKAA 2YJSA 2ZM3A 2C1AA 1OL6A 3V51A 1IA9A 4TWNA 4KSPA 3REPA 3ZC6A 1Q24A 3TV7A 1X8BA 4AZWA 4V01A 2VTPA 4MF1A 3D5XA 1GIHA 2XM8A 5IUGA 3SHEA 3UQCA 1UKHA 2JKQA 5DH3A 2X2LA 4V04A 3NNXA 3OCTA 2XK4A 2VTTA 2J9MA 3OCGA 5EI2A 2Z7RA 4X2NA 3UO4A 3UVPA 4AW5A 4WNOA 1K2PA 4ALUA 4FEXA 2XCHA 4ZSJA 3RPYA 4NH1A 4RVTA 4KAOA 3LZBA 4XG7A 2OJ9A 3JY0A 3UG2A 3VJNA 4QMWA 4CFNA 2ITTA 2WMXA 3IO7A 3TN8A 4BB4A 4YTHA 2HY0A 4OTPA 4IIRA 2VTSA 4RA5A 3QXOA 4FTJA 3F3WA 3CKXA 3P5KA 2XIRA 5EDQA 3MY5A 2UZUE 4E4MA 2YZAA 3GU7A 2G15A 1OIYA 3FPQA 5FEDA 4QTCA 4RX8A 1TQMA 5G6VA 2W0JA 3NRMA 4FA2A 4K77A 4ZTHA 3MA6A 5CSWA 2XK3A 5AP4A 4AGDA 4KIPA 3PY3A 1V0PA 1AGWA 2BZHB 2J5EA 1WVWA 3AMYA 3OTUA 2A27A 2AC5A 2WMBA 4LGHA 4HYUA 4BWPA 3COHA 3W2QA 3HYHA 4GS6A 1IA8A 3WF5A 4FSUA 3HKOA 2JGZA 1JAMA 2YLEA 2PE0A 5EOBA 2R3KA 3FWQA 5FG8A 1GZOA 3E8EA 3QGWA 4JBQA 4EKKA 1CDKA 3LCTA 3ZSHA 4BCOA 4JDHA 3NYOA 2GNLA 2HK5A 4FKLA 3ROYA 4CYJA 2YIYA 2QURA 3ORTA 4JL9A 3JYAA 5HORA 4U40A 4FKPA 2EXCX 4J96A 4WUAA 3DLZA 2G01A 4GUBA 4QP9A 3LJ2A 2PHKA 3HRBA 3U51A 3C7QA 1FVVA 3QUPA 3DDQA 5AIRA 5EFQA 4UZDA 5DFPA 3Q5ZA 1J91A 4M84A 4ACGA 4AW0A 3IOPA 4D2VA 3QWJA 4P4CA 2YACA 2UVYA 3LFBA 4OGRA 5J8IA 2XIXA 3EN5A 4FE2A 3H9OA 1W8CA 3OUNB 3QFVA 3FY2A 4NCTC 4TYHB 2QODA 1BLXA 2Y9QA 1LP4A 5G1XA 2EB2A 4KINA 3KRRA 3BU3A 1H4LA 2ACXA 3HA6A 4FYNA 3ZO4A 5DI1A 4RLKA 4F63A 2PU8A 4BCGA 4BBFA 3SC1A 2JDTA 4ZEGA 1JKKA 3PA3A 2A1AB 3OWPA 2G2IA 3EL7A 4G5JA 4AW1A 3NNWA 4MNFA 5CF5A 1QL6A 2OSCA 4TNBA 5AUVA 2V7AA 3S1HA 2UW7A 4ZTRA 5TT7A 4BDEA 4C2WA 4L68A 3MTLA 4FOBA 3CGFA 4ZTQA 4FVRA 4Y46A 1ZY4A 1YDTE 4QP7A 2HYYA 2WTKC 2VX3A 3IDCA 1XH4A 4LMNA 3ZU7A 4ASDA 3G15A 4I5MA 4F65A 4ZMFA 3HMPA 