3LIJA

Crystal structure of full length cpcdpk3 (cgd5_820) in complex with ca2+ and amppnp
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
479
structure length
465
Chain Sequence
YFQGDLQATPGMFITSKKGHLSEMYQRVKKLGSGEVLLCRDKVTHVERAIKIIRKSSNSKLLEEVAVLKLLDHPNIMKLYDFFEDKRNYYLVMECYKGGELFDEIIHRMKFNEVDAAVIIKQVLSGVTYLHKHNIVHRDLKPENLLLESKEKDALIKIVDFGLSAVFENQKKMKERLGTAYYIAPEVLRKKYDEKCDVWSIGVILFILLAGYPPFGGQTDQEILRKVEKGKYTFDSPEWKNVSEGAKDLIKQMLQFDSQRRISAQQALEHPWIKEMCSKKESLPSLANAIENMRKFQNSQKLAQAALLYMASKLTSQEETKELTDIFRHIDKNGDGQLDRQELIDGYSKLSGEEVAVFPQIESEVDAILGAADFDRNGYIDYSEFVTVAMDRKSLLSKDKLESAFQKFDQDGNGKISVDELASVFLDHLESKTWKEMISGIDSNNDGDVDFEEFCKMIQKLCSNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of full length CpCDPK3 (cgd5_820) in complex with Ca2+ and AMPPNP
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Cryptosporidium parvum
molecule keywords Calcium/calmodulin dependent protein kinase with a kinase do
total genus 153
structure length 465
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.-:
pdb deposition date 2010-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00036 EF-hand_1 EF hand
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lijA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lijA02
3QX2A 4MD8E 1OBDA 2UVZA 2ACXA 4GS6A 3OTVA 4MXXA 2R4BA 3CP9A 2ZM4A 3ACKA 3D14A 3FQEA 2VTRA 1TQPA 2CLXA 2AC3A 3K3JA 3PFQA 5HNGA 4I22A 5HI2A 3W8LA 4BY9E 3WZDA 4DEIA 4FTRA 4I92A 4J98A 4QP4A 4C4JA 3CQUA 3DQWA 3OWJA 2Y8OA 4J8NA 4FYOA 3N51A 4DINA 4NSTA 2EB3A 2PVLA 3L9PA 4M15A 1Q99A 4Q9SA 3JVRA 3HX4A 2XM9A 3PVGA 4GSBA 2J0IA 3BU6A 4QYYA 4TNDA 4CLJA 3G15A 3Q3BA 2J5FA 2CKQA 2I0YA 2R3OA 5EM8A 4K0YA 3N4UA 4FV7A 4N4SA 3DTWA 3DGKA 2XVDA 2ZM1A 4C61A 3R8ZA 1KWPA 4O7SA 4MWIA 5CYIA 5DEWA 5CAVA 3FY0A 5KMOA 5D10A 5KO1A 4U45A 1PW2A 3W2SA 4R8QA 4HCUA 2EUFB 4PX6A 2Y4IC 3Q9WA 4J1RA 1MQBA 4CMTA 3BYVA 3ZRKA 4QP7A 2WTWA 3W16A 4Y72A 5E1SA 4FTUA 3OTUA 4PL4A 5HOAA 4CGAA 2PZYA 2PL0A 1GIHA 2ITYA 5I3OA 4UV0A 4ASEA 3LPBA 3MB6A 4MYGA 3PJ2A 4ALWA 1IASA 3KKVA 1ZY4A 5J87A 4DFYA 2RFNA 3A7IA 4AG8A 4EOKA 5HU9A 1W84A 3OCSA 4NM5A 4YNOA 4CT2A 3KVWA 4XRLA 4C38A 3HDNA 4FNWA 