3KXGA

Crystal structure of z. mays ck2 kinase alpha subunit in complex with the inhibitor 3,4,5,6,7-pentabromo-1h-indazole (k64)
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
327
structure length
326
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ATP site-directed inhibitors of protein kinase CK2: an update.
pubmed rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Zea mays
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 109
structure length 326
sequence length 327
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kxgA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kxgA02
4ID7A 4ZY5A 2VO3A 2C6DA 3B8QA 4U6RA 3POOA 3ORMA 4YLKA 2XIZA 3SKCA 5LJJA 2BDJA 2JDRA 4FX3A 2PE2A 1JAMA 3ZTXA 2PVNA 3PG3A 5EKOA 3TNHA 3EIDA 1NVQA 1Q24A 5EQEA 2UVYA 5JFVA 4AA4A 5HO7A 3QTQA 2XBAA 4JLCA 4BR3A 3QZFA 4G9CA 4QMYA 3TL8A 4KD1A 4E4MA 3LKMA 3Q32A 3V5WA 3PRIA 4GMYA 2HENA 5IQBA 4NT4A 4JJRA 4E20A 2QVSE 2XF0A 1OPKA 5DPVA 3FXWA 2JDTA 1Q61A 2BHHA 3BKBA 3LCDA 3MFSA 4AP7A 3AQVA 2VNYA 3OCSA 3OMVA 4IJ9A 1OL5A 1H27A 2XEYA 2ZV2A 1YWNA 1OBDA 3R2BA 3UZPA 3VS1A 3UPZA 3HAMA 2YM8A 4BI2A 4EWHA 3VBWA 5BPYA 5M06A 4IE9A 4D55A 4DFBA 3MS9A 2OXXA 4U97A 2O0UA 5IEXA 5CVHA 5DT4A 5L2WA 2H6DA 4Z9LA 4O6EA 2GFCA 4IEBA 1UA2A 4G6LA 4MBIA 5M4IA 3W2SA 2R3KA 2ETMA 3C4ZA 1NY3A 1OECA 5EI2A 2NRUA 5C8MA 4G34A 4D5HA 2UV2A 3ORNA 1GIJA 3QGYA 5IMEA 4IZ7A 2WMUA 5HU3A 4MD8E 5FM3A 3IK3A 5L6WL 4PMPA 3D83A 2JKOA 4E4LA 2E9NA 2QO9A 2HW7A 5I3OA 2WOUA 3RBWA 2CN8A 4IX6A 4PWNA 2X1NA 1RE8A 4QT1A 1YXUA 4U8ZA 3OTUA 3NS9A 1KOBA 4O38A 3QFVA 3PJCA 3HYHA 3ZUUA 5DA3A 1J7LA 2EB3A 3FQEA 4UWCA 5CI6A 2X8EA 4GU9A 5FQDC 4LOQA 4FV6A 5M53A 3FI4A 3COMA 2H96A 4KIPA 4RJ8A 2RG5A 3EZRA 1P4OA 2F4JA 2OFVA 2VWIA 2W4JA 4WG4A 3NUYA 3OVVA 4GK4A 5EDPA 3VS2A 2C0OA 5HVKA 3QRUA 3A2CA 3R7UA 3OFMA 4CT1A 5CZHA 2ZJWA 3CEKA 3FKNA 2W06A 4PL3A 2VZ6A 1OL1A 4RX7A 4CEGA 2J2IB 3BYSA 4O7TA 2V55A 5EOBA 3NVMB 2BVAA 2IW8A 2J0LA 4QP1A 4TWCA 5KBQA 3OWKA 5BVKA 5HQ0A 4APPA 3I7CA 3PVUA 