3KULB

Kinase domain of human ephrin type-a receptor 8 (epha8)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
273
structure length
271
Chain Sequence
TREIEASRIHIEKIIGSGDSGEVCYGRLRVPGQRDVPVAIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYMENGSLDTFLRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPDAATTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGERPYWNMTNRDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVLDALIRSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Kinase Domain of Human Ephrin Type-A Receptor 8 (Epha8)
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Ephrin type-A receptor 8
total genus 83
structure length 271
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kulB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kulB01
2JFMA 1H28A 2WFYA 5HTBA 2PMNX 5E8UA 5AX9A 1DAYA 3GC9A 2BMCA 2J5FA 3HMMA 2BRNA 4YNEA 3UTOA 5KBRA 3EQBA 4HYSA 5CAVA 2BR1A 2UVXA 5JGAA 2F57A 3W8QA 3UC4A 4XG6A 4E6DA 5IEXA 2VO7A 4IH8A 1IG1A 2J50A 4KIQA 4A4LA 3GC7A 3EN5A 1QMZA 3ENMA 1XH8A 4O7LA 4RZWA 4OAUC 1M14A 3C9WA 4LV5A 5IQIA 2BVAA 5E8SA 2ZB1A 4BCMA 4ACDA 3AC3A 4EBWA 3FLZA 4ARKA 1CM8A 5HVJA 3ULZA 2C5XA 3TV4A 5ETAA 4C2WA 3A7GA 4GFOA 3C4WA 4G17A 2UZLA 3CY2A 4IDTA 3SXRA 4C0TA 2VWBA 4LOQA 4RIWB 2GQGA 2R3KA 5IA4A 2OIDA 2UW7A 4IJPA 3ZFYA 4EJ7A 1KUTA 1GIJA 3PPJA 3DQWA 4GSBA 2JKKA 1OKVA 4LUDA 4R5SA 2XNMA 1J91A 3QLGA 4WT6A 4CG8A 3TZ8A 4QOXA 1STCE 3LVPA 3DA6A 3LLTA 4O86A 2G2FA 2PMIA 4FTQA 3UPXA 3GCUA 5DGZA 2CGWA 3L8XA 3OROA 3R0TA 4DGGA 3LFQA 3MGYA 3HAVA 1SYKA 3PSDA 3G33A 2OZAB 5J5SA 1DI8A 2WEIA 4H39A 4RWLA 5HZNA 3FKNA 4C4FA 4CCBA 2HZIA 4FSUA 5HE1A 2IVSA 3PY0A 3FQSA 3MBLA 2BRHA 1J1BA 5E8ZA 4ACGA 4QP1A 4RFZA 4XG2A 4EI4A 3D2IA 2X8IA 2RFDA 5EDQA 2C3IB 2ONLC 5L8LA 2NPQA 2WXVA 4FSQA 4S32A 2W1DA 4QP7A 5CXHA 5IA2A 5HIDA 3UIMA 3BE2A 4MNFA 3VHKA 2JFLA 3E64A 3PZEA 1OUKA 3CGOA 1W83A 3FZTA 4O2PA 4BF2A 1SNUA 3PG3A 4FL3A 3D0EA 3OW4A 4O1OA 4C7TA 3LLAA 4MAOA 4RVKA 5T6KA 4XG8A 2JAMA 4O0SA 1BUHA 1UNLA 3VAPA 5EQPA 1CDKA 4UXLA 3V51A 3ZRLA 1JNKA 