3KRLA

Cfms tyrosine kinase in complex with 5-cyano-furan-2-carboxylic acid [4-(4-methyl-piperazin-1-yl)-2-piperidin-1-yl-phenyl]-amide
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
315
structure length
281
Chain Sequence
KYQVRWKIIPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKRQLSSRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Optimization of a Potent Class of Arylamide Colony-Stimulating Factor-1 Receptor Inhibitors Leading to Anti-inflammatory Clinical Candidate 4-Cyano-N-[2-(1-cyclohexen-1-yl)-4-[1-[(dimethylamino)acetyl]-4-piperidinyl]phenyl]-1H-imidazole-2-carboxamide (JNJ-28312141).
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, Basic fibro
total genus 84
structure length 281
sequence length 315
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3krlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3krlA01
3ZFMA 3BWFA 4E4XA 2QNJA 5A4TA 2PMLX 4X6RA 1G3NA 2YWPA 3TZ7A 2EUFB 3W2OA 1OI9A 3BWJA 4IANA 3ORIA 4NFMA 3TUDA 5AP0A 2CGWA 2ITVA 4OTFA 4DGNA 5FXQA 4DCEA 1VEBA 3ETAA 4FVRA 2QKRA 1JQHA 1OB3A 2WTKC 5ETAA 5H3QA 4DEGA 5IPJA 5AAEA 4YZNA 3L8PA 1LEZA 4I1ZA 3A99A 4QMXA 5H9BA 5HLPA 3ZM4A 3SHEA 3BLHA 4XG6A 3KXGA 4FKVA 3TL8A 3QD0A 4IVCA 4M97A 3K3JA 3C4ZA 3DJ7A 4IAAA 4WSYA 4HCTA 4F65A 3WF6A 1VYWA 2IVVA 4TXCA 3KF4A 3FYKX 1PXMA 4CFMA 4QMNA 5LVLA 5EQPA 4I24A 4V01A 3TNPC 2V7AA 4EOKA 3W33A 2R9SA 4EOQA 4ZSAA 3TACA 4GH2A 5H2UA 3M42A 4UY9A 3HV7A 2NPQA 1P4FA 1BMKA 3P4KA 5K9IA 2OJFE 1XH6A 4P5QA 2Z7LA 3VS6A 4FV2A 3P5KA 3QHRA 4QYHA 5FBNC 5FWKK 5BMSA 4A9TA 3Q9XA 4QP4A 4J53A 2EXMA 3QTQA 2IZRA 3LCDA 4Y85A 3RAHA 3RAKA 5KNJA 3EN9A 5LVNA 2GNGA 2YCFA 1IA9A 4P7EA 3GQIA 1OL6A 4JAJA 3ET7A 3PWYA 4IC7A 3EL7A 3VHEA 4DCAA 3F82A 3OXIA 4MBJA 2XIKA 4WKQA 4BIBA 4ANQA 1XH9A 2QLQA 3EOCA 5IQEA 1UWJA 2C0OA 4XUFA 2PPQA 3FXXA 3GT8A 4OW8A 3F3TA 2QURA 4Y83A 2CGUA 3HA8A 