1APME 3TACA 3VNTA 4USDA 4A9YA 2X6DA 4ANBA 4DLJA 3HMIA 4GCJA 3P7BA 3E8CA 3KCKA 3OCSA 3BBTB 1PKGA 3Q3BA 3ZCLA 4FGBA 4ZSAA 5I9YA 5DR9A 3IG7A 4ITJA 3VBTA 4QPAA 4FSZA 1U59A 2XKFA 3FYJX 3UVQA 4D9UA 4DA5A 1XKKA 4OTRA 3W2OA 4CCUA 4E5BA 1V0BA 2JITA 5IDPA 3R01A 4UMQA 1Q62A 3A7IA 2OJFE 4MXZA 5E8VA 3VUGA 2C3LA 3NUSA 3UODA 2OXDA 1YXSA 2P33A 4BDHA 1WFCA 4GL9A 3FXZA 3QD3A 5FXRA 4M97A 5IA2A 4L53A 4ENXA 3Q9WA 5CS6A 3TG1A 2UW0A 4H39A 2V22A 4JBVA 4USEA 3GC9A 3SD0A 4ANSA 1H07A 4P90A 4AT3A 4B4LA 1FINA 5TE0A 2VX1A 5HIBA 3UNZA 3MIYA 4LOQA 3GU8A 3HDNA 3HNGA 4NJ3A 5HNBA 2QCSA 2QOCA 4YJTA 2ONLA 3TTIA 3OW3A 2WU6A 3ACJA 4F6UA 2BKKA 5FXQA 2O63A 3A61A 3G33A 4FV7A 4F09A 2ZM1A 5EDPA 3L8XA 3CR0A 5BVDA 3NYXA 3VUKA 2QQ7A 2HCKA 5ACBC 4XLVA 4WO5A 5IG1A 3ATTA 5FUTA 4JDIA 4UV0A 1PHKA 2JDOA 2YM5A 2HZIA 3UTOA 5ICPA 3FL4A 3BBWA 3VQHA 5A9UA 1ZARA 5BUJA 4X2FA 4RZWA 3TZ9A 4ZJJA 4BDKA 3MH1A 3ZZEA 1W82A 5EHOA 5HNGA 4F08A 4IWOA 4UWCA 4O1OA 3FC2A 4Q9SA 4BDIA 5A4QA 4FVPA 4D0WA 1PMVA 3DT1A 3QYWA 4YURA 4NK9A 1A48A 2EXEA 4FKIA 1YWNA 2G2HA 4UB7A 3OW4A 2R3MA 3F5PA 3QZGA 4GFOA 3FV8A 4U44A 2ZVAA 4XV1A 3TV4A 4A9TA 3COKA 5C8NA 2ZJWA 3GCSA 5ETFA 3D5UA 3ORZA 2B55A 4GK2A 3RINA 4I0RA 5J1VA 3O7LD 3PY0A 4WOVA 3ZEPA 4EOQA 3F2NA 1KUTA 3WE8A 3R1YA 5D9HA 4YP8A 5L8JA 4BL1A 2OO8X 4MX9A 4UEUA 1W83A 5HLWA 2XJ2A 4HYHA 3DKFA 5ANIA 2BRBA 4YHJA 1PF8A 4BRXA 4D2SA 1W98A 5BMMA 4QMTA 3EFKA 1VJYA 3NCGA 4PMSA 5ANEA 3EN6A 5IQAA 4O2PA 3HAMA 3R00A 2ETKA 4GT5A 3QQUA 4L7FA 5HX6A 3UZRA 4AU8A 5TF9A 2JFMA 4W8DA 2PVJA 3PLAE 4QPMA 4C35A 3KRLA 3RMFA 4YZCA 3AT3A 3PRIA 4EYMA 3VHKA 3VN9A 2FA2A 5CVHA 4C7TA 4YLKA 4NL0A 4WNKA 2E9VA 3PE1A 4F7NA 3COMA 4FUYA 5EG3A 