3LFQA

Crystal structure of cdk2 with sar60, an aminoindazole type inhibitor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
298
structure length
289
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rational design of potent GSK3beta inhibitors with selectivity for Cdk1 and Cdk2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 78
structure length 289
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lfqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lfqA01
3HL7A 2XNBA 4K77A 5DR6A 5ANIA 4S32A 4F0FA 2V0DA 5CXZA 2F57A 4O27B 3NZ0A 5DN3A 2OO8X 2G1TA 4UZHA 3BYMA 5EW9A 4U79A 4M0YA 3KRLA 4USDA 3RALA 4EWHA 2W99B 4ERKA 4WBBB 5IH5A 4K33A 4B4LA 4J97A 5AEPA 3LKMA 3TIZA 5DEYA 2E9VA 4C0TA 5CWZA 4USFA 4FODA 4GVAA 1OKZA 2BALA 4L67A 4ZTHA 3VBYA 3JUHA 4B0GA 1MQBA 2ONLC 4DGLC 3O50A 4AA0A 3DZQA 4HCVA 1DI9A 2G2FA 4J7BA 2B1PA 5L2QA 4OAUC 2A0CX 3WF8A 5FRIA 2B9JA 5B7VA 2JFLA 3HMNA 4NW5A 3R0TA 4I6BA 2XYNA 5CS6A 4XLIA 1WBVA 3TNIA 4I21A 4EZ5A 5E4HA 1VJYA 3AT3A 2NNWB 1JSUA 3VHKA 1E9HA 4AOIA 3QTSA 3ZSGA 2JKOA 4I1ZA 2WMQA 5M07A 4KKGA 3FMEA 4K11A 3BU3A 3QYZA 3WZJA 4X2JA 3ZFYA 3LLAA 2QO2A 3HEGA 4YU2A 5J9ZA 3NW7A 2QLUA 2PVLA 4NSTA 4XEYA 4X3FB 2X6EA 4FICA 3MW1A 3UODA 4D58A 3BHHA 1YXVA 3UIMA 5A46A 3O23A 3C4XA 2VN9A 1YKRA 2VWWA 3Q9WA 4BN1A 5LVNA 3VIDA 2OK1A 4CCBA 3QX4A 3AC3A 3NPCA 4WSYA 1GAGA 3T9IA 5IKWA 4V0GA 3IS5A 1W0XC 3IKAA 4F9BA 2C5OA 2Y4IC 1Y6BA 2JFMA 4JRNA 4UV0A 3TT0A 4DFXE 3TI1A 5A6OA 1UNLA 3IDCA 2F49A 5JH6A 4CYJA 4TW9A 1J1CA 1PXLA 2X2MA 4GU6A 4QMXA 1NVRA 2WHBA 4S2ZA 3VUMA 3OTVA 4FR4A 3D7TB 2BKKA 5HCXA 4XRLA 1WZYA 5IUIA 4D0XA 2WU7A 4O7RA 2XNNA 4WNOA 3PXRA 5FGKA 3K5VA 1VR2A 5CVHA 1BX6A 5F1ZA 3ZO4A 3D5VA 3VUDA 3HAVA 4GG5A 3P23A 3GEQA 5JQ5A 2W17A 4UB7A 2YLFA 3O17A 5C03A 3ZBFA 5J9YA 4O83A 5EH0A 5DMZA 1V1KA 3WZDA 4JBPA 3TXOA 1B38A 4DBNA 2RG5A 3G0EA 3PA4A 4YC6A 3V8SA 4BBEA 4UMRA 5ITAA 2CKPA 2YEXA 4L46A 5CEOA 4NU1A 4IX4A 4YUQA 2A19B 5M56A 4IVDA 3DLSA 1FGKA 4BIDA 3BV2A 3IW4A 