3JS2A

Crystal structure of minimal kinase domain of fibroblast growth factor receptor 1 in complex with 5-(2-thienyl)nicotinic acid
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
302
structure length
295
Chain Sequence
ELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGAFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel fibroblast growth factor receptor 1 kinase inhibitors by structure-based virtual screening
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Basic fibroblast growth factor receptor 1
total genus 88
structure length 295
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3js2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3js2A01
3AGLA 3ATTA 4ZS0A 3KN6A 3UZPA 3KRWA 3FXXA 2WMBA 4IBMA 5J5TA 4LRJA 4YHJA 5HCXA 3RK7A 4F65A 2NNWB 3VWAA 4KWPA 2J0IA 2C1AA 2XM9A 5J9LA 5CF6A 2VO0A 3EL7A 4A9RA 1MUOA 4IAZA 4MXZA 4S33A 2GHGA 1H0VA 2X9FA 3DS6A 5EM5A 5FRIA 3QYZA 3VS3A 3CD3A 4CFWA 3CY3A 2JDTA 3CTJA 3IGGA 4S2ZA 5CT0A 5AV1A 4WRGA 1P5EA 2JLDA 3DBDA 3Q32A 3OW4A 5AUZA 4O0SA 5AR8A 4CT1A 4G3CA 3ANRA 1OIRA 2C1BA 2GSFA 4FTKA 2BDFA 1J1CA 2Z7LA 3O96A 4GVAA 4RJ4A 4M69A 4BDKA 2ESMA 4BGGA 4FL2A 4RJ6A 2VNWA 4D1XA 4C35A 4FG9A 4D28A 5BMMA 1O9UA 2EU9A 2UW6A 2WQMA 2I0VA 3ORKA 2VTJA 2W4KA 4QP7A 4XRLA 5C03A 2PE1A 3PVBA 1QL6A 3K2LA 4GV1A 1PXOA 3HNGA 4TT7A 4EHEA 2CJMA 2ZMCA 4PP9A 1L3RE 2I0HA 5KZIA 2A0CX 4YLKA 3W18A 4BKYA 4ZTQA 5D41A 3COIA 3IW8A 2JKOA 4YZCA 4JDJA 2DYLA 3IQ7A 4YTIA 5BYLA 2IZTA 2ZJWA 3VS2A 3TV4A 4FIJA 1CKPA 3G9LX 4QQCA 1UU8A 4LQMA 3AC8A 4WNKA 3O8UA 2R7BA 5J9ZA 4L01A 4TYEA 4L3JA 3RNIA 3UIUA 4IWDA 3BX5A 3BWFA 2BDWA 4HCTA 2PZYA 3TV6A 2WMTA 4B8LA 3ATSA 4BICA 3MVMA 4DGNA 2PVKA 4LUDA 4I20A 4CFMA 3QGYA 3UPXA 1WVYA 4L6QA 4TYIA 3W55A 1EH4A 3SXRA 4BCOA 2XBAA 4DFZE 2QD9A 4MF0A 3B2TA 5FD2A 4ZLOA 3IOPA 5A9UA 3I81A 3Q9XA 2XM8A 3L9NA 2ZMDA 4IVCA 2WELA 4RWIA 4LOQA 3EN4A 2R3OA 4UZDA 2GS6A 3R7GA 4YJVA 4BDBA 4BCQA 5L4QA 2J0KA 5EW3A 3PVWA 3OY3A 2CGVA 3R01A 1NVRA 4TRLA 4YBJA 5AX3A 3WZKA 3KXNA 3KXHA 4L3LA 4EC8A 