4R3CA 3RKBA 2UVYA 3W8QA 3HMPA 3FKLA 1LUFA 4MAOA 3ZRMA 2BZKB 3QQUA 1UU9A 2WMUA 2XK3A 4E4LA 3L1SA 4EH6A 3BU3A 3QTWA 2VWBA 1REJA 5GIOE 3KEXA 4GEOA 5LWMA 2NP8A 3NNUA 2VTTA 4RJ6A 5AP7A 4FT9A 3ZRLA 2UW5A 1OB3A 3I7CA 4C02A 4QMNA 2O65A 2QOBA 3CGFA 5C8MA 5JFWA 5DI1A 3NUNA 3WF7A 3FLWA 4RWIA 5M07A 4BZOA 2PVKA 4XUFA 3WBLA 4E5AX 1U4DA 3MJ1A 5HLWA 3BGQA 5DOSA 1Y6BA 2R9SA 3N9XA 4TL0A 5L2SA 4L7FA 3O7LB 4MF0A 4QPAA 5AP4A 3PZHA 4RZVA 3A61A 2QOFA 4D55A 2BAQA 3EJ1A 4DFXE 3UODA 4C57A 1SM2A 2BVAA 5HO6A 1BYGA 4YTIA 3Q9XA 4HW7A 5JFXA 2OZAB 3OT8A 2A1AB 3BEAA 4LL0A 3TIYA 4AT4A 1OL6A 4RX7A 2HAKA 1B6CB 2WMBA 4U3YA 2PVJA 2WGJA 4OR5A 4YHJA 3CD8A 4O22A 3K54A 5DRDA 3QTUA 2OZAA 2OJIA 3VO3A 4F99A 2YDKA 2VTMA 3FI4A 4QMQA 4QP1A 2C6LA 3BWFA 3NAXA 3QKKA 3EQHA 2WTVA 4EZ3A 4O86A 3TT0A 3H0YA 3GI3A 4HGEA 3TEIA 3L9NA 1Q8TA 2IW6A 2XIXA 2EVAA 4QQ5A 4BTMA 2YISA 1YI6A 4FIIA 4XNEA 4XS2A 5DT0A 5AAEA 3DY7A 1GZOA 2WTKC 2FSLX 3QQJA 3F2AA 3A4PA 3GQIA 3V5TA 4JX7A 4BDBA 4FEXA 5BUEA 3MFUA 4KIQA 2W5HA 2BTSA 3IGOA 3NW5A 2IZTA 4OTRA 2C5OA 4CFMA 2GSFA 2QURA 4G5JA 3JR1A 2BZIB 3EL8A 4XBRA 2PZ5A 3FMNA 3OXIA 5EKNA 5TT7A 2WOTA 2PE2A 3JVSA 4NJDA 5FEDA 5AUUA 3OHTA 3BYSA 5CZHA 5ITAA 4ZMFA 2B9HA 2J2IB 4FV4A 3KXZA 1REKA 3TUCA 1O6KA 2YM6A 4YC8A 4FGBA 4XHKB 1R0EA 2ETMA 3F3ZA 4CFXA 2JKKA 2P2HA 4JDHA 2J50A 4I21A 2W1FA 2PZIA 3EN7A 4YJRA 4WNKA 5EYDA 1M14A 3IW6A 2QHMA 3GGFA 1H4LA 4U41A 4TY1A 5CS6A 2RFEA 3O51A 3NR9A 1AQ1A 4RA4A 4DTAA 3D83A 2G2IA 3BHVA 3EWHA 3JS2A 3KXNA 3LHJA 4XCUA 4YGAA 3VJOA 4ZTLA 4BZNA 2AYPA 3DZQA 4OLIA 4AW5A 4X2NA 3LMIA 3VBVA 1YI4A 5C27A 3Q4UA 4C8BA 4QPMA 4O1PA 3ZH8A 4YJTA 5HZNA 4I6BA 3OBGA 5ANKA 5IPJA 1L3RE 4M0YA 4BBFA 3ODYX 5E8UA 3I6UA 4YZNA 3E92A 4FMQA 4R7IA 4C2VA 4DFNA 3QQKA 3UQCA 5C4LA 1O6YA 1ZARA 4ANMA 2GDOA 4FVPA 5HTBA 3NUPA 1XH4A 3GEQA 3P23A 4IZ5A 2WXVA 2XCHA 4FEUA 3F2RA 3OCTA 4GIIA 4QTEA 1KV2A 3QKMA 5DPVA 3GC8A 3RINA 3C5IA 3QCYA 4ZOGA 2R3NA 5DLSA 1URWA 1XQZA 2YN8A 4F9BA 1CDKA 1CKIA 3R8MA 3W1FA 4CT1A 2HZ4A 3ZZEA 4C4GA 4EK5A 3MESA 3MSSA 2RG5A 4ANNA 1ZMVA 2RGPA 2WFYA 3OW4A 3PP0A 3PSBA 3PVBA 3QRJA 2R3MA 4GK4A 2BKZA 2OFUA 3VUGA 4RIOA 2WTJA 4F9WA 3DQXA 5LARA 4AT5A 2UZTA 1GZNA 4JQEA 5CI6A 1OGUA 2QOKA 