4QP1A 3QCQA 1ND4A 2EXMA 2VNYA 1KE8A 3UNKA 4KB8A 3SOCA 3MPMA 4I22A 3ZU7A 4BHNA 5M51A 2VTMA 2J90A 4NFNA 3R9HA 4FEUA 3MI9A 2UUEA 3C5IA 3DBCA 2UZWE 3BYOA 4UN0C 1Q24A 2OXDA 4XG4A 3OFMA 4I5CA 5DRBA 1JKTA 4FTLA 4EZ7A 2C6IA 3GQLA 4LOOA 3FC2A 4KABA 5CSVA 5B2LA 1G8AA 3SAYA 3OCSA 2XNEA 4NM5A 3PJCA 3KF7A 4XRJA 5EI8A 1KOAA 3A8WA 4PX6A 5FXQA 1PJKA 5H3QA 2G2HA 4ZJVA 5T68A 1PYXA 4WA9A 3FPMA 3COMA 3IO7A 3MB6A 4YZMA 5LCKA 4A06A 3NUNA 2XJ2A 5JZNA 4ANQA 5M44A 2Z2WA 3BE2A 4JLCA 4O0YA 4S33A 1OL1A 1DI8A 5HVYA 4AACA 4EOJA 3VW6A 4LG4A 3M42A 4AFJA 3F3ZA 5E8SA 1MRUA 4DG3E 5J8IA 2GTNA 4EEVA 3BEAA 3QL8A 3LE6A 4D2VA 4C2VA 3RVGA 4WD5A 4CTBA 4ZSLA 5IQDA 4UEUA 2IZUA 2XCHA 3C4EA 4IX5A 4WKQA 4F63A 4JBVA 4XG9A 4HNFA 4I0RA 5EI6A 3DNDA 4PF4A 2VWBA 4RLLA 3T3VA 3TDVA 2OW3A 1IR3A 3A60A 3I81A 2H9VA 3OEFX 5CSXA 1A06A 2ZJWA 4PL5A 4E5WA 1SZMA 1H00A 3DA6A 3ANQA 2PZYA 3E93A 3RWPA 1F5QA 3D14A 2EVAA 1XWSA 4KA3A 5EHYA 3P9JA 5C8KA 3F3VA 4R3CA 4N6YA 4A9UA 3QCYA 3AD4A 3MBLA 3ZRKA 2YABA 4CYIA 4EH8A 5BYLA 2FGIA 2VO0A 3GC7A 5HU3A 5BQ0A 5IQEA 4K9YA 3CQEA 5E91A 3R6XA 5IQIA 1ZARA 4LFIA 4H39A 5CF4A 1K2PA 1WBNA 5IEVA 1G3NA 3FWQA 2XEYA 3PVWA 1Z9XA 4LOPA 3BPRA 1YXTA 1H0WA 4JS8A 2BTSA 2R3KA 3GCUA 3O0GA 1DM2A 2G9XA 5H8GA 4EHZA 5L2WA 4L53A 3HA6A 4J95A 3MS9A 4AX8A 2OG8A 4E6QA 5K9IA 1WVWA 2IN6A 5CAPA 2O8YA 1BL7A 3OUNB 4IB5A 2C3IB 3EFLA 2I40A 3G0FA 5EI2A 3SLSA 3E88A 5DEWA 5D7AA 4C62A 4IVBA 4FKJA 4XS2A 2W4JA 1H1SA 2X81A 2QOCA 2CMWA 3A8XA 5I0BA 5K5XA 5DPVA 1YWRA 1OBGA 1NT2A 1VYWA 1IRKA 3PY0A 4G2FA 5DHJA 4EK5A 4RJ4A 4YZDA 2CLQA 3MWUA 1B39A 4R7IA 3Q04A 3KN6A 1CDKA 4RT7A 3TNPC 2WOUA 5JRQA 4EC9A 4YHFA 4ZZMA 2X8EA 3IW7A 4IVAA 5L3AA 3V04A 3RZFA 2BAQA 1SM2A 3HV3A 4TKSA 2E2BA 3DK7A 4JX3A 4M68A 3SXSA 1A9UA 1SVEA 4BDFA 2J0JA 4IWQA 2HY81 4YJSA 3PSBA 4WBOA 5D9HA 1OL5A 5EQYA 4ALWA 4Q5EA 3D15A 2XK7A 5ETIA 4XP2A 1U4DA 2BVAA 3JY9A 4CRLA 3UZRA 1KV2A 4FVPA 2XH5A 4J8MA 3TKHA 1W7HA 1Y6AA 1PKGA 2J7TA 3F3WA 3V51A 5IF1A 4GT5A 2GU8A 4OW8A 1WAKA 