2E9VA 4MD7E 5ETCA 4EHVA 2V0DA 2XVDA 4DTAA 4AAAA 4FNYA 2PY3A 4XJ0A 2ITTA 1B39A 3QTRA 4RVMA 5I9VA 3QL8A 1MP8A 4AX8A 4YSJA 3ZYAA 2NO3A 4BI0A 2GNFA 4I4EA 5AP2A 2JDVA 5C8KA 4DFNA 3V8SA 2OJJA 4E4NA 3CTHA 4YR8A 3R9HA 2YIWA 3W18A 2ZVAA 3WZJA 1XH9A 2X9FA 5I9WA 3IOPA 3BQCA 2WEIA 3HV6A 5AR8A 5HIBA 3TNPC 1O6LA 2EUFB 4F4PA 2JC6A 4J98A 4B8LA 5KMLA 2KULA 3K3JA 1BX6A 3DZOA 4ALWA 5GNKA 5AR3A 1U59A 4IB0A 2XKFA 4D2TA 5DVRA 5KE0A 4APCA 4G3FA 2WQBA 3GVUA 4UEUA 1IEPA 3TIYA 3VF8A 3U4UA 3H4JA 3SXSA 3MESA 1O6YA 2R3LA 3NYOA 4G6NA 3ZDIA 3QRTA 2J4ZA 2H8HA 3DDPA 3PJ8A 5ETAA 3V5PA 2NRYA 1GIHA 1Q3WA 4R3PA 5LVLA 1J3HA 3SXFA 4U80A 1T46A 3K3IA 3UOJA 2BZKB 3PPKA 3ZSIA 3NUSA 2Y4PA 4MNEB 3ZC5A 2WGJA 2V5QA 4ZJJA 5CT7A 4AOJA 2XA4A 5B2LA 4ZTLA 3PTGA 1R78A 3QKMA 3PXZA 2B7AA 4KS8A 5CEIA 4QO9A 5AUVA 4P4CA 4TNBA 3SRVA 3UTOA 4D0WA 3ZEPA 5A4CA 2IW9A 4D4VA 3KRXA 1UKIA 4YZMA 4EC8A 3ZO4A 4Y8DA 2F2CB 2P3GX 4M84A 5J7BA 4FEUA 3TKUA 1PYEA 5EM5A 2R3GA 5IF1A 1ZWSA 3H9FA 3DY7A 3R73A 3BBTB 4R1VA 3AC8A 1SVHA 2RKUA 3R7IA 3ZUVA 4EK3A 4AW5A 2VTOA 1NVRA 3FYJX 4D9TA 5J1VA 3GC0A 4Q9SA 4U42A 4CLJA 2QOFA 3ZFXA 2P33A 3RPSA 5BX0A 2UZWE 2ZM3A 4FTNA 4FUYA 3SG9A 5CVGA 5G1XA 2FSTX 3ID6C 3EN9A 3D7TA 2OXYA 3SAYA 3KULB 4YPDA 3ANRA 3II5A 4HOKA 5HCYA 4ZZOA 2LGCA 3R04A 5HLWA 2YDJA 2YA9A 5KMJA 2YLFA 2UZDA 4FKWA 3EFJA 5AA9A 2WD1A 3QU0A 2RFSA 4FSMA 4IFCA 5FBNC 3PE2A 4V0GB 3PJ2A 1WMKA 1XHAA 3FZSA 4ZSAA 3GB2A 5BYYA 2V7AA 4UBAA 3R9NA 3OD6X 5BYZA 2WPAA 2XB7A 1R0PA 2BKKA 5DR9A 1OL2A 3JY0A 3EQFA 5C9CA 4FTTA 5JK3A 3C5IA 3GOPA 3IW8A 4M3QA 3ROYA 4BIBA 4HGTA 2J0JA 2GHGA 3LE6A 3P5KA 5JGBA 3Q9WA 4HZRA 2BIKB 4NKSA 3RNYA 4A4OA 4RIYA 3TUDA 1XO2B 3DQXA 1NXKA 1IA8A 1PXOA 3COIA 3JYAA 4XV2A 4BBFA 4FV5A 1QCFA 3NUAA 4RIXB 4O1OA 3KCFA 3KL8A 5CSPA 2OXDA 3DBCA 4A07A 3FV8A 2BZJA 2XK9A 4FV9A 2VGPA 2XRUA 4XV3A 5E8ZA 2OF4A 4A9SA 5CSVA 1P2AA 2O65A 5DEYA 4CFUA 4P90A 4F7JA 4F08A 4J52A 3VS7A 3OF0A 4ASDA 3U8WA 2Y6OA 4X3FA 2WTWA 4R1YA 2A4LA 3LCSA 1AD5A 3VBQA 2VTAA 4E8AA 5IU2A 2CGVA 3DZQA 2YDIA 3LJ1A 4LI5A 