2B52A 4FVQA 2UW6A 4N70A 3UMWA 1RJBA 3S3IA 5HNBA 4EH8A 5HBHA 1SYKA 4RC3A 4YZ9A 3RHXA 3VBVA 4ZTMA 5L2TA 4G1WA 4AZVA 5FDPA 5GZ8A 3RBWA 3TV7A 2Z60A 4G34A 4HPTE 3U6IA 1RQQA 3QYWA 5LMKA 4BWXA 3TUBA 2HXQA 4M67A 3DPKA 2ZYBA 3R00A 4PF4A 3CLYA 3KMUA 4RWKA 3ZZEA 4A9SA 5AADA 5F4NA 5G6VA 5IKWA 4FKSA 5EM8A 5BVKA 2XVDA 5HG8A 5C03A 3BBWA 2XNPA 2VWYA 2O0UA 1A48A 2CLQA 2H8HA 3F3ZA 4I6QA 1AQ1A 4K2RA 5HD7A 4IBMA 3H0ZA 5I9XA 1TQMA 5EFQA 4O38A 4XG4A 4GUEA 4BCFA 4ITIA 4F1TA 2VN9A 3OC1A 4U5JA 1Z57A 2GFCA 1KE9A 4RJ4A 2PL0A 4OBOA 4DFZE 4HVGA 4L00A 3QA8A 2XZSA 1H1RA 3HGKA 3IO7A 4IACA 2QO9A 4O96A 5CSVA 4QP2A 3FBVA 1FMOE 4R6VA 3VUIA 4BGGA 4CGAA 3I79A 2Q83A 2HAKA 1CKIA 1U59A 3O17A 3VBTA 2GS2A 2B9IA 2PULA 2Z2WA 2YZLA 3PWDA 2YDIA 3F7WA 3LOKA 4X3FA 3R9HA 3TZ9A 1MUOA 2BUJA 4ID7A 3MYGA 3Q9WA 4IJPA 4NM0A 4RLKA 1GAGA 3RPSA 4KSPA 1OL1A 2HY81 2V22A 4R5SA 4DG2E 4O7WA 4FZDB 3R7OA 4OLIA 3PZHA 2QOHA 3FL4A 3FMJA 3E8CA 1K3AA 5HIDA 2ITOA 2C4GA 2GTMA 5C26A 3FC1X 3VS4A 2ZB0A 5KMKA 3FV8A 4A9YA 4D0WA 5IU2A 3KU2A 5DN3A 3LXLA 4PQNA 5CTPA 3NNUA 3V5LA 3UNKA 4J7BA 5AUXA 4JG8A 3TTIA 3NVMB 3R9DA 5E92A 5AA8A 3QCXA 5CQUA 4AT4A 1LP4A 2YIWA 4FR4A 4O0WA 4PMTA 5BVOA 5KO1A 3C51A 3P79A 1W7HA 5L2SA 4X7QA 2XNMA 4Z55A 2XM9A 4FTTA 1PF8A 1V0BA 2OF4A 4PX6A 3UO6A 5F95A 4EK3A 5T3QA 3ZEPA 2HW6A 3BI6A 4YBJA 3SC1A 4TZRA 2YM3A 2QG5A 2ZAZA 4HW7A 3FYJX 3PXFA 2BRBA 1E9HA 2WELA 2OJ9A 2GNJA 5GZAA 5CYIA 3PVUA 5EYDA 3DQXA 5ACKA 1HCKA 3BYUA 4S30A 5DBXA 2ZM3A 3EQBA 2HY0A 4FKOA 5B0XA 4X3JA 4WRGA 4EOSA 1L8TA 2I7QA 2BDFA 3DGKA 4PTEA 3SG8A 4DTBA 3ZONA 3LJ1A 3R9NA 4UWBA 3CQWA 4TNBA 4XBUA 3TJDA 3UC3A 5JQ5A 3HAMA 2V5QA 2ZM4A 3NNWA 5M51A 3GFWA 5TT7A 4BYJA 1WBTA 2ERKA 2QCSA 3D5WA 2VTRA 2WQEA 3MVMA 2F49A 2X4ZA 5HTCA 5TR6A 2PK9A 2O64A 1KE8A 2ZOQA 4HGSA 1VJYA 2UZOA 1XR1A 1YDTE 4FKRA 3HP5A 2W4KA 1SVHA 1OGUA 4HYUA 4Q5EA 2OJGA 5CU3A 2YM6A 4YU2A 2W1CA 4TKSA 