4Z3VA 4CEGA 2WEVA 5B0XA 2BAJA 4AFEA 3G15A 2B9IA 3NVMB 5GIPE 3RHKA 3MFRA 4KINA 2JKKA 3WE8A 5JMSA 2WU6A 4QYGA 3G9LX 3QTZA 1ZMVA 3KULA 1M7NA 4B9DA 2CNQA 4ZSEA 1M2RA 3AC8A 3U54A 4UMPA 3BYSA 1H8FA 3D9VA 2RF9A 3N4VA 3WIKA 4LYNA 3DNEA 2CCHA 4KSPA 5CYIA 3PPKA 4YZCA 2IW6A 3DXPA 3D0EA 2X7GA 2VTNA 4QMVA 3WOWA 3OROA 4BI0A 1J1BA 4TT7A 1ZYJA 3NAXA 4AG8A 3MB7A 3DBDA 1WVXA 3ROCA 3IG7A 4W4YA 5E8UA 4KIOA 5CU2A 5IZFA 4CT1A 2UZDA 2CKOA 4GS6A 3AMAA 5DNRA 4GW8A 2YCFA 2QODA 4ANOA 2QG5A 5L2SA 1PXOA 3BLQA 3LPBA 2UW8A 1M7QA 3FKOA 2V7AA 3GFEA 4IDTA 4MF0A 3G9NA 4PUZA 5I3OA 4BYJA 1DAWA 4CFUA 1U54B 2OICA 4DH1A 3L8VA 3ZH8A 4C58A 3EWHA 3EN7A 2HWOA 4KKEA 4RJ5A 4X7QA 5FBNC 5J1WA 4XV3A 2PVJA 4KUJA 4XOYA 4E5AX 3P7BA 4GFOA 1P2AA 5AWMA 2BRMA 3BYUA 5HICA 5E9EA 3GENA 5C4KA 1ZMWA 4QQCA 2HZNA 3VF9A 3EMGA 3QBNA 3ET7A 3BKBA 4G34A 3BHUA 3R7EA 3VWAA 3ZO1A 5HX8A 3N4TA 1UKHA 3SX9A 4TTHB 2YN8A 2R3RA 1H01A 4D1XA 5AM6A 3Q5IA 1JBPE 4WSQA 4TZRA 4ZJJA 4AZVA 4BDDA 1GIJA 4EH3A 2Y4PA 3FXWA 1XJDA 3I7CA 4QO9A 4OTFA 4AZSA 3AC5A 2XRWA 3IOPA 2PVKA 4FSQA 5EW8A 4XCUA 3KFAA 3LXNA 4EI4A 5HBJA 5K4JA 4XX9A 2Q0BA 4UBAA 4QPMA 2BRHA 5LMAA 2P33A 2UZTA 3S2PA 1H1WA 3ERKA 4QP8A 3BU6A 4KIQA 2WQBA 1I09A 3NRMA 4MXZA 1PY5A 4U45A 3CD8A 3GBZA 3R30A 4LL5A 3NUXA 5HD7A 3FJQE 3A7JA 2P2HA 4ARKA 1YHVA 2P2IA 4ALUA 4CMOA 5CNNA 4C59A 3GOKA 1MUOA 2R64A 4C38A 4MQ1A 1EH4A 4BWPA 3Q9ZA 5D41A 4C36A 5AAEA 5IMEA 4XOZA 4FSWA 3VUGA 4BKZA 1CSNA 5FWKK 4EL9A 1IG1A 4IB1A 2R3FA 3QA8A 4E8AA 4Z7HA 3BZ3A 4M12A 5HE1A 2QONA 3KXZA 2PTKA 4PPBA 4R77A 5FEQA 2Z02A 3QALE 5I9XA 5HHWA 3I7BA 4FOCA 3EL7A 4P90A 2F9GA 1OGUA 5J87A 3NSZA 4IBMA 2XM9A 5M06A 5EYMA 4JVGA 4KS7A 4NJDA 4O2ZA 3RPYA 3UJGA 3HP2A 2JEDA 4IWPA 4IFCA 5KKRB 1REKA 4EOOA 2RL5A 2UV2A 3ZO3A 4CSVA 2YISA 1DS5A 3QTWA 4NKAA 2XK9A 5ETAA 2W05A 4TNDA 3KVXA 1ZOGA 3F2AA 5IA0A 2BRBA 4BB4A 1UA2A 3OXZA 4JAJA 5AR8A 3E8NA 3GP0A 2HENA 3EJ1A 3OTUA 3QGWA 4FG7A 2W4KA 5CSWA 4XV1A 3FLNC 2OSCA 4YNOA 5BVOA 5FBOA 4E93A 5KBQA 4DC2A 3R7UA 