3FLQA 1SVEA 1U5RA 3BHTA 3BLRA 3I7CA 2ITNA 1RJBA 3NAYA 4OW8A 4ZZOA 3SRVA 4FR4A 5CU3A 2HY81 4DT9A 3LMHA 1HOWA 3HP2A 2FUMA 1MUOA 3FL4A 3FV8A 4E4NA 4O7ZA 3D7ZA 3MVJA 3MESA 1H1SA 2WU6A 5C1QB 4ZS4A 2J6MA 4G3EA 5KMKA 5FEQA 5HE3A 2JIVA 2UW8A 4RQVA 2WQMA 5CSPA 1Q8TA 3QTWA 3RINA 3F2RA 4O84A 3FZSA 1NVRA 3EYHA 3MTLA 5DHJA 3W2SA 5C9CA 2WEVA 4D2RA 4EORA 3CS9A 3SDJA 5M07A 4Q9SA 5HE2A 1U4DA 3IGGA 3MS9A 4OTIA 3V6SA 3BGPA 3F5XA 4ZTHA 2XNNA 3K2LA 5HI2A 2X4FA 5F20A 3OHTA 3UQFA 5A3XA 3EOCA 4KBKA 3MFRA 2WQBA 3PIZA 4CKIA 2XJ0A 4IHPA 2OF2A 3UQGA 2CJMA 4FKRA 5C4LA 3CKWA 4MD7E 3G9LX 3QUPA 5EW3A 3OWKA 4FG9A 3QX4A 5CSXA 3HMNA 3FI3A 4EH8A 3JY0A 3WE8A 3NUSA 3R9RA 4F0GA 3KGAA 5EM5A 1PXNA 4O1PA 3LFCA 3FSFA 3E5AA 1T46A 4GL9A 3L8SA 4IFCA 3QX2A 5CNNA 4G1WA 3TV6A 5E90A 4FSNA 4C4IA 3D7TA 4V04A 1Q62A 4I5PA 3U54A 5CZIA 2CKEA 2J90A 4E5WA 3GCPA 4YTCA 3S3IA 1R1WA 2GTNA 4BL1A 1H07A 2R7BA 5LWNA 3V8TA 3MH0A 4XV9A 3TL8A 5IH5A 3BQCA 3HRBA 3POOA 3KU2A 2J0JA 3MJ1A 1OPLA 3D83A 3ZO4A 2FSOX 3RALA 4FKJA 4MXYA 1F3MC 4HPUE 4FV8A 3GQLA 3MW1A 4YMJA 3NPCA 5K5NA 3HX4A 3SXFA 3G9NA 3AC8A 4L7FA 4DEEA 4FK3A 3VF9A 4BY9E 2RGPA 2WOTA 4L67A 1H0WA 3Q3BA 1UA2A 4YURA 3QHWA 3ORIA 5AP7A 2R3RA 2XBJA 4RIYB 3F7WA 5KX8A 3V01A 3O8UA 3KMMA 3RJCA 3Q2JA 4EHZA 4C58A 5I3RA 3GFWA 1UKIA 4DEGA 2HIWA 2QU6A 4QT1A 2J0MB 1F5QA 4FV5A 3PZHA 2JKQA 4D5HA 4D0XA 3NNVA 3O96A 1OL5A 1VZOA 1R0EA 4WRSA 1PMEA 2XKFA 3ZZEA 5TF9A 5CNOA 4YJSA 2B9FA 5J87A 3WE4A 2WIHA 4QMZA 3TXOA 2VX0A 3IG7A 3QCYA 4FUYA 2VTQA 3NSZA 3Q9XA 2QR8A 4N6ZA 3E7OA 4GS6A 5F95A 5H8EA 3TKUA 2VTPA 4EUTA 5IG1A 5IMXA 1EH4A 2HZ4A 1AGWA 3UZTA 3Q2MA 2R7IA 3FPMA 1BLXA 4G3FA 3S1HA 4RC2A 4D4VA 4X2GA 4Y83A 2PTKA 2QOLA 2R3NA 4K2RA 2R3JA 4IJ9A 4FI1A 5K5XA 2HOGA 2JITA 3VO3A 4QMNA 4DFUA 4L8MA 3DKCA 4IC8A 2EWAA 3KF7A 4NKAA 3KXXA 3FLYA 4FEVA 2NNWB 5CEOA 5DG5A 4PMTA 3R8LA 2VNWA 3QD2B 2RSVA 5C8KA 4E5AX 1UWJA 5AAGA 1WCCA 2ITZA 2YAKA 3LCTA 5TT7A 3T9IA 4FNZA 3VUHA 2RFNA 4U97A 3BPRA 4EK6A 2WO6A 1VEBA 4IAZA 4OBOA 2R3PA 3RM7A 3MPTA 5HBJA 2OXDA 3WILA 1FGIA 4HW7A 4L44A 3UOHA 2CDZA 1E1VA 