3KK9A

Camkii substrate complex b
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
282
structure length
275
Chain Sequence
TKFSDNYDVKEELGKGAFSVVRRCVHKTTGLEFAAKIINTKKLSARDFQKLEREARICRKLQHPNIVRLHDSIQEESFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREFYSEADASHCIQQILESIAYCHSNGIVHRNLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVNDSEAWHGFAGTPGYLSPEVLKKDPYSKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYAQIKAGAYDYPSPEWDTVTPEAKSLIDSMLTVNPKKRITADQALKVPWICNAIHRQDVDC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Intersubunit capture of regulatory segments is a component of cooperative CaMKII activation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Caenorhabditis elegans
molecule keywords Calcium/calmodulin dependent protein kinase II
total genus 83
structure length 275
sequence length 282
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2009-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kk9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kk9A01
3C4CA 1Y57A 2X7FA 3FI2A 3PJ3A 4N70A 3UP7A 3LLAA 3PYYA 3GB2A 1REJA 5CLPA 4DEEA 4FOCA 3RM7A 1SNXA 4MX9A 4U3YA 4MF1A 3O71A 3MA6A 5FEEA 3ZEPA 2JDOA 3FJQE 4F99A 2UZWE 3V6RA 1WBVA 3AC2A 2YWPA 2JAMA 4BRXA 4QP6A 2VAGA 4BL1A 5A54A 5HZNA 4GKIA 3O7LD 2UZTA 3OMVA 3VUHA 2F57A 2YJRA 5CAUA 3R8VA 4YZ9A 3CCNA 3TV4A 1ERKA 4CFXA 3PVGA 4LGHA 5J5SA 2JITA 4QP9A 4CXAA 2W1EA 5EFQA 3MFTA 5M55A 3UOJA 2R2PA 3GP0A 3REPA 4FIIA 5GJGA 3CQWA 1NA7A 2YJSA 1SYKA 1RDQE 2BKZA 3BV3A 3IOPA 5EKOA 1KE5A 4RBLA 1YRPA 4BDEA 4KIOA 4EK5A 4USEA 4FV6A 2F7ZE 4UV0A 3FZ1A 4KS7A 5EKNA 3QCXA 3QGWA 4TYHA 5KNJA 3SAYA 1Q8UA 4AACA 2Y4IB 3ZFMA 2X7OA 4O0RA 2XP2A 4IZAA 4BYIA 3QA0A 2UW3A 4FSTA 2NP8A 3U54A 4YZCA 4F4PA 4ITJA 5A4EA 1M2PA 3ELJA 2YHVA 4YNEA 4V0GB 1OBGA 2A19B 3IW4A 5CQUA 3A99A 4ASXA 3V6SA 1URWA 4O7VA 2ITZA 3UNKA 3C13A 3W2PA 4WOVA 4FG7A 2ZVAA 2VGOA 3LAUA 4JXFA 4RX7A 3R7YA 4EOSA 3ZBFA 4IX3A 3LFAA 3PRFA 1XH6A 4X2NA 3BI6A 5BMSA 4U7ZA 4UALA 4X2JA 5AUTA 1Q3WA 2X4ZA 3FL4A 1NW1A 3LMGA 2BHEA 1FGKA 4U6RA 3FKLA 3P0MA 1UU3A 2BAJA 1JSUA 3IGGA 2WTKC 3GCQA 3H0ZA 