4I0SA 4N4SA 4OTFA 3FDNA 3TTJA 2R3RA 3F61A 4FKTA 4IM2A 4RA4A 1YI3A 4EH8A 2VTOA 4QMQA 2BRNA 3SVVA 1SZMA 3NMUF 4EK6A 4KSQA 5TT7A 2UVYA 3EFWA 4RFMA 3QRIA 4NW6A 2QLQA 3LXLA 4LV8A 4WNOA 5C4LA 3ZH8A 4E1ZA 4EHVA 3DK6A 1YRPA 4KBCA 2UZUE 3S2PA 3DLZA 3EJ1A 4MBIA 4NFNA 4MBJA 3U6IA 4EK5A 5FBOA 4G16A 2YM3A 5CNOA 3Q2MA 1YVJA 3I79A 2BIKB 2QOLA 1W0XC 4OBPA 5AR3A 4CGAA 2BR1A 3VBVA 4P2KA 4CG8A 2ZV2A 4Q5HA 1SNUA 3BYMA 2UZVA 1J7LA 3GNIB 2ONLA 4M15A 1RW8A 2PMLX 4FV7A 3FYJX 4QTDA 4NM5A 5DN3A 2HZ4A 4IM3A 4NJDA 4NKAA 3OCGA 3W32A 1VZOA 3R8LA 4O82A 4HVDA 4E5WA 3CCNA 4D58A 5FUTA 4S32A 5M51A 4D5HA 2AC3A 3FMKA 3QCYA 3QRTA 3WF8A 4DYMA 3KMUA 1E1VA 3K5VA 5KMKA 5HU9A 4FGBA 3V5WA 4NL0A 2QOQA 3H10A 3GCVA 2UW9A 3JVSA 3TNWA 3P7BA 5CEMA 1G3NA 1OECA 2B52A 3MFSA 1UA2A 2IZRA 3DKFA 2HENA 3EIDA 3F3ZA 4OBQA 4DH1A 5JGAA 4FE2A 1YWNA 4AE6A 4RC3A 5E9EA 5I9UA 4R8QA 4QYGA 4E73A 4FA2A 5AV2A 3M42A 3VJOA 1P4OA 5DWRA 3W16A 3MA6A 4C59A 3PFQA 2B4SB 2ITNA 1OGUA 2E9VA 3DB6A 4V0GA 4YC6A 2CNVA 2XNPA 3KRXA 3MS9A 3F2RA 2Y6MA 3CQWA 4OTRA 5K0KA 3R7IA 1O6KA 4NKSA 4GL9A 1RJBA 3G90X 3HA6A 3BE2A 4FL1A 4A4OA 4NM3A 1R0PA 4D4RA 2OW3A 4G17A 5IA0A 4DCEA 5BMSA 5IEVA 3KEXA 3JXWA 5IA1A 4G31A 1YI4A 3FUPA 1ZYJA 4MNEB 3DU8A 5IQDA 2IO6A 4OLIA 4YPDA 2OH4A 4FK3A 4EKKA 3DGKA 4XG9A 2QVSE 4QMPA 1I44A 1KE5A 3FZPA 3FSFA 1REJA 4U41A 3WE4A 4FEUA 4RRVA 2C5YA 2OO8X 2ETKA 3M2WA 4F9AA 1NA7A 1Q97A 2HW6A 3LZBA 3F5XA 3KRJA 4FTQA 2ZOQA 3NUNA 3S0OA 2X7GA 4XV9A 5JFXA 4TKSA 2R3GA 3SHEA 4NIFA 2B9JA 5BUIA 4E5BA 4ITJA 2GS7A 5DFPA 5E8YA 3MVLA 3C5IA 4QMSA 4EOQA 4CV8A 1CTPE 5ANJA 4E7WA 4IX3A 3F5GA 3DTWA 4ZAUA 5EM8A 4IW0A 2HXQA 3T9IA 4RT7A 4RC2A 1XH4A 3U4UA 3HV4A 3GENA 4PDOA 4PF4A 3MTFA 4O0RA 4KD1A 4DE4A 2ETMA 3TACA 3D7TB 4RIYA 5D11A 4AW1A 4O1PA 2WO6A 5KO1A 4BIEA 3W1FA 4RMZA 4J8MA 4EQMA 2C3KA 5CEKA 2O8YA 3LAUA 4HNIA 4EUUA 3NR9A 2CLQA 3LMHA 1WMKA 3KN5A 4F63A 3BIZA 4Q9SA 2QOOA 1TKIA 5KNJA 3C1XA 3OWPA 4E4NA 4CLJA 3NAXA 4F7JA 3LM5A 3D5XA 2QOIA 3TJCA 1SNXA 2E9OA 3C7QA 3FMJA 2WPAA 4R6VA 3ZLYA 2CNQA 2BUJA 4M68A 3GC7A 