2CLXA 4R7BA 2KULA 2C5NA 3BRBA 3HMIA 3LMIA 4HGLA 4UYNA 3TNWA 3VW6A 3RZFA 4C59A 2WMSA 1Z57A 2UV2A 5HG9A 3R7VA 5HNIX 2W1FA 4I6BA 4HOKA 3NNWA 4XOZA 5DEYA 5B2MA 3WZKA 2XH5A 3AXWA 4FT3A 4QTEA 2ZVAA 5E7RA 2UW3A 4J8MA 4YJUA 2RKUA 2W1EA 3R2YA 2I0EA 1QPJA 4YC6A 4BYJA 4CV8A 4ID7A 2X2MA 3OEZA 4C4HA 2IZSA 4ZJVA 4YJOA 4LMNA 2HXQA 5E1SA 3ZEWA 5M44A 4FV1A 3K54A 2JKMA 3RBWA 3V8WA 3I60A 3RCJA 2JDOA 1XO2B 4BC6A 1R39A 2J0IA 3FLNC 4TXCA 3OWPA 4EOIA 5ITAA 5EH0A 4Q2AA 3DNDA 2J51A 4R3PA 4XG4A 3MB7A 2QOIA 1P4FA 2YCSA 3E8EA 3LCOA 3E8CA 1JLUE 4CFFA 2VNYA 5FBOA 1YOLA 3SKCA 4O7VA 5EQEA 1YOJA 5ETFA 4YJQA 1YWNA 2YDKA 3UVRA 4B7TA 4FSTA 3WBLA 4AZTA 3DFCB 1FPUA 1W98A 1GZNA 4WD5A 2FGIA 3LFFA 4ZY4A 1XWSA 3R1YA 4AWIA 2OLCA 3ZOSA 4IFGA 3OD6X 3CLYA 3UOLA 5J7HA 4NYEA 2QU5A 1L3RE 1ZMVA 4AGWA 3QRKA 4R7HA 4KRDA 3EB0A 2WTKB 3NNXA 3QQKA 4G2FA 1TKIA 1PXJA 4W4XA 1O6YA 2EB2A 3C13A 3TEIA 2X39A 3QTXA 4N0SA 4XH6A 5FLFA 1PXMA 4BI0A 3FMMA 2R0UA 1FVRA 4GU9A 5AP2A 4BDAA 3ID6C 2I0VA 3VS7A 3E87A 5AUUA 3CEKA 1H1QA 3DJ6A 4ZSLA 3S95A 4D0WA 4DFXE 3FI4A 3FWQA 5HIEA 1J7LA 4BCKA 3GCSA 2XA4A 4U43A 2C6MA 2EU9A 4LUEA 4GK3A 1YDRE 4TWPA 5BPYA 1TQMA 3D15A 4FSYA 3FC2A 4CFUA 4EJNA 4P2KA 1PJKA 1H1PA 3QHRA 4BWKA 3OXTA 1PXIA 4GT5A 5EYMA 2BPMA 3RKBA 4HVHA 4YTFA 4EH7A 4YSJA 2ZM1A 4BFMA 5GIOE 2ERZE 2CLQA 4K6ZA 3VBTA 3U6HA 5ACBC 2VX1A 2WMVA 1TVOA 4Y72A 2FO0A 3HDNA 4I93A 3L9MA 3F5PA 4L46A 2J4ZA 3PYYA 1M2RA 5HQ0A 4IQ6A 5D7VA 2X2KA 4H58A 4KKGA 5DN3A 5I3OA 4JQEA 4W8DA 5F4NA 4CG9A 1IEPA 3VRYA 4BI2A 4ERKA 1YXXA 5F9EA 2PVNA 4JQ7A 3HV7A 3LQ8A 2X7OA 4C34A 4KRCA 4X0MA 4RWKA 4JG8A 4LOPA 2QHNA 4LG4A 3AGLA 3C50A 3TJCA 4AE9A 4NIFB 2OJJA 4OTRA 3MWUA 2XIYA 4AW2A 4I3ZA 3E7VA 2WNTA 3FLSA 4USFA 4DINA 1Q8ZA 3RHKA 2IWIA 2QONA 5M55A 4DYMA 1J3HA 3ANRA 3LFAA 3TG1A 4BVUA 3Q52A 4IX6A 4XEYA 4RJ3A 4FKQA 2X6DA 4Y46A 1URWA 2F7ZE 1PHKA 2WMQA 3EN4A 3K5VA 4I94A 3L1SA 3PXZA 4MXXA 3DZOA 4DLIA 4D9TA 2B7AA 4RFMA 3EQDA 3VUIA 5E8VA 3E62A 4EH3A 5AAEA 5BUIA 5EHLA 4UN0C 3MB6A 1QCFA 5FTGA 3QU0A 3QZGA 1Q8UA 4QMWA 1G8SA 5F1ZA 3QQLA 1WVYA 1A06A 2GS2A 4RA5A 