3DTWA 3RWQA 5H8EA 3BCEA 3TZMA 4TXCA 4AS0A 3AOXA 1ND4A 2W1ZA 4BWKA 4C3PA 3LOKA 3ORMA 3EQHA 4UMQA 3ODYX 4LMNA 2ITPA 1FVTA 2BZHB 4FKJA 3U4UA 4BKZA 3SKCA 4C4IA 5HTCA 4I24A 3UOLA 4FV2A 3AD6A 3GBZA 2BHHA 4Z3VA 5AFVA 3AMAA 4FTJA 4JDIA 2W1GA 4XV3A 2JKKA 5HLPA 4O96A 4E20A 4O22A 4PPCA 4IMYA 3RKBA 5GHVA 2QG7A 3H10A 1OIQA 4GFMA 4EONA 4O2ZA 3VQUA 2F7XE 4FT5A 4L46A 3KGAA 2QNJA 5AUVA 3GFWA 4X3FB 4HCVA 4U45A 3RNYA 1I09A 4I6HA 3PA3A 1I44A 4LOQA 4WNKA 3RP9A 5A14A 3PE2A 3EMGA 5E8TA 3AT4A 3DFCB 3VULA 4M12A 3PTGA 1Q8YA 2Y4PA 3IW6A 5DMZA 3GNIB 4H36A 3OWKA 5I3RA 4FTTA 5L2SA 3WF5A 1WAKA 4II5A 3W16A 2YCRA 4IB1A 2BDJA 5TR6A 5JFXA 4DH8A 3NS9A 4YSMA 1LP4A 1JWHA 3F2AA 1OL6A 4CD0A 4QNYA 3QALE 2LGCA 3POZA 4E4XA 4PDYA 4FODA 5AUUA 2R3GA 1OVEA 3ZONA 2XYNA 2BROA 3WILA 3FXZA 3A8XA 4AN3A 4I21A 2BVAA 3ZLSA 4F9CA 4TY1A 4O86A 1UWJA 3NW7A 4MHAA 5I4NA 5HESA 4CFFA 5HORA 5LARA 2IVSA 5DG5A 4FIFA 3WF7A 3Q53A 4BDJA 4IWPA 5L6OA 4JR7A 5EI6A 1Z5MA 3LVPA 2AUHA 4JAIA 5KBRA 2WTWA 3H9RA 3TG1A 3OOGA 5IQAA 4CMTA 1MRUA 5K3YA 2XIKA 2HY0A 2I40A 2OXXA 4C0TA 5HD4A 4HOKA 3TV6A 4O6EA 4KSPA 1UU9A 4EYJA 2GTMA 3PPJA 4HGLA 2IVUA 4HJOA 3VN9A 4NM0A 4ACMA 2VX1A 4PMPA 3I81A 3DBFA 2VTRA 5F4NA 1P14A 5E8ZA 4KABA 5ANKA 3VS6A 3FHRA 5L2IA 4CZTA 3ZBXA 2I0YA 3R0TA 1QCFA 1PMNA 2HZ0A 5CU2A 3HMPA 4RSSA 2PZIA 4F6WA 3GCPA 4QTEA 1W0XC 3OROA 3SRVA 2E9UA 3MPTA 2OICA 2EXEA 2BKKA 1APME 4OR5A 5FQDC 1S9JA 3OBJA 4XX9A 4EL9A 3P23A 3R21A 1T45A 2FUMA 5CAPA 4JAJA 4GK2A 1CKIA 4G34A 4BC6A 4DT9A 1OKZA 4MH7A 5E8SA 4AE6A 4F9AA 5HO8A 3P9JA 4PMSA 3VUIA 2WQMA 5AUZA 3SA0A 5IDNA 3R8PA 1V0OA 4MNEB 4FIJA 4IB0A 5L2QA 3OWJA 1R78A 4C4JA 4A9UA 5LMAA 4M84A 2OJGA 2PPQA 2C6OA 5F1ZA 4R78A 4AN2A 3D2KA 3TNWA 2IZRA 3DNEA 3EB0A 3I7CA 3TJDA 2WEVA 4BY9E 4W4XA 1JPAA 4RIWB 5DEYA 4IE9A 1JNKA 5IU2A 4M97A 3KQ7A 4RWLA 5CSVA 3QCYA 5E1EA 4A4XA 2WTDA 3BEGA 4O0UA 4XHKB 3BZ3A 4QQ5A 2FSOX 4W9WA 2I0HA 2IG7A 2C6MA 4L43A 3GC8A 2XJ1A 3CEKA 4PY1A 3QTIA 3KF4A 4WG3A 5IH5A 5IMEA 2ITTA 4J98A 4UWYA 5BYLA 3KRLA 5FP5A 1YHWA 1ZWSA 3BYSA 2FH9A 2PVRA 4EYMA 4NKSA 5CT7A 2X9FA 1KE7A 3F7WA 5LJJA 4DFUA 4IX4A 3AMYA 3LCSA 3QUPA 5CTPA 3RMFA 