1IRKA 4QMLA 4HGSA 3D5VA 1Q62A 4DEGA 2YM4A 4E3CA 3I5ZA 3HVCA 4RX5A 4KIKB 2YHVA 3O96A 3VHKA 3ALNA 4JDJA 3Q96A 3QRJA 4TYHB 2C5XA 4WUAA 3PIZA 4PY1A 4Z3VA 1P14A 1ZARA 3CCNA 3D94A 3NYVA 5EYMA 3HV3A 4CMOA 4IAIA 3HAVA 2CPKE 4FZDB 4L44A 5DBXA 5K0XA 4QP9A 2CJMA 2WKMA 4IIRA 4IW0A 1DS5A 2X4FA 4OTWA 4QTCA 4S32A 4YPSA 4CRSA 4DH7A 4FA2A 4LV8A 5HTIA 2ONLA 4UMPA 3MH1A 4I21A 4CTCA 3L9NA 4R3RA 3NIZA 2DYLA 2UW6A 1Q5KA 4L8MA 4LL5A 5EQYA 2FB8A 3TCPA 5J1WA 3N4VA 5CU6A 1GZOA 3H0YA 3QWJA 2ZDTA 3AD6A 3IQ7A 3PE1A 3SQQA 4DGOA 3HDNA 2ZDUA 3CJGA 3ZLYA 5KZ0A 4FEWA 4IHPA 5LVPA 2IO6A 2YCFA 1WBNA 3SGCA 4RX9A 3WE8A 3FI8A 4USDA 3SDJA 2Z7SA 3I81A 5JFXA 2QO7A 3EL8A 3KK9A 1FGKA 2C4GA 2UZOA 4AOTA 4GKHA 5GIPE 2JDSA 3Q9YA 1W83A 4C58A 4Q2AA 1KV2A 4Q5EA 2CNVA 5IQDA 1DAWA 3RAIA 4UV0A 2GQGA 3AD4A 3RPVA 4GYIA 3R9OA 2VO0A 4I0SA 4UALA 3HMMA 4L3LA 5FBOA 1M7NA 5KNJA 3JUHA 3O7LD 4MEDA 4IDVA 4CXAA 5LVOA 2PVJA 1H1QA 4C35A 3TV7A 4CD0A 4U44A 3R9DA 2QKWB 4L42A 5IPJA 4KUJA 4MXZA 1H00A 5E92A 2ZMDA 3C4WA 1XH6A 4FKLA 3F5UA 3RINA 5AFVA 3BYMA 2YFXA 3GCQA 3F82A 2VAGA 1Z9XA 3QTUA 2A19B 3RGFA 5BNJA 5FDPA 4FYOA 4OT6A 2EWAA 3A7FA 3COHA 1OM1A 5K5XA 3D4QA 4R6VA 3VBYA 2ITWA 2WMTA 3ANQA 5IQAA 2C6IA 4K0YA 5GZ8A 1PXLA 4TRLA 5DE2A 3HV4A 4C4IA 3WZUA 5EM8A 4RVLA 4EL9A 5JN2A 3AT4A 5CU3A 5FP5A 3DNDA 3DGKA 3HRBA 5EQPA 3EJ1A 4RFMA 4C36A 3DPKA 5DI1A 5IKWA 3RHKA 4O7LA 3FI3A 2A27A 3U6JA 3ODYX 5HIDA 3LFDA 3Q9XA 5AM6A 2WTDA 3OT8A 3L8SA 3OOGA 3ZDUA 4Z55A 5AADA 2B52A 2CNQA 5JZJA 4UYNA 1QPCA 4TY1A 4MXXA 2ITUA 1FPUA 3GUBA 4TL0A 4MX9A 3TM0A 5ITAA 3HA8A 4MK0A 3FY0A 3RJCA 2WTVA 4FV2A 3VS6A 4FL2A 2BDWA 4IAYA 2FSLX 3CLYA 2QU5A 4BDGA 1KE6A 2ITPA 3D9VA 1H1SA 3F7ZA 5L8LA 2W1ZA 5A46A 2W4OA 4GW8A 2XMYA 3FZ1A 2ZOQA 4FEQA 4CG8A 1LEWA 2OJ9A 2HXQA 4MXYA 4XV1A 5CS6A 5JFSA 2BR1A 5IUGA 3D15A 4MF1A 4QPMA 4C7TA 5FTQA 2DS1A 2XYNA 4DN5A 3F7WA 2BPMA 4I1ZA 4BGHA 3ENHA 4C38A 3PWYA 2VWZA 3UOHA 2IZRA 1WBWA 2PVLA 4YJUA 4CYIA 4BZNA 3NEWA 4OBQA 5M08A 3RALA 3TNIA 3Q53A 5CU0A 3L8XA 2V62A 4CVAA 2HOGA 2OBJA 