5BYZA 4ZZNA 2PVMA 3ANRA 3VF8A 4FTUA 5CALA 1SMHA 2J0KA 2XZSA 4PMTA 4TWCA 3U4UA 5GNKA 4D0WA 3TKUA 3UQGA 3E64A 1XR1A 1WFCA 4EOPA 1KUTA 3HX4A 5D7VA 4D2SA 4M69B 4FT3A 3FI8A 2GCDA 3OZ6A 1Q8ZA 5F9EA 3OWPA 4GIIA 4BTMA 4LM5A 2FB8A 4EQCA 3KF4A 3LFBA 1BUHA 4KIKB 5H9BA 3UOKA 2F4JA 3VJOA 2W06A 5M55A 5CNOA 3LJ1A 3CQWA 3ZLSA 5HO7A 3B2TA 3F5PA 3LCTA 5KX8A 3VJNA 2IVUA 4BDAA 4XBUA 1OZ1A 2ETMA 5HLWA 3ZSHA 2UW3A 4F0IA 3AGMA 4RJ6A 2EXCX 3UO6A 4BDIA 4F6SA 5BVEA 2WKMA 3FEGA 5EYCA 5FG8A 3FLQA 2Q0NA 4IAYA 4O2PA 3ZUTA 4BY9E 4JG6A 2JDSA 5FXSA 4WNPA 2JGZA 5EK7A 2W1FA 4NZWB 5IQHA 4XG8A 3LJ0A 1VEBA 4OT6A 3FMNA 2HOGA 3BLHA 1KE9A 1M14A 2XJ0A 3DK6A 2GFSA 3O7LD 3QQUA 3BCEA 4OTIA 4EQUA 4ZLOA 3DXQA 5C26A 4L68A 4GYGA 4GYIA 4JDHA 4YZNA 3ZTXA 5EKNA 4X2KA 5JN2A 1TVOA 4QP6A 1ZLTA 2Y6MA 4JX7A 3DQWA 3TN8A 2XYUA 2FSLX 5EOLA 4O0XA 4DEGA 5EM8A 4FIIA 4FOBA 5CZHA 4Y73A 2GNJA 4RC2A 2F2UA 3PG1A 3H9FA 4O38A 4TXCA 4YTCA 4KBAA 5IQCA 3S4QA 3ORXA 4JAIA 2NPQA 3QZHA 3R8VA 4ENXA 4D2WA 4BCPA 2OH0E 3U6HA 2GQGA 4P4CA 4YBJA 3TEIA 4MH7A 4CKRA 1OL2A 2GHLA 3ENHA 3V01A 5L4QA 1JOWB 4FTRA 4V01A 2R3IA 2UZBA 3DBFA 4MNEA 3VS5A 1R0PA 2J4ZA 3R7YA 4BZDA 5J7HA 2BPMA 3CP9A 4U9AA 4RA4A 3SRVA 1YI6A 3UNJA 2XS0A 4QMWA 4O0TA 3UZPA 1R39A 4PTEA 4LV5A 1H28A 2VX0A 1U5RA 2GMXA 2YM4A 4F7JA 5DBXA 4QQTA 5B2MA 1KWPA 3LAUA 4RIWA 3LMGA 4E4XA 4EYMA 4N57A 3Q2MA 5KMLA 2EWAA 3IW8A 1FGIA 3TV6A 4BIEA 2PZRA 3SA0A 4D55A 5HVKA 2XK8A 4LOQA 2OJFE 3RK5A 3TG1A 3PY1A 3FI3A 4BYIA 3ALNA 4E20A 4MKCA 3FYJX 4FKWA 3W2QA 5BUIA 4APPA 4BWKA 5KMMA 5KNJA 5I4NA 2VX1A 2OIQA 4FTNA 2CSNA 1J7LA 3Q9XA 5AUVA 4E26A 2HZ0A 5LMKA 1XBAA 3NIEA 5FP5A 4FIJA 3U9NA 4HVIA 2XB7A 2XMYA 1J7UA 5IU2A 3V8WA 1NW1A 3I6UA 3EN4A 3SW4A 2ZM1A 4OAVB 1Q97A 2UZOA 4H58A 5TR6A 4O7NA 3VUIA 4FV8A 4BCHA 2XBJA 3ZEWA 5EYDA 4IC8A 4ACMA 3PPJA 2B7AA 5KKRC 2VWUA 5M08A 1UNHA 3HRFA 4BVUA 5DE2A 5H2UA 3A7IA 4FVRA 4AE6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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