3Q4UA 1G5SA 3ZLYA 3OTVA 4Q2AA 3BU3A 3OXTA 3VHKA 3VBXA 5J8IA 2G01A 2J4ZA 1WCCA 3Q4TA 4O7RA 1PKGA 2R2PA 2UW5A 4F0GA 5FUTA 4RWIA 5BYZA 1X8BA 5AR2A 3IW5A 3ZXTA 3UO5A 5EM6A 2Y6MA 2XMYA 1DI8A 1MRUA 3ORPA 4NL0A 4QP3A 1ZZLA 5DG5A 4BCGA 5CF4A 1J7UA 5IQBA 2X2MA 4I6FA 4RFMA 4E3CA 4G3GA 4TWNA 1ZOGA 2X2KA 3AT2A 4NCTC 2JAVA 3U8WA 3NS9A 4I5MA 2FSMX 4KBKA 5E8TA 3V5TA 2VO3A 3WF8A 2XEYA 5GIPE 3ITZA 2W9ZB 4IADA 1YXVA 5HU3A 2C6TA 2R3JA 4D2VA 2XK9A 3QTXA 3R04A 4X2KA 3HV5A 2XYNA 2I1MA 4V0GA 3UVQA 3VBQA 3POOA 3NAXA 4Y5HA 4HPUE 4L8MA 2IW6A 3I7BA 4FOCA 2VWUA 1H1QA 3D0EA 4IB3A 3M11A 4B8LA 3EQHA 2BAJA 4RIYA 4UWCA 4IIRA 4H05A 3DKGA 1P4OA 4RBLA 5AAGA 4IAYA 5JGBA 4DTKA 2BILB 5A4QA 2P55A 4AGDA 4BBFA 3T9TA 4R78A 4PMMA 3GVUA 5DYJA 3WARA 3MPAA 5IUGA 5EOBA 2OW3A 1PHKA 1OIYA 3MS9A 2VX3A 3U4UA 4GJ3A 3FE3A 4ZSEA 2IZTA 3I0QA 4JAIA 4U44A 3DBDA 3VS5A 3MH3A 2RGPA 1KUTA 5ETFA 3OOGA 4JI9A 4RQVA 4ZP5A 5L2WA 4C3RA 3DFAA 4C0TA 2UZUE 5AIRA 5E91A 3W16A 4RC4A 3SKCA 3D4QA 4WOVA 5M08A 5C27A 2ZVAA 3KVXA 4M15A 1IRKA 3P1AA 3ZO1A 1YXXA 2GNFA 4CZTA 5CAQA 2XB7A 3I60A 5CEKA 3NUSA 4BCOA 4F99A 3GU7A 3BEGA 1VZOA 5EQYA 2V0DA 3EQRA 3AC1A 3MA6A 1XHAA 3Q60A 3EQDA 3ID6C 2J5EA 2P33A 2WTVA 2W4JA 3LAUA 5IA5A 3VUGA 3FQHA 5FGKA 4GV1A 3AXWA 3PJ1A 5ANJA 5HE0A 5IA3A 1Q24A 3EQIA 2CKOA 2P2HA 3JXWA 4YJRA 1H8FA 3ROCA 1YXSA 4C3PA 2VV9A 2XK3A 1T45A 4XEYA 5I9ZA 4BGQA 3R7UA 4AP7A 4G17A 3QZFA 4K8AA 4P2KA 1CSNA 3C50A 5CANA 4JS8A 2WIHA 2DUVA 3UOJA 3PJ3A 3RCDA 4TY1A 4ACMA 4I6HA 1ZY4A 4EOIA 3QTIA 3F2NA 4I0RA 2PSQA 4OBPA 2UZBA 4BHNA 3BKBA 5DHJA 3P7BA 4PL4A 5LMBA 5ACBC 2X2LA 2X4FA 2Y7JA 5DR2A 4TRLA 4G6OA 4L53A 4RX7A 4Z9LA 4BDHA 3OY1A 4NU1A 3SG9A 3MY5A 5HICA 3A4PA 2XS0A 4PNKA 3B2WA 4W4WA 5IDNA 3R2BA 4YZMA 3GC0A 3RKBA 3HV4A 3ZBXA 4G3CA 5GJGA 3DK3A 3DKCA 4JDJA 3QTWA 5CAVA 3O8UA 1BYGA 3DY7A 3IGGA 3ZOSA 3O71A 3TTJA 4RX5A 1R0PA 3FLQA 4XHKB 1M7NA 1U46A 