5FLFA 3UQGA 3V5TA 4BDDA 3O7LB 4GT4A 4EH6A 4EUUA 2C5NA 2CMWA 5HEZA 5AV4A 5GIOE 4YJOA 5ANJA 1V0BA 4PTEA 3AD5A 3GNIB 2PVKA 2SRCA 4FTAA 3HMPA 3FLZA 4TT7A 4W8DA 4XP3A 5CXZA 4D1SA 5DFPA 4RQKA 2VX0A 5JGAA 3TNWA 3I1AA 3R7VA 4FSUA 3OWLA 4I0TA 2JFMA 2YZLA 3GU7A 1REJA 4M15A 4I0RA 4ZAUA 5BMSA 3MIAA 5AP7A 5GZAA 4H39A 5D1JA 2F9GA 4WSQA 4DF3A 2UZLA 3DJ7A 5F94A 2BRBA 5AUWA 3GQIA 4UMQA 4D28A 2PHKA 4UMTA 4ERKA 4O7NA 3R6XA 1UNLA 4OTFA 3ZCLA 3FXZA 2UW4A 3MY1A 3TACA 2G2IA 4RIWB 4DFYA 4BDJA 3V51A 5DR6A 1UNGA 2ITXA 2XK7A 2VUWA 3ORZA 1H08A 3BHVA 1PMNA 3FEGA 4R5SA 4PPCA 4YJRA 4HNIA 3VVHA 3BU5A 1YOJA 5EI6A 4I6FA 3W10A 1MQBA 4S34A 4L43A 1UVRA 4TN6A 1K2PA 5H8GA 4WNMA 3PXQA 5F4NA 5CF5A 5IA3A 2CKPA 4FG7A 3KREA 1CDKA 4NM3A 1XBAA 5AUXA 4UB7A 3ZU7A 5GHVA 2PPQA 3SHEA 1W7HA 3QQHA 3FLQA 4WOVA 4DTKA 1OBGA 3HRCA 4EC9A 5FUTA 4FODA 3AMYA 5EW3A 2RF9A 4BL1A 4YBJA 3KXZA 3VUTA 1ZOGA 4KBCA 4KWPA 2X6EA 4RJ3A 1JKKA 3F2NA 4IDTA 1H1PA 2HZ4A 4XLIA 5HI2A 2YLEA 2WQMA 3FZTA 4FKGA 4EOKA 4BCIA 4HNFA 3CKWA 4PNIA 1GY3A 3KXHA 5C4KA 2X2KA 4R3CA 4B0GA 3DXQA 1WBPA 3LXPA 4QMNA 4YTFA 4H1JA 4QP4A 3KN6A 4JNWA 3E62A 5LOHA 2UUEA 4FIHA 5AR4A 3FL5A 4L46A 3WYYA 4MXOA 5DG5A 4OBPA 4EH7A 4MNEA 4ANMA 4DE4A 2PSQA 3N4TA 4G3EA 3ZLWA 3BU3A 2X2MA 4FSNA 4A7CA 1GAGA 3R22A 2AYPA 5IQCA 4QMVA 3QRKA 5I5ZA 3NUPA 4O0WA 2ITNA 2BRHA 2WELA 4CFFA 4U7ZA 4G5PA 2DUVA 4G31A 1F0QA 2CCHA 2W5AA 3O8TA 4IVDA 4JVGA 5TT7A 4XYFA 4RIYB 3GP0A 3VS4A 2WMWA 4Y72A 2R3FA 3RP9A 3AGLA 1OGUA 5IA0A 5LMBA 2YITA 5CVFA 4TYGA 4FSWA 4DEEA 2Q0NA 5KMKA 5E7RA 1ATPE 4NFNA 4E1ZA 1OIQA 2WTCA 2UW3A 4RSSA 3S00A 2OJGA 3NWWA 2CKOA 1XBCA 3W55A 1PMVA 1U5RA 3PXRA 4CNHA 4J53A 3KULA 3NX8A 3R02A 4EJ7A 2HY81 2X8IA 3FMJA 3F88A 3TZ8A 3ET7A 3QLFA 2IVUA 1KWPA 4BCJA 3UIXA 4NFMA 4PNKA 3REPA 3MPTA 3JXWA 3K5VA 2HYYA 3A61A 3AMAA 4FKQA 2EXEA 5TF9A 1DAYA 5KCVA 4V0GA 3HNGA 4QP6A 4XV9A 4CSVA 4CCUA 3P9JA 3L9LA 2ITZA 4LGHA 2BALA 3QA0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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