4A9SA 4BCKA 2UUEA 3SX9A 4AT4A 2G2IA 4HVSA 1H4LA 4EBVA 5BVDA 2CN5A 3PA4A 3R1SA 4Y95A 5DPVA 5E92A 4FKOA 3T8OA 1TQIA 3HMIA 4QMTA 3O7LD 4G2FA 5BNJA 4J99A 4XLVA 4XLIA 4Q9ZA 4N57A 5F94A 3VS6A 3PXKA 2YDJA 4FX3A 1XH5A 3FZRA 3KCKA 2ZYBA 2OBJA 2W05A 4W9XA 3R9DA 4FTIA 5I9ZA 3ZLSA 4X2GA 5FWKK 3PG3A 1VYWA 2PU8A 2CSNA 4GFGA 4MTAA 5HCZA 3ZO4A 3GT8A 2WEIA 5J1VA 3UMXA 2REIA 4PL3A 4ALWA 3C9WA 4EK8A 3QQGA 4Z16A 5KMMA 4QMYA 5AR5A 3Q4CA 4QTEA 3P0MA 4WO5A 5KMIA 5GINE 3E88A 2ZM1A 3ANQA 3ULZA 4AN3A 5A4CA 3RWQA 4C36A 5LCKA 2FGIA 4FZ6A 2VTRA 2JKMA 3PXRA 5CVFA 5EW8A 3L9MA 4F9WA 3MH1A 3E5AA 2P33A 2VD5A 2HW7A 2VWZA 3R0TA 4IX6A 3FPQA 3B8QA 4LL5A 4NU1A 3T9TA 2QURA 3UNJA 2FSMX 2LGCA 4GMYA 3MPAA 4AA0A 5CI6A 3MGYA 4ALUA 1K9AA 3EQHA 2IZSA 5CAVA 3AT3A 2I6LA 2W4OA 3A61A 3PJCA 4WBOA 4B4LA 4MKCA 4BCIA 3C0GA 3HV7A 3FI2A 3CJFA 3OCTA 4XYFA 4WSQA 3F3UA 4FF8A 5CWZA 3DK7A 4O21A 3TCPA 3OXTA 3RWPA 4CKIA 4U44A 4XP2A 2F57A 5AR2A 3ORTA 3UBDA 4S34A 3RPVA 2X4FA 3U6JA 2XVDA 3A7GA 4TNBA 4GEOA 5F1ZA 3EQRA 3TZ8A 5AR4A 1FVTA 3AD5A 3TXOA 4FTRA 4YC3A 3ZYAA 5IZFA 3QA8A 3ZCLA 1OPLA 2JAMA 4ZS4A 5HIDA 5IUHA 4JL9A 4RQKA 5L6OA 3E3BX 3N51A 3D9VA 4EH6A 4C58A 2QLUA 3H0YA 3F2NA 4KBAA 3PA5A 3G51A 5FM2A 4EQCA 4OTGA 3F5UA 1IRKA 3KFAA 4ONAA 5HBJA 4HVGA 5IH5A 4I92A 5EOLA 4HCUA 4G3FA 5C01A 3ZUVA 4WUNA 4K2RA 4A9TA 3HRCA 3AD6A 3L9LA 4I3ZA 3TWJA 3TM0A 5FEQA 5A6NA 2W9FB 3MB7A 4IQ6A 2GNJA 1UKIA 4CFFA 4CSVA 2YWPA 5CVHA 3DJ7A 3JR1A 3CD8A 4C4IA 2J0LA 5GZAA 3Q5ZA 5H9BA 3IDPA 3LMGA 3UZTA 2C5OA 4QYHA 2XKCA 3C4WA 5CEOA 1YXXA 4FEVA 1TQPA 4O27B 1B39A 2VAGA 5GJFA 2QHMA 4A4XA 3R8VA 3DKOA 4JBOA 3FZTA 4P4CA 4CYIA 5AEPA 4RX9A 2WTVA 3FKOA 4WUAA 2X2LA 3F6XA 4E4MA 5M57A 1PMVA 4NSTA 5L8JA 2WQOA 4UN0C 3I0QA 3HUCA 5CU4A 5E7RA 5L3AA 4OAUC 2UZLA 3NUAA 5CYIA 3Q9ZA 3F7WA 2PVMA 3H9FA 1OIQA 3AC1A 4ANNA 5LMBA 5DT4A 2B55A 1XJDA 3QCSA 1V0PA 3GCSA 4EORA 2XRUA 3D5UA 4UWYA 4XMOA 3OTUA 4EH5A 3FAAA 2HOGA 2XB7A 4I6HA 4F6SA 3PPJA 3RK9A 2C6KA 3BV3A 3UO6A 2HZNA 2YIRA 3QTIA 5EI2A 3FMHA 3EN7A 4MD7E 3MFRA 3Q4ZA 2J2IB 3LHJA 