3ZS5A 1URWA 4HNIA 5L6OA 5EDPA 4RJ3A 3LPBA 5AV3A 4FYNA 4RFYA 5FTQA 3T8OA 5KHXA 4Z16A 1YKRA 3DAEA 2CN8A 5HCYA 4R77A 4J52A 2CGXA 4C4IA 2OGVA 3Q52A 4BDBA 3PIYA 3FZ1A 4XRJA 3HVCA 3FLYA 4G9RA 2XK6A 5EM5A 1CKPA 1PXIA 2JIVA 3D2IA 2X81A 3FLWA 4ZSLA 4BTKA 3HDMA 3GU5A 1H08A 4L46A 5DGZA 2YM7A 1ZYCA 5BVEA 4BKYA 3EN7A 5KMLA 3AT3A 2W4OA 3G33A 5ANDA 3DK7A 3SXRA 3CSVA 1OUKA 3DTWA 4R3PA 1REKA 1ND4A 5CASA 4PWNA 2HZ0A 1LUFA 2OF2A 3COKA 4P4CA 4TN6A 3G9LX 2UVZA 2UW0A 2YACA 4KINA 2HZ4A 4E6CA 4JRVA 4C35A 4CKJA 5DA3A 4MHAA 3VNTA 3HP2A 4UN0C 3FWQA 2E9OA 2Z02A 4D28A 2OSCA 3EWHA 3UP7A 4B99A 3NUNA 2JD5A 3FI2A 4OR5A 4PPAA 4ZTRA 5A14A 3EQFA 5HD4A 2QOQA 4FTUA 1Q97A 3RPYA 1OL7A 2RFNA 5AV0A 3A8WA 4DC2A 5IEXA 1JVPP 3TNHA 4AWIA 5L8KA 5CALA 2B55A 3OUKA 2X7GA 3NSZA 3VO3A 4KNBA 5A6NA 3GC9A 3DU8A 3FZTA 3HMNA 4Q5HA 4XG7A 4DN5A 4LG4A 3EH9A 3HRCA 2VTPA 3HECA 1BI7A 2PZIA 3H3CA 3LE6A 3FHRA 4JX7A 4O22A 4QMMA 2YDKA 3QQJA 4WG4A 2R3FA 2PVYA 1WBVA 3DLZA 2YDJA 4R8QA 3VW6A 5BVNA 4USEA 5IMXA 4MQ1A 3GU8A 3LFEA 5C4KA 2W1ZA 4JDHA 4QMLA 3DNEA 3C4CA 3ZFYA 5BVFA 4IB5A 2F2CB 2XA4A 1RW8A 3VWAA 4FV7A 4UBAA 5JSMA 4D5HA 2GS7A 4FKUA 4MWHA 3TG1A 3QXPA 3ZYAA 4YLKA 4NTSA 5BVWA 4BTFA 2XF0A 3CGFA 4CEGA 2VTHA 4G6NA 4FBXA 4HJOA 1U54A 2RG5A 1U5RA 1Z9XA 2RKUA 2X6DA 3A62A 3R21A 4GCJA 4IZAA 4IWQA 4S32A 4EUTA 4EH4A 4EZ5A 2C3JA 5JFSA 4BYIA 4K18A 5GNKA 3SD0A 5JFXA 4HVIA 3OVVA 4F64A 4D55A 5EQEA 3AGLA 3SOAA 2WEVA 3QTZA 4KS8A 4ACHA 4D1XA 2JDOA 4IX5A 4CCUA 2R64A 2CKPA 3PG1A 4D1ZA 3QRJA 4QQ5A 3FI4A 5BVDA 3DZOA 4EHGA 3FEGA 3E8EA 3KK8A 4DFUA 5KMIA 3FMEA 2BRNA 3GB2A 4M68A 3TT0A 2WD1A 3QFVA 4PPCA 5DI1A 2O3PA 3T9IA 5AX9A 4Y73A 3RAIA 1NT2A 4V0GB 1W84A 5AP4A 4EONA 2IN6A 5LWNA 4FKPA 4CFVA 3BU6A 5K0KA 3P0MA 4YJNA 1XO2B 5CX9A 4K11A 4ACGA 3OHTA 1H1PA 4RIYB 2XBAA 2B0QA 3BEAA 5CWZA 3LXPA 4BDGA 2XK4A 3FAAA 4DAWA 4D5KA 3VBYA 2J90A 2O2UA 2WTDA 3G9NA 4G16A 