5IQCA 3SOCA 4DFNA 3U8WA 3OT3A 4X6QC 4NWMA 2P2IA 5I3OA 2YIWA 5HG9A 4J8NA 5DGZA 4ZLYA 2VTNA 1H24A 4GIHA 3MBLA 4Z55A 3BGQA 2QKWB 2PZ5A 1UWHA 4IM3A 4O0YA 5DG5A 5HCYA 4O0SA 3R9NA 2C5OA 4OAVB 4CFWA 2HIWA 3OD6X 5C8MA 5CU4A 1QPJA 2C6KA 2V62A 3G9NA 3QUDA 4CLIA 2WHBA 1ZWSA 2XRWA 3GC8A 5KNJA 4P5QA 4QO9A 5CYIA 3SOAA 3KREA 3G2FA 2WMUA 3QLGA 4C4IA 5IQDA 3AT4A 5D7VA 5FD2A 4ASZA 1M7QA 2WFYA 2BTSA 5CAPA 2XNMA 4DEEA 4DTAA 3H0ZA 4JX7A 4N6YA 5FP5A 2VGPA 3R2YA 4LFIA 5H3QA 3UPXA 3K5UA 3F61A 4YMJA 4G6LA 2IJMA 3RAKA 3F7WA 2I0HA 4YZ9A 1IAJA 4FSMA 3UP2A 2UZNA 2R0UA 5CLPA 3EJ1A 4BCPA 5HEZA 5JGAA 4E3CA 3QTXA 4DE4A 3KMWA 2BFYA 4N70A 3ROCA 4KS8A 2OXYA 4I1ZA 4PMTA 5AX9A 5AAFA 2QU5A 1S9IA 4O27B 3QLFA 4YHFA 4FKTA 5A4CA 2H34A 3UYTA 5CALA 1FGIA 1H1RA 1TKIA 2XCKA 3BWJA 3EN9A 5HE0A 2IZUA 4FV3A 3RHXA 3F82A 4HGEA 1SM2A 4Z3VA 5HLNA 3JUHA 1YXTA 5DA3A 3ODYX 3ZLYA 4P7EA 3L9PA 3ZC5A 3WF7A 3ZLXA 4DHFA 5FDPA 5JZJA 3A2CA 4G6NA 5CNOA 3PSBA 4WNPA 2W1ZA 3FHIA 3ZH8A 3V6SA 5B2KA 3EFWA 2C6DA 5CEPA 2RG5A 4G31A 2VWYA 3ZEWA 2RFNA 4FTNA 3UNKA 2VV9A 2FUMA 1NVRA 2WTCA 4H3QA 4C0TA 4EHVA 3R1NA 3EQPA 3VAPA 5ANDA 4AT5A 4D2RA 4MBLA 2R3GA 4ZTLA 3SX9A 3MI9A 5L2TA 3D0EA 2XF0A 4L3PA 2CKEA 2RIOA 4EUTA 3DBDA 3Q60A 4FT0A 3R9HA 5DEYA 5KKRB 3LCOA 5LOHA 1QPEA 3EKKA 4IX6A 5I4NA 2PZRA 2HZ4A 2WTVA 3TUCA 2ZMDA 4NYEA 2X9EA 2LAVA 2F57A 2VGOA 4EJ7A 2UW5A 4CKIA 3UZTA 4NIFB 1QCFA 4RVLA 3FBVA 4FTRA 3GOPA 3DU8A 5LMKC 4ID7A 2WIPA 4M0ZA 1MQBA 4B8MA 3QQGA 4N6ZA 3E88A 4IB3A 3QRUA 4WKQA 4FIJA 2YA9A 3Q6UA 2JDVA 5HVKA 3CPCA 3II5A 4NZWB 2JAVA 4K2RA 3TUDA 4PY1A 3ZHPC 4OT6A 5E8XA 1U5RA 3C4XA 2P3GX 3OF0A 3W16A 3PE2A 2H9VA 1Y91A 2V55A 2WEVA 5ETAA 1NVQA 2QR7A 