4C58A 4F64A 4ASEA 2VNYA 4BZOA 3EQDA 4MXCA 3CE3A 2A4LA 4PRJA 1ZY4A 4IAZA 2IW9A 3G15A 2GHGA 1OL2A 4F63A 2W06A 3F5PA 2WHBA 4IZ5A 3P79A 4CSVA 4EOKA 3BYUA 3TNHA 2ZB0A 4HVSA 4CMOA 2ERKA 3MVJA 4Y95A 3VHKA 3KN6A 2Q0BA 2XK8A 3PZEA 4MBJA 4QMYA 5H3QA 4D0WA 4FVQA 4OUCA 4WUNA 1OUYA 2B52A 2PSQA 3FI3A 3Q4TA 4RLKA 4WT6A 2PY3A 4GW8A 3A61A 5KHXA 2XA4A 2XK9A 2XK7A 4KD1A 4IANA 4ZTSA 3ZMMA 4DH5A 1FQ1B 2VTTA 4FK3A 2H96A 3TACA 3R1SA 4ZSLA 4ENYA 5HE1A 5AUWA 5LCKA 3ULZA 4EOQA 4DEAA 5JQ8A 4FSQA 2XKEA 4R7HA 4PNKA 4YTCA 4ACDA 3POOA 5CY3A 1BUHA 2GFCA 4GT5A 5DEWA 5HG7A 5B7VA 1K9AA 3DAJA 4GT4A 3CJGA 5CAQA 3R63A 4LL5A 3ENMA 4X2FA 4U41A 5FLFA 3BU3A 3A7IA 4ANBA 1FMKA 3PXYA 2JDSA 3VF8A 4ANNA 4NU1A 5E8VA 4FIGA 4JIKA 2CN8A 4EZ5A 5M44A 3COHA 3P1AA 3MH2A 4FTLA 2B9HA 3PZHA 3KXGA 4FVRA 4NEUA 4PDSA 3ZZEA 4YSJA 3LQ3A 3ERKA 3R7VA 3O50A 5IA2A 1RQQA 2R3LA 4RJ6A 4YJTA 3QWJA 1YOJA 4IW0A 3KK9A 5J9ZA 3FC2A 4C02A 4XMOA 3TXOA 2R3IA 2RKUA 2C0IA 3ZSHA 4RFYA 4IAYA 3L9LA 4JDKA 4RIYA 4DTAA 3QBNA 4BDAA 4GH2A 2WZJA 3W2CA 1YDSE 2GTNA 2V62A 3F9NA 5CASA 3UJGA 3GU5A 3NVKI 3TJCA 3LFDA 2QCSA 4IB5A 4E6QA 4FICA 3BX5A 2A1AB 3EIDA 5HE2A 3T9TA 4EH6A 5KMIA 3EL8A 4GVJA 4CRSA 3R9RA 3Q4CA 4QRCA 4YO4A 1P5EA 3JY9A 3KEXA 4BIDA 2G15A 4F7NA 4HZSA 4LL0A 4RWIA 3U4WA 4FV7A 4BVUA 1E9HA 3LFFA 4O84A 4WG5A 5M51A 3NDMA 4TYGA 4V05A 3TZ8A 4AA0A 5AM6A 4I5MA 4EC9A 1H00A 1W7HA 2R9SA 3BBTB 2ZM4A 3I5ZA 4LI5A 4JI9A 1BYGA 1R0PA 4N57A 4ALWA 4Z16A 3LLTA 2CJMA 3DNDA 5AEPA 5BVNA 4HYSA 3EQGA 3S95A 2WFYA 4U0IA 4WHZA 2C4GA 1YWRA 3PXRA 4LUEA 5HVJA 4FV8A 3F2NA 1H07A 1OPJA 2UZEA 5J1VA 3BYMA 3AT3A 3JVSA 3DKOA 3NZ0A 4CG9A 3G9NA 4N6YA 4FSRA 4O0TA 2IPXA 2J0KA 3QRKA 2YISA 4UWCA 1YI4A 3OC1A 3ET7A 4G3FA 4QP4A 2I6LA 4FGBA 4GV1A 4FKLA 5HO6A 5IUHA 3UGCA 2JDVA 4F0FA 3EQRA 3VRYA 2GPHA 2I1MA 4ZXTA 2XNPA 4XG2A 4C61A 3GCSA 3QQJA 4FR4A 4AA5A 2C6LA 4I5PA 3V8TA 2PZRA 2G1TA 3KF7A 5A6NA 3QTQA 3VBYA 1SZMA 2R5TA 2OZAB 5ANDA 2PVNA 5JRSA 1GZNA 3D7TB 3W32A 3UQFA 4O81A 4EOPA 4O0SA 1Q62A 4Q5HA 3VUMA 4XOYA 4RVKA 1T46A 3PLSA 3K5VA 4AW5A 3TUDA 2ZDTA 3EKNA 3V51A 3PPKA 3NW5A 4C34A 4NIFB 5JRQA 2QKRA 3KB7A 4M15A 5HBEA 5A3XA 