4D2PA 4JR7A 3CTQA 3D7TA 2ZV9A 4BL1A 1JSTA 5KHWA 3GOPA 4WO5A 3F5PA 3F2AA 1OKYA 4EBWA 2BROA 1OKVA 1P5EA 2XUUA 3LM0A 1ZOHA 2BPMA 3WE8A 4YHFA 2J9MA 1ZYDA 5BUIA 5IEVA 5I5ZA 3TNWA 4DGOA 5KBRA 3QRUA 3CKWA 3QD3A 3V8TA 4XP3A 5DMZA 4GS6A 2YM8A 3D94A 1Q4LA 5DT3A 3ZSGA 3QC9A 3ERKA 1Q62A 4G5JA 1VR2A 5CF8A 3UNZA 5CY3A 3CEKA 4EH3A 1H00A 3ZLWA 2HW7A 4K9YA 2XNEA 2QOCA 3QQHA 3C7QA 3QLGA 4GVAA 5LMKC 3DS6A 3WZKA 4BCKA 4DH1A 3SDJA 1XH4A 5A6OA 3LJ0A 4L3PA 4PRJA 3ZUTA 3PYYA 2UZEA 3R28A 4XG2A 4CZYB 3ACKA 3HX4A 4F09A 4L3LA 3I7CA 1M17A 3L9LA 4KKGA 3LLTA 4ANMA 2ITNA 4KKEA 3NIEA 1H07A 3WIGA 4C4EA 1NVSA 5AR4A 3FPMA 5M55A 1DS5A 3E92A 4I5CA 3ZSIA 3FSFA 4UB7A 4RZVA 1YOLA 4IXPA 4ZS0A 1GIIA 2CLXA 4EYJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZFM A;  3BWF A;  4E4X A;  2QNJ A;  5A4T A;  2PML X;  4X6R A;  1G3N A;  2YWP A;  3TZ7 A;  2EUF B;  3W2O A;  1OI9 A;  3BWJ A;  4IAN A;  3ORI A;  4NFM A;  3TUD A;  5AP0 A;  2CGW A;  2ITV A;  4OTF A;  4DGN A;  5FXQ A;  4DCE A;  1VEB A;  3ETA A;  4FVR A;  2QKR A;  1JQH A;  1OB3 A;  2WTK C;  5ETA A;  5H3Q A;  4DEG A;  5IPJ A;  5AAE A;  4YZN A;  3L8P A;  1LEZ A;  4I1Z A;  3A99 A;  4QMX A;  5H9B A;  5HLP A;  3ZM4 A;  3SHE A;  3BLH A;  4XG6 A;  3KXG A;  1W2C A;  4FKV A;  3TL8 A;  3QD0 A;  4IVC A;  4M97 A;  3UDT A;  3K3J A;  3C4Z A;  3DJ7 A;  4IAA A;  4WSY A;  4HCT A;  4F65 A;  3WF6 A;  1VYW A;  2IVV A;  4TXC A;  3KF4 A;  3FYK X;  1PXM A;  4CFM A;  4QMN A;  5LVL A;  5EQP A;  4I24 A;  4V01 A;  3TNP C;  2V7A A;  4EOK A;  3W33 A;  2R9S A;  4EOQ A;  4ZSA A;  3TAC A;  4GH2 A;  5H2U A;  3M42 A;  4UY9 A;  3HV7 A;  2NPQ A;  1P4F A;  1BMK A;  3P4K A;  5K9I A;  2OJF E;  1XH6 A;  4P5Q A;  2Z7L A;  3VS6 A;  4FV2 A;  3P5K A;  3QHR A;  4QYH A;  5FBN C;  5FWK K;  5BMS A;  4A9T A;  3Q9X A;  4QP4 A;  4J53 A;  2EXM A; 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