2YN8A 2NRYA 2OWBA 3F66A 4FTAA 4DFBA 5CANA 1IEPA 5HHWA 1U5QA 4J95A 4FC0A 3DOGA 4AN3A 4WSYA 4KIOA 4ZS0A 4HVIA 3SGCA 2J5FA 4IC8A 5F95A 3ALOA 1F0QA 3EMGA 4MXYA 5JFWA 3E64A 3W8LA 1A9UA 4TY1A 2JDSA 4CXAA 2ITXA 1CKIA 2ZV8A 3MSSA 1R1WA 3F3VA 5ANOA 4AFEA 4UMRA 2HZ0A 4UMUA 3G6HA 2PZIA 5GINE 3MVLA 1Q8WA 4ENYA 1UNHA 2A2AA 2UW6A 4FOCA 5EK7A 1I44A 4D4RA 4AQCA 4L52A 5IQBA 5CAUA 1GNGA 3KB7A 4C58A 1LUFA 4FIFA 5DEWA 3UOLA 2J0KA 3AC8A 4EQUA 4FZDB 3VF9A 3QD4A 4FTLA 3AXWA 2BIKB 5CEKA 1QPCA 3RALA 3VS4A 4L01A 4XRJA 3ZM4A 5AUWA 5CSPA 3BPRA 3FSFA 4FTCA 4YZBA 1A06A 2I6LA 3KXHA 4W4YA 4Y72A 2VO3A 3MPTA 4TYJA 5DBXA 2JIIA 2ZAZA 5A4EA 4CV8A 3VUDA 4M0YA 3MJ1A 3POOA 4FBXA 5L6PA 1YKRA 2RFSA 3NIZA 3NS9A 5EM8A 3CIKA 4BBMA 4F9YA 4RWJA 3R1SA 5H8GA 1OKZA 3MESA 1F5QA 4EH7A 3S3IA 4CD0A 5HNIX 3CLYA 3P79A 3B2WA 3QYZA 5CT7A 4GRBA 2WXVA 2BRGA 2R3JA 4FI1A 3RBWA 3QA8A 5LCJA 3OP5A 4G16A 3TNHA 1BYGA 3ZFMA 2HW7A 4O6EA 2IVSA 3R7EA 3O51A 1YDSE 3D2KA 1NXKA 4BGHA 4FV2A 4GYIA 3QHRA 2BALA 4RLLA 1Y8GA 4U3YA 3FMLA 4GT4A 3D5WA 4E4NA 2VTLA 4JS8A 4NT4A 4YLJA 4RIWA 3MY0A 1T45A 4MD7E 5DT0A 4CLJA 5HQ0A 4A4OA 3ZSGA 4HVDA 1FGKA 3AT2A 3ACKA 2F9GA 4WRGA 3FZTA 4FKGA 4IXPA 3R7IA 2B9JA 4MXOA 3R02A 2J50A 2W4OA 4K18A 5CI7A 3MFSA 4APPA 3GBZA 3ODZX 1KE5A 2VO6A 2Z7QA 4MD8E 3PJ1A 3PTGA 4LUEA 4L43A 2OLCA 2P55A 4BIDA 3DKCA 4D4VA 3LQ3A 3PSDA 2ITQA 3HDMA 2WMRA 2JC6A 3BQCA 4L42A 4AX8A 1JKLA 3U9NA 1OMWA 2HXQA 4OTHA 1U54A 1H1SA 1NT2A 2YCRA 2C6OA 1OB3A 3R21A 1ZOEA 3RI1A 2UZWE 4DCAA 4UWYA 3EHAA 1NVSA 5E91A 2PY3A 3JY9A 4MBIA 4ZSEA 3RP9A 4QTBA 3O50A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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