3UDBA 4O91A 3HP5A 3L9PA 4RMZA 5FD2A 1R1WA 2OIQA 2ZM3A 4BTKA 4CZYB 1OL5A 4XLIA 2VWYA 3R02A 4Q5EA 5GINE 4BWXA 2UW6A 2GNLA 1HOWA 3BPRA 4O1OA 3ZFXA 4C8BA 1KUTA 5IMXA 4FEUA 4JJRA 3HKOA 3FE3A 3HZTA 4ZEGA 4BKYA 1WFCA 5HIDA 3KCFA 3DDPA 4OTDA 1Q97A 4TT7A 5AR3A 1XH5A 3C4XA 3KRXA 4R5SA 4EH7A 4UB7A 3D14A 4KINA 3E5AA 2YCQA 4BWPA 2YM6A 2JD5A 3CBLA 3RCJA 3I0OA 3BWFA 4L3PA 1B38A 4NCTC 4MKCA 1Q8WA 3CLYA 3NR9A 3SW4A 5I5ZA 1PKGA 2JFMA 4AE9A 3PSBA 4G6LA 2GNJA 1JKSA 5L8KA 4QO9A 4I6QA 2ITXA 2OZOA 3PG3A 4IC8A 5JQ5A 4HPUE 1WZYA 3PFQA 2EXCX 4NK9A 4TYIA 5BYZA 4HVDA 4RFZA 4UXQA 3QQFA 4MAOA 2C6EA 1OIUA 4Y83A 5LMBA 2HY81 5EW9A 2PVYA 3NIEA 3MB7A 2XH5A 1H0VA 3QKLA 5ANIA 5AIRA 4BHNA 5T68A 3BELA 3ALOA 2B55A 3OCBA 4ACHA 1OBDA 2IZSA 2JKMA 3PY1A 2KTYA 3Q9YA 4MK0A 4GYIA 3ORIA 4EUTA 5DN3A 3FMLA 1LPUA 4YJQA 2C0TA 4FTMA 4XCUA 5IPJA 3FMKA 1Q4LA 4NL0A 1ZZ2A 1U4DA 5CZHA 2XK4A 4E6AA 2CGWA 1JLUE 2WMTA 2XMYA 3DBCA 4EWQA 2B1PA 2FSTX 2RGPA 1MQ4A 4D9TA 4EZ7A 4DN5A 4PL5A 2HZIA 4PWNA 4CV8A 3V8WA 2BDWA 5ANEA 4P2KA 5AP6A 3TTJA 4YTFA 3U6HA 3N4UA 2PE0A 5EYMA 4BFMA 4RWJA 4FV4A 4CFUA 4D4VA 1JBPE 1JQHA 4ASZA 3MH0A 4ERWA 2VNWA 1TKIA 3TKUA 1M17A 5ANJA 3V8SA 5C4KA 3F3WA 2Z7RA 2P3GX 3P78A 1ZXEA 4PX6A 3V3VA 4FZ6A 4DGGA 2R3MA 4EJ7A 3SXFA 3GU8A 4IAFA 1Y6AA 2RG5A 4O21A 2J90A 3HP2A 4EKKA 1HCKA 2YIWA 2YZAA 3L9MA 4KSQA 4NFNA 5BVKA 4U44A 3GVUA 2B9FA 4U42A 2UZUE 3C4ZA 1DAWA 2DS1A 4IVDA 3HRCA 4WNOA 4D5HA 3QCQA 1IG1A 3FSKA 4PNIA 5CU0A 5L8LA 2Z7SA 5A4TA 5GIPE 4ORKA 4BDCA 1WBNA 1XHAA 2OFVA 3HV4A 3BHVA 4IZ7A 1YWNA 4QD6A 4USDA 3W8QA 4EH3A 4JX3A 2WMVA 1V1KA 2YM8A 4RJ4A 3SOAA 4R3PA 3K3IA 3BE2A 4ZK5A 1CM8A 2PVFA 2G9XA 3PWDA 3IKAA 4L53A 5F94A 5J5TA 1SVHA 2X2MA 3GOKA 4RVMA 2PVKA 3OCGA 3QCSA 4GG7A 4Z9LA 4YHJA 5C03A 3KC3A 3QD2B 2OF2A 4RJ3A 4YU2A 2C69A 4LUDA 4NM3A 5HICA 1FMOE 2J51A 5TT7A 4JT3A 3HDNA 4XP0A 3FZSA 4H58A 4YLLA 3RAWA 4C36A 2C30A 5GZAA 1QPEA 5HO7A 1FVVA 3MGYA 4XV1A 5CVHA 4AOTA 5CAVA 2RL5A 1PXOA 3FKOA 1MUOA 1GZ8A 2B9IA 1NXKA 4YUQA 4OGRA 4G16A 4O27B 2VD5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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