2PL0A 2XJ1A 3ORLA 2W1CA 2R4BA 3QGYA 4JBVA 5D41A 3R8UA 5I9UA 3ZEPA 3L9LA 1H08A 5HU9A 4BCNA 5EM8A 2YITA 1BYGA 3DV3A 3QTSA 4OT5A 4MHAA 2C6EA 4IWOA 4P5QA 2WTWA 4X2FA 1XQZA 5CX9A 2Q0BA 5EKNA 3SA0A 2BKKA 4BDIA 2W99B 5L6OA 3SVVA 4AS0A 3HDMA 4G6OA 5AJQA 3QD0A 4D1ZA 2OICA 3UE4A 3NZ0A 3AMYA 3ZXTA 4JRVA 1Q8YA 3AGMA 1YI4A 2I1MA 3GB2A 2PHKA 4J1RA 2JIIA 3NNUA 3DNEA 1OKWA 3V5WA 3JR1A 4BIDA 4RJ4A 4JBQA 1KOAA 2R3QA 1PMVA 1NT2A 4U9AA 2OIBA 4ZMEA 2GNLA 3PXFA 3E93A 3O0GA 3WIGA 2ZV7A 3W10A 2Y4IB 5CALA 5DT0A 5HLNA 5CSWA 3T3VA 3P7BA 4ANMA 4QYHA 4R5YA 5KKRC 2CKQA 4UX9A 1H4LA 3U55A 4A4OA 5DOSA 2CPKE 4E3CA 4PPBA 4QP4A 2VTAA 5KE0A 3VHEA 4EUUA 2CNQA 4GJ2A 3CJFA 1UNGA 3LE6A 3HUBA 2YIQA 1ZYCA 4L3PA 4TRLA 3DT1A 3GU8A 3QUDA 4MH7A 4NH1A 4W9WA 3BIZA 3FHIA 4CQGA 3COMA 4IVDA 4AAAA 5J9YA 2YWPA 3PWYA 4LI5A 4OBPA 4A06A 5DMZA 2IG7A 2ONLA 1Z9XA 3NCZA 3PUPA 3IOKA 3KA0A 3QYZA 3RWPA 4XV2A 2R3GA 5AR3A 4YC3A 4MD8E 3VBVA 4GKHA 3QD3A 4FTOA 1OKYA 1PMUA 2XNBA 3OY1A 4DH8A 4PWNA 2R3MA 4PX6A 1YW2A 1XH5A 5KMJA 1WBSA 3KRLA 3ZTXA 4QMQA 1H8FA 1FOTA 2GHGA 4I5HA 3S2PA 3IW6A 2FSMX 4J53A 4FKUA 1QPCA 5HO8A 2W1HA 4EONA 3GU5A 4NUSA 4U5JA 3D9VA 2IZRA 3NYOA 3ZSIA 3EFJA 2OI4X 3EH9A 3TN8A 4FGRA 4AOJA 3DBCA 1JKSA 2Z2WA 3LOKA 4QQ5A 4WNKA 3W2RA 4YJRA 3F82A 1HCKA 2XIXA 4EKLA 3QD4A 4HGSA 4F0FA 3P4KA 4DFZE 4DTKA 4PL5A 5FWKK 4MBJA 1U54A 4WBBB 2XIRA 2X81A 4IAFA 5CS6A 4W8EA 3ZM4A 5M53A 4EWQA 3R8PA 4ANLA 2ETMA 3OCSA 3DQXA 1KE9A 4BBMA 3MFTA 4IVBA 5GIPE 4U42A 5LWMA 4D2PA 1SVGA 3EN9A 3I7BA 3PRIA 5IA0A 4R77A 4NSTA 4JX7A 2PVLA 1ZYLA 3SGCA 4NW5A 2VWVA 2Q83A 2HZ0A 4FZ6A 4BZOA 4QYFA 3UBDA 3MH3A 2CMWA 3C7QA 4DT8A 1Y6BA 5FDPA 4GMYA 4L7SA 3SQQA 2W05A 3V6RA 2WB8A 4M84A 4K77A 3JUHA 3WYXA 2B9JA 4BTKA 5EDRA 4RQKA 3IPHA 4DAWA 5A9UA 4ERWA 3PSCA 1XBAA 2JAVA 2O8YA 3B8RA 4QMVA 4P5ZA 2XCHA 3QWKA 3FZ1A 5HU3A 3ODZX 4I6HA 3MY0A 4Q5HA 1LR4A 3SD0A 3PJ8A 1CTPE 4ACMA 4BKYA 4ZZMA 3ROYA 3G5DA 4LRKA 5KHXA 2CGVA 3EKKA 2XK9A 3Q04A 3SV0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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