4UMRA 4FOCA 5AP0A 5AIKA 4X6QC 2C30A 2CDZA 3IONA 4EH2A 3DNDA 3MN3A 5FP5A 1IG1A 3TUBA 4C3FA 4CCBA 4I5CA 3UIXA 5CSXA 1P14A 3KXMA 3R2YA 2HY0A 4ZZOA 3VN9A 3WOWA 3ZSGA 2X7OA 4M69B 3SG8A 5AP3A 5KKRC 4RA5A 3RGFA 3QTQA 3VBWA 1UKHA 3C51A 5EQYA 4DA5A 3L8SA 3UVRA 4J7BA 3TKUA 5BPYA 3PYYA 5CANA 4YGAA 1ZYSA 3GEQA 3R30A 4ASDA 2BTRA 3COKA 3VW6A 4Z9LA 4XP0A 4KKHA 3Q2JA 1Q8YA 1Q61A 4JS8A 2YJRA 4DEAA 5GZ8A 5L6PA 4H58A 4QMUA 1OL2A 1H0WA 2P0CA 2ITWA 4ITIA 4JXFA 4RZWA 1OPJA 3P79A 3PY1A 4F1TA 3PUPA 2OG8A 1NVQA 4II5A 3ZLWA 5HU3A 3FLQA 4DH7A 4F9CA 5C8KA 5HQ0A 3NNUA 4IC8A 3ALNA 4QMLA 3W2RA 2WMUA 1QCFA 2JIIA 3ETAA 4TYGA 2YN8A 3D2KA 3KQ7A 2WU7A 2QNJA 4GS6A 3Q3BA 2GFCA 1XO2B 4RX5A 5LVNA 3DZOA 3U55A 5LCJA 3PA3A 2XYNA 4MD8E 1JLUE 2YIQA 3BU6A 1YHWA 4AUAA 3CPBA 5TE0A 4JAIA 4F6UA 2QI8A 2VTNA 3BGPA 5CU2A 3BEAA 3UOHA 4X21A 2BMCA 3IPHA 3ZFYA 5AV4A 3EOCA 5I9VA 3MSSA 2PHKA 3R6XA 1CDKA 1WBOA 4GH2A 3QGWA 3ZOSA 3BLHA 4ANBA 5JZNA 4AP7A 4IDTA 3UVPA 4FG7A 2XMYA 4L68A 4KSPA 2X6DA 3NAYA 4FKQA 4JBQA 4A06A 3GC9A 2VGPA 5FM3A 4A07A 4KAOA 3H9OA 4KBKA 4QT1A 4RIWA 3QWJA 3DJ5A 5D10A 1OVEA 5HTIA 2PVJA 2C4GA 4EYJA 4ZP5A 3MI9A 3DQXA 3JS2A 4ZJJA 2WTIA 2BDJA 2ITVA 4YO6A 1FBNA 4X3JA 5HTBA 3NUSA 4GCJA 2PVNA 2CKQA 3L8XA 5AX9A 2ZV9A 3VBQA 4YO4A 3UVQA 5KHWA 4P5QA 2JFMA 2VO3A 2R7IA 3BU3A 3VHKA 5EI8A 4CNHA 1H1PA 4FGRA 1YWRA 4QQ5A 2YHVA 3I6WA 4UB7A 4Y5HA 5DA3A 5D1JA 3TEIA 2IW6A 5FTOA 2C68A 4IH8A 5KKRB 4IE9A 4FZ7A 3KMMA 3POZA 4RG0A 3R9RA 2EXEA 3IG7A 3SD0A 3W8LA 4RPVA 2HZIA 2WIPA 4XG6A 2XYUA 4FYOA 5EHOA 2DQ7X 3JVRA 3WZJA 3UZRA 3ZDIA 3ODYX 3UMWA 1MP8A 4C33A 5HE1A 4DBNA 2R0IA 3OEZA 5EM6A 4QTBA 4QMNA 2YERA 3QU0A 5LWNA 3UE4A 2IVTA 2WB8A 4RX8A 2IWIA 4O38A 4W8EA 2CMWA 4U79A 3TDVA 4G5JA 4DFBA 2YA9A 3RAKA 3EFJA 4MXAA 4PL5A 3LIJA 4AAAA 2ITPA 2W4JA 4O7WA 2QQ7A 1FGIA 1UNGA 3RMFA 3WF9A 4HPUE 2YAAA 4RWJA 4DG2E 2X8EA 4DT8A 2OI4X 3R1QA 2XKEA 1OUKA 3MFUA 3DY7A 4D9UA 1IEPA 4HGLA 3HKOA 4JX7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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