1GZ8A 3E3BX 4HCVA 4M12A 4AZTA 1JNKA 2XB7A 3D2KA 3FBVA 3ZUUA 3LMHA 5IUGA 2F4JA 3A2CA 2OF4A 1GIJA 5FTQA 2R3JA 2UW3A 4BKYA 4EORA 1X8BA 4P5QA 4L46A 2HCKA 4EUTA 1XH6A 3PIXA 4JOAA 2B7AA 4R6VA 3PWYA 5AMNA 5HD4A 2IJMA 4K33A 5IQAA 4PDSA 1JSUA 4YBJA 3R7UA 5IQBA 2GNHA 4FNZA 2C6KA 4HVSA 4WO5A 4DH3A 2X39A 4YJOA 2NRYA 3HRBA 4RX8A 2I0VA 3KGAA 2C0TA 3LJ0A 5CF6A 4ZK5A 4YJPA 2VO7A 4USEA 3PY1A 1AGWA 5HCXA 3SXRA 3VF9A 3W2PA 2GNJA 3UPXA 3ZFMA 1J3HA 2XEZA 5CLPA 4BIDA 3QHRA 3R73A 3RNIA 4L43A 1NT2A 4G34A 2ZDTA 3AMAA 5FXSA 3MDYA 4YZ9A 3DOGA 4GKHA 4RG0A 4CFWA 5FBOA 4Y5HA 3OP5A 1V0OA 2JEDA 5CU3A 5IU2A 3ZTXA 1JSVA 5C8NA 4ENYA 4ZJIA 2ITTA 2CMWA 3FMKA 3GU8A 2Z7SA 2C6EA 4IC8A 4EHZA 4R3RA 4AF3A 4O21A 4YZBA 5K0XA 4DBNA 1XH5A 2W1HA 1FVVA 4IAZA 4N0SA 3C7QA 2HZ0A 3EB0A 3Q52A 2UZBA 2WHBA 5JZJA 3W2CA 3TTJA 5CENA 2GNGA 2ITPA 3GNIB 3DFAA 1TKIA 4I24A 4R3PA 1WBSA 3UMWA 3VAPA 3FSKA 3U4UA 4FA2A 2BIYA 2IWIA 2C5NA 4OTGA 3RALA 4ASXA 1BI8A 5AUYA 4XG9A 4O0VA 1J7LA 1SNXA 5LQFA 4K6ZA 4QTDA 1KE6A 4FK3A 1XBAA 3OT3A 4GU9A 2ZOQA 3FZPA 5IMXA 2QVSE 3O50A 2X2KA 2QOIA 3TNQB 2WZJA 2W1EA 4YUQA 3Q2JA 4TWOA 4QPSA 3DB6A 2ITUA 1OKZA 1JVPP 2OXDA 3UOKA 5HVJA 4FKWA 1UKHA 2GHLA 3R1YA 3AQVA 4L3PA 4FE2A 2X8EA 3RK5A 5IMEA 3GFEA 1XH9A 3VJNA 5AM7A 2YM5A 3B8RA 2CGXA 4EHEA 1VEBA 3R1NA 4EL9A 5LCJA 3EQCA 2HZIA 2JDTA 2IW9A 4ZAUA 2XIKA 4OTQA 5F95A 5I0BA 2BRNA 2PK9A 3KRRA 4CFVA 4YU2A 2X0GA 4YR8A 4OBPA 2C3LA 5FEQA 5C8KA 3LFDA 4I94A 4QP6A 4YJSA 3QYZA 4TN6A 2PYWA 4IWQA 2NPQA 2HWPA 3PXFA 4FG7A 3I6WA 4HCTA 4ZTNA 3C5UA 4EOOA 4FSYA 1JKLA 3BQCA 4GFMA 4TNBA 3ZLYA 2BAJA 4AP7A 3BLRA 4O2ZA 1XO2B 3IDBA 5FM3A 2X6DA 4AUAA 4WKQA 2CGVA 3LW0A 1B38A 3OFMA 4KAOA 4QMSA 4EC9A 1YXXA 2HW7A 4WNMA 3DLSA 3VRZA 2R3PA 1BUHA 3NLBA 4RGJA 2W4OA 4D9UA 2C4GA 3FLNC 5AA8A 4O0UA 1CKJA 5M06A 4G17A 2BPMA 1H1RA 4X3JA 5EYMA 4D4SA 2GNLA 3IOPA 5CSHA 3BV3A 4C4FA 3COIA 5ETAA 3F5PA 1WCCA 3WF8A 1OPLA 3SLSA 4R5YA 4HYSA 1XH8A 3WYXA 3V01A 4BDGA 3U6HA 3IECA 5AA9A 3BRBA 4FTAA 2QR7A 5JEBA 3AC5A 3OY1A 5FG8A 2ZB1A 4BWKA 1FBNA 2XNGA 4FTOA 2W0JA 4HOKA 4MXYA 5EYKA 3ZLWA 5GZAA 4R7BA 3R28A 4PNIA 2F2CB 4CYIA 2XKDA 3UG2A 2C6IA 4CV9A 2XF0A 2DUVA 3ZS5A 3PZEA 5CTPA 3R7IA 2W5AA 3MVJA 2YLEA 3OWPA 4AZVA 2WMTA 4HVHA 3KMWA 4AOIA 4AZEA 3VRYA 4L68A 4USDA 2FGIA 2VNWA 2HELA 3RBWA 3FI3A 3QD0A 4JAIA 4OW8A 4IW0A 1SNUA 3GFWA 4BGHA 4FGRA 1GIIA 3RWPA 1M52A 2QOOA 3PPKA 1PKGA 3QGWA 4I6FA 2WMSA 3KK8A 3KXHA 4YLLA 4Q2AA 2ZV8A 5IQHA 5EW9A 1Q5KA 4F6SA 3HV5A 3V6SA 4JBPA 4LI5A 3VS7A 3E8DA 5HBEA 4KABA 4QT1A 3FMHA 4I93A 3BWJA 4D4YA 1U46A 4QMLA 3SAYA 4CG9A 4GJ2A 3S95A 2HXQA 4KIPA 4AGCA 4WG4A 5EQPA 5A46A 1XHAA 4BTFA 1Q8UA 1E1XA 2HXLA 3PJCA 3ZFXA 5EI2A 3AC1A 5A14A 3SVVA 3ODZX 3DLZA 4O7WA 3DU8A 1ZYSA 3ZEWA 1UU8A 4JIKA 2WMVA 4RLLA 4FL2A 4GYGA 4BHZA 4QYEA 3R9NA 1VJYA 3R9RA 4RMZA 4N6YA 5CZIA 2UZUE 3DV3A 4GT5A 1YOJA 3QU0A 4W4WA 4DT8A 3RPVA 3FZ1A 4L00A 4BCPA 2BR1A 2QKRA 5DR9A 4EUUA 3IW7A 1XWSA 3D5WA 1WBNA 4F63A 3UO5A 4I5CA 5DGZA 1H00A 4EWHA 4FT5A 4E6CA 3GC7A 4U97A 5HX6A 2PVYA 4EJNA 5JGBA 3UJGA 5D7VA 4AS0A 2WMAA 2X9FA 3C51A 2F2UA 2VWUA 2Y9QA 3C4ZA 1JBPE 4PRJA 3KXMA 3CJGA 4U5JA 3R1QA 3EFKA 2C47A 1YOLA 3G51A 4AX8A 5JFVA 2R0IA 5E8VA 2YM4A 4YSMA 3VQUA 1R1WA 3PXZA 4J95A 4JBQA 4BTKA 3ORKA 4QMXA 3V51A 5DVRA 2VNYA 3LFFA 1P5EA 4EBVA 1I09A 4M13A 2B54A 3EN9A 2NNWB 4NIFB 4EZ7A 4MD7E 1H01A 4GH2A 5JRSA 1PMEA 3C4XA 1NVSA 1P4OA 2JITA 3UOHA 3UOLA 1FQ1B 1LEZA 1T46A 3VC4A 5IDPA 3DA6A 3CPCA 2WD1A 2UW9A 2VTIA 2H8HA 3B2WA 4NIFA 5EOLA 3MH0A 3W2RA 3V5LA 4CCUA 2ITXA 3FMJA 4TYHB 4ZZOA 3R2YA 2C68A 2XP2A 5A4EA 4RJ4A 4TRLA 3AD6A 5JQ5A 3FJQE 3FHIA 5DR2A 4E4XA 4W9WA 1YRPA 3QTIA 2ZV9A 4KD1A 3NYVA 5HIBA 1YXSA 2PMIA 3DBEA 4RFZA 4TYHA 5KZ0A 3C4FA 3ZXZA 3O23A 4OBOA 2GHMA 5DIAA 5HG5A 5KHXA 5GIPE 1H27A 2C0OA 2ONLA 3K5UA 4D2SA 1STCE 3G6GA 2BDJA 2BUJA 3I5NA 3OC1A 4MNEB 4OTWA 4ZSEA 3V8SA 4PTEA 3DK7A 2A27A 1P14A 4KS8A 2OXYA 1BMKA 3JYAA 1VYZA 4XEYA 1IR3A 4M97A 2C6DA 4QMTA 1QPJA 3LCKA 3GB2A 4MNEA 4PF4A 5CSWA 2P4IA 2UZVA 1A06A 5HVYA 4FV2A 4NK9A 4GVAA 2XKEA 3BCEA 3IKAA 3ELJA 1KUTA 3PXRA 1Y8YA 4QYHA 2FUMA 3AC2A 5E9EA 4FNXA 2CGWA 3E7OA 5HCYA 5CEPA 2GCDA 3QRUA 3DXPA 3MVLA 2B55A 5LMAA 5CAOA 2FSTX 4EYMA 5CVHA 4WG3A 4JG8A 4JXFA 3R04A 3KVXA 1ATPE 5CNNA 4Y8DA 4IFCA 4D2WA 4E6DA 2G2FA 3